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***  TRANSPORT PROTEIN 16-FEB-16 5I6C  ***

LOGs for ID: 240603151953864293

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 240603151953864293.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 240603151953864293.atom to be opened. Openam> File opened: 240603151953864293.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 948 First residue number = 66 Last residue number = 545 Number of atoms found = 6979 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -49.537745 +/- 18.371569 From: -94.530000 To: -12.130000 = -28.721731 +/- 18.538632 From: -75.968000 To: 10.107000 = 8.037267 +/- 13.057494 From: -28.350000 To: 40.393000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1957 % Filled. Pdbmat> 2620846 non-zero elements. Pdbmat> 286598 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.13 +/- 21.60 Maximum number = 137 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 5.731960E+06 Pdbmat> Larger element = 508.850 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 948 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 240603151953864293.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 240603151953864293.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 240603151953864293.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6979 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 948 residues. Blocpdb> 41 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 42 Blocpdb> 39 atoms in block 3 Block first atom: 83 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 122 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 159 Blocpdb> 31 atoms in block 6 Block first atom: 195 Blocpdb> 37 atoms in block 7 Block first atom: 226 Blocpdb> 34 atoms in block 8 Block first atom: 263 Blocpdb> 35 atoms in block 9 Block first atom: 297 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 332 Blocpdb> 34 atoms in block 11 Block first atom: 378 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 412 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 445 Blocpdb> 47 atoms in block 14 Block first atom: 483 Blocpdb> 43 atoms in block 15 Block first atom: 530 Blocpdb> 42 atoms in block 16 Block first atom: 573 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 615 Blocpdb> 36 atoms in block 18 Block first atom: 647 Blocpdb> 35 atoms in block 19 Block first atom: 683 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 718 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 749 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 792 Blocpdb> 34 atoms in block 23 Block first atom: 830 Blocpdb> 40 atoms in block 24 Block first atom: 864 Blocpdb> 37 atoms in block 25 Block first atom: 904 Blocpdb> 32 atoms in block 26 Block first atom: 941 Blocpdb> 28 atoms in block 27 Block first atom: 973 Blocpdb> 40 atoms in block 28 Block first atom: 1001 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 1041 Blocpdb> 40 atoms in block 30 Block first atom: 1079 Blocpdb> 42 atoms in block 31 Block first atom: 1119 Blocpdb> 33 atoms in block 32 Block first atom: 1161 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1194 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1232 Blocpdb> 35 atoms in block 35 Block first atom: 1266 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1301 Blocpdb> 33 atoms in block 37 Block first atom: 1336 Blocpdb> 34 atoms in block 38 Block first atom: 1369 Blocpdb> 30 atoms in block 39 Block first atom: 1403 Blocpdb> 40 atoms in block 40 Block first atom: 1433 Blocpdb> 40 atoms in block 41 Block first atom: 1473 Blocpdb> 35 atoms in block 42 Block first atom: 1513 Blocpdb> 44 atoms in block 43 Block first atom: 1548 Blocpdb> 36 atoms in block 44 Block first atom: 1592 Blocpdb> 40 atoms in block 45 Block first atom: 1628 Blocpdb> 38 atoms in block 46 Block first atom: 1668 Blocpdb> 34 atoms in block 47 Block first atom: 1706 Blocpdb> 31 atoms in block 48 Block first atom: 1740 Blocpdb> 31 atoms in block 49 Block first atom: 1771 Blocpdb> 38 atoms in block 50 Block first atom: 1802 Blocpdb> 37 atoms in block 51 Block first atom: 1840 Blocpdb> 30 atoms in block 52 Block first atom: 1877 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 1907 Blocpdb> 41 atoms in block 54 Block first atom: 1951 Blocpdb> 37 atoms in block 55 Block first atom: 1992 Blocpdb> 37 atoms in block 56 Block first atom: 2029 Blocpdb> 39 atoms in block 57 Block first atom: 2066 Blocpdb> 33 atoms in block 58 Block first atom: 2105 Blocpdb> 35 atoms in block 59 Block first atom: 2138 Blocpdb> 32 atoms in block 60 Block first atom: 2173 Blocpdb> 40 atoms in block 61 Block first atom: 2205 Blocpdb> 35 atoms in block 62 Block first atom: 2245 Blocpdb> 44 atoms in block 63 Block first atom: 2280 Blocpdb> 33 atoms in block 64 Block first atom: 2324 Blocpdb> 33 atoms in block 65 Block first atom: 2357 Blocpdb> 33 atoms in block 66 Block first atom: 2390 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 2423 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2456 Blocpdb> 41 atoms in block 69 Block first atom: 2492 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 2533 Blocpdb> 37 atoms in block 71 Block first atom: 2568 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 2605 Blocpdb> 34 atoms in block 73 Block first atom: 2651 Blocpdb> 32 atoms in block 74 Block first atom: 2685 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 2717 Blocpdb> 30 atoms in block 76 Block first atom: 2761 Blocpdb> 34 atoms in block 77 Block first atom: 2791 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 2825 Blocpdb> 46 atoms in block 79 Block first atom: 2856 Blocpdb> 33 atoms in block 80 Block first atom: 2902 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 2935 Blocpdb> 33 atoms in block 82 Block first atom: 2967 Blocpdb> 48 atoms in block 83 Block first atom: 3000 Blocpdb> 45 atoms in block 84 Block first atom: 3048 Blocpdb> 32 atoms in block 85 Block first atom: 3093 Blocpdb> 32 atoms in block 86 Block first atom: 3125 Blocpdb> 43 atoms in block 87 Block first atom: 3157 Blocpdb> 41 atoms in block 88 Block first atom: 3200 Blocpdb> 40 atoms in block 89 Block first atom: 3241 Blocpdb> 40 atoms in block 90 Block first atom: 3281 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 3321 Blocpdb> 41 atoms in block 92 Block first atom: 3362 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 3403 Blocpdb> 35 atoms in block 94 Block first atom: 3437 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 3472 Blocpdb> 37 atoms in block 96 Block first atom: 3509 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 3546 Blocpdb> 41 atoms in block 98 Block first atom: 3587 Blocpdb> 39 atoms in block 99 Block first atom: 3628 Blocpdb> 37 atoms in block 100 Block first atom: 3667 Blocpdb> 36 atoms in block 101 Block first atom: 3704 Blocpdb> 31 atoms in block 102 Block first atom: 3740 Blocpdb> 37 atoms in block 103 Block first atom: 3771 Blocpdb> 34 atoms in block 104 Block first atom: 3808 Blocpdb> 35 atoms in block 105 Block first atom: 3842 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 3877 Blocpdb> 34 atoms in block 107 Block first atom: 3923 Blocpdb> 33 atoms in block 108 Block first atom: 3957 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 3990 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 4028 Blocpdb> 31 atoms in block 111 Block first atom: 4043 Blocpdb> 32 atoms in block 112 Block first atom: 4074 Blocpdb> 39 atoms in block 113 Block first atom: 4106 Blocpdb> 27 atoms in block 114 Block first atom: 4145 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 4172 Blocpdb> 35 atoms in block 116 Block first atom: 4220 Blocpdb> 39 atoms in block 117 Block first atom: 4255 Blocpdb> 38 atoms in block 118 Block first atom: 4294 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 4332 Blocpdb> 29 atoms in block 120 Block first atom: 4371 Blocpdb> 30 atoms in block 121 Block first atom: 4400 Blocpdb> 37 atoms in block 122 Block first atom: 4430 Blocpdb> 39 atoms in block 123 Block first atom: 4467 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 4506 Blocpdb> 44 atoms in block 125 Block first atom: 4544 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 4588 Blocpdb> 37 atoms in block 127 Block first atom: 4621 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 4658 Blocpdb> 34 atoms in block 129 Block first atom: 4692 Blocpdb> 40 atoms in block 130 Block first atom: 4726 Blocpdb> 29 atoms in block 131 Block first atom: 4766 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 4795 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 4831 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 4862 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 4900 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 4938 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 4978 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5019 Blocpdb> 41 atoms in block 139 Block first atom: 5056 Blocpdb> 37 atoms in block 140 Block first atom: 5097 Blocpdb> 32 atoms in block 141 Block first atom: 5134 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 5166 Blocpdb> 30 atoms in block 143 Block first atom: 5201 Blocpdb> 32 atoms in block 144 Block first atom: 5231 Blocpdb> 40 atoms in block 145 Block first atom: 5263 Blocpdb> 33 atoms in block 146 Block first atom: 5303 Blocpdb> 35 atoms in block 147 Block first atom: 5336 Blocpdb> 48 atoms in block 148 Block first atom: 5371 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5419 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 5459 Blocpdb> 35 atoms in block 151 Block first atom: 5493 Blocpdb> 38 atoms in block 152 Block first atom: 5528 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 5566 Blocpdb> 34 atoms in block 154 Block first atom: 5599 Blocpdb> 38 atoms in block 155 Block first atom: 5633 Blocpdb> 39 atoms in block 156 Block first atom: 5671 Blocpdb> 37 atoms in block 157 Block first atom: 5710 Blocpdb> 37 atoms in block 158 Block first atom: 5747 Blocpdb> 32 atoms in block 159 Block first atom: 5784 Blocpdb> 36 atoms in block 160 Block first atom: 5816 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 5852 Blocpdb> 37 atoms in block 162 Block first atom: 5882 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 5919 Blocpdb> 35 atoms in block 164 Block first atom: 5959 Blocpdb> 37 atoms in block 165 Block first atom: 5994 Blocpdb> 42 atoms in block 166 Block first atom: 6031 Blocpdb> 38 atoms in block 167 Block first atom: 6073 Blocpdb> 36 atoms in block 168 Block first atom: 6111 Blocpdb> 37 atoms in block 169 Block first atom: 6147 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 6184 Blocpdb> 35 atoms in block 171 Block first atom: 6218 Blocpdb> 29 atoms in block 172 Block first atom: 6253 Blocpdb> 43 atoms in block 173 Block first atom: 6282 Blocpdb> 36 atoms in block 174 Block first atom: 6325 Blocpdb> 32 atoms in block 175 Block first atom: 6361 Blocpdb> 34 atoms in block 176 Block first atom: 6393 Blocpdb> 47 atoms in block 177 Block first atom: 6427 Blocpdb> 46 atoms in block 178 Block first atom: 6474 Blocpdb> 31 atoms in block 179 Block first atom: 6520 Blocpdb> 33 atoms in block 180 Block first atom: 6551 Blocpdb> 36 atoms in block 181 Block first atom: 6584 Blocpdb> 44 atoms in block 182 Block first atom: 6620 Blocpdb> 43 atoms in block 183 Block first atom: 6664 Blocpdb> 44 atoms in block 184 Block first atom: 6707 Blocpdb> 37 atoms in block 185 Block first atom: 6751 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 6788 Blocpdb> 36 atoms in block 187 Block first atom: 6828 Blocpdb> 37 atoms in block 188 Block first atom: 6864 Blocpdb> 37 atoms in block 189 Block first atom: 6901 Blocpdb> 33 atoms in block 190 Block first atom: 6938 Blocpdb> 9 atoms in block 191 Block first atom: 6970 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2621037 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20937 Prepmat> Matrix trace = 5731960.0000 Prepmat> Last element read: 20937 20937 143.7394 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16611 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6979 RTB> Total mass = 6979.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6979 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 217918.2641 RTB> 59235 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59235 Diagstd> Projected matrix trace = 217918.2641 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 217918.2641 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6787990 0.9119158 1.8711890 2.3537181 2.5556959 3.1323935 3.3232045 3.3577862 4.7231485 4.8492733 5.6481728 5.7269888 5.9093368 6.5841388 6.9770434 7.4124263 7.9972374 8.6525718 8.9701022 9.2973648 9.6090823 9.7689280 10.5851606 10.7148009 10.8879920 11.1525830 11.2724020 11.6851634 11.9251455 12.2998936 12.6767145 13.6785892 13.9372576 14.2581670 14.6304847 15.2337494 15.4196436 15.7904893 16.2352386 17.0107204 17.2507853 18.0061931 18.3409160 18.6749306 19.3416270 19.5444070 19.8713365 20.4025410 20.8054656 21.3134658 21.7233635 21.9038356 22.7254351 23.1498504 23.3748928 23.9969698 24.4693500 24.9803769 25.2090882 25.3733409 26.5427785 26.9967332 27.4016132 27.7279587 28.2603118 28.4784906 28.9652096 29.8644926 29.9272478 30.1745274 30.3836777 30.8148527 31.3884535 31.9533712 32.0844120 32.5692300 33.0247501 33.1940186 33.7011606 33.7752427 34.8492382 35.1637799 35.5173563 35.9298594 36.0838897 36.3858654 36.7974877 37.1286930 37.3381976 38.3487378 38.7907451 39.2341848 39.6043130 39.7105119 40.4886179 40.6122311 41.2413465 41.3972708 41.9980471 42.2477753 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034323 0.0034328 0.0034330 0.0034332 0.0034335 89.4676182 103.6985444 148.5436573 166.5990453 173.6000602 192.1911739 197.9583459 198.9856696 235.9994985 239.1297509 258.0769793 259.8713775 263.9761267 278.6408388 286.8342389 295.6483591 307.0897172 319.4242509 325.2325289 331.1122249 336.6171487 339.4053902 353.3002996 355.4572149 358.3184555 362.6461013 364.5889597 371.2040240 374.9964221 380.8429830 386.6327471 401.6205563 405.4001858 410.0408534 415.3599681 423.8368219 426.4149747 431.5121947 437.5469070 447.8748068 451.0240658 460.7933803 465.0565779 469.2721479 477.5752169 480.0721683 484.0707254 490.4981909 495.3178733 501.3284119 506.1261951 508.2242291 517.6680763 522.4796441 525.0130442 531.9532703 537.1635025 542.7436784 545.2225996 546.9959455 559.4592672 564.2231323 568.4383184 571.8132699 577.2763353 579.5004324 584.4315031 593.4345817 594.0577561 596.5069642 598.5706951 602.8028934 608.3874400 613.8377913 615.0951778 619.7250138 624.0437676 625.6409932 630.4021842 631.0946803 641.0500298 643.9365209 647.1658566 650.9131410 652.3068714 655.0306693 658.7253316 661.6832041 663.5474050 672.4667526 676.3310736 680.1858558 683.3867003 684.3023366 690.9740799 692.0280605 697.3674914 698.6845431 703.7360979 705.8252696 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6979 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9849E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9119 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.977 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 125622 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240603151953864293.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240603151953864293.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 240603151953864293.atom Openam> file on opening on unit 11: 240603151953864293.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 948 First residue number = 66 Last residue number = 545 Number of atoms found = 6979 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9849E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9119 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.977 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25 Bfactors> 106 vectors, 20937 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.678800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.631 for 948 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.02 Bfactors> = 162.703 +/- 27.11 Bfactors> Shiftng-fct= 162.681 Bfactors> Scaling-fct= 1451.756 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240603151953864293.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240603151953864293.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 6979 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7713 0.0034 0.9959 0.0034 0.8959 0.0034 0.7519 0.0034 0.9750 0.0034 0.7029 89.4638 0.6269 103.6932 0.6613 148.5298 0.7960 166.6019 0.5145 173.6029 0.4559 192.1709 0.4565 197.9438 0.2998 198.9835 0.6219 235.9857 0.2438 239.1127 0.5959 258.0620 0.3612 259.8605 0.3889 263.9573 0.4765 278.6259 0.4901 286.8210 0.3440 295.6272 0.3890 307.0720 0.4695 319.4184 0.3196 325.2167 0.2535 331.0915 0.5289 336.6013 0.4455 339.3921 0.3065 353.3659 0.6299 355.3623 0.4058 358.3361 0.3772 362.5885 0.4016 364.5345 0.4469 371.2649 0.4920 375.0566 0.5224 380.8283 0.2361 386.6662 0.5857 401.6240 0.5145 405.4227 0.5941 410.0496 0.3984 415.3353 0.2678 423.7665 0.4380 426.4016 0.5317 431.4870 0.5022 437.5923 0.3550 447.8461 0.6393 450.9944 0.5168 460.8223 0.4869 465.0250 0.4936 469.1901 0.5805 477.5346 0.5575 479.9974 0.4915 484.0337 0.5844 490.4466 0.6008 495.3506 0.5169 501.2661 0.3552 506.0653 0.5020 508.1579 0.3863 517.6978 0.5359 522.4589 0.4239 524.9356 0.2745 531.9640 0.4190 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perturbed structure for DQ=-100 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 240603151953864293 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240603151953864293.eigenfacs 240603151953864293.atom 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