Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* AlphaFold_pred *

LOGs for ID: 22122913042579067

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 22122913042579067.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 22122913042579067.atom to be opened.

 Openam> File opened: 22122913042579067.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    500
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    500
            Number of atoms found    =   7880
            Mean number per residue  =     15.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     5.670945 +/-    23.854948 From:   -42.938000 To:    76.406000
 =     3.230216 +/-    15.172728 From:   -31.852000 To:    52.816000
 =    -3.411557 +/-    17.275707 From:   -54.000000 To:    39.737000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.8393 % Filled.
 Pdbmat>      5139543  non-zero elements.
 Pdbmat>       565902 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    143.63 +/-     51.80
         Maximum number =    249
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.131804E+07
 Pdbmat> Larger element =  865.845    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
500 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 22122913042579067.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 22122913042579067.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 22122913042579067.atom                                                                                                          

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  7880 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   500 residues.
 Blocpdb>    53 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    46 atoms in block      2
 Block first atom:     54
 Blocpdb>    56 atoms in block      3
 Block first atom:    100
 Blocpdb>    41 atoms in block      4
 Block first atom:    156
 Blocpdb>    43 atoms in block      5
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    55 atoms in block      6
 Block first atom:    240
 Blocpdb>    34 atoms in block      7
 Block first atom:    295
 Blocpdb>    50 atoms in block      8
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    55 atoms in block      9
 Block first atom:    379
 Blocpdb>    40 atoms in block     10
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    53 atoms in block     11
 Block first atom:    474
 Blocpdb>    35 atoms in block     12
 Block first atom:    527
 Blocpdb>    38 atoms in block     13
 Block first atom:    562
 Blocpdb>    55 atoms in block     14
 Block first atom:    600
 Blocpdb>    57 atoms in block     15
 Block first atom:    655
 Blocpdb>    50 atoms in block     16
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    48 atoms in block     17
 Block first atom:    762
 Blocpdb>    36 atoms in block     18
 Block first atom:    810
 Blocpdb>    56 atoms in block     19
 Block first atom:    846
 Blocpdb>    50 atoms in block     20
 Block first atom:    902
 Blocpdb>    51 atoms in block     21
 Block first atom:    952
 Blocpdb>    47 atoms in block     22
 Block first atom:   1003
 Blocpdb>    53 atoms in block     23
 Block first atom:   1050
 Blocpdb>    46 atoms in block     24
 Block first atom:   1103
 Blocpdb>    45 atoms in block     25
 Block first atom:   1149
 Blocpdb>    41 atoms in block     26
 Block first atom:   1194
 Blocpdb>    46 atoms in block     27
 Block first atom:   1235
 Blocpdb>    51 atoms in block     28
 Block first atom:   1281
 Blocpdb>    39 atoms in block     29
 Block first atom:   1332
 Blocpdb>    54 atoms in block     30
 Block first atom:   1371
 Blocpdb>    56 atoms in block     31
 Block first atom:   1425
 Blocpdb>    42 atoms in block     32
 Block first atom:   1481
 Blocpdb>    50 atoms in block     33
 Block first atom:   1523
 Blocpdb>    51 atoms in block     34
 Block first atom:   1573
 Blocpdb>    47 atoms in block     35
 Block first atom:   1624
 Blocpdb>    40 atoms in block     36
 Block first atom:   1671
 Blocpdb>    38 atoms in block     37
 Block first atom:   1711
 Blocpdb>    60 atoms in block     38
 Block first atom:   1749
 Blocpdb>    59 atoms in block     39
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    47 atoms in block     40
 Block first atom:   1868
 Blocpdb>    61 atoms in block     41
 Block first atom:   1915
 Blocpdb>    62 atoms in block     42
 Block first atom:   1976
 Blocpdb>    43 atoms in block     43
 Block first atom:   2038
 Blocpdb>    50 atoms in block     44
 Block first atom:   2081
 Blocpdb>    47 atoms in block     45
 Block first atom:   2131
 Blocpdb>    43 atoms in block     46
 Block first atom:   2178
 Blocpdb>    56 atoms in block     47
 Block first atom:   2221
 Blocpdb>    62 atoms in block     48
 Block first atom:   2277
 Blocpdb>    41 atoms in block     49
 Block first atom:   2339
 Blocpdb>    41 atoms in block     50
 Block first atom:   2380
 Blocpdb>    28 atoms in block     51
 Block first atom:   2421
 Blocpdb>    50 atoms in block     52
 Block first atom:   2449
 Blocpdb>    33 atoms in block     53
 Block first atom:   2499
 Blocpdb>    38 atoms in block     54
 Block first atom:   2532
 Blocpdb>    55 atoms in block     55
 Block first atom:   2570
 Blocpdb>    45 atoms in block     56
 Block first atom:   2625
 Blocpdb>    41 atoms in block     57
 Block first atom:   2670
 Blocpdb>    53 atoms in block     58
 Block first atom:   2711
 Blocpdb>    52 atoms in block     59
 Block first atom:   2764
 Blocpdb>    42 atoms in block     60
 Block first atom:   2816
 Blocpdb>    36 atoms in block     61
 Block first atom:   2858
 Blocpdb>    41 atoms in block     62
 Block first atom:   2894
 Blocpdb>    45 atoms in block     63
 Block first atom:   2935
 Blocpdb>    40 atoms in block     64
 Block first atom:   2980
 Blocpdb>    39 atoms in block     65
 Block first atom:   3020
 Blocpdb>    50 atoms in block     66
 Block first atom:   3059
 Blocpdb>    41 atoms in block     67
 Block first atom:   3109
 Blocpdb>    49 atoms in block     68
 Block first atom:   3150
 Blocpdb>    45 atoms in block     69
 Block first atom:   3199
 Blocpdb>    62 atoms in block     70
 Block first atom:   3244
 Blocpdb>    46 atoms in block     71
 Block first atom:   3306
 Blocpdb>    58 atoms in block     72
 Block first atom:   3352
 Blocpdb>    45 atoms in block     73
 Block first atom:   3410
 Blocpdb>    55 atoms in block     74
 Block first atom:   3455
 Blocpdb>    70 atoms in block     75
 Block first atom:   3510
 Blocpdb>    55 atoms in block     76
 Block first atom:   3580
 Blocpdb>    38 atoms in block     77
 Block first atom:   3635
 Blocpdb>    47 atoms in block     78
 Block first atom:   3673
 Blocpdb>    47 atoms in block     79
 Block first atom:   3720
 Blocpdb>    52 atoms in block     80
 Block first atom:   3767
 Blocpdb>    52 atoms in block     81
 Block first atom:   3819
 Blocpdb>    53 atoms in block     82
 Block first atom:   3871
 Blocpdb>    54 atoms in block     83
 Block first atom:   3924
 Blocpdb>    30 atoms in block     84
 Block first atom:   3978
 Blocpdb>    44 atoms in block     85
 Block first atom:   4008
 Blocpdb>    41 atoms in block     86
 Block first atom:   4052
 Blocpdb>    55 atoms in block     87
 Block first atom:   4093
 Blocpdb>    40 atoms in block     88
 Block first atom:   4148
 Blocpdb>    55 atoms in block     89
 Block first atom:   4188
 Blocpdb>    33 atoms in block     90
 Block first atom:   4243
 Blocpdb>    51 atoms in block     91
 Block first atom:   4276
 Blocpdb>    47 atoms in block     92
 Block first atom:   4327
 Blocpdb>    44 atoms in block     93
 Block first atom:   4374
 Blocpdb>    56 atoms in block     94
 Block first atom:   4418
 Blocpdb>    41 atoms in block     95
 Block first atom:   4474
 Blocpdb>    47 atoms in block     96
 Block first atom:   4515
 Blocpdb>    38 atoms in block     97
 Block first atom:   4562
 Blocpdb>    57 atoms in block     98
 Block first atom:   4600
 Blocpdb>    48 atoms in block     99
 Block first atom:   4657
 Blocpdb>    39 atoms in block    100
 Block first atom:   4705
 Blocpdb>    42 atoms in block    101
 Block first atom:   4744
 Blocpdb>    44 atoms in block    102
 Block first atom:   4786
 Blocpdb>    41 atoms in block    103
 Block first atom:   4830
 Blocpdb>    29 atoms in block    104
 Block first atom:   4871
 Blocpdb>    45 atoms in block    105
 Block first atom:   4900
 Blocpdb>    48 atoms in block    106
 Block first atom:   4945
 Blocpdb>    41 atoms in block    107
 Block first atom:   4993
 Blocpdb>    53 atoms in block    108
 Block first atom:   5034
 Blocpdb>    35 atoms in block    109
 Block first atom:   5087
 Blocpdb>    38 atoms in block    110
 Block first atom:   5122
 Blocpdb>    53 atoms in block    111
 Block first atom:   5160
 Blocpdb>    39 atoms in block    112
 Block first atom:   5213
 Blocpdb>    41 atoms in block    113
 Block first atom:   5252
 Blocpdb>    45 atoms in block    114
 Block first atom:   5293
 Blocpdb>    63 atoms in block    115
 Block first atom:   5338
 Blocpdb>    44 atoms in block    116
 Block first atom:   5401
 Blocpdb>    52 atoms in block    117
 Block first atom:   5445
 Blocpdb>    46 atoms in block    118
 Block first atom:   5497
 Blocpdb>    44 atoms in block    119
 Block first atom:   5543
 Blocpdb>    60 atoms in block    120
 Block first atom:   5587
 Blocpdb>    40 atoms in block    121
 Block first atom:   5647
 Blocpdb>    47 atoms in block    122
 Block first atom:   5687
 Blocpdb>    47 atoms in block    123
 Block first atom:   5734
 Blocpdb>    35 atoms in block    124
 Block first atom:   5781
 Blocpdb>    53 atoms in block    125
 Block first atom:   5816
 Blocpdb>    58 atoms in block    126
 Block first atom:   5869
 Blocpdb>    57 atoms in block    127
 Block first atom:   5927
 Blocpdb>    39 atoms in block    128
 Block first atom:   5984
 Blocpdb>    38 atoms in block    129
 Block first atom:   6023
 Blocpdb>    39 atoms in block    130
 Block first atom:   6061
 Blocpdb>    45 atoms in block    131
 Block first atom:   6100
 Blocpdb>    54 atoms in block    132
 Block first atom:   6145
 Blocpdb>    46 atoms in block    133
 Block first atom:   6199
 Blocpdb>    49 atoms in block    134
 Block first atom:   6245
 Blocpdb>    51 atoms in block    135
 Block first atom:   6294
 Blocpdb>    62 atoms in block    136
 Block first atom:   6345
 Blocpdb>    43 atoms in block    137
 Block first atom:   6407
 Blocpdb>    58 atoms in block    138
 Block first atom:   6450
 Blocpdb>    37 atoms in block    139
 Block first atom:   6508
 Blocpdb>    52 atoms in block    140
 Block first atom:   6545
 Blocpdb>    34 atoms in block    141
 Block first atom:   6597
 Blocpdb>    41 atoms in block    142
 Block first atom:   6631
 Blocpdb>    57 atoms in block    143
 Block first atom:   6672
 Blocpdb>    67 atoms in block    144
 Block first atom:   6729
 Blocpdb>    52 atoms in block    145
 Block first atom:   6796
 Blocpdb>    42 atoms in block    146
 Block first atom:   6848
 Blocpdb>    42 atoms in block    147
 Block first atom:   6890
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   6932
 Blocpdb>    54 atoms in block    149
 Block first atom:   6964
 Blocpdb>    55 atoms in block    150
 Block first atom:   7018
 Blocpdb>    55 atoms in block    151
 Block first atom:   7073
 Blocpdb>    47 atoms in block    152
 Block first atom:   7128
 Blocpdb>    49 atoms in block    153
 Block first atom:   7175
 Blocpdb>    45 atoms in block    154
 Block first atom:   7224
 Blocpdb>    38 atoms in block    155
 Block first atom:   7269
 Blocpdb>    32 atoms in block    156
 Block first atom:   7307
 Blocpdb>    51 atoms in block    157
 Block first atom:   7339
 Blocpdb>    50 atoms in block    158
 Block first atom:   7390
 Blocpdb>    55 atoms in block    159
 Block first atom:   7440
 Blocpdb>    60 atoms in block    160
 Block first atom:   7495
 Blocpdb>    49 atoms in block    161
 Block first atom:   7555
 Blocpdb>    49 atoms in block    162
 Block first atom:   7604
 Blocpdb>    52 atoms in block    163
 Block first atom:   7653
 Blocpdb>    43 atoms in block    164
 Block first atom:   7705
 Blocpdb>    55 atoms in block    165
 Block first atom:   7748
 Blocpdb>    43 atoms in block    166
 Block first atom:   7803
 Blocpdb>    35 atoms in block    167
 Block first atom:   7845

 Blocpdb>   167 blocks.

 Blocpdb> At most,     70 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    28 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      5139710 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      23640

 Prepmat> Matrix trace    =   11318040.0000
 Prepmat> Last element read:   23640  23640       184.9121
 Prepmat>        14029 lines saved.
 Prepmat>        12394 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  7880
 RTB> Total mass =        7880.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  7880
 RTB> Number of blocks =   167
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  364375.4894
 RTB>     56319 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =     1002
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    56319
 Diagstd> Projected matrix trace =  364375.4894

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>   1002 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 364375.4894
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0124496      0.0168587      0.0182151      0.0256119
      0.0666083      0.1346854      0.1656705      0.2165735      0.2806512
      0.3767520      0.5516919      0.7052204      0.8951430      0.9075080
      1.2266180      1.8171678      1.9629684      2.4132869      2.7051351
      2.8215213      3.8663815      4.1697238      4.2970971      4.4120481
      4.6038888      5.4756722      5.6646808      6.2823864      6.3389677
      6.9744482      7.4751948      7.5686609      8.6950033      9.2483467
     10.3263082     10.3403001     11.5362429     12.1959122     12.5685086
     12.6836589     12.9379110     13.6624341     14.0089231     15.2564850
     15.7839157     16.0881305     17.2268894     18.0793714     18.7100978
     19.2003811     19.9117548     20.7045370     21.4269735     21.9242353
     22.7189940     22.8802935     24.0813392     24.9747479     26.0883533
     26.5483382     28.1418596     28.3180148     28.8641789     29.9338808
     30.4966753     30.9278058     33.0452808     33.5582260     33.8232561
     34.4150060     35.9119257     36.5331453     37.2688861     38.1030248
     38.7060404     39.0478119     39.7744320     40.6552958     41.2423159
     42.2016411     42.5215587     43.2127685     43.8456807     44.5553814
     45.2293158     46.1270185     46.9073093     47.3633392     47.7627210
     49.3432762     50.0083840     51.1097372     51.6593589     52.6566815
     53.5951628     54.1099647     54.5647776     55.2733410     55.6979499
     56.3618518

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034305      0.0034318      0.0034326      0.0034334      0.0034360
      0.0034367     12.1163853     14.0996149     14.6558545     17.3786722
     28.0258824     39.8524973     44.1995561     50.5356614     57.5279288
     66.6535192     80.6572810     91.1922064    102.7404536    103.4476193
    120.2679596    146.3837243    152.1429867    168.6940490    178.6034158
    182.4050864    213.5244610    221.7424930    225.1038204    228.0948071
    233.0009508    254.1054629    258.4538475    272.1808738    273.4038024
    286.7808884    296.8974983    298.7478616    320.2065090    330.2382176
    348.9537106    349.1900432    368.8310505    379.2297724    384.9791013
    386.7386328    390.5956118    401.3833201    406.4411353    424.1529805
    431.4223662    435.5600821    450.7115770    461.7287775    469.7137888
    475.8282308    484.5627752    494.1150043    502.6615855    508.4608361
    517.5947096    519.4288599    532.8875793    542.6825247    554.6494847
    559.5178566    576.0652473    577.8653874    583.4113636    594.1235846
    599.6827109    603.9066820    624.2377141    629.0639205    631.5430896
    637.0436702    650.7506750    656.3550216    662.9312423    670.3089324
    675.5922405    678.5684008    684.8528595    692.3948722    697.3756877
    705.4397865    708.1085990    713.8407331    719.0493348    724.8453601
    730.3067069    737.5185912    743.7304127    747.3369183    750.4811876
    762.7975177    767.9212591    776.3313140    780.4943908    787.9923899
    794.9834312    798.7923660    802.1424036    807.3338060    810.4288363
    815.2445555

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   7880
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    167

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9798E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9875E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9968E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0016E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.2450E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.6859E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.8215E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.5612E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  6.6608E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1347    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1657    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2166    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2807    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3768    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5517    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7052    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8951    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9075    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.227    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.817    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.963    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.413    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.705    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.822    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.866    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.170    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.297    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.412    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.604    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.476    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.665    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.282    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.339    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.974    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.475    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.569    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.695    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.248    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.36    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with   1002 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99996 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000
 0.99995 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003
 1.00003 0.99998 0.99995 1.00005 1.00002
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997
 0.99999 1.00001 0.99996 0.99996 1.00001
 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>   141840 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99996 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000
 0.99995 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003
 1.00003 0.99998 0.99995 1.00005 1.00002
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997
 0.99999 1.00001 0.99996 0.99996 1.00001
 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22122913042579067.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22122913042579067.eigenfacs                                     
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 22122913042579067.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 22122913042579067.atom                                          
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    500
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    500
            Number of atoms found    =   7880
            Mean number per residue  =     15.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9798E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9875E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9968E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0016E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.2450E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.6859E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.8215E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.5612E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  6.6608E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1347    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1657    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2166    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2807    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3768    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5517    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7052    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8951    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9075    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.227    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.817    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.963    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.413    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.705    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.822    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.866    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.170    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.297    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.412    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.604    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.476    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.665    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.282    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.339    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.974    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.475    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.569    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.695    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.248    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.36    

 Bfactors>  106 vectors,  23640 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.012450
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.565 for    500 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.512 +/-   2.12
 Bfactors> =     87.622 +/-  15.38
 Bfactors> Shiftng-fct=     87.109
 Bfactors> Scaling-fct=      7.239

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22122913042579067.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22122913042579067.eigenfacs                                     

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   802.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   807.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   810.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   815.2    

 Chkmod>  106 vectors,  23640 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   7880 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    41 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7906
      0.0034      0.9830
      0.0034      0.5696
      0.0034      0.5716
      0.0034      0.7549
      0.0034      0.8760
     12.1161      0.0430
     14.0991      0.0809
     14.6552      0.1079
     17.3779      0.0587
     28.0246      0.3677
     39.8529      0.0604
     44.2016      0.4063
     50.5366      0.0938
     57.5305      0.0762
     66.6549      0.0487
     80.6544      0.0854
     91.1870      0.1992
    102.7336      0.0510
    103.4427      0.1321
    120.2815      0.2585
    146.3707      0.2215
    152.1377      0.2589
    168.6768      0.2084
    178.5913      0.0263
    182.4127      0.2257
    213.5048      0.1818
    221.7403      0.2587
    225.0916      0.1439
    228.0838      0.2302
    232.9938      0.3110
    254.1022      0.1417
    258.4500      0.1555
    272.1608      0.0219
    273.3928      0.3299
    286.7594      0.0317
    296.8809      0.1739
    298.7417      0.0520
    320.1927      0.4076
    330.2179      0.3071
    349.0011      0.0562
    349.1700      0.0430
    368.8753      0.3506
    379.2770      0.1539
    384.9854      0.2974
    386.6662      0.1933
    390.6104      0.2822
    401.3303      0.0285
    406.4393      0.2043
    424.1836      0.1995
    431.3503      0.3490
    435.5667      0.1240
    450.7329      0.4085
    461.7170      0.1196
    469.6924      0.3256
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    484.5206      0.3858
    494.0397      0.1869
    502.6755      0.2794
    508.3899      0.1035
    517.5839      0.0531
    519.4032      0.2855
    532.8499      0.3907
    542.6076      0.3546
    554.6432      0.4052
    559.5113      0.3591
    576.0215      0.2358
    577.8608      0.3105
    583.3441      0.4436
    594.0596      0.4666
    599.6897      0.0972
    603.9022      0.3111
    624.2555      0.5087
    629.0535      0.2684
    631.4856      0.0341
    637.0625      0.4098
    650.7053      0.2916
    656.2986      0.3639
    662.9127      0.2180
    670.2536      0.1763
    675.5978      0.3968
    678.5583      0.2622
    684.7853      0.4557
    692.4052      0.1366
    697.3262      0.3804
    705.3958      0.4581
    708.0652      0.3237
    713.7872      0.2567
    719.0539      0.2486
    724.8518      0.3345
    730.2809      0.2046
    737.5108      0.0408
    743.7198      0.4336
    747.2785      0.3002
    750.4276      0.4510
    762.7394      0.4152
    767.9007      0.2269
    776.3000      0.3380
    780.4657      0.3870
    787.9834      0.1339
    794.9852      0.2330
    798.7583      0.2126
    802.0729      0.2710
    807.2748      0.3452
    810.4090      0.3302
    815.1962      0.4772
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22122913042579067 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122913042579067.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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STDERR:

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If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
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*** AlphaFold_pred ***

LOGs for ID: 22122913042579067

output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* AlphaFold_pred *
