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LOGs for ID: 2405271642113669817

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2405271642113669817.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2405271642113669817.atom to be opened. Openam> File opened: 2405271642113669817.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 376 First residue number = 4 Last residue number = 379 Number of atoms found = 3159 Mean number per residue = 8.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.084258 +/- 13.398419 From: -30.115000 To: 35.282000 = 14.846485 +/- 10.053257 From: -7.393000 To: 39.037000 = -21.387877 +/- 11.883148 From: -48.838000 To: 5.476000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9017 % Filled. Pdbmat> 1303206 non-zero elements. Pdbmat> 142713 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 90.35 +/- 25.38 Maximum number = 166 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 2.854260E+06 Pdbmat> Larger element = 673.142 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 376 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2405271642113669817.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2405271642113669817.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2405271642113669817.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3159 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 376 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 61 Blocpdb> 12 atoms in block 6 Block first atom: 73 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 85 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 102 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 119 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 133 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 149 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 165 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 179 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 196 Blocpdb> 12 atoms in block 15 Block first atom: 216 Blocpdb> 18 atoms in block 16 Block first atom: 228 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 246 Blocpdb> 18 atoms in block 18 Block first atom: 262 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 280 Blocpdb> 22 atoms in block 20 Block first atom: 298 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 320 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 336 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 353 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 369 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 384 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 399 Blocpdb> 20 atoms in block 27 Block first atom: 415 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 435 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 451 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 467 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 486 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 505 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 522 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 535 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 551 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 567 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 585 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 597 Blocpdb> 18 atoms in block 39 Block first atom: 612 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 630 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 644 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 659 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 672 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 690 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 704 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 724 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 740 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 753 Blocpdb> 13 atoms in block 49 Block first atom: 768 Blocpdb> 10 atoms in block 50 Block first atom: 781 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 791 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 814 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 831 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 846 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 861 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 876 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 894 Blocpdb> 18 atoms in block 58 Block first atom: 910 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 928 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 950 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 965 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 980 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 992 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1012 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1037 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 1053 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1068 Blocpdb> 11 atoms in block 68 Block first atom: 1085 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 70 Block first atom: 1119 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1132 Blocpdb> 26 atoms in block 72 Block first atom: 1151 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1177 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1200 Blocpdb> 21 atoms in block 75 Block first atom: 1226 Blocpdb> 20 atoms in block 76 Block first atom: 1247 Blocpdb> 8 atoms in block 77 Block first atom: 1267 Blocpdb> 14 atoms in block 78 Block first atom: 1275 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1289 Blocpdb> 12 atoms in block 80 Block first atom: 1304 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1316 Blocpdb> 12 atoms in block 82 Block first atom: 1332 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1344 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1360 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1379 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1399 Blocpdb> 20 atoms in block 87 Block first atom: 1418 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1438 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1454 Blocpdb> 23 atoms in block 90 Block first atom: 1468 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1491 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 1508 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1528 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 1544 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1562 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 1576 Blocpdb> 35 atoms in block 97 Block first atom: 1585 Blocpdb> 12 atoms in block 98 Block first atom: 1620 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1632 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1644 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 1660 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1679 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1694 Blocpdb> 12 atoms in block 104 Block first atom: 1705 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1717 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 1733 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1752 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1766 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1778 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1793 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1810 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 1830 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1848 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 1865 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1877 Blocpdb> 20 atoms in block 116 Block first atom: 1890 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 1910 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1926 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 1945 Blocpdb> 35 atoms in block 120 Block first atom: 1965 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2000 Blocpdb> 18 atoms in block 122 Block first atom: 2013 Blocpdb> 18 atoms in block 123 Block first atom: 2031 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 2049 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2065 Blocpdb> 15 atoms in block 126 Block first atom: 2079 Blocpdb> 28 atoms in block 127 Block first atom: 2094 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 2122 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 130 Block first atom: 2156 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 2179 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 2199 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2219 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2235 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2250 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 2267 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2285 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 2301 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2321 Blocpdb> 13 atoms in block 140 Block first atom: 2336 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2349 Blocpdb> 14 atoms in block 142 Block first atom: 2364 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2378 Blocpdb> 14 atoms in block 144 Block first atom: 2393 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 2407 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2418 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 2435 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 2454 Blocpdb> 11 atoms in block 149 Block first atom: 2474 Blocpdb> 11 atoms in block 150 Block first atom: 2485 Blocpdb> 14 atoms in block 151 Block first atom: 2496 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2510 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2525 Blocpdb> 24 atoms in block 154 Block first atom: 2542 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2566 Blocpdb> 18 atoms in block 156 Block first atom: 2581 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 2599 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 2618 Blocpdb> 17 atoms in block 159 Block first atom: 2633 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 2650 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2670 Blocpdb> 12 atoms in block 162 Block first atom: 2682 Blocpdb> 11 atoms in block 163 Block first atom: 2694 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2705 Blocpdb> 17 atoms in block 165 Block first atom: 2720 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 2737 Blocpdb> 34 atoms in block 167 Block first atom: 2759 Blocpdb> 21 atoms in block 168 Block first atom: 2793 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2814 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2833 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 2848 Blocpdb> 26 atoms in block 172 Block first atom: 2868 Blocpdb> 16 atoms in block 173 Block first atom: 2894 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 2910 Blocpdb> 18 atoms in block 175 Block first atom: 2934 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2952 Blocpdb> 10 atoms in block 177 Block first atom: 2967 Blocpdb> 19 atoms in block 178 Block first atom: 2977 Blocpdb> 17 atoms in block 179 Block first atom: 2996 Blocpdb> 16 atoms in block 180 Block first atom: 3013 Blocpdb> 13 atoms in block 181 Block first atom: 3029 Blocpdb> 16 atoms in block 182 Block first atom: 3042 Blocpdb> 15 atoms in block 183 Block first atom: 3058 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 3073 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 3090 Blocpdb> 26 atoms in block 186 Block first atom: 3107 Blocpdb> 16 atoms in block 187 Block first atom: 3133 Blocpdb> 11 atoms in block 188 Block first atom: 3148 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1303394 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9477 Prepmat> Matrix trace = 2854260.0000 Prepmat> Last element read: 9477 9477 69.8308 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 15590 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3159 RTB> Total mass = 3159.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3159 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 286290.8151 RTB> 75516 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 75516 Diagstd> Projected matrix trace = 286290.8151 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 286290.8151 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.7345803 4.4340086 5.3525706 6.7408402 7.8895832 8.1093734 9.9125480 10.1086233 10.6904701 12.7468390 13.4838755 14.8234146 15.0703546 16.2898988 16.8923709 17.6010433 18.3250671 19.1669475 19.3750562 21.0001464 21.7005845 23.1598988 23.7552743 25.0679011 27.1627975 27.4444035 28.6034879 29.2796630 29.4502044 29.9980941 30.7587374 32.0485232 32.3262476 32.6454758 33.1822173 33.7741120 35.0042647 35.7800141 35.9546064 36.6717029 37.2448619 37.7351894 38.7709691 39.6240756 39.9889178 40.5514477 40.7457568 42.7185515 43.1308701 44.0236369 45.1108486 45.5810322 46.2367449 46.7650023 47.6543418 48.4001556 48.7663243 49.7414101 50.1518083 50.6431189 51.7345209 52.7625600 53.1807797 53.7719186 54.6327401 55.8010795 55.9014267 57.3958404 57.6093371 57.9927376 58.5397424 59.0077411 59.9849069 60.8661243 61.1939257 61.6869277 62.3603669 63.0462815 63.4279960 64.3474488 64.7824005 65.4398949 65.8405843 66.7700746 67.4502440 68.2830570 69.0539078 69.4485815 69.9478213 70.6121718 71.2190970 71.6121051 71.9056058 72.4698373 73.0340079 73.9745375 75.0431166 75.6093736 76.1154715 76.7591379 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034321 0.0034324 0.0034338 0.0034346 0.0034346 179.5728263 228.6617618 251.2328824 281.9371441 305.0157823 309.2352049 341.8912067 345.2560419 355.0534045 387.7006512 398.7517920 418.0896417 421.5576895 438.2828460 446.3140770 455.5798280 464.8556000 475.4137707 477.9877497 497.6298703 505.8607640 522.5930255 529.2675959 543.6936577 565.9558172 568.8819814 580.7708056 587.5953048 589.3040649 594.7604920 602.2537776 614.7510672 617.4089602 620.4499896 625.5297678 631.0841172 642.4743000 649.5544079 651.1372629 657.5985076 662.7175385 667.0656033 676.1586503 683.5571843 686.6969297 691.5099951 693.1647590 709.7469575 713.1639639 720.5070574 729.3496493 733.1407474 738.3952705 742.6013946 749.6292399 755.4724981 758.3248565 765.8687100 769.0216712 772.7793392 781.0619761 788.7842131 791.9041712 796.2932721 802.6417971 811.1787789 811.9078234 822.6886200 824.2172873 826.9553963 830.8462875 834.1607963 841.0392708 847.1944551 849.4727223 852.8876992 857.5305699 862.2337507 864.8400146 871.0858254 874.0248865 878.4490488 881.1343227 887.3321372 891.8401967 897.3291128 902.3798951 904.9549709 908.2018375 912.5046053 916.4177909 918.9428445 920.8240527 924.4297710 928.0210930 933.9774903 940.6990627 944.2415354 947.3964463 951.3938167 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3159 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.890 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 56862 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405271642113669817.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405271642113669817.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2405271642113669817.atom Openam> file on opening on unit 11: 2405271642113669817.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 376 First residue number = 4 Last residue number = 379 Number of atoms found = 3159 Mean number per residue = 8.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.890 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.76 Bfactors> 106 vectors, 9477 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.735000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.697 for 395 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.017 +/- 0.02 Bfactors> = 23.170 +/- 7.13 Bfactors> Shiftng-fct= 23.153 Bfactors> Scaling-fct= 395.553 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405271642113669817.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405271642113669817.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7 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Chkmod> That is: 3159 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2405271642113669817 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom making animated gifs 11 models are in 2405271642113669817.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405271642113669817.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405271642113669817.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2405271642113669817 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405271642113669817.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2405271642113669817 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405271642113669817.eigenfacs 2405271642113669817.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405271642113669817.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405271642113669817.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2405271642113669817.10.pdb 2405271642113669817.11.pdb 2405271642113669817.7.pdb 2405271642113669817.8.pdb 2405271642113669817.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.275s user 0m22.200s sys 0m0.048s rm: cannot remove '2405271642113669817.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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