Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* 3CM3_S112C_apo *

LOGs for ID: 2405281028003778489

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2405281028003778489.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2405281028003778489.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2405281028003778489.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    164
            First residue number     =      7
            Last  residue number     =    170
            Number of atoms found    =   1366
            Mean number per residue  =      8.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    14.012083 +/-     7.968932 From:    -2.980000 To:    34.854000
 =    10.238001 +/-     8.716009 From:   -15.893000 To:    28.511000
 =    16.668578 +/-    10.304314 From:    -3.845000 To:    39.861000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.0587 % Filled.
 Pdbmat>       508863  non-zero elements.
 Pdbmat>        55638 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     81.46 +/-     24.55
         Maximum number =    138
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.112760E+06
 Pdbmat> Larger element =  517.718    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
164 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2405281028003778489.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2405281028003778489.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2405281028003778489.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1366 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   164 residues.
 Blocpdb>     6 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:      7
 Blocpdb>    12 atoms in block      3
 Block first atom:     15
 Blocpdb>     9 atoms in block      4
 Block first atom:     27
 Blocpdb>    12 atoms in block      5
 Block first atom:     36
 Blocpdb>     8 atoms in block      6
 Block first atom:     48
 Blocpdb>     8 atoms in block      7
 Block first atom:     56
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     64
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:     72
 Blocpdb>     6 atoms in block     10
 Block first atom:     83
 Blocpdb>     7 atoms in block     11
 Block first atom:     89
 Blocpdb>     4 atoms in block     12
 Block first atom:     96
 Blocpdb>     8 atoms in block     13
 Block first atom:    100
 Blocpdb>     8 atoms in block     14
 Block first atom:    108
 Blocpdb>    10 atoms in block     15
 Block first atom:    116
 Blocpdb>     9 atoms in block     16
 Block first atom:    126
 Blocpdb>     5 atoms in block     17
 Block first atom:    135
 Blocpdb>     9 atoms in block     18
 Block first atom:    140
 Blocpdb>     6 atoms in block     19
 Block first atom:    149
 Blocpdb>     7 atoms in block     20
 Block first atom:    155
 Blocpdb>     7 atoms in block     21
 Block first atom:    162
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    169
 Blocpdb>     8 atoms in block     23
 Block first atom:    177
 Blocpdb>     7 atoms in block     24
 Block first atom:    185
 Blocpdb>    11 atoms in block     25
 Block first atom:    192
 Blocpdb>     7 atoms in block     26
 Block first atom:    203
 Blocpdb>     7 atoms in block     27
 Block first atom:    210
 Blocpdb>     8 atoms in block     28
 Block first atom:    217
 Blocpdb>     8 atoms in block     29
 Block first atom:    225
 Blocpdb>     7 atoms in block     30
 Block first atom:    233
 Blocpdb>    12 atoms in block     31
 Block first atom:    240
 Blocpdb>     8 atoms in block     32
 Block first atom:    252
 Blocpdb>     4 atoms in block     33
 Block first atom:    260
 Blocpdb>     8 atoms in block     34
 Block first atom:    264
 Blocpdb>    21 atoms in block     35
 Block first atom:    272
 Blocpdb>     9 atoms in block     36
 Block first atom:    293
 Blocpdb>     8 atoms in block     37
 Block first atom:    302
 Blocpdb>     5 atoms in block     38
 Block first atom:    310
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    315
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    323
 Blocpdb>     5 atoms in block     41
 Block first atom:    331
 Blocpdb>     7 atoms in block     42
 Block first atom:    336
 Blocpdb>     9 atoms in block     43
 Block first atom:    343
 Blocpdb>     6 atoms in block     44
 Block first atom:    352
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    358
 Blocpdb>     7 atoms in block     46
 Block first atom:    367
 Blocpdb>     9 atoms in block     47
 Block first atom:    374
 Blocpdb>    11 atoms in block     48
 Block first atom:    383
 Blocpdb>     9 atoms in block     49
 Block first atom:    394
 Blocpdb>    12 atoms in block     50
 Block first atom:    403
 Blocpdb>     7 atoms in block     51
 Block first atom:    415
 Blocpdb>     8 atoms in block     52
 Block first atom:    422
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    430
 Blocpdb>     8 atoms in block     54
 Block first atom:    438
 Blocpdb>     7 atoms in block     55
 Block first atom:    446
 Blocpdb>     8 atoms in block     56
 Block first atom:    453
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    461
 Blocpdb>     9 atoms in block     58
 Block first atom:    477
 Blocpdb>    12 atoms in block     59
 Block first atom:    486
 Blocpdb>     7 atoms in block     60
 Block first atom:    498
 Blocpdb>     8 atoms in block     61
 Block first atom:    505
 Blocpdb>     7 atoms in block     62
 Block first atom:    513
 Blocpdb>     8 atoms in block     63
 Block first atom:    520
 Blocpdb>     6 atoms in block     64
 Block first atom:    528
 Blocpdb>     8 atoms in block     65
 Block first atom:    534
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    542
 Blocpdb>     8 atoms in block     67
 Block first atom:    550
 Blocpdb>     8 atoms in block     68
 Block first atom:    558
 Blocpdb>     8 atoms in block     69
 Block first atom:    566
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:    574
 Blocpdb>     8 atoms in block     71
 Block first atom:    584
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:    592
 Blocpdb>     8 atoms in block     73
 Block first atom:    599
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    607
 Blocpdb>     8 atoms in block     75
 Block first atom:    614
 Blocpdb>     8 atoms in block     76
 Block first atom:    622
 Blocpdb>     7 atoms in block     77
 Block first atom:    630
 Blocpdb>     7 atoms in block     78
 Block first atom:    637
 Blocpdb>     7 atoms in block     79
 Block first atom:    644
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:    651
 Blocpdb>     8 atoms in block     81
 Block first atom:    667
 Blocpdb>     6 atoms in block     82
 Block first atom:    675
 Blocpdb>     9 atoms in block     83
 Block first atom:    681
 Blocpdb>    12 atoms in block     84
 Block first atom:    690
 Blocpdb>    11 atoms in block     85
 Block first atom:    702
 Blocpdb>     8 atoms in block     86
 Block first atom:    713
 Blocpdb>     8 atoms in block     87
 Block first atom:    721
 Blocpdb>     7 atoms in block     88
 Block first atom:    729
 Blocpdb>     7 atoms in block     89
 Block first atom:    736
 Blocpdb>     5 atoms in block     90
 Block first atom:    743
 Blocpdb>    11 atoms in block     91
 Block first atom:    748
 Blocpdb>     8 atoms in block     92
 Block first atom:    759
 Blocpdb>    12 atoms in block     93
 Block first atom:    767
 Blocpdb>     9 atoms in block     94
 Block first atom:    779
 Blocpdb>     6 atoms in block     95
 Block first atom:    788
 Blocpdb>     8 atoms in block     96
 Block first atom:    794
 Blocpdb>     9 atoms in block     97
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    11 atoms in block     98
 Block first atom:    811
 Blocpdb>     8 atoms in block     99
 Block first atom:    822
 Blocpdb>     9 atoms in block    100
 Block first atom:    830
 Blocpdb>     7 atoms in block    101
 Block first atom:    839
 Blocpdb>     7 atoms in block    102
 Block first atom:    846
 Blocpdb>     8 atoms in block    103
 Block first atom:    853
 Blocpdb>     7 atoms in block    104
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    10 atoms in block    105
 Block first atom:    868
 Blocpdb>     6 atoms in block    106
 Block first atom:    878
 Blocpdb>     5 atoms in block    107
 Block first atom:    884
 Blocpdb>     5 atoms in block    108
 Block first atom:    889
 Blocpdb>     4 atoms in block    109
 Block first atom:    894
 Blocpdb>     7 atoms in block    110
 Block first atom:    898
 Blocpdb>     8 atoms in block    111
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    11 atoms in block    112
 Block first atom:    913
 Blocpdb>     6 atoms in block    113
 Block first atom:    924
 Blocpdb>     4 atoms in block    114
 Block first atom:    930
 Blocpdb>     5 atoms in block    115
 Block first atom:    934
 Blocpdb>     8 atoms in block    116
 Block first atom:    939
 Blocpdb>     8 atoms in block    117
 Block first atom:    947
 Blocpdb>     8 atoms in block    118
 Block first atom:    955
 Blocpdb>     5 atoms in block    119
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    12 atoms in block    120
 Block first atom:    968
 Blocpdb>     8 atoms in block    121
 Block first atom:    980
 Blocpdb>     8 atoms in block    122
 Block first atom:    988
 Blocpdb>     6 atoms in block    123
 Block first atom:    996
 Blocpdb>     9 atoms in block    124
 Block first atom:   1002
 Blocpdb>     8 atoms in block    125
 Block first atom:   1011
 Blocpdb>     9 atoms in block    126
 Block first atom:   1019
 Blocpdb>     9 atoms in block    127
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>     6 atoms in block    128
 Block first atom:   1037
 Blocpdb>     8 atoms in block    129
 Block first atom:   1043
 Blocpdb>     7 atoms in block    130
 Block first atom:   1051
 Blocpdb>     8 atoms in block    131
 Block first atom:   1058
 Blocpdb>     8 atoms in block    132
 Block first atom:   1066
 Blocpdb>    12 atoms in block    133
 Block first atom:   1074
 Blocpdb>    11 atoms in block    134
 Block first atom:   1086
 Blocpdb>     8 atoms in block    135
 Block first atom:   1097
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>     7 atoms in block    137
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    12 atoms in block    138
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    10 atoms in block    139
 Block first atom:   1136
 Blocpdb>     6 atoms in block    140
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>     8 atoms in block    141
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    11 atoms in block    142
 Block first atom:   1160
 Blocpdb>     8 atoms in block    143
 Block first atom:   1171
 Blocpdb>     8 atoms in block    144
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    11 atoms in block    145
 Block first atom:   1187
 Blocpdb>     4 atoms in block    146
 Block first atom:   1198
 Blocpdb>     5 atoms in block    147
 Block first atom:   1202
 Blocpdb>    11 atoms in block    148
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>     7 atoms in block    149
 Block first atom:   1218
 Blocpdb>     9 atoms in block    150
 Block first atom:   1225
 Blocpdb>     8 atoms in block    151
 Block first atom:   1234
 Blocpdb>     7 atoms in block    152
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>     9 atoms in block    153
 Block first atom:   1249
 Blocpdb>    11 atoms in block    154
 Block first atom:   1258
 Blocpdb>     9 atoms in block    155
 Block first atom:   1269
 Blocpdb>    11 atoms in block    156
 Block first atom:   1278
 Blocpdb>     9 atoms in block    157
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>     8 atoms in block    158
 Block first atom:   1298
 Blocpdb>     8 atoms in block    159
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>     9 atoms in block    160
 Block first atom:   1314
 Blocpdb>     9 atoms in block    161
 Block first atom:   1323
 Blocpdb>    12 atoms in block    162
 Block first atom:   1332
 Blocpdb>     7 atoms in block    163
 Block first atom:   1344
 Blocpdb>    16 atoms in block    164
 Block first atom:   1350

 Blocpdb>   164 blocks.

 Blocpdb> At most,     21 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       509027 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4098

 Prepmat> Matrix trace    =    1112760.0000
 Prepmat> Last element read:    4098   4098       251.0845
 Prepmat>        13531 lines saved.
 Prepmat>        11440 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1366
 RTB> Total mass =        1366.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1366
 RTB> Number of blocks =   164
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  243868.1559
 RTB>     72780 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      984
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    72780
 Diagstd> Projected matrix trace =  243868.1559

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    984 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 243868.1559
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.5760485      4.4732412      5.4373893      6.2773047
      7.6943915      8.8980419      9.2738592      9.3040751     11.2220831
     12.5879144     12.8161584     14.7666012     15.7343563     16.2201243
     16.6743620     19.1974856     19.8747624     20.7752911     22.0482024
     22.9945773     23.4209987     23.8099469     24.2800986     26.5431962
     27.2330002     28.0021647     29.6393890     30.4468154     31.9732093
     32.6736591     32.8772616     33.9972209     34.7100317     35.2872533
     35.9134470     36.5736341     37.8616275     38.6561746     39.2991758
     40.6662909     42.1103697     42.4581248     43.1116671     43.5184992
     44.4595358     44.9873256     45.5801826     47.0158791     47.9454807
     48.3470353     49.3089163     50.0182036     50.6434736     51.5328021
     52.6807540     53.9859450     54.1008246     54.7897591     56.4991549
     56.7613156     57.0541505     57.5867989     58.4033663     58.7887403
     59.1149966     59.6095724     60.3898094     62.7611419     63.1620150
     63.8944520     64.6617592     66.2785203     66.6736331     67.4664752
     67.6823611     68.6759143     69.2441193     70.1129399     70.4305805
     71.0154144     72.4138127     73.3314975     73.5020107     74.0390084
     74.9149288     74.9291242     75.9324115     76.4313627     77.6182648
     78.0848744     78.3099771     79.2481507     79.5389498     80.1120303
     80.9982435     81.7262892     83.0655879     83.6623911     84.2445812
     85.0463525

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034328      0.0034336      0.0034339      0.0034350      0.0034352
      0.0034358    174.2899298    229.6711473    253.2156207    272.0707705
    301.2190395    323.9235353    330.6934010    331.2316933    363.7743063
    385.2761905    388.7534114    417.2876709    430.7445293    437.3431904
    443.4247132    475.7923505    484.1124511    494.9585593    509.8963156
    520.7244811    525.5305713    529.8762980    535.0821987    559.4636685
    566.6867067    574.6336880    591.1938441    599.1922910    614.0283105
    620.7177536    622.6487186    633.1651297    639.7684007    645.0660829
    650.7644582    656.7186320    668.1822265    675.1569105    680.7489831
    692.4884940    704.6765306    707.5802214    713.0051863    716.3614966
    724.0653123    728.3504090    733.1339152    744.5906196    751.9156409
    755.0578098    762.5318862    767.9966493    772.7820457    779.5377644
    788.1724882    797.8764270    798.7248980    803.7943992    816.2369601
    818.1284713    820.2361429    824.0560446    829.8779399    832.6114085
    834.9185586    838.4038875    843.8730351    860.2817275    863.0247854
    868.0142501    873.2106787    884.0598804    886.6910825    891.9474961
    893.3734273    899.9067417    903.6218590    909.2731549    911.3305187
    915.1064007    924.0723756    929.9092271    930.9897301    934.3843957
    939.8952738    939.9843184    946.2565018    949.3603330    956.7032410
    959.5745882    960.9567211    966.6958372    968.4678466    971.9505042
    977.3116614    981.6940760    989.7051997    993.2542146    996.7041537
   1001.4358310

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1366
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    164

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9935E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.576    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.473    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.437    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.277    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.694    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.898    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.274    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.304    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.05    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    984 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00005 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    24588 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00005 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2405281028003778489.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2405281028003778489.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2405281028003778489.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2405281028003778489.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    164
            First residue number     =      7
            Last  residue number     =    170
            Number of atoms found    =   1366
            Mean number per residue  =      8.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9935E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.576    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.473    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.437    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.277    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.694    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.898    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.274    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.304    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.05    

 Bfactors>  106 vectors,   4098 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.576000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.554 for    171 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.030 +/-   0.04
 Bfactors> =     20.221 +/-   6.75
 Bfactors> Shiftng-fct=     20.191
 Bfactors> Scaling-fct=    188.297

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2405281028003778489.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2405281028003778489.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   989.7    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   996.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1001.    

 Chkmod>  106 vectors,   4098 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1366 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    43 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    57 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    79 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9134
      0.0034      0.7864
      0.0034      0.8718
      0.0034      0.8752
      0.0034      0.7778
      0.0034      0.8769
    174.2808      0.3090
    229.6551      0.3681
    253.1957      0.0544
    272.0525      0.2841
    301.1984      0.2396
    323.9089      0.0881
    330.6817      0.1201
    331.2161      0.0398
    363.7249      0.2169
    385.2916      0.4501
    388.7950      0.2113
    417.3178      0.3928
    430.6664      0.0870
    437.3227      0.3110
    443.3477      0.5267
    475.8031      0.4329
    484.0337      0.3116
    494.9934      0.3522
    509.8952      0.5001
    520.6503      0.3236
    525.4968      0.4622
    529.8541      0.1897
    535.0581      0.1683
    559.4060      0.5646
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    574.5868      0.3021
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    599.1979      0.3750
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    620.6564      0.4567
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    650.7053      0.3070
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    829.8184      0.2400
    832.5846      0.3389
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    899.8949      0.3531
    903.5562      0.1671
    909.2151      0.3082
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    934.3505      0.3722
    939.8240      0.3909
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    996.6343      0.1337
   1001.4143      0.4033
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2405281028003778489 7 -100 100 20 on 0
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 9 will be plotted
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getting mode 9
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getting mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.587s
user	0m13.558s
sys	0m0.012s
rm: cannot remove '2405281028003778489.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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