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LOGs for ID: 2406061503071366589

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2406061503071366589.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2406061503071366589.atom to be opened. Openam> File opened: 2406061503071366589.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 372 First residue number = 1 Last residue number = 372 Number of atoms found = 3436 Mean number per residue = 9.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 10.625842 +/- 13.681552 From: -18.288000 To: 51.527000 = -15.752493 +/- 15.020049 From: -60.417000 To: 20.609000 = -40.253724 +/- 14.893368 From: -86.309000 To: -10.724000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5127 % Filled. Pdbmat> 1335085 non-zero elements. Pdbmat> 146086 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.03 +/- 30.09 Maximum number = 147 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.921720E+06 Pdbmat> Larger element = 588.911 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 372 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2406061503071366589.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2406061503071366589.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2406061503071366589.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3436 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 372 residues. Blocpdb> 20 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 21 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 59 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 72 Blocpdb> 21 atoms in block 6 Block first atom: 95 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 116 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 133 Blocpdb> 16 atoms in block 9 Block first atom: 148 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 164 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 183 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 197 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 214 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 237 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 264 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 288 Blocpdb> 26 atoms in block 17 Block first atom: 313 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 339 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 356 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 373 Blocpdb> 11 atoms in block 21 Block first atom: 384 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 395 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 411 Blocpdb> 14 atoms in block 24 Block first atom: 423 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 437 Blocpdb> 29 atoms in block 26 Block first atom: 453 Blocpdb> 15 atoms in block 27 Block first atom: 482 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 497 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 515 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 529 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 549 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 563 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 590 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 610 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 629 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 645 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 660 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 680 Blocpdb> 18 atoms in block 39 Block first atom: 698 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 716 Blocpdb> 20 atoms in block 41 Block first atom: 743 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 763 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 782 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 808 Blocpdb> 23 atoms in block 45 Block first atom: 825 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 848 Blocpdb> 20 atoms in block 47 Block first atom: 867 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 887 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 910 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 926 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 950 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 966 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 980 Blocpdb> 21 atoms in block 54 Block first atom: 1002 Blocpdb> 26 atoms in block 55 Block first atom: 1023 Blocpdb> 21 atoms in block 56 Block first atom: 1049 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 1070 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1089 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 1111 Blocpdb> 24 atoms in block 60 Block first atom: 1129 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 1153 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1169 Blocpdb> 18 atoms in block 63 Block first atom: 1192 Blocpdb> 14 atoms in block 64 Block first atom: 1210 Blocpdb> 23 atoms in block 65 Block first atom: 1224 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 1247 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 1259 Blocpdb> 15 atoms in block 68 Block first atom: 1272 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1287 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1306 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1323 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1339 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1355 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 1375 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1387 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1399 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1415 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1432 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1452 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1471 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1488 Blocpdb> 25 atoms in block 82 Block first atom: 1510 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1535 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1554 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1569 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1582 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1599 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1624 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1639 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1655 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1665 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 1682 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1702 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1721 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1741 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1758 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1779 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 1795 Blocpdb> 24 atoms in block 99 Block first atom: 1810 Blocpdb> 15 atoms in block 100 Block first atom: 1834 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1849 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 1869 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1889 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1902 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 1917 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1936 Blocpdb> 18 atoms in block 107 Block first atom: 1953 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1971 Blocpdb> 17 atoms in block 109 Block first atom: 1985 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 2002 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 2022 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 2040 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 2058 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 2076 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 2090 Blocpdb> 20 atoms in block 116 Block first atom: 2106 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 2126 Blocpdb> 24 atoms in block 118 Block first atom: 2142 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 2166 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 2182 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 2202 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2229 Blocpdb> 10 atoms in block 123 Block first atom: 2254 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 2264 Blocpdb> 29 atoms in block 125 Block first atom: 2282 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 2311 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 2330 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2348 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 2364 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2384 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2403 Blocpdb> 14 atoms in block 132 Block first atom: 2422 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2436 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2455 Blocpdb> 25 atoms in block 135 Block first atom: 2470 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 2495 Blocpdb> 20 atoms in block 137 Block first atom: 2511 Blocpdb> 25 atoms in block 138 Block first atom: 2531 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2556 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 2571 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2585 Blocpdb> 34 atoms in block 142 Block first atom: 2600 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2634 Blocpdb> 10 atoms in block 144 Block first atom: 2654 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2664 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2683 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2700 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2715 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 2730 Blocpdb> 18 atoms in block 150 Block first atom: 2751 Blocpdb> 20 atoms in block 151 Block first atom: 2769 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2789 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2803 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2820 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 2836 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 2853 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2872 Blocpdb> 19 atoms in block 158 Block first atom: 2889 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 2908 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 2931 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2948 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 2966 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 2983 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 3007 Blocpdb> 21 atoms in block 165 Block first atom: 3024 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3045 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 3067 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 3083 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 3105 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 3124 Blocpdb> 15 atoms in block 171 Block first atom: 3141 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 3156 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 3180 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 3194 Blocpdb> 16 atoms in block 175 Block first atom: 3211 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 3227 Blocpdb> 30 atoms in block 177 Block first atom: 3242 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 3272 Blocpdb> 17 atoms in block 179 Block first atom: 3298 Blocpdb> 15 atoms in block 180 Block first atom: 3315 Blocpdb> 13 atoms in block 181 Block first atom: 3330 Blocpdb> 15 atoms in block 182 Block first atom: 3343 Blocpdb> 18 atoms in block 183 Block first atom: 3358 Blocpdb> 23 atoms in block 184 Block first atom: 3376 Blocpdb> 18 atoms in block 185 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 186 Block first atom: 3416 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1335271 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10308 Prepmat> Matrix trace = 2921720.0000 Prepmat> Last element read: 10308 10308 47.2866 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 15510 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3436 RTB> Total mass = 3436.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3436 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 260849.7143 RTB> 64926 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64926 Diagstd> Projected matrix trace = 260849.7143 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 260849.7143 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0106323 0.0381638 0.0404742 0.0988631 0.1162570 0.1896444 0.2762443 0.2928040 0.3174843 0.4374973 0.5794255 0.5924204 0.9735695 1.0320591 1.1666724 1.2269662 1.2766455 1.3878250 1.8668999 1.9765336 2.2812954 2.3428172 2.6517701 2.7684563 2.8907976 3.1701496 3.4877066 3.7077046 3.7367017 4.0816251 4.3645155 4.8633137 4.9917479 5.1921431 5.6571182 5.7807470 5.8627677 6.2608952 6.3418555 6.7628055 7.0628488 7.5221027 7.9352866 8.3916745 9.0784633 9.5380153 10.1718133 10.6307583 11.2114458 11.2973961 11.6243871 12.0429420 12.5123716 13.0330170 13.3279373 13.6065138 13.9034681 14.5081494 15.1584789 15.4680716 15.8017908 15.8966343 16.7813287 16.8842642 17.1557399 18.6043959 18.6772868 19.2746590 19.5008885 19.6044903 19.9979701 20.6493636 21.3969391 21.8970068 22.1583555 22.6834912 23.0716737 23.5700658 24.6850004 25.7181978 26.2972156 26.7528417 26.9901430 27.8801324 28.2463678 28.3748838 28.8425411 29.4061473 29.6938276 30.2264793 30.4961071 30.8239594 31.1994708 31.6409407 31.9842009 32.3643210 32.7525231 32.9338414 33.1005990 33.8829580 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034321 0.0034327 0.0034333 0.0034339 0.0034341 11.1972026 21.2139233 21.8466148 34.1438380 37.0258338 47.2895593 57.0744746 58.7602732 61.1866121 71.8262126 82.6597461 83.5815217 107.1466886 110.3183015 117.2923650 120.2850285 122.6960119 127.9271241 148.3733146 152.6677754 164.0159330 166.2128075 176.8329607 180.6816782 184.6307866 193.3459849 202.7987395 209.0970199 209.9130759 219.3874790 226.8628062 239.4756829 242.6172078 247.4392594 258.2812652 261.0882113 262.9339237 271.7149263 273.4660720 282.3961223 288.5926285 297.8275779 305.8979661 314.5716602 327.1910765 335.3700584 346.3334750 354.0604386 363.6018561 364.9929353 370.2374204 376.8439755 384.1183874 392.0286086 396.4393454 400.5610472 404.9084612 413.6197713 422.7884284 427.0840643 431.6665878 432.9600974 444.8447320 446.2069700 449.7798615 468.3850949 469.3017505 476.7477285 479.5373953 480.8095199 485.6106892 493.4562069 502.3091690 508.1449998 511.1684533 517.1901304 521.5966953 527.2003354 539.5253428 550.7005955 556.8653090 561.6687231 564.1542614 573.3802054 577.1339009 578.4453397 583.1926483 588.8631052 591.7365178 597.0202508 599.6771242 602.8919597 606.5531938 610.8294587 614.1338459 617.7724405 621.4664114 623.1842597 624.7599862 632.1002168 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3436 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9861E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0632E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8164E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0474E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8863E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1163 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.032 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.167 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.977 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.343 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.488 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.657 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 0.99996 0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00005 0.99999 0.99996 1.00000 1.00003 0.99998 0.99994 1.00000 1.00000 1.00001 1.00006 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999 1.00005 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99996 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 61848 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 0.99996 0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00005 0.99999 0.99996 1.00000 1.00003 0.99998 0.99994 1.00000 1.00000 1.00001 1.00006 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999 1.00005 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99996 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406061503071366589.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406061503071366589.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2406061503071366589.atom Openam> file on opening on unit 11: 2406061503071366589.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 372 First residue number = 1 Last residue number = 372 Number of atoms found = 3436 Mean number per residue = 9.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9861E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0632E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8164E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0474E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8863E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1163 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.167 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.977 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.343 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.891 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.657 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Bfactors> 106 vectors, 10308 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.010632 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.823 +/- 2.50 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.823 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2406061503071366589.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2406061503071366589.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 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Chkmod> That is: 3436 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2406061503071366589 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2406061503071366589.eigenfacs 2406061503071366589.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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