*** pdz ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 23011717530784080.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 23011717530784080.atom to be opened.
Openam> File opened: 23011717530784080.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 96
First residue number = 1
Last residue number = 96
Number of atoms found = 1470
Mean number per residue = 15.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.328880 +/- 6.724529 From: -17.866000 To: 14.370000
= 0.664990 +/- 9.697005 From: -27.345000 To: 20.300000
= -1.168486 +/- 6.117918 From: -19.387000 To: 13.127000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 10.1316 % Filled.
Pdbmat> 985426 non-zero elements.
Pdbmat> 108524 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 147.65 +/- 53.34
Maximum number = 260
Minimum number = 26
Pdbmat> Matrix trace = 2.170480E+06
Pdbmat> Larger element = 920.377
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
96 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 23011717530784080.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 23011717530784080.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
23011717530784080.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1470 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 96 residues.
Blocpdb> 9 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 10
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 17 atoms in block 4
Block first atom: 28
Blocpdb> 24 atoms in block 5
Block first atom: 45
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 69
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 83
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 97
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 116
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 135
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 154
Blocpdb> 24 atoms in block 12
Block first atom: 171
Blocpdb> 10 atoms in block 13
Block first atom: 195
Blocpdb> 7 atoms in block 14
Block first atom: 205
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 212
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 234
Blocpdb> 21 atoms in block 17
Block first atom: 256
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 277
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 284
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 304
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 318
Blocpdb> 24 atoms in block 22
Block first atom: 337
Blocpdb> 10 atoms in block 23
Block first atom: 361
Blocpdb> 19 atoms in block 24
Block first atom: 371
Blocpdb> 24 atoms in block 25
Block first atom: 390
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 414
Blocpdb> 21 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 17 atoms in block 28
Block first atom: 451
Blocpdb> 7 atoms in block 29
Block first atom: 468
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 475
Blocpdb> 11 atoms in block 31
Block first atom: 487
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 498
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 510
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 526
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 547
Blocpdb> 16 atoms in block 36
Block first atom: 561
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 577
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 594
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 611
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 628
Blocpdb> 24 atoms in block 41
Block first atom: 644
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 668
Blocpdb> 16 atoms in block 43
Block first atom: 685
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 701
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 716
Blocpdb> 7 atoms in block 46
Block first atom: 728
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 735
Blocpdb> 14 atoms in block 48
Block first atom: 742
Blocpdb> 10 atoms in block 49
Block first atom: 756
Blocpdb> 11 atoms in block 50
Block first atom: 766
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 777
Blocpdb> 10 atoms in block 52
Block first atom: 792
Blocpdb> 7 atoms in block 53
Block first atom: 802
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 809
Blocpdb> 24 atoms in block 55
Block first atom: 828
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 852
Blocpdb> 7 atoms in block 57
Block first atom: 869
Blocpdb> 12 atoms in block 58
Block first atom: 876
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 907
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 926
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 940
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 957
Blocpdb> 14 atoms in block 64
Block first atom: 973
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 987
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 994
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 1009
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1023
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1039
Blocpdb> 7 atoms in block 70
Block first atom: 1056
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1063
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1082
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1098
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1115
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1129
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1144
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1160
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1176
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1191
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1210
Blocpdb> 19 atoms in block 81
Block first atom: 1229
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1248
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 1270
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 1281
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1288
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1302
Blocpdb> 16 atoms in block 87
Block first atom: 1324
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1340
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1350
Blocpdb> 11 atoms in block 90
Block first atom: 1369
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1380
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1394
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1408
Blocpdb> 19 atoms in block 94
Block first atom: 1422
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1441
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1455
Blocpdb> 96 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 985522 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4410
Prepmat> Matrix trace = 2170480.0000
Prepmat> Last element read: 4410 4410 209.2168
Prepmat> 4657 lines saved.
Prepmat> 3415 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1470
RTB> Total mass = 1470.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1470
RTB> Number of blocks = 96
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 253796.7956
RTB> 43236 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 576
Diagstd> Nb of non-zero elements: 43236
Diagstd> Projected matrix trace = 253796.7956
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 576 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 253796.7956
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.3254794 5.0462105 7.3345024 11.4461168
13.2394949 16.4293517 19.0364826 22.9210304 24.7096755
26.9260683 31.6978633 33.7253496 38.3894620 42.1774591
46.2796199 49.4548933 53.2303500 55.6325764 59.4086346
61.9108496 66.4099105 67.5470514 70.1188459 76.0275220
78.6839232 80.6489683 81.5332323 83.0829028 87.1745784
91.2823003 93.7616045 94.6855234 97.6129697 98.9186343
105.2749588 106.9287500 111.0688884 111.4506458 112.5089827
116.7964818 118.1302626 120.3139460 124.5955865 125.4093834
129.9878725 131.0838912 134.4581061 137.0815199 139.8984532
142.5061687 144.1186570 146.6073061 147.8769170 148.9647550
150.9757212 151.8839199 153.9965484 157.7354480 159.7354833
160.6124865 162.0773852 163.6960614 165.7843288 166.6723832
169.6756316 171.5778618 171.7526991 174.3600365 175.2411542
176.6665423 179.0845299 179.5071216 182.4444163 184.5362599
185.7109023 186.7002681 188.7105309 190.0071614 192.6526950
193.8929742 196.5695499 198.7716846 201.1341455 202.0632567
203.4262156 207.2060588 207.8789962 208.6944629 212.2313442
212.7569820 214.6770533 216.2695341 217.7962586 218.3503470
220.0396863 221.9010347 224.4353498 225.8628314 228.2863993
230.4667815
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034328 0.0034341 0.0034343 0.0034350
0.0034372 225.8459995 243.9371588 294.0902369 367.3874919
395.1217974 440.1548516 473.7929929 519.8910591 539.7949299
563.4842109 611.3786583 630.6283788 672.8237189 705.2376452
738.7375453 763.6597741 792.2731556 809.9530906 836.9896079
854.4342767 884.9357242 892.4799704 909.3114506 946.8489415
963.2483706 975.2022359 980.5338933 989.8083455 1013.8885254
1037.5011055 1051.4964130 1056.6643913 1072.8747962 1080.0263121
1114.1863158 1122.9037322 1144.4359529 1146.4010493 1151.8313085
1173.5731388 1180.2550436 1191.1138255 1212.1227703 1216.0748211
1238.0742701 1243.2828493 1259.1827781 1271.4074027 1284.4042578
1296.3196741 1303.6331138 1314.8405431 1320.5214924 1325.3697181
1334.2857160 1338.2929153 1347.5682615 1363.8290351 1372.4482582
1376.2107095 1382.4724680 1389.3587335 1398.1926601 1401.9324972
1414.5067283 1422.4136326 1423.1381655 1433.8996407 1437.5181368
1443.3525868 1453.1964087 1454.9099761 1466.7651019 1475.1498429
1479.8373362 1483.7739809 1491.7407326 1496.8568365 1507.2414350
1512.0853875 1522.4863299 1530.9906538 1540.0619204 1543.6148729
1548.8121263 1563.1350646 1565.6712823 1568.7391806 1581.9765539
1583.9343994 1591.0656253 1596.9560079 1602.5828385 1604.6200832
1610.8154587 1617.6141747 1626.8252749 1631.9906426 1640.7231255
1648.5398460
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1470
Rtb_to_modes> Number of blocs = 96
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0019E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.325
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.335
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 230.5
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 576 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00003 0.99997 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
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1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
1.00002 0.99997 1.00002 1.00003 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00005
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003
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1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000
1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00004 1.00003 0.99998 1.00001
1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000
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1.00003 1.00000 1.00000 0.99995 0.99998
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
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0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 26460 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00003 0.99997 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
1.00005 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
1.00002 0.99997 1.00002 1.00003 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00005
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000
1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00004 1.00003 0.99998 1.00001
1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99993 0.99999 1.00000 1.00001
1.00003 1.00000 1.00000 0.99995 0.99998
0.99999 0.99996 0.99998 1.00003 1.00003
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011717530784080.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011717530784080.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 23011717530784080.atom
Openam> file on opening on unit 11:
23011717530784080.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 96
First residue number = 1
Last residue number = 96
Number of atoms found = 1470
Mean number per residue = 15.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0019E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.335
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 149.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 196.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 225.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 228.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.5
Bfactors> 106 vectors, 4410 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.325000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.015 +/- 0.03
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.015
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 23011717530784080.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
23011717530784080.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4371E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1238.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1284.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1338.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1348.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1372.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1376.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1389.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1398.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1402.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1415.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1423.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1437.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1443.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1453.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1455.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1467.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1480.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1484.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1492.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1497.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1507.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1512.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1523.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1531.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1540.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1544.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1549.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1563.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1566.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1569.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1582.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1584.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1591.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1597.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1603.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1605.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1611.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1618.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1627.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1632.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1641.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1649.
Chkmod> 106 vectors, 4410 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1470 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 87 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7671
0.0034 0.7858
0.0034 0.9543
0.0034 0.6807
0.0034 0.8918
0.0034 0.8172
225.8238 0.0795
243.9216 0.2371
294.0876 0.3068
367.4340 0.1872
395.1124 0.1756
440.1446 0.0661
473.8164 0.1059
519.8571 0.2455
539.7753 0.2295
563.5012 0.4405
611.3730 0.3036
630.6448 0.3115
672.7996 0.1922
705.2286 0.1527
738.7089 0.3269
763.5892 0.1133
792.2365 0.3944
809.8996 0.2144
836.9633 0.4187
854.3917 0.3609
884.8983 0.1040
892.4611 0.4419
909.2799 0.3552
946.8237 0.3911
963.1830 0.3226
975.1666 0.3594
980.4724 0.2914
989.7486 0.3551
1013.8184 0.2918
1037.4435 0.4083
1051.4423 0.4337
1056.6440 0.3938
1072.8124 0.4637
1079.9874 0.4063
1114.2710 0.4959
1122.7046 0.3722
1144.5471 0.3559
1146.6056 0.4700
1151.7359 0.3085
1173.5404 0.5257
1180.0532 0.4023
1190.9937 0.2918
1212.0922 0.4327
1215.9771 0.4122
1238.0789 0.4650
1243.3059 0.3272
1259.3249 0.2741
1271.4385 0.3949
1284.3562 0.2393
1296.2360 0.1431
1303.4928 0.2180
1314.7513 0.4334
1320.5679 0.2575
1325.4696 0.1410
1334.3357 0.2971
1338.3063 0.2968
1347.5255 0.2044
1363.6172 0.3273
1372.2369 0.2597
1376.0981 0.4540
1382.5096 0.3922
1389.3158 0.3683
1398.1987 0.3524
1401.9885 0.2724
1414.5476 0.2489
1422.4443 0.1589
1423.2730 0.2638
1434.0024 0.3600
1437.2876 0.2413
1443.4273 0.3765
1453.1968 0.0451
1454.8187 0.2155
1466.5236 0.3401
1474.9416 0.3395
1479.7304 0.3526
1483.7092 0.3460
1491.6351 0.3117
1496.7644 0.3558
1507.3618 0.3798
1512.0479 0.3489
1522.5389 0.1658
1531.0340 0.4144
1539.8651 0.3682
1543.6889 0.1549
1548.6458 0.3762
1563.0451 0.2033
1565.6832 0.2176
1568.6926 0.2178
1581.7918 0.3912
1584.0265 0.2103
1591.0824 0.3080
1596.9999 0.1407
1602.5278 0.3039
1604.7336 0.3728
1610.6010 0.2263
1617.5410 0.2679
1626.6273 0.2910
1632.0549 0.2051
1640.7016 0.3894
1648.5879 0.3106
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 23011717530784080 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
23011717530784080.eigenfacs
23011717530784080.atom
making animated gifs
11 models are in 23011717530784080.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 23011717530784080 8 -100 100 20 on 0
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 23011717530784080 10 -100 100 20 on 0
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generate a series of perturbations for mode 10
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11 models are in 23011717530784080.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 23011717530784080 11 -100 100 20 on 0
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generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 23011717530784080.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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user 0m3.704s
sys 0m0.016s
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