*** METAL BINDING PROTEIN 30-OCT-99 1D9Y ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 23012322232774474.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 23012322232774474.atom to be opened.
Openam> File opened: 23012322232774474.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 309
First residue number = 1
Last residue number = 309
Number of atoms found = 2415
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 10.681361 +/- 8.745440 From: -12.244000 To: 37.259000
= 22.235922 +/- 14.106922 From: -7.497000 To: 51.343000
= 53.506735 +/- 9.698551 From: 27.220000 To: 74.750000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.5483 % Filled.
Pdbmat> 931372 non-zero elements.
Pdbmat> 101890 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.38 +/- 23.14
Maximum number = 134
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 2.037800E+06
Pdbmat> Larger element = 513.225
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
309 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 23012322232774474.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 23012322232774474.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
23012322232774474.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2415 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 309 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 13 atoms in block 4
Block first atom: 51
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 64
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 83
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 97
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 111
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 123
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 136
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 152
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 182
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 194
Blocpdb> 17 atoms in block 15
Block first atom: 210
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 227
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 241
Blocpdb> 12 atoms in block 18
Block first atom: 255
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 267
Blocpdb> 9 atoms in block 20
Block first atom: 284
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 293
Blocpdb> 18 atoms in block 22
Block first atom: 310
Blocpdb> 13 atoms in block 23
Block first atom: 328
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 341
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 358
Blocpdb> 13 atoms in block 26
Block first atom: 371
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 384
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 402
Blocpdb> 18 atoms in block 29
Block first atom: 428
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 446
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 461
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 474
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 486
Blocpdb> 10 atoms in block 34
Block first atom: 500
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 510
Blocpdb> 17 atoms in block 36
Block first atom: 526
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 543
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 558
Blocpdb> 13 atoms in block 39
Block first atom: 570
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 583
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 599
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 615
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 630
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 643
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 657
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 669
Blocpdb> 17 atoms in block 47
Block first atom: 683
Blocpdb> 21 atoms in block 48
Block first atom: 700
Blocpdb> 13 atoms in block 49
Block first atom: 721
Blocpdb> 10 atoms in block 50
Block first atom: 734
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 744
Blocpdb> 18 atoms in block 52
Block first atom: 761
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 779
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 793
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 813
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 831
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 853
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 868
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 885
Blocpdb> 15 atoms in block 60
Block first atom: 902
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 917
Blocpdb> 20 atoms in block 62
Block first atom: 932
Blocpdb> 12 atoms in block 63
Block first atom: 952
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 964
Blocpdb> 23 atoms in block 65
Block first atom: 980
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 1003
Blocpdb> 12 atoms in block 67
Block first atom: 1022
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1034
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1053
Blocpdb> 10 atoms in block 70
Block first atom: 1067
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1077
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1093
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1110
Blocpdb> 12 atoms in block 74
Block first atom: 1127
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1139
Blocpdb> 17 atoms in block 76
Block first atom: 1154
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1171
Blocpdb> 14 atoms in block 78
Block first atom: 1184
Blocpdb> 10 atoms in block 79
Block first atom: 1198
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1208
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1225
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1247
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1260
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 1277
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1298
Blocpdb> 19 atoms in block 86
Block first atom: 1311
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1330
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1344
Blocpdb> 12 atoms in block 89
Block first atom: 1358
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1370
Blocpdb> 12 atoms in block 91
Block first atom: 1387
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1399
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1416
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1429
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 1445
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1455
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1471
Blocpdb> 24 atoms in block 98
Block first atom: 1487
Blocpdb> 24 atoms in block 99
Block first atom: 1511
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1535
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1551
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1567
Blocpdb> 11 atoms in block 103
Block first atom: 1585
Blocpdb> 17 atoms in block 104
Block first atom: 1596
Blocpdb> 20 atoms in block 105
Block first atom: 1613
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 1633
Blocpdb> 16 atoms in block 107
Block first atom: 1651
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1667
Blocpdb> 21 atoms in block 109
Block first atom: 1685
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 1706
Blocpdb> 11 atoms in block 111
Block first atom: 1725
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1736
Blocpdb> 14 atoms in block 113
Block first atom: 1749
Blocpdb> 18 atoms in block 114
Block first atom: 1763
Blocpdb> 9 atoms in block 115
Block first atom: 1781
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1790
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1802
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1819
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1831
Blocpdb> 17 atoms in block 120
Block first atom: 1848
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1865
Blocpdb> 18 atoms in block 122
Block first atom: 1879
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 1897
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1915
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1931
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1944
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 1962
Blocpdb> 27 atoms in block 128
Block first atom: 1975
Blocpdb> 13 atoms in block 129
Block first atom: 2002
Blocpdb> 12 atoms in block 130
Block first atom: 2015
Blocpdb> 18 atoms in block 131
Block first atom: 2027
Blocpdb> 14 atoms in block 132
Block first atom: 2045
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2059
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2078
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 2094
Blocpdb> 17 atoms in block 136
Block first atom: 2117
Blocpdb> 13 atoms in block 137
Block first atom: 2134
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2147
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2166
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2183
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2198
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2212
Blocpdb> 12 atoms in block 143
Block first atom: 2229
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2241
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 2257
Blocpdb> 14 atoms in block 146
Block first atom: 2268
Blocpdb> 13 atoms in block 147
Block first atom: 2282
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 2295
Blocpdb> 19 atoms in block 149
Block first atom: 2313
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 2332
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 2344
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2363
Blocpdb> 14 atoms in block 153
Block first atom: 2380
Blocpdb> 12 atoms in block 154
Block first atom: 2394
Blocpdb> 10 atoms in block 155
Block first atom: 2405
Blocpdb> 155 blocks.
Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 931527 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7245
Prepmat> Matrix trace = 2037800.0000
Prepmat> Last element read: 7245 7245 80.6044
Prepmat> 12091 lines saved.
Prepmat> 10310 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2415
RTB> Total mass = 2415.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2415
RTB> Number of blocks = 155
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 223826.8946
RTB> 61755 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 930
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61755
Diagstd> Projected matrix trace = 223826.8946
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 930 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 223826.8946
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.6667818 3.1356349 4.8793110 7.6274399
9.8107046 10.3256377 11.4887070 12.8190471 14.5289689
15.9235953 16.1861001 18.3408549 19.1009605 19.4451883
20.4160919 22.8680872 23.1002985 23.3525257 25.2702094
25.9039820 26.9461024 27.7273570 28.7819567 29.0578667
30.9336795 31.4768410 32.1607263 33.2994958 34.2502755
34.5833669 35.4313518 37.0916826 37.1909083 38.0942476
38.7930334 39.5258690 40.0977247 40.4623664 41.5724867
43.2944510 43.4461316 44.3673955 44.5255903 45.6247507
46.4302803 47.6026362 48.6628912 49.0742761 49.4184102
49.6061857 50.4302675 51.2242970 52.3492822 53.3758246
53.8574221 54.3673756 54.8956642 55.6662657 56.6991190
57.1094082 57.9796576 58.1246411 58.3720277 59.2025676
60.0842484 62.0526633 62.2084348 62.6799782 63.4961598
64.2198468 64.6939417 64.9025277 65.7656843 66.2301837
67.2961235 67.9426227 68.7730178 69.3912457 69.6838602
71.0229075 72.1503828 73.2977060 73.6090393 73.8902876
74.1646633 75.0529068 75.3773410 76.5007524 77.0079419
77.1240935 77.7998288 78.7541885 79.5343495 80.3884156
80.8461170 81.4308122 82.1718526 82.2666076 83.4419395
83.8173237
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034328 0.0034334 0.0034339 0.0034340 0.0034351
0.0034354 177.3327811 192.2905874 239.8692229 299.9056715
340.1303452 348.9423825 368.0703702 388.7972202 413.9164409
433.3270961 436.8842525 465.0558032 474.5946989 478.8520561
490.6610529 519.2902875 521.9201643 524.7617956 545.8831650
552.6861040 563.6938000 571.8070652 582.5798209 585.3655282
603.9640253 609.2434240 615.8262599 626.6342217 635.5172085
638.6000036 646.3818319 661.3533348 662.2373522 670.2317242
676.3510215 682.7095747 687.6305210 690.7500414 700.1615897
714.5150796 715.7656241 723.3146271 724.6029921 733.4922548
739.9390249 749.2224505 757.5202277 760.7154407 763.3780451
764.8269764 771.1536457 777.2008804 785.6889512 793.3550293
796.9261194 800.6901115 804.5708661 810.1982939 817.6801136
820.6332515 826.8621331 827.8953099 829.6552587 835.5367401
841.7354090 855.4123050 856.4853080 859.7252826 865.3045957
870.2217080 873.4279523 874.8348716 880.6329920 883.7374514
890.8207082 895.0894410 900.5427232 904.5813347 906.4865835
915.1546775 922.3900298 929.6949494 931.6673052 933.4454838
935.1769526 940.7604230 942.7915619 949.7911824 952.9344742
953.6528620 957.8215434 963.6783690 968.4398392 973.6256678
976.3934632 979.9178380 984.3664870 984.9338753 991.9447319
994.1734824
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2415
Rtb_to_modes> Number of blocs = 155
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.136
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.879
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.66
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.82
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 930 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003
1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99997
1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998
1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 43470 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003
1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99997
1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998
1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23012322232774474.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23012322232774474.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 23012322232774474.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23012322232774474.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 309
First residue number = 1
Last residue number = 309
Number of atoms found = 2415
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.136
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.879
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.82
Bfactors> 106 vectors, 7245 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.667000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.378 for 309 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.020 +/- 0.01
Bfactors> = 22.906 +/- 7.33
Bfactors> Shiftng-fct= 22.887
Bfactors> Scaling-fct= 503.423
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23012322232774474.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23012322232774474.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.1
Chkmod> 106 vectors, 7245 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2415 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7839
0.0034 0.9845
0.0034 0.7483
0.0034 0.9869
0.0034 0.8821
0.0034 0.7570
177.3324 0.6826
192.2935 0.6873
239.8513 0.6645
299.8841 0.3801
340.1209 0.6802
349.0011 0.6884
368.0753 0.3125
388.7950 0.5088
413.9134 0.3233
433.2596 0.3214
436.9181 0.5213
465.0250 0.4244
474.5624 0.5671
478.8907 0.4098
490.6869 0.3823
519.2897 0.2915
521.8944 0.4447
524.7109 0.4195
545.8575 0.4385
552.6199 0.4787
563.7104 0.4458
571.8098 0.4187
582.5350 0.5845
585.3619 0.3994
603.9022 0.4853
609.2478 0.3991
615.7929 0.5295
626.6121 0.4683
635.4874 0.3703
638.5415 0.3797
646.3418 0.5654
661.3099 0.5287
662.2008 0.4180
670.1656 0.3469
676.2955 0.6494
682.7159 0.5649
687.6205 0.3461
690.7002 0.4912
700.1106 0.3725
714.4477 0.4608
715.7668 0.3882
723.3048 0.5818
724.6078 0.1387
733.4226 0.4460
739.9050 0.4866
749.1695 0.4529
757.4652 0.4496
760.6496 0.4142
763.3576 0.3797
764.8235 0.3780
771.1185 0.4786
777.1349 0.5040
785.6606 0.5053
793.3520 0.4530
796.9110 0.4679
800.6751 0.4525
804.5681 0.3554
810.1907 0.4495
817.6514 0.3939
820.6023 0.4060
826.8291 0.3177
827.8267 0.3033
829.6052 0.4395
835.4828 0.3189
841.6695 0.4551
855.3572 0.4784
856.4593 0.4208
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getting mode 7
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23012322232774474.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23012322232774474.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 23012322232774474.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 23012322232774474 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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