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* 2act prueba *

LOGs for ID: 2405231911372957831

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2405231911372957831.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2405231911372957831.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2405231911372957831.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    217
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    218
            Number of atoms found    =   1650
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    53.654786 +/-     9.756273 From:    30.987000 To:    76.165000
 =    19.164905 +/-    10.352886 From:    -2.650000 To:    41.761000
 =    22.220762 +/-     7.875567 From:     3.916000 To:    41.525000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   5.1761 % Filled.
 Pdbmat>       634271  non-zero elements.
 Pdbmat>        69384 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     84.10 +/-     23.69
         Maximum number =    132
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.387680E+06
 Pdbmat> Larger element =  483.255    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
217 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2405231911372957831.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2405231911372957831.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2405231911372957831.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1650 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   217 residues.
 Blocpdb>    15 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    18 atoms in block      2
 Block first atom:     16
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     34
 Blocpdb>    25 atoms in block      4
 Block first atom:     49
 Blocpdb>    12 atoms in block      5
 Block first atom:     74
 Blocpdb>     9 atoms in block      6
 Block first atom:     86
 Blocpdb>    14 atoms in block      7
 Block first atom:     95
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:    109
 Blocpdb>    15 atoms in block      9
 Block first atom:    125
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    140
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    153
 Blocpdb>     8 atoms in block     12
 Block first atom:    168
 Blocpdb>    19 atoms in block     13
 Block first atom:    176
 Blocpdb>    17 atoms in block     14
 Block first atom:    195
 Blocpdb>    13 atoms in block     15
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    12 atoms in block     16
 Block first atom:    225
 Blocpdb>    16 atoms in block     17
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    12 atoms in block     18
 Block first atom:    253
 Blocpdb>    17 atoms in block     19
 Block first atom:    265
 Blocpdb>    15 atoms in block     20
 Block first atom:    282
 Blocpdb>    11 atoms in block     21
 Block first atom:    297
 Blocpdb>    15 atoms in block     22
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    14 atoms in block     23
 Block first atom:    323
 Blocpdb>    14 atoms in block     24
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    18 atoms in block     25
 Block first atom:    351
 Blocpdb>    17 atoms in block     26
 Block first atom:    369
 Blocpdb>    16 atoms in block     27
 Block first atom:    386
 Blocpdb>    10 atoms in block     28
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    24 atoms in block     29
 Block first atom:    412
 Blocpdb>    17 atoms in block     30
 Block first atom:    436
 Blocpdb>    18 atoms in block     31
 Block first atom:    453
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    471
 Blocpdb>    12 atoms in block     33
 Block first atom:    481
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    12 atoms in block     36
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    20 atoms in block     37
 Block first atom:    536
 Blocpdb>    19 atoms in block     38
 Block first atom:    556
 Blocpdb>    16 atoms in block     39
 Block first atom:    575
 Blocpdb>    12 atoms in block     40
 Block first atom:    591
 Blocpdb>    12 atoms in block     41
 Block first atom:    603
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    615
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    20 atoms in block     44
 Block first atom:    644
 Blocpdb>    19 atoms in block     45
 Block first atom:    664
 Blocpdb>    12 atoms in block     46
 Block first atom:    683
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    695
 Blocpdb>    12 atoms in block     48
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    724
 Blocpdb>    12 atoms in block     50
 Block first atom:    738
 Blocpdb>    17 atoms in block     51
 Block first atom:    750
 Blocpdb>    17 atoms in block     52
 Block first atom:    767
 Blocpdb>    21 atoms in block     53
 Block first atom:    784
 Blocpdb>    14 atoms in block     54
 Block first atom:    805
 Blocpdb>    16 atoms in block     55
 Block first atom:    819
 Blocpdb>    19 atoms in block     56
 Block first atom:    835
 Blocpdb>    17 atoms in block     57
 Block first atom:    854
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    871
 Blocpdb>    20 atoms in block     59
 Block first atom:    885
 Blocpdb>    17 atoms in block     60
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    19 atoms in block     61
 Block first atom:    922
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    941
 Blocpdb>    12 atoms in block     63
 Block first atom:    958
 Blocpdb>    16 atoms in block     64
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    21 atoms in block     65
 Block first atom:    986
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    13 atoms in block     67
 Block first atom:   1021
 Blocpdb>    13 atoms in block     68
 Block first atom:   1034
 Blocpdb>    13 atoms in block     69
 Block first atom:   1047
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:   1060
 Blocpdb>    13 atoms in block     71
 Block first atom:   1069
 Blocpdb>    20 atoms in block     72
 Block first atom:   1082
 Blocpdb>    21 atoms in block     73
 Block first atom:   1102
 Blocpdb>    11 atoms in block     74
 Block first atom:   1123
 Blocpdb>    12 atoms in block     75
 Block first atom:   1134
 Blocpdb>    18 atoms in block     76
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>    11 atoms in block     77
 Block first atom:   1164
 Blocpdb>    10 atoms in block     78
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:   1185
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    15 atoms in block     81
 Block first atom:   1212
 Blocpdb>    15 atoms in block     82
 Block first atom:   1227
 Blocpdb>    15 atoms in block     83
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:   1257
 Blocpdb>    11 atoms in block     85
 Block first atom:   1273
 Blocpdb>    13 atoms in block     86
 Block first atom:   1284
 Blocpdb>    11 atoms in block     87
 Block first atom:   1297
 Blocpdb>    20 atoms in block     88
 Block first atom:   1308
 Blocpdb>    22 atoms in block     89
 Block first atom:   1328
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   1350
 Blocpdb>    14 atoms in block     91
 Block first atom:   1366
 Blocpdb>    22 atoms in block     92
 Block first atom:   1380
 Blocpdb>    14 atoms in block     93
 Block first atom:   1402
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1416
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1434
 Blocpdb>    16 atoms in block     96
 Block first atom:   1452
 Blocpdb>    19 atoms in block     97
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    16 atoms in block     98
 Block first atom:   1487
 Blocpdb>    19 atoms in block     99
 Block first atom:   1503
 Blocpdb>    11 atoms in block    100
 Block first atom:   1522
 Blocpdb>     9 atoms in block    101
 Block first atom:   1533
 Blocpdb>    11 atoms in block    102
 Block first atom:   1542
 Blocpdb>    10 atoms in block    103
 Block first atom:   1553
 Blocpdb>    13 atoms in block    104
 Block first atom:   1563
 Blocpdb>    15 atoms in block    105
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    13 atoms in block    106
 Block first atom:   1591
 Blocpdb>    19 atoms in block    107
 Block first atom:   1604
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1623
 Blocpdb>    12 atoms in block    109
 Block first atom:   1638

 Blocpdb>   109 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       634380 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4950

 Prepmat> Matrix trace    =    1387680.0000
 Prepmat> Last element read:    4950   4950       158.7357
 Prepmat>         5996 lines saved.
 Prepmat>         4787 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1650
 RTB> Total mass =        1650.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1650
 RTB> Number of blocks =   109
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  156032.9858
 RTB>     41853 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      654
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    41853
 Diagstd> Projected matrix trace =  156032.9858

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    654 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 156032.9858
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      5.5189151      5.9323639      7.5575512     14.2994273
     15.5136809     16.5566169     17.4676736     19.4140684     20.9706431
     21.4151977     22.5444075     24.3822023     25.2891495     25.6935736
     26.5223914     27.5218465     28.2527925     30.1470857     30.9690097
     33.1586747     33.8450423     35.1839644     35.7675651     36.4444406
     38.5486169     39.4509405     40.1175755     41.4635491     42.9256127
     43.7647080     44.5051170     45.6108706     46.6228574     47.9465007
     48.6883140     49.4140013     51.3020844     52.5102094     53.0525565
     53.2879927     55.0463723     55.9013993     56.9013912     57.6633897
     58.6243099     59.2361532     60.0820467     61.4630839     62.4541600
     63.2160047     63.9871440     66.3434275     66.6710877     67.7368667
     69.0005289     69.6211436     71.2648766     71.3694094     72.2954865
     72.9017935     74.7287401     76.0600199     76.7684710     76.8859664
     79.1673908     80.0077579     80.6669024     81.6385959     82.7619042
     83.6035898     84.7775295     85.6157647     87.0354570     87.7797728
     88.2309685     89.5225188     90.5357547     90.7850477     91.9275534
     93.9769206     94.0939098     95.0978780     96.9166098     97.3439026
     97.9722260     98.8154510     99.9037775    100.2164303    101.0253526
    102.0716699    102.8830908    104.2053023    105.0200324    106.6196931
    107.0130556    107.6922190    108.8236529    109.6249753    110.2903327
    110.7845678

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034324      0.0034331      0.0034333      0.0034337      0.0034337
      0.0034345    255.1068600    264.4899492    298.5285209    410.6337127
    427.7132532    441.8563295    453.8504965    478.4687283    497.2801852
    502.5234403    515.6021187    536.2060935    546.0876965    550.4368949
    559.2443698    569.6840550    577.1995315    596.2356614    604.3088290
    625.3078234    631.7464507    644.1213085    649.4413978    655.5577024
    674.2169712    682.0621677    687.8007100    699.2436267    711.4649864
    718.3850702    724.4363832    733.3806736    741.4719456    751.9236393
    757.7180767    763.3439914    777.7907711    786.8956695    790.9489222
    792.7020124    805.6745252    811.9076242    819.1373382    824.6038617
    831.4461985    835.7737066    841.7199867    851.3388525    858.1752122
    863.3935550    868.6436383    884.4926587    886.6741566    893.7330786
    902.0310559    906.0785652    916.7122799    917.3843601    923.3170869
    927.1807080    938.7265698    947.0512846    951.4516544    952.1794826
    966.2031434    971.3177618    975.3106591    981.1672500    987.8943862
    992.9051036    999.8518597   1004.7827030   1013.0791733   1017.4018111
   1020.0132270   1027.4517276   1033.2498322   1034.6713968   1041.1615738
   1052.7030598   1053.3580960   1058.9627739   1069.0410626   1071.3951033
   1074.8472959   1079.4628704   1085.3910475   1087.0881081   1091.4666438
   1097.1042319   1101.4563262   1108.5114646   1112.8364809   1121.2797898
   1123.3463088   1126.9053560   1132.8096245   1136.9726940   1140.4178430
   1142.9702174

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1650
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    109

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9911E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9950E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9962E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.519    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.932    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.558    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.97    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.38    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.29    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.69    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.52    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.52    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.25    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.15    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.97    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.16    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.85    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.93    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.76    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.90    

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 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
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 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.8    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    654 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    29700 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003
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 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
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 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99997 0.99998 0.99999
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2405231911372957831.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2405231911372957831.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2405231911372957831.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2405231911372957831.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    217
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    218
            Number of atoms found    =   1650
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9911E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9950E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9962E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.519    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.932    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.558    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.8    

 Bfactors>  106 vectors,   4950 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     5.519000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.630 for    217 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.020 +/-   0.02
 Bfactors> =      8.594 +/-   3.39
 Bfactors> Shiftng-fct=      8.574
 Bfactors> Scaling-fct=    188.150

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2405231911372957831.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2405231911372957831.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   255.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   264.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   298.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   410.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   427.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   441.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   453.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   478.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   497.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   502.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   515.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   536.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   546.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   550.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   569.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   577.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   596.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   604.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   625.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   631.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   644.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   649.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   655.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   682.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   687.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   699.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   711.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   724.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   733.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   741.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1121.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1123.    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1133.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1140.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1143.    

 Chkmod>  106 vectors,   4950 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1650 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    23 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7700
      0.0034      0.9533
      0.0034      0.9261
      0.0034      0.8694
      0.0034      0.9434
      0.0034      0.8013
    255.0979      0.6298
    264.4705      0.5995
    298.5246      0.6270
    410.6243      0.3678
    427.6442      0.7498
    441.8825      0.6200
    453.8612      0.3148
    478.3981      0.5351
    497.2512      0.2252
    502.5582      0.1992
    515.5296      0.5005
    536.1589      0.1206
    546.0734      0.3513
    550.3750      0.3879
    559.1952      0.3297
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    644.0574      0.5623
    649.4356      0.2841
    655.4896      0.3891
    674.2001      0.4074
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    711.4708      0.3242
    718.3156      0.3505
    724.4450      0.4998
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    741.4174      0.4948
    751.9188      0.3809
    757.6987      0.5002
    763.2803      0.5521
    777.7416      0.4823
    786.8603      0.2956
    790.8959      0.4043
    792.6829      0.4170
    805.6665      0.5397
    811.8626      0.4263
    819.0922      0.3826
    824.5442      0.4911
    831.3799      0.3897
    835.7650      0.5164
    841.6695      0.5158
    851.2809      0.4786
    858.1098      0.2948
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   1136.7944      0.4692
   1140.4189      0.4358
   1143.0008      0.3364
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231911372957831 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2405231911372957831.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2405231911372957831.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2405231911372957831.eigenfacs
2405231911372957831.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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2405231911372957831.atom
making animated gifs
11 models are in 2405231911372957831.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231911372957831 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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11 models are in 2405231911372957831.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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normal mode computation
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making animated gifs
11 models are in 2405231911372957831.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2405231911372957831.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2405231911372957831 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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2405231911372957831.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m5.244s
user	0m5.223s
sys	0m0.020s
rm: cannot remove '2405231911372957831.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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