CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 2407122107363414786

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2407122107363414786.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2407122107363414786.atom to be opened. Openam> File opened: 2407122107363414786.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 556 First residue number = 1 Last residue number = 562 Number of atoms found = 8880 Mean number per residue = 16.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 89.178294 +/- 16.025898 From: 53.680000 To: 131.370000 = 89.178007 +/- 15.241359 From: 53.250000 To: 125.710000 = 42.043711 +/- 15.873165 From: 7.240000 To: 77.890000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'ASX ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 30 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8844 % Filled. Pdbmat> 6687053 non-zero elements. Pdbmat> 738346 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 166.29 +/- 47.18 Maximum number = 241 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.476692E+07 Pdbmat> Larger element = 893.963 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 556 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2407122107363414786.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2407122107363414786.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2407122107363414786.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8880 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 556 residues. Blocpdb> 58 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 55 atoms in block 2 Block first atom: 59 Blocpdb> 54 atoms in block 3 Block first atom: 114 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 168 Blocpdb> 65 atoms in block 5 Block first atom: 201 Blocpdb> 51 atoms in block 6 Block first atom: 266 Blocpdb> 55 atoms in block 7 Block first atom: 317 Blocpdb> 46 atoms in block 8 Block first atom: 372 Blocpdb> 45 atoms in block 9 Block first atom: 418 Blocpdb> 43 atoms in block 10 Block first atom: 463 Blocpdb> 45 atoms in block 11 Block first atom: 506 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 551 Blocpdb> 49 atoms in block 13 Block first atom: 592 Blocpdb> 51 atoms in block 14 Block first atom: 641 Blocpdb> 54 atoms in block 15 Block first atom: 692 Blocpdb> 49 atoms in block 16 Block first atom: 746 Blocpdb> 48 atoms in block 17 Block first atom: 795 Blocpdb> 36 atoms in block 18 Block first atom: 843 Blocpdb> 60 atoms in block 19 Block first atom: 879 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 939 Blocpdb> 36 atoms in block 21 Block first atom: 985 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 1021 Blocpdb> 38 atoms in block 23 Block first atom: 1060 Blocpdb> 48 atoms in block 24 Block first atom: 1098 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 1146 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1195 Blocpdb> 54 atoms in block 27 Block first atom: 1237 Blocpdb> 52 atoms in block 28 Block first atom: 1291 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 1343 Blocpdb> 47 atoms in block 30 Block first atom: 1382 Blocpdb> 50 atoms in block 31 Block first atom: 1429 Blocpdb> 58 atoms in block 32 Block first atom: 1479 Blocpdb> 58 atoms in block 33 Block first atom: 1537 Blocpdb> 54 atoms in block 34 Block first atom: 1595 Blocpdb> 46 atoms in block 35 Block first atom: 1649 Blocpdb> 61 atoms in block 36 Block first atom: 1695 Blocpdb> 37 atoms in block 37 Block first atom: 1756 Blocpdb> 53 atoms in block 38 Block first atom: 1793 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1846 Blocpdb> 28 atoms in block 40 Block first atom: 1894 Blocpdb> 51 atoms in block 41 Block first atom: 1922 Blocpdb> 48 atoms in block 42 Block first atom: 1973 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 2021 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 2064 Blocpdb> 42 atoms in block 45 Block first atom: 2116 Blocpdb> 41 atoms in block 46 Block first atom: 2158 Blocpdb> 46 atoms in block 47 Block first atom: 2199 Blocpdb> 42 atoms in block 48 Block first atom: 2245 Blocpdb> 55 atoms in block 49 Block first atom: 2287 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 2342 Blocpdb> 51 atoms in block 51 Block first atom: 2386 Blocpdb> 46 atoms in block 52 Block first atom: 2437 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2483 Blocpdb> 65 atoms in block 54 Block first atom: 2524 Blocpdb> 47 atoms in block 55 Block first atom: 2589 Blocpdb> 65 atoms in block 56 Block first atom: 2636 Blocpdb> 52 atoms in block 57 Block first atom: 2701 Blocpdb> 56 atoms in block 58 Block first atom: 2753 Blocpdb> 45 atoms in block 59 Block first atom: 2809 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2854 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2902 Blocpdb> 57 atoms in block 62 Block first atom: 2940 Blocpdb> 41 atoms in block 63 Block first atom: 2997 Blocpdb> 35 atoms in block 64 Block first atom: 3038 Blocpdb> 41 atoms in block 65 Block first atom: 3073 Blocpdb> 43 atoms in block 66 Block first atom: 3114 Blocpdb> 52 atoms in block 67 Block first atom: 3157 Blocpdb> 48 atoms in block 68 Block first atom: 3209 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 3257 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3293 Blocpdb> 40 atoms in block 71 Block first atom: 3338 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3378 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 3419 Blocpdb> 47 atoms in block 74 Block first atom: 3464 Blocpdb> 35 atoms in block 75 Block first atom: 3511 Blocpdb> 55 atoms in block 76 Block first atom: 3546 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3601 Blocpdb> 52 atoms in block 78 Block first atom: 3641 Blocpdb> 37 atoms in block 79 Block first atom: 3693 Blocpdb> 52 atoms in block 80 Block first atom: 3730 Blocpdb> 45 atoms in block 81 Block first atom: 3782 Blocpdb> 67 atoms in block 82 Block first atom: 3827 Blocpdb> 53 atoms in block 83 Block first atom: 3894 Blocpdb> 46 atoms in block 84 Block first atom: 3947 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3993 Blocpdb> 60 atoms in block 86 Block first atom: 4043 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 4103 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 4139 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 4181 Blocpdb> 66 atoms in block 90 Block first atom: 4245 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 4311 Blocpdb> 49 atoms in block 92 Block first atom: 4351 Blocpdb> 50 atoms in block 93 Block first atom: 4400 Blocpdb> 60 atoms in block 94 Block first atom: 4450 Blocpdb> 56 atoms in block 95 Block first atom: 4510 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 4566 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 4609 Blocpdb> 53 atoms in block 98 Block first atom: 4657 Blocpdb> 60 atoms in block 99 Block first atom: 4710 Blocpdb> 46 atoms in block 100 Block first atom: 4770 Blocpdb> 48 atoms in block 101 Block first atom: 4816 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 4864 Blocpdb> 50 atoms in block 103 Block first atom: 4902 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 4952 Blocpdb> 46 atoms in block 105 Block first atom: 4990 Blocpdb> 51 atoms in block 106 Block first atom: 5036 Blocpdb> 53 atoms in block 107 Block first atom: 5087 Blocpdb> 51 atoms in block 108 Block first atom: 5140 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 5191 Blocpdb> 46 atoms in block 110 Block first atom: 5241 Blocpdb> 48 atoms in block 111 Block first atom: 5287 Blocpdb> 51 atoms in block 112 Block first atom: 5335 Blocpdb> 36 atoms in block 113 Block first atom: 5386 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 5422 Blocpdb> 35 atoms in block 115 Block first atom: 5464 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 5499 Blocpdb> 58 atoms in block 117 Block first atom: 5537 Blocpdb> 40 atoms in block 118 Block first atom: 5595 Blocpdb> 51 atoms in block 119 Block first atom: 5635 Blocpdb> 58 atoms in block 120 Block first atom: 5686 Blocpdb> 38 atoms in block 121 Block first atom: 5744 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 5782 Blocpdb> 57 atoms in block 123 Block first atom: 5823 Blocpdb> 57 atoms in block 124 Block first atom: 5880 Blocpdb> 51 atoms in block 125 Block first atom: 5937 Blocpdb> 62 atoms in block 126 Block first atom: 5988 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 6050 Blocpdb> 64 atoms in block 128 Block first atom: 6091 Blocpdb> 42 atoms in block 129 Block first atom: 6155 Blocpdb> 47 atoms in block 130 Block first atom: 6197 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6244 Blocpdb> 34 atoms in block 132 Block first atom: 6292 Blocpdb> 45 atoms in block 133 Block first atom: 6326 Blocpdb> 51 atoms in block 134 Block first atom: 6371 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 6422 Blocpdb> 54 atoms in block 136 Block first atom: 6460 Blocpdb> 44 atoms in block 137 Block first atom: 6514 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 6558 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 6607 Blocpdb> 49 atoms in block 140 Block first atom: 6643 Blocpdb> 48 atoms in block 141 Block first atom: 6692 Blocpdb> 54 atoms in block 142 Block first atom: 6740 Blocpdb> 39 atoms in block 143 Block first atom: 6794 Blocpdb> 53 atoms in block 144 Block first atom: 6833 Blocpdb> 43 atoms in block 145 Block first atom: 6886 Blocpdb> 53 atoms in block 146 Block first atom: 6929 Blocpdb> 50 atoms in block 147 Block first atom: 6982 Blocpdb> 60 atoms in block 148 Block first atom: 7032 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 7092 Blocpdb> 63 atoms in block 150 Block first atom: 7146 Blocpdb> 41 atoms in block 151 Block first atom: 7209 Blocpdb> 57 atoms in block 152 Block first atom: 7250 Blocpdb> 32 atoms in block 153 Block first atom: 7307 Blocpdb> 54 atoms in block 154 Block first atom: 7339 Blocpdb> 53 atoms in block 155 Block first atom: 7393 Blocpdb> 25 atoms in block 156 Block first atom: 7446 Blocpdb> 51 atoms in block 157 Block first atom: 7471 Blocpdb> 43 atoms in block 158 Block first atom: 7522 Blocpdb> 43 atoms in block 159 Block first atom: 7565 Blocpdb> 50 atoms in block 160 Block first atom: 7608 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 7658 Blocpdb> 33 atoms in block 162 Block first atom: 7701 Blocpdb> 48 atoms in block 163 Block first atom: 7734 Blocpdb> 33 atoms in block 164 Block first atom: 7782 Blocpdb> 54 atoms in block 165 Block first atom: 7815 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 7869 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 7905 Blocpdb> 55 atoms in block 168 Block first atom: 7947 Blocpdb> 35 atoms in block 169 Block first atom: 8002 Blocpdb> 59 atoms in block 170 Block first atom: 8037 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 8096 Blocpdb> 45 atoms in block 172 Block first atom: 8138 Blocpdb> 44 atoms in block 173 Block first atom: 8183 Blocpdb> 58 atoms in block 174 Block first atom: 8227 Blocpdb> 67 atoms in block 175 Block first atom: 8285 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 8352 Blocpdb> 47 atoms in block 177 Block first atom: 8394 Blocpdb> 57 atoms in block 178 Block first atom: 8441 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8498 Blocpdb> 37 atoms in block 180 Block first atom: 8542 Blocpdb> 59 atoms in block 181 Block first atom: 8579 Blocpdb> 66 atoms in block 182 Block first atom: 8638 Blocpdb> 47 atoms in block 183 Block first atom: 8704 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8751 Blocpdb> 37 atoms in block 185 Block first atom: 8794 Blocpdb> 50 atoms in block 186 Block first atom: 8830 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 25 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6687239 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26640 Prepmat> Matrix trace = 14766920.0000 Prepmat> Last element read: 26640 26640 666.2869 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 15156 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8880 RTB> Total mass = 8880.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8880 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 496601.7429 RTB> 77670 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 77670 Diagstd> Projected matrix trace = 496601.7429 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 496601.7429 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9159149 1.5764770 2.9711568 7.0127488 7.8779029 9.6088182 18.1103262 19.0934838 21.5508313 21.8185523 23.6426765 25.4341595 26.5353120 29.0317983 29.7766062 32.4404781 33.4117577 34.3217589 37.0239569 38.7235278 40.1262455 41.0654596 41.5483346 42.3656309 43.5421711 43.8476141 45.1361566 45.9524507 46.3436628 47.0116260 47.6977614 48.9140101 49.5179014 49.9572742 50.1841169 51.0105719 51.4465244 52.8396533 53.6109459 54.0050386 55.8166595 56.3795444 57.1745344 57.6645272 59.5707064 60.3462818 60.9473176 61.4349784 61.8246639 63.8530747 67.0983295 68.0438423 68.6635038 69.9930186 71.7996347 72.5770074 73.7860529 75.3733958 76.9821922 77.6212196 79.1465353 79.2545999 79.4762151 83.3528656 84.1353596 84.8788981 86.4628960 88.0803421 91.0310954 91.8990619 92.5627157 92.6826983 93.5723427 96.0284866 96.2357652 97.5189395 98.6969281 99.9322914 100.3908364 101.5494795 101.8940976 102.6550352 104.0321894 105.6390804 106.3614767 108.8779465 109.4293978 110.6647963 111.5834495 112.0836081 113.0373977 114.4567189 116.3197632 117.0028218 117.7832285 119.4397649 120.9647620 121.4544764 122.0925526 123.9878088 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034308 0.0034334 0.0034335 0.0034335 0.0034340 0.0034350 103.9256716 136.3449642 187.1794058 287.5672482 304.7899136 336.6125227 462.1238857 474.5018044 504.1122993 507.2338707 528.0117664 547.6511141 559.3805727 585.1028985 592.5607469 618.4988596 627.6896131 636.1800532 660.7492759 675.7448403 687.8750278 695.8788289 699.9581759 706.8090793 716.5563025 719.0651879 729.5542103 736.1216978 739.2485103 744.5569405 749.9706686 759.4722584 764.1460904 767.5287417 769.2693398 775.5778130 778.8849284 789.3602632 795.1004792 798.0175097 811.2920139 815.3725028 821.1010333 824.6119954 838.1305196 843.5688579 847.7593307 851.1441828 853.8393428 867.7331468 889.5106129 895.7559365 899.8254260 908.4952106 920.1452694 925.1130525 932.7868602 942.7668889 952.7751409 956.7214506 966.0758689 966.7351714 968.0858414 991.4151426 996.0578394 1000.4494429 1009.7414143 1019.1421804 1036.0725430 1041.0002151 1044.7522721 1045.4291724 1050.4346316 1064.1315572 1065.2794080 1072.3579235 1078.8153025 1085.5459295 1088.0336234 1094.2942849 1096.1495099 1100.2348787 1107.5903151 1116.1115086 1119.9211832 1133.0921764 1135.9580276 1142.3522059 1147.0838672 1149.6518216 1154.5330127 1161.7586807 1171.1756519 1174.6093358 1178.5201368 1186.7787195 1194.3310357 1196.7461616 1199.8856710 1209.1627864 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8880 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.576 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.971 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.013 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.878 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 159840 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407122107363414786.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407122107363414786.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2407122107363414786.atom Openam> file on opening on unit 11: 2407122107363414786.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 556 First residue number = 1 Last residue number = 562 Number of atoms found = 8880 Mean number per residue = 16.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.576 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.971 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.013 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.878 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0 Bfactors> 106 vectors, 26640 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.915900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.006 +/- 0.00 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.006 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407122107363414786.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407122107363414786.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1094. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Chkmod> 106 vectors, 26640 coordinates in file. Chkmod> That is: 8880 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9329 0.0034 0.9323 0.0034 0.8530 0.0034 0.7410 0.0034 0.9181 0.0034 0.7079 103.9204 0.7560 136.3185 0.7136 187.1664 0.7476 287.5601 0.7558 304.7787 0.6569 336.6013 0.7675 462.0999 0.4246 474.4381 0.1028 504.0809 0.2983 507.2289 0.3331 527.9592 0.4197 547.5828 0.2938 559.4060 0.1785 585.0597 0.2823 592.5691 0.2612 618.4678 0.4292 627.6462 0.4751 636.1364 0.4615 660.6856 0.1421 675.6851 0.1929 687.8777 0.2876 695.8874 0.1386 699.9422 0.3864 706.8152 0.3490 716.5077 0.2494 719.0539 0.4026 729.5540 0.3688 736.0705 0.2887 739.1876 0.4339 744.5121 0.0394 749.9561 0.2290 759.4085 0.3058 764.1295 0.4815 767.5167 0.4036 769.2048 0.5553 775.5402 0.4995 778.8778 0.5238 789.3290 0.4659 795.0593 0.4281 798.0199 0.4202 811.2815 0.5493 815.3408 0.3229 821.0332 0.4767 824.5442 0.4436 838.0896 0.4847 843.5586 0.3645 847.7416 0.2827 851.0732 0.3715 853.7705 0.3405 867.6750 0.3568 889.4835 0.2209 895.6922 0.2331 899.7638 0.4772 908.4366 0.4361 920.1081 0.4967 925.0924 0.4486 932.7718 0.3298 942.7052 0.3286 952.7207 0.3356 956.6729 0.3718 966.0555 0.3135 966.6656 0.3259 968.0673 0.4089 991.3555 0.2500 996.0425 0.2165 1000.4130 0.4054 1009.6812 0.4511 1019.0965 0.3717 1036.0218 0.3891 1040.9608 0.5263 1044.6921 0.3881 1045.3691 0.4905 1050.3764 0.3920 1064.0943 0.4020 1065.2571 0.5085 1072.3177 0.4710 1078.7858 0.5736 1085.4869 0.4190 1088.0366 0.4145 1093.9807 0.4901 1096.1342 0.3857 1100.4286 0.4332 1107.3714 0.2662 1115.8571 0.4155 1120.0759 0.2729 1133.1583 0.4280 1135.7567 0.4669 1142.4848 0.5432 1147.1197 0.5101 1149.6865 0.4188 1154.2925 0.4312 1161.9284 0.3428 1171.0259 0.5348 1174.5447 0.4220 1178.5534 0.4860 1186.5302 0.3850 1194.4537 0.4285 1196.9190 0.4262 1199.8708 0.5079 1209.1703 0.4473 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2407122107363414786 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom making animated gifs 11 models are in 2407122107363414786.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2407122107363414786 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom making animated gifs 11 models are in 2407122107363414786.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2407122107363414786 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom making animated gifs 11 models are in 2407122107363414786.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2407122107363414786 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom making animated gifs 11 models are in 2407122107363414786.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2407122107363414786 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407122107363414786.eigenfacs 2407122107363414786.atom making animated gifs 11 models are in 2407122107363414786.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407122107363414786.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2407122107363414786.10.pdb 2407122107363414786.11.pdb 2407122107363414786.7.pdb 2407122107363414786.8.pdb 2407122107363414786.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m46.074s user 0m45.827s sys 0m0.208s rm: cannot remove '2407122107363414786.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.