*** OXIDOREDUCTASE 27-SEP-05 2C29 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2406271141311183625.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2406271141311183625.atom to be opened.
Openam> File opened: 2406271141311183625.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2498
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 80.973991 +/- 9.206829 From: 56.675000 To: 102.429000
= 63.916871 +/- 12.628720 From: 34.525000 To: 94.584000
= 35.124890 +/- 10.884504 From: 7.113000 To: 61.231000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3813 % Filled.
Pdbmat> 949593 non-zero elements.
Pdbmat> 103860 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.15 +/- 22.16
Maximum number = 133
Minimum number = 18
Pdbmat> Matrix trace = 2.077200E+06
Pdbmat> Larger element = 522.925
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
324 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2406271141311183625.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2406271141311183625.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2406271141311183625.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2498 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 324 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 53
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 63
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 82
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 92
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 114
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 129
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 148
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 180
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 199
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 229
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 262
Blocpdb> 12 atoms in block 19
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 289
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 305
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 324
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 340
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 356
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 372
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 386
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 403
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 418
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 440
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 454
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 470
Blocpdb> 9 atoms in block 32
Block first atom: 483
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 492
Blocpdb> 13 atoms in block 34
Block first atom: 509
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 522
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 535
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 548
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 561
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 572
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 593
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 605
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 619
Blocpdb> 18 atoms in block 43
Block first atom: 635
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 653
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 664
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 679
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 696
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 712
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 729
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 743
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 760
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 772
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 784
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 800
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 815
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 826
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 836
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 852
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 870
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 889
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 907
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 920
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 931
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 942
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 957
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 974
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 993
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1010
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1024
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1044
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1059
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1079
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1093
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1106
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1123
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1139
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1157
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1172
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1191
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1213
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1231
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1246
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1261
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1275
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1289
Blocpdb> 19 atoms in block 86
Block first atom: 1308
Blocpdb> 10 atoms in block 87
Block first atom: 1327
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1337
Blocpdb> 11 atoms in block 89
Block first atom: 1354
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1365
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1384
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1399
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1415
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1429
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1444
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1455
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1473
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1489
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1501
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1516
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1529
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1545
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1557
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1571
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1586
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1597
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1614
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1629
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1647
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1663
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1683
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1696
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1714
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1732
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1748
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1762
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1775
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1793
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1813
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1833
Blocpdb> 11 atoms in block 121
Block first atom: 1848
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1859
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1872
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 1895
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1909
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1921
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 1939
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1953
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 1969
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 1985
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1999
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2015
Blocpdb> 17 atoms in block 133
Block first atom: 2033
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2050
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2066
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2086
Blocpdb> 12 atoms in block 137
Block first atom: 2101
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2113
Blocpdb> 11 atoms in block 139
Block first atom: 2129
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 2140
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2151
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2167
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2182
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2195
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2212
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2227
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2244
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2259
Blocpdb> 20 atoms in block 149
Block first atom: 2271
Blocpdb> 20 atoms in block 150
Block first atom: 2291
Blocpdb> 18 atoms in block 151
Block first atom: 2311
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2329
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2346
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 2362
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2387
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2396
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2411
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2424
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2440
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2453
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2469
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2482
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 949755 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7494
Prepmat> Matrix trace = 2077200.0000
Prepmat> Last element read: 7494 7494 284.9278
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11363 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2498
RTB> Total mass = 2498.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2498
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 229535.0772
RTB> 63810 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 63810
Diagstd> Projected matrix trace = 229535.0772
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 229535.0772
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.6840957 4.2510589 5.8981379 7.3544458
9.0910817 10.2792127 11.2839583 12.2053465 12.9320802
13.6691987 14.9092122 16.1014943 17.0772874 17.1781813
18.5802800 19.2834285 19.9808166 20.4641128 20.9646620
21.3092950 22.3674427 22.8782693 23.9418940 24.8708830
25.4848778 25.7311472 27.1912811 28.3721686 30.0473791
31.2840131 31.3265734 31.8187970 32.1886224 33.2731612
34.2333035 34.7678835 35.5960045 36.1827675 36.9907455
38.1478045 38.8289089 39.7047637 41.0395480 41.1790331
41.7721379 42.9838262 43.2338148 43.6524492 44.6367737
45.6255369 46.2335924 46.8241016 47.2913073 48.0995449
48.9062409 50.1984126 51.6655145 52.4258744 52.4773529
53.0353318 53.2168041 54.9654075 56.5568967 57.1860356
57.9777067 58.7700332 59.0759920 59.0820468 60.4106551
60.8986784 61.0361562 61.6187638 62.8586559 63.7638977
63.9382763 64.3879587 65.0795826 66.1368658 66.9425394
67.5683980 67.6631586 68.4018200 68.8826880 70.3813378
70.7545683 70.8228284 72.5991957 72.6787846 72.9729070
73.6268949 75.9170510 76.0373372 76.4335138 77.2296203
78.1944313 79.1741839 79.8537390 80.1066000 81.2363292
82.1736796
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034315 0.0034317 0.0034330 0.0034348 0.0034353
0.0034356 208.4302423 223.8947154 263.7258739 294.4897994
327.4183846 348.1570609 364.7757982 379.3764225 390.5075854
401.4826752 419.2978426 435.7409452 448.7502708 450.0739440
468.0814253 476.8561698 485.4023746 491.2377582 497.2092646
501.2793576 513.5744945 519.4058823 531.3424728 541.5528962
548.1968787 550.8392202 566.2524770 578.4176626 595.2488688
607.3744374 607.7874479 612.5438139 616.0932851 626.3863895
635.3597302 640.3013346 647.8819891 653.1999921 660.4528556
670.7026997 676.6636914 684.2528075 695.6592511 696.8404508
701.8408328 711.9472489 714.0145453 717.4631300 725.5071197
733.4985750 738.3700976 743.0704773 746.7684134 753.1227453
759.4119412 769.3789008 780.5408905 786.2635112 786.6494445
790.8205120 792.1723415 805.0817950 816.6539484 821.1836153
826.8482217 832.4789263 834.6430699 834.6858411 844.0186689
847.4209849 848.3769653 852.4163494 860.9497916 867.1269983
868.3118787 871.3599777 876.0273387 883.1146419 888.4773721
892.6209827 893.2466865 898.1091249 901.2604707 911.0118772
913.4242198 913.8647246 925.2544550 925.7614841 927.6328161
931.7802972 946.1607869 946.9100588 949.3736920 954.3050674
960.2475173 966.2445960 970.3823939 971.9175623 978.7469592
984.3774300
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2498
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9854E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.898
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.354
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.17
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001
1.00003 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44964 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
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1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406271141311183625.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406271141311183625.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2406271141311183625.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2406271141311183625.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2498
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9854E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.354
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.08
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.17
Bfactors> 106 vectors, 7494 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.684000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.743 for 325 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.020 +/- 0.02
Bfactors> = 32.124 +/- 8.40
Bfactors> Shiftng-fct= 32.104
Bfactors> Scaling-fct= 475.052
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406271141311183625.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406271141311183625.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.3
Chkmod> 106 vectors, 7494 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2498 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8325
0.0034 0.7474
0.0034 0.9720
0.0034 0.9026
0.0034 0.7087
0.0034 0.7407
208.4186 0.5521
223.8836 0.4138
263.7115 0.5642
294.4682 0.4893
327.4029 0.3238
348.1554 0.4058
364.6962 0.7727
379.4324 0.4881
390.4594 0.7400
401.4772 0.5953
419.2909 0.4225
435.7020 0.4692
448.7666 0.5705
450.0784 0.5982
468.0578 0.3722
476.7933 0.4032
485.3716 0.4013
491.1673 0.3386
497.1326 0.2817
501.2661 0.5523
513.5818 0.1294
519.4032 0.3362
531.2986 0.3861
541.5200 0.4524
548.1209 0.6009
550.8033 0.2902
566.2148 0.4474
578.3707 0.4103
595.2493 0.3132
607.3094 0.2661
607.7946 0.3630
612.5291 0.4295
616.0800 0.3660
626.3297 0.3295
635.3018 0.4312
640.2933 0.4379
647.8905 0.4207
653.1470 0.5735
660.4178 0.2473
670.6932 0.5372
676.6442 0.3345
684.1824 0.3536
695.6332 0.4253
696.8187 0.4229
701.7927 0.4079
711.8850 0.4214
713.9524 0.3390
717.4122 0.4317
725.5022 0.4945
733.5030 0.4325
738.3097 0.5588
743.0060 0.5993
746.7260 0.4878
753.0940 0.3040
759.4085 0.5942
769.3580 0.5566
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getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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2406271141311183625.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 12 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271141311183625 13 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2406271141311183625.eigenfacs
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2406271141311183625.eigenfacs
2406271141311183625.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406271141311183625.eigenfacs
2406271141311183625.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406271141311183625.eigenfacs
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2406271141311183625.eigenfacs
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2406271141311183625.eigenfacs
2406271141311183625.atom
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2406271141311183625.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2406271141311183625.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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11 models are in 2406271141311183625.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 14
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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getting mode 16
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making animated gifs
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271141311183625.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2406271141311183625.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m15.109s
user 0m14.982s
sys 0m0.076s
rm: cannot remove '2406271141311183625.sdijf': No such file or directory
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elNémo
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