*** Mustii2 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2406081248061747729.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2406081248061747729.atom to be opened.
Openam> File opened: 2406081248061747729.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 364
First residue number = 1
Last residue number = 364
Number of atoms found = 2862
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.231223 +/- 15.338370 From: -29.813000 To: 44.189000
= -0.194937 +/- 16.238405 From: -41.132000 To: 35.220000
= -0.036812 +/- 12.559387 From: -35.148000 To: 25.926000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8016 % Filled.
Pdbmat> 1032772 non-zero elements.
Pdbmat> 112860 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.87 +/- 23.33
Maximum number = 128
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 2.257200E+06
Pdbmat> Larger element = 480.013
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
364 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2406081248061747729.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2406081248061747729.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2406081248061747729.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2862 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 364 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 25
Blocpdb> 14 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 12 atoms in block 5
Block first atom: 54
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 66
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 88
Blocpdb> 14 atoms in block 8
Block first atom: 101
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 115
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 130
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 144
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 159
Blocpdb> 18 atoms in block 13
Block first atom: 174
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 192
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 207
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 221
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 238
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 251
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 267
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 284
Blocpdb> 18 atoms in block 21
Block first atom: 298
Blocpdb> 13 atoms in block 22
Block first atom: 316
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 329
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 343
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 360
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 374
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 390
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 405
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 419
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 433
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 446
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 460
Blocpdb> 18 atoms in block 33
Block first atom: 474
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 492
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 509
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 527
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 541
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 556
Blocpdb> 13 atoms in block 39
Block first atom: 569
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 582
Blocpdb> 18 atoms in block 41
Block first atom: 603
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 621
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 634
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 651
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 670
Blocpdb> 12 atoms in block 46
Block first atom: 682
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 694
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 713
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 728
Blocpdb> 12 atoms in block 50
Block first atom: 742
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 754
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 769
Blocpdb> 9 atoms in block 53
Block first atom: 782
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 791
Blocpdb> 13 atoms in block 55
Block first atom: 810
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 823
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 841
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 852
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 868
Blocpdb> 26 atoms in block 60
Block first atom: 880
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 906
Blocpdb> 20 atoms in block 62
Block first atom: 922
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 942
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 959
Blocpdb> 10 atoms in block 65
Block first atom: 977
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 987
Blocpdb> 10 atoms in block 67
Block first atom: 1003
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1013
Blocpdb> 15 atoms in block 69
Block first atom: 1030
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1045
Blocpdb> 13 atoms in block 71
Block first atom: 1061
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1074
Blocpdb> 12 atoms in block 73
Block first atom: 1090
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1102
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1117
Blocpdb> 14 atoms in block 76
Block first atom: 1133
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1147
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1162
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1180
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1196
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1212
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1230
Blocpdb> 13 atoms in block 83
Block first atom: 1242
Blocpdb> 20 atoms in block 84
Block first atom: 1255
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1275
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1291
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 1308
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1330
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1347
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1363
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1380
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1396
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1412
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1427
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 1443
Blocpdb> 19 atoms in block 96
Block first atom: 1465
Blocpdb> 13 atoms in block 97
Block first atom: 1484
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1497
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1514
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1529
Blocpdb> 17 atoms in block 101
Block first atom: 1545
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 1562
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1582
Blocpdb> 19 atoms in block 104
Block first atom: 1597
Blocpdb> 18 atoms in block 105
Block first atom: 1616
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1634
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1648
Blocpdb> 16 atoms in block 108
Block first atom: 1666
Blocpdb> 21 atoms in block 109
Block first atom: 1682
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1703
Blocpdb> 15 atoms in block 111
Block first atom: 1719
Blocpdb> 17 atoms in block 112
Block first atom: 1734
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1751
Blocpdb> 13 atoms in block 114
Block first atom: 1768
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 1781
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1799
Blocpdb> 12 atoms in block 117
Block first atom: 1811
Blocpdb> 17 atoms in block 118
Block first atom: 1823
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1840
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 1860
Blocpdb> 15 atoms in block 121
Block first atom: 1882
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 1897
Blocpdb> 11 atoms in block 123
Block first atom: 1913
Blocpdb> 17 atoms in block 124
Block first atom: 1924
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1941
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 1954
Blocpdb> 11 atoms in block 127
Block first atom: 1973
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 1984
Blocpdb> 19 atoms in block 129
Block first atom: 2004
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 2023
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2044
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 2059
Blocpdb> 17 atoms in block 133
Block first atom: 2074
Blocpdb> 19 atoms in block 134
Block first atom: 2091
Blocpdb> 18 atoms in block 135
Block first atom: 2110
Blocpdb> 9 atoms in block 136
Block first atom: 2128
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 2137
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2156
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2172
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 2184
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2195
Blocpdb> 13 atoms in block 142
Block first atom: 2215
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2228
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2241
Blocpdb> 14 atoms in block 145
Block first atom: 2256
Blocpdb> 13 atoms in block 146
Block first atom: 2270
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2283
Blocpdb> 25 atoms in block 148
Block first atom: 2299
Blocpdb> 14 atoms in block 149
Block first atom: 2324
Blocpdb> 15 atoms in block 150
Block first atom: 2338
Blocpdb> 14 atoms in block 151
Block first atom: 2353
Blocpdb> 12 atoms in block 152
Block first atom: 2367
Blocpdb> 20 atoms in block 153
Block first atom: 2379
Blocpdb> 15 atoms in block 154
Block first atom: 2399
Blocpdb> 16 atoms in block 155
Block first atom: 2414
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2430
Blocpdb> 15 atoms in block 157
Block first atom: 2447
Blocpdb> 11 atoms in block 158
Block first atom: 2462
Blocpdb> 19 atoms in block 159
Block first atom: 2473
Blocpdb> 14 atoms in block 160
Block first atom: 2492
Blocpdb> 16 atoms in block 161
Block first atom: 2506
Blocpdb> 15 atoms in block 162
Block first atom: 2522
Blocpdb> 20 atoms in block 163
Block first atom: 2537
Blocpdb> 19 atoms in block 164
Block first atom: 2557
Blocpdb> 20 atoms in block 165
Block first atom: 2576
Blocpdb> 14 atoms in block 166
Block first atom: 2596
Blocpdb> 12 atoms in block 167
Block first atom: 2610
Blocpdb> 17 atoms in block 168
Block first atom: 2622
Blocpdb> 15 atoms in block 169
Block first atom: 2639
Blocpdb> 16 atoms in block 170
Block first atom: 2654
Blocpdb> 21 atoms in block 171
Block first atom: 2670
Blocpdb> 13 atoms in block 172
Block first atom: 2691
Blocpdb> 16 atoms in block 173
Block first atom: 2704
Blocpdb> 17 atoms in block 174
Block first atom: 2720
Blocpdb> 15 atoms in block 175
Block first atom: 2737
Blocpdb> 16 atoms in block 176
Block first atom: 2752
Blocpdb> 12 atoms in block 177
Block first atom: 2768
Blocpdb> 15 atoms in block 178
Block first atom: 2780
Blocpdb> 14 atoms in block 179
Block first atom: 2795
Blocpdb> 16 atoms in block 180
Block first atom: 2809
Blocpdb> 18 atoms in block 181
Block first atom: 2825
Blocpdb> 11 atoms in block 182
Block first atom: 2843
Blocpdb> 9 atoms in block 183
Block first atom: 2853
Blocpdb> 183 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1032955 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8586
Prepmat> Matrix trace = 2257200.0000
Prepmat> Last element read: 8586 8586 34.8368
Prepmat> 16837 lines saved.
Prepmat> 15036 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2862
RTB> Total mass = 2862.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2862
RTB> Number of blocks = 183
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 240463.2800
RTB> 62055 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1098
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62055
Diagstd> Projected matrix trace = 240463.2800
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1098 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 240463.2800
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2367959 0.2951798 0.4390316 0.9552198
1.2174594 1.2843182 1.4056282 1.7845496 2.3918720
2.4982266 3.8767286 4.3989062 4.9981035 5.1999527
5.2846543 5.7617376 6.3925687 7.1888054 7.3979787
8.5752107 9.0559092 9.7367867 10.0445014 11.9386918
12.2040645 13.0404483 13.9420023 14.5179402 15.2298763
16.3945483 17.0455208 17.4048876 17.7122532 18.1965893
18.6820396 19.6874588 20.6399312 20.9112857 21.4924047
21.8312144 22.5589896 22.9884793 23.8971740 24.0147345
25.0341067 25.4327330 26.6863500 27.6877193 28.2131084
29.6355856 29.9790857 30.4832106 30.8212214 31.2104505
31.4435640 32.7286781 33.3881336 33.7236531 34.3485963
35.0161613 36.3401958 36.5683675 36.9071046 37.7868284
38.0253217 38.8775154 38.9689719 39.8121619 40.4942559
40.8085567 41.3754520 42.0454379 42.5454006 43.0083348
43.4137423 43.8508805 44.9752371 45.2066133 45.8680442
46.8605892 47.2699953 47.4931252 47.7319144 48.3624099
48.4379337 49.9442453 50.3312061 50.8464407 51.3485223
52.1200016 52.3534570 53.0443032 53.0999256 53.5711570
54.2773722 54.6183135 55.6579602 55.9786516 56.9266854
57.1272683
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034329 0.0034331 0.0034338 0.0034340
0.0034345 52.8423757 58.9981758 71.9520478 106.1321427
119.8181267 123.0641613 128.7450412 145.0639823 167.9439046
171.6371099 213.8099835 227.7548479 242.7716120 247.6252781
249.6339061 260.6585766 274.5572916 291.1545911 295.3600937
317.9930881 326.7843959 338.8465820 344.1592705 375.2093490
379.3564978 392.1403576 405.4691861 413.7593133 423.7829382
439.6884000 448.3327013 453.0340988 457.0168227 463.2231731
469.3614581 481.8258671 493.3434912 496.5759114 503.4284845
507.3810317 515.7688412 520.6554297 530.8460049 532.1501331
543.3270532 547.6357561 560.9703003 571.3982051 576.7940195
591.1559121 594.5720256 599.5503121 602.8651827 606.6599140
608.9212963 621.2401451 627.4676671 630.6125169 636.4287306
642.5834668 654.6194604 656.6713471 659.7057480 667.5218726
669.6251066 677.0870871 677.8830177 685.1776072 691.0221867
693.6987274 698.5003947 704.1330349 708.3070902 712.1501898
715.4987712 719.0919704 728.2525453 730.1233988 735.4453246
743.3599395 746.6001278 748.3601521 750.2391212 755.1778564
755.7672777 767.4286486 770.3958758 774.3290608 778.1427137
783.9664736 785.7202797 790.8873961 791.3019511 794.8053711
800.0270785 802.5358152 810.1378499 812.4684343 819.3193826
820.7615613
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2862
Rtb_to_modes> Number of blocs = 183
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9552
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.785
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.398
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.737
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.90
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.21
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.13
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1098 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999
1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00000 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
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1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 51516 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999
1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00000 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
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1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406081248061747729.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406081248061747729.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2406081248061747729.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2406081248061747729.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 364
First residue number = 1
Last residue number = 364
Number of atoms found = 2862
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2952
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.217
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.392
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.399
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.998
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.200
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.056
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.13
Bfactors> 106 vectors, 8586 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.236800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.092 +/- 0.13
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.092
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2406081248061747729.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406081248061747729.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7
Chkmod> 106 vectors, 8586 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2862 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7020
0.0034 0.6954
0.0034 0.9890
0.0034 0.7393
0.0034 0.9743
0.0034 0.7588
52.8406 0.1757
58.9977 0.4997
71.9464 0.3960
106.1265 0.3886
119.7904 0.1657
123.0436 0.4327
128.7565 0.4685
145.0761 0.4043
167.9412 0.2072
171.6220 0.3600
213.8083 0.5947
227.7475 0.3083
242.7587 0.4976
247.6158 0.4724
249.6314 0.3378
260.6533 0.2860
274.5548 0.2164
291.1460 0.3792
295.3478 0.3912
317.9755 0.4148
326.7720 0.3866
338.8357 0.5518
344.0674 0.4681
375.2138 0.3632
379.2770 0.4264
392.1168 0.4265
405.4227 0.2842
413.7709 0.4717
423.7665 0.2316
439.6085 0.4094
448.3724 0.3052
452.9510 0.2115
456.9681 0.2449
463.2467 0.3001
469.3157 0.5505
481.8363 0.1420
493.3231 0.3703
496.5393 0.1788
503.3787 0.2727
507.3451 0.4166
515.7583 0.1568
520.6503 0.2582
530.8546 0.4908
532.0748 0.4808
543.2592 0.4271
547.5828 0.4158
560.9846 0.2236
571.3972 0.1235
576.7375 0.4393
591.1746 0.4381
594.5556 0.4530
599.4930 0.2724
602.8274 0.3151
606.6295 0.3194
608.8606 0.2789
621.2260 0.2966
627.4583 0.3776
630.5513 0.4301
636.4144 0.4611
642.5911 0.4083
654.5896 0.3807
656.6578 0.4006
659.7033 0.3148
667.5212 0.1743
669.6376 0.4671
677.0797 0.3657
677.8629 0.2924
685.1296 0.3585
690.9562 0.4343
693.6812 0.2864
698.5088 0.3350
704.1410 0.3173
708.3150 0.2679
712.1334 0.3124
715.4372 0.2375
719.0539 0.2019
728.2598 0.3445
730.1194 0.3863
735.4294 0.4008
743.3234 0.4606
746.5681 0.3801
748.3034 0.3972
750.1919 0.3954
755.1266 0.3079
755.7510 0.3639
767.3631 0.3233
770.3536 0.4948
774.3229 0.3783
778.1205 0.3200
783.9328 0.3583
785.6606 0.4167
790.8214 0.3072
791.2685 0.2569
794.7627 0.4404
800.0121 0.4333
802.5138 0.4301
810.1179 0.4297
812.4433 0.4988
819.3081 0.3918
820.7460 0.4133
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2406081248061747729.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2406081248061747729.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2406081248061747729.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2406081248061747729.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2406081248061747729.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2406081248061747729.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7
Projmod> 106 vectors, 8586 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 364
First residue number = 1
Last residue number = 364
Number of atoms found = 2862
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 364
First residue number = 1
Last residue number = 364
Number of atoms found = 2862
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2862 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 0.00
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 2 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 3 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 4 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 5 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 6 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 7 F= 52.84 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 8 F= 59.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 9 F= 71.95 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 10 F= 106.13 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 11 F= 119.79 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 12 F= 123.04 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 13 F= 128.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 14 F= 145.08 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 15 F= 167.94 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 16 F= 171.62 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 17 F= 213.81 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 18 F= 227.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 19 F= 242.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 20 F= 247.62 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 21 F= 249.63 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 22 F= 260.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 23 F= 274.55 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 24 F= 291.15 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 25 F= 295.35 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 26 F= 317.98 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 27 F= 326.77 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 28 F= 338.84 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 29 F= 344.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 30 F= 375.21 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 31 F= 379.28 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 32 F= 392.12 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 33 F= 405.42 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 34 F= 413.77 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 35 F= 423.77 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 36 F= 439.61 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 37 F= 448.37 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 38 F= 452.95 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 39 F= 456.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 40 F= 463.25 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 41 F= 469.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
%Projmod-Wn> Eigenvector 42 Norm= 1.0002
Vector: 42 F= 481.84 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 43 F= 493.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 44 F= 496.54 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 45 F= 503.38 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 46 F= 507.35 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 47 F= 515.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 48 F= 520.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 49 F= 530.85 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 50 F= 532.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 51 F= 543.26 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 52 F= 547.58 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 53 F= 560.98 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 54 F= 571.40 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 55 F= 576.74 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 56 F= 591.17 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 57 F= 594.56 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 58 F= 599.49 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 59 F= 602.83 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 60 F= 606.63 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 61 F= 608.86 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 62 F= 621.23 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 63 F= 627.46 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 106 F= 820.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 52.840569
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.00 for mode -1 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2406081248061747729 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406081248061747729.eigenfacs
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2406081248061747729.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2406081248061747729.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2406081248061747729.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406081248061747729.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
making animated gifs
11 models are in 2406081248061747729.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 271 1.915 259 0.816
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 271 1.532 260 0.712
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 271 1.149 263 0.671
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 271 0.766 266 0.557
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 271 0.383 271 0.383
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 271 0.000 271 0.000
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 271 0.383 271 0.383
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 271 0.766 266 0.557
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 271 1.149 263 0.671
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 271 1.533 260 0.713
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 271 1.916 259 0.817
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2406081248061747729 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
making animated gifs
11 models are in 2406081248061747729.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 271 1.643 257 1.363
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 271 1.315 264 1.190
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 271 0.986 271 0.986
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 271 0.657 271 0.657
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 271 0.329 271 0.329
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 271 0.000 271 0.000
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 271 0.329 271 0.329
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 271 0.657 271 0.657
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 271 0.986 271 0.986
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 271 1.314 264 1.190
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 271 1.643 257 1.363
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2406081248061747729 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
making animated gifs
11 models are in 2406081248061747729.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 271 1.458 263 1.331
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 271 1.166 270 1.147
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 271 0.874 271 0.874
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 271 0.582 271 0.582
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 271 0.291 271 0.291
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 271 0.000 271 0.000
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 271 0.290 271 0.290
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 271 0.581 271 0.581
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 271 0.871 271 0.871
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 271 1.161 270 1.142
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 271 1.450 262 1.316
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2406081248061747729 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
making animated gifs
11 models are in 2406081248061747729.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 271 1.079 269 1.046
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 271 0.863 271 0.863
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 271 0.648 271 0.648
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 271 0.432 271 0.432
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 271 0.216 271 0.216
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 271 0.000 271 0.000
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 271 0.216 271 0.216
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 271 0.432 271 0.432
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 271 0.648 271 0.648
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 271 0.864 271 0.864
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 271 1.080 269 1.047
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2406081248061747729 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2406081248061747729.eigenfacs
2406081248061747729.atom
making animated gifs
11 models are in 2406081248061747729.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2406081248061747729.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2406081248061747729.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 271 1.683 256 0.949
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 271 1.346 260 0.824
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 271 1.010 263 0.688
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 271 0.673 268 0.573
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 271 0.337 271 0.337
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 271 0.000 271 0.000
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 271 0.337 271 0.337
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 271 0.673 268 0.573
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 271 1.009 263 0.687
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 271 1.346 260 0.822
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 271 1.682 256 0.945
2406081248061747729.10.pdb
2406081248061747729.11.pdb
2406081248061747729.7.pdb
2406081248061747729.8.pdb
2406081248061747729.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.429s
user 0m20.369s
sys 0m0.060s
rm: cannot remove '2406081248061747729.sdijf': No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG
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