***  4qg6  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2407051322282258162.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2407051322282258162.atom to be opened.
Openam> File opened: 2407051322282258162.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 502
First residue number = 24
Last residue number = 531
Number of atoms found = 3849
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 15.819650 +/- 13.080091 From: -13.131000 To: 49.027000
= -0.309847 +/- 17.965081 From: -38.222000 To: 40.640000
= 1.951725 +/- 11.123158 From: -26.586000 To: 27.904000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.0999 % Filled.
Pdbmat> 1400026 non-zero elements.
Pdbmat> 153013 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.51 +/- 21.32
Maximum number = 131
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 3.060260E+06
Pdbmat> Larger element = 498.201
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
502 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2407051322282258162.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2407051322282258162.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2407051322282258162.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3849 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 502 residues.
Blocpdb> 26 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 27 atoms in block 2
Block first atom: 27
Blocpdb> 25 atoms in block 3
Block first atom: 54
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 79
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 103
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 124
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 146
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 170
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 189
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 210
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 229
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 251
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 273
Blocpdb> 25 atoms in block 14
Block first atom: 297
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 322
Blocpdb> 23 atoms in block 16
Block first atom: 341
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 364
Blocpdb> 25 atoms in block 18
Block first atom: 388
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 413
Blocpdb> 31 atoms in block 20
Block first atom: 434
Blocpdb> 24 atoms in block 21
Block first atom: 465
Blocpdb> 24 atoms in block 22
Block first atom: 489
Blocpdb> 26 atoms in block 23
Block first atom: 513
Blocpdb> 19 atoms in block 24
Block first atom: 539
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 558
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 584
Blocpdb> 23 atoms in block 27
Block first atom: 603
Blocpdb> 27 atoms in block 28
Block first atom: 626
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 653
Blocpdb> 21 atoms in block 30
Block first atom: 672
Blocpdb> 20 atoms in block 31
Block first atom: 693
Blocpdb> 24 atoms in block 32
Block first atom: 713
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 737
Blocpdb> 25 atoms in block 34
Block first atom: 759
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 784
Blocpdb> 9 atoms in block 36
Block first atom: 805
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 814
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 832
Blocpdb> 23 atoms in block 39
Block first atom: 856
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 879
Blocpdb> 29 atoms in block 41
Block first atom: 900
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 929
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 952
Blocpdb> 30 atoms in block 44
Block first atom: 977
Blocpdb> 29 atoms in block 45
Block first atom: 1007
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 1036
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1058
Blocpdb> 20 atoms in block 48
Block first atom: 1081
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1101
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1124
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 1151
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1171
Blocpdb> 25 atoms in block 53
Block first atom: 1193
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1218
Blocpdb> 24 atoms in block 55
Block first atom: 1240
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1264
Blocpdb> 25 atoms in block 57
Block first atom: 1286
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 1311
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 1327
Blocpdb> 24 atoms in block 60
Block first atom: 1345
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 1369
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 1388
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 1407
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1424
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1447
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1465
Blocpdb> 25 atoms in block 67
Block first atom: 1491
Blocpdb> 28 atoms in block 68
Block first atom: 1516
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1544
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1564
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1588
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1611
Blocpdb> 30 atoms in block 73
Block first atom: 1633
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1663
Blocpdb> 25 atoms in block 75
Block first atom: 1683
Blocpdb> 27 atoms in block 76
Block first atom: 1708
Blocpdb> 24 atoms in block 77
Block first atom: 1735
Blocpdb> 22 atoms in block 78
Block first atom: 1759
Blocpdb> 21 atoms in block 79
Block first atom: 1781
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1802
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1827
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 1850
Blocpdb> 23 atoms in block 83
Block first atom: 1875
Blocpdb> 29 atoms in block 84
Block first atom: 1898
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 1927
Blocpdb> 25 atoms in block 86
Block first atom: 1955
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 1980
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1999
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2019
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 2042
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 2062
Blocpdb> 20 atoms in block 92
Block first atom: 2083
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2103
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2128
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2152
Blocpdb> 20 atoms in block 96
Block first atom: 2178
Blocpdb> 25 atoms in block 97
Block first atom: 2198
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2223
Blocpdb> 23 atoms in block 99
Block first atom: 2243
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 2266
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 2285
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 2309
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2332
Blocpdb> 27 atoms in block 104
Block first atom: 2357
Blocpdb> 25 atoms in block 105
Block first atom: 2384
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 2409
Blocpdb> 21 atoms in block 107
Block first atom: 2427
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 2448
Blocpdb> 23 atoms in block 109
Block first atom: 2466
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 2489
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2506
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 2528
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 2546
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 2567
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 2588
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2615
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 2636
Blocpdb> 26 atoms in block 118
Block first atom: 2664
Blocpdb> 25 atoms in block 119
Block first atom: 2690
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 2715
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 2734
Blocpdb> 27 atoms in block 122
Block first atom: 2759
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 2786
Blocpdb> 28 atoms in block 124
Block first atom: 2814
Blocpdb> 24 atoms in block 125
Block first atom: 2842
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2866
Blocpdb> 21 atoms in block 127
Block first atom: 2888
Blocpdb> 21 atoms in block 128
Block first atom: 2909
Blocpdb> 19 atoms in block 129
Block first atom: 2930
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 2949
Blocpdb> 20 atoms in block 131
Block first atom: 2965
Blocpdb> 26 atoms in block 132
Block first atom: 2985
Blocpdb> 16 atoms in block 133
Block first atom: 3011
Blocpdb> 21 atoms in block 134
Block first atom: 3027
Blocpdb> 22 atoms in block 135
Block first atom: 3048
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 3070
Blocpdb> 22 atoms in block 137
Block first atom: 3089
Blocpdb> 26 atoms in block 138
Block first atom: 3111
Blocpdb> 28 atoms in block 139
Block first atom: 3137
Blocpdb> 29 atoms in block 140
Block first atom: 3165
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 3194
Blocpdb> 20 atoms in block 142
Block first atom: 3214
Blocpdb> 26 atoms in block 143
Block first atom: 3234
Blocpdb> 23 atoms in block 144
Block first atom: 3260
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 3283
Blocpdb> 23 atoms in block 146
Block first atom: 3308
Blocpdb> 27 atoms in block 147
Block first atom: 3331
Blocpdb> 26 atoms in block 148
Block first atom: 3358
Blocpdb> 21 atoms in block 149
Block first atom: 3384
Blocpdb> 24 atoms in block 150
Block first atom: 3405
Blocpdb> 25 atoms in block 151
Block first atom: 3429
Blocpdb> 24 atoms in block 152
Block first atom: 3454
Blocpdb> 24 atoms in block 153
Block first atom: 3478
Blocpdb> 27 atoms in block 154
Block first atom: 3502
Blocpdb> 26 atoms in block 155
Block first atom: 3529
Blocpdb> 21 atoms in block 156
Block first atom: 3555
Blocpdb> 20 atoms in block 157
Block first atom: 3576
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 3596
Blocpdb> 31 atoms in block 159
Block first atom: 3616
Blocpdb> 21 atoms in block 160
Block first atom: 3647
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 3668
Blocpdb> 22 atoms in block 162
Block first atom: 3690
Blocpdb> 29 atoms in block 163
Block first atom: 3712
Blocpdb> 17 atoms in block 164
Block first atom: 3741
Blocpdb> 22 atoms in block 165
Block first atom: 3758
Blocpdb> 23 atoms in block 166
Block first atom: 3780
Blocpdb> 25 atoms in block 167
Block first atom: 3803
Blocpdb> 22 atoms in block 168
Block first atom: 3827
Blocpdb> 168 blocks.
Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1400194 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11547
Prepmat> Matrix trace = 3060260.0000
Prepmat> Last element read: 11547 11547 155.7368
Prepmat> 14197 lines saved.
Prepmat> 12558 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3849
RTB> Total mass = 3849.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3849
RTB> Number of blocks = 168
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 209798.7304
RTB> 56448 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1008
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56448
Diagstd> Projected matrix trace = 209798.7304
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1008 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 209798.7304
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6328830 0.8349910 1.2387767 2.1139174
2.2484761 2.5027721 3.5589344 4.4658630 5.0116814
5.4192844 6.1940933 6.8935051 7.5511975 8.2954128
8.5440381 9.2915913 9.9786365 10.0556297 11.0443192
12.0553398 12.3132013 12.5856556 12.7630463 13.3711531
14.4785207 15.8268782 16.1506947 16.2249628 16.8130626
17.7347451 18.0625647 19.1035949 19.3836597 19.7166369
20.4178672 20.9899583 21.0590958 22.0834000 22.5182143
23.1895599 23.7481318 24.1721976 24.8313959 25.3320943
26.8546377 27.1883916 28.1636830 28.4858743 28.8122261
29.3854073 30.0343009 30.1268358 30.8724604 31.2856126
31.8291142 32.0566410 32.6269101 33.0331902 33.5142621
33.6670140 34.2605574 34.3823877 34.8012696 35.5664622
36.8894211 37.3512510 37.5736841 38.5533574 38.6659275
39.6632079 39.9122516 41.0099197 41.4028271 41.9091238
42.4537614 43.1094374 43.4618979 44.0700533 44.5327482
44.7710061 45.4390399 45.7710735 46.1045243 46.7972027
47.3141643 48.0901981 48.2438107 48.9766604 49.9992013
50.3861499 50.8603929 51.3816817 51.9202261 52.3877050
53.2819127 53.4516772 53.8894091 54.1759890 54.9274611
55.0105510
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034316 0.0034331 0.0034334 0.0034337 0.0034347
0.0034348 86.3887100 99.2284449 120.8625602 157.8844230
162.8318741 171.7931854 204.8591058 229.4816583 243.1011462
252.7937025 270.2614799 285.1118919 298.4030062 312.7622155
317.4145785 331.0094021 343.0290353 344.3498652 360.8816134
377.0378998 381.0489505 385.2416218 387.9470485 397.0815530
413.1972059 432.0091145 436.4061718 437.4084158 445.2651405
457.3069010 461.5141148 474.6274259 478.0938629 482.1827833
490.6823848 497.5091450 498.3278288 510.3031508 515.3025054
522.9275630 529.1880217 533.8919199 541.1228176 546.5511695
562.7362982 566.2223898 576.2885678 579.5755518 582.8860846
588.6554074 595.1193123 596.0353807 603.3660935 607.3899642
612.6431141 614.8289194 620.2735372 624.1235055 628.6517243
630.0827355 635.6125918 636.7417062 640.6086882 647.6130842
659.5476852 663.6633830 665.6365642 674.2584258 675.2420757
683.8946379 686.0383513 695.4080917 698.7314295 702.9906854
707.5438618 712.9867476 715.8954859 720.8867912 724.6612330
726.5971791 731.9979309 734.6675027 737.3387407 742.8570121
746.9488571 753.0495671 754.2513267 759.9584782 767.8507517
770.8162599 774.4352915 778.3939246 782.4625632 785.9772344
792.6567886 793.9185491 797.1627393 799.2795555 804.8038456
805.4123371
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3849
Rtb_to_modes> Number of blocs = 168
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9861E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6329
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.239
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.248
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.466
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.012
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.419
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.551
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.295
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.544
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.979
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.01
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1008 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 0.99998 0.99995
0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
0.99997 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001
0.99997 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001
0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997
0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998
0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 69282 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 0.99998 0.99995
0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
0.99997 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001
0.99997 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001
0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997
0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998
0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407051322282258162.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407051322282258162.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2407051322282258162.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407051322282258162.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 502
First residue number = 24
Last residue number = 531
Number of atoms found = 3849
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9861E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6329
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.239
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.248
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.466
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.419
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.894
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.551
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.295
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.979
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.01
Bfactors> 106 vectors, 11547 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.632900
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.517 for 502 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.036 +/- 0.04
Bfactors> = 40.157 +/- 28.48
Bfactors> Shiftng-fct= 40.121
Bfactors> Scaling-fct= 798.680
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407051322282258162.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407051322282258162.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Chkmod> 106 vectors, 11547 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3849 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 40 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7548
0.0034 0.8192
0.0034 0.9841
0.0034 0.7301
0.0034 0.7487
0.0034 0.9966
86.3862 0.5442
99.2247 0.5022
120.8683 0.3434
157.8807 0.2232
162.8076 0.5596
171.7936 0.4244
204.8522 0.5224
229.4753 0.1237
243.0984 0.2043
252.7762 0.1616
270.2478 0.5191
285.1099 0.4336
298.3863 0.3864
312.7410 0.5589
317.4002 0.2474
331.0025 0.1602
343.0206 0.4198
344.4099 0.3761
360.7956 0.2018
377.0946 0.2344
380.9831 0.3661
385.2916 0.5513
387.8841 0.1788
397.0474 0.5763
413.2006 0.2088
432.0332 0.4471
436.3781 0.3527
437.3227 0.3173
445.2055 0.3249
457.2261 0.2805
461.4615 0.2594
474.5624 0.4179
478.0282 0.3155
482.2032 0.2425
490.6869 0.4606
497.4883 0.3927
498.3171 0.4299
510.2420 0.2292
515.3008 0.2574
522.9101 0.3457
529.1861 0.4785
533.8447 0.4940
541.0844 0.3885
546.5051 0.3750
562.6635 0.5250
566.2148 0.1649
576.2261 0.3923
579.5926 0.3577
582.8385 0.5197
588.6761 0.2056
595.0512 0.3041
596.0411 0.4366
603.3162 0.4344
607.4065 0.4568
612.6253 0.4351
614.8347 0.4738
620.2763 0.2758
624.0666 0.6132
628.5848 0.3683
630.0836 0.2939
635.5801 0.2661
636.6923 0.3041
640.5695 0.4796
647.6175 0.5424
659.5245 0.4347
663.6238 0.5011
665.5754 0.5755
674.2001 0.4701
675.2486 0.5568
683.8376 0.3787
685.9896 0.5691
695.3789 0.4437
698.6776 0.5102
702.9679 0.3861
707.4821 0.2866
712.9608 0.3959
715.8491 0.4696
720.8554 0.4634
724.6078 0.3046
726.5578 0.4444
731.9742 0.4789
734.6273 0.3241
737.2709 0.2005
742.8473 0.4849
746.8839 0.3442
753.0157 0.4670
754.1892 0.3728
759.9518 0.5190
767.8239 0.3957
770.8126 0.3996
774.3991 0.4869
778.3478 0.3314
782.4273 0.3044
785.9607 0.4055
792.6085 0.4692
793.8720 0.4900
797.1329 0.3680
799.2748 0.3783
804.7879 0.4206
805.3737 0.3689
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2407051322282258162 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
making animated gifs
11 models are in 2407051322282258162.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2407051322282258162 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
making animated gifs
11 models are in 2407051322282258162.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2407051322282258162 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
making animated gifs
11 models are in 2407051322282258162.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2407051322282258162 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
making animated gifs
11 models are in 2407051322282258162.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2407051322282258162 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407051322282258162.eigenfacs
2407051322282258162.atom
making animated gifs
11 models are in 2407051322282258162.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407051322282258162.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2407051322282258162.10.pdb
2407051322282258162.11.pdb
2407051322282258162.7.pdb
2407051322282258162.8.pdb
2407051322282258162.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.991s
user 0m18.907s
sys 0m0.084s
rm: cannot remove '2407051322282258162.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|