*** aforphan ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 23011918305391529.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 23011918305391529.atom to be opened.
Openam> File opened: 23011918305391529.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 460
First residue number = 49
Last residue number = 508
Number of atoms found = 7358
Mean number per residue = 16.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -5.261456 +/- 14.678307 From: -40.556000 To: 30.626000
= 3.199458 +/- 11.774530 From: -26.700000 To: 34.481000
= -1.848907 +/- 15.378629 From: -35.482000 To: 36.051000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2502 % Filled.
Pdbmat> 5482530 non-zero elements.
Pdbmat> 604353 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 164.27 +/- 49.39
Maximum number = 250
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.208706E+07
Pdbmat> Larger element = 896.993
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
460 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 23011918305391529.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 23011918305391529.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
23011918305391529.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7358 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 460 residues.
Blocpdb> 55 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 65 atoms in block 2
Block first atom: 56
Blocpdb> 44 atoms in block 3
Block first atom: 121
Blocpdb> 42 atoms in block 4
Block first atom: 165
Blocpdb> 50 atoms in block 5
Block first atom: 207
Blocpdb> 55 atoms in block 6
Block first atom: 257
Blocpdb> 38 atoms in block 7
Block first atom: 312
Blocpdb> 47 atoms in block 8
Block first atom: 350
Blocpdb> 50 atoms in block 9
Block first atom: 397
Blocpdb> 55 atoms in block 10
Block first atom: 447
Blocpdb> 54 atoms in block 11
Block first atom: 502
Blocpdb> 40 atoms in block 12
Block first atom: 556
Blocpdb> 43 atoms in block 13
Block first atom: 596
Blocpdb> 44 atoms in block 14
Block first atom: 639
Blocpdb> 49 atoms in block 15
Block first atom: 683
Blocpdb> 40 atoms in block 16
Block first atom: 732
Blocpdb> 39 atoms in block 17
Block first atom: 772
Blocpdb> 55 atoms in block 18
Block first atom: 811
Blocpdb> 41 atoms in block 19
Block first atom: 866
Blocpdb> 60 atoms in block 20
Block first atom: 907
Blocpdb> 53 atoms in block 21
Block first atom: 967
Blocpdb> 58 atoms in block 22
Block first atom: 1020
Blocpdb> 46 atoms in block 23
Block first atom: 1078
Blocpdb> 49 atoms in block 24
Block first atom: 1124
Blocpdb> 36 atoms in block 25
Block first atom: 1173
Blocpdb> 43 atoms in block 26
Block first atom: 1209
Blocpdb> 43 atoms in block 27
Block first atom: 1252
Blocpdb> 44 atoms in block 28
Block first atom: 1295
Blocpdb> 55 atoms in block 29
Block first atom: 1339
Blocpdb> 47 atoms in block 30
Block first atom: 1394
Blocpdb> 37 atoms in block 31
Block first atom: 1441
Blocpdb> 55 atoms in block 32
Block first atom: 1478
Blocpdb> 54 atoms in block 33
Block first atom: 1533
Blocpdb> 47 atoms in block 34
Block first atom: 1587
Blocpdb> 55 atoms in block 35
Block first atom: 1634
Blocpdb> 46 atoms in block 36
Block first atom: 1689
Blocpdb> 45 atoms in block 37
Block first atom: 1735
Blocpdb> 47 atoms in block 38
Block first atom: 1780
Blocpdb> 49 atoms in block 39
Block first atom: 1827
Blocpdb> 45 atoms in block 40
Block first atom: 1876
Blocpdb> 46 atoms in block 41
Block first atom: 1921
Blocpdb> 39 atoms in block 42
Block first atom: 1967
Blocpdb> 50 atoms in block 43
Block first atom: 2006
Blocpdb> 62 atoms in block 44
Block first atom: 2056
Blocpdb> 46 atoms in block 45
Block first atom: 2118
Blocpdb> 43 atoms in block 46
Block first atom: 2164
Blocpdb> 54 atoms in block 47
Block first atom: 2207
Blocpdb> 42 atoms in block 48
Block first atom: 2261
Blocpdb> 46 atoms in block 49
Block first atom: 2303
Blocpdb> 46 atoms in block 50
Block first atom: 2349
Blocpdb> 50 atoms in block 51
Block first atom: 2395
Blocpdb> 53 atoms in block 52
Block first atom: 2445
Blocpdb> 40 atoms in block 53
Block first atom: 2498
Blocpdb> 58 atoms in block 54
Block first atom: 2538
Blocpdb> 32 atoms in block 55
Block first atom: 2596
Blocpdb> 48 atoms in block 56
Block first atom: 2628
Blocpdb> 47 atoms in block 57
Block first atom: 2676
Blocpdb> 42 atoms in block 58
Block first atom: 2723
Blocpdb> 48 atoms in block 59
Block first atom: 2765
Blocpdb> 52 atoms in block 60
Block first atom: 2813
Blocpdb> 42 atoms in block 61
Block first atom: 2865
Blocpdb> 66 atoms in block 62
Block first atom: 2907
Blocpdb> 47 atoms in block 63
Block first atom: 2973
Blocpdb> 57 atoms in block 64
Block first atom: 3020
Blocpdb> 54 atoms in block 65
Block first atom: 3077
Blocpdb> 59 atoms in block 66
Block first atom: 3131
Blocpdb> 58 atoms in block 67
Block first atom: 3190
Blocpdb> 32 atoms in block 68
Block first atom: 3248
Blocpdb> 41 atoms in block 69
Block first atom: 3280
Blocpdb> 43 atoms in block 70
Block first atom: 3321
Blocpdb> 44 atoms in block 71
Block first atom: 3364
Blocpdb> 45 atoms in block 72
Block first atom: 3408
Blocpdb> 60 atoms in block 73
Block first atom: 3453
Blocpdb> 43 atoms in block 74
Block first atom: 3513
Blocpdb> 48 atoms in block 75
Block first atom: 3556
Blocpdb> 52 atoms in block 76
Block first atom: 3604
Blocpdb> 43 atoms in block 77
Block first atom: 3656
Blocpdb> 62 atoms in block 78
Block first atom: 3699
Blocpdb> 49 atoms in block 79
Block first atom: 3761
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3810
Blocpdb> 49 atoms in block 81
Block first atom: 3852
Blocpdb> 50 atoms in block 82
Block first atom: 3901
Blocpdb> 50 atoms in block 83
Block first atom: 3951
Blocpdb> 51 atoms in block 84
Block first atom: 4001
Blocpdb> 44 atoms in block 85
Block first atom: 4052
Blocpdb> 44 atoms in block 86
Block first atom: 4096
Blocpdb> 47 atoms in block 87
Block first atom: 4140
Blocpdb> 38 atoms in block 88
Block first atom: 4187
Blocpdb> 46 atoms in block 89
Block first atom: 4225
Blocpdb> 54 atoms in block 90
Block first atom: 4271
Blocpdb> 42 atoms in block 91
Block first atom: 4325
Blocpdb> 53 atoms in block 92
Block first atom: 4367
Blocpdb> 50 atoms in block 93
Block first atom: 4420
Blocpdb> 41 atoms in block 94
Block first atom: 4470
Blocpdb> 43 atoms in block 95
Block first atom: 4511
Blocpdb> 55 atoms in block 96
Block first atom: 4554
Blocpdb> 46 atoms in block 97
Block first atom: 4609
Blocpdb> 42 atoms in block 98
Block first atom: 4655
Blocpdb> 50 atoms in block 99
Block first atom: 4697
Blocpdb> 48 atoms in block 100
Block first atom: 4747
Blocpdb> 45 atoms in block 101
Block first atom: 4795
Blocpdb> 52 atoms in block 102
Block first atom: 4840
Blocpdb> 60 atoms in block 103
Block first atom: 4892
Blocpdb> 67 atoms in block 104
Block first atom: 4952
Blocpdb> 45 atoms in block 105
Block first atom: 5019
Blocpdb> 41 atoms in block 106
Block first atom: 5064
Blocpdb> 45 atoms in block 107
Block first atom: 5105
Blocpdb> 46 atoms in block 108
Block first atom: 5150
Blocpdb> 57 atoms in block 109
Block first atom: 5196
Blocpdb> 53 atoms in block 110
Block first atom: 5253
Blocpdb> 39 atoms in block 111
Block first atom: 5306
Blocpdb> 50 atoms in block 112
Block first atom: 5345
Blocpdb> 55 atoms in block 113
Block first atom: 5395
Blocpdb> 38 atoms in block 114
Block first atom: 5450
Blocpdb> 52 atoms in block 115
Block first atom: 5488
Blocpdb> 51 atoms in block 116
Block first atom: 5540
Blocpdb> 41 atoms in block 117
Block first atom: 5591
Blocpdb> 60 atoms in block 118
Block first atom: 5632
Blocpdb> 39 atoms in block 119
Block first atom: 5692
Blocpdb> 55 atoms in block 120
Block first atom: 5731
Blocpdb> 42 atoms in block 121
Block first atom: 5786
Blocpdb> 44 atoms in block 122
Block first atom: 5828
Blocpdb> 46 atoms in block 123
Block first atom: 5872
Blocpdb> 36 atoms in block 124
Block first atom: 5918
Blocpdb> 49 atoms in block 125
Block first atom: 5954
Blocpdb> 53 atoms in block 126
Block first atom: 6003
Blocpdb> 54 atoms in block 127
Block first atom: 6056
Blocpdb> 37 atoms in block 128
Block first atom: 6110
Blocpdb> 50 atoms in block 129
Block first atom: 6147
Blocpdb> 50 atoms in block 130
Block first atom: 6197
Blocpdb> 39 atoms in block 131
Block first atom: 6247
Blocpdb> 56 atoms in block 132
Block first atom: 6286
Blocpdb> 54 atoms in block 133
Block first atom: 6342
Blocpdb> 38 atoms in block 134
Block first atom: 6396
Blocpdb> 42 atoms in block 135
Block first atom: 6434
Blocpdb> 40 atoms in block 136
Block first atom: 6476
Blocpdb> 59 atoms in block 137
Block first atom: 6516
Blocpdb> 50 atoms in block 138
Block first atom: 6575
Blocpdb> 51 atoms in block 139
Block first atom: 6625
Blocpdb> 48 atoms in block 140
Block first atom: 6676
Blocpdb> 50 atoms in block 141
Block first atom: 6724
Blocpdb> 51 atoms in block 142
Block first atom: 6774
Blocpdb> 49 atoms in block 143
Block first atom: 6825
Blocpdb> 56 atoms in block 144
Block first atom: 6874
Blocpdb> 46 atoms in block 145
Block first atom: 6930
Blocpdb> 51 atoms in block 146
Block first atom: 6976
Blocpdb> 43 atoms in block 147
Block first atom: 7027
Blocpdb> 47 atoms in block 148
Block first atom: 7070
Blocpdb> 34 atoms in block 149
Block first atom: 7117
Blocpdb> 41 atoms in block 150
Block first atom: 7151
Blocpdb> 39 atoms in block 151
Block first atom: 7192
Blocpdb> 51 atoms in block 152
Block first atom: 7231
Blocpdb> 53 atoms in block 153
Block first atom: 7282
Blocpdb> 24 atoms in block 154
Block first atom: 7334
Blocpdb> 154 blocks.
Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5482684 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 22074
Prepmat> Matrix trace = 12087060.0000
Prepmat> Last element read: 22074 22074 157.2697
Prepmat> 11936 lines saved.
Prepmat> 10142 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7358
RTB> Total mass = 7358.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7358
RTB> Number of blocks = 154
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 397794.6242
RTB> 62238 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 924
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62238
Diagstd> Projected matrix trace = 397794.6242
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 924 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 397794.6242
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.3056763 2.4244295 5.3159107 8.4760860
10.1712156 10.8287593 13.6810189 15.1447914 17.3878973
19.3740791 21.2320230 22.2479174 24.4660654 25.1480205
26.4238699 28.6633361 28.9637056 29.4524502 32.8500250
33.2806931 34.5994649 35.1092924 37.8689852 39.0421232
40.1548877 42.1241480 43.8358212 44.9521361 46.6796403
48.4072972 48.6641993 50.1644693 52.4687894 54.5061069
55.4490950 57.2658340 59.2052588 60.4762095 61.7548148
63.0323910 63.9619236 65.4307698 67.1592377 69.1690909
70.2089255 72.0555443 73.0468326 74.3077146 75.7413304
77.2031589 78.8822921 79.5614327 81.1144553 81.8335709
83.7372972 84.5695425 84.9220925 86.7047819 88.9375423
90.1894716 91.0768208 91.8582370 93.0027398 94.4827989
96.4209766 97.0316887 97.7971260 98.8206367 99.2944843
101.8935029 103.0917430 103.7275045 104.4513308 106.5368090
107.8052217 108.3118591 111.2143856 112.7674348 113.8218095
114.8427330 115.3223706 116.4768737 118.2386252 119.8012988
120.7688352 121.1412082 123.8585270 124.7580905 125.3762565
126.2201061 128.5270327 129.4392894 130.4061435 130.8031759
132.5402164 133.2426582 135.1436700 135.7930370 136.8240464
137.6915941
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034286 0.0034315 0.0034326 0.0034341 0.0034353
0.0034374 124.0832153 169.0830459 250.3710534 316.1498335
346.3232998 357.3424656 401.6562243 422.5975041 452.8129235
477.9756968 500.3696598 512.2004569 537.1274486 544.5618120
558.2047030 581.3780733 584.4163301 589.3265337 622.3907544
626.4572809 638.7486145 643.4374266 668.2471480 678.5189698
688.1204873 704.7918042 718.9684847 728.0654918 741.9233347
755.5282323 757.5304097 769.1187365 786.5852568 801.7110364
808.6163367 821.7563623 835.5557310 844.4764865 853.3568756
862.1387606 868.4724346 878.3878002 889.9142460 903.1321735
909.8953458 921.7836103 928.1025689 936.0784182 945.0651424
954.1415654 964.4618221 968.6047129 978.0125061 982.3381972
993.6987642 998.6246246 1000.7039721 1011.1528383 1024.0893324
1031.2719409 1036.3327231 1040.7689649 1047.2325963 1055.5326108
1066.3040120 1069.6755650 1073.8863606 1079.4911946 1082.0761943
1096.1463110 1102.5726658 1105.9671948 1109.8192898 1120.8438742
1127.4964385 1130.1427032 1145.1852975 1153.1535253 1158.5319710
1163.7160922 1166.1436746 1171.9663251 1180.7962521 1188.5735009
1193.3634139 1195.2017784 1208.5322262 1212.9129689 1215.9141977
1219.9992133 1231.0977023 1235.4590083 1240.0645893 1241.9508946
1250.1701293 1253.4786018 1262.3888052 1265.4180673 1270.2128306
1274.2334285
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7358
Rtb_to_modes> Number of blocs = 154
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9687E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.476
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.25
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.15
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.04
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.15
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.45
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.83
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 924 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
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1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00005 1.00002
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998
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0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
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0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 132444 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
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1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998
0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011918305391529.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011918305391529.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 23011918305391529.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23011918305391529.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 460
First residue number = 49
Last residue number = 508
Number of atoms found = 7358
Mean number per residue = 16.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9687E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0020E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.424
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.316
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.476
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.7
Bfactors> 106 vectors, 22074 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.306000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.006 +/- 0.01
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.006
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011918305391529.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011918305391529.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4284E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1110.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1220.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1265.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1270.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274.
Chkmod> 106 vectors, 22074 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7358 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7236
0.0034 0.7384
0.0034 0.8646
0.0034 0.8906
0.0034 0.6835
0.0034 0.9419
124.0933 0.6916
169.0608 0.6050
250.3624 0.6001
316.1347 0.6276
346.2877 0.5914
357.3476 0.7205
401.6240 0.4494
422.5125 0.5911
452.8209 0.3662
477.9049 0.0952
500.3243 0.4394
512.2024 0.2704
537.1476 0.1606
544.5599 0.1777
558.1399 0.3118
581.3193 0.2284
584.3539 0.4155
589.2767 0.3209
622.3638 0.3796
626.4239 0.3446
638.7261 0.3600
643.4163 0.4215
668.2274 0.3115
678.4714 0.4538
688.0491 0.2725
704.7268 0.3578
718.9719 0.4944
728.0169 0.2908
741.8943 0.4276
755.5169 0.3533
757.4652 0.3945
769.0515 0.1353
786.5606 0.4180
801.7053 0.4271
808.5882 0.4418
821.7510 0.2548
835.5533 0.4052
844.4667 0.3432
853.2870 0.1815
862.0854 0.5258
868.4221 0.3456
878.3449 0.4579
889.8811 0.2536
903.0993 0.3847
909.8632 0.3083
921.7725 0.5884
928.0828 0.3400
936.0526 0.5118
945.0163 0.3506
954.0811 0.2447
964.4064 0.3943
968.5544 0.4833
977.9437 0.3396
982.2746 0.3220
993.6721 0.4273
998.5845 0.3538
1000.6487 0.4196
1011.0815 0.4085
1024.0595 0.3637
1031.2307 0.2804
1036.3063 0.3942
1040.7343 0.4160
1047.1722 0.4146
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getting mode 7
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011918305391529.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 23011918305391529 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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