CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  OA_Job  ***

LOGs for ID: 2405282354003919942

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2405282354003919942.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2405282354003919942.atom to be opened. Openam> File opened: 2405282354003919942.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1482 First residue number = 43 Last residue number = 875 Number of atoms found = 12248 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 111.316323 +/- 15.199643 From: 73.685000 To: 148.967000 = 111.325081 +/- 24.679067 From: 55.627000 To: 167.144000 = 106.807349 +/- 26.877365 From: 60.219000 To: 160.958000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6900 % Filled. Pdbmat> 4657852 non-zero elements. Pdbmat> 509466 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.19 +/- 21.56 Maximum number = 132 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.018932E+07 Pdbmat> Larger element = 503.164 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1482 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2405282354003919942.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2405282354003919942.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2405282354003919942.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12248 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1482 residues. Blocpdb> 70 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 70 atoms in block 2 Block first atom: 71 Blocpdb> 66 atoms in block 3 Block first atom: 141 Blocpdb> 70 atoms in block 4 Block first atom: 207 Blocpdb> 59 atoms in block 5 Block first atom: 277 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 336 Blocpdb> 75 atoms in block 7 Block first atom: 400 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 475 Blocpdb> 62 atoms in block 9 Block first atom: 533 Blocpdb> 64 atoms in block 10 Block first atom: 595 Blocpdb> 68 atoms in block 11 Block first atom: 659 Blocpdb> 63 atoms in block 12 Block first atom: 727 Blocpdb> 59 atoms in block 13 Block first atom: 790 Blocpdb> 70 atoms in block 14 Block first atom: 849 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 919 Blocpdb> 66 atoms in block 16 Block first atom: 942 Blocpdb> 71 atoms in block 17 Block first atom: 1008 Blocpdb> 54 atoms in block 18 Block first atom: 1079 Blocpdb> 66 atoms in block 19 Block first atom: 1133 Blocpdb> 60 atoms in block 20 Block first atom: 1199 Blocpdb> 60 atoms in block 21 Block first atom: 1259 Blocpdb> 74 atoms in block 22 Block first atom: 1319 Blocpdb> 65 atoms in block 23 Block first atom: 1393 Blocpdb> 77 atoms in block 24 Block first atom: 1458 Blocpdb> 71 atoms in block 25 Block first atom: 1535 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 1606 Blocpdb> 66 atoms in block 27 Block first atom: 1677 Blocpdb> 73 atoms in block 28 Block first atom: 1743 Blocpdb> 58 atoms in block 29 Block first atom: 1816 Blocpdb> 60 atoms in block 30 Block first atom: 1874 Blocpdb> 63 atoms in block 31 Block first atom: 1934 Blocpdb> 66 atoms in block 32 Block first atom: 1997 Blocpdb> 56 atoms in block 33 Block first atom: 2063 Blocpdb> 63 atoms in block 34 Block first atom: 2119 Blocpdb> 73 atoms in block 35 Block first atom: 2182 Blocpdb> 60 atoms in block 36 Block first atom: 2255 Blocpdb> 61 atoms in block 37 Block first atom: 2315 Blocpdb> 62 atoms in block 38 Block first atom: 2376 Blocpdb> 71 atoms in block 39 Block first atom: 2438 Blocpdb> 79 atoms in block 40 Block first atom: 2509 Blocpdb> 74 atoms in block 41 Block first atom: 2588 Blocpdb> 67 atoms in block 42 Block first atom: 2662 Blocpdb> 68 atoms in block 43 Block first atom: 2729 Blocpdb> 58 atoms in block 44 Block first atom: 2797 Blocpdb> 51 atoms in block 45 Block first atom: 2855 Blocpdb> 76 atoms in block 46 Block first atom: 2906 Blocpdb> 53 atoms in block 47 Block first atom: 2982 Blocpdb> 70 atoms in block 48 Block first atom: 3035 Blocpdb> 31 atoms in block 49 Block first atom: 3105 Blocpdb> 57 atoms in block 50 Block first atom: 3136 Blocpdb> 59 atoms in block 51 Block first atom: 3193 Blocpdb> 63 atoms in block 52 Block first atom: 3252 Blocpdb> 66 atoms in block 53 Block first atom: 3315 Blocpdb> 69 atoms in block 54 Block first atom: 3381 Blocpdb> 66 atoms in block 55 Block first atom: 3450 Blocpdb> 70 atoms in block 56 Block first atom: 3516 Blocpdb> 71 atoms in block 57 Block first atom: 3586 Blocpdb> 73 atoms in block 58 Block first atom: 3657 Blocpdb> 58 atoms in block 59 Block first atom: 3730 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 3788 Blocpdb> 68 atoms in block 61 Block first atom: 3830 Blocpdb> 54 atoms in block 62 Block first atom: 3898 Blocpdb> 59 atoms in block 63 Block first atom: 3952 Blocpdb> 64 atoms in block 64 Block first atom: 4011 Blocpdb> 69 atoms in block 65 Block first atom: 4075 Blocpdb> 68 atoms in block 66 Block first atom: 4144 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 4212 Blocpdb> 74 atoms in block 68 Block first atom: 4230 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4304 Blocpdb> 73 atoms in block 70 Block first atom: 4370 Blocpdb> 65 atoms in block 71 Block first atom: 4443 Blocpdb> 62 atoms in block 72 Block first atom: 4508 Blocpdb> 59 atoms in block 73 Block first atom: 4570 Blocpdb> 64 atoms in block 74 Block first atom: 4629 Blocpdb> 69 atoms in block 75 Block first atom: 4693 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 4762 Blocpdb> 57 atoms in block 77 Block first atom: 4833 Blocpdb> 67 atoms in block 78 Block first atom: 4890 Blocpdb> 55 atoms in block 79 Block first atom: 4957 Blocpdb> 58 atoms in block 80 Block first atom: 5012 Blocpdb> 69 atoms in block 81 Block first atom: 5070 Blocpdb> 71 atoms in block 82 Block first atom: 5139 Blocpdb> 72 atoms in block 83 Block first atom: 5210 Blocpdb> 63 atoms in block 84 Block first atom: 5282 Blocpdb> 63 atoms in block 85 Block first atom: 5345 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 5408 Blocpdb> 60 atoms in block 87 Block first atom: 5436 Blocpdb> 75 atoms in block 88 Block first atom: 5496 Blocpdb> 66 atoms in block 89 Block first atom: 5571 Blocpdb> 72 atoms in block 90 Block first atom: 5637 Blocpdb> 73 atoms in block 91 Block first atom: 5709 Blocpdb> 64 atoms in block 92 Block first atom: 5782 Blocpdb> 69 atoms in block 93 Block first atom: 5846 Blocpdb> 68 atoms in block 94 Block first atom: 5915 Blocpdb> 60 atoms in block 95 Block first atom: 5983 Blocpdb> 75 atoms in block 96 Block first atom: 6043 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 6118 Blocpdb> 70 atoms in block 98 Block first atom: 6125 Blocpdb> 70 atoms in block 99 Block first atom: 6195 Blocpdb> 66 atoms in block 100 Block first atom: 6265 Blocpdb> 70 atoms in block 101 Block first atom: 6331 Blocpdb> 59 atoms in block 102 Block first atom: 6401 Blocpdb> 64 atoms in block 103 Block first atom: 6460 Blocpdb> 75 atoms in block 104 Block first atom: 6524 Blocpdb> 58 atoms in block 105 Block first atom: 6599 Blocpdb> 62 atoms in block 106 Block first atom: 6657 Blocpdb> 64 atoms in block 107 Block first atom: 6719 Blocpdb> 68 atoms in block 108 Block first atom: 6783 Blocpdb> 63 atoms in block 109 Block first atom: 6851 Blocpdb> 59 atoms in block 110 Block first atom: 6914 Blocpdb> 70 atoms in block 111 Block first atom: 6973 Blocpdb> 23 atoms in block 112 Block first atom: 7043 Blocpdb> 66 atoms in block 113 Block first atom: 7066 Blocpdb> 71 atoms in block 114 Block first atom: 7132 Blocpdb> 54 atoms in block 115 Block first atom: 7203 Blocpdb> 66 atoms in block 116 Block first atom: 7257 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 7323 Blocpdb> 60 atoms in block 118 Block first atom: 7383 Blocpdb> 74 atoms in block 119 Block first atom: 7443 Blocpdb> 65 atoms in block 120 Block first atom: 7517 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 7582 Blocpdb> 71 atoms in block 122 Block first atom: 7659 Blocpdb> 71 atoms in block 123 Block first atom: 7730 Blocpdb> 66 atoms in block 124 Block first atom: 7801 Blocpdb> 73 atoms in block 125 Block first atom: 7867 Blocpdb> 58 atoms in block 126 Block first atom: 7940 Blocpdb> 60 atoms in block 127 Block first atom: 7998 Blocpdb> 63 atoms in block 128 Block first atom: 8058 Blocpdb> 66 atoms in block 129 Block first atom: 8121 Blocpdb> 56 atoms in block 130 Block first atom: 8187 Blocpdb> 63 atoms in block 131 Block first atom: 8243 Blocpdb> 73 atoms in block 132 Block first atom: 8306 Blocpdb> 60 atoms in block 133 Block first atom: 8379 Blocpdb> 61 atoms in block 134 Block first atom: 8439 Blocpdb> 62 atoms in block 135 Block first atom: 8500 Blocpdb> 71 atoms in block 136 Block first atom: 8562 Blocpdb> 79 atoms in block 137 Block first atom: 8633 Blocpdb> 74 atoms in block 138 Block first atom: 8712 Blocpdb> 67 atoms in block 139 Block first atom: 8786 Blocpdb> 68 atoms in block 140 Block first atom: 8853 Blocpdb> 58 atoms in block 141 Block first atom: 8921 Blocpdb> 51 atoms in block 142 Block first atom: 8979 Blocpdb> 76 atoms in block 143 Block first atom: 9030 Blocpdb> 53 atoms in block 144 Block first atom: 9106 Blocpdb> 70 atoms in block 145 Block first atom: 9159 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 9229 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 9260 Blocpdb> 59 atoms in block 148 Block first atom: 9317 Blocpdb> 63 atoms in block 149 Block first atom: 9376 Blocpdb> 66 atoms in block 150 Block first atom: 9439 Blocpdb> 69 atoms in block 151 Block first atom: 9505 Blocpdb> 66 atoms in block 152 Block first atom: 9574 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 9640 Blocpdb> 71 atoms in block 154 Block first atom: 9710 Blocpdb> 73 atoms in block 155 Block first atom: 9781 Blocpdb> 58 atoms in block 156 Block first atom: 9854 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 9912 Blocpdb> 68 atoms in block 158 Block first atom: 9954 Blocpdb> 54 atoms in block 159 Block first atom: 10022 Blocpdb> 59 atoms in block 160 Block first atom: 10076 Blocpdb> 64 atoms in block 161 Block first atom: 10135 Blocpdb> 69 atoms in block 162 Block first atom: 10199 Blocpdb> 68 atoms in block 163 Block first atom: 10268 Blocpdb> 18 atoms in block 164 Block first atom: 10336 Blocpdb> 74 atoms in block 165 Block first atom: 10354 Blocpdb> 66 atoms in block 166 Block first atom: 10428 Blocpdb> 73 atoms in block 167 Block first atom: 10494 Blocpdb> 65 atoms in block 168 Block first atom: 10567 Blocpdb> 62 atoms in block 169 Block first atom: 10632 Blocpdb> 59 atoms in block 170 Block first atom: 10694 Blocpdb> 64 atoms in block 171 Block first atom: 10753 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 10817 Blocpdb> 71 atoms in block 173 Block first atom: 10886 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 10957 Blocpdb> 67 atoms in block 175 Block first atom: 11014 Blocpdb> 55 atoms in block 176 Block first atom: 11081 Blocpdb> 58 atoms in block 177 Block first atom: 11136 Blocpdb> 69 atoms in block 178 Block first atom: 11194 Blocpdb> 71 atoms in block 179 Block first atom: 11263 Blocpdb> 72 atoms in block 180 Block first atom: 11334 Blocpdb> 63 atoms in block 181 Block first atom: 11406 Blocpdb> 63 atoms in block 182 Block first atom: 11469 Blocpdb> 28 atoms in block 183 Block first atom: 11532 Blocpdb> 60 atoms in block 184 Block first atom: 11560 Blocpdb> 75 atoms in block 185 Block first atom: 11620 Blocpdb> 66 atoms in block 186 Block first atom: 11695 Blocpdb> 72 atoms in block 187 Block first atom: 11761 Blocpdb> 73 atoms in block 188 Block first atom: 11833 Blocpdb> 64 atoms in block 189 Block first atom: 11906 Blocpdb> 69 atoms in block 190 Block first atom: 11970 Blocpdb> 68 atoms in block 191 Block first atom: 12039 Blocpdb> 60 atoms in block 192 Block first atom: 12107 Blocpdb> 75 atoms in block 193 Block first atom: 12167 Blocpdb> 7 atoms in block 194 Block first atom: 12241 Blocpdb> 194 blocks. Blocpdb> At most, 79 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4658046 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 36744 Prepmat> Matrix trace = 10189320.0000 Prepmat> Last element read: 36744 36744 112.8721 Prepmat> 18916 lines saved. Prepmat> 17419 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12248 RTB> Total mass = 12248.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12248 RTB> Number of blocks = 194 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188972.2930 RTB> 50946 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1164 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50946 Diagstd> Projected matrix trace = 188972.2930 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1164 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188972.2930 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1441710 0.2588784 0.3116443 0.6094057 0.7269704 1.1477129 1.3842483 1.7004308 1.9412987 1.9693108 2.6932355 2.8099093 3.2091736 3.4224098 3.9755964 4.2911144 4.4573405 5.0982665 5.4994909 5.6899413 5.8326403 6.5688843 6.6413910 6.6850591 6.7555297 7.6075055 7.8655231 7.9615383 8.1252472 8.1635359 9.0690396 9.1556744 9.8224284 10.0966874 10.1763426 10.2930707 11.2493889 11.2946585 11.4316159 11.9275575 12.1260305 12.3846853 12.7879695 12.9154534 14.0207720 14.1681368 14.5307872 15.1884262 15.2296478 15.4152425 15.7586808 15.8508424 16.3927767 16.6649158 16.9367485 16.9598712 17.6256927 17.7402136 18.0215202 18.2501209 18.5578650 18.6539212 19.0441619 19.5568131 19.8629045 20.1045111 20.3380305 20.8159647 21.0646221 21.1373630 21.5353519 21.6261403 21.9734512 22.1569780 22.4919898 22.5644855 22.9344589 23.1013420 23.1944199 23.7332143 23.7828343 24.5913119 25.3349454 25.4139756 25.8386676 26.1048359 26.1465259 26.4644705 26.6249824 27.0400530 27.3588665 27.6660642 28.1984294 28.5860243 28.8306622 29.0121026 29.3019165 29.6849861 29.7252525 29.9190413 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034332 0.0034333 0.0034337 0.0034337 0.0034338 0.0034355 41.2319852 55.2513880 60.6212460 84.7712412 92.5877750 116.3354074 127.7621678 141.6037540 151.3008812 152.3885779 178.2101537 182.0293550 194.5323729 200.8913735 216.5192054 224.9470632 229.2625844 245.1921420 254.6575306 259.0294668 262.2574761 278.3178663 279.8496729 280.7681926 282.2441732 299.5135107 304.5503379 306.4035365 309.5377149 310.2661767 327.0212170 328.5794891 340.3335118 345.0521479 346.4105737 348.3916669 364.2166080 364.9487097 367.1547008 375.0343436 378.1417316 382.1534361 388.3256488 390.2564675 406.6129851 408.7442457 413.9423405 423.2058553 423.7797597 426.3541169 431.0773548 432.3360537 439.6646430 443.2990928 446.8999429 447.2049015 455.8987252 457.3774016 460.9894560 463.9040381 467.7989962 469.0081061 473.8885472 480.2245112 483.9680114 486.9025380 489.7221277 495.4428349 498.3932097 499.2529997 503.9312218 504.9923372 509.0312176 511.1525643 515.0023596 515.8316648 520.0433283 521.9319522 522.9823571 529.0217905 529.5745254 538.5005228 546.5819262 547.4337702 551.9888911 554.8246704 555.2675271 558.6333826 560.3249292 564.6756355 567.9947621 571.1747107 576.6439501 580.5934867 583.0725410 584.9043917 587.8185591 591.6484152 592.0495518 593.9763002 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12248 Rtb_to_modes> Number of blocs = 194 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1442 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2589 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.693 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.569 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.866 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.156 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 220464 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405282354003919942.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405282354003919942.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2405282354003919942.atom Openam> file on opening on unit 11: 2405282354003919942.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1482 First residue number = 43 Last residue number = 875 Number of atoms found = 12248 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1442 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2589 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.693 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.569 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.866 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92 Bfactors> 106 vectors, 36744 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.144200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.762 for 1482 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.035 +/- 0.03 Bfactors> = 57.048 +/- 31.28 Bfactors> Shiftng-fct= 57.014 Bfactors> Scaling-fct= 1165.473 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405282354003919942.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405282354003919942.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0 Chkmod> 106 vectors, 36744 coordinates in file. Chkmod> That is: 12248 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9438 0.0034 0.7572 0.0034 0.9541 0.0034 0.9197 0.0034 0.7568 0.0034 0.7529 41.2344 0.7178 55.2513 0.6524 60.6143 0.6227 84.7672 0.8587 92.5857 0.6186 116.3450 0.6350 127.7452 0.6603 141.5797 0.6136 151.2827 0.7909 152.3700 0.7529 178.1947 0.1992 182.0245 0.1164 194.5188 0.3708 200.8707 0.3774 216.5209 0.3893 224.9344 0.2429 229.2440 0.2266 245.1752 0.6393 254.6352 0.4118 259.0197 0.2758 262.2543 0.6970 278.3084 0.1722 279.8294 0.4833 280.7549 0.3646 282.2419 0.2595 299.5104 0.3602 304.5465 0.3136 306.3993 0.4453 309.5197 0.3718 310.2617 0.4766 327.0065 0.3174 328.5712 0.3173 340.3115 0.3351 345.0939 0.3187 346.4579 0.3094 348.3247 0.3457 364.2109 0.5184 364.8578 0.4663 367.1130 0.5084 375.0566 0.3458 378.1874 0.3875 382.0647 0.3009 388.3398 0.2862 390.3084 0.4442 406.5843 0.4500 408.7536 0.4999 413.9134 0.3402 423.2096 0.5432 423.7665 0.5331 426.4016 0.3590 431.0769 0.2945 432.3060 0.2965 439.6085 0.4327 443.2147 0.5597 446.9237 0.5471 447.1874 0.4254 455.9349 0.4696 457.3550 0.6099 460.9502 0.5956 463.8826 0.5225 467.8058 0.4460 468.9387 0.5083 473.8164 0.6355 480.2430 0.5023 483.9119 0.2637 486.8270 0.3551 489.7248 0.3812 495.4696 0.4081 498.3171 0.3022 499.2627 0.3392 503.9640 0.3839 505.0157 0.3664 508.9694 0.3621 511.1655 0.4329 514.9575 0.4364 515.7583 0.4782 519.9705 0.5247 521.8944 0.4775 522.9101 0.4012 528.9633 0.4312 529.5202 0.4953 538.4630 0.4946 546.5051 0.3510 547.3675 0.4728 551.9794 0.3737 554.7495 0.5252 555.2806 0.3857 558.5622 0.4021 560.2484 0.5623 564.6508 0.5196 567.9821 0.5605 571.1908 0.4450 576.6353 0.5365 580.6089 0.3385 583.0408 0.5443 584.8581 0.4109 587.7741 0.5127 591.5733 0.5334 592.0714 0.5217 593.9603 0.4849 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2405282354003919942 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom making animated gifs 11 models are in 2405282354003919942.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2405282354003919942 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom making animated gifs 11 models are in 2405282354003919942.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2405282354003919942 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom making animated gifs 11 models are in 2405282354003919942.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2405282354003919942 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom making animated gifs 11 models are in 2405282354003919942.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2405282354003919942 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405282354003919942.eigenfacs 2405282354003919942.atom making animated gifs 11 models are in 2405282354003919942.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405282354003919942.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2405282354003919942.10.pdb 2405282354003919942.11.pdb 2405282354003919942.7.pdb 2405282354003919942.8.pdb 2405282354003919942.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m10.773s user 1m10.564s sys 0m0.184s rm: cannot remove '2405282354003919942.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.