***  cyp121_perturbations  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2406282151071460988.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2406282151071460988.atom to be opened.
Openam> File opened: 2406282151071460988.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 394
First residue number = 3
Last residue number = 396
Number of atoms found = 6194
Mean number per residue = 15.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.339100 +/- 12.553589 From: -23.029000 To: 35.466000
= 21.494247 +/- 10.498494 From: -11.350000 To: 45.635000
= -11.340939 +/- 13.153649 From: -40.079000 To: 21.705000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.7082 % Filled.
Pdbmat> 4675901 non-zero elements.
Pdbmat> 515493 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 166.45 +/- 48.03
Maximum number = 259
Minimum number = 25
Pdbmat> Matrix trace = 1.030986E+07
Pdbmat> Larger element = 910.453
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
394 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2406282151071460988.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2406282151071460988.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2406282151071460988.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6194 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 394 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 35 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 34 atoms in block 3
Block first atom: 59
Blocpdb> 30 atoms in block 4
Block first atom: 93
Blocpdb> 31 atoms in block 5
Block first atom: 123
Blocpdb> 34 atoms in block 6
Block first atom: 154
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 188
Blocpdb> 43 atoms in block 8
Block first atom: 207
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 250
Blocpdb> 26 atoms in block 10
Block first atom: 276
Blocpdb> 25 atoms in block 11
Block first atom: 302
Blocpdb> 43 atoms in block 12
Block first atom: 327
Blocpdb> 38 atoms in block 13
Block first atom: 370
Blocpdb> 37 atoms in block 14
Block first atom: 408
Blocpdb> 43 atoms in block 15
Block first atom: 445
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 488
Blocpdb> 38 atoms in block 17
Block first atom: 526
Blocpdb> 33 atoms in block 18
Block first atom: 564
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 597
Blocpdb> 33 atoms in block 20
Block first atom: 614
Blocpdb> 43 atoms in block 21
Block first atom: 647
Blocpdb> 27 atoms in block 22
Block first atom: 690
Blocpdb> 32 atoms in block 23
Block first atom: 717
Blocpdb> 29 atoms in block 24
Block first atom: 749
Blocpdb> 25 atoms in block 25
Block first atom: 778
Blocpdb> 33 atoms in block 26
Block first atom: 803
Blocpdb> 34 atoms in block 27
Block first atom: 836
Blocpdb> 36 atoms in block 28
Block first atom: 870
Blocpdb> 44 atoms in block 29
Block first atom: 906
Blocpdb> 35 atoms in block 30
Block first atom: 950
Blocpdb> 37 atoms in block 31
Block first atom: 985
Blocpdb> 24 atoms in block 32
Block first atom: 1022
Blocpdb> 20 atoms in block 33
Block first atom: 1046
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 1066
Blocpdb> 38 atoms in block 35
Block first atom: 1083
Blocpdb> 33 atoms in block 36
Block first atom: 1121
Blocpdb> 29 atoms in block 37
Block first atom: 1154
Blocpdb> 30 atoms in block 38
Block first atom: 1183
Blocpdb> 28 atoms in block 39
Block first atom: 1213
Blocpdb> 31 atoms in block 40
Block first atom: 1241
Blocpdb> 30 atoms in block 41
Block first atom: 1272
Blocpdb> 31 atoms in block 42
Block first atom: 1302
Blocpdb> 21 atoms in block 43
Block first atom: 1333
Blocpdb> 29 atoms in block 44
Block first atom: 1354
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 1383
Blocpdb> 26 atoms in block 46
Block first atom: 1405
Blocpdb> 46 atoms in block 47
Block first atom: 1431
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1477
Blocpdb> 39 atoms in block 49
Block first atom: 1503
Blocpdb> 29 atoms in block 50
Block first atom: 1542
Blocpdb> 28 atoms in block 51
Block first atom: 1571
Blocpdb> 32 atoms in block 52
Block first atom: 1599
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1631
Blocpdb> 34 atoms in block 54
Block first atom: 1652
Blocpdb> 37 atoms in block 55
Block first atom: 1686
Blocpdb> 43 atoms in block 56
Block first atom: 1723
Blocpdb> 26 atoms in block 57
Block first atom: 1766
Blocpdb> 24 atoms in block 58
Block first atom: 1792
Blocpdb> 34 atoms in block 59
Block first atom: 1816
Blocpdb> 31 atoms in block 60
Block first atom: 1850
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1881
Blocpdb> 33 atoms in block 62
Block first atom: 1914
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1947
Blocpdb> 24 atoms in block 64
Block first atom: 1969
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1993
Blocpdb> 43 atoms in block 66
Block first atom: 2015
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 2058
Blocpdb> 30 atoms in block 68
Block first atom: 2084
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 2114
Blocpdb> 29 atoms in block 70
Block first atom: 2140
Blocpdb> 24 atoms in block 71
Block first atom: 2169
Blocpdb> 35 atoms in block 72
Block first atom: 2193
Blocpdb> 33 atoms in block 73
Block first atom: 2228
Blocpdb> 35 atoms in block 74
Block first atom: 2261
Blocpdb> 26 atoms in block 75
Block first atom: 2296
Blocpdb> 31 atoms in block 76
Block first atom: 2322
Blocpdb> 27 atoms in block 77
Block first atom: 2353
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 2380
Blocpdb> 41 atoms in block 79
Block first atom: 2401
Blocpdb> 44 atoms in block 80
Block first atom: 2442
Blocpdb> 30 atoms in block 81
Block first atom: 2486
Blocpdb> 30 atoms in block 82
Block first atom: 2516
Blocpdb> 30 atoms in block 83
Block first atom: 2546
Blocpdb> 28 atoms in block 84
Block first atom: 2576
Blocpdb> 21 atoms in block 85
Block first atom: 2604
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2625
Blocpdb> 33 atoms in block 87
Block first atom: 2651
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 2684
Blocpdb> 41 atoms in block 89
Block first atom: 2704
Blocpdb> 38 atoms in block 90
Block first atom: 2745
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 2783
Blocpdb> 31 atoms in block 92
Block first atom: 2819
Blocpdb> 45 atoms in block 93
Block first atom: 2850
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2895
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2922
Blocpdb> 34 atoms in block 96
Block first atom: 2948
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2982
Blocpdb> 33 atoms in block 98
Block first atom: 3010
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 3043
Blocpdb> 26 atoms in block 100
Block first atom: 3071
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 3097
Blocpdb> 34 atoms in block 102
Block first atom: 3121
Blocpdb> 39 atoms in block 103
Block first atom: 3155
Blocpdb> 43 atoms in block 104
Block first atom: 3194
Blocpdb> 34 atoms in block 105
Block first atom: 3237
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 3271
Blocpdb> 36 atoms in block 107
Block first atom: 3295
Blocpdb> 41 atoms in block 108
Block first atom: 3331
Blocpdb> 23 atoms in block 109
Block first atom: 3372
Blocpdb> 34 atoms in block 110
Block first atom: 3395
Blocpdb> 30 atoms in block 111
Block first atom: 3429
Blocpdb> 33 atoms in block 112
Block first atom: 3459
Blocpdb> 23 atoms in block 113
Block first atom: 3492
Blocpdb> 34 atoms in block 114
Block first atom: 3515
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 3549
Blocpdb> 17 atoms in block 116
Block first atom: 3576
Blocpdb> 35 atoms in block 117
Block first atom: 3593
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 3628
Blocpdb> 22 atoms in block 119
Block first atom: 3653
Blocpdb> 39 atoms in block 120
Block first atom: 3675
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 3714
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 3742
Blocpdb> 30 atoms in block 123
Block first atom: 3771
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 3801
Blocpdb> 51 atoms in block 125
Block first atom: 3839
Blocpdb> 31 atoms in block 126
Block first atom: 3890
Blocpdb> 43 atoms in block 127
Block first atom: 3921
Blocpdb> 33 atoms in block 128
Block first atom: 3964
Blocpdb> 35 atoms in block 129
Block first atom: 3997
Blocpdb> 37 atoms in block 130
Block first atom: 4032
Blocpdb> 29 atoms in block 131
Block first atom: 4069
Blocpdb> 38 atoms in block 132
Block first atom: 4098
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 4136
Blocpdb> 23 atoms in block 134
Block first atom: 4160
Blocpdb> 30 atoms in block 135
Block first atom: 4183
Blocpdb> 38 atoms in block 136
Block first atom: 4213
Blocpdb> 43 atoms in block 137
Block first atom: 4251
Blocpdb> 33 atoms in block 138
Block first atom: 4294
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 4327
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 4362
Blocpdb> 26 atoms in block 141
Block first atom: 4384
Blocpdb> 38 atoms in block 142
Block first atom: 4410
Blocpdb> 29 atoms in block 143
Block first atom: 4448
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 4477
Blocpdb> 31 atoms in block 145
Block first atom: 4501
Blocpdb> 33 atoms in block 146
Block first atom: 4532
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 4565
Blocpdb> 35 atoms in block 148
Block first atom: 4584
Blocpdb> 40 atoms in block 149
Block first atom: 4619
Blocpdb> 29 atoms in block 150
Block first atom: 4659
Blocpdb> 34 atoms in block 151
Block first atom: 4688
Blocpdb> 35 atoms in block 152
Block first atom: 4722
Blocpdb> 35 atoms in block 153
Block first atom: 4757
Blocpdb> 34 atoms in block 154
Block first atom: 4792
Blocpdb> 17 atoms in block 155
Block first atom: 4826
Blocpdb> 34 atoms in block 156
Block first atom: 4843
Blocpdb> 26 atoms in block 157
Block first atom: 4877
Blocpdb> 31 atoms in block 158
Block first atom: 4903
Blocpdb> 34 atoms in block 159
Block first atom: 4934
Blocpdb> 28 atoms in block 160
Block first atom: 4968
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 4996
Blocpdb> 34 atoms in block 162
Block first atom: 5018
Blocpdb> 31 atoms in block 163
Block first atom: 5052
Blocpdb> 38 atoms in block 164
Block first atom: 5083
Blocpdb> 28 atoms in block 165
Block first atom: 5121
Blocpdb> 25 atoms in block 166
Block first atom: 5149
Blocpdb> 35 atoms in block 167
Block first atom: 5174
Blocpdb> 30 atoms in block 168
Block first atom: 5209
Blocpdb> 31 atoms in block 169
Block first atom: 5239
Blocpdb> 24 atoms in block 170
Block first atom: 5270
Blocpdb> 36 atoms in block 171
Block first atom: 5294
Blocpdb> 24 atoms in block 172
Block first atom: 5330
Blocpdb> 18 atoms in block 173
Block first atom: 5354
Blocpdb> 29 atoms in block 174
Block first atom: 5372
Blocpdb> 31 atoms in block 175
Block first atom: 5401
Blocpdb> 40 atoms in block 176
Block first atom: 5432
Blocpdb> 27 atoms in block 177
Block first atom: 5472
Blocpdb> 26 atoms in block 178
Block first atom: 5499
Blocpdb> 34 atoms in block 179
Block first atom: 5525
Blocpdb> 29 atoms in block 180
Block first atom: 5559
Blocpdb> 41 atoms in block 181
Block first atom: 5588
Blocpdb> 39 atoms in block 182
Block first atom: 5629
Blocpdb> 21 atoms in block 183
Block first atom: 5668
Blocpdb> 28 atoms in block 184
Block first atom: 5689
Blocpdb> 29 atoms in block 185
Block first atom: 5717
Blocpdb> 30 atoms in block 186
Block first atom: 5746
Blocpdb> 31 atoms in block 187
Block first atom: 5776
Blocpdb> 36 atoms in block 188
Block first atom: 5807
Blocpdb> 40 atoms in block 189
Block first atom: 5843
Blocpdb> 38 atoms in block 190
Block first atom: 5883
Blocpdb> 44 atoms in block 191
Block first atom: 5921
Blocpdb> 41 atoms in block 192
Block first atom: 5965
Blocpdb> 43 atoms in block 193
Block first atom: 6006
Blocpdb> 29 atoms in block 194
Block first atom: 6049
Blocpdb> 43 atoms in block 195
Block first atom: 6078
Blocpdb> 30 atoms in block 196
Block first atom: 6121
Blocpdb> 44 atoms in block 197
Block first atom: 6150
Blocpdb> 197 blocks.
Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4676098 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 18582
Prepmat> Matrix trace = 10309860.0000
Prepmat> Last element read: 18582 18582 443.2332
Prepmat> 19504 lines saved.
Prepmat> 16937 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6194
RTB> Total mass = 6194.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6194
RTB> Number of blocks = 197
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 556808.9805
RTB> 89421 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1182
Diagstd> Nb of non-zero elements: 89421
Diagstd> Projected matrix trace = 556808.9805
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1182 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 556808.9805
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.0562200 6.9159741 7.6410235 8.7907985
10.4678903 12.1429589 13.3185984 15.6476282 16.2858867
18.6419450 21.1564636 23.3032301 26.2559350 26.7551720
28.3472901 30.5876468 32.3127056 33.6976833 36.1326004
39.5008619 40.0201029 42.5453725 43.5898797 45.0197364
45.5323594 47.4656019 49.6119075 50.1911277 51.0230843
52.2646170 53.5338201 55.1258802 56.8749684 57.7472820
58.5832253 60.3096628 60.9369476 62.1883538 63.8741180
64.2039135 65.9709381 66.7080030 67.9571616 69.1322591
70.8257008 72.2592999 72.7693304 75.3334544 76.2188587
77.7879334 80.2195820 80.8586146 81.1538989 82.5980761
84.1422047 85.9777271 87.2540936 88.5544157 89.0682573
90.7433318 92.1524988 92.8363449 94.3975337 96.1373847
97.7818699 98.9905893 99.2558999 100.9609134 101.9343410
103.2262770 104.0726323 105.2072497 105.5915888 107.2844718
108.1596576 108.4506596 108.8441087 111.2944785 111.9102762
113.2481984 114.9460839 115.2229519 116.3850060 117.9310605
119.1724138 120.6832206 120.9668610 121.8054817 124.0740463
124.7195141 126.4128405 127.6241490 127.8792806 129.2621353
129.7108042 130.6439311 132.2063517 132.8719589 134.6339341
135.5841995
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034336 0.0034341 0.0034342 0.0034348
0.0034360 218.7036500 285.5761670 300.1726014 321.9655787
351.3377873 378.4055892 396.3004279 429.5557520 438.2288702
468.8575262 499.4785219 524.2076352 556.4280619 561.6931845
578.1640108 600.5764712 617.2796253 630.3696602 652.7470071
682.4935730 686.9646361 708.3068562 716.9487563 728.6127293
732.7492081 748.1432749 764.8710847 769.3230720 775.6729277
785.0533415 794.5283495 806.2561656 818.9471286 825.2034869
831.1548038 843.3128742 847.6872059 856.3470593 867.8761197
870.1137484 882.0061432 886.9195950 895.1852052 902.8916877
913.8832566 923.0859804 926.3379781 942.5170635 948.0396493
957.7483159 972.6027150 976.4689278 978.2502669 986.9161279
996.0983572 1006.9044503 1014.3508234 1021.8811576 1024.8416283
1034.4336526 1042.4346490 1046.2953539 1055.0562245 1064.7347587
1073.8025953 1080.4190549 1081.8659341 1091.1184910 1096.3659522
1103.2918560 1107.8055840 1113.8279559 1115.8605980 1124.7699731
1129.3483774 1130.8666042 1132.9160876 1145.5975858 1148.7625368
1155.6090414 1164.2396081 1165.6409036 1171.5040568 1179.2594963
1185.4497467 1192.9403431 1194.3413978 1198.4742214 1209.5832191
1212.7254323 1220.9303100 1226.7659406 1227.9915335 1234.6132773
1236.7540926 1241.1946650 1248.5945665 1251.7337126 1260.0058121
1264.4446435
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6194
Rtb_to_modes> Number of blocs = 197
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.056
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.641
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.791
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.6
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 111492 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406282151071460988.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406282151071460988.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2406282151071460988.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2406282151071460988.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 394
First residue number = 3
Last residue number = 396
Number of atoms found = 6194
Mean number per residue = 15.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.056
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.641
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.791
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.6
Bfactors> 106 vectors, 18582 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.056000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.260 for 394 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.006 +/- 0.02
Bfactors> = 11.064 +/- 3.75
Bfactors> Shiftng-fct= 11.058
Bfactors> Scaling-fct= 168.940
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406282151071460988.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406282151071460988.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1198.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1241.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264.
Chkmod> 106 vectors, 18582 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6194 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7517
0.0034 0.8311
0.0034 0.8970
0.0034 0.7397
0.0034 0.7101
0.0034 0.9877
218.6883 0.0045
285.5644 0.4215
300.1593 0.0359
321.9554 0.2780
351.3581 0.3638
378.3432 0.2070
396.3043 0.1616
429.5699 0.5155
438.2654 0.3920
468.8129 0.7134
499.4988 0.7456
524.1488 0.5957
556.4472 0.5680
561.7197 0.5883
578.1668 0.3450
600.5738 0.5093
617.2273 0.3114
630.3643 0.3803
652.6955 0.2596
682.4568 0.2525
686.9343 0.2336
708.3150 0.2726
716.9190 0.3429
728.5836 0.3552
732.6988 0.3347
748.1458 0.3360
764.8235 0.4306
769.2814 0.3057
775.6162 0.4292
784.9850 0.4541
794.4659 0.3836
806.2517 0.3213
818.8762 0.1896
825.1875 0.4508
831.0962 0.3105
843.2790 0.2800
847.6720 0.2383
856.3216 0.3648
867.8109 0.3392
870.0499 0.4347
881.9620 0.3359
886.8948 0.2845
895.1655 0.4445
902.8382 0.4839
913.8718 0.4276
923.0508 0.5195
926.3025 0.5059
942.4550 0.3966
948.0060 0.4920
957.7199 0.4948
972.5635 0.3979
976.4354 0.4622
978.1848 0.4297
986.8853 0.2947
996.0425 0.2502
1006.8745 0.3591
1014.2835 0.3321
1021.8118 0.4168
1024.8077 0.3870
1034.3703 0.3264
1042.3758 0.3594
1046.2710 0.3103
1055.0247 0.2880
1064.7035 0.4282
1073.7462 0.2734
1080.3695 0.3371
1081.8418 0.3665
1091.2828 0.3743
1096.1342 0.3980
1103.1041 0.4597
1107.9037 0.1730
1113.7418 0.3336
1115.8571 0.3934
1124.8031 0.3236
1129.5105 0.5172
1131.0753 0.3582
1132.6379 0.4223
1145.5768 0.3929
1148.6605 0.2893
1155.3135 0.3804
1163.9562 0.4544
1165.4748 0.3625
1171.5292 0.3387
1179.0536 0.4368
1185.5360 0.4388
1192.9721 0.4656
1194.4537 0.3512
1198.3958 0.3217
1209.6578 0.4203
1212.5785 0.2845
1220.8159 0.3392
1226.5972 0.3073
1228.0383 0.3800
1234.7411 0.4219
1236.6495 0.3247
1240.9327 0.2746
1248.5110 0.3452
1251.8120 0.4624
1259.7929 0.4797
1264.4640 0.4280
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2406282151071460988 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
making animated gifs
11 models are in 2406282151071460988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2406282151071460988 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
making animated gifs
11 models are in 2406282151071460988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2406282151071460988 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
making animated gifs
11 models are in 2406282151071460988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2406282151071460988 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
making animated gifs
11 models are in 2406282151071460988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2406282151071460988 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406282151071460988.eigenfacs
2406282151071460988.atom
making animated gifs
11 models are in 2406282151071460988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406282151071460988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2406282151071460988.10.pdb
2406282151071460988.11.pdb
2406282151071460988.7.pdb
2406282151071460988.8.pdb
2406282151071460988.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m35.425s
user 0m35.296s
sys 0m0.128s
rm: cannot remove '2406282151071460988.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|