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***  dimer_af  ***

LOGs for ID: 2406121241352526571

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2406121241352526571.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2406121241352526571.atom to be opened. Openam> File opened: 2406121241352526571.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 702 First residue number = 1 Last residue number = 351 Number of atoms found = 10724 Mean number per residue = 15.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 52.987741 +/- 23.725972 From: -24.726000 To: 97.024000 = 43.054705 +/- 19.105502 From: -24.085000 To: 82.471000 = 14.720530 +/- 18.440646 From: -31.969000 To: 61.008000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4428 % Filled. Pdbmat> 7466810 non-zero elements. Pdbmat> 822634 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 153.42 +/- 51.31 Maximum number = 245 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.645268E+07 Pdbmat> Larger element = 886.610 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 702 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2406121241352526571.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2406121241352526571.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2406121241352526571.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10724 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 702 residues. Blocpdb> 60 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 78 atoms in block 2 Block first atom: 61 Blocpdb> 63 atoms in block 3 Block first atom: 139 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 202 Blocpdb> 75 atoms in block 5 Block first atom: 248 Blocpdb> 85 atoms in block 6 Block first atom: 323 Blocpdb> 56 atoms in block 7 Block first atom: 408 Blocpdb> 68 atoms in block 8 Block first atom: 464 Blocpdb> 70 atoms in block 9 Block first atom: 532 Blocpdb> 54 atoms in block 10 Block first atom: 602 Blocpdb> 65 atoms in block 11 Block first atom: 656 Blocpdb> 60 atoms in block 12 Block first atom: 721 Blocpdb> 57 atoms in block 13 Block first atom: 781 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 838 Blocpdb> 64 atoms in block 15 Block first atom: 907 Blocpdb> 59 atoms in block 16 Block first atom: 971 Blocpdb> 70 atoms in block 17 Block first atom: 1030 Blocpdb> 58 atoms in block 18 Block first atom: 1100 Blocpdb> 65 atoms in block 19 Block first atom: 1158 Blocpdb> 60 atoms in block 20 Block first atom: 1223 Blocpdb> 64 atoms in block 21 Block first atom: 1283 Blocpdb> 44 atoms in block 22 Block first atom: 1347 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1391 Blocpdb> 77 atoms in block 24 Block first atom: 1457 Blocpdb> 55 atoms in block 25 Block first atom: 1534 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 1589 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1660 Blocpdb> 54 atoms in block 28 Block first atom: 1719 Blocpdb> 55 atoms in block 29 Block first atom: 1773 Blocpdb> 69 atoms in block 30 Block first atom: 1828 Blocpdb> 57 atoms in block 31 Block first atom: 1897 Blocpdb> 75 atoms in block 32 Block first atom: 1954 Blocpdb> 79 atoms in block 33 Block first atom: 2029 Blocpdb> 74 atoms in block 34 Block first atom: 2108 Blocpdb> 70 atoms in block 35 Block first atom: 2182 Blocpdb> 53 atoms in block 36 Block first atom: 2252 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 2305 Blocpdb> 67 atoms in block 38 Block first atom: 2347 Blocpdb> 66 atoms in block 39 Block first atom: 2414 Blocpdb> 54 atoms in block 40 Block first atom: 2480 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 2534 Blocpdb> 52 atoms in block 42 Block first atom: 2590 Blocpdb> 73 atoms in block 43 Block first atom: 2642 Blocpdb> 49 atoms in block 44 Block first atom: 2715 Blocpdb> 52 atoms in block 45 Block first atom: 2764 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 2816 Blocpdb> 68 atoms in block 47 Block first atom: 2881 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2949 Blocpdb> 70 atoms in block 49 Block first atom: 3000 Blocpdb> 45 atoms in block 50 Block first atom: 3070 Blocpdb> 56 atoms in block 51 Block first atom: 3115 Blocpdb> 69 atoms in block 52 Block first atom: 3171 Blocpdb> 68 atoms in block 53 Block first atom: 3240 Blocpdb> 60 atoms in block 54 Block first atom: 3308 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 3368 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 3420 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 3466 Blocpdb> 71 atoms in block 58 Block first atom: 3519 Blocpdb> 66 atoms in block 59 Block first atom: 3590 Blocpdb> 72 atoms in block 60 Block first atom: 3656 Blocpdb> 56 atoms in block 61 Block first atom: 3728 Blocpdb> 47 atoms in block 62 Block first atom: 3784 Blocpdb> 55 atoms in block 63 Block first atom: 3831 Blocpdb> 53 atoms in block 64 Block first atom: 3886 Blocpdb> 55 atoms in block 65 Block first atom: 3939 Blocpdb> 70 atoms in block 66 Block first atom: 3994 Blocpdb> 71 atoms in block 67 Block first atom: 4064 Blocpdb> 53 atoms in block 68 Block first atom: 4135 Blocpdb> 63 atoms in block 69 Block first atom: 4188 Blocpdb> 60 atoms in block 70 Block first atom: 4251 Blocpdb> 47 atoms in block 71 Block first atom: 4311 Blocpdb> 64 atoms in block 72 Block first atom: 4358 Blocpdb> 74 atoms in block 73 Block first atom: 4422 Blocpdb> 61 atoms in block 74 Block first atom: 4496 Blocpdb> 53 atoms in block 75 Block first atom: 4557 Blocpdb> 51 atoms in block 76 Block first atom: 4610 Blocpdb> 53 atoms in block 77 Block first atom: 4661 Blocpdb> 53 atoms in block 78 Block first atom: 4714 Blocpdb> 45 atoms in block 79 Block first atom: 4767 Blocpdb> 51 atoms in block 80 Block first atom: 4812 Blocpdb> 57 atoms in block 81 Block first atom: 4863 Blocpdb> 63 atoms in block 82 Block first atom: 4920 Blocpdb> 55 atoms in block 83 Block first atom: 4983 Blocpdb> 71 atoms in block 84 Block first atom: 5038 Blocpdb> 58 atoms in block 85 Block first atom: 5109 Blocpdb> 60 atoms in block 86 Block first atom: 5167 Blocpdb> 73 atoms in block 87 Block first atom: 5227 Blocpdb> 63 atoms in block 88 Block first atom: 5300 Blocpdb> 60 atoms in block 89 Block first atom: 5363 Blocpdb> 78 atoms in block 90 Block first atom: 5423 Blocpdb> 63 atoms in block 91 Block first atom: 5501 Blocpdb> 46 atoms in block 92 Block first atom: 5564 Blocpdb> 75 atoms in block 93 Block first atom: 5610 Blocpdb> 85 atoms in block 94 Block first atom: 5685 Blocpdb> 56 atoms in block 95 Block first atom: 5770 Blocpdb> 68 atoms in block 96 Block first atom: 5826 Blocpdb> 70 atoms in block 97 Block first atom: 5894 Blocpdb> 54 atoms in block 98 Block first atom: 5964 Blocpdb> 65 atoms in block 99 Block first atom: 6018 Blocpdb> 60 atoms in block 100 Block first atom: 6083 Blocpdb> 57 atoms in block 101 Block first atom: 6143 Blocpdb> 69 atoms in block 102 Block first atom: 6200 Blocpdb> 64 atoms in block 103 Block first atom: 6269 Blocpdb> 59 atoms in block 104 Block first atom: 6333 Blocpdb> 70 atoms in block 105 Block first atom: 6392 Blocpdb> 58 atoms in block 106 Block first atom: 6462 Blocpdb> 65 atoms in block 107 Block first atom: 6520 Blocpdb> 60 atoms in block 108 Block first atom: 6585 Blocpdb> 64 atoms in block 109 Block first atom: 6645 Blocpdb> 44 atoms in block 110 Block first atom: 6709 Blocpdb> 66 atoms in block 111 Block first atom: 6753 Blocpdb> 77 atoms in block 112 Block first atom: 6819 Blocpdb> 55 atoms in block 113 Block first atom: 6896 Blocpdb> 71 atoms in block 114 Block first atom: 6951 Blocpdb> 59 atoms in block 115 Block first atom: 7022 Blocpdb> 54 atoms in block 116 Block first atom: 7081 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 7135 Blocpdb> 69 atoms in block 118 Block first atom: 7190 Blocpdb> 57 atoms in block 119 Block first atom: 7259 Blocpdb> 75 atoms in block 120 Block first atom: 7316 Blocpdb> 79 atoms in block 121 Block first atom: 7391 Blocpdb> 74 atoms in block 122 Block first atom: 7470 Blocpdb> 70 atoms in block 123 Block first atom: 7544 Blocpdb> 53 atoms in block 124 Block first atom: 7614 Blocpdb> 42 atoms in block 125 Block first atom: 7667 Blocpdb> 67 atoms in block 126 Block first atom: 7709 Blocpdb> 66 atoms in block 127 Block first atom: 7776 Blocpdb> 54 atoms in block 128 Block first atom: 7842 Blocpdb> 56 atoms in block 129 Block first atom: 7896 Blocpdb> 52 atoms in block 130 Block first atom: 7952 Blocpdb> 73 atoms in block 131 Block first atom: 8004 Blocpdb> 49 atoms in block 132 Block first atom: 8077 Blocpdb> 52 atoms in block 133 Block first atom: 8126 Blocpdb> 65 atoms in block 134 Block first atom: 8178 Blocpdb> 68 atoms in block 135 Block first atom: 8243 Blocpdb> 51 atoms in block 136 Block first atom: 8311 Blocpdb> 70 atoms in block 137 Block first atom: 8362 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 8432 Blocpdb> 56 atoms in block 139 Block first atom: 8477 Blocpdb> 69 atoms in block 140 Block first atom: 8533 Blocpdb> 68 atoms in block 141 Block first atom: 8602 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 8670 Blocpdb> 52 atoms in block 143 Block first atom: 8730 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 8782 Blocpdb> 53 atoms in block 145 Block first atom: 8828 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 8881 Blocpdb> 66 atoms in block 147 Block first atom: 8952 Blocpdb> 72 atoms in block 148 Block first atom: 9018 Blocpdb> 56 atoms in block 149 Block first atom: 9090 Blocpdb> 47 atoms in block 150 Block first atom: 9146 Blocpdb> 55 atoms in block 151 Block first atom: 9193 Blocpdb> 53 atoms in block 152 Block first atom: 9248 Blocpdb> 55 atoms in block 153 Block first atom: 9301 Blocpdb> 70 atoms in block 154 Block first atom: 9356 Blocpdb> 71 atoms in block 155 Block first atom: 9426 Blocpdb> 53 atoms in block 156 Block first atom: 9497 Blocpdb> 63 atoms in block 157 Block first atom: 9550 Blocpdb> 60 atoms in block 158 Block first atom: 9613 Blocpdb> 47 atoms in block 159 Block first atom: 9673 Blocpdb> 64 atoms in block 160 Block first atom: 9720 Blocpdb> 74 atoms in block 161 Block first atom: 9784 Blocpdb> 61 atoms in block 162 Block first atom: 9858 Blocpdb> 53 atoms in block 163 Block first atom: 9919 Blocpdb> 51 atoms in block 164 Block first atom: 9972 Blocpdb> 53 atoms in block 165 Block first atom: 10023 Blocpdb> 53 atoms in block 166 Block first atom: 10076 Blocpdb> 45 atoms in block 167 Block first atom: 10129 Blocpdb> 51 atoms in block 168 Block first atom: 10174 Blocpdb> 57 atoms in block 169 Block first atom: 10225 Blocpdb> 63 atoms in block 170 Block first atom: 10282 Blocpdb> 55 atoms in block 171 Block first atom: 10345 Blocpdb> 71 atoms in block 172 Block first atom: 10400 Blocpdb> 58 atoms in block 173 Block first atom: 10471 Blocpdb> 60 atoms in block 174 Block first atom: 10529 Blocpdb> 73 atoms in block 175 Block first atom: 10589 Blocpdb> 63 atoms in block 176 Block first atom: 10661 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 42 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7466986 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32172 Prepmat> Matrix trace = 16452680.0000 Prepmat> Last element read: 32172 32172 534.6089 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13856 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10724 RTB> Total mass = 10724.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10724 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 401985.0652 RTB> 59280 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59280 Diagstd> Projected matrix trace = 401985.0652 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 401985.0652 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0041750 0.0074192 0.0084053 0.0131905 0.0452094 0.0477345 0.2570651 0.2958158 0.6770229 0.7046239 1.5633603 1.8403161 2.6546524 2.7868722 3.5726877 3.9591600 4.4334625 5.1533530 6.3537589 6.6470306 8.1231612 8.1876003 8.6258994 9.4405226 9.7598389 12.3116974 13.6197057 14.3627608 14.4547502 14.9626601 15.4061180 16.4035445 16.4260891 16.6923382 19.0856100 20.1018345 20.8783532 21.1040911 22.3290148 24.1695714 24.8660609 25.7097293 28.0477141 29.2708502 29.4614252 30.4266391 31.1419080 32.7368647 33.7015702 34.4232712 36.0880485 37.3687307 37.5023459 41.1547063 41.1904003 41.4719532 42.0070550 42.0692523 42.4532995 44.5175285 45.0945463 45.5330069 47.0023033 47.6142457 48.1620612 49.0386839 49.7577669 50.6330808 52.4315363 54.5741794 55.6688383 55.9136724 56.4977354 57.3221378 58.1016143 58.7414450 59.3173424 62.7806147 64.4105325 65.2265695 65.6583923 66.0779265 66.3514097 67.6939976 67.7714923 69.1697778 69.6141792 70.9556447 71.5418793 73.5139071 73.9645729 74.0636121 77.1520634 78.2463504 78.9027776 79.1217400 79.5880901 79.7180984 81.3840151 83.6500517 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034332 0.0034344 0.0034347 0.0034349 0.0034352 7.0165456 9.3534780 9.9556852 12.4717107 23.0892387 23.7252986 55.0575480 59.0617019 89.3504927 91.1536266 135.7765640 147.3131410 176.9290378 181.2816351 205.2545556 216.0711610 228.6476792 246.5132267 273.7225928 279.9684679 309.4979778 310.7231391 318.9315426 333.6516666 339.2474603 381.0256806 400.7551771 411.5420761 412.8578781 420.0487397 426.2279153 439.8090194 440.1111465 443.6636706 474.4039573 486.8701250 496.1847360 498.8599129 513.1331362 533.8629161 541.5003938 550.6099208 575.1008592 587.5068696 589.4163198 598.9937233 605.9933927 621.3178378 630.4060147 637.1201630 652.3444613 663.8186561 665.0043683 696.6345882 696.9366231 699.3144870 703.8115634 704.3324165 707.5400123 724.5373908 729.2178503 732.7544180 744.4831119 749.3138060 753.6120130 760.4395276 765.9946228 772.7027482 786.3059682 802.2115070 810.2170152 811.9967463 816.2267066 822.1602392 827.7313036 832.2764250 836.3462673 860.4151765 871.5127097 877.0160660 879.9143542 882.7210504 884.5458667 893.4502220 893.9614777 903.1366584 906.0332455 914.7212227 918.4921576 931.0650677 933.9145836 934.5396343 953.8257728 960.5662544 964.5870480 965.9245297 968.7669665 969.5578916 979.6362256 993.1809645 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10724 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9871E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1750E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4192E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.4053E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3191E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5209E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7735E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2958 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.573 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.441 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.65 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99995 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 193032 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99995 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406121241352526571.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406121241352526571.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2406121241352526571.atom Openam> file on opening on unit 11: 2406121241352526571.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 702 First residue number = 1 Last residue number = 351 Number of atoms found = 10724 Mean number per residue = 15.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9871E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1750E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4192E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4053E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3191E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5209E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7735E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2958 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.573 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.647 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.441 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.65 Bfactors> 106 vectors, 32172 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.004175 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.032 for 702 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.852 +/- 1.80 Bfactors> = 80.466 +/- 9.36 Bfactors> Shiftng-fct= 79.614 Bfactors> Scaling-fct= 5.190 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406121241352526571.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406121241352526571.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.955 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.7 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vecteur en lecture: 811.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.1 Chkmod> 106 vectors, 32172 coordinates in file. Chkmod> That is: 10724 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6766 0.0034 0.5009 0.0034 0.9115 0.0034 0.6931 0.0034 0.7585 0.0034 0.9442 7.0162 0.1487 9.3531 0.3691 9.9553 0.3181 12.4714 0.5911 23.0881 0.0690 23.7244 0.0728 55.0589 0.2173 59.0576 0.2852 89.3451 0.0892 91.1482 0.0972 135.7551 0.5713 147.2942 0.4549 176.9330 0.5437 181.2780 0.4924 205.2547 0.4730 216.0575 0.3737 228.6259 0.4173 246.4942 0.4634 273.7160 0.0821 279.9558 0.0879 309.4816 0.3072 310.7174 0.0914 318.9197 0.1522 333.6458 0.1924 339.2357 0.2193 380.9831 0.5071 400.7423 0.1241 411.4849 0.2683 412.7723 0.1994 419.9934 0.2321 426.2633 0.3680 439.7426 0.1673 440.1446 0.2017 443.6136 0.2844 474.4381 0.2630 486.8270 0.2354 496.1830 0.0637 498.7901 0.0645 513.1224 0.2219 533.8447 0.1040 541.5200 0.4176 550.5892 0.4638 575.0996 0.1592 587.4731 0.2108 589.3768 0.3784 599.0011 0.1982 605.9488 0.3446 621.3209 0.4925 630.3643 0.2678 637.0625 0.3352 652.3341 0.2062 663.8014 0.1128 664.9550 0.1039 696.5649 0.3693 696.9033 0.3377 699.2680 0.1999 703.8060 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2406121241352526571 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2406121241352526571 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406121241352526571.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2406121241352526571.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2406121241352526571 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2406121241352526571.eigenfacs 2406121241352526571.atom making animated gifs 11 models are in 2406121241352526571.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2406121241352526571.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2406121241352526571.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2406121241352526571.10.pdb 2406121241352526571.11.pdb 2406121241352526571.7.pdb 2406121241352526571.8.pdb 2406121241352526571.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m57.714s user 0m57.484s sys 0m0.200s rm: cannot remove '2406121241352526571.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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