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LOGs for ID: 2406150013412870212

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2406150013412870212.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2406150013412870212.atom to be opened. Openam> File opened: 2406150013412870212.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1380 First residue number = 5 Last residue number = 144 Number of atoms found = 11090 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 127.681239 +/- 23.779129 From: 77.695000 To: 177.671000 = 127.651814 +/- 23.809529 From: 79.681000 To: 177.606000 = 127.736798 +/- 15.372937 From: 97.512000 To: 158.504000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7349 % Filled. Pdbmat> 4067394 non-zero elements. Pdbmat> 444616 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.18 +/- 20.28 Maximum number = 121 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 8.892320E+06 Pdbmat> Larger element = 474.879 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1380 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2406150013412870212.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2406150013412870212.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2406150013412870212.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11090 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1380 residues. Blocpdb> 62 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 48 atoms in block 2 Block first atom: 63 Blocpdb> 59 atoms in block 3 Block first atom: 111 Blocpdb> 52 atoms in block 4 Block first atom: 170 Blocpdb> 50 atoms in block 5 Block first atom: 222 Blocpdb> 52 atoms in block 6 Block first atom: 272 Blocpdb> 54 atoms in block 7 Block first atom: 324 Blocpdb> 55 atoms in block 8 Block first atom: 378 Blocpdb> 58 atoms in block 9 Block first atom: 433 Blocpdb> 62 atoms in block 10 Block first atom: 491 Blocpdb> 56 atoms in block 11 Block first atom: 553 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 609 Blocpdb> 67 atoms in block 13 Block first atom: 664 Blocpdb> 57 atoms in block 14 Block first atom: 731 Blocpdb> 61 atoms in block 15 Block first atom: 788 Blocpdb> 59 atoms in block 16 Block first atom: 849 Blocpdb> 56 atoms in block 17 Block first atom: 908 Blocpdb> 49 atoms in block 18 Block first atom: 964 Blocpdb> 60 atoms in block 19 Block first atom: 1013 Blocpdb> 37 atoms in block 20 Block first atom: 1073 Blocpdb> 62 atoms in block 21 Block first atom: 1110 Blocpdb> 48 atoms in block 22 Block first atom: 1172 Blocpdb> 59 atoms in block 23 Block first atom: 1220 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1279 Blocpdb> 50 atoms in block 25 Block first atom: 1331 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1381 Blocpdb> 54 atoms in block 27 Block first atom: 1433 Blocpdb> 55 atoms in block 28 Block first atom: 1487 Blocpdb> 58 atoms in block 29 Block first atom: 1542 Blocpdb> 62 atoms in block 30 Block first atom: 1600 Blocpdb> 56 atoms in block 31 Block first atom: 1662 Blocpdb> 55 atoms in block 32 Block first atom: 1718 Blocpdb> 67 atoms in block 33 Block first atom: 1773 Blocpdb> 57 atoms in block 34 Block first atom: 1840 Blocpdb> 61 atoms in block 35 Block first atom: 1897 Blocpdb> 59 atoms in block 36 Block first atom: 1958 Blocpdb> 56 atoms in block 37 Block first atom: 2017 Blocpdb> 49 atoms in block 38 Block first atom: 2073 Blocpdb> 60 atoms in block 39 Block first atom: 2122 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 2182 Blocpdb> 62 atoms in block 41 Block first atom: 2219 Blocpdb> 48 atoms in block 42 Block first atom: 2281 Blocpdb> 59 atoms in block 43 Block first atom: 2329 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 2388 Blocpdb> 50 atoms in block 45 Block first atom: 2440 Blocpdb> 52 atoms in block 46 Block first atom: 2490 Blocpdb> 54 atoms in block 47 Block first atom: 2542 Blocpdb> 55 atoms in block 48 Block first atom: 2596 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2651 Blocpdb> 62 atoms in block 50 Block first atom: 2709 Blocpdb> 56 atoms in block 51 Block first atom: 2771 Blocpdb> 55 atoms in block 52 Block first atom: 2827 Blocpdb> 67 atoms in block 53 Block first atom: 2882 Blocpdb> 57 atoms in block 54 Block first atom: 2949 Blocpdb> 61 atoms in block 55 Block first atom: 3006 Blocpdb> 59 atoms in block 56 Block first atom: 3067 Blocpdb> 56 atoms in block 57 Block first atom: 3126 Blocpdb> 49 atoms in block 58 Block first atom: 3182 Blocpdb> 60 atoms in block 59 Block first atom: 3231 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 3291 Blocpdb> 62 atoms in block 61 Block first atom: 3328 Blocpdb> 48 atoms in block 62 Block first atom: 3390 Blocpdb> 59 atoms in block 63 Block first atom: 3438 Blocpdb> 52 atoms in block 64 Block first atom: 3497 Blocpdb> 50 atoms in block 65 Block first atom: 3549 Blocpdb> 52 atoms in block 66 Block first atom: 3599 Blocpdb> 54 atoms in block 67 Block first atom: 3651 Blocpdb> 55 atoms in block 68 Block first atom: 3705 Blocpdb> 58 atoms in block 69 Block first atom: 3760 Blocpdb> 62 atoms in block 70 Block first atom: 3818 Blocpdb> 56 atoms in block 71 Block first atom: 3880 Blocpdb> 55 atoms in block 72 Block first atom: 3936 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 3991 Blocpdb> 57 atoms in block 74 Block first atom: 4058 Blocpdb> 61 atoms in block 75 Block first atom: 4115 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 4176 Blocpdb> 56 atoms in block 77 Block first atom: 4235 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 4291 Blocpdb> 60 atoms in block 79 Block first atom: 4340 Blocpdb> 37 atoms in block 80 Block first atom: 4400 Blocpdb> 62 atoms in block 81 Block first atom: 4437 Blocpdb> 48 atoms in block 82 Block first atom: 4499 Blocpdb> 59 atoms in block 83 Block first atom: 4547 Blocpdb> 52 atoms in block 84 Block first atom: 4606 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 4658 Blocpdb> 52 atoms in block 86 Block first atom: 4708 Blocpdb> 54 atoms in block 87 Block first atom: 4760 Blocpdb> 55 atoms in block 88 Block first atom: 4814 Blocpdb> 58 atoms in block 89 Block first atom: 4869 Blocpdb> 62 atoms in block 90 Block first atom: 4927 Blocpdb> 56 atoms in block 91 Block first atom: 4989 Blocpdb> 55 atoms in block 92 Block first atom: 5045 Blocpdb> 67 atoms in block 93 Block first atom: 5100 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 5167 Blocpdb> 61 atoms in block 95 Block first atom: 5224 Blocpdb> 59 atoms in block 96 Block first atom: 5285 Blocpdb> 56 atoms in block 97 Block first atom: 5344 Blocpdb> 49 atoms in block 98 Block first atom: 5400 Blocpdb> 60 atoms in block 99 Block first atom: 5449 Blocpdb> 37 atoms in block 100 Block first atom: 5509 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 5546 Blocpdb> 48 atoms in block 102 Block first atom: 5608 Blocpdb> 59 atoms in block 103 Block first atom: 5656 Blocpdb> 52 atoms in block 104 Block first atom: 5715 Blocpdb> 50 atoms in block 105 Block first atom: 5767 Blocpdb> 52 atoms in block 106 Block first atom: 5817 Blocpdb> 54 atoms in block 107 Block first atom: 5869 Blocpdb> 55 atoms in block 108 Block first atom: 5923 Blocpdb> 58 atoms in block 109 Block first atom: 5978 Blocpdb> 62 atoms in block 110 Block first atom: 6036 Blocpdb> 56 atoms in block 111 Block first atom: 6098 Blocpdb> 55 atoms in block 112 Block first atom: 6154 Blocpdb> 67 atoms in block 113 Block first atom: 6209 Blocpdb> 57 atoms in block 114 Block first atom: 6276 Blocpdb> 61 atoms in block 115 Block first atom: 6333 Blocpdb> 59 atoms in block 116 Block first atom: 6394 Blocpdb> 56 atoms in block 117 Block first atom: 6453 Blocpdb> 49 atoms in block 118 Block first atom: 6509 Blocpdb> 60 atoms in block 119 Block first atom: 6558 Blocpdb> 37 atoms in block 120 Block first atom: 6618 Blocpdb> 62 atoms in block 121 Block first atom: 6655 Blocpdb> 48 atoms in block 122 Block first atom: 6717 Blocpdb> 59 atoms in block 123 Block first atom: 6765 Blocpdb> 52 atoms in block 124 Block first atom: 6824 Blocpdb> 50 atoms in block 125 Block first atom: 6876 Blocpdb> 52 atoms in block 126 Block first atom: 6926 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 6978 Blocpdb> 55 atoms in block 128 Block first atom: 7032 Blocpdb> 58 atoms in block 129 Block first atom: 7087 Blocpdb> 62 atoms in block 130 Block first atom: 7145 Blocpdb> 56 atoms in block 131 Block first atom: 7207 Blocpdb> 55 atoms in block 132 Block first atom: 7263 Blocpdb> 67 atoms in block 133 Block first atom: 7318 Blocpdb> 57 atoms in block 134 Block first atom: 7385 Blocpdb> 61 atoms in block 135 Block first atom: 7442 Blocpdb> 59 atoms in block 136 Block first atom: 7503 Blocpdb> 56 atoms in block 137 Block first atom: 7562 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 7618 Blocpdb> 60 atoms in block 139 Block first atom: 7667 Blocpdb> 37 atoms in block 140 Block first atom: 7727 Blocpdb> 62 atoms in block 141 Block first atom: 7764 Blocpdb> 48 atoms in block 142 Block first atom: 7826 Blocpdb> 59 atoms in block 143 Block first atom: 7874 Blocpdb> 52 atoms in block 144 Block first atom: 7933 Blocpdb> 50 atoms in block 145 Block first atom: 7985 Blocpdb> 52 atoms in block 146 Block first atom: 8035 Blocpdb> 54 atoms in block 147 Block first atom: 8087 Blocpdb> 55 atoms in block 148 Block first atom: 8141 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 8196 Blocpdb> 62 atoms in block 150 Block first atom: 8254 Blocpdb> 56 atoms in block 151 Block first atom: 8316 Blocpdb> 55 atoms in block 152 Block first atom: 8372 Blocpdb> 67 atoms in block 153 Block first atom: 8427 Blocpdb> 57 atoms in block 154 Block first atom: 8494 Blocpdb> 61 atoms in block 155 Block first atom: 8551 Blocpdb> 59 atoms in block 156 Block first atom: 8612 Blocpdb> 56 atoms in block 157 Block first atom: 8671 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 8727 Blocpdb> 60 atoms in block 159 Block first atom: 8776 Blocpdb> 37 atoms in block 160 Block first atom: 8836 Blocpdb> 62 atoms in block 161 Block first atom: 8873 Blocpdb> 48 atoms in block 162 Block first atom: 8935 Blocpdb> 59 atoms in block 163 Block first atom: 8983 Blocpdb> 52 atoms in block 164 Block first atom: 9042 Blocpdb> 50 atoms in block 165 Block first atom: 9094 Blocpdb> 52 atoms in block 166 Block first atom: 9144 Blocpdb> 54 atoms in block 167 Block first atom: 9196 Blocpdb> 55 atoms in block 168 Block first atom: 9250 Blocpdb> 58 atoms in block 169 Block first atom: 9305 Blocpdb> 62 atoms in block 170 Block first atom: 9363 Blocpdb> 56 atoms in block 171 Block first atom: 9425 Blocpdb> 55 atoms in block 172 Block first atom: 9481 Blocpdb> 67 atoms in block 173 Block first atom: 9536 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 9603 Blocpdb> 61 atoms in block 175 Block first atom: 9660 Blocpdb> 59 atoms in block 176 Block first atom: 9721 Blocpdb> 56 atoms in block 177 Block first atom: 9780 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 9836 Blocpdb> 60 atoms in block 179 Block first atom: 9885 Blocpdb> 37 atoms in block 180 Block first atom: 9945 Blocpdb> 62 atoms in block 181 Block first atom: 9982 Blocpdb> 48 atoms in block 182 Block first atom: 10044 Blocpdb> 59 atoms in block 183 Block first atom: 10092 Blocpdb> 52 atoms in block 184 Block first atom: 10151 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 10203 Blocpdb> 52 atoms in block 186 Block first atom: 10253 Blocpdb> 54 atoms in block 187 Block first atom: 10305 Blocpdb> 55 atoms in block 188 Block first atom: 10359 Blocpdb> 58 atoms in block 189 Block first atom: 10414 Blocpdb> 62 atoms in block 190 Block first atom: 10472 Blocpdb> 56 atoms in block 191 Block first atom: 10534 Blocpdb> 55 atoms in block 192 Block first atom: 10590 Blocpdb> 67 atoms in block 193 Block first atom: 10645 Blocpdb> 57 atoms in block 194 Block first atom: 10712 Blocpdb> 61 atoms in block 195 Block first atom: 10769 Blocpdb> 59 atoms in block 196 Block first atom: 10830 Blocpdb> 56 atoms in block 197 Block first atom: 10889 Blocpdb> 49 atoms in block 198 Block first atom: 10945 Blocpdb> 60 atoms in block 199 Block first atom: 10994 Blocpdb> 37 atoms in block 200 Block first atom: 11053 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 37 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4067594 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 33270 Prepmat> Matrix trace = 8892320.0000 Prepmat> Last element read: 33270 33270 145.1417 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18394 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11090 RTB> Total mass = 11090.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11090 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 200998.2447 RTB> 58416 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58416 Diagstd> Projected matrix trace = 200998.2447 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 200998.2447 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7848870 0.8150938 1.0017181 1.0154600 2.9230020 2.9465895 3.0061763 3.0328434 4.0308622 4.1138769 4.2811492 4.4251359 4.4766060 4.5452630 4.5845228 4.9760016 4.9779509 5.6882299 5.8723109 5.9622246 6.9486339 7.0934318 7.1240808 7.2520613 7.9097657 8.0985136 8.9769649 9.0114552 9.2869689 9.3706828 9.8355834 10.0382549 10.3591863 10.5132755 10.9993609 11.3697047 11.8200826 12.0315941 13.8631516 14.0048279 14.3166620 14.6297843 15.1966288 15.4293766 15.6273324 15.8718395 16.0461859 16.3324098 16.5688783 17.1936164 17.6195772 17.9891299 18.3962047 18.9739058 19.3616937 19.9447121 20.2062283 20.4369564 21.2162326 21.5110638 21.6177776 21.7634439 22.3468396 22.7102310 23.5256073 23.9311219 24.1338274 24.7260794 25.0852429 25.5217306 25.7030491 25.8204069 26.2687362 26.5364948 26.6879206 26.9604955 27.2193195 27.3698982 27.6173407 27.7299483 28.1049110 28.6417668 28.6993835 29.1989163 29.5259020 29.7428508 29.8752900 29.9864749 30.3642408 30.5955474 31.0151038 31.2514115 31.3211632 31.5988863 32.2068826 33.0304375 33.3626483 33.5055179 33.9508043 34.2917965 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034339 0.0034341 0.0034344 0.0034349 0.0034350 0.0034351 96.2052638 98.0390478 108.6846066 109.4275548 185.6563630 186.4039451 188.2792688 189.1125162 218.0189575 220.2525413 224.6857154 228.4328649 229.7575092 231.5126837 232.5103803 242.2342418 242.2816849 258.9905105 263.1478355 265.1547722 286.2496703 289.2167755 289.8409195 292.4327534 305.4056653 309.0280761 325.3569174 325.9813423 330.9270559 332.4152181 340.5613367 344.0522398 349.5087889 352.0986030 360.1463402 366.1591352 373.3408704 376.6663866 404.3209701 406.3817241 410.8811014 415.3500253 423.3201179 426.5495326 429.2770839 432.6223093 434.9919195 438.8543570 442.0199131 450.2761015 455.8196275 460.5749977 465.7570061 473.0136246 477.8228920 484.9636260 488.1327070 490.9117076 500.1835614 503.6469692 504.8946893 506.5928901 513.3379078 517.4948782 526.7028905 531.2229263 533.4680097 539.9740758 543.8816863 548.5930994 550.5383837 551.7938063 556.5636906 559.3930404 560.9868077 563.8443269 566.5443491 568.1092643 570.6715330 571.8337843 575.6869541 581.1592872 581.7435328 586.7845181 590.0609401 592.2247817 593.5418490 594.6452959 598.3792067 600.6540281 604.7583871 607.0578778 607.7349626 610.4233925 616.2680118 624.0975004 627.2281468 628.5697085 632.7327500 635.9023051 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11090 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.031 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.477 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.585 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.978 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.252 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.977 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.371 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.29 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 199620 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406150013412870212.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406150013412870212.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2406150013412870212.atom Openam> file on opening on unit 11: 2406150013412870212.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1380 First residue number = 5 Last residue number = 144 Number of atoms found = 11090 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8151 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.031 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.477 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.585 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.978 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.252 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.977 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.371 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.29 Bfactors> 106 vectors, 33270 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.784900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.808 for 1380 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.01 Bfactors> = 40.356 +/- 23.50 Bfactors> Shiftng-fct= 40.339 Bfactors> Scaling-fct= 2451.241 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406150013412870212.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406150013412870212.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 11090 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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calculating perturbed structure for DQ=-60 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2406150013412870212.eigenfacs 2406150013412870212.atom 2406150013412870212.10.pdb 2406150013412870212.11.pdb 2406150013412870212.7.pdb 2406150013412870212.8.pdb 2406150013412870212.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m2.776s user 1m2.607s sys 0m0.168s rm: cannot remove '2406150013412870212.sdijf': No such file or directory




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