*** UBIQUITIN 17-APR-92 1AAR ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2405231924023010811.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2405231924023010811.atom to be opened.
Openam> File opened: 2405231924023010811.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 152
First residue number = 1
Last residue number = 76
Number of atoms found = 1203
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 18.200213 +/- 7.073582 From: 2.666000 To: 36.562000
= 7.735976 +/- 12.753552 From: -17.693000 To: 34.220000
= 6.016461 +/- 6.768197 From: -11.523000 To: 21.205000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 6.4848 % Filled.
Pdbmat> 422433 non-zero elements.
Pdbmat> 46140 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.71 +/- 21.07
Maximum number = 121
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 922800.
Pdbmat> Larger element = 458.518
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
152 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2405231924023010811.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2405231924023010811.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2405231924023010811.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1203 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 152 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 9 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 18
Blocpdb> 11 atoms in block 4
Block first atom: 26
Blocpdb> 7 atoms in block 5
Block first atom: 37
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 44
Blocpdb> 7 atoms in block 7
Block first atom: 53
Blocpdb> 8 atoms in block 8
Block first atom: 60
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 68
Blocpdb> 4 atoms in block 10
Block first atom: 75
Blocpdb> 9 atoms in block 11
Block first atom: 79
Blocpdb> 7 atoms in block 12
Block first atom: 88
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 95
Blocpdb> 7 atoms in block 14
Block first atom: 103
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 110
Blocpdb> 9 atoms in block 16
Block first atom: 118
Blocpdb> 7 atoms in block 17
Block first atom: 127
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 134
Blocpdb> 7 atoms in block 19
Block first atom: 143
Blocpdb> 6 atoms in block 20
Block first atom: 150
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 156
Blocpdb> 7 atoms in block 22
Block first atom: 164
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 171
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 179
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 188
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 196
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 203
Blocpdb> 5 atoms in block 28
Block first atom: 212
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 217
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 226
Blocpdb> 9 atoms in block 31
Block first atom: 234
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 243
Blocpdb> 9 atoms in block 33
Block first atom: 251
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 260
Blocpdb> 4 atoms in block 35
Block first atom: 269
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 273
Blocpdb> 7 atoms in block 37
Block first atom: 281
Blocpdb> 7 atoms in block 38
Block first atom: 288
Blocpdb> 8 atoms in block 39
Block first atom: 295
Blocpdb> 9 atoms in block 40
Block first atom: 303
Blocpdb> 9 atoms in block 41
Block first atom: 312
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 321
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 332
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 340
Blocpdb> 11 atoms in block 45
Block first atom: 348
Blocpdb> 5 atoms in block 46
Block first atom: 359
Blocpdb> 4 atoms in block 47
Block first atom: 364
Blocpdb> 9 atoms in block 48
Block first atom: 368
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 377
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 386
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 394
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 403
Blocpdb> 4 atoms in block 53
Block first atom: 411
Blocpdb> 11 atoms in block 54
Block first atom: 415
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 426
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 433
Blocpdb> 6 atoms in block 57
Block first atom: 441
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 447
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 455
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 467
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 475
Blocpdb> 9 atoms in block 62
Block first atom: 483
Blocpdb> 9 atoms in block 63
Block first atom: 492
Blocpdb> 9 atoms in block 64
Block first atom: 501
Blocpdb> 6 atoms in block 65
Block first atom: 510
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 516
Blocpdb> 8 atoms in block 67
Block first atom: 523
Blocpdb> 10 atoms in block 68
Block first atom: 531
Blocpdb> 8 atoms in block 69
Block first atom: 541
Blocpdb> 7 atoms in block 70
Block first atom: 549
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 556
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 564
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 575
Blocpdb> 11 atoms in block 74
Block first atom: 583
Blocpdb> 4 atoms in block 75
Block first atom: 594
Blocpdb> 4 atoms in block 76
Block first atom: 598
Blocpdb> 8 atoms in block 77
Block first atom: 602
Blocpdb> 9 atoms in block 78
Block first atom: 610
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 619
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 627
Blocpdb> 7 atoms in block 81
Block first atom: 638
Blocpdb> 9 atoms in block 82
Block first atom: 645
Blocpdb> 7 atoms in block 83
Block first atom: 654
Blocpdb> 8 atoms in block 84
Block first atom: 661
Blocpdb> 7 atoms in block 85
Block first atom: 669
Blocpdb> 4 atoms in block 86
Block first atom: 676
Blocpdb> 9 atoms in block 87
Block first atom: 680
Blocpdb> 7 atoms in block 88
Block first atom: 689
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 696
Blocpdb> 7 atoms in block 90
Block first atom: 704
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 711
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 719
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 728
Blocpdb> 9 atoms in block 94
Block first atom: 735
Blocpdb> 7 atoms in block 95
Block first atom: 744
Blocpdb> 6 atoms in block 96
Block first atom: 751
Blocpdb> 8 atoms in block 97
Block first atom: 757
Blocpdb> 7 atoms in block 98
Block first atom: 765
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 772
Blocpdb> 9 atoms in block 100
Block first atom: 780
Blocpdb> 8 atoms in block 101
Block first atom: 789
Blocpdb> 7 atoms in block 102
Block first atom: 797
Blocpdb> 9 atoms in block 103
Block first atom: 804
Blocpdb> 5 atoms in block 104
Block first atom: 813
Blocpdb> 9 atoms in block 105
Block first atom: 818
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 827
Blocpdb> 9 atoms in block 107
Block first atom: 835
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 844
Blocpdb> 9 atoms in block 109
Block first atom: 852
Blocpdb> 9 atoms in block 110
Block first atom: 861
Blocpdb> 4 atoms in block 111
Block first atom: 870
Blocpdb> 8 atoms in block 112
Block first atom: 874
Blocpdb> 7 atoms in block 113
Block first atom: 882
Blocpdb> 7 atoms in block 114
Block first atom: 889
Blocpdb> 8 atoms in block 115
Block first atom: 896
Blocpdb> 9 atoms in block 116
Block first atom: 904
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 913
Blocpdb> 11 atoms in block 118
Block first atom: 922
Blocpdb> 8 atoms in block 119
Block first atom: 933
Blocpdb> 8 atoms in block 120
Block first atom: 941
Blocpdb> 11 atoms in block 121
Block first atom: 949
Blocpdb> 5 atoms in block 122
Block first atom: 960
Blocpdb> 4 atoms in block 123
Block first atom: 965
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 969
Blocpdb> 9 atoms in block 125
Block first atom: 978
Blocpdb> 8 atoms in block 126
Block first atom: 987
Blocpdb> 9 atoms in block 127
Block first atom: 995
Blocpdb> 8 atoms in block 128
Block first atom: 1004
Blocpdb> 4 atoms in block 129
Block first atom: 1012
Blocpdb> 11 atoms in block 130
Block first atom: 1016
Blocpdb> 7 atoms in block 131
Block first atom: 1027
Blocpdb> 8 atoms in block 132
Block first atom: 1034
Blocpdb> 6 atoms in block 133
Block first atom: 1042
Blocpdb> 8 atoms in block 134
Block first atom: 1048
Blocpdb> 12 atoms in block 135
Block first atom: 1056
Blocpdb> 8 atoms in block 136
Block first atom: 1068
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1076
Blocpdb> 9 atoms in block 138
Block first atom: 1084
Blocpdb> 9 atoms in block 139
Block first atom: 1093
Blocpdb> 9 atoms in block 140
Block first atom: 1102
Blocpdb> 6 atoms in block 141
Block first atom: 1111
Blocpdb> 7 atoms in block 142
Block first atom: 1117
Blocpdb> 8 atoms in block 143
Block first atom: 1124
Blocpdb> 10 atoms in block 144
Block first atom: 1132
Blocpdb> 8 atoms in block 145
Block first atom: 1142
Blocpdb> 7 atoms in block 146
Block first atom: 1150
Blocpdb> 8 atoms in block 147
Block first atom: 1157
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 1165
Blocpdb> 8 atoms in block 149
Block first atom: 1176
Blocpdb> 11 atoms in block 150
Block first atom: 1184
Blocpdb> 4 atoms in block 151
Block first atom: 1195
Blocpdb> 5 atoms in block 152
Block first atom: 1198
Blocpdb> 152 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 422585 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3609
Prepmat> Matrix trace = 922800.0000
Prepmat> Last element read: 3609 3609 11.2220
Prepmat> 11629 lines saved.
Prepmat> 9784 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1203
RTB> Total mass = 1203.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1203
RTB> Number of blocks = 152
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212145.3344
RTB> 64104 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 912
Diagstd> Nb of non-zero elements: 64104
Diagstd> Projected matrix trace = 212145.3344
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 912 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212145.3344
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4524308 0.8103129 2.0703947 2.7880166
3.3337421 3.6606118 4.1549522 7.2569920 7.8692971
10.3058860 12.1154212 12.6076190 13.0355473 13.5120525
14.3328372 19.2277431 20.6491902 22.0109194 22.2604906
22.8572798 24.2415814 24.5945671 25.4799263 26.5094921
27.5365772 28.9744608 29.7322397 30.9165328 31.3958227
32.5647060 33.6216299 33.7118104 35.2629561 36.8176909
37.7613771 38.1302938 38.7875330 39.2939322 39.7468246
40.6588621 41.4478049 42.1208535 43.1463428 45.0110516
45.6599999 45.7867382 47.0716613 48.0857136 49.3547427
50.1729578 51.0818822 51.5916260 53.9507032 54.2590917
55.6861228 57.0279235 58.1187656 58.2851693 58.9031657
60.3326421 61.0564908 61.5917015 64.7761845 65.2017000
65.4469351 66.2767128 66.7689215 67.4458779 68.0333154
69.0275440 70.1664521 71.3875070 72.0544344 72.9125467
73.6953848 74.1639748 75.1265868 76.0146786 76.4420605
77.5477046 77.7610846 78.0471852 78.4748275 79.1177490
80.1275400 80.7064046 81.5348037 81.8081149 82.1771371
83.2769340 84.2231794 84.7061567 85.4946756 85.6017115
86.6574914 87.4995679 87.6870887 88.9035214 89.3095362
90.6291797
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034317 0.0034337 0.0034340 0.0034347 0.0034351
0.0034351 73.0417816 97.7510987 156.2506563 181.3188521
198.2719495 207.7648715 221.3493743 292.5321500 304.6233937
348.6084801 377.9762735 385.5776204 392.0666620 399.1682062
411.1131467 476.1671549 493.4541346 509.4650215 512.3451694
519.1675657 534.6576119 538.5361627 548.1436202 559.1083572
569.8364928 584.5248261 592.1191310 603.7966123 608.4588526
619.6819708 629.6579072 630.5017815 644.8439628 658.9061392
667.2970307 670.5487482 676.3030710 680.7035664 684.6151406
692.4252404 699.1108590 704.7642433 713.2918721 728.5424468
733.7755444 734.7932080 745.0322000 753.0144552 762.8861427
769.1838067 776.1197334 779.9825523 797.6159592 799.8923435
810.3427868 820.0475955 827.8534653 829.0377597 833.4213052
843.4735189 848.5182743 852.2291425 873.9829535 876.8488566
878.4963001 884.0478258 887.3244750 891.8113313 895.6866433
902.2076203 909.6200802 917.5006659 921.7765109 927.2490860
932.2135812 935.1726117 941.2220857 946.7689625 949.4267696
956.2682882 957.5830166 959.3429815 961.9676448 965.9001679
972.0445845 975.5494319 980.5433423 982.1853976 984.3981385
990.9634671 996.5775423 999.4308911 1004.0719036 1004.7002356
1010.8770496 1015.7766716 1016.8645472 1023.8934434 1026.2287969
1033.7828064
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1203
Rtb_to_modes> Number of blocs = 152
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4524
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.788
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.661
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.257
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.869
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.63
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 912 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 1.00002 1.00005 1.00003
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00004 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996
0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 21654 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 1.00002 1.00005 1.00003
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00004 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996
0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999
0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2405231924023010811.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2405231924023010811.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2405231924023010811.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2405231924023010811.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 152
First residue number = 1
Last residue number = 76
Number of atoms found = 1203
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.661
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.257
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.63
Bfactors> 106 vectors, 3609 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.452400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.370 for 152 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.096 +/- 0.72
Bfactors> = 13.124 +/- 4.73
Bfactors> Shiftng-fct= 13.028
Bfactors> Scaling-fct= 6.593
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2405231924023010811.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2405231924023010811.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Chkmod> 106 vectors, 3609 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1203 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7599
0.0034 0.7760
0.0034 0.9983
0.0034 0.6878
0.0034 0.9660
0.0034 0.7404
73.0362 0.0040
97.7461 0.0025
156.2291 0.0090
181.3105 0.6935
198.2711 0.6554
207.7670 0.0040
221.3411 0.7042
292.5198 0.0359
304.6046 0.0212
348.6631 0.5981
378.0315 0.0358
385.5975 0.5289
392.1168 0.6548
399.1208 0.0248
411.0548 0.0318
476.1747 0.3876
493.4426 0.4433
509.4325 0.3019
512.3175 0.2406
519.1762 0.0395
534.6172 0.2148
538.4630 0.1261
548.1209 0.1567
559.0897 0.1759
569.8474 0.3181
584.4547 0.3954
592.0714 0.4187
603.8045 0.4436
608.4732 0.2844
619.6106 0.5480
629.6156 0.6323
630.4578 0.4037
644.7893 0.4910
658.8985 0.4520
667.2562 0.5121
670.5174 0.5005
676.2955 0.6662
680.6403 0.3671
684.6131 0.3898
692.4052 0.5255
699.0994 0.5785
704.7268 0.3957
713.2915 0.1072
728.5027 0.2429
733.7440 0.3122
734.7878 0.3808
744.9871 0.4658
753.0157 0.2772
762.8167 0.2581
769.1281 0.4167
776.0721 0.2001
779.9368 0.3662
797.5765 0.3686
799.8647 0.3641
810.3362 0.6043
820.0273 0.4699
827.8267 0.4617
829.0365 0.3759
833.3631 0.4181
843.4188 0.3501
848.5062 0.3530
852.1808 0.4635
873.9712 0.3540
876.7998 0.3675
878.4792 0.4009
884.0318 0.4584
887.2936 0.3052
891.8003 0.3312
895.6264 0.3339
902.1849 0.3514
909.6040 0.4707
917.4773 0.2846
921.7086 0.2989
927.1931 0.4264
932.2028 0.1634
935.1074 0.3050
941.2031 0.3631
946.6992 0.2969
949.3732 0.2605
956.2414 0.4296
957.5352 0.3427
959.3191 0.4221
961.8968 0.1688
965.8724 0.3697
972.0178 0.1733
975.5293 0.3248
980.4724 0.3029
982.1546 0.3582
984.3730 0.4904
990.9392 0.3238
996.5160 0.3407
999.4107 0.2534
1004.0013 0.2937
1004.6471 0.3509
1010.8483 0.3707
1015.7356 0.3763
1016.8378 0.3683
1023.8292 0.2009
1026.1874 0.2813
1033.7431 0.3470
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231924023010811 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231924023010811.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231924023010811 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231924023010811.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231924023010811 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231924023010811.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231924023010811 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231924023010811.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231924023010811 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2405231924023010811.eigenfacs
2405231924023010811.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231924023010811.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231924023010811.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2405231924023010811.10.pdb
2405231924023010811.11.pdb
2405231924023010811.7.pdb
2405231924023010811.8.pdb
2405231924023010811.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m10.780s
user 0m10.752s
sys 0m0.028s
rm: cannot remove '2405231924023010811.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
