***  Mak_Prdx1_Model  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 23011808392224348.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 23011808392224348.atom to be opened.
Openam> File opened: 23011808392224348.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 3
Last residue number = 175
Number of atoms found = 2700
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 61.469496 +/- 11.297550 From: 34.791000 To: 88.029000
= 47.465253 +/- 11.207040 From: 20.332000 To: 74.532000
= 31.064852 +/- 12.781744 From: 2.015000 To: 58.353000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1288 % Filled.
Pdbmat> 1026530 non-zero elements.
Pdbmat> 112275 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.17 +/- 23.03
Maximum number = 132
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 2.245500E+06
Pdbmat> Larger element = 504.069
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
346 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 23011808392224348.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 23011808392224348.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
23011808392224348.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2700 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 346 residues.
Blocpdb> 10 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 11
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 24
Blocpdb> 14 atoms in block 4
Block first atom: 41
Blocpdb> 12 atoms in block 5
Block first atom: 55
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 67
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 80
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 100
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 112
Blocpdb> 15 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 12 atoms in block 11
Block first atom: 139
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 151
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 171
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 188
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 202
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 216
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 236
Blocpdb> 21 atoms in block 18
Block first atom: 249
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 270
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 284
Blocpdb> 23 atoms in block 21
Block first atom: 306
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 329
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 344
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 363
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 381
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 394
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 408
Blocpdb> 13 atoms in block 28
Block first atom: 425
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 438
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 455
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 474
Blocpdb> 20 atoms in block 32
Block first atom: 488
Blocpdb> 18 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 526
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 542
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 557
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 572
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 581
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 594
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 608
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 629
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 645
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 658
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 680
Blocpdb> 16 atoms in block 45
Block first atom: 695
Blocpdb> 18 atoms in block 46
Block first atom: 711
Blocpdb> 8 atoms in block 47
Block first atom: 729
Blocpdb> 12 atoms in block 48
Block first atom: 737
Blocpdb> 15 atoms in block 49
Block first atom: 749
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 764
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 780
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 795
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 808
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 823
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 843
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 858
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 872
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 892
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 903
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 920
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 933
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 946
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 960
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 982
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 994
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 1013
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1029
Blocpdb> 12 atoms in block 68
Block first atom: 1046
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1058
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1077
Blocpdb> 15 atoms in block 71
Block first atom: 1094
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1109
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1125
Blocpdb> 11 atoms in block 74
Block first atom: 1140
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1151
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1168
Blocpdb> 17 atoms in block 77
Block first atom: 1183
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1200
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1219
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1234
Blocpdb> 20 atoms in block 81
Block first atom: 1248
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 1268
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1286
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1303
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1317
Blocpdb> 13 atoms in block 86
Block first atom: 1333
Blocpdb> 5 atoms in block 87
Block first atom: 1346
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1351
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1361
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1374
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1391
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1405
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1417
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 1430
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1450
Blocpdb> 12 atoms in block 96
Block first atom: 1462
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1474
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1489
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1501
Blocpdb> 17 atoms in block 100
Block first atom: 1521
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1538
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1552
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1566
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1586
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 1599
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1620
Blocpdb> 22 atoms in block 107
Block first atom: 1634
Blocpdb> 23 atoms in block 108
Block first atom: 1656
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1679
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 1694
Blocpdb> 18 atoms in block 111
Block first atom: 1713
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1731
Blocpdb> 14 atoms in block 113
Block first atom: 1744
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1758
Blocpdb> 13 atoms in block 115
Block first atom: 1775
Blocpdb> 17 atoms in block 116
Block first atom: 1788
Blocpdb> 19 atoms in block 117
Block first atom: 1805
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1824
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1838
Blocpdb> 18 atoms in block 120
Block first atom: 1858
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1876
Blocpdb> 15 atoms in block 122
Block first atom: 1892
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1907
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 1922
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1931
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1944
Blocpdb> 21 atoms in block 127
Block first atom: 1958
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1979
Blocpdb> 13 atoms in block 129
Block first atom: 1995
Blocpdb> 22 atoms in block 130
Block first atom: 2008
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2030
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2045
Blocpdb> 18 atoms in block 133
Block first atom: 2061
Blocpdb> 8 atoms in block 134
Block first atom: 2079
Blocpdb> 12 atoms in block 135
Block first atom: 2087
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2099
Blocpdb> 16 atoms in block 137
Block first atom: 2114
Blocpdb> 15 atoms in block 138
Block first atom: 2130
Blocpdb> 13 atoms in block 139
Block first atom: 2145
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2158
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2173
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2193
Blocpdb> 14 atoms in block 143
Block first atom: 2208
Blocpdb> 20 atoms in block 144
Block first atom: 2222
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 2242
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2253
Blocpdb> 13 atoms in block 147
Block first atom: 2270
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2283
Blocpdb> 14 atoms in block 149
Block first atom: 2296
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 2310
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2332
Blocpdb> 19 atoms in block 152
Block first atom: 2344
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2363
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2379
Blocpdb> 12 atoms in block 155
Block first atom: 2396
Blocpdb> 19 atoms in block 156
Block first atom: 2408
Blocpdb> 17 atoms in block 157
Block first atom: 2427
Blocpdb> 15 atoms in block 158
Block first atom: 2444
Blocpdb> 16 atoms in block 159
Block first atom: 2459
Blocpdb> 15 atoms in block 160
Block first atom: 2475
Blocpdb> 11 atoms in block 161
Block first atom: 2490
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2501
Blocpdb> 15 atoms in block 163
Block first atom: 2518
Blocpdb> 17 atoms in block 164
Block first atom: 2533
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 2550
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 2569
Blocpdb> 14 atoms in block 167
Block first atom: 2584
Blocpdb> 20 atoms in block 168
Block first atom: 2598
Blocpdb> 18 atoms in block 169
Block first atom: 2618
Blocpdb> 17 atoms in block 170
Block first atom: 2636
Blocpdb> 14 atoms in block 171
Block first atom: 2653
Blocpdb> 16 atoms in block 172
Block first atom: 2667
Blocpdb> 13 atoms in block 173
Block first atom: 2683
Blocpdb> 5 atoms in block 174
Block first atom: 2695
Blocpdb> 174 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1026704 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8100
Prepmat> Matrix trace = 2245500.0000
Prepmat> Last element read: 8100 8100 144.1470
Prepmat> 15226 lines saved.
Prepmat> 13271 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2700
RTB> Total mass = 2700.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2700
RTB> Number of blocks = 174
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 245588.5473
RTB> 67734 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1044
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67734
Diagstd> Projected matrix trace = 245588.5473
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1044 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 245588.5473
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.7526784 3.5096702 4.2589600 6.1581741
7.3502958 8.0596924 8.5477011 10.7186239 10.9990193
11.3912367 12.8401580 14.2710450 14.5265728 15.1714790
15.3557945 15.6515425 16.7460273 18.1186228 18.5512252
18.9919649 19.6000707 20.0979809 20.5168994 20.9300335
21.7707384 22.9584672 23.7322701 24.1291918 25.1399871
25.7111896 26.6374225 27.7247101 28.6682194 28.7053416
29.6874029 29.8870460 30.8674239 31.0051936 31.5577876
33.3609120 34.0827521 34.7571135 35.3579259 35.9651735
36.0633053 37.4353019 37.9543485 38.1810700 39.2043162
39.6821660 40.0737966 40.6006969 41.1125651 42.1710075
43.0642365 43.7202615 44.8353091 45.0718981 46.0232907
46.7425868 47.3150353 47.6872199 48.5795586 49.3022064
49.3814002 50.3026776 51.2039885 51.5256168 51.7316087
53.1010754 53.2779012 53.7097182 54.3003648 54.7934269
55.0020212 55.3093033 55.8804569 56.4597611 57.3753205
57.8425343 58.4673788 58.6165172 59.3027739 60.1243990
60.2299305 60.5341663 61.0975119 61.3531749 61.8053344
62.2066102 62.9928703 63.4479724 63.9974903 64.5663705
64.9786941 65.2088115 66.2273416 66.2887101 66.7908671
66.8431561
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034342 0.0034343 0.0034345 0.0034348
0.0034355 180.1660751 203.4362942 224.1026846 269.4767255
294.4066991 308.2865046 317.4826118 355.5206221 360.1407478
366.5056870 389.1172321 410.2259864 413.8823080 422.9696838
425.5312178 429.6094770 444.3765959 462.2297270 467.7153023
473.2386748 480.7553203 486.8234563 491.8709169 496.7984608
506.6777812 520.3154541 529.0112661 533.4167736 544.4748273
550.6255574 560.4558150 571.7797724 581.4275951 581.8039164
591.6724983 593.6586173 603.3168753 604.6617606 610.0262942
627.2118247 633.9610972 640.2021542 645.7117229 651.2329409
652.1207879 664.4096789 668.9998971 670.9950679 679.9268979
684.0580614 687.4253211 691.9297827 696.2778301 705.1837054
712.6128614 718.0201889 727.1187840 729.0347073 736.6888797
742.4234006 746.9557325 749.8877901 756.8713440 762.4800029
763.0921403 770.1775089 777.0467990 779.4834166 781.0399925
791.3105181 792.6269497 795.8325852 800.1965117 803.8213029
805.3498919 807.5964002 811.7555276 815.9523512 822.5415452
825.8837796 830.3326060 831.3909361 836.2435562 842.0166019
842.7552395 844.8810378 848.8032670 850.5773254 853.7058561
856.4727473 861.8684420 864.9761925 868.7138627 872.5663633
875.3480525 876.8966738 883.7184895 884.1278365 887.4702863
887.8176078
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2700
Rtb_to_modes> Number of blocs = 174
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.510
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.259
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.158
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.060
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.548
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.84
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00003 1.00006 0.99998 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 48600 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00003 1.00006 0.99998 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011808392224348.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011808392224348.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 23011808392224348.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23011808392224348.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 3
Last residue number = 175
Number of atoms found = 2700
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.510
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.259
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.548
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.84
Bfactors> 106 vectors, 8100 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.753000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.684 for 346 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.021 +/- 0.02
Bfactors> = 38.325 +/- 12.13
Bfactors> Shiftng-fct= 38.304
Bfactors> Scaling-fct= 575.243
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011808392224348.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011808392224348.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.8
Chkmod> 106 vectors, 8100 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2700 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7448
0.0034 0.8736
0.0034 0.8472
0.0034 0.7469
0.0034 0.8509
0.0034 0.9631
180.1689 0.6664
203.4371 0.6184
224.0941 0.5885
269.4613 0.2121
294.3881 0.2258
308.2792 0.4721
317.4745 0.6397
355.5282 0.6209
360.1413 0.2967
366.4701 0.3928
389.0981 0.3306
410.1934 0.2047
413.9134 0.2534
422.9309 0.3269
425.5712 0.4617
429.5699 0.4419
444.4102 0.4299
462.2275 0.3316
467.6798 0.4892
473.1939 0.3492
480.7338 0.2259
486.8270 0.4877
491.8870 0.4359
496.7767 0.3003
506.6474 0.2991
520.3105 0.3014
528.9633 0.3632
533.4028 0.4951
544.4516 0.4461
550.5892 0.2866
560.4589 0.6184
571.7067 0.4668
581.4207 0.4732
581.8261 0.4749
591.6730 0.4610
593.6625 0.4631
603.3162 0.3951
604.6827 0.4439
610.0215 0.4591
627.1763 0.3803
633.9083 0.4615
640.2013 0.4821
645.7029 0.3687
651.2487 0.4364
652.0629 0.5429
664.4228 0.4283
668.9329 0.3465
670.9569 0.4238
679.8603 0.1099
684.0100 0.2366
687.3632 0.5804
691.8941 0.3222
696.2262 0.4186
705.1450 0.3620
712.5472 0.4569
717.9872 0.4237
727.1256 0.3676
728.9881 0.4355
736.6309 0.3582
742.3710 0.3197
746.9629 0.4518
749.8775 0.4329
756.8423 0.4027
762.4302 0.2509
763.0486 0.2391
770.1239 0.2024
776.9832 0.4325
779.4831 0.4642
780.9943 0.4337
791.2685 0.3537
792.6085 0.1534
795.8005 0.2876
800.1595 0.3225
803.7617 0.4935
805.3005 0.1846
807.5668 0.2841
811.7174 0.3841
815.9191 0.4559
822.5398 0.4218
825.8302 0.3120
830.3156 0.3214
831.3799 0.4901
836.1881 0.3877
841.9497 0.3004
842.7195 0.3711
844.8157 0.2541
848.7841 0.3928
850.5188 0.4033
853.7014 0.3562
856.4593 0.4668
861.8118 0.2862
864.9529 0.3432
868.6936 0.3788
872.5534 0.3549
875.3193 0.3802
876.8670 0.5315
883.6983 0.2374
884.0985 0.3833
887.4264 0.3089
887.7585 0.4323
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
making animated gifs
11 models are in 23011808392224348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
making animated gifs
11 models are in 23011808392224348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
making animated gifs
11 models are in 23011808392224348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
making animated gifs
11 models are in 23011808392224348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 23011808392224348 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011808392224348.eigenfacs
23011808392224348.atom
making animated gifs
11 models are in 23011808392224348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011808392224348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
23011808392224348.10.pdb
23011808392224348.11.pdb
23011808392224348.7.pdb
23011808392224348.8.pdb
23011808392224348.9.pdb
STDERR:
real 0m15.121s
user 0m15.044s
sys 0m0.044s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|