*** G7J6M8 chmr ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22123107561910511.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22123107561910511.atom to be opened.
Openam> File opened: 22123107561910511.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 629
First residue number = 27
Last residue number = 655
Number of atoms found = 5052
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.146847 +/- 50.994586 From: -36.650000 To: 117.596000
= -5.358183 +/- 13.943998 From: -44.620000 To: 27.502000
= -4.296771 +/- 30.573638 From: -59.372000 To: 49.352000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.5161 % Filled.
Pdbmat> 1741350 non-zero elements.
Pdbmat> 190142 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 75.27 +/- 25.15
Maximum number = 127
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 3.802840E+06
Pdbmat> Larger element = 487.771
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
629 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22123107561910511.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22123107561910511.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22123107561910511.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5052 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 629 residues.
Blocpdb> 29 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 36 atoms in block 2
Block first atom: 30
Blocpdb> 28 atoms in block 3
Block first atom: 66
Blocpdb> 35 atoms in block 4
Block first atom: 94
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 129
Blocpdb> 36 atoms in block 6
Block first atom: 159
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 195
Blocpdb> 29 atoms in block 8
Block first atom: 225
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 254
Blocpdb> 30 atoms in block 10
Block first atom: 280
Blocpdb> 39 atoms in block 11
Block first atom: 310
Blocpdb> 27 atoms in block 12
Block first atom: 349
Blocpdb> 34 atoms in block 13
Block first atom: 376
Blocpdb> 32 atoms in block 14
Block first atom: 410
Blocpdb> 35 atoms in block 15
Block first atom: 442
Blocpdb> 26 atoms in block 16
Block first atom: 477
Blocpdb> 33 atoms in block 17
Block first atom: 503
Blocpdb> 25 atoms in block 18
Block first atom: 536
Blocpdb> 30 atoms in block 19
Block first atom: 561
Blocpdb> 32 atoms in block 20
Block first atom: 591
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 623
Blocpdb> 33 atoms in block 22
Block first atom: 650
Blocpdb> 30 atoms in block 23
Block first atom: 683
Blocpdb> 37 atoms in block 24
Block first atom: 713
Blocpdb> 32 atoms in block 25
Block first atom: 750
Blocpdb> 37 atoms in block 26
Block first atom: 782
Blocpdb> 32 atoms in block 27
Block first atom: 819
Blocpdb> 33 atoms in block 28
Block first atom: 851
Blocpdb> 33 atoms in block 29
Block first atom: 884
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 917
Blocpdb> 34 atoms in block 31
Block first atom: 943
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 977
Blocpdb> 32 atoms in block 33
Block first atom: 1005
Blocpdb> 33 atoms in block 34
Block first atom: 1037
Blocpdb> 30 atoms in block 35
Block first atom: 1070
Blocpdb> 30 atoms in block 36
Block first atom: 1100
Blocpdb> 28 atoms in block 37
Block first atom: 1130
Blocpdb> 34 atoms in block 38
Block first atom: 1158
Blocpdb> 30 atoms in block 39
Block first atom: 1192
Blocpdb> 29 atoms in block 40
Block first atom: 1222
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 1251
Blocpdb> 34 atoms in block 42
Block first atom: 1276
Blocpdb> 35 atoms in block 43
Block first atom: 1310
Blocpdb> 35 atoms in block 44
Block first atom: 1345
Blocpdb> 37 atoms in block 45
Block first atom: 1380
Blocpdb> 32 atoms in block 46
Block first atom: 1417
Blocpdb> 28 atoms in block 47
Block first atom: 1449
Blocpdb> 29 atoms in block 48
Block first atom: 1477
Blocpdb> 30 atoms in block 49
Block first atom: 1506
Blocpdb> 31 atoms in block 50
Block first atom: 1536
Blocpdb> 29 atoms in block 51
Block first atom: 1567
Blocpdb> 37 atoms in block 52
Block first atom: 1596
Blocpdb> 24 atoms in block 53
Block first atom: 1633
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1657
Blocpdb> 28 atoms in block 55
Block first atom: 1687
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1715
Blocpdb> 31 atoms in block 57
Block first atom: 1748
Blocpdb> 39 atoms in block 58
Block first atom: 1779
Blocpdb> 39 atoms in block 59
Block first atom: 1818
Blocpdb> 31 atoms in block 60
Block first atom: 1857
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1888
Blocpdb> 33 atoms in block 62
Block first atom: 1921
Blocpdb> 34 atoms in block 63
Block first atom: 1954
Blocpdb> 39 atoms in block 64
Block first atom: 1988
Blocpdb> 27 atoms in block 65
Block first atom: 2027
Blocpdb> 28 atoms in block 66
Block first atom: 2054
Blocpdb> 27 atoms in block 67
Block first atom: 2082
Blocpdb> 41 atoms in block 68
Block first atom: 2109
Blocpdb> 42 atoms in block 69
Block first atom: 2150
Blocpdb> 38 atoms in block 70
Block first atom: 2192
Blocpdb> 33 atoms in block 71
Block first atom: 2230
Blocpdb> 42 atoms in block 72
Block first atom: 2263
Blocpdb> 32 atoms in block 73
Block first atom: 2305
Blocpdb> 30 atoms in block 74
Block first atom: 2337
Blocpdb> 30 atoms in block 75
Block first atom: 2367
Blocpdb> 36 atoms in block 76
Block first atom: 2397
Blocpdb> 35 atoms in block 77
Block first atom: 2433
Blocpdb> 31 atoms in block 78
Block first atom: 2468
Blocpdb> 34 atoms in block 79
Block first atom: 2499
Blocpdb> 34 atoms in block 80
Block first atom: 2533
Blocpdb> 25 atoms in block 81
Block first atom: 2567
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 2592
Blocpdb> 32 atoms in block 83
Block first atom: 2619
Blocpdb> 34 atoms in block 84
Block first atom: 2651
Blocpdb> 33 atoms in block 85
Block first atom: 2685
Blocpdb> 32 atoms in block 86
Block first atom: 2718
Blocpdb> 35 atoms in block 87
Block first atom: 2750
Blocpdb> 25 atoms in block 88
Block first atom: 2785
Blocpdb> 32 atoms in block 89
Block first atom: 2810
Blocpdb> 33 atoms in block 90
Block first atom: 2842
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2875
Blocpdb> 36 atoms in block 92
Block first atom: 2904
Blocpdb> 34 atoms in block 93
Block first atom: 2940
Blocpdb> 31 atoms in block 94
Block first atom: 2974
Blocpdb> 34 atoms in block 95
Block first atom: 3005
Blocpdb> 37 atoms in block 96
Block first atom: 3039
Blocpdb> 36 atoms in block 97
Block first atom: 3076
Blocpdb> 39 atoms in block 98
Block first atom: 3112
Blocpdb> 31 atoms in block 99
Block first atom: 3151
Blocpdb> 40 atoms in block 100
Block first atom: 3182
Blocpdb> 33 atoms in block 101
Block first atom: 3222
Blocpdb> 38 atoms in block 102
Block first atom: 3255
Blocpdb> 39 atoms in block 103
Block first atom: 3293
Blocpdb> 37 atoms in block 104
Block first atom: 3332
Blocpdb> 31 atoms in block 105
Block first atom: 3369
Blocpdb> 28 atoms in block 106
Block first atom: 3400
Blocpdb> 36 atoms in block 107
Block first atom: 3428
Blocpdb> 33 atoms in block 108
Block first atom: 3464
Blocpdb> 35 atoms in block 109
Block first atom: 3497
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 3532
Blocpdb> 30 atoms in block 111
Block first atom: 3564
Blocpdb> 32 atoms in block 112
Block first atom: 3594
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 3626
Blocpdb> 30 atoms in block 114
Block first atom: 3659
Blocpdb> 29 atoms in block 115
Block first atom: 3689
Blocpdb> 32 atoms in block 116
Block first atom: 3718
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 3750
Blocpdb> 30 atoms in block 118
Block first atom: 3778
Blocpdb> 29 atoms in block 119
Block first atom: 3808
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 3837
Blocpdb> 36 atoms in block 121
Block first atom: 3861
Blocpdb> 34 atoms in block 122
Block first atom: 3897
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 3931
Blocpdb> 33 atoms in block 124
Block first atom: 3956
Blocpdb> 30 atoms in block 125
Block first atom: 3989
Blocpdb> 32 atoms in block 126
Block first atom: 4019
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 4051
Blocpdb> 30 atoms in block 128
Block first atom: 4082
Blocpdb> 32 atoms in block 129
Block first atom: 4112
Blocpdb> 35 atoms in block 130
Block first atom: 4144
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 4179
Blocpdb> 32 atoms in block 132
Block first atom: 4204
Blocpdb> 28 atoms in block 133
Block first atom: 4236
Blocpdb> 46 atoms in block 134
Block first atom: 4264
Blocpdb> 33 atoms in block 135
Block first atom: 4310
Blocpdb> 34 atoms in block 136
Block first atom: 4343
Blocpdb> 28 atoms in block 137
Block first atom: 4377
Blocpdb> 33 atoms in block 138
Block first atom: 4405
Blocpdb> 33 atoms in block 139
Block first atom: 4438
Blocpdb> 33 atoms in block 140
Block first atom: 4471
Blocpdb> 31 atoms in block 141
Block first atom: 4504
Blocpdb> 26 atoms in block 142
Block first atom: 4535
Blocpdb> 33 atoms in block 143
Block first atom: 4561
Blocpdb> 35 atoms in block 144
Block first atom: 4594
Blocpdb> 27 atoms in block 145
Block first atom: 4629
Blocpdb> 28 atoms in block 146
Block first atom: 4656
Blocpdb> 39 atoms in block 147
Block first atom: 4684
Blocpdb> 30 atoms in block 148
Block first atom: 4723
Blocpdb> 30 atoms in block 149
Block first atom: 4753
Blocpdb> 32 atoms in block 150
Block first atom: 4783
Blocpdb> 42 atoms in block 151
Block first atom: 4815
Blocpdb> 30 atoms in block 152
Block first atom: 4857
Blocpdb> 27 atoms in block 153
Block first atom: 4887
Blocpdb> 31 atoms in block 154
Block first atom: 4914
Blocpdb> 29 atoms in block 155
Block first atom: 4945
Blocpdb> 36 atoms in block 156
Block first atom: 4974
Blocpdb> 31 atoms in block 157
Block first atom: 5010
Blocpdb> 12 atoms in block 158
Block first atom: 5040
Blocpdb> 158 blocks.
Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1741508 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 15156
Prepmat> Matrix trace = 3802840.0000
Prepmat> Last element read: 15156 15156 91.8188
Prepmat> 12562 lines saved.
Prepmat> 11273 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5052
RTB> Total mass = 5052.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5052
RTB> Number of blocks = 158
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 169265.6004
RTB> 43998 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 948
Diagstd> Nb of non-zero elements: 43998
Diagstd> Projected matrix trace = 169265.6004
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 948 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 169265.6004
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0002069 0.0004648 0.0015001 0.0038265
0.0090855 0.0209524 0.0441453 0.0740314 0.1842389
0.2542851 0.4186200 0.5976500 0.6903790 0.9125694
1.0610586 1.5584603 1.6963756 1.9110689 1.9383315
2.5938438 3.0130987 3.1133237 3.3890799 3.5334466
3.6322619 3.9548360 4.3063536 4.5556721 4.6587114
5.0496497 5.2900503 6.1316715 6.2792092 6.6017347
7.1706359 7.2553587 7.5369677 8.1038484 8.5006260
8.8233789 9.0083151 9.4864908 9.7367996 9.8772889
10.2900539 10.4685427 10.6706372 10.7794640 11.3988806
11.6101666 11.8758950 12.5250042 13.1102480 13.4827403
13.6202581 13.6562031 14.2745392 14.4876089 15.0246928
15.1448484 15.4346898 16.0993879 16.2948656 16.4455161
16.8210855 17.6971904 18.4560921 18.7501952 18.9549507
19.7276187 19.7541720 19.7983866 19.9655259 20.8112826
21.1043877 21.2098836 22.0791882 22.6508675 22.8521796
23.5809760 23.7355028 24.2971019 24.4911843 24.5352803
24.9648354 25.2806861 25.5722161 26.0996628 26.9542105
27.1212738 27.8818154 28.1466377 28.7376469 28.9256124
29.1988364 29.8642532 30.0897603 30.2440268 30.6575368
31.2038656
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034329 0.0034331 0.0034335 0.0034342
0.0034344 1.5621119 2.3412538 4.2058002 6.7173394
10.3507196 15.7185436 22.8158958 29.5463165 46.6107323
54.7590300 70.2595353 83.9496221 90.2275327 103.7356959
111.8574649 135.5636193 141.4348011 150.1182359 151.1852085
174.8908922 188.4959228 191.6052565 199.9107652 204.1242232
206.9587799 215.9531396 225.3461392 231.7776256 234.3841192
244.0202710 249.7613205 268.8962350 272.1120379 279.0129199
290.7864173 292.4992281 298.1217120 309.1298437 316.6071612
322.5616600 325.9245422 334.4629953 338.8468063 341.2826092
348.3406079 351.3487356 354.7239054 356.5281814 366.6286363
370.0108892 374.2212584 384.3122440 393.1884332 398.7350061
400.7633042 401.2917793 410.2762046 413.3268675 420.9185649
422.5982998 426.6229683 435.7124430 438.3496576 440.3713276
445.3713637 456.8224532 466.5145080 470.2168388 472.7772927
482.3170482 482.6415375 483.1813702 485.2166073 495.3871123
498.8634182 500.1087156 510.2544852 516.8180825 519.1096409
527.3223369 529.0472948 535.2695243 537.4031082 537.8866830
542.5748183 545.9963113 549.1354272 554.7696937 563.7786017
565.5230642 573.3975122 576.1141495 582.1312075 584.0318903
586.7837150 593.4322033 595.6685132 597.1935209 601.2622110
606.5959126
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5052
Rtb_to_modes> Number of blocs = 158
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0693E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6484E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5001E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8265E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0855E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0952E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4145E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4031E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1842
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2543
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4186
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5977
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6904
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9126
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.061
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.696
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.911
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.594
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.013
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.113
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.533
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.632
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.955
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.306
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.556
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.659
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.050
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.132
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.279
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.602
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.171
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.255
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.537
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.823
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.008
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.486
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.737
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.877
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.20
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 948 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
1.00003 1.00002 0.99999 0.99995 0.99996
0.99997 1.00003 1.00003 1.00002 1.00000
1.00003 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000
1.00003 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99997 0.99993 1.00000
1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00004 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99997 0.99995 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00004 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 90936 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
1.00003 1.00002 0.99999 0.99995 0.99996
0.99997 1.00003 1.00003 1.00002 1.00000
1.00003 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000
1.00003 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99997 0.99993 1.00000
1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00004 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99997 0.99995 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00004 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22123107561910511.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22123107561910511.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22123107561910511.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22123107561910511.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 629
First residue number = 27
Last residue number = 655
Number of atoms found = 5052
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0693E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6484E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5001E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8265E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0855E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0952E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4145E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4031E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1842
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2543
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4186
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5977
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.061
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.696
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.113
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.632
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.556
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.659
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.050
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.132
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.171
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.255
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.537
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.008
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.20
Bfactors> 106 vectors, 15156 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000207
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.082 for 629 C-alpha atoms.
Bfactors> = 24.500 +/- 21.95
Bfactors> = 80.871 +/- 18.24
Bfactors> Shiftng-fct= 56.372
Bfactors> Scaling-fct= 0.831
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22123107561910511.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22123107561910511.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.562
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.341
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.717
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.5
Chkmod> 106 vectors, 15156 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5052 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9798
0.0034 0.6829
0.0034 0.8407
0.0034 0.7175
0.0034 0.8956
0.0034 0.8505
1.5620 0.5947
2.3411 0.7182
4.2057 0.6038
6.7170 0.7016
10.3503 0.6626
15.7177 0.5544
22.8148 0.2725
29.5450 0.2028
46.6038 0.0952
54.7583 0.1074
70.2548 0.0303
83.9495 0.1006
90.2250 0.1222
103.7330 0.0644
111.8496 0.1359
135.5378 0.0969
141.4131 0.0731
150.1091 0.1203
151.1658 0.0635
174.8886 0.1322
188.4847 0.0351
191.5871 0.3536
199.8998 0.2197
204.1026 0.2363
206.9424 0.2915
215.9483 0.1836
225.3272 0.1266
231.7760 0.2397
234.3813 0.1799
244.0183 0.3200
249.7494 0.1914
268.8919 0.1276
272.0958 0.0838
279.0065 0.1214
290.7813 0.1352
292.4794 0.2318
298.1096 0.0456
309.1195 0.2840
316.6005 0.1211
322.5409 0.2423
325.9049 0.2725
334.4400 0.1963
338.8357 0.1826
341.2630 0.1131
348.3247 0.2314
351.3581 0.0759
354.6981 0.1591
356.5217 0.3050
366.6309 0.2424
369.9924 0.1183
374.2699 0.2873
384.3724 0.3421
393.1678 0.3981
398.6774 0.2876
400.7423 0.2491
401.3303 0.1846
410.1934 0.0881
413.3432 0.1608
420.8348 0.1962
422.5125 0.2785
426.5398 0.1353
435.7020 0.0602
438.2654 0.0770
440.4125 0.2518
445.3379 0.1594
456.8391 0.1919
466.5439 0.2229
470.1942 0.3073
472.6953 0.0925
482.3255 0.1524
482.5699 0.1286
483.1803 0.1673
485.2501 0.2168
495.3506 0.3056
498.7901 0.1549
500.0886 0.2265
510.2420 0.1658
516.7860 0.2599
519.0626 0.0598
527.2888 0.3337
529.0747 0.1988
535.2785 0.1723
537.3670 0.2226
537.9153 0.2531
542.4990 0.2724
545.9655 0.1006
549.0881 0.1874
554.7495 0.2210
563.7104 0.1837
565.4855 0.1274
573.3542 0.2028
576.1238 0.2469
582.1301 0.2747
584.0511 0.2291
586.7702 0.2917
593.3645 0.3145
595.6453 0.2965
597.1281 0.1867
601.2606 0.3053
606.5323 0.2891
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22123107561910511 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
making animated gifs
11 models are in 22123107561910511.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22123107561910511 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
making animated gifs
11 models are in 22123107561910511.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22123107561910511 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
making animated gifs
11 models are in 22123107561910511.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22123107561910511 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
making animated gifs
11 models are in 22123107561910511.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22123107561910511 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22123107561910511.eigenfacs
22123107561910511.atom
making animated gifs
11 models are in 22123107561910511.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22123107561910511.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22123107561910511.10.pdb
22123107561910511.11.pdb
22123107561910511.7.pdb
22123107561910511.8.pdb
22123107561910511.9.pdb
STDERR:
real 0m16.012s
user 0m15.952s
sys 0m0.056s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
