CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  nuevo proyecto  ***

LOGs for ID: 2405231921172994741

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2405231921172994741.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2405231921172994741.atom to be opened. Openam> File opened: 2405231921172994741.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 152 First residue number = 1 Last residue number = 76 Number of atoms found = 1203 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 18.200213 +/- 7.073582 From: 2.666000 To: 36.562000 = 7.735976 +/- 12.753552 From: -17.693000 To: 34.220000 = 6.016461 +/- 6.768197 From: -11.523000 To: 21.205000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.4848 % Filled. Pdbmat> 422433 non-zero elements. Pdbmat> 46140 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.71 +/- 21.07 Maximum number = 121 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 922800. Pdbmat> Larger element = 458.518 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 152 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2405231921172994741.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2405231921172994741.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2405231921172994741.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1203 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 152 residues. Blocpdb> 8 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 9 atoms in block 2 Block first atom: 9 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 18 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 26 Blocpdb> 7 atoms in block 5 Block first atom: 37 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 44 Blocpdb> 7 atoms in block 7 Block first atom: 53 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 60 Blocpdb> 7 atoms in block 9 Block first atom: 68 Blocpdb> 4 atoms in block 10 Block first atom: 75 Blocpdb> 9 atoms in block 11 Block first atom: 79 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 88 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 95 Blocpdb> 7 atoms in block 14 Block first atom: 103 Blocpdb> 8 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 9 atoms in block 16 Block first atom: 118 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 127 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 134 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 143 Blocpdb> 6 atoms in block 20 Block first atom: 150 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 156 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 164 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 171 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 179 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 188 Blocpdb> 7 atoms in block 26 Block first atom: 196 Blocpdb> 9 atoms in block 27 Block first atom: 203 Blocpdb> 5 atoms in block 28 Block first atom: 212 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 217 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 226 Blocpdb> 9 atoms in block 31 Block first atom: 234 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 243 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 251 Blocpdb> 9 atoms in block 34 Block first atom: 260 Blocpdb> 4 atoms in block 35 Block first atom: 269 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 273 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 281 Blocpdb> 7 atoms in block 38 Block first atom: 288 Blocpdb> 8 atoms in block 39 Block first atom: 295 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 303 Blocpdb> 9 atoms in block 41 Block first atom: 312 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 321 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 332 Blocpdb> 8 atoms in block 44 Block first atom: 340 Blocpdb> 11 atoms in block 45 Block first atom: 348 Blocpdb> 5 atoms in block 46 Block first atom: 359 Blocpdb> 4 atoms in block 47 Block first atom: 364 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 368 Blocpdb> 9 atoms in block 49 Block first atom: 377 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 386 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 394 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 403 Blocpdb> 4 atoms in block 53 Block first atom: 411 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 415 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 426 Blocpdb> 8 atoms in block 56 Block first atom: 433 Blocpdb> 6 atoms in block 57 Block first atom: 441 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 447 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 455 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 467 Blocpdb> 8 atoms in block 61 Block first atom: 475 Blocpdb> 9 atoms in block 62 Block first atom: 483 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 492 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 501 Blocpdb> 6 atoms in block 65 Block first atom: 510 Blocpdb> 7 atoms in block 66 Block first atom: 516 Blocpdb> 8 atoms in block 67 Block first atom: 523 Blocpdb> 10 atoms in block 68 Block first atom: 531 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 541 Blocpdb> 7 atoms in block 70 Block first atom: 549 Blocpdb> 8 atoms in block 71 Block first atom: 556 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 564 Blocpdb> 8 atoms in block 73 Block first atom: 575 Blocpdb> 11 atoms in block 74 Block first atom: 583 Blocpdb> 4 atoms in block 75 Block first atom: 594 Blocpdb> 4 atoms in block 76 Block first atom: 598 Blocpdb> 8 atoms in block 77 Block first atom: 602 Blocpdb> 9 atoms in block 78 Block first atom: 610 Blocpdb> 8 atoms in block 79 Block first atom: 619 Blocpdb> 11 atoms in block 80 Block first atom: 627 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 638 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 645 Blocpdb> 7 atoms in block 83 Block first atom: 654 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 661 Blocpdb> 7 atoms in block 85 Block first atom: 669 Blocpdb> 4 atoms in block 86 Block first atom: 676 Blocpdb> 9 atoms in block 87 Block first atom: 680 Blocpdb> 7 atoms in block 88 Block first atom: 689 Blocpdb> 8 atoms in block 89 Block first atom: 696 Blocpdb> 7 atoms in block 90 Block first atom: 704 Blocpdb> 8 atoms in block 91 Block first atom: 711 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 719 Blocpdb> 7 atoms in block 93 Block first atom: 728 Blocpdb> 9 atoms in block 94 Block first atom: 735 Blocpdb> 7 atoms in block 95 Block first atom: 744 Blocpdb> 6 atoms in block 96 Block first atom: 751 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 757 Blocpdb> 7 atoms in block 98 Block first atom: 765 Blocpdb> 8 atoms in block 99 Block first atom: 772 Blocpdb> 9 atoms in block 100 Block first atom: 780 Blocpdb> 8 atoms in block 101 Block first atom: 789 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 797 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 804 Blocpdb> 5 atoms in block 104 Block first atom: 813 Blocpdb> 9 atoms in block 105 Block first atom: 818 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 827 Blocpdb> 9 atoms in block 107 Block first atom: 835 Blocpdb> 8 atoms in block 108 Block first atom: 844 Blocpdb> 9 atoms in block 109 Block first atom: 852 Blocpdb> 9 atoms in block 110 Block first atom: 861 Blocpdb> 4 atoms in block 111 Block first atom: 870 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 874 Blocpdb> 7 atoms in block 113 Block first atom: 882 Blocpdb> 7 atoms in block 114 Block first atom: 889 Blocpdb> 8 atoms in block 115 Block first atom: 896 Blocpdb> 9 atoms in block 116 Block first atom: 904 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 913 Blocpdb> 11 atoms in block 118 Block first atom: 922 Blocpdb> 8 atoms in block 119 Block first atom: 933 Blocpdb> 8 atoms in block 120 Block first atom: 941 Blocpdb> 11 atoms in block 121 Block first atom: 949 Blocpdb> 5 atoms in block 122 Block first atom: 960 Blocpdb> 4 atoms in block 123 Block first atom: 965 Blocpdb> 9 atoms in block 124 Block first atom: 969 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 978 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 987 Blocpdb> 9 atoms in block 127 Block first atom: 995 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1004 Blocpdb> 4 atoms in block 129 Block first atom: 1012 Blocpdb> 11 atoms in block 130 Block first atom: 1016 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 1027 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1034 Blocpdb> 6 atoms in block 133 Block first atom: 1042 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 1048 Blocpdb> 12 atoms in block 135 Block first atom: 1056 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1068 Blocpdb> 8 atoms in block 137 Block first atom: 1076 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 1084 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1093 Blocpdb> 9 atoms in block 140 Block first atom: 1102 Blocpdb> 6 atoms in block 141 Block first atom: 1111 Blocpdb> 7 atoms in block 142 Block first atom: 1117 Blocpdb> 8 atoms in block 143 Block first atom: 1124 Blocpdb> 10 atoms in block 144 Block first atom: 1132 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1142 Blocpdb> 7 atoms in block 146 Block first atom: 1150 Blocpdb> 8 atoms in block 147 Block first atom: 1157 Blocpdb> 11 atoms in block 148 Block first atom: 1165 Blocpdb> 8 atoms in block 149 Block first atom: 1176 Blocpdb> 11 atoms in block 150 Block first atom: 1184 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1195 Blocpdb> 5 atoms in block 152 Block first atom: 1198 Blocpdb> 152 blocks. Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 422585 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3609 Prepmat> Matrix trace = 922800.0000 Prepmat> Last element read: 3609 3609 11.2220 Prepmat> 11629 lines saved. Prepmat> 9784 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1203 RTB> Total mass = 1203.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1203 RTB> Number of blocks = 152 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 212145.3344 RTB> 64104 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 912 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64104 Diagstd> Projected matrix trace = 212145.3344 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 912 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 212145.3344 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4524308 0.8103129 2.0703947 2.7880166 3.3337421 3.6606118 4.1549522 7.2569920 7.8692971 10.3058860 12.1154212 12.6076190 13.0355473 13.5120525 14.3328372 19.2277431 20.6491902 22.0109194 22.2604906 22.8572798 24.2415814 24.5945671 25.4799263 26.5094921 27.5365772 28.9744608 29.7322397 30.9165328 31.3958227 32.5647060 33.6216299 33.7118104 35.2629561 36.8176909 37.7613771 38.1302938 38.7875330 39.2939322 39.7468246 40.6588621 41.4478049 42.1208535 43.1463428 45.0110516 45.6599999 45.7867382 47.0716613 48.0857136 49.3547427 50.1729578 51.0818822 51.5916260 53.9507032 54.2590917 55.6861228 57.0279235 58.1187656 58.2851693 58.9031657 60.3326421 61.0564908 61.5917015 64.7761845 65.2017000 65.4469351 66.2767128 66.7689215 67.4458779 68.0333154 69.0275440 70.1664521 71.3875070 72.0544344 72.9125467 73.6953848 74.1639748 75.1265868 76.0146786 76.4420605 77.5477046 77.7610846 78.0471852 78.4748275 79.1177490 80.1275400 80.7064046 81.5348037 81.8081149 82.1771371 83.2769340 84.2231794 84.7061567 85.4946756 85.6017115 86.6574914 87.4995679 87.6870887 88.9035214 89.3095362 90.6291797 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034337 0.0034340 0.0034347 0.0034351 0.0034351 73.0417816 97.7510987 156.2506563 181.3188521 198.2719495 207.7648715 221.3493743 292.5321500 304.6233937 348.6084801 377.9762735 385.5776204 392.0666620 399.1682062 411.1131467 476.1671549 493.4541346 509.4650215 512.3451694 519.1675657 534.6576119 538.5361627 548.1436202 559.1083572 569.8364928 584.5248261 592.1191310 603.7966123 608.4588526 619.6819708 629.6579072 630.5017815 644.8439628 658.9061392 667.2970307 670.5487482 676.3030710 680.7035664 684.6151406 692.4252404 699.1108590 704.7642433 713.2918721 728.5424468 733.7755444 734.7932080 745.0322000 753.0144552 762.8861427 769.1838067 776.1197334 779.9825523 797.6159592 799.8923435 810.3427868 820.0475955 827.8534653 829.0377597 833.4213052 843.4735189 848.5182743 852.2291425 873.9829535 876.8488566 878.4963001 884.0478258 887.3244750 891.8113313 895.6866433 902.2076203 909.6200802 917.5006659 921.7765109 927.2490860 932.2135812 935.1726117 941.2220857 946.7689625 949.4267696 956.2682882 957.5830166 959.3429815 961.9676448 965.9001679 972.0445845 975.5494319 980.5433423 982.1853976 984.3981385 990.9634671 996.5775423 999.4308911 1004.0719036 1004.7002356 1010.8770496 1015.7766716 1016.8645472 1023.8934434 1026.2287969 1033.7828064 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1203 Rtb_to_modes> Number of blocs = 152 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.63 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 912 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 21654 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 0.99999 1.00005 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405231921172994741.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405231921172994741.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2405231921172994741.atom Openam> file on opening on unit 11: 2405231921172994741.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 152 First residue number = 1 Last residue number = 76 Number of atoms found = 1203 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.63 Bfactors> 106 vectors, 3609 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.452400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.370 for 152 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.096 +/- 0.72 Bfactors> = 13.124 +/- 4.73 Bfactors> Shiftng-fct= 13.028 Bfactors> Scaling-fct= 6.593 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2405231921172994741.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2405231921172994741.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034. Chkmod> 106 vectors, 3609 coordinates in file. Chkmod> That is: 1203 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7599 0.0034 0.7760 0.0034 0.9983 0.0034 0.6878 0.0034 0.9660 0.0034 0.7404 73.0362 0.0040 97.7461 0.0025 156.2291 0.0090 181.3105 0.6935 198.2711 0.6554 207.7670 0.0040 221.3411 0.7042 292.5198 0.0359 304.6046 0.0212 348.6631 0.5981 378.0315 0.0358 385.5975 0.5289 392.1168 0.6548 399.1208 0.0248 411.0548 0.0318 476.1747 0.3876 493.4426 0.4433 509.4325 0.3019 512.3175 0.2406 519.1762 0.0395 534.6172 0.2148 538.4630 0.1261 548.1209 0.1567 559.0897 0.1759 569.8474 0.3181 584.4547 0.3954 592.0714 0.4187 603.8045 0.4436 608.4732 0.2844 619.6106 0.5480 629.6156 0.6323 630.4578 0.4037 644.7893 0.4910 658.8985 0.4520 667.2562 0.5121 670.5174 0.5005 676.2955 0.6662 680.6403 0.3671 684.6131 0.3898 692.4052 0.5255 699.0994 0.5785 704.7268 0.3957 713.2915 0.1072 728.5027 0.2429 733.7440 0.3122 734.7878 0.3808 744.9871 0.4658 753.0157 0.2772 762.8167 0.2581 769.1281 0.4167 776.0721 0.2001 779.9368 0.3662 797.5765 0.3686 799.8647 0.3641 810.3362 0.6043 820.0273 0.4699 827.8267 0.4617 829.0365 0.3759 833.3631 0.4181 843.4188 0.3501 848.5062 0.3530 852.1808 0.4635 873.9712 0.3540 876.7998 0.3675 878.4792 0.4009 884.0318 0.4584 887.2936 0.3052 891.8003 0.3312 895.6264 0.3339 902.1849 0.3514 909.6040 0.4707 917.4773 0.2846 921.7086 0.2989 927.1931 0.4264 932.2028 0.1634 935.1074 0.3050 941.2031 0.3631 946.6992 0.2969 949.3732 0.2605 956.2414 0.4296 957.5352 0.3427 959.3191 0.4221 961.8968 0.1688 965.8724 0.3697 972.0178 0.1733 975.5293 0.3248 980.4724 0.3029 982.1546 0.3582 984.3730 0.4904 990.9392 0.3238 996.5160 0.3407 999.4107 0.2534 1004.0013 0.2937 1004.6471 0.3509 1010.8483 0.3707 1015.7356 0.3763 1016.8378 0.3683 1023.8292 0.2009 1026.1874 0.2813 1033.7431 0.3470 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2405231921172994741 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom making animated gifs 11 models are in 2405231921172994741.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2405231921172994741 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom making animated gifs 11 models are in 2405231921172994741.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2405231921172994741 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom making animated gifs 11 models are in 2405231921172994741.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2405231921172994741 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom making animated gifs 11 models are in 2405231921172994741.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2405231921172994741 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2405231921172994741.eigenfacs 2405231921172994741.atom making animated gifs 11 models are in 2405231921172994741.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2405231921172994741.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2405231921172994741.10.pdb 2405231921172994741.11.pdb 2405231921172994741.7.pdb 2405231921172994741.8.pdb 2405231921172994741.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m10.862s user 0m10.841s sys 0m0.020s rm: cannot remove '2405231921172994741.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.