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***  hsp90  ***

LOGs for ID: 2407052049042402197

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2407052049042402197.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2407052049042402197.atom to be opened. Openam> File opened: 2407052049042402197.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 746 First residue number = 294 Last residue number = 699 Number of atoms found = 6154 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = -29.403377 +/- 22.104404 From: -76.950000 To: 24.930000 = -67.045334 +/- 20.527420 From: -117.289000 To: -18.435000 = 22.027357 +/- 15.993008 From: -17.482000 To: 61.754000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3107 % Filled. Pdbmat> 2233820 non-zero elements. Pdbmat> 244134 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.34 +/- 22.58 Maximum number = 129 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 4.882680E+06 Pdbmat> Larger element = 492.674 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 746 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2407052049042402197.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2407052049042402197.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2407052049042402197.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6154 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 746 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 33 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 72 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 103 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 141 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 177 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 207 Blocpdb> 31 atoms in block 8 Block first atom: 246 Blocpdb> 37 atoms in block 9 Block first atom: 277 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 314 Blocpdb> 37 atoms in block 11 Block first atom: 340 Blocpdb> 32 atoms in block 12 Block first atom: 377 Blocpdb> 36 atoms in block 13 Block first atom: 409 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 445 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 479 Blocpdb> 38 atoms in block 16 Block first atom: 512 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 550 Blocpdb> 30 atoms in block 18 Block first atom: 587 Blocpdb> 34 atoms in block 19 Block first atom: 617 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 651 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 687 Blocpdb> 26 atoms in block 22 Block first atom: 725 Blocpdb> 31 atoms in block 23 Block first atom: 751 Blocpdb> 7 atoms in block 24 Block first atom: 782 Blocpdb> 32 atoms in block 25 Block first atom: 789 Blocpdb> 32 atoms in block 26 Block first atom: 821 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 853 Blocpdb> 31 atoms in block 28 Block first atom: 889 Blocpdb> 36 atoms in block 29 Block first atom: 920 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 956 Blocpdb> 35 atoms in block 31 Block first atom: 985 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1020 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1058 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1099 Blocpdb> 29 atoms in block 35 Block first atom: 1133 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1162 Blocpdb> 34 atoms in block 37 Block first atom: 1197 Blocpdb> 32 atoms in block 38 Block first atom: 1231 Blocpdb> 36 atoms in block 39 Block first atom: 1263 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1299 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 1336 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1359 Blocpdb> 37 atoms in block 43 Block first atom: 1389 Blocpdb> 32 atoms in block 44 Block first atom: 1426 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1458 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 1493 Blocpdb> 31 atoms in block 47 Block first atom: 1532 Blocpdb> 33 atoms in block 48 Block first atom: 1563 Blocpdb> 29 atoms in block 49 Block first atom: 1596 Blocpdb> 29 atoms in block 50 Block first atom: 1625 Blocpdb> 39 atoms in block 51 Block first atom: 1654 Blocpdb> 31 atoms in block 52 Block first atom: 1693 Blocpdb> 36 atoms in block 53 Block first atom: 1724 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 1760 Blocpdb> 37 atoms in block 55 Block first atom: 1792 Blocpdb> 31 atoms in block 56 Block first atom: 1829 Blocpdb> 37 atoms in block 57 Block first atom: 1860 Blocpdb> 29 atoms in block 58 Block first atom: 1897 Blocpdb> 28 atoms in block 59 Block first atom: 1926 Blocpdb> 29 atoms in block 60 Block first atom: 1954 Blocpdb> 32 atoms in block 61 Block first atom: 1983 Blocpdb> 35 atoms in block 62 Block first atom: 2015 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2050 Blocpdb> 36 atoms in block 64 Block first atom: 2086 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 2122 Blocpdb> 31 atoms in block 66 Block first atom: 2158 Blocpdb> 34 atoms in block 67 Block first atom: 2189 Blocpdb> 33 atoms in block 68 Block first atom: 2223 Blocpdb> 34 atoms in block 69 Block first atom: 2256 Blocpdb> 30 atoms in block 70 Block first atom: 2290 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2320 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 2353 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 2380 Blocpdb> 32 atoms in block 74 Block first atom: 2407 Blocpdb> 30 atoms in block 75 Block first atom: 2439 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 2469 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 2505 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2530 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 2563 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 2596 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 2627 Blocpdb> 37 atoms in block 82 Block first atom: 2659 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 2696 Blocpdb> 34 atoms in block 84 Block first atom: 2723 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2757 Blocpdb> 31 atoms in block 86 Block first atom: 2787 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 2818 Blocpdb> 27 atoms in block 88 Block first atom: 2854 Blocpdb> 27 atoms in block 89 Block first atom: 2881 Blocpdb> 32 atoms in block 90 Block first atom: 2908 Blocpdb> 31 atoms in block 91 Block first atom: 2940 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 2971 Blocpdb> 36 atoms in block 93 Block first atom: 3010 Blocpdb> 24 atoms in block 94 Block first atom: 3046 Blocpdb> 38 atoms in block 95 Block first atom: 3070 Blocpdb> 33 atoms in block 96 Block first atom: 3108 Blocpdb> 31 atoms in block 97 Block first atom: 3141 Blocpdb> 38 atoms in block 98 Block first atom: 3172 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3210 Blocpdb> 30 atoms in block 100 Block first atom: 3246 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 3276 Blocpdb> 31 atoms in block 102 Block first atom: 3315 Blocpdb> 37 atoms in block 103 Block first atom: 3346 Blocpdb> 26 atoms in block 104 Block first atom: 3383 Blocpdb> 37 atoms in block 105 Block first atom: 3409 Blocpdb> 32 atoms in block 106 Block first atom: 3446 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 3478 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 3514 Blocpdb> 33 atoms in block 109 Block first atom: 3548 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 3581 Blocpdb> 37 atoms in block 111 Block first atom: 3619 Blocpdb> 30 atoms in block 112 Block first atom: 3656 Blocpdb> 34 atoms in block 113 Block first atom: 3686 Blocpdb> 36 atoms in block 114 Block first atom: 3720 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 3756 Blocpdb> 26 atoms in block 116 Block first atom: 3794 Blocpdb> 31 atoms in block 117 Block first atom: 3820 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 3851 Blocpdb> 32 atoms in block 119 Block first atom: 3858 Blocpdb> 32 atoms in block 120 Block first atom: 3890 Blocpdb> 36 atoms in block 121 Block first atom: 3922 Blocpdb> 31 atoms in block 122 Block first atom: 3958 Blocpdb> 36 atoms in block 123 Block first atom: 3989 Blocpdb> 29 atoms in block 124 Block first atom: 4025 Blocpdb> 35 atoms in block 125 Block first atom: 4054 Blocpdb> 38 atoms in block 126 Block first atom: 4089 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 4127 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 4168 Blocpdb> 29 atoms in block 129 Block first atom: 4202 Blocpdb> 35 atoms in block 130 Block first atom: 4231 Blocpdb> 34 atoms in block 131 Block first atom: 4266 Blocpdb> 32 atoms in block 132 Block first atom: 4300 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 4332 Blocpdb> 37 atoms in block 134 Block first atom: 4368 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 4405 Blocpdb> 30 atoms in block 136 Block first atom: 4428 Blocpdb> 37 atoms in block 137 Block first atom: 4458 Blocpdb> 32 atoms in block 138 Block first atom: 4495 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 4527 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 4562 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4601 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4632 Blocpdb> 29 atoms in block 143 Block first atom: 4665 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 4694 Blocpdb> 39 atoms in block 145 Block first atom: 4723 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 4762 Blocpdb> 36 atoms in block 147 Block first atom: 4793 Blocpdb> 32 atoms in block 148 Block first atom: 4829 Blocpdb> 37 atoms in block 149 Block first atom: 4861 Blocpdb> 31 atoms in block 150 Block first atom: 4898 Blocpdb> 37 atoms in block 151 Block first atom: 4929 Blocpdb> 29 atoms in block 152 Block first atom: 4966 Blocpdb> 28 atoms in block 153 Block first atom: 4995 Blocpdb> 29 atoms in block 154 Block first atom: 5023 Blocpdb> 32 atoms in block 155 Block first atom: 5052 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 5084 Blocpdb> 36 atoms in block 157 Block first atom: 5119 Blocpdb> 36 atoms in block 158 Block first atom: 5155 Blocpdb> 36 atoms in block 159 Block first atom: 5191 Blocpdb> 31 atoms in block 160 Block first atom: 5227 Blocpdb> 34 atoms in block 161 Block first atom: 5258 Blocpdb> 33 atoms in block 162 Block first atom: 5292 Blocpdb> 34 atoms in block 163 Block first atom: 5325 Blocpdb> 30 atoms in block 164 Block first atom: 5359 Blocpdb> 33 atoms in block 165 Block first atom: 5389 Blocpdb> 27 atoms in block 166 Block first atom: 5422 Blocpdb> 27 atoms in block 167 Block first atom: 5449 Blocpdb> 32 atoms in block 168 Block first atom: 5476 Blocpdb> 30 atoms in block 169 Block first atom: 5508 Blocpdb> 36 atoms in block 170 Block first atom: 5538 Blocpdb> 25 atoms in block 171 Block first atom: 5574 Blocpdb> 33 atoms in block 172 Block first atom: 5599 Blocpdb> 33 atoms in block 173 Block first atom: 5632 Blocpdb> 31 atoms in block 174 Block first atom: 5665 Blocpdb> 32 atoms in block 175 Block first atom: 5696 Blocpdb> 37 atoms in block 176 Block first atom: 5728 Blocpdb> 27 atoms in block 177 Block first atom: 5765 Blocpdb> 34 atoms in block 178 Block first atom: 5792 Blocpdb> 30 atoms in block 179 Block first atom: 5826 Blocpdb> 31 atoms in block 180 Block first atom: 5856 Blocpdb> 36 atoms in block 181 Block first atom: 5887 Blocpdb> 27 atoms in block 182 Block first atom: 5923 Blocpdb> 27 atoms in block 183 Block first atom: 5950 Blocpdb> 32 atoms in block 184 Block first atom: 5977 Blocpdb> 31 atoms in block 185 Block first atom: 6009 Blocpdb> 39 atoms in block 186 Block first atom: 6040 Blocpdb> 36 atoms in block 187 Block first atom: 6079 Blocpdb> 24 atoms in block 188 Block first atom: 6115 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 6138 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2234009 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18462 Prepmat> Matrix trace = 4882680.0000 Prepmat> Last element read: 18462 18462 140.2058 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 16304 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6154 RTB> Total mass = 6154.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6154 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 212646.0527 RTB> 56601 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56601 Diagstd> Projected matrix trace = 212646.0527 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 212646.0527 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0590261 0.1021267 0.2732213 0.3601955 0.5434293 0.6448057 1.0774045 1.5221787 1.5930310 2.3310805 2.9211033 3.1143713 3.8275739 4.2996285 4.3398221 4.5020340 4.9381534 5.3338434 5.9770789 6.4907860 6.6190801 7.6415550 7.9135978 8.4639829 8.9023044 9.4326796 9.6358544 10.3031694 10.3906651 11.2358715 11.4730177 11.9453836 12.5316951 12.9387658 13.3323625 13.5280890 13.8830882 14.3661997 14.8153575 14.9988083 15.5401655 16.8078315 16.9651281 17.0774573 17.1514565 17.5779147 17.8547238 17.9437731 18.3037270 18.5724842 19.0216561 19.5009711 19.7621939 20.0722960 20.6751579 20.7237939 21.3436708 21.4261264 21.8809102 22.0348887 22.1918110 22.6579136 22.7066548 23.3114474 23.7402825 24.6881416 25.1068977 25.5215454 25.9297510 26.2174841 26.5023078 26.8773313 27.1883500 27.5856870 28.2733974 28.8201153 29.3272656 29.5286771 29.8437875 30.2042088 30.6545461 31.2682713 31.6464123 31.7578082 32.3871479 32.7032002 32.9552564 33.3091100 33.4838942 33.6646127 34.0424783 34.4955902 34.9375748 35.1634137 35.4395226 35.7321107 36.1559332 36.3153355 36.4937105 36.7571373 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034329 0.0034334 0.0034336 0.0034345 0.0034349 26.3825898 34.7028295 56.7613311 65.1725081 80.0510053 87.1986435 112.7157658 133.9763388 137.0589479 165.7959487 185.5960531 191.6374897 212.4501658 225.1701143 226.2201278 230.4091201 241.3112488 250.7930005 265.4848699 276.6584416 279.3792189 300.1830409 305.4796373 315.9240363 324.0011122 333.5130414 337.0857505 348.5625307 350.0394195 363.9977193 367.8189599 375.3144889 384.4148801 390.6085146 396.5051546 399.4050077 404.6115933 411.5913407 417.9760027 420.5558302 428.0781883 445.1958659 447.2742040 448.7525039 449.7237092 455.2804028 458.8511751 459.9939972 464.5848523 467.9832175 473.6084513 479.5384107 482.7395251 486.5122798 493.7643123 494.3447349 501.6835223 502.6516486 507.9581957 509.7423427 511.5541974 516.8984603 517.4541313 524.3000511 529.1005599 539.5596693 544.1163884 548.5911092 552.9609385 556.0204778 559.0325909 562.9740190 566.2219564 570.3444012 577.4099705 582.9658808 588.0727649 590.0886691 593.2288309 596.8002722 601.2328830 607.2216057 610.8822711 611.9564844 617.9902633 620.9982933 623.3868371 626.7246766 628.3668435 630.0602654 633.5864265 637.7890671 641.8619895 643.9331682 646.4563591 649.1194401 652.9577305 654.3955095 656.0006827 658.3640686 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6154 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9026E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3602 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.331 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.300 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.977 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.619 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 110772 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407052049042402197.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407052049042402197.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2407052049042402197.atom Openam> file on opening on unit 11: 2407052049042402197.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 746 First residue number = 294 Last residue number = 699 Number of atoms found = 6154 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9026E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3602 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.331 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.300 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.977 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.619 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.76 Bfactors> 106 vectors, 18462 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.059026 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.270 for 746 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.109 +/- 0.10 Bfactors> = 94.707 +/- 20.83 Bfactors> Shiftng-fct= 94.597 Bfactors> Scaling-fct= 203.235 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407052049042402197.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407052049042402197.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9 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Chkmod> That is: 6154 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8449 0.0034 0.9633 0.0034 0.7965 0.0034 0.7766 0.0034 0.8478 0.0034 0.9577 26.3814 0.5019 34.6968 0.6070 56.7567 0.6732 65.1701 0.5832 80.0454 0.4779 87.1945 0.7204 112.6898 0.7670 133.9627 0.6867 137.0517 0.6231 165.7860 0.5933 185.5848 0.5438 191.6178 0.6046 212.4529 0.5309 225.1702 0.4902 226.2151 0.2951 230.3984 0.7111 241.2971 0.5064 250.7859 0.3640 265.4717 0.1248 276.6511 0.5060 279.3655 0.6166 300.1789 0.5677 305.4743 0.2592 315.9108 0.4479 323.9817 0.4362 333.5044 0.2119 337.0738 0.1093 348.4940 0.1945 350.0132 0.2579 364.0490 0.1264 367.7548 0.3855 375.3709 0.1810 384.3724 0.4297 390.6104 0.3603 396.4530 0.3512 399.4161 0.3168 404.5492 0.3653 411.6281 0.2230 418.0235 0.2268 420.5545 0.4304 428.0575 0.4494 445.2055 0.3363 447.3192 0.2343 448.7666 0.1953 449.6853 0.2362 455.2879 0.1900 458.7708 0.2169 459.9259 0.3971 464.5176 0.4162 467.9318 0.2872 473.5675 0.1439 479.5059 0.2037 482.6920 0.2998 486.4636 0.2488 493.8009 0.4001 494.2783 0.2428 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DQ=-80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407052049042402197.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2407052049042402197 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom making animated gifs 11 models are in 2407052049042402197.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407052049042402197.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407052049042402197.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2407052049042402197 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407052049042402197.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2407052049042402197 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407052049042402197.eigenfacs 2407052049042402197.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407052049042402197.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407052049042402197.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2407052049042402197.10.pdb 2407052049042402197.11.pdb 2407052049042402197.7.pdb 2407052049042402197.8.pdb 2407052049042402197.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m32.298s user 0m32.177s sys 0m0.100s rm: cannot remove '2407052049042402197.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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