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***  01-JUN-22  ***

LOGs for ID: 2405251523233294513

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2405251523233294513.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2405251523233294513.atom to be opened. Openam> File opened: 2405251523233294513.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 372 First residue number = 1 Last residue number = 372 Number of atoms found = 2922 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 3.751222 +/- 22.264713 From: -45.038000 To: 70.502000 = -10.146769 +/- 23.870100 From: -67.982000 To: 37.532000 = -1.874005 +/- 16.927411 From: -42.555000 To: 32.699000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0541 % Filled. Pdbmat> 789285 non-zero elements. Pdbmat> 85762 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 58.70 +/- 25.34 Maximum number = 122 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.715240E+06 Pdbmat> Larger element = 442.857 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 372 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2405251523233294513.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2405251523233294513.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2405251523233294513.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2922 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 372 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 21 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 55 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 69 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 86 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 103 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 120 Blocpdb> 17 atoms in block 9 Block first atom: 135 Blocpdb> 13 atoms in block 10 Block first atom: 152 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 165 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 182 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 194 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 208 Blocpdb> 13 atoms in block 15 Block first atom: 224 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 237 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 251 Blocpdb> 18 atoms in block 18 Block first atom: 265 Blocpdb> 9 atoms in block 19 Block first atom: 283 Blocpdb> 10 atoms in block 20 Block first atom: 292 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 302 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 321 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 344 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 359 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 372 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 387 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 406 Blocpdb> 19 atoms in block 28 Block first atom: 417 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 436 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 452 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 464 Blocpdb> 12 atoms in block 32 Block first atom: 482 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 494 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 507 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 525 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 537 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 552 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 571 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 586 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 605 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 622 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 639 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 659 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 675 Blocpdb> 13 atoms in block 45 Block first atom: 691 Blocpdb> 12 atoms in block 46 Block first atom: 704 Blocpdb> 12 atoms in block 47 Block first atom: 716 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 728 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 744 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 764 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 776 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 794 Blocpdb> 16 atoms in block 53 Block first atom: 807 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 823 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 838 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 850 Blocpdb> 23 atoms in block 57 Block first atom: 865 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 888 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 902 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 920 Blocpdb> 18 atoms in block 61 Block first atom: 936 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 954 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 977 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 990 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1005 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1021 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1037 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1053 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1069 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1086 Blocpdb> 11 atoms in block 71 Block first atom: 1103 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1114 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1130 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1143 Blocpdb> 18 atoms in block 75 Block first atom: 1158 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1176 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1198 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1214 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1235 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1251 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1267 Blocpdb> 15 atoms in block 82 Block first atom: 1282 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1297 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1318 Blocpdb> 12 atoms in block 85 Block first atom: 1334 Blocpdb> 25 atoms in block 86 Block first atom: 1346 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1371 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1385 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1400 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1415 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1429 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1447 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1462 Blocpdb> 15 atoms in block 94 Block first atom: 1479 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1494 Blocpdb> 20 atoms in block 96 Block first atom: 1511 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 1531 Blocpdb> 11 atoms in block 98 Block first atom: 1549 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 1560 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1577 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1593 Blocpdb> 16 atoms in block 102 Block first atom: 1609 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 1625 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1642 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1661 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1681 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1698 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1719 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1731 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1746 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 1761 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1780 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1796 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1814 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1830 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1846 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1864 Blocpdb> 13 atoms in block 118 Block first atom: 1882 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1895 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1912 Blocpdb> 15 atoms in block 121 Block first atom: 1925 Blocpdb> 14 atoms in block 122 Block first atom: 1940 Blocpdb> 13 atoms in block 123 Block first atom: 1954 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1967 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1983 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 1999 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 2012 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 2026 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2043 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 2057 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 2070 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 2086 Blocpdb> 14 atoms in block 133 Block first atom: 2105 Blocpdb> 19 atoms in block 134 Block first atom: 2119 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2138 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 2155 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 2175 Blocpdb> 22 atoms in block 138 Block first atom: 2185 Blocpdb> 8 atoms in block 139 Block first atom: 2207 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2215 Blocpdb> 8 atoms in block 141 Block first atom: 2230 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2238 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2253 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 2270 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2278 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2293 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 2307 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2325 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2340 Blocpdb> 18 atoms in block 150 Block first atom: 2355 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2373 Blocpdb> 16 atoms in block 152 Block first atom: 2388 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2404 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2418 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2431 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 2446 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 2461 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2479 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2492 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 2507 Blocpdb> 15 atoms in block 161 Block first atom: 2524 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2539 Blocpdb> 13 atoms in block 163 Block first atom: 2554 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2567 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2583 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2599 Blocpdb> 11 atoms in block 167 Block first atom: 2616 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 2627 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 2644 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 2661 Blocpdb> 15 atoms in block 171 Block first atom: 2678 Blocpdb> 12 atoms in block 172 Block first atom: 2693 Blocpdb> 15 atoms in block 173 Block first atom: 2705 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 2720 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2737 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2750 Blocpdb> 19 atoms in block 177 Block first atom: 2764 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2783 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 2799 Blocpdb> 13 atoms in block 180 Block first atom: 2813 Blocpdb> 13 atoms in block 181 Block first atom: 2826 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2839 Blocpdb> 23 atoms in block 183 Block first atom: 2856 Blocpdb> 10 atoms in block 184 Block first atom: 2879 Blocpdb> 18 atoms in block 185 Block first atom: 2889 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 2906 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 789471 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8766 Prepmat> Matrix trace = 1715240.0000 Prepmat> Last element read: 8766 8766 93.0785 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 16125 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2922 RTB> Total mass = 2922.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2922 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 167438.9581 RTB> 42786 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 42786 Diagstd> Projected matrix trace = 167438.9581 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 167438.9581 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000037 0.0000101 0.0000331 0.0000955 0.0002123 0.0003291 0.0008447 0.0009867 0.0012731 0.0017240 0.0036627 0.0043217 0.0048107 0.0091630 0.0097415 0.0147809 0.0171369 0.0228575 0.0238849 0.0273505 0.0367755 0.0421920 0.0493282 0.0549121 0.0656573 0.0809341 0.0827423 0.0874601 0.0921393 0.1106191 0.1139125 0.1284847 0.1463870 0.1517291 0.1738152 0.1949742 0.2219096 0.2367624 0.2683480 0.3116187 0.3220265 0.3435464 0.3688885 0.4371222 0.4513023 0.5137462 0.5679006 0.5847740 0.6115343 0.6271015 0.6813056 0.7089010 0.7924201 0.7949375 0.8188707 0.8526615 0.9012045 0.9567543 1.0069499 1.0269004 1.1076907 1.2718926 1.4121785 1.4506424 1.5619123 1.7042261 1.7521961 1.7592777 1.8804879 2.0806745 2.1388960 2.2130564 2.3388539 2.3763769 2.6705386 2.7290655 2.7831949 2.9295217 2.9847548 3.0082873 3.0707687 3.3213114 3.4374951 3.6436509 3.7025549 3.8436011 3.9632335 4.0004813 4.0928642 4.3067527 4.3174396 4.5491987 4.7426743 4.8794087 4.9761358 5.3404067 5.5236925 5.5977667 5.7065953 5.7902398 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034341 0.2080562 0.3458736 0.6248837 1.0611771 1.5823534 1.9699772 3.1560943 3.4111293 3.8745909 4.5087964 6.5719401 7.1387320 7.5318286 10.3947381 10.7178498 13.2021928 14.2154706 16.4175816 16.7825120 17.9588184 20.8245118 22.3054048 24.1180814 25.4465668 27.8251138 30.8930734 31.2362592 32.1144417 32.9623177 36.1168919 36.6505902 38.9243136 41.5476562 42.2989570 45.2729897 47.9494696 51.1544334 52.8386368 56.2528370 60.6187559 61.6227508 63.6484692 65.9542618 71.7954143 72.9506317 77.8340418 81.8335624 83.0403784 84.9191599 85.9932181 89.6326562 91.4298671 96.6658403 96.8192617 98.2659234 100.2729076 103.0877234 106.2173581 108.9680578 110.0422472 114.2890270 122.4674014 129.0446712 130.7902770 135.7136713 141.7616914 143.7429752 144.0331567 148.9122923 156.6380791 158.8144867 161.5442561 166.0721573 167.3990329 177.4576442 179.3916655 181.1619935 185.8632969 187.6072482 188.3453653 190.2912576 197.9019512 201.3336312 207.2829876 208.9517610 212.8944952 216.1822887 217.1957911 219.6893207 225.3565826 225.6360109 231.6128940 236.4868133 239.8716267 242.2375101 250.9472536 255.2172508 256.9228193 259.4082703 261.3024940 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2922 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6709E-06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0145E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3114E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5496E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1233E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2910E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.4471E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8675E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2731E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7240E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6627E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3217E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8107E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1630E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7415E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4781E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7137E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2857E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3885E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7350E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6776E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2192E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9328E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4912E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5657E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0934E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2742E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7460E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2139E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2368 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3220 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4371 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5848 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6813 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.759 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.880 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.729 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.783 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.703 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.000 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.790 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99994 1.00002 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 1.00008 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 1.00004 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99997 0.99998 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 52596 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99994 1.00002 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 1.00008 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 1.00004 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99997 0.99998 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405251523233294513.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405251523233294513.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2405251523233294513.atom Openam> file on opening on unit 11: 2405251523233294513.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 372 First residue number = 1 Last residue number = 372 Number of atoms found = 2922 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6709E-06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0145E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3114E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5496E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1233E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2910E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4471E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8675E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2731E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7240E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6627E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3217E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8107E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1630E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7415E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4781E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7137E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2857E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3885E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7350E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6776E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2192E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9328E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4912E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5657E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0934E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2742E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7460E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2139E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2368 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3220 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4371 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5848 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6813 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.759 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.880 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.729 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.783 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.703 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.000 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.790 Bfactors> 106 vectors, 8766 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000004 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.313 for 372 C-alpha atoms. Bfactors> = 2264.445 +/- ****** Bfactors> = 67.971 +/- 21.61 Bfactors> Shiftng-fct= -2196.475 Bfactors> Scaling-fct= 0.007 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405251523233294513.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405251523233294513.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.2080 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.3459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.582 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.5 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vecteur en lecture: 161.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.3 Chkmod> 106 vectors, 8766 coordinates in file. Chkmod> That is: 2922 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 64 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8373 0.0034 0.7303 0.0034 0.8428 0.0034 0.9740 0.0034 0.8299 0.0034 0.8421 0.2080 0.4912 0.3459 0.4958 0.6249 0.4495 1.0611 0.6545 1.5823 0.3851 1.9699 0.7625 3.1560 0.7152 3.4110 0.4700 3.8744 0.4454 4.5086 0.6661 6.5717 0.2734 7.1385 0.3939 7.5315 0.4612 10.3943 0.2185 10.7174 0.3023 13.2017 0.2578 14.2149 0.7081 16.4167 0.2989 16.7818 0.6547 17.9579 0.5966 20.8237 0.3877 22.3045 0.1543 24.1170 0.1469 25.4455 0.3986 27.8238 0.4370 30.8917 0.2667 31.2349 0.2837 32.1130 0.2928 32.9608 0.3560 36.1122 0.1402 36.6470 0.3423 38.9250 0.1288 41.5477 0.1842 42.2931 0.2134 45.2691 0.1993 47.9506 0.0961 51.1511 0.1820 52.8406 0.1349 56.2454 0.2225 60.6143 0.1296 61.6176 0.1113 63.6414 0.3278 65.9525 0.4659 71.7905 0.2888 72.9473 0.1790 77.8272 0.1274 81.8300 0.2181 83.0387 0.1269 84.9131 0.2332 85.9894 0.2109 89.6284 0.4266 91.4259 0.0506 96.6605 0.1743 96.8128 0.1667 98.2635 0.1001 100.2709 0.0666 103.0830 0.3281 106.2153 0.1599 108.9661 0.1555 110.0429 0.2000 114.3001 0.0728 122.4673 0.1692 129.0310 0.1143 130.8008 0.1198 135.7117 0.0887 141.7462 0.1438 143.7288 0.0736 144.0156 0.1537 148.8866 0.1016 156.6436 0.0730 158.8115 0.1450 161.5353 0.0466 166.0702 0.1387 167.3786 0.0698 177.4654 0.1023 179.3818 0.1282 181.1479 0.1366 185.8705 0.0723 187.6069 0.0853 188.3283 0.0852 190.2903 0.0723 197.8842 0.0582 201.3105 0.0408 207.2840 0.0807 208.9553 0.0632 212.8964 0.1320 216.1666 0.1008 217.1734 0.0792 219.6835 0.0542 225.3534 0.0298 225.6148 0.0656 231.5979 0.0626 236.4848 0.0605 239.8513 0.0801 242.2238 0.0589 250.9269 0.0327 255.2134 0.1222 256.9171 0.1405 259.4063 0.1605 261.2859 0.1307 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2405251523233294513 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom making animated gifs 11 models are in 2405251523233294513.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2405251523233294513 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom making animated gifs 11 models are in 2405251523233294513.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2405251523233294513 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405251523233294513.eigenfacs 2405251523233294513.atom making animated gifs 11 models are in 2405251523233294513.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405251523233294513.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be 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