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***  1w50  ***

LOGs for ID: 230117144349141864

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 230117144349141864.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 230117144349141864.atom to be opened. Openam> File opened: 230117144349141864.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 377 First residue number = -1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 2966 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 65.731433 +/- 11.203225 From: 36.841000 To: 93.108000 = 47.289815 +/- 14.803971 From: 13.101000 To: 79.869000 = -0.056169 +/- 9.679109 From: -24.380000 To: 24.572000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8252 % Filled. Pdbmat> 1118549 non-zero elements. Pdbmat> 122327 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.49 +/- 23.40 Maximum number = 127 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.446540E+06 Pdbmat> Larger element = 484.755 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 377 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 230117144349141864.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 230117144349141864.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 230117144349141864.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2966 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 378 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 51 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 67 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 82 Blocpdb> 13 atoms in block 7 Block first atom: 97 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 110 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 126 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 145 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 162 Blocpdb> 10 atoms in block 12 Block first atom: 176 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 186 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 200 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 216 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 232 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 248 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 263 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 274 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 286 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 305 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 317 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 326 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 355 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 374 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 395 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 419 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 439 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 456 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 468 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 506 Blocpdb> 13 atoms in block 34 Block first atom: 525 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 538 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 557 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 571 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 590 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 603 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 626 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 639 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 656 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 667 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 683 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 696 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 725 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 740 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 754 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 772 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 785 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 798 Blocpdb> 16 atoms in block 53 Block first atom: 811 Blocpdb> 14 atoms in block 54 Block first atom: 827 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 841 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 861 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 880 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 892 Blocpdb> 23 atoms in block 59 Block first atom: 906 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 929 Blocpdb> 12 atoms in block 61 Block first atom: 941 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 953 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 966 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 983 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1000 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 1016 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1031 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1045 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1062 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1080 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1099 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1113 Blocpdb> 16 atoms in block 73 Block first atom: 1129 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1145 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1162 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1177 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1196 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1210 Blocpdb> 10 atoms in block 79 Block first atom: 1227 Blocpdb> 5 atoms in block 80 Block first atom: 1237 Blocpdb> 11 atoms in block 81 Block first atom: 1242 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1253 Blocpdb> 10 atoms in block 83 Block first atom: 1264 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1274 Blocpdb> 12 atoms in block 85 Block first atom: 1290 Blocpdb> 12 atoms in block 86 Block first atom: 1302 Blocpdb> 18 atoms in block 87 Block first atom: 1314 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1332 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1346 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1365 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 1375 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 1397 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1416 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 1431 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 1453 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 1476 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1500 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1516 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1532 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1550 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1566 Blocpdb> 13 atoms in block 102 Block first atom: 1582 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1595 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1611 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 1628 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 1642 Blocpdb> 20 atoms in block 107 Block first atom: 1660 Blocpdb> 20 atoms in block 108 Block first atom: 1680 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1700 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1715 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1730 Blocpdb> 11 atoms in block 112 Block first atom: 1744 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1755 Blocpdb> 19 atoms in block 114 Block first atom: 1770 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1789 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1804 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1822 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1840 Blocpdb> 12 atoms in block 119 Block first atom: 1854 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1866 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 1881 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1898 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1908 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1920 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 1936 Blocpdb> 15 atoms in block 126 Block first atom: 1956 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 1971 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 1986 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 2008 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2021 Blocpdb> 13 atoms in block 131 Block first atom: 2038 Blocpdb> 23 atoms in block 132 Block first atom: 2051 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 2074 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2083 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 2097 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 2118 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 2134 Blocpdb> 15 atoms in block 138 Block first atom: 2152 Blocpdb> 14 atoms in block 139 Block first atom: 2167 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 2181 Blocpdb> 12 atoms in block 141 Block first atom: 2201 Blocpdb> 16 atoms in block 142 Block first atom: 2213 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2229 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 2244 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 2259 Blocpdb> 15 atoms in block 146 Block first atom: 2281 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2296 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2312 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 2328 Blocpdb> 19 atoms in block 150 Block first atom: 2349 Blocpdb> 14 atoms in block 151 Block first atom: 2368 Blocpdb> 17 atoms in block 152 Block first atom: 2382 Blocpdb> 12 atoms in block 153 Block first atom: 2399 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2411 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 2424 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2441 Blocpdb> 21 atoms in block 157 Block first atom: 2455 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2476 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2492 Blocpdb> 15 atoms in block 160 Block first atom: 2506 Blocpdb> 13 atoms in block 161 Block first atom: 2521 Blocpdb> 11 atoms in block 162 Block first atom: 2534 Blocpdb> 15 atoms in block 163 Block first atom: 2545 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 2560 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2569 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2584 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2601 Blocpdb> 19 atoms in block 168 Block first atom: 2616 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2635 Blocpdb> 19 atoms in block 170 Block first atom: 2653 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2672 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 2688 Blocpdb> 12 atoms in block 173 Block first atom: 2708 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 2720 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2736 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 2749 Blocpdb> 17 atoms in block 177 Block first atom: 2760 Blocpdb> 18 atoms in block 178 Block first atom: 2777 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 2795 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 2815 Blocpdb> 10 atoms in block 181 Block first atom: 2833 Blocpdb> 16 atoms in block 182 Block first atom: 2843 Blocpdb> 11 atoms in block 183 Block first atom: 2859 Blocpdb> 18 atoms in block 184 Block first atom: 2870 Blocpdb> 15 atoms in block 185 Block first atom: 2888 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 2903 Blocpdb> 17 atoms in block 187 Block first atom: 2919 Blocpdb> 10 atoms in block 188 Block first atom: 2936 Blocpdb> 21 atoms in block 189 Block first atom: 2945 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1118738 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8898 Prepmat> Matrix trace = 2446540.0000 Prepmat> Last element read: 8898 8898 145.9956 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 15853 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2966 RTB> Total mass = 2966.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2966 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 265436.9794 RTB> 72837 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72837 Diagstd> Projected matrix trace = 265436.9794 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 265436.9794 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.7333698 2.0982729 3.1355008 4.7508642 5.8221974 6.9509485 8.4638089 8.9128981 9.4387904 9.9843826 10.5851609 12.6617097 13.1795661 13.6175439 14.2385595 15.3809234 15.6652630 17.1723429 17.6351357 17.8652207 18.4140661 18.9329212 19.6906231 20.7111211 21.1924815 22.1287895 22.8663337 23.4756754 23.8087182 23.9653177 24.2744535 24.9489881 25.7052941 26.3873296 27.2990164 27.7694188 28.3974727 28.4904082 28.7562505 30.0149364 30.0779885 30.8361394 31.2514065 31.8280690 32.3645228 32.6206357 33.2540824 34.2158095 34.5963659 35.4812676 36.1008195 36.6371562 37.2001412 37.6469183 38.3906289 39.0110037 39.8427531 40.4543281 40.8767496 41.5754443 41.7671038 42.0752723 42.9172026 43.3129550 43.9227012 44.0268817 45.1013644 45.9357995 46.5282820 47.1279997 47.7836917 48.0187068 48.8940838 49.8970964 50.2523392 50.7771213 51.0084420 51.4159629 52.1962847 52.5258498 52.9651943 53.3828785 53.7344937 54.1910084 55.4021189 55.4276694 56.5745101 57.5743094 57.7283292 58.3489191 58.7717943 59.5685255 59.9848716 60.6026667 61.3690137 62.0775376 62.7652734 63.1873671 63.8906997 64.3500457 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034304 0.0034325 0.0034332 0.0034333 0.0034339 0.0034357 142.9686739 157.2991091 192.2864757 236.6909150 262.0225959 286.2973410 315.9207895 324.1938347 333.6210543 343.1277862 353.3003045 386.4038609 394.2265209 400.7233708 409.7588176 425.8792546 429.7977380 449.9974531 456.0208326 458.9860358 465.9830601 472.5024819 481.8645862 494.1935629 499.9035106 510.8273116 519.2703775 526.1436433 529.8626265 531.6023300 535.0199924 542.4025820 550.5624262 557.8186127 567.3731502 572.2406101 578.6755403 579.6216735 582.3196020 594.9274307 595.5519828 603.0110633 607.0578288 612.6330555 617.7743670 620.2138931 626.2067786 635.1973683 638.7200083 646.8369848 652.4598776 657.2886885 662.3195501 666.2849384 672.8339443 678.2485008 685.4407980 690.6814250 694.2780858 700.1864944 701.7985408 704.3828086 711.3952869 714.6677543 719.6806085 720.5336102 729.2729760 735.9883161 740.7195184 745.4779181 750.6459229 752.4896138 759.3175481 767.0663255 769.7920497 773.8010565 775.5616209 778.6535482 784.5399728 787.0128510 790.2974217 793.4074503 796.0161165 799.3903416 808.2737374 808.4600965 816.7811026 823.9666785 825.0680588 829.4910185 832.4913990 838.1151772 841.0390234 845.3589360 850.6871093 855.5837374 860.3100429 863.1979696 867.9887624 871.1034025 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2966 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9794E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.733 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.136 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.35 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 53388 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 230117144349141864.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 230117144349141864.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 230117144349141864.atom Openam> file on opening on unit 11: 230117144349141864.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 377 First residue number = -1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 2966 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9794E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.733 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.136 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.439 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.35 Bfactors> 106 vectors, 8898 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.733000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.659 for 377 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.024 +/- 0.03 Bfactors> = 32.227 +/- 15.24 Bfactors> Shiftng-fct= 32.203 Bfactors> Scaling-fct= 552.665 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 230117144349141864.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 230117144349141864.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.4 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 230117144349141864 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=0 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=20 230117144349141864.eigenfacs 230117144349141864.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 230117144349141864.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 230117144349141864.10.pdb 230117144349141864.11.pdb 230117144349141864.7.pdb 230117144349141864.8.pdb 230117144349141864.9.pdb STDERR: real 0m17.631s user 0m17.604s sys 0m0.020s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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