*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240624215557714030.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240624215557714030.atom to be opened.
Openam> File opened: 240624215557714030.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1792
First residue number = 1
Last residue number = 70
Number of atoms found = 14307
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.004236 +/- 21.421370 From: -50.610000 To: 50.793000
= 0.003364 +/- 24.955096 From: -50.742000 To: 50.731000
= 0.127936 +/- 32.188251 From: -65.588000 To: 76.281000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5519 % Filled.
Pdbmat> 5083856 non-zero elements.
Pdbmat> 555426 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.64 +/- 23.59
Maximum number = 133
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 1.110852E+07
Pdbmat> Larger element = 491.260
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1792 non-zero elements, NRBL set to 9
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240624215557714030.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 9
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240624215557714030.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240624215557714030.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 14307 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 9 residue(s) per block.
Blocpdb> 1792 residues.
Blocpdb> 62 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 85 atoms in block 2
Block first atom: 63
Blocpdb> 66 atoms in block 3
Block first atom: 148
Blocpdb> 77 atoms in block 4
Block first atom: 214
Blocpdb> 85 atoms in block 5
Block first atom: 291
Blocpdb> 74 atoms in block 6
Block first atom: 376
Blocpdb> 70 atoms in block 7
Block first atom: 450
Blocpdb> 69 atoms in block 8
Block first atom: 520
Blocpdb> 76 atoms in block 9
Block first atom: 589
Blocpdb> 82 atoms in block 10
Block first atom: 665
Blocpdb> 69 atoms in block 11
Block first atom: 747
Blocpdb> 81 atoms in block 12
Block first atom: 816
Blocpdb> 67 atoms in block 13
Block first atom: 897
Blocpdb> 70 atoms in block 14
Block first atom: 964
Blocpdb> 70 atoms in block 15
Block first atom: 1034
Blocpdb> 71 atoms in block 16
Block first atom: 1104
Blocpdb> 64 atoms in block 17
Block first atom: 1175
Blocpdb> 67 atoms in block 18
Block first atom: 1239
Blocpdb> 77 atoms in block 19
Block first atom: 1306
Blocpdb> 84 atoms in block 20
Block first atom: 1383
Blocpdb> 64 atoms in block 21
Block first atom: 1467
Blocpdb> 67 atoms in block 22
Block first atom: 1531
Blocpdb> 65 atoms in block 23
Block first atom: 1598
Blocpdb> 61 atoms in block 24
Block first atom: 1663
Blocpdb> 74 atoms in block 25
Block first atom: 1724
Blocpdb> 59 atoms in block 26
Block first atom: 1798
Blocpdb> 76 atoms in block 27
Block first atom: 1857
Blocpdb> 82 atoms in block 28
Block first atom: 1933
Blocpdb> 61 atoms in block 29
Block first atom: 2015
Blocpdb> 71 atoms in block 30
Block first atom: 2076
Blocpdb> 64 atoms in block 31
Block first atom: 2147
Blocpdb> 67 atoms in block 32
Block first atom: 2211
Blocpdb> 67 atoms in block 33
Block first atom: 2278
Blocpdb> 71 atoms in block 34
Block first atom: 2345
Blocpdb> 68 atoms in block 35
Block first atom: 2416
Blocpdb> 62 atoms in block 36
Block first atom: 2484
Blocpdb> 72 atoms in block 37
Block first atom: 2546
Blocpdb> 69 atoms in block 38
Block first atom: 2618
Blocpdb> 73 atoms in block 39
Block first atom: 2687
Blocpdb> 70 atoms in block 40
Block first atom: 2760
Blocpdb> 71 atoms in block 41
Block first atom: 2830
Blocpdb> 77 atoms in block 42
Block first atom: 2901
Blocpdb> 68 atoms in block 43
Block first atom: 2978
Blocpdb> 81 atoms in block 44
Block first atom: 3046
Blocpdb> 86 atoms in block 45
Block first atom: 3127
Blocpdb> 70 atoms in block 46
Block first atom: 3213
Blocpdb> 80 atoms in block 47
Block first atom: 3283
Blocpdb> 75 atoms in block 48
Block first atom: 3363
Blocpdb> 67 atoms in block 49
Block first atom: 3438
Blocpdb> 70 atoms in block 50
Block first atom: 3505
Blocpdb> 66 atoms in block 51
Block first atom: 3575
Blocpdb> 70 atoms in block 52
Block first atom: 3641
Blocpdb> 72 atoms in block 53
Block first atom: 3711
Blocpdb> 87 atoms in block 54
Block first atom: 3783
Blocpdb> 78 atoms in block 55
Block first atom: 3870
Blocpdb> 82 atoms in block 56
Block first atom: 3948
Blocpdb> 69 atoms in block 57
Block first atom: 4030
Blocpdb> 67 atoms in block 58
Block first atom: 4099
Blocpdb> 70 atoms in block 59
Block first atom: 4166
Blocpdb> 65 atoms in block 60
Block first atom: 4236
Blocpdb> 78 atoms in block 61
Block first atom: 4301
Blocpdb> 70 atoms in block 62
Block first atom: 4379
Blocpdb> 70 atoms in block 63
Block first atom: 4449
Blocpdb> 78 atoms in block 64
Block first atom: 4519
Blocpdb> 62 atoms in block 65
Block first atom: 4597
Blocpdb> 60 atoms in block 66
Block first atom: 4659
Blocpdb> 76 atoms in block 67
Block first atom: 4719
Blocpdb> 62 atoms in block 68
Block first atom: 4795
Blocpdb> 93 atoms in block 69
Block first atom: 4857
Blocpdb> 81 atoms in block 70
Block first atom: 4950
Blocpdb> 73 atoms in block 71
Block first atom: 5031
Blocpdb> 72 atoms in block 72
Block first atom: 5104
Blocpdb> 72 atoms in block 73
Block first atom: 5176
Blocpdb> 64 atoms in block 74
Block first atom: 5248
Blocpdb> 57 atoms in block 75
Block first atom: 5312
Blocpdb> 73 atoms in block 76
Block first atom: 5369
Blocpdb> 82 atoms in block 77
Block first atom: 5442
Blocpdb> 77 atoms in block 78
Block first atom: 5524
Blocpdb> 26 atoms in block 79
Block first atom: 5601
Blocpdb> 62 atoms in block 80
Block first atom: 5627
Blocpdb> 85 atoms in block 81
Block first atom: 5689
Blocpdb> 66 atoms in block 82
Block first atom: 5774
Blocpdb> 77 atoms in block 83
Block first atom: 5840
Blocpdb> 85 atoms in block 84
Block first atom: 5917
Blocpdb> 74 atoms in block 85
Block first atom: 6002
Blocpdb> 70 atoms in block 86
Block first atom: 6076
Blocpdb> 69 atoms in block 87
Block first atom: 6146
Blocpdb> 76 atoms in block 88
Block first atom: 6215
Blocpdb> 82 atoms in block 89
Block first atom: 6291
Blocpdb> 69 atoms in block 90
Block first atom: 6373
Blocpdb> 81 atoms in block 91
Block first atom: 6442
Blocpdb> 67 atoms in block 92
Block first atom: 6523
Blocpdb> 70 atoms in block 93
Block first atom: 6590
Blocpdb> 70 atoms in block 94
Block first atom: 6660
Blocpdb> 71 atoms in block 95
Block first atom: 6730
Blocpdb> 64 atoms in block 96
Block first atom: 6801
Blocpdb> 67 atoms in block 97
Block first atom: 6865
Blocpdb> 77 atoms in block 98
Block first atom: 6932
Blocpdb> 84 atoms in block 99
Block first atom: 7009
Blocpdb> 64 atoms in block 100
Block first atom: 7093
Blocpdb> 67 atoms in block 101
Block first atom: 7157
Blocpdb> 65 atoms in block 102
Block first atom: 7224
Blocpdb> 61 atoms in block 103
Block first atom: 7289
Blocpdb> 74 atoms in block 104
Block first atom: 7350
Blocpdb> 59 atoms in block 105
Block first atom: 7424
Blocpdb> 76 atoms in block 106
Block first atom: 7483
Blocpdb> 82 atoms in block 107
Block first atom: 7559
Blocpdb> 61 atoms in block 108
Block first atom: 7641
Blocpdb> 71 atoms in block 109
Block first atom: 7702
Blocpdb> 64 atoms in block 110
Block first atom: 7773
Blocpdb> 67 atoms in block 111
Block first atom: 7837
Blocpdb> 67 atoms in block 112
Block first atom: 7904
Blocpdb> 71 atoms in block 113
Block first atom: 7971
Blocpdb> 68 atoms in block 114
Block first atom: 8042
Blocpdb> 62 atoms in block 115
Block first atom: 8110
Blocpdb> 72 atoms in block 116
Block first atom: 8172
Blocpdb> 69 atoms in block 117
Block first atom: 8244
Blocpdb> 73 atoms in block 118
Block first atom: 8313
Blocpdb> 70 atoms in block 119
Block first atom: 8386
Blocpdb> 71 atoms in block 120
Block first atom: 8456
Blocpdb> 77 atoms in block 121
Block first atom: 8527
Blocpdb> 68 atoms in block 122
Block first atom: 8604
Blocpdb> 81 atoms in block 123
Block first atom: 8672
Blocpdb> 86 atoms in block 124
Block first atom: 8753
Blocpdb> 70 atoms in block 125
Block first atom: 8839
Blocpdb> 80 atoms in block 126
Block first atom: 8909
Blocpdb> 75 atoms in block 127
Block first atom: 8989
Blocpdb> 67 atoms in block 128
Block first atom: 9064
Blocpdb> 70 atoms in block 129
Block first atom: 9131
Blocpdb> 66 atoms in block 130
Block first atom: 9201
Blocpdb> 70 atoms in block 131
Block first atom: 9267
Blocpdb> 72 atoms in block 132
Block first atom: 9337
Blocpdb> 87 atoms in block 133
Block first atom: 9409
Blocpdb> 78 atoms in block 134
Block first atom: 9496
Blocpdb> 82 atoms in block 135
Block first atom: 9574
Blocpdb> 69 atoms in block 136
Block first atom: 9656
Blocpdb> 67 atoms in block 137
Block first atom: 9725
Blocpdb> 70 atoms in block 138
Block first atom: 9792
Blocpdb> 65 atoms in block 139
Block first atom: 9862
Blocpdb> 78 atoms in block 140
Block first atom: 9927
Blocpdb> 70 atoms in block 141
Block first atom: 10005
Blocpdb> 70 atoms in block 142
Block first atom: 10075
Blocpdb> 78 atoms in block 143
Block first atom: 10145
Blocpdb> 62 atoms in block 144
Block first atom: 10223
Blocpdb> 60 atoms in block 145
Block first atom: 10285
Blocpdb> 76 atoms in block 146
Block first atom: 10345
Blocpdb> 62 atoms in block 147
Block first atom: 10421
Blocpdb> 93 atoms in block 148
Block first atom: 10483
Blocpdb> 81 atoms in block 149
Block first atom: 10576
Blocpdb> 73 atoms in block 150
Block first atom: 10657
Blocpdb> 72 atoms in block 151
Block first atom: 10730
Blocpdb> 72 atoms in block 152
Block first atom: 10802
Blocpdb> 64 atoms in block 153
Block first atom: 10874
Blocpdb> 57 atoms in block 154
Block first atom: 10938
Blocpdb> 73 atoms in block 155
Block first atom: 10995
Blocpdb> 82 atoms in block 156
Block first atom: 11068
Blocpdb> 77 atoms in block 157
Block first atom: 11150
Blocpdb> 26 atoms in block 158
Block first atom: 11227
Blocpdb> 82 atoms in block 159
Block first atom: 11253
Blocpdb> 73 atoms in block 160
Block first atom: 11335
Blocpdb> 83 atoms in block 161
Block first atom: 11408
Blocpdb> 70 atoms in block 162
Block first atom: 11491
Blocpdb> 61 atoms in block 163
Block first atom: 11561
Blocpdb> 72 atoms in block 164
Block first atom: 11622
Blocpdb> 60 atoms in block 165
Block first atom: 11694
Blocpdb> 79 atoms in block 166
Block first atom: 11754
Blocpdb> 79 atoms in block 167
Block first atom: 11833
Blocpdb> 68 atoms in block 168
Block first atom: 11912
Blocpdb> 76 atoms in block 169
Block first atom: 11980
Blocpdb> 76 atoms in block 170
Block first atom: 12056
Blocpdb> 75 atoms in block 171
Block first atom: 12132
Blocpdb> 71 atoms in block 172
Block first atom: 12207
Blocpdb> 70 atoms in block 173
Block first atom: 12278
Blocpdb> 65 atoms in block 174
Block first atom: 12348
Blocpdb> 78 atoms in block 175
Block first atom: 12413
Blocpdb> 23 atoms in block 176
Block first atom: 12491
Blocpdb> 82 atoms in block 177
Block first atom: 12514
Blocpdb> 73 atoms in block 178
Block first atom: 12596
Blocpdb> 83 atoms in block 179
Block first atom: 12669
Blocpdb> 70 atoms in block 180
Block first atom: 12752
Blocpdb> 61 atoms in block 181
Block first atom: 12822
Blocpdb> 72 atoms in block 182
Block first atom: 12883
Blocpdb> 60 atoms in block 183
Block first atom: 12955
Blocpdb> 79 atoms in block 184
Block first atom: 13015
Blocpdb> 79 atoms in block 185
Block first atom: 13094
Blocpdb> 68 atoms in block 186
Block first atom: 13173
Blocpdb> 76 atoms in block 187
Block first atom: 13241
Blocpdb> 76 atoms in block 188
Block first atom: 13317
Blocpdb> 75 atoms in block 189
Block first atom: 13393
Blocpdb> 71 atoms in block 190
Block first atom: 13468
Blocpdb> 70 atoms in block 191
Block first atom: 13539
Blocpdb> 65 atoms in block 192
Block first atom: 13609
Blocpdb> 78 atoms in block 193
Block first atom: 13674
Blocpdb> 23 atoms in block 194
Block first atom: 13752
Blocpdb> 59 atoms in block 195
Block first atom: 13775
Blocpdb> 69 atoms in block 196
Block first atom: 13834
Blocpdb> 78 atoms in block 197
Block first atom: 13903
Blocpdb> 63 atoms in block 198
Block first atom: 13981
Blocpdb> 66 atoms in block 199
Block first atom: 14044
Blocpdb> 71 atoms in block 200
Block first atom: 14110
Blocpdb> 77 atoms in block 201
Block first atom: 14181
Blocpdb> 50 atoms in block 202
Block first atom: 14257
Blocpdb> 202 blocks.
Blocpdb> At most, 93 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5084058 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 42921
Prepmat> Matrix trace = 11108520.0000
Prepmat> Last element read: 42921 42921 67.9750
Prepmat> 20504 lines saved.
Prepmat> 19015 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14307
RTB> Total mass = 14307.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 14307
RTB> Number of blocks = 202
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 193500.9606
RTB> 50538 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1212
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50538
Diagstd> Projected matrix trace = 193500.9606
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1212 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 193500.9606
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0455731 0.0702624 0.1080117 0.1179884
0.1487115 0.2028996 0.2690799 0.3565135 0.4142318
0.4766102 0.5252608 0.5446040 0.5953693 0.6285473
0.6651618 0.7547062 0.7774232 0.8394319 0.9519589
1.0834342 1.1438932 1.4271116 1.4911638 1.8916943
1.9713151 2.2931898 2.4267536 2.5413481 2.7812423
2.8656644 2.9492093 3.2147664 3.3973641 3.5282126
3.6901918 3.8846326 3.9166501 4.0074091 4.0520906
4.2573817 4.3615460 4.6390195 4.7845233 4.8900195
5.1037956 5.3310600 5.6048330 5.6699702 6.0053593
6.0838196 6.2708700 6.7317585 6.7698907 6.7800741
7.1088801 7.5429786 8.0098968 8.1681620 8.3650297
8.5630073 8.7375380 8.8827579 9.3301758 9.4202332
9.5053562 9.7454442 9.8378393 9.9266184 10.2209657
10.4569125 10.5945318 11.1857058 11.4899977 11.8102317
11.9410405 12.4282313 12.5424498 13.0125234 13.1498213
13.1593519 13.4440787 13.7500656 13.8512116 13.9746216
14.4509946 14.5749848 14.8154683 15.2101639 15.4002468
15.7873203 15.8208204 16.0800106 16.1629285 16.7408502
17.2718081 17.4240118 17.6221941 17.6602054 17.9963193
18.3481505
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034326 0.0034326 0.0034331 0.0034333
0.0034344 23.1819275 28.7843711 35.6886945 37.3005207
41.8762255 48.9143022 56.3295063 64.8385485 69.8903177
74.9681742 78.7014578 80.1374857 83.7892866 86.0922936
88.5643476 94.3374753 95.7467493 99.4919664 105.9508352
113.0307356 116.1416592 129.7251719 132.6044087 149.3553423
152.4661028 164.4429572 169.1640702 173.1120743 181.0984327
183.8264267 186.4867923 194.7018120 200.1549456 203.9729854
208.6026172 214.0278343 214.9080423 217.3837725 218.5922972
224.0611577 226.7856173 233.8882369 237.5278938 240.1322981
245.3250628 250.7275557 257.0849285 258.5744840 266.1121967
267.8449379 271.9312882 281.7471584 282.5440133 282.7564379
289.5315359 298.2405680 307.3326778 310.3540751 314.0718579
317.7667390 320.9887554 323.6452162 331.6959684 333.2929341
334.7953964 338.9971914 340.6003904 342.1337710 347.1692450
351.1535123 353.4566569 363.1842249 368.0910441 373.1852660
375.2462549 382.8246945 384.5797966 391.7202665 393.7814062
393.9240805 398.1629121 402.6685083 404.1468167 405.9432360
412.8042408 414.5713969 417.9775649 423.5085934 426.1466910
431.4688932 431.9264309 435.4501515 436.5714248 444.3079001
451.2988038 453.2829238 455.8534763 456.3448515 460.6670242
465.1482880
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14307
Rtb_to_modes> Number of blocs = 202
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9880E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5573E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0262E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1080
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1180
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1487
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2029
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2691
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4142
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5446
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5954
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6285
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6652
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7547
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7774
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8394
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.083
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.144
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.427
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.892
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.971
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.293
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.427
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.781
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.866
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.397
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.528
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.885
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.052
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.257
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.362
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.639
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.785
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.890
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.605
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.670
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.005
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.732
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.770
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.780
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.109
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.543
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.010
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.168
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.365
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.563
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.330
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.420
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.505
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.745
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1212 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 1.00003
1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99997
0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000
1.00004 0.99999 0.99996 1.00001 1.00003
1.00001 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00004 1.00001 0.99996 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 257526 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 1.00003
1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99997
0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000
1.00004 0.99999 0.99996 1.00001 1.00003
1.00001 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00004 1.00001 0.99996 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240624215557714030.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240624215557714030.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240624215557714030.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240624215557714030.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1792
First residue number = 1
Last residue number = 70
Number of atoms found = 14307
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9880E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5573E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0262E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1180
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1487
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2029
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2691
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4142
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5954
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6285
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Bfactors> 106 vectors, 42921 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.045573
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.326 for 1792 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.110 +/- 0.13
Bfactors> = 43.154 +/- 85.20
Bfactors> Shiftng-fct= 43.044
Bfactors> Scaling-fct= 668.526
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240624215557714030.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240624215557714030.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.56
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Chkmod> 106 vectors, 42921 coordinates in file.
Chkmod> That is: 14307 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9649
0.0034 0.7754
0.0034 0.9288
0.0034 0.7534
0.0034 0.7509
0.0034 0.8857
23.1809 0.4823
28.7831 0.3204
35.6852 0.6507
37.3008 0.3954
41.8728 0.7927
48.9123 0.6027
56.3292 0.3919
64.8345 0.6335
69.8846 0.6605
74.9642 0.3992
78.7010 0.3001
80.1337 0.0511
83.7879 0.2320
86.0854 0.1078
88.5631 0.0434
94.3330 0.5419
95.7412 0.7459
99.4858 0.6705
105.9486 0.5217
113.0032 0.4537
116.1421 0.6837
129.7145 0.0477
132.5914 0.0516
149.3610 0.2696
152.4474 0.1373
164.4291 0.0950
169.1654 0.3390
173.0928 0.3183
181.0828 0.3602
183.8293 0.3427
186.4722 0.3702
194.7005 0.2407
200.1356 0.0449
203.9581 0.3145
208.5882 0.2279
214.0288 0.2109
214.9084 0.1789
217.3633 0.1335
218.5805 0.1775
224.0415 0.1852
226.7877 0.2874
233.8777 0.3618
237.5295 0.2871
240.1215 0.4499
245.3194 0.2908
250.7154 0.4732
257.0777 0.4162
258.5641 0.3155
266.0928 0.2786
267.8374 0.0430
271.9224 0.2482
281.7401 0.3228
282.5342 0.4084
282.7428 0.4270
289.5215 0.4398
298.2282 0.3595
307.3215 0.2043
310.3377 0.3723
314.0578 0.4659
317.7530 0.3323
320.9835 0.2912
323.6357 0.4556
331.6786 0.5816
333.2745 0.2272
334.7748 0.4848
338.9749 0.4802
340.5886 0.4045
342.1257 0.3588
347.1379 0.1367
351.1903 0.2885
353.3659 0.1090
363.2383 0.2974
368.0753 0.1500
373.1656 0.4957
375.2138 0.4246
382.8355 0.3463
384.5257 0.4464
391.6655 0.3211
393.7672 0.4487
393.9169 0.3755
398.0854 0.5048
402.6503 0.4548
404.1118 0.4711
405.8587 0.3991
412.7723 0.2296
414.4827 0.5147
418.0235 0.4201
423.4881 0.2636
426.1250 0.2278
431.4870 0.0057
431.8967 0.0034
435.4313 0.2984
436.5131 0.3764
444.2775 0.3495
451.2558 0.1604
453.2113 0.4246
455.8055 0.2808
456.3226 0.1963
460.6944 0.3785
465.1518 0.2851
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 240624215557714030.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240624215557714030.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 240624215557714030.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240624215557714030.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 240624215557714030.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
240624215557714030.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Projmod> 106 vectors, 42921 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1792
First residue number = 1
Last residue number = 70
Number of atoms found = 14307
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1784
First residue number = 746
Last residue number = 70
Number of atoms found = 14267
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240624215557714030 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
making animated gifs
11 models are in 240624215557714030.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 135 23.618
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 135 23.619
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 135 23.620
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 135 23.621
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 135 23.622
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 135 23.624
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 135 23.626
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 135 23.628
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 135 23.630
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 135 23.633
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 135 23.635
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240624215557714030 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240624215557714030.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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240624215557714030.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 135 23.628
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 135 23.627
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 135 23.626
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 135 23.625
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 135 23.624
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 135 23.624
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 135 23.623
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 135 23.623
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 135 23.623
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 135 23.623
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 135 23.623
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240624215557714030 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 135 23.619
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 135 23.619
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 135 23.620
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 135 23.621
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MODEL 6 MODE=9 DQ=0 135 23.624
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 135 23.625
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 135 23.627
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 135 23.629
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 135 23.631
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 135 23.633
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240624215557714030 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=20
240624215557714030.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 240624215557714030.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 135 23.688
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 135 23.673
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 135 23.659
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 135 23.646
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 135 23.634
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 135 23.624
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 135 23.614
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 135 23.606
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 135 23.598
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 135 23.592
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 135 23.587
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240624215557714030 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240624215557714030.eigenfacs
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240624215557714030.eigenfacs
240624215557714030.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240624215557714030.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
240624215557714030.eigenfacs
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240624215557714030.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
240624215557714030.eigenfacs
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240624215557714030.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
240624215557714030.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 240624215557714030.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 240624215557714030.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 135 23.621
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 135 23.622
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 135 23.622
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 135 23.622
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 135 23.623
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 135 23.624
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 135 23.625
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 135 23.626
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 135 23.627
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 135 23.628
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 135 23.630
240624215557714030.10.pdb
240624215557714030.11.pdb
240624215557714030.7.pdb
240624215557714030.8.pdb
240624215557714030.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m30.030s
user 1m29.618s
sys 0m0.220s
rm: cannot remove '240624215557714030.sdijf': No such file or directory
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