*** TPPPabetacomplex ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2403121211282908770.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2403121211282908770.atom to be opened.
Openam> File opened: 2403121211282908770.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 261
First residue number = 1
Last residue number = 42
Number of atoms found = 3971
Mean number per residue = 15.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 51.887515 +/- 12.712254 From: 15.363000 To: 77.993000
= 41.894201 +/- 9.420130 From: 21.513000 To: 71.843000
= 49.514004 +/- 14.108548 From: 13.068000 To: 80.288000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.4713 % Filled.
Pdbmat> 2463454 non-zero elements.
Pdbmat> 271529 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 136.76 +/- 44.75
Maximum number = 230
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 5.430580E+06
Pdbmat> Larger element = 820.220
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
261 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2403121211282908770.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2403121211282908770.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2403121211282908770.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3971 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 261 residues.
Blocpdb> 29 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 34 atoms in block 2
Block first atom: 30
Blocpdb> 32 atoms in block 3
Block first atom: 64
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 96
Blocpdb> 32 atoms in block 5
Block first atom: 120
Blocpdb> 24 atoms in block 6
Block first atom: 152
Blocpdb> 38 atoms in block 7
Block first atom: 176
Blocpdb> 28 atoms in block 8
Block first atom: 214
Blocpdb> 33 atoms in block 9
Block first atom: 242
Blocpdb> 21 atoms in block 10
Block first atom: 275
Blocpdb> 26 atoms in block 11
Block first atom: 296
Blocpdb> 33 atoms in block 12
Block first atom: 322
Blocpdb> 36 atoms in block 13
Block first atom: 355
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 391
Blocpdb> 46 atoms in block 15
Block first atom: 411
Blocpdb> 30 atoms in block 16
Block first atom: 457
Blocpdb> 34 atoms in block 17
Block first atom: 487
Blocpdb> 26 atoms in block 18
Block first atom: 521
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 547
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 564
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 586
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 603
Blocpdb> 25 atoms in block 23
Block first atom: 623
Blocpdb> 34 atoms in block 24
Block first atom: 648
Blocpdb> 21 atoms in block 25
Block first atom: 682
Blocpdb> 34 atoms in block 26
Block first atom: 703
Blocpdb> 25 atoms in block 27
Block first atom: 737
Blocpdb> 44 atoms in block 28
Block first atom: 762
Blocpdb> 44 atoms in block 29
Block first atom: 806
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 850
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 876
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 900
Blocpdb> 34 atoms in block 33
Block first atom: 922
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 956
Blocpdb> 39 atoms in block 35
Block first atom: 977
Blocpdb> 34 atoms in block 36
Block first atom: 1016
Blocpdb> 29 atoms in block 37
Block first atom: 1050
Blocpdb> 38 atoms in block 38
Block first atom: 1079
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 1117
Blocpdb> 30 atoms in block 40
Block first atom: 1150
Blocpdb> 34 atoms in block 41
Block first atom: 1180
Blocpdb> 28 atoms in block 42
Block first atom: 1214
Blocpdb> 35 atoms in block 43
Block first atom: 1242
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 1277
Blocpdb> 38 atoms in block 45
Block first atom: 1296
Blocpdb> 30 atoms in block 46
Block first atom: 1334
Blocpdb> 30 atoms in block 47
Block first atom: 1364
Blocpdb> 28 atoms in block 48
Block first atom: 1394
Blocpdb> 31 atoms in block 49
Block first atom: 1422
Blocpdb> 36 atoms in block 50
Block first atom: 1453
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1489
Blocpdb> 41 atoms in block 52
Block first atom: 1522
Blocpdb> 29 atoms in block 53
Block first atom: 1563
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1592
Blocpdb> 38 atoms in block 55
Block first atom: 1614
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1652
Blocpdb> 35 atoms in block 57
Block first atom: 1685
Blocpdb> 37 atoms in block 58
Block first atom: 1720
Blocpdb> 32 atoms in block 59
Block first atom: 1757
Blocpdb> 29 atoms in block 60
Block first atom: 1789
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1818
Blocpdb> 29 atoms in block 62
Block first atom: 1848
Blocpdb> 44 atoms in block 63
Block first atom: 1877
Blocpdb> 44 atoms in block 64
Block first atom: 1921
Blocpdb> 34 atoms in block 65
Block first atom: 1965
Blocpdb> 33 atoms in block 66
Block first atom: 1999
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 2032
Blocpdb> 25 atoms in block 68
Block first atom: 2058
Blocpdb> 40 atoms in block 69
Block first atom: 2083
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 2123
Blocpdb> 41 atoms in block 71
Block first atom: 2154
Blocpdb> 38 atoms in block 72
Block first atom: 2195
Blocpdb> 22 atoms in block 73
Block first atom: 2233
Blocpdb> 32 atoms in block 74
Block first atom: 2255
Blocpdb> 33 atoms in block 75
Block first atom: 2287
Blocpdb> 30 atoms in block 76
Block first atom: 2320
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 2350
Blocpdb> 36 atoms in block 78
Block first atom: 2373
Blocpdb> 29 atoms in block 79
Block first atom: 2409
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 2438
Blocpdb> 28 atoms in block 81
Block first atom: 2460
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 2488
Blocpdb> 43 atoms in block 83
Block first atom: 2515
Blocpdb> 26 atoms in block 84
Block first atom: 2558
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 2584
Blocpdb> 42 atoms in block 86
Block first atom: 2612
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 2654
Blocpdb> 28 atoms in block 88
Block first atom: 2675
Blocpdb> 37 atoms in block 89
Block first atom: 2703
Blocpdb> 44 atoms in block 90
Block first atom: 2740
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2784
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 2810
Blocpdb> 29 atoms in block 93
Block first atom: 2828
Blocpdb> 29 atoms in block 94
Block first atom: 2857
Blocpdb> 32 atoms in block 95
Block first atom: 2886
Blocpdb> 31 atoms in block 96
Block first atom: 2918
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2949
Blocpdb> 35 atoms in block 98
Block first atom: 2977
Blocpdb> 27 atoms in block 99
Block first atom: 3012
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 3039
Blocpdb> 37 atoms in block 101
Block first atom: 3057
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 3094
Blocpdb> 43 atoms in block 103
Block first atom: 3112
Blocpdb> 27 atoms in block 104
Block first atom: 3155
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 3182
Blocpdb> 33 atoms in block 106
Block first atom: 3203
Blocpdb> 39 atoms in block 107
Block first atom: 3236
Blocpdb> 33 atoms in block 108
Block first atom: 3275
Blocpdb> 14 atoms in block 109
Block first atom: 3308
Blocpdb> 23 atoms in block 110
Block first atom: 3322
Blocpdb> 24 atoms in block 111
Block first atom: 3345
Blocpdb> 35 atoms in block 112
Block first atom: 3369
Blocpdb> 41 atoms in block 113
Block first atom: 3404
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 3445
Blocpdb> 28 atoms in block 115
Block first atom: 3468
Blocpdb> 31 atoms in block 116
Block first atom: 3496
Blocpdb> 34 atoms in block 117
Block first atom: 3527
Blocpdb> 39 atoms in block 118
Block first atom: 3561
Blocpdb> 35 atoms in block 119
Block first atom: 3600
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 3635
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 3675
Blocpdb> 28 atoms in block 122
Block first atom: 3700
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 3728
Blocpdb> 36 atoms in block 124
Block first atom: 3746
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 3782
Blocpdb> 38 atoms in block 126
Block first atom: 3799
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 3837
Blocpdb> 33 atoms in block 128
Block first atom: 3863
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 3896
Blocpdb> 32 atoms in block 130
Block first atom: 3910
Blocpdb> 30 atoms in block 131
Block first atom: 3941
Blocpdb> 131 blocks.
Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2463585 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11913
Prepmat> Matrix trace = 5430580.0000
Prepmat> Last element read: 11913 11913 163.5985
Prepmat> 8647 lines saved.
Prepmat> 7278 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3971
RTB> Total mass = 3971.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3971
RTB> Number of blocks = 131
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 295550.8324
RTB> 47283 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 786
Diagstd> Nb of non-zero elements: 47283
Diagstd> Projected matrix trace = 295550.8324
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 786 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 295550.8324
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.3394144 2.4217833 2.8729260 4.0433840
4.8339949 5.6239896 7.1509240 9.0840412 9.9826681
10.5752858 12.5240407 14.1598961 15.2844219 16.5131221
17.5488971 18.3778830 20.0413937 20.9722380 22.1522739
22.9948834 24.8179201 25.3273891 27.3735930 28.2006276
30.3742519 31.9996270 33.3790175 34.1151855 34.5667954
35.5436753 37.6434029 39.0742944 40.4759223 41.4243696
42.4658457 43.5455208 46.8751900 47.9003165 50.1826223
51.1627030 52.1074266 53.2664726 53.9463272 55.0237002
56.4387653 58.2301571 58.9609270 59.9533965 60.2288149
60.8359229 61.9284644 64.8811099 65.8817061 67.3137316
68.3046761 70.7348367 72.1040985 72.7107773 73.4414764
74.4295110 75.6845422 76.7095234 78.0631004 78.7854110
83.1064470 83.3563978 83.9566494 85.6021597 86.5015510
88.1934104 89.4650926 90.5863791 92.3825937 93.2802122
94.4489850 95.4614123 96.7767119 97.8113570 99.0128255
100.3927919 101.4126005 103.9544919 104.4211938 105.6978662
106.7485881 107.5864118 109.2733181 109.8377470 111.4735391
112.2224745 112.5763802 114.0542880 115.3677713 116.3027539
116.7987942 118.2267499 119.2578205 121.0644059 121.6331252
122.9793392
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034331 0.0034332 0.0034342 0.0034361
0.0034363 125.6761217 168.9907432 184.0591874 218.3573300
238.7527447 257.5238962 290.3864604 327.2915761 343.0983246
353.1354660 384.2974614 408.6253571 424.5411470 441.2755621
454.9044586 465.5250140 486.1376312 497.2990958 511.0982998
520.7279462 540.9759661 546.5004097 568.1476088 576.6664254
598.4778419 614.2819272 627.3820009 634.2626659 638.4469844
647.4055930 666.2538294 678.7984668 690.8657411 698.9131864
707.6445542 716.5838645 743.4757382 751.5614087 769.2578839
776.7334718 783.8718940 792.5419322 797.5836109 805.5085907
815.8006226 828.6464256 833.8298376 840.8183406 842.7474348
846.9842427 854.5558191 874.6905121 881.4094430 890.9372428
897.4711533 913.2968464 922.0941271 925.9652191 930.6062814
936.8452583 944.7107875 951.0862928 959.4407901 963.8693773
989.9485822 991.4361487 994.9994239 1004.7028659 1009.9671019
1019.7961047 1027.1221339 1033.5386702 1043.7352613 1048.7936348
1055.3437141 1060.9849121 1068.2692105 1073.9644909 1080.5403951
1088.0442199 1093.5565342 1107.1766300 1109.6591722 1116.4220110
1121.9573551 1126.3516300 1135.1476268 1138.0755371 1146.5187858
1150.3637836 1152.1762542 1159.7145051 1166.3731985 1171.0900188
1173.5847566 1180.7369539 1185.8744562 1194.8228454 1197.6259922
1204.2353119
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3971
Rtb_to_modes> Number of blocs = 131
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.339
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.422
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.873
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.834
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.0
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 786 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 71478 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000
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1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2403121211282908770.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2403121211282908770.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2403121211282908770.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2403121211282908770.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 261
First residue number = 1
Last residue number = 42
Number of atoms found = 3971
Mean number per residue = 15.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.339
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.422
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.873
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.043
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.834
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.624
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.983
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.0
Bfactors> 106 vectors, 11913 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.339000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.014 +/- 0.01
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.014
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2403121211282908770.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2403121211282908770.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2403121211282908770.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2403121211282908770.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2403121211282908770.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2403121211282908770.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1093.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1109.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Projmod> 106 vectors, 11913 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 261
First residue number = 1
Last residue number = 42
Number of atoms found = 3971
Mean number per residue = 15.2
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 261
First residue number = 1
Last residue number = 42
Number of atoms found = 3971
Mean number per residue = 15.2
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 3971 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 33.01
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.033 Sum= 0.001 q= 69.5783
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.214 Sum= 0.047 q= 445.2273
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.141 Sum= 0.067 q= 292.3660
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.246 Sum= 0.127 q= -511.6547
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.208 Sum= 0.171 q= 433.5366
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.025 Sum= 0.171 q= 51.2488
Vector: 7 F= 125.65 Cos= 0.125 Sum= 0.187 q= 259.1130
Vector: 8 F= 168.99 Cos= -0.141 Sum= 0.207 q= -294.1440
Vector: 9 F= 184.05 Cos= -0.081 Sum= 0.213 q= -168.6093
Vector: 10 F= 218.34 Cos= -0.004 Sum= 0.213 q= -8.0198
Vector: 11 F= 238.74 Cos= 0.100 Sum= 0.223 q= 207.7385
Vector: 12 F= 257.51 Cos= 0.126 Sum= 0.239 q= 261.2475
Vector: 13 F= 290.38 Cos= -0.047 Sum= 0.241 q= -96.9435
Vector: 14 F= 327.28 Cos= -0.126 Sum= 0.257 q= -263.0012
Vector: 15 F= 343.09 Cos= 0.134 Sum= 0.275 q= 278.6284
%Projmod-Wn> Eigenvector 16 Norm= 0.9999
Vector: 16 F= 353.20 Cos= 0.017 Sum= 0.275 q= 35.9855
Vector: 17 F= 384.22 Cos= 0.008 Sum= 0.276 q= 16.6226
Vector: 18 F= 408.61 Cos= 0.186 Sum= 0.310 q= 387.2190
Vector: 19 F= 424.46 Cos= 0.107 Sum= 0.322 q= 223.5589
Vector: 20 F= 441.21 Cos= 0.351 Sum= 0.445 q= 730.1191
Vector: 21 F= 454.90 Cos= 0.237 Sum= 0.501 q= 493.9978
Vector: 22 F= 465.53 Cos= 0.082 Sum= 0.508 q= 169.5998
Vector: 23 F= 486.10 Cos= 0.074 Sum= 0.513 q= 153.5265
Vector: 24 F= 497.25 Cos= -0.154 Sum= 0.537 q= -319.7484
Vector: 25 F= 511.05 Cos= -0.218 Sum= 0.584 q= -452.7493
Vector: 26 F= 520.65 Cos= -0.125 Sum= 0.600 q= -259.6503
Vector: 27 F= 540.98 Cos= -0.057 Sum= 0.603 q= -119.1866
Vector: 28 F= 546.51 Cos= 0.139 Sum= 0.622 q= 288.7531
Vector: 29 F= 568.09 Cos= -0.097 Sum= 0.632 q= -201.4253
Vector: 30 F= 576.64 Cos= 0.064 Sum= 0.636 q= 133.6695
Vector: 31 F= 598.41 Cos= -0.127 Sum= 0.652 q= -263.6421
Vector: 32 F= 614.26 Cos= 0.058 Sum= 0.655 q= 121.1070
Vector: 33 F= 627.36 Cos= -0.115 Sum= 0.669 q= -239.7860
Vector: 34 F= 634.28 Cos= -0.049 Sum= 0.671 q= -101.6394
Vector: 35 F= 638.45 Cos= -0.036 Sum= 0.672 q= -74.9561
Vector: 36 F= 647.34 Cos= 0.138 Sum= 0.691 q= 286.9173
Vector: 37 F= 666.20 Cos= -0.073 Sum= 0.697 q= -151.6523
Vector: 38 F= 678.73 Cos= -0.053 Sum= 0.700 q= -109.4297
Vector: 39 F= 690.87 Cos= -0.012 Sum= 0.700 q= -24.7800
Vector: 40 F= 698.85 Cos= 0.009 Sum= 0.700 q= 19.0708
Vector: 41 F= 707.65 Cos= -0.061 Sum= 0.703 q= -126.8733
Vector: 42 F= 716.59 Cos= 0.015 Sum= 0.704 q= 31.9662
Vector: 43 F= 743.48 Cos= 0.123 Sum= 0.719 q= 255.6290
Vector: 44 F= 751.53 Cos= -0.054 Sum= 0.722 q= -112.8619
Vector: 45 F= 769.20 Cos= 0.037 Sum= 0.723 q= 76.7449
Vector: 46 F= 776.68 Cos= 0.072 Sum= 0.728 q= 150.7669
Vector: 47 F= 783.86 Cos= -0.068 Sum= 0.733 q= -142.1851
Vector: 48 F= 792.53 Cos= -0.108 Sum= 0.745 q= -224.0929
Vector: 49 F= 797.58 Cos= -0.045 Sum= 0.747 q= -94.1776
Vector: 50 F= 805.45 Cos= -0.000 Sum= 0.747 q= -0.8891
Vector: 51 F= 815.77 Cos= -0.022 Sum= 0.747 q= -46.7572
Vector: 52 F= 828.61 Cos= 0.035 Sum= 0.748 q= 73.6986
Vector: 53 F= 833.79 Cos= 0.021 Sum= 0.749 q= 44.2109
Vector: 54 F= 840.76 Cos= -0.025 Sum= 0.750 q= -51.0451
Vector: 55 F= 842.72 Cos= 0.016 Sum= 0.750 q= 32.4468
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Vector: 57 F= 854.53 Cos= -0.071 Sum= 0.758 q= -148.4027
Vector: 58 F= 874.65 Cos= 0.122 Sum= 0.773 q= 254.0758
Vector: 59 F= 881.36 Cos= 0.026 Sum= 0.774 q= 53.6257
Vector: 60 F= 890.87 Cos= 0.052 Sum= 0.777 q= 108.8164
Vector: 61 F= 897.40 Cos= -0.023 Sum= 0.777 q= -48.3984
Vector: 62 F= 913.23 Cos= 0.051 Sum= 0.780 q= 105.5097
Vector: 63 F= 922.03 Cos= 0.068 Sum= 0.784 q= 141.4072
Vector: 64 F= 925.92 Cos= -0.034 Sum= 0.785 q= -71.6533
Vector: 65 F= 930.56 Cos= 0.042 Sum= 0.787 q= 87.2879
Vector: 66 F= 936.81 Cos= 0.007 Sum= 0.787 q= 14.3676
Vector: 67 F= 944.64 Cos= -0.020 Sum= 0.788 q= -40.9759
Vector: 68 F= 951.05 Cos= -0.010 Sum= 0.788 q= -21.6543
Vector: 69 F= 959.38 Cos= -0.070 Sum= 0.793 q= -146.4438
Vector: 70 F= 963.86 Cos= -0.042 Sum= 0.794 q= -86.4678
Vector: 71 F= 989.93 Cos= -0.031 Sum= 0.795 q= -64.6355
Vector: 72 F= 991.42 Cos= 0.055 Sum= 0.798 q= 114.6107
Vector: 73 F= 994.98 Cos= 0.015 Sum= 0.799 q= 30.6947
Vector: 74 F= 1004.65 Cos= 0.053 Sum= 0.801 q= 110.5857
Vector: 75 F= 1009.91 Cos= -0.035 Sum= 0.803 q= -73.0982
Vector: 76 F= 1019.73 Cos= -0.022 Sum= 0.803 q= -45.1640
Vector: 77 F= 1027.11 Cos= -0.070 Sum= 0.808 q= -145.2214
Vector: 78 F= 1033.51 Cos= 0.024 Sum= 0.809 q= 50.4763
Vector: 79 F= 1043.68 Cos= 0.023 Sum= 0.809 q= 48.7379
Vector: 80 F= 1048.75 Cos= 0.033 Sum= 0.810 q= 68.3645
Vector: 81 F= 1055.30 Cos= 0.125 Sum= 0.826 q= 260.0193
Vector: 82 F= 1060.93 Cos= -0.031 Sum= 0.827 q= -64.9992
Vector: 83 F= 1068.24 Cos= 0.028 Sum= 0.828 q= 58.3023
Vector: 84 F= 1073.91 Cos= -0.027 Sum= 0.828 q= -55.5997
Vector: 85 F= 1080.48 Cos= -0.021 Sum= 0.829 q= -43.2675
Vector: 86 F= 1088.04 Cos= 0.022 Sum= 0.829 q= 45.2908
Vector: 87 F= 1093.44 Cos= 0.008 Sum= 0.829 q= 15.8018
Vector: 88 F= 1107.37 Cos= 0.044 Sum= 0.831 q= 92.3710
Vector: 89 F= 1109.50 Cos= -0.001 Sum= 0.831 q= -2.8058
Vector: 90 F= 1116.39 Cos= 0.024 Sum= 0.832 q= 49.3945
Vector: 91 F= 1121.65 Cos= -0.011 Sum= 0.832 q= -23.5393
Vector: 92 F= 1126.37 Cos= 0.068 Sum= 0.837 q= 142.4002
Vector: 93 F= 1135.24 Cos= 0.040 Sum= 0.838 q= 82.3789
Vector: 94 F= 1137.83 Cos= 0.002 Sum= 0.838 q= 4.0157
Vector: 95 F= 1146.61 Cos= 0.121 Sum= 0.853 q= 250.8493
Vector: 96 F= 1150.20 Cos= -0.005 Sum= 0.853 q= -10.9909
Vector: 97 F= 1152.25 Cos= -0.008 Sum= 0.853 q= -16.1928
Vector: 98 F= 1159.90 Cos= -0.000 Sum= 0.853 q= -0.2163
Vector: 99 F= 1166.49 Cos= -0.015 Sum= 0.853 q= -31.9956
Vector: 100 F= 1171.03 Cos= -0.038 Sum= 0.855 q= -79.7346
Vector: 101 F= 1173.54 Cos= -0.023 Sum= 0.855 q= -48.3509
Vector: 102 F= 1180.55 Cos= -0.017 Sum= 0.855 q= -36.3871
Vector: 103 F= 1186.03 Cos= 0.010 Sum= 0.856 q= 21.3288
Vector: 104 F= 1194.95 Cos= -0.022 Sum= 0.856 q= -45.1370
Vector: 105 F= 1197.41 Cos= 0.038 Sum= 0.857 q= 78.3463
Vector: 106 F= 1204.28 Cos= 0.051 Sum= 0.860 q= 106.9559
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003436
Projmod> Lowest non-zero frequency : 125.651282
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.35 for mode 20 with F= 441.21 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.123 0.240 0.377 0.455 0.513 0.860
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2403121211282908770 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
making animated gifs
11 models are in 2403121211282908770.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 219 9.457 33 1.822
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 219 9.357 33 1.851
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 219 9.267 33 1.888
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 219 9.185 29 1.903
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 219 9.112 29 1.907
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 219 9.050 34 1.883
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 219 8.997 34 1.870
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 219 8.954 30 1.895
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 219 8.921 33 1.987
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 219 8.899 34 1.974
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 219 8.887 27 2.066
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2403121211282908770 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
making animated gifs
11 models are in 2403121211282908770.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 219 9.912 34 1.861
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 219 9.728 34 1.865
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 219 9.549 34 1.874
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 219 9.376 34 1.888
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 219 9.210 34 1.933
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 219 9.050 34 1.883
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 219 8.897 33 1.891
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 219 8.751 31 1.891
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 219 8.613 31 1.896
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 219 8.482 32 1.952
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 219 8.361 33 2.015
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2403121211282908770 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
making animated gifs
11 models are in 2403121211282908770.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 219 9.041 34 1.707
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 219 9.024 30 2.049
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 219 9.016 29 2.075
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 219 9.018 29 2.055
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 219 9.029 29 1.949
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 219 9.050 34 1.883
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 219 9.080 35 1.903
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 219 9.119 34 1.860
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 219 9.168 35 1.950
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 219 9.225 31 1.922
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 219 9.292 31 1.941
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2403121211282908770 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
making animated gifs
11 models are in 2403121211282908770.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 219 9.342 24 2.097
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 219 9.266 24 2.050
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 219 9.199 25 2.055
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 219 9.140 28 2.033
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 219 9.090 29 1.952
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 219 9.050 34 1.883
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 219 9.018 34 1.901
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 219 8.996 36 1.922
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 219 8.983 35 1.877
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 219 8.979 37 1.848
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 219 8.985 36 1.844
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2403121211282908770 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2403121211282908770.eigenfacs
2403121211282908770.atom
making animated gifs
11 models are in 2403121211282908770.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2403121211282908770.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 219 9.414 33 1.819
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 219 9.326 33 1.822
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 219 9.246 29 1.961
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 219 9.173 30 1.939
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 219 9.107 34 1.943
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 219 9.050 34 1.883
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 219 9.000 34 1.848
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 219 8.959 32 2.070
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 219 8.925 34 1.776
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 219 8.900 33 1.835
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 219 8.883 38 1.873
2403121211282908770.10.pdb
2403121211282908770.11.pdb
2403121211282908770.7.pdb
2403121211282908770.8.pdb
2403121211282908770.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.579s
user 0m13.487s
sys 0m0.092s
../../bin/check_modes: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
mv: cannot stat 'Chkmod.res': No such file or directory
cat: 2403121211282908770.Chkmod.res: No such file or directory
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elNémo
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Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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