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***  Mak_Prdx1_Model  ***

LOGs for ID: 23011808392224348

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 23011808392224348.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 23011808392224348.atom to be opened. Openam> File opened: 23011808392224348.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 346 First residue number = 3 Last residue number = 175 Number of atoms found = 2700 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 61.469496 +/- 11.297550 From: 34.791000 To: 88.029000 = 47.465253 +/- 11.207040 From: 20.332000 To: 74.532000 = 31.064852 +/- 12.781744 From: 2.015000 To: 58.353000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.1288 % Filled. Pdbmat> 1026530 non-zero elements. Pdbmat> 112275 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.17 +/- 23.03 Maximum number = 132 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.245500E+06 Pdbmat> Larger element = 504.069 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 346 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 23011808392224348.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 23011808392224348.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 23011808392224348.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2700 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 346 residues. Blocpdb> 10 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 13 atoms in block 2 Block first atom: 11 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 24 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 41 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 55 Blocpdb> 13 atoms in block 6 Block first atom: 67 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 80 Blocpdb> 12 atoms in block 8 Block first atom: 100 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 112 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 124 Blocpdb> 12 atoms in block 11 Block first atom: 139 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 151 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 171 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 188 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 202 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 216 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 236 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 249 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 270 Blocpdb> 22 atoms in block 20 Block first atom: 284 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 306 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 329 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 344 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 363 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 381 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 394 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 408 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 425 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 455 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 474 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 488 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 508 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 526 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 542 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 557 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 572 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 594 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 608 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 629 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 645 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 658 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 680 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 695 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 729 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 737 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 749 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 764 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 780 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 795 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 808 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 823 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 843 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 858 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 872 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 892 Blocpdb> 17 atoms in block 59 Block first atom: 903 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 920 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 933 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 946 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 960 Blocpdb> 12 atoms in block 64 Block first atom: 982 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 994 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1013 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1029 Blocpdb> 12 atoms in block 68 Block first atom: 1046 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1058 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1077 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1094 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1109 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1125 Blocpdb> 11 atoms in block 74 Block first atom: 1140 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1151 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1168 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1183 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1200 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1219 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1234 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1248 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1268 Blocpdb> 17 atoms in block 83 Block first atom: 1286 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 1303 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1317 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1333 Blocpdb> 5 atoms in block 87 Block first atom: 1346 Blocpdb> 10 atoms in block 88 Block first atom: 1351 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1361 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1374 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1391 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1405 Blocpdb> 13 atoms in block 93 Block first atom: 1417 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1430 Blocpdb> 12 atoms in block 95 Block first atom: 1450 Blocpdb> 12 atoms in block 96 Block first atom: 1462 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1474 Blocpdb> 12 atoms in block 98 Block first atom: 1489 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 1501 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1521 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1538 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1552 Blocpdb> 20 atoms in block 103 Block first atom: 1566 Blocpdb> 13 atoms in block 104 Block first atom: 1586 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 1599 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1620 Blocpdb> 22 atoms in block 107 Block first atom: 1634 Blocpdb> 23 atoms in block 108 Block first atom: 1656 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1679 Blocpdb> 19 atoms in block 110 Block first atom: 1694 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 1713 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1731 Blocpdb> 14 atoms in block 113 Block first atom: 1744 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1758 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1775 Blocpdb> 17 atoms in block 116 Block first atom: 1788 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1805 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1824 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 1838 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1858 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1876 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1892 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1907 Blocpdb> 9 atoms in block 124 Block first atom: 1922 Blocpdb> 13 atoms in block 125 Block first atom: 1931 Blocpdb> 14 atoms in block 126 Block first atom: 1944 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 1958 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 1979 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 1995 Blocpdb> 22 atoms in block 130 Block first atom: 2008 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2030 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2045 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2061 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 2079 Blocpdb> 12 atoms in block 135 Block first atom: 2087 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2099 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2114 Blocpdb> 15 atoms in block 138 Block first atom: 2130 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2145 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2158 Blocpdb> 20 atoms in block 141 Block first atom: 2173 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2193 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2208 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 2222 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 2242 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2253 Blocpdb> 13 atoms in block 147 Block first atom: 2270 Blocpdb> 13 atoms in block 148 Block first atom: 2283 Blocpdb> 14 atoms in block 149 Block first atom: 2296 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 2310 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2332 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 2344 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2363 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2379 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2396 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 2408 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2427 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 2444 Blocpdb> 16 atoms in block 159 Block first atom: 2459 Blocpdb> 15 atoms in block 160 Block first atom: 2475 Blocpdb> 11 atoms in block 161 Block first atom: 2490 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 2501 Blocpdb> 15 atoms in block 163 Block first atom: 2518 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 2533 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2550 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2569 Blocpdb> 14 atoms in block 167 Block first atom: 2584 Blocpdb> 20 atoms in block 168 Block first atom: 2598 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2618 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 2636 Blocpdb> 14 atoms in block 171 Block first atom: 2653 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2667 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 2683 Blocpdb> 5 atoms in block 174 Block first atom: 2695 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1026704 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8100 Prepmat> Matrix trace = 2245500.0000 Prepmat> Last element read: 8100 8100 144.1470 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 13271 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2700 RTB> Total mass = 2700.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2700 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 245588.5473 RTB> 67734 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67734 Diagstd> Projected matrix trace = 245588.5473 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 245588.5473 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.7526784 3.5096702 4.2589600 6.1581741 7.3502958 8.0596924 8.5477011 10.7186239 10.9990193 11.3912367 12.8401580 14.2710450 14.5265728 15.1714790 15.3557945 15.6515425 16.7460273 18.1186228 18.5512252 18.9919649 19.6000707 20.0979809 20.5168994 20.9300335 21.7707384 22.9584672 23.7322701 24.1291918 25.1399871 25.7111896 26.6374225 27.7247101 28.6682194 28.7053416 29.6874029 29.8870460 30.8674239 31.0051936 31.5577876 33.3609120 34.0827521 34.7571135 35.3579259 35.9651735 36.0633053 37.4353019 37.9543485 38.1810700 39.2043162 39.6821660 40.0737966 40.6006969 41.1125651 42.1710075 43.0642365 43.7202615 44.8353091 45.0718981 46.0232907 46.7425868 47.3150353 47.6872199 48.5795586 49.3022064 49.3814002 50.3026776 51.2039885 51.5256168 51.7316087 53.1010754 53.2779012 53.7097182 54.3003648 54.7934269 55.0020212 55.3093033 55.8804569 56.4597611 57.3753205 57.8425343 58.4673788 58.6165172 59.3027739 60.1243990 60.2299305 60.5341663 61.0975119 61.3531749 61.8053344 62.2066102 62.9928703 63.4479724 63.9974903 64.5663705 64.9786941 65.2088115 66.2273416 66.2887101 66.7908671 66.8431561 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034342 0.0034343 0.0034345 0.0034348 0.0034355 180.1660751 203.4362942 224.1026846 269.4767255 294.4066991 308.2865046 317.4826118 355.5206221 360.1407478 366.5056870 389.1172321 410.2259864 413.8823080 422.9696838 425.5312178 429.6094770 444.3765959 462.2297270 467.7153023 473.2386748 480.7553203 486.8234563 491.8709169 496.7984608 506.6777812 520.3154541 529.0112661 533.4167736 544.4748273 550.6255574 560.4558150 571.7797724 581.4275951 581.8039164 591.6724983 593.6586173 603.3168753 604.6617606 610.0262942 627.2118247 633.9610972 640.2021542 645.7117229 651.2329409 652.1207879 664.4096789 668.9998971 670.9950679 679.9268979 684.0580614 687.4253211 691.9297827 696.2778301 705.1837054 712.6128614 718.0201889 727.1187840 729.0347073 736.6888797 742.4234006 746.9557325 749.8877901 756.8713440 762.4800029 763.0921403 770.1775089 777.0467990 779.4834166 781.0399925 791.3105181 792.6269497 795.8325852 800.1965117 803.8213029 805.3498919 807.5964002 811.7555276 815.9523512 822.5415452 825.8837796 830.3326060 831.3909361 836.2435562 842.0166019 842.7552395 844.8810378 848.8032670 850.5773254 853.7058561 856.4727473 861.8684420 864.9761925 868.7138627 872.5663633 875.3480525 876.8966738 883.7184895 884.1278365 887.4702863 887.8176078 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2700 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.84 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00006 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 48600 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00006 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23011808392224348.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23011808392224348.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 23011808392224348.atom Openam> file on opening on unit 11: 23011808392224348.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 346 First residue number = 3 Last residue number = 175 Number of atoms found = 2700 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.84 Bfactors> 106 vectors, 8100 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.753000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.684 for 346 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.02 Bfactors> = 38.325 +/- 12.13 Bfactors> Shiftng-fct= 38.304 Bfactors> Scaling-fct= 575.243 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 23011808392224348.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 23011808392224348.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 2700 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23011808392224348.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 23011808392224348.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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