***  ALPHAFOLD_MODEL  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22122815071378961.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22122815071378961.atom to be opened.
Openam> File opened: 22122815071378961.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1855
First residue number = 1
Last residue number = 1855
Number of atoms found = 14569
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -9.858337 +/- 25.490043 From: -78.691000 To: 46.979000
= -0.245994 +/- 25.785588 From: -56.405000 To: 70.442000
= 24.704478 +/- 39.950993 From: -48.922000 To: 129.239000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5341 % Filled.
Pdbmat> 5101406 non-zero elements.
Pdbmat> 557208 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.49 +/- 28.52
Maximum number = 196
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.114416E+07
Pdbmat> Larger element = 691.931
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1855 non-zero elements, NRBL set to 10
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22122815071378961.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 10
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22122815071378961.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22122815071378961.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 14569 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 10 residue(s) per block.
Blocpdb> 1855 residues.
Blocpdb> 73 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 78 atoms in block 2
Block first atom: 74
Blocpdb> 86 atoms in block 3
Block first atom: 152
Blocpdb> 78 atoms in block 4
Block first atom: 238
Blocpdb> 75 atoms in block 5
Block first atom: 316
Blocpdb> 71 atoms in block 6
Block first atom: 391
Blocpdb> 77 atoms in block 7
Block first atom: 462
Blocpdb> 74 atoms in block 8
Block first atom: 539
Blocpdb> 92 atoms in block 9
Block first atom: 613
Blocpdb> 75 atoms in block 10
Block first atom: 705
Blocpdb> 87 atoms in block 11
Block first atom: 780
Blocpdb> 80 atoms in block 12
Block first atom: 867
Blocpdb> 88 atoms in block 13
Block first atom: 947
Blocpdb> 82 atoms in block 14
Block first atom: 1035
Blocpdb> 67 atoms in block 15
Block first atom: 1117
Blocpdb> 86 atoms in block 16
Block first atom: 1184
Blocpdb> 84 atoms in block 17
Block first atom: 1270
Blocpdb> 74 atoms in block 18
Block first atom: 1354
Blocpdb> 76 atoms in block 19
Block first atom: 1428
Blocpdb> 81 atoms in block 20
Block first atom: 1504
Blocpdb> 79 atoms in block 21
Block first atom: 1585
Blocpdb> 77 atoms in block 22
Block first atom: 1664
Blocpdb> 83 atoms in block 23
Block first atom: 1741
Blocpdb> 74 atoms in block 24
Block first atom: 1824
Blocpdb> 76 atoms in block 25
Block first atom: 1898
Blocpdb> 59 atoms in block 26
Block first atom: 1974
Blocpdb> 75 atoms in block 27
Block first atom: 2033
Blocpdb> 76 atoms in block 28
Block first atom: 2108
Blocpdb> 62 atoms in block 29
Block first atom: 2184
Blocpdb> 78 atoms in block 30
Block first atom: 2246
Blocpdb> 72 atoms in block 31
Block first atom: 2324
Blocpdb> 85 atoms in block 32
Block first atom: 2396
Blocpdb> 79 atoms in block 33
Block first atom: 2481
Blocpdb> 66 atoms in block 34
Block first atom: 2560
Blocpdb> 78 atoms in block 35
Block first atom: 2626
Blocpdb> 83 atoms in block 36
Block first atom: 2704
Blocpdb> 83 atoms in block 37
Block first atom: 2787
Blocpdb> 84 atoms in block 38
Block first atom: 2870
Blocpdb> 80 atoms in block 39
Block first atom: 2954
Blocpdb> 82 atoms in block 40
Block first atom: 3034
Blocpdb> 84 atoms in block 41
Block first atom: 3116
Blocpdb> 79 atoms in block 42
Block first atom: 3200
Blocpdb> 81 atoms in block 43
Block first atom: 3279
Blocpdb> 84 atoms in block 44
Block first atom: 3360
Blocpdb> 72 atoms in block 45
Block first atom: 3444
Blocpdb> 78 atoms in block 46
Block first atom: 3516
Blocpdb> 77 atoms in block 47
Block first atom: 3594
Blocpdb> 71 atoms in block 48
Block first atom: 3671
Blocpdb> 67 atoms in block 49
Block first atom: 3742
Blocpdb> 77 atoms in block 50
Block first atom: 3809
Blocpdb> 80 atoms in block 51
Block first atom: 3886
Blocpdb> 75 atoms in block 52
Block first atom: 3966
Blocpdb> 79 atoms in block 53
Block first atom: 4041
Blocpdb> 78 atoms in block 54
Block first atom: 4120
Blocpdb> 82 atoms in block 55
Block first atom: 4198
Blocpdb> 82 atoms in block 56
Block first atom: 4280
Blocpdb> 81 atoms in block 57
Block first atom: 4362
Blocpdb> 73 atoms in block 58
Block first atom: 4443
Blocpdb> 82 atoms in block 59
Block first atom: 4516
Blocpdb> 81 atoms in block 60
Block first atom: 4598
Blocpdb> 88 atoms in block 61
Block first atom: 4679
Blocpdb> 71 atoms in block 62
Block first atom: 4767
Blocpdb> 78 atoms in block 63
Block first atom: 4838
Blocpdb> 75 atoms in block 64
Block first atom: 4916
Blocpdb> 84 atoms in block 65
Block first atom: 4991
Blocpdb> 69 atoms in block 66
Block first atom: 5075
Blocpdb> 69 atoms in block 67
Block first atom: 5144
Blocpdb> 77 atoms in block 68
Block first atom: 5213
Blocpdb> 81 atoms in block 69
Block first atom: 5290
Blocpdb> 81 atoms in block 70
Block first atom: 5371
Blocpdb> 79 atoms in block 71
Block first atom: 5452
Blocpdb> 85 atoms in block 72
Block first atom: 5531
Blocpdb> 76 atoms in block 73
Block first atom: 5616
Blocpdb> 82 atoms in block 74
Block first atom: 5692
Blocpdb> 83 atoms in block 75
Block first atom: 5774
Blocpdb> 80 atoms in block 76
Block first atom: 5857
Blocpdb> 78 atoms in block 77
Block first atom: 5937
Blocpdb> 82 atoms in block 78
Block first atom: 6015
Blocpdb> 73 atoms in block 79
Block first atom: 6097
Blocpdb> 81 atoms in block 80
Block first atom: 6170
Blocpdb> 84 atoms in block 81
Block first atom: 6251
Blocpdb> 89 atoms in block 82
Block first atom: 6335
Blocpdb> 81 atoms in block 83
Block first atom: 6424
Blocpdb> 91 atoms in block 84
Block first atom: 6505
Blocpdb> 73 atoms in block 85
Block first atom: 6596
Blocpdb> 81 atoms in block 86
Block first atom: 6669
Blocpdb> 79 atoms in block 87
Block first atom: 6750
Blocpdb> 77 atoms in block 88
Block first atom: 6829
Blocpdb> 79 atoms in block 89
Block first atom: 6906
Blocpdb> 77 atoms in block 90
Block first atom: 6985
Blocpdb> 71 atoms in block 91
Block first atom: 7062
Blocpdb> 91 atoms in block 92
Block first atom: 7133
Blocpdb> 76 atoms in block 93
Block first atom: 7224
Blocpdb> 72 atoms in block 94
Block first atom: 7300
Blocpdb> 72 atoms in block 95
Block first atom: 7372
Blocpdb> 83 atoms in block 96
Block first atom: 7444
Blocpdb> 77 atoms in block 97
Block first atom: 7527
Blocpdb> 76 atoms in block 98
Block first atom: 7604
Blocpdb> 80 atoms in block 99
Block first atom: 7680
Blocpdb> 81 atoms in block 100
Block first atom: 7760
Blocpdb> 74 atoms in block 101
Block first atom: 7841
Blocpdb> 84 atoms in block 102
Block first atom: 7915
Blocpdb> 80 atoms in block 103
Block first atom: 7999
Blocpdb> 70 atoms in block 104
Block first atom: 8079
Blocpdb> 85 atoms in block 105
Block first atom: 8149
Blocpdb> 82 atoms in block 106
Block first atom: 8234
Blocpdb> 76 atoms in block 107
Block first atom: 8316
Blocpdb> 78 atoms in block 108
Block first atom: 8392
Blocpdb> 94 atoms in block 109
Block first atom: 8470
Blocpdb> 80 atoms in block 110
Block first atom: 8564
Blocpdb> 83 atoms in block 111
Block first atom: 8644
Blocpdb> 82 atoms in block 112
Block first atom: 8727
Blocpdb> 81 atoms in block 113
Block first atom: 8809
Blocpdb> 78 atoms in block 114
Block first atom: 8890
Blocpdb> 79 atoms in block 115
Block first atom: 8968
Blocpdb> 84 atoms in block 116
Block first atom: 9047
Blocpdb> 82 atoms in block 117
Block first atom: 9131
Blocpdb> 81 atoms in block 118
Block first atom: 9213
Blocpdb> 86 atoms in block 119
Block first atom: 9294
Blocpdb> 82 atoms in block 120
Block first atom: 9380
Blocpdb> 77 atoms in block 121
Block first atom: 9462
Blocpdb> 74 atoms in block 122
Block first atom: 9539
Blocpdb> 73 atoms in block 123
Block first atom: 9613
Blocpdb> 80 atoms in block 124
Block first atom: 9686
Blocpdb> 78 atoms in block 125
Block first atom: 9766
Blocpdb> 75 atoms in block 126
Block first atom: 9844
Blocpdb> 75 atoms in block 127
Block first atom: 9919
Blocpdb> 71 atoms in block 128
Block first atom: 9994
Blocpdb> 79 atoms in block 129
Block first atom: 10065
Blocpdb> 77 atoms in block 130
Block first atom: 10144
Blocpdb> 71 atoms in block 131
Block first atom: 10221
Blocpdb> 77 atoms in block 132
Block first atom: 10292
Blocpdb> 82 atoms in block 133
Block first atom: 10369
Blocpdb> 71 atoms in block 134
Block first atom: 10451
Blocpdb> 84 atoms in block 135
Block first atom: 10522
Blocpdb> 89 atoms in block 136
Block first atom: 10606
Blocpdb> 77 atoms in block 137
Block first atom: 10695
Blocpdb> 76 atoms in block 138
Block first atom: 10772
Blocpdb> 71 atoms in block 139
Block first atom: 10848
Blocpdb> 84 atoms in block 140
Block first atom: 10919
Blocpdb> 80 atoms in block 141
Block first atom: 11003
Blocpdb> 86 atoms in block 142
Block first atom: 11083
Blocpdb> 70 atoms in block 143
Block first atom: 11169
Blocpdb> 66 atoms in block 144
Block first atom: 11239
Blocpdb> 82 atoms in block 145
Block first atom: 11305
Blocpdb> 75 atoms in block 146
Block first atom: 11387
Blocpdb> 68 atoms in block 147
Block first atom: 11462
Blocpdb> 67 atoms in block 148
Block first atom: 11530
Blocpdb> 81 atoms in block 149
Block first atom: 11597
Blocpdb> 85 atoms in block 150
Block first atom: 11678
Blocpdb> 81 atoms in block 151
Block first atom: 11763
Blocpdb> 92 atoms in block 152
Block first atom: 11844
Blocpdb> 74 atoms in block 153
Block first atom: 11936
Blocpdb> 92 atoms in block 154
Block first atom: 12010
Blocpdb> 88 atoms in block 155
Block first atom: 12102
Blocpdb> 74 atoms in block 156
Block first atom: 12190
Blocpdb> 86 atoms in block 157
Block first atom: 12264
Blocpdb> 96 atoms in block 158
Block first atom: 12350
Blocpdb> 69 atoms in block 159
Block first atom: 12446
Blocpdb> 84 atoms in block 160
Block first atom: 12515
Blocpdb> 77 atoms in block 161
Block first atom: 12599
Blocpdb> 86 atoms in block 162
Block first atom: 12676
Blocpdb> 73 atoms in block 163
Block first atom: 12762
Blocpdb> 83 atoms in block 164
Block first atom: 12835
Blocpdb> 70 atoms in block 165
Block first atom: 12918
Blocpdb> 82 atoms in block 166
Block first atom: 12988
Blocpdb> 77 atoms in block 167
Block first atom: 13070
Blocpdb> 79 atoms in block 168
Block first atom: 13147
Blocpdb> 81 atoms in block 169
Block first atom: 13226
Blocpdb> 85 atoms in block 170
Block first atom: 13307
Blocpdb> 85 atoms in block 171
Block first atom: 13392
Blocpdb> 70 atoms in block 172
Block first atom: 13477
Blocpdb> 77 atoms in block 173
Block first atom: 13547
Blocpdb> 67 atoms in block 174
Block first atom: 13624
Blocpdb> 84 atoms in block 175
Block first atom: 13691
Blocpdb> 75 atoms in block 176
Block first atom: 13775
Blocpdb> 66 atoms in block 177
Block first atom: 13850
Blocpdb> 86 atoms in block 178
Block first atom: 13916
Blocpdb> 78 atoms in block 179
Block first atom: 14002
Blocpdb> 70 atoms in block 180
Block first atom: 14080
Blocpdb> 76 atoms in block 181
Block first atom: 14150
Blocpdb> 74 atoms in block 182
Block first atom: 14226
Blocpdb> 76 atoms in block 183
Block first atom: 14300
Blocpdb> 77 atoms in block 184
Block first atom: 14376
Blocpdb> 76 atoms in block 185
Block first atom: 14453
Blocpdb> 41 atoms in block 186
Block first atom: 14528
Blocpdb> 186 blocks.
Blocpdb> At most, 96 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 41 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5101592 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 43707
Prepmat> Matrix trace = 11144160.0000
Prepmat> Last element read: 43707 43707 129.4549
Prepmat> 17392 lines saved.
Prepmat> 16269 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14569
RTB> Total mass = 14569.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 14569
RTB> Number of blocks = 186
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 154064.6501
RTB> 37602 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1116
Diagstd> Nb of non-zero elements: 37602
Diagstd> Projected matrix trace = 154064.6501
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1116 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 154064.6501
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0022030 0.0038912 0.0157921 0.0242856
0.0284655 0.0300759 0.0335552 0.0379398 0.0432238
0.0553682 0.0604090 0.0674618 0.0760334 0.0906949
0.0934663 0.1032190 0.1166439 0.1406025 0.1491923
0.1770141 0.1906511 0.2129801 0.2202124 0.2569584
0.2845121 0.3330803 0.3352497 0.3927236 0.4254479
0.4513229 0.4583232 0.5492961 0.5663662 0.5960998
0.6684771 0.6872832 0.7252768 0.7337836 0.7463171
0.8009005 0.8267644 0.8466802 0.8568297 0.9279556
0.9986748 1.0723540 1.1369249 1.1779472 1.1940443
1.2724115 1.2763660 1.3235122 1.3704163 1.4515634
1.4866242 1.5867393 1.6221188 1.6890132 1.8107278
1.8254810 1.9187310 2.0566043 2.1367352 2.1811323
2.2522368 2.3150841 2.3812527 2.4260795 2.5239893
2.6924832 2.7672099 2.7821066 2.8928544 2.9622688
3.0902560 3.1633680 3.2205724 3.2736803 3.3401128
3.4673500 3.6959345 3.7791001 3.9844514 4.1186953
4.2837647 4.3381638 4.4114028 4.4397471 4.5504044
4.5652396 4.7727709 5.1019032 5.2046217 5.2779824
5.3958856 5.5730421 5.7042905 5.9323776 6.0560678
6.0717177
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034329 0.0034337 0.0034338 0.0034340
0.0034344 5.0968297 6.7738634 13.6463309 16.9227183
18.3212316 18.8323562 19.8918426 21.1515785 22.5765057
25.5520231 26.6898433 28.2048810 29.9431515 32.7029382
33.1988375 34.8879226 37.0873901 40.7184962 41.9438713
45.6876965 47.4149049 50.1146576 50.9584466 55.0461144
57.9222822 62.6714486 62.8752118 68.0516712 70.8301991
72.9522925 73.5158830 80.4819582 81.7229363 83.8406760
88.7847843 90.0250047 92.4798589 93.0206297 93.8116938
97.1817178 98.7384158 99.9205908 100.5176991 104.6065516
108.5193882 112.4512698 115.7873627 117.8577613 118.6603174
122.4923787 122.6825785 124.9278453 127.1222389 130.8317891
132.4024064 136.7880225 138.3045929 141.1275508 146.1241040
146.7181824 150.4188728 155.7294145 158.7342463 160.3748570
162.9679889 165.2261050 167.5706760 169.1405727 172.5198370
178.1852630 180.6410009 181.1265691 184.6964585 186.8992291
190.8941009 193.1390713 194.8775504 196.4777680 198.4613085
202.2060380 208.7648678 211.1006037 216.7602026 220.3814898
224.7543374 226.1769031 228.0781260 228.8096809 231.6435840
232.0208783 237.2359887 245.2795760 247.7364246 249.4762745
252.2473699 256.3547941 259.3558794 264.4902548 267.2333435
267.5784079
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14569
Rtb_to_modes> Number of blocs = 186
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2030E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8912E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5792E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4286E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8465E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0076E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3555E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7940E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3224E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5368E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0409E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7462E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6033E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0695E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3466E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1032
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1166
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1406
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1492
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1770
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1907
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2202
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2570
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2845
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3352
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4254
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5664
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5961
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6685
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6873
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7463
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8268
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8467
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8568
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9987
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.072
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.137
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.272
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.276
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.324
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.452
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.487
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.622
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.689
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.919
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.057
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.137
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.181
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.252
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.315
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.381
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.524
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.767
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.782
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.893
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.962
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.221
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.467
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.696
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.779
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.411
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.440
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.278
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.396
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.573
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.704
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.932
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.056
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.072
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998
0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996
0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 262242 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998
0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996
0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22122815071378961.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22122815071378961.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22122815071378961.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22122815071378961.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1855
First residue number = 1
Last residue number = 1855
Number of atoms found = 14569
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2030E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8912E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5792E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4286E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8465E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0076E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3555E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7940E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3224E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5368E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0409E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7462E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6033E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0695E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3466E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1032
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1166
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1492
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1770
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1907
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2202
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2570
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2845
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3352
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4254
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4583
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5664
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6685
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6873
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7463
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8009
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8268
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8568
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.072
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.137
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.178
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.272
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.324
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.452
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.487
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.689
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.137
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.181
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.252
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.381
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.962
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.221
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.696
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.779
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.440
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.396
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.573
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.932
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.056
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.072
Bfactors> 106 vectors, 43707 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.002203
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.113 for 1855 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.234 +/- 1.56
Bfactors> = 91.858 +/- 58.17
Bfactors> Shiftng-fct= 90.624
Bfactors> Scaling-fct= 37.317
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22122815071378961.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22122815071378961.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.774
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6
Chkmod> 106 vectors, 43707 coordinates in file.
Chkmod> That is: 14569 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7398
0.0034 0.6538
0.0034 0.8522
0.0034 0.7461
0.0034 0.9652
0.0034 0.8734
5.0966 0.4132
6.7736 0.5448
13.6457 0.2640
16.9221 0.3325
18.3203 0.2369
18.8316 0.1236
19.8909 0.1578
21.1507 0.0308
22.5756 0.4974
25.5509 0.5032
26.6887 0.2894
28.2037 0.4340
29.9418 0.0913
32.7015 0.2886
33.1974 0.1958
34.8832 0.2543
37.0788 0.5760
40.7164 0.3833
41.9432 0.4204
45.6839 0.1179
47.4190 0.1712
50.1149 0.2621
50.9548 0.4439
55.0482 0.2938
57.9186 0.0307
62.6706 0.2576
62.8679 0.1334
68.0467 0.1223
70.8232 0.2050
72.9473 0.2854
73.5109 0.4692
80.4788 0.3249
81.7219 0.0815
83.8371 0.1808
88.7825 0.3101
90.0222 0.1577
92.4774 0.1177
93.0177 0.4108
93.8066 0.0514
97.1775 0.1765
98.7363 0.2076
99.9175 0.2875
100.5116 0.1403
104.6046 0.0363
108.5161 0.3906
112.4279 0.2043
115.7862 0.5049
117.8553 0.0480
118.6530 0.0408
122.4673 0.0932
122.6597 0.0229
124.9455 0.1240
127.0975 0.3284
130.8458 0.0375
132.4135 0.4325
136.7934 0.2166
138.2936 0.4689
141.1209 0.1677
146.1288 0.2191
146.6926 0.3219
150.4230 0.1542
155.7377 0.3229
158.7373 0.2255
160.3631 0.0749
162.9524 0.4213
165.2160 0.2379
167.5546 0.2788
169.1305 0.3258
172.5128 0.0558
178.1616 0.2351
180.6264 0.1914
181.1153 0.0644
184.6932 0.3104
186.8827 0.2050
190.8780 0.3312
193.1195 0.3382
194.8821 0.3880
196.4789 0.1573
198.4494 0.5383
202.1872 0.3619
208.7578 0.3989
211.0887 0.3249
216.7386 0.3513
220.3802 0.1981
224.7509 0.1627
226.1629 0.2245
228.0579 0.2679
228.8064 0.2156
231.6233 0.2463
232.0048 0.3191
237.2315 0.1668
245.2714 0.2011
247.7348 0.1255
249.4660 0.3302
252.2392 0.0539
256.3428 0.3593
259.3381 0.2560
264.4705 0.3269
267.2204 0.3222
267.5731 0.4246
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22122815071378961 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
making animated gifs
11 models are in 22122815071378961.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22122815071378961 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
making animated gifs
11 models are in 22122815071378961.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22122815071378961 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
making animated gifs
11 models are in 22122815071378961.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22122815071378961 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
making animated gifs
11 models are in 22122815071378961.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22122815071378961 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22122815071378961.eigenfacs
22122815071378961.atom
making animated gifs
11 models are in 22122815071378961.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22122815071378961.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22122815071378961.10.pdb
22122815071378961.11.pdb
22122815071378961.7.pdb
22122815071378961.8.pdb
22122815071378961.9.pdb
STDERR:
real 1m17.312s
user 1m16.976s
sys 0m0.244s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|