***  1stjob  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2405281028183778631.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2405281028183778631.atom to be opened.
Openam> File opened: 2405281028183778631.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 164
First residue number = 1007
Last residue number = 1170
Number of atoms found = 1366
Mean number per residue = 8.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 14.012258 +/- 7.968766 From: -2.980000 To: 34.854000
= 10.238257 +/- 8.716089 From: -15.893000 To: 28.511000
= 16.668705 +/- 10.304312 From: -3.845000 To: 39.861000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 6.0589 % Filled.
Pdbmat> 508881 non-zero elements.
Pdbmat> 55640 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.46 +/- 24.56
Maximum number = 138
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 1.112800E+06
Pdbmat> Larger element = 517.638
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
164 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2405281028183778631.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2405281028183778631.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2405281028183778631.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1366 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 164 residues.
Blocpdb> 6 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 8 atoms in block 2
Block first atom: 7
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 15
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 27
Blocpdb> 12 atoms in block 5
Block first atom: 36
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 48
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 8
Block first atom: 64
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 72
Blocpdb> 6 atoms in block 10
Block first atom: 83
Blocpdb> 7 atoms in block 11
Block first atom: 89
Blocpdb> 4 atoms in block 12
Block first atom: 96
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 100
Blocpdb> 8 atoms in block 14
Block first atom: 108
Blocpdb> 10 atoms in block 15
Block first atom: 116
Blocpdb> 9 atoms in block 16
Block first atom: 126
Blocpdb> 5 atoms in block 17
Block first atom: 135
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 140
Blocpdb> 6 atoms in block 19
Block first atom: 149
Blocpdb> 7 atoms in block 20
Block first atom: 155
Blocpdb> 7 atoms in block 21
Block first atom: 162
Blocpdb> 8 atoms in block 22
Block first atom: 169
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 177
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 185
Blocpdb> 11 atoms in block 25
Block first atom: 192
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 203
Blocpdb> 7 atoms in block 27
Block first atom: 210
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 217
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 225
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 233
Blocpdb> 12 atoms in block 31
Block first atom: 240
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 252
Blocpdb> 4 atoms in block 33
Block first atom: 260
Blocpdb> 8 atoms in block 34
Block first atom: 264
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 272
Blocpdb> 9 atoms in block 36
Block first atom: 293
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 302
Blocpdb> 5 atoms in block 38
Block first atom: 310
Blocpdb> 8 atoms in block 39
Block first atom: 315
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 323
Blocpdb> 5 atoms in block 41
Block first atom: 331
Blocpdb> 7 atoms in block 42
Block first atom: 336
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 343
Blocpdb> 6 atoms in block 44
Block first atom: 352
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 358
Blocpdb> 7 atoms in block 46
Block first atom: 367
Blocpdb> 9 atoms in block 47
Block first atom: 374
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 383
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 394
Blocpdb> 12 atoms in block 50
Block first atom: 403
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 415
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 422
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 430
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 438
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 446
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 453
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 461
Blocpdb> 9 atoms in block 58
Block first atom: 477
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 486
Blocpdb> 7 atoms in block 60
Block first atom: 498
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 505
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 513
Blocpdb> 8 atoms in block 63
Block first atom: 520
Blocpdb> 6 atoms in block 64
Block first atom: 528
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 534
Blocpdb> 8 atoms in block 66
Block first atom: 542
Blocpdb> 8 atoms in block 67
Block first atom: 550
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 558
Blocpdb> 8 atoms in block 69
Block first atom: 566
Blocpdb> 10 atoms in block 70
Block first atom: 574
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 584
Blocpdb> 7 atoms in block 72
Block first atom: 592
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 599
Blocpdb> 7 atoms in block 74
Block first atom: 607
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 614
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 622
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 630
Blocpdb> 7 atoms in block 78
Block first atom: 637
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 644
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 651
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 667
Blocpdb> 6 atoms in block 82
Block first atom: 675
Blocpdb> 9 atoms in block 83
Block first atom: 681
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 690
Blocpdb> 11 atoms in block 85
Block first atom: 702
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 713
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 721
Blocpdb> 7 atoms in block 88
Block first atom: 729
Blocpdb> 7 atoms in block 89
Block first atom: 736
Blocpdb> 5 atoms in block 90
Block first atom: 743
Blocpdb> 11 atoms in block 91
Block first atom: 748
Blocpdb> 8 atoms in block 92
Block first atom: 759
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 767
Blocpdb> 9 atoms in block 94
Block first atom: 779
Blocpdb> 6 atoms in block 95
Block first atom: 788
Blocpdb> 8 atoms in block 96
Block first atom: 794
Blocpdb> 9 atoms in block 97
Block first atom: 802
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 811
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 822
Blocpdb> 9 atoms in block 100
Block first atom: 830
Blocpdb> 7 atoms in block 101
Block first atom: 839
Blocpdb> 7 atoms in block 102
Block first atom: 846
Blocpdb> 8 atoms in block 103
Block first atom: 853
Blocpdb> 7 atoms in block 104
Block first atom: 861
Blocpdb> 10 atoms in block 105
Block first atom: 868
Blocpdb> 6 atoms in block 106
Block first atom: 878
Blocpdb> 5 atoms in block 107
Block first atom: 884
Blocpdb> 5 atoms in block 108
Block first atom: 889
Blocpdb> 4 atoms in block 109
Block first atom: 894
Blocpdb> 7 atoms in block 110
Block first atom: 898
Blocpdb> 8 atoms in block 111
Block first atom: 905
Blocpdb> 11 atoms in block 112
Block first atom: 913
Blocpdb> 6 atoms in block 113
Block first atom: 924
Blocpdb> 4 atoms in block 114
Block first atom: 930
Blocpdb> 5 atoms in block 115
Block first atom: 934
Blocpdb> 8 atoms in block 116
Block first atom: 939
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 947
Blocpdb> 8 atoms in block 118
Block first atom: 955
Blocpdb> 5 atoms in block 119
Block first atom: 963
Blocpdb> 12 atoms in block 120
Block first atom: 968
Blocpdb> 8 atoms in block 121
Block first atom: 980
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 988
Blocpdb> 6 atoms in block 123
Block first atom: 996
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 1002
Blocpdb> 8 atoms in block 125
Block first atom: 1011
Blocpdb> 9 atoms in block 126
Block first atom: 1019
Blocpdb> 9 atoms in block 127
Block first atom: 1028
Blocpdb> 6 atoms in block 128
Block first atom: 1037
Blocpdb> 8 atoms in block 129
Block first atom: 1043
Blocpdb> 7 atoms in block 130
Block first atom: 1051
Blocpdb> 8 atoms in block 131
Block first atom: 1058
Blocpdb> 8 atoms in block 132
Block first atom: 1066
Blocpdb> 12 atoms in block 133
Block first atom: 1074
Blocpdb> 11 atoms in block 134
Block first atom: 1086
Blocpdb> 8 atoms in block 135
Block first atom: 1097
Blocpdb> 12 atoms in block 136
Block first atom: 1105
Blocpdb> 7 atoms in block 137
Block first atom: 1117
Blocpdb> 12 atoms in block 138
Block first atom: 1124
Blocpdb> 10 atoms in block 139
Block first atom: 1136
Blocpdb> 6 atoms in block 140
Block first atom: 1146
Blocpdb> 8 atoms in block 141
Block first atom: 1152
Blocpdb> 11 atoms in block 142
Block first atom: 1160
Blocpdb> 8 atoms in block 143
Block first atom: 1171
Blocpdb> 8 atoms in block 144
Block first atom: 1179
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 1187
Blocpdb> 4 atoms in block 146
Block first atom: 1198
Blocpdb> 5 atoms in block 147
Block first atom: 1202
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 1207
Blocpdb> 7 atoms in block 149
Block first atom: 1218
Blocpdb> 9 atoms in block 150
Block first atom: 1225
Blocpdb> 8 atoms in block 151
Block first atom: 1234
Blocpdb> 7 atoms in block 152
Block first atom: 1242
Blocpdb> 9 atoms in block 153
Block first atom: 1249
Blocpdb> 11 atoms in block 154
Block first atom: 1258
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 1269
Blocpdb> 11 atoms in block 156
Block first atom: 1278
Blocpdb> 9 atoms in block 157
Block first atom: 1289
Blocpdb> 8 atoms in block 158
Block first atom: 1298
Blocpdb> 8 atoms in block 159
Block first atom: 1306
Blocpdb> 9 atoms in block 160
Block first atom: 1314
Blocpdb> 9 atoms in block 161
Block first atom: 1323
Blocpdb> 12 atoms in block 162
Block first atom: 1332
Blocpdb> 7 atoms in block 163
Block first atom: 1344
Blocpdb> 16 atoms in block 164
Block first atom: 1350
Blocpdb> 164 blocks.
Blocpdb> At most, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 509045 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4098
Prepmat> Matrix trace = 1112800.0000
Prepmat> Last element read: 4098 4098 251.0845
Prepmat> 13531 lines saved.
Prepmat> 11441 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1366
RTB> Total mass = 1366.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1366
RTB> Number of blocks = 164
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 243877.3277
RTB> 72744 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 984
Diagstd> Nb of non-zero elements: 72744
Diagstd> Projected matrix trace = 243877.3277
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 984 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 243877.3277
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.5760373 4.4730305 5.4372073 6.2768191
7.6933679 8.8978688 9.2730894 9.3038560 11.2221689
12.5880814 12.8148511 14.7635957 15.7343755 16.2196245
16.6747555 19.1996047 19.8745142 20.7762621 22.0437587
22.9931947 23.4170606 23.8068895 24.2782411 26.5439763
27.2318550 27.9998470 29.6396208 30.4467718 31.9724737
32.6696581 32.8761773 33.9992498 34.7091978 35.2869835
35.9143401 36.5743261 37.8616834 38.6562497 39.2970185
40.6652857 42.1159086 42.4588801 43.1131348 43.5191988
44.4530849 44.9860458 45.5798405 47.0140115 47.9379480
48.3476477 49.3124842 50.0146988 50.6438019 51.5313321
52.6806631 53.9864993 54.1006188 54.7908019 56.4992619
56.7628334 57.0501385 57.5825562 58.4018367 58.7881128
59.1134196 59.6144946 60.3893092 62.7590070 63.1594458
63.8922756 64.6638065 66.2799566 66.6729797 67.4715800
67.6872704 68.6745716 69.2444061 70.1139821 70.4305657
71.0137274 72.4090709 73.3321660 73.5035709 74.0378150
74.9182630 74.9268888 75.9324674 76.4267648 77.6145464
78.0812814 78.3084047 79.2479103 79.5321093 80.1101819
81.0003575 81.7261941 83.0637162 83.6627458 84.2434766
85.0444947
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034337 0.0034340 0.0034342 0.0034346
0.0034355 174.2895516 229.6657363 253.2113826 272.0602466
301.1990034 323.9203852 330.6796763 331.2277929 363.7756962
385.2787459 388.7335838 417.2452030 430.7447923 437.3364529
443.4299446 475.8186095 484.1094285 494.9701267 509.8449297
520.7088253 525.4863869 529.8422766 535.0617306 559.4718901
566.6747913 574.6099068 591.1961566 599.1918625 614.0212472
620.6797474 622.6384515 633.1840226 639.7607149 645.0636171
650.7725500 656.7248452 668.1827201 675.1575664 680.7302985
692.4799353 704.7228734 707.5865152 713.0173226 716.3672543
724.0127806 728.3400482 733.1311637 744.5758312 751.8565720
755.0625923 762.5594740 767.9697421 772.7845499 779.5266457
788.1718080 797.8805232 798.7233790 803.8020481 816.2377331
818.1394100 820.2073032 824.0256877 829.8670724 832.6069650
834.9074219 838.4385023 843.8695400 860.2670959 863.0072332
867.9994669 873.2245026 884.0694592 886.6867375 891.9812400
893.4058266 899.8979442 903.6237302 909.2799127 911.3304231
915.0955314 924.0421196 929.9134662 930.9996105 934.3768651
939.9161893 939.9702967 946.2568503 949.3317771 956.6803244
959.5525112 960.9470739 966.6943714 968.4262004 971.9392912
977.3244148 981.6935048 989.6940488 993.2563203 996.6976194
1001.4248932
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1366
Rtb_to_modes> Number of blocs = 164
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.576
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.473
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.277
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.693
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.898
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.273
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.304
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.04
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 984 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99994 0.99996
1.00003 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001
0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99996 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00004 1.00002 0.99999
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003
1.00002 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 24588 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99994 0.99996
1.00003 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001
0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99996 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00004 1.00002 0.99999
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003
1.00002 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2405281028183778631.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2405281028183778631.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2405281028183778631.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2405281028183778631.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 164
First residue number = 1007
Last residue number = 1170
Number of atoms found = 1366
Mean number per residue = 8.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.576
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.473
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.277
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.693
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.273
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.304
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.04
Bfactors> 106 vectors, 4098 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.576000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.560 for 171 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.030 +/- 0.04
Bfactors> = 20.306 +/- 6.59
Bfactors> Shiftng-fct= 20.275
Bfactors> Scaling-fct= 183.689
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2405281028183778631.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2405281028183778631.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Chkmod> 106 vectors, 4098 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1366 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 59 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8818
0.0034 0.8190
0.0034 0.8138
0.0034 0.7764
0.0034 0.9738
0.0034 0.9089
174.2808 0.3090
229.6551 0.3682
253.1957 0.0544
272.0525 0.2841
301.1789 0.2400
323.9089 0.0884
330.6639 0.1207
331.2161 0.0397
363.7249 0.2169
385.2916 0.4501
388.6433 0.2110
417.1765 0.3933
430.6664 0.0869
437.3227 0.3108
443.3477 0.5268
475.8031 0.4323
484.0337 0.3120
494.9934 0.3532
509.7796 0.5006
520.6503 0.3226
525.4968 0.4634
529.8541 0.1903
535.0581 0.1673
559.4060 0.5649
566.6312 0.3143
574.5868 0.3022
591.1746 0.3249
599.1979 0.3745
613.9711 0.5467
620.6564 0.4596
622.6479 0.3712
633.1638 0.2971
639.7406 0.1446
645.0635 0.4131
650.7053 0.3076
656.6578 0.3063
668.1392 0.1220
675.1613 0.2761
680.7269 0.3977
692.4903 0.4397
704.7268 0.3558
707.5655 0.3953
712.9608 0.2459
716.3431 0.3971
723.9566 0.3776
728.3408 0.3397
733.1010 0.3476
744.5121 0.1403
751.8404 0.4113
755.0485 0.3248
762.5075 0.2591
767.9007 0.3182
772.7224 0.3666
779.4831 0.2835
788.1330 0.2823
797.8721 0.3088
798.6845 0.2738
803.7617 0.3286
816.2080 0.2396
818.0839 0.3751
820.1711 0.2785
823.9720 0.3236
829.8184 0.2400
832.5846 0.3397
834.8474 0.2074
838.3709 0.3588
843.8381 0.2946
860.2370 0.3658
862.9740 0.3875
867.9467 0.2822
873.1613 0.3037
884.0318 0.3883
886.6289 0.1324
891.9325 0.4482
893.3855 0.2697
899.8294 0.3524
903.5562 0.1669
909.2151 0.3087
911.2876 0.4396
915.0322 0.2709
924.0084 0.3896
929.8598 0.1783
930.9370 0.2467
934.3505 0.3721
939.8867 0.3800
939.9495 0.0556
946.2009 0.4049
949.3111 0.2543
956.6112 0.2270
959.5034 0.3583
960.9156 0.2143
966.6656 0.2687
968.3718 0.3125
971.8965 0.2378
977.2803 0.3890
981.6742 0.3121
989.6294 0.3944
993.1974 0.4096
996.6343 0.1338
1001.3554 0.4030
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028183778631 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
making animated gifs
11 models are in 2405281028183778631.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028183778631 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
making animated gifs
11 models are in 2405281028183778631.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028183778631 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
making animated gifs
11 models are in 2405281028183778631.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028183778631 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
making animated gifs
11 models are in 2405281028183778631.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028183778631 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405281028183778631.eigenfacs
2405281028183778631.atom
making animated gifs
11 models are in 2405281028183778631.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405281028183778631.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2405281028183778631.10.pdb
2405281028183778631.11.pdb
2405281028183778631.7.pdb
2405281028183778631.8.pdb
2405281028183778631.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.309s
user 0m13.281s
sys 0m0.028s
rm: cannot remove '2405281028183778631.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|