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***  OXIDOREDUCTASE 27-SEP-05 2C29  ***

LOGs for ID: 2406271127291177026

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2406271127291177026.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2406271127291177026.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2406271127291177026.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    650
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    330
            Number of atoms found    =   5027
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    64.750015 +/-    19.565441 From:    16.615000 To:   102.429000
 =    45.670010 +/-    21.258410 From:     6.362000 To:    94.584000
 =    34.326318 +/-    10.935141 From:     7.113000 To:    62.178000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.6854 % Filled.
 Pdbmat>      1916743  non-zero elements.
 Pdbmat>       209649 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     83.41 +/-     22.04
         Maximum number =    133
         Minimum number =     15

 Pdbmat> Matrix trace   = 4.192980E+06
 Pdbmat> Larger element =  522.925    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
650 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2406271127291177026.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2406271127291177026.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2406271127291177026.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  5027 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   650 residues.
 Blocpdb>    29 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    23 atoms in block      2
 Block first atom:     30
 Blocpdb>    29 atoms in block      3
 Block first atom:     53
 Blocpdb>    32 atoms in block      4
 Block first atom:     82
 Blocpdb>    34 atoms in block      5
 Block first atom:    114
 Blocpdb>    32 atoms in block      6
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    37 atoms in block      7
 Block first atom:    180
 Blocpdb>    30 atoms in block      8
 Block first atom:    217
 Blocpdb>    30 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    28 atoms in block     10
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    35 atoms in block     11
 Block first atom:    305
 Blocpdb>    32 atoms in block     12
 Block first atom:    340
 Blocpdb>    31 atoms in block     13
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    37 atoms in block     14
 Block first atom:    403
 Blocpdb>    30 atoms in block     15
 Block first atom:    440
 Blocpdb>    22 atoms in block     16
 Block first atom:    470
 Blocpdb>    30 atoms in block     17
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    26 atoms in block     18
 Block first atom:    522
 Blocpdb>    24 atoms in block     19
 Block first atom:    548
 Blocpdb>    33 atoms in block     20
 Block first atom:    572
 Blocpdb>    30 atoms in block     21
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    29 atoms in block     22
 Block first atom:    635
 Blocpdb>    32 atoms in block     23
 Block first atom:    664
 Blocpdb>    33 atoms in block     24
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    31 atoms in block     25
 Block first atom:    729
 Blocpdb>    24 atoms in block     26
 Block first atom:    760
 Blocpdb>    31 atoms in block     27
 Block first atom:    784
 Blocpdb>    21 atoms in block     28
 Block first atom:    815
 Blocpdb>    34 atoms in block     29
 Block first atom:    836
 Blocpdb>    37 atoms in block     30
 Block first atom:    870
 Blocpdb>    24 atoms in block     31
 Block first atom:    907
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    931
 Blocpdb>    36 atoms in block     33
 Block first atom:    957
 Blocpdb>    31 atoms in block     34
 Block first atom:    993
 Blocpdb>    35 atoms in block     35
 Block first atom:   1024
 Blocpdb>    34 atoms in block     36
 Block first atom:   1059
 Blocpdb>    30 atoms in block     37
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    34 atoms in block     38
 Block first atom:   1123
 Blocpdb>    34 atoms in block     39
 Block first atom:   1157
 Blocpdb>    40 atoms in block     40
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    30 atoms in block     41
 Block first atom:   1231
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    38 atoms in block     43
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>    27 atoms in block     44
 Block first atom:   1327
 Blocpdb>    30 atoms in block     45
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1384
 Blocpdb>    29 atoms in block     47
 Block first atom:   1415
 Blocpdb>    29 atoms in block     48
 Block first atom:   1444
 Blocpdb>    28 atoms in block     49
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    28 atoms in block     50
 Block first atom:   1501
 Blocpdb>    28 atoms in block     51
 Block first atom:   1529
 Blocpdb>    29 atoms in block     52
 Block first atom:   1557
 Blocpdb>    28 atoms in block     53
 Block first atom:   1586
 Blocpdb>    33 atoms in block     54
 Block first atom:   1614
 Blocpdb>    36 atoms in block     55
 Block first atom:   1647
 Blocpdb>    31 atoms in block     56
 Block first atom:   1683
 Blocpdb>    34 atoms in block     57
 Block first atom:   1714
 Blocpdb>    27 atoms in block     58
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    38 atoms in block     59
 Block first atom:   1775
 Blocpdb>    35 atoms in block     60
 Block first atom:   1813
 Blocpdb>    24 atoms in block     61
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    37 atoms in block     62
 Block first atom:   1872
 Blocpdb>    30 atoms in block     63
 Block first atom:   1909
 Blocpdb>    30 atoms in block     64
 Block first atom:   1939
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    34 atoms in block     66
 Block first atom:   1999
 Blocpdb>    33 atoms in block     67
 Block first atom:   2033
 Blocpdb>    35 atoms in block     68
 Block first atom:   2066
 Blocpdb>    28 atoms in block     69
 Block first atom:   2101
 Blocpdb>    22 atoms in block     70
 Block first atom:   2129
 Blocpdb>    31 atoms in block     71
 Block first atom:   2151
 Blocpdb>    30 atoms in block     72
 Block first atom:   2182
 Blocpdb>    32 atoms in block     73
 Block first atom:   2212
 Blocpdb>    27 atoms in block     74
 Block first atom:   2244
 Blocpdb>    40 atoms in block     75
 Block first atom:   2271
 Blocpdb>    35 atoms in block     76
 Block first atom:   2311
 Blocpdb>    41 atoms in block     77
 Block first atom:   2346
 Blocpdb>    24 atoms in block     78
 Block first atom:   2387
 Blocpdb>    29 atoms in block     79
 Block first atom:   2411
 Blocpdb>    29 atoms in block     80
 Block first atom:   2440
 Blocpdb>    30 atoms in block     81
 Block first atom:   2469
 Blocpdb>    29 atoms in block     82
 Block first atom:   2499
 Blocpdb>    24 atoms in block     83
 Block first atom:   2528
 Blocpdb>    26 atoms in block     84
 Block first atom:   2552
 Blocpdb>    32 atoms in block     85
 Block first atom:   2578
 Blocpdb>    34 atoms in block     86
 Block first atom:   2610
 Blocpdb>    43 atoms in block     87
 Block first atom:   2644
 Blocpdb>    30 atoms in block     88
 Block first atom:   2687
 Blocpdb>    30 atoms in block     89
 Block first atom:   2717
 Blocpdb>    33 atoms in block     90
 Block first atom:   2747
 Blocpdb>    29 atoms in block     91
 Block first atom:   2780
 Blocpdb>    34 atoms in block     92
 Block first atom:   2809
 Blocpdb>    31 atoms in block     93
 Block first atom:   2843
 Blocpdb>    30 atoms in block     94
 Block first atom:   2874
 Blocpdb>    33 atoms in block     95
 Block first atom:   2904
 Blocpdb>    36 atoms in block     96
 Block first atom:   2937
 Blocpdb>    26 atoms in block     97
 Block first atom:   2973
 Blocpdb>    37 atoms in block     98
 Block first atom:   2999
 Blocpdb>    28 atoms in block     99
 Block first atom:   3036
 Blocpdb>    21 atoms in block    100
 Block first atom:   3064
 Blocpdb>    35 atoms in block    101
 Block first atom:   3085
 Blocpdb>    27 atoms in block    102
 Block first atom:   3120
 Blocpdb>    34 atoms in block    103
 Block first atom:   3147
 Blocpdb>    29 atoms in block    104
 Block first atom:   3181
 Blocpdb>    32 atoms in block    105
 Block first atom:   3210
 Blocpdb>    30 atoms in block    106
 Block first atom:   3242
 Blocpdb>    29 atoms in block    107
 Block first atom:   3272
 Blocpdb>    29 atoms in block    108
 Block first atom:   3301
 Blocpdb>    22 atoms in block    109
 Block first atom:   3330
 Blocpdb>    28 atoms in block    110
 Block first atom:   3352
 Blocpdb>    37 atoms in block    111
 Block first atom:   3380
 Blocpdb>    30 atoms in block    112
 Block first atom:   3417
 Blocpdb>    23 atoms in block    113
 Block first atom:   3447
 Blocpdb>    34 atoms in block    114
 Block first atom:   3470
 Blocpdb>    34 atoms in block    115
 Block first atom:   3504
 Blocpdb>    36 atoms in block    116
 Block first atom:   3538
 Blocpdb>    32 atoms in block    117
 Block first atom:   3574
 Blocpdb>    32 atoms in block    118
 Block first atom:   3606
 Blocpdb>    31 atoms in block    119
 Block first atom:   3638
 Blocpdb>    29 atoms in block    120
 Block first atom:   3669
 Blocpdb>    47 atoms in block    121
 Block first atom:   3698
 Blocpdb>    29 atoms in block    122
 Block first atom:   3745
 Blocpdb>    31 atoms in block    123
 Block first atom:   3774
 Blocpdb>    30 atoms in block    124
 Block first atom:   3805
 Blocpdb>    28 atoms in block    125
 Block first atom:   3835
 Blocpdb>    32 atoms in block    126
 Block first atom:   3863
 Blocpdb>    34 atoms in block    127
 Block first atom:   3895
 Blocpdb>    30 atoms in block    128
 Block first atom:   3929
 Blocpdb>    25 atoms in block    129
 Block first atom:   3959
 Blocpdb>    33 atoms in block    130
 Block first atom:   3984
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   4017
 Blocpdb>    29 atoms in block    132
 Block first atom:   4045
 Blocpdb>    26 atoms in block    133
 Block first atom:   4074
 Blocpdb>    27 atoms in block    134
 Block first atom:   4100
 Blocpdb>    36 atoms in block    135
 Block first atom:   4127
 Blocpdb>    33 atoms in block    136
 Block first atom:   4163
 Blocpdb>    33 atoms in block    137
 Block first atom:   4196
 Blocpdb>    33 atoms in block    138
 Block first atom:   4229
 Blocpdb>    30 atoms in block    139
 Block first atom:   4262
 Blocpdb>    35 atoms in block    140
 Block first atom:   4292
 Blocpdb>    36 atoms in block    141
 Block first atom:   4327
 Blocpdb>    27 atoms in block    142
 Block first atom:   4363
 Blocpdb>    35 atoms in block    143
 Block first atom:   4390
 Blocpdb>    28 atoms in block    144
 Block first atom:   4425
 Blocpdb>    30 atoms in block    145
 Block first atom:   4453
 Blocpdb>    29 atoms in block    146
 Block first atom:   4483
 Blocpdb>    36 atoms in block    147
 Block first atom:   4512
 Blocpdb>    31 atoms in block    148
 Block first atom:   4548
 Blocpdb>    37 atoms in block    149
 Block first atom:   4579
 Blocpdb>    30 atoms in block    150
 Block first atom:   4616
 Blocpdb>    24 atoms in block    151
 Block first atom:   4646
 Blocpdb>    31 atoms in block    152
 Block first atom:   4670
 Blocpdb>    30 atoms in block    153
 Block first atom:   4701
 Blocpdb>    30 atoms in block    154
 Block first atom:   4731
 Blocpdb>    31 atoms in block    155
 Block first atom:   4761
 Blocpdb>    35 atoms in block    156
 Block first atom:   4792
 Blocpdb>    35 atoms in block    157
 Block first atom:   4827
 Blocpdb>    36 atoms in block    158
 Block first atom:   4862
 Blocpdb>    30 atoms in block    159
 Block first atom:   4898
 Blocpdb>    32 atoms in block    160
 Block first atom:   4928
 Blocpdb>    26 atoms in block    161
 Block first atom:   4960
 Blocpdb>    28 atoms in block    162
 Block first atom:   4986
 Blocpdb>    14 atoms in block    163
 Block first atom:   5013

 Blocpdb>   163 blocks.

 Blocpdb> At most,     47 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    14 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1916906 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      15081

 Prepmat> Matrix trace    =    4192980.0000
 Prepmat> Last element read:   15081  15081        88.1131
 Prepmat>        13367 lines saved.
 Prepmat>        11847 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  5027
 RTB> Total mass =        5027.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  5027
 RTB> Number of blocks =   163
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  201686.3885
 RTB>     52239 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      978
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    52239
 Diagstd> Projected matrix trace =  201686.3885

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    978 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 201686.3885
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0246746      0.0301013      0.1869554      0.4077348
      0.5115133      0.7041428      4.7011276      4.8235182      5.5634636
      5.8722425      7.3247125      7.7295960      9.3530975      9.7902078
     12.2437751     13.1250881     13.3814083     13.8631190     14.6441130
     14.8347811     15.4723913     16.5160461     16.8289472     17.0360842
     17.3531023     17.7615054     19.2634155     20.1001311     20.9491592
     21.1851854     21.5939224     21.7646625     22.3297418     22.7344182
     24.3370116     24.4056963     24.8656042     25.5261781     26.3610188
     26.8383489     27.0575356     27.5558471     28.3101251     28.3852875
     28.8208394     29.4960309     30.2937051     30.8262653     31.7200865
     31.8713636     32.0515486     32.6669154     33.1201081     33.6186246
     33.9011522     34.8465806     36.0717645     36.5286243     37.8203852
     38.0093973     39.1471284     39.5456612     39.9422891     40.1797631
     40.8944755     41.3776989     42.1928453     43.1989987     43.4812597
     43.8856499     44.0430104     44.3277448     44.7913777     45.0794881
     45.3051399     45.5713713     46.8874797     47.0074575     47.5238987
     48.3133427     49.2195755     49.5664479     50.4420053     50.6388830
     50.8756710     50.9606021     51.9443205     52.7661394     53.0444508
     53.1920185     53.6140625     54.0024371     55.8662406     55.9720042
     56.2553235     56.8720709     58.0417744     58.0893326     58.5301460
     58.5743403

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034321      0.0034326      0.0034332      0.0034336      0.0034338
      0.0034345     17.0576900     18.8403033     46.9530962     69.3400499
     77.6647103     91.1225072    235.4487016    238.4938800    256.1343965
    263.1463020    293.8938999    301.9073448    332.1031633    339.7748549
    379.9731877    393.4109052    397.2337969    404.3204945    415.5533773
    418.2499060    427.1436954    441.3146290    445.4754291    448.2085831
    452.3596333    457.6517916    476.6086568    486.8494961    497.0253953
    499.8174504    504.6160372    506.6070725    513.1414906    517.7703806
    535.7089538    536.4643682    541.4954209    548.6408971    557.5404426
    562.5656069    564.8581504    570.0358416    577.7848822    578.5513731
    582.9732038    589.7623854    597.6837895    602.9145100    611.5929373
    613.0495854    614.7800824    620.6536936    624.9440719    629.6297655
    632.2699037    641.0255863    652.1972655    656.3144080    667.8182051
    669.4848777    679.4308075    682.8804839    686.2964547    688.3335946
    694.4286041    698.5193604    705.3662679    713.7269903    716.0549297
    719.3769987    720.6655767    722.9913458    726.7624670    729.0960882
    730.9186071    733.0630492    743.5731936    744.5239305    748.6025652
    754.7946682    761.8407732    764.5205770    771.2433849    772.7470197
    774.5515997    775.1978431    782.6440989    788.8109675    790.8884965
    791.9878437    795.1235899    797.9982886    811.6522634    812.4201931
    814.4737529    818.9262676    827.3049456    827.6438143    830.7781845
    831.0917727

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   5027
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    163

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9894E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9955E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.4675E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  3.0101E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1870    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4077    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5115    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7041    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.701    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.824    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.563    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.872    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.325    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.730    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.353    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.790    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.57    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    978 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 0.99998
 1.00003 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00005
 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00003

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    90486 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 0.99998
 1.00003 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00005
 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00003

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2406271127291177026.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2406271127291177026.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2406271127291177026.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2406271127291177026.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    650
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    330
            Number of atoms found    =   5027
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9894E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9955E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.4675E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  3.0101E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1870    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4077    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5115    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7041    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.701    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.824    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.563    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.872    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.325    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.730    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.353    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.790    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.57    

 Bfactors>  106 vectors,  15081 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.024675
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.637 for    654 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.273 +/-   0.14
 Bfactors> =     31.151 +/-   8.15
 Bfactors> Shiftng-fct=     30.878
 Bfactors> Scaling-fct=     57.128

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2406271127291177026.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2406271127291177026.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.6    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.0    

 Chkmod>  106 vectors,  15081 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   5027 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9720
      0.0034      0.7366
      0.0034      0.7964
      0.0034      0.7695
      0.0034      0.9638
      0.0034      0.7848
     17.0571      0.7692
     18.8394      0.7540
     46.9567      0.7342
     69.3341      0.7770
     77.6604      0.7462
     91.1158      0.7316
    235.4354      0.3469
    238.4956      0.3468
    256.1127      0.3849
    263.1296      0.3984
    293.8871      0.3448
    301.9023      0.3375
    332.0872      0.5015
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    393.4676      0.2812
    397.1958      0.3226
    404.2577      0.5136
    415.4772      0.4161
    418.1645      0.4623
    427.0924      0.2439
    441.3485      0.6793
    445.4702      0.6591
    448.2408      0.5090
    452.2998      0.4756
    457.6128      0.4049
    476.5459      0.2736
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    504.5485      0.5101
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    830.7415      0.4284
    831.0253      0.3346
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 12 -100 100 20 on 0
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 13 -100 100 20 on 0
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2406271127291177026.eigenfacs
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2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
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2406271127291177026.eigenfacs
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2406271127291177026.atom
making animated gifs
11 models are in 2406271127291177026.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 14 -100 100 20 on 0
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2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
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2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
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2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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2406271127291177026.atom
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2406271127291177026.atom
making animated gifs
11 models are in 2406271127291177026.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2406271127291177026.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 15 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2406271127291177026 16 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
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2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406271127291177026.eigenfacs
2406271127291177026.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406271127291177026.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
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making animated gifs
11 models are in 2406271127291177026.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406271127291177026.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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2406271127291177026.7.pdb
2406271127291177026.8.pdb
2406271127291177026.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m21.959s
user	0m21.879s
sys	0m0.080s
rm: cannot remove '2406271127291177026.sdijf': No such file or directory
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