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***  opt_a_lac  ***

LOGs for ID: 2406061849031399629

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2406061849031399629.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2406061849031399629.atom to be opened. Openam> File opened: 2406061849031399629.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 133 First residue number = 1001 Last residue number = 1134 Number of atoms found = 2010 Mean number per residue = 15.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 12.344606 +/- 7.592445 From: -6.294000 To: 29.561000 = 54.229585 +/- 7.792408 From: 34.355000 To: 71.014000 = 23.904998 +/- 8.080198 From: 7.492000 To: 43.249000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 7.9097 % Filled. Pdbmat> 1438256 non-zero elements. Pdbmat> 158494 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 157.71 +/- 48.12 Maximum number = 244 Minimum number = 35 Pdbmat> Matrix trace = 3.169880E+06 Pdbmat> Larger element = 860.918 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 133 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2406061849031399629.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2406061849031399629.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2406061849031399629.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2010 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 133 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 7 atoms in block 3 Block first atom: 24 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 31 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 50 Blocpdb> 10 atoms in block 6 Block first atom: 66 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 76 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 87 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 101 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 120 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 134 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 153 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 175 Blocpdb> 7 atoms in block 14 Block first atom: 189 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 196 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 211 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 230 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 254 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 270 Blocpdb> 7 atoms in block 20 Block first atom: 294 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 301 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 316 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 332 Blocpdb> 14 atoms in block 24 Block first atom: 342 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 356 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 368 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 378 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 400 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 411 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 431 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 447 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 466 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 480 Blocpdb> 7 atoms in block 34 Block first atom: 499 Blocpdb> 22 atoms in block 35 Block first atom: 506 Blocpdb> 12 atoms in block 36 Block first atom: 528 Blocpdb> 11 atoms in block 37 Block first atom: 540 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 551 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 565 Blocpdb> 19 atoms in block 40 Block first atom: 579 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 598 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 609 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 628 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 645 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 665 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 679 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 693 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 717 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 737 Blocpdb> 10 atoms in block 50 Block first atom: 751 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 761 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 778 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 785 Blocpdb> 10 atoms in block 54 Block first atom: 797 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 807 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 821 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 835 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 854 Blocpdb> 11 atoms in block 59 Block first atom: 870 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 881 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 895 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 906 Blocpdb> 12 atoms in block 63 Block first atom: 928 Blocpdb> 12 atoms in block 64 Block first atom: 940 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 952 Blocpdb> 10 atoms in block 66 Block first atom: 959 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 969 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 993 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1000 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1014 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1029 Blocpdb> 24 atoms in block 72 Block first atom: 1046 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1070 Blocpdb> 10 atoms in block 74 Block first atom: 1085 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1095 Blocpdb> 20 atoms in block 76 Block first atom: 1111 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1131 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1145 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1165 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1182 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 1196 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1203 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1214 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1230 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1240 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1255 Blocpdb> 10 atoms in block 87 Block first atom: 1271 Blocpdb> 19 atoms in block 88 Block first atom: 1281 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1300 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 1314 Blocpdb> 12 atoms in block 91 Block first atom: 1334 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1346 Blocpdb> 10 atoms in block 93 Block first atom: 1363 Blocpdb> 14 atoms in block 94 Block first atom: 1373 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1387 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1406 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1420 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 1436 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1458 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1477 Blocpdb> 12 atoms in block 101 Block first atom: 1491 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 1503 Blocpdb> 21 atoms in block 103 Block first atom: 1510 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1531 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1546 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 107 Block first atom: 1588 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1608 Blocpdb> 14 atoms in block 109 Block first atom: 1622 Blocpdb> 24 atoms in block 110 Block first atom: 1636 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 1660 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 1679 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 1693 Blocpdb> 15 atoms in block 114 Block first atom: 1712 Blocpdb> 10 atoms in block 115 Block first atom: 1727 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1737 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1756 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 1770 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1791 Blocpdb> 10 atoms in block 120 Block first atom: 1808 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 1818 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1828 Blocpdb> 7 atoms in block 123 Block first atom: 1840 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1847 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 1859 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 1879 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 1901 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 1920 Blocpdb> 10 atoms in block 129 Block first atom: 1942 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1952 Blocpdb> 10 atoms in block 131 Block first atom: 1968 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 1978 Blocpdb> 13 atoms in block 133 Block first atom: 1997 Blocpdb> 133 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1438389 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6030 Prepmat> Matrix trace = 3169880.0000 Prepmat> Last element read: 6030 6030 156.8672 Prepmat> 8912 lines saved. Prepmat> 6925 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2010 RTB> Total mass = 2010.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2010 RTB> Number of blocks = 133 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 378936.8550 RTB> 69501 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 798 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69501 Diagstd> Projected matrix trace = 378936.8550 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 798 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 378936.8550 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 18.9848130 19.3445183 28.8221400 33.5556410 42.2410182 44.1203041 45.1072757 49.1649456 50.5572601 54.4767738 56.2566136 58.3815587 61.2542279 61.8705289 65.1331201 66.7003957 69.6206830 69.7454879 71.8072718 75.5944667 77.9363137 80.4289028 82.2471511 83.9458897 87.4859195 89.0572535 91.4794500 95.4094289 100.7403900 101.8741418 104.9877765 107.2228384 111.0291564 113.3885654 116.4857016 117.9559741 119.3032149 122.0137576 123.8797541 127.0170529 127.7913280 128.7543891 129.7391261 132.7826224 134.2544372 136.4922770 138.8741108 141.4088530 142.1391900 143.4505791 145.0618357 146.9827729 149.1476568 151.2670762 153.3047988 155.8002409 157.6617925 159.9258088 161.6029767 163.2524196 165.7041461 168.4421961 170.8603614 172.1998905 173.7273344 174.3507515 175.5565351 179.1808405 184.8862542 185.4181675 187.4914373 188.1360681 190.3003170 191.6223998 193.1024613 193.2677507 194.0402649 196.0030745 198.8488229 199.4031431 199.9112130 202.1305873 204.1732361 206.9708999 207.4627113 210.1246404 211.3266621 212.3455901 213.0498852 214.3417950 214.9550069 216.5237886 218.2164424 220.9243201 222.1278737 223.9806077 224.6502842 225.2197767 226.2822015 227.6907490 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034315 0.0034338 0.0034347 0.0034359 0.0034364 0.0034367 473.1495620 477.6109121 582.9863573 629.0396916 705.7688223 721.2976689 729.3207661 761.4178637 772.1239883 801.4952822 814.4830924 829.7229889 849.8911665 854.1559975 876.3875950 886.8690219 906.0755683 906.8873384 920.1942042 944.1484488 958.6613324 973.8708177 984.8173976 994.9356633 1015.6974463 1024.7783200 1038.6208880 1060.6959933 1089.9262047 1096.0421648 1112.6655692 1124.4468447 1144.2312388 1156.3249876 1172.0107364 1179.3840524 1186.1001305 1199.4984227 1208.6357820 1223.8446570 1227.5691676 1232.1860895 1236.8891059 1251.3128403 1258.2287501 1268.6718970 1279.6933877 1291.3191156 1294.6494716 1300.6080362 1307.8919439 1316.5231447 1326.1831255 1335.5725566 1344.5382294 1355.4370192 1363.5105738 1373.2656536 1380.4477026 1387.4747671 1397.8544964 1409.3560617 1419.4364082 1424.9896688 1431.2956729 1433.8614612 1438.8111035 1453.5871161 1476.5480765 1478.6705474 1486.9145099 1489.4684623 1498.0111161 1503.2057129 1508.9998095 1509.6454987 1512.6596060 1520.2909916 1531.2876945 1533.4205534 1535.3728524 1543.8720299 1551.6532892 1562.2478089 1564.1028412 1574.1052662 1578.6011941 1582.4022923 1585.0243283 1589.8227668 1592.0953101 1597.8944524 1604.1279867 1614.0502216 1618.4407691 1625.1763344 1627.6040671 1629.6657643 1633.5050369 1638.5812202 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2010 Rtb_to_modes> Number of blocs = 133 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9856E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99995 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99996 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99995 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406061849031399629.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406061849031399629.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2406061849031399629.atom Openam> file on opening on unit 11: 2406061849031399629.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 133 First residue number = 1001 Last residue number = 1134 Number of atoms found = 2010 Mean number per residue = 15.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9856E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du 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Valeur propre du vecteur en lecture: 163.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.9 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 213.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 222.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 225.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 226.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.7 Bfactors> 106 vectors, 6030 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 18.980000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.576 for 133 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.006 +/- 0.01 Bfactors> = 17.373 +/- 6.18 Bfactors> Shiftng-fct= 17.367 Bfactors> Scaling-fct= 879.155 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406061849031399629.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406061849031399629.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1630. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1633. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1639. Chkmod> 106 vectors, 6030 coordinates in file. Chkmod> That is: 2010 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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