*** 01-JUN-22 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2212271600466321.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2212271600466321.atom to be opened.
Openam> File opened: 2212271600466321.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 628
First residue number = 1
Last residue number = 628
Number of atoms found = 4731
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -12.018832 +/- 46.713252 From: -119.643000 To: 88.026000
= 12.726205 +/- 18.869201 From: -28.953000 To: 59.315000
= 9.957108 +/- 50.080723 From: -67.409000 To: 123.231000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.4690 % Filled.
Pdbmat> 1479651 non-zero elements.
Pdbmat> 161280 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 68.18 +/- 26.05
Maximum number = 126
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 3.225600E+06
Pdbmat> Larger element = 475.506
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
628 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2212271600466321.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2212271600466321.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2212271600466321.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4731 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 628 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 25 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 29 atoms in block 3
Block first atom: 57
Blocpdb> 31 atoms in block 4
Block first atom: 86
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 117
Blocpdb> 28 atoms in block 6
Block first atom: 146
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 174
Blocpdb> 28 atoms in block 8
Block first atom: 204
Blocpdb> 32 atoms in block 9
Block first atom: 232
Blocpdb> 29 atoms in block 10
Block first atom: 264
Blocpdb> 31 atoms in block 11
Block first atom: 293
Blocpdb> 30 atoms in block 12
Block first atom: 324
Blocpdb> 31 atoms in block 13
Block first atom: 354
Blocpdb> 27 atoms in block 14
Block first atom: 385
Blocpdb> 29 atoms in block 15
Block first atom: 412
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 441
Blocpdb> 42 atoms in block 17
Block first atom: 479
Blocpdb> 32 atoms in block 18
Block first atom: 521
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 553
Blocpdb> 30 atoms in block 20
Block first atom: 580
Blocpdb> 31 atoms in block 21
Block first atom: 610
Blocpdb> 27 atoms in block 22
Block first atom: 641
Blocpdb> 31 atoms in block 23
Block first atom: 668
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 699
Blocpdb> 28 atoms in block 25
Block first atom: 735
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 763
Blocpdb> 27 atoms in block 27
Block first atom: 799
Blocpdb> 34 atoms in block 28
Block first atom: 826
Blocpdb> 28 atoms in block 29
Block first atom: 860
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 888
Blocpdb> 38 atoms in block 31
Block first atom: 916
Blocpdb> 31 atoms in block 32
Block first atom: 954
Blocpdb> 19 atoms in block 33
Block first atom: 985
Blocpdb> 25 atoms in block 34
Block first atom: 1004
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 1029
Blocpdb> 34 atoms in block 36
Block first atom: 1057
Blocpdb> 30 atoms in block 37
Block first atom: 1091
Blocpdb> 28 atoms in block 38
Block first atom: 1121
Blocpdb> 30 atoms in block 39
Block first atom: 1149
Blocpdb> 25 atoms in block 40
Block first atom: 1179
Blocpdb> 32 atoms in block 41
Block first atom: 1204
Blocpdb> 29 atoms in block 42
Block first atom: 1236
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 1265
Blocpdb> 33 atoms in block 44
Block first atom: 1291
Blocpdb> 24 atoms in block 45
Block first atom: 1324
Blocpdb> 31 atoms in block 46
Block first atom: 1348
Blocpdb> 45 atoms in block 47
Block first atom: 1379
Blocpdb> 32 atoms in block 48
Block first atom: 1424
Blocpdb> 30 atoms in block 49
Block first atom: 1456
Blocpdb> 32 atoms in block 50
Block first atom: 1486
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1518
Blocpdb> 31 atoms in block 52
Block first atom: 1551
Blocpdb> 32 atoms in block 53
Block first atom: 1582
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1614
Blocpdb> 27 atoms in block 55
Block first atom: 1640
Blocpdb> 35 atoms in block 56
Block first atom: 1667
Blocpdb> 39 atoms in block 57
Block first atom: 1702
Blocpdb> 35 atoms in block 58
Block first atom: 1741
Blocpdb> 32 atoms in block 59
Block first atom: 1776
Blocpdb> 26 atoms in block 60
Block first atom: 1808
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1834
Blocpdb> 34 atoms in block 62
Block first atom: 1867
Blocpdb> 31 atoms in block 63
Block first atom: 1901
Blocpdb> 31 atoms in block 64
Block first atom: 1932
Blocpdb> 33 atoms in block 65
Block first atom: 1963
Blocpdb> 36 atoms in block 66
Block first atom: 1996
Blocpdb> 35 atoms in block 67
Block first atom: 2032
Blocpdb> 36 atoms in block 68
Block first atom: 2067
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 2103
Blocpdb> 30 atoms in block 70
Block first atom: 2129
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2159
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 2190
Blocpdb> 33 atoms in block 73
Block first atom: 2221
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 2254
Blocpdb> 29 atoms in block 75
Block first atom: 2276
Blocpdb> 38 atoms in block 76
Block first atom: 2305
Blocpdb> 36 atoms in block 77
Block first atom: 2343
Blocpdb> 36 atoms in block 78
Block first atom: 2379
Blocpdb> 30 atoms in block 79
Block first atom: 2415
Blocpdb> 29 atoms in block 80
Block first atom: 2445
Blocpdb> 31 atoms in block 81
Block first atom: 2474
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 2505
Blocpdb> 30 atoms in block 83
Block first atom: 2532
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 2562
Blocpdb> 33 atoms in block 85
Block first atom: 2589
Blocpdb> 33 atoms in block 86
Block first atom: 2622
Blocpdb> 28 atoms in block 87
Block first atom: 2655
Blocpdb> 32 atoms in block 88
Block first atom: 2683
Blocpdb> 32 atoms in block 89
Block first atom: 2715
Blocpdb> 35 atoms in block 90
Block first atom: 2747
Blocpdb> 31 atoms in block 91
Block first atom: 2782
Blocpdb> 32 atoms in block 92
Block first atom: 2813
Blocpdb> 28 atoms in block 93
Block first atom: 2845
Blocpdb> 29 atoms in block 94
Block first atom: 2873
Blocpdb> 25 atoms in block 95
Block first atom: 2902
Blocpdb> 28 atoms in block 96
Block first atom: 2927
Blocpdb> 27 atoms in block 97
Block first atom: 2955
Blocpdb> 29 atoms in block 98
Block first atom: 2982
Blocpdb> 38 atoms in block 99
Block first atom: 3011
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 3049
Blocpdb> 26 atoms in block 101
Block first atom: 3079
Blocpdb> 27 atoms in block 102
Block first atom: 3105
Blocpdb> 28 atoms in block 103
Block first atom: 3132
Blocpdb> 32 atoms in block 104
Block first atom: 3160
Blocpdb> 26 atoms in block 105
Block first atom: 3192
Blocpdb> 32 atoms in block 106
Block first atom: 3218
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 3250
Blocpdb> 28 atoms in block 108
Block first atom: 3278
Blocpdb> 32 atoms in block 109
Block first atom: 3306
Blocpdb> 35 atoms in block 110
Block first atom: 3338
Blocpdb> 30 atoms in block 111
Block first atom: 3373
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 3403
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 3429
Blocpdb> 31 atoms in block 114
Block first atom: 3462
Blocpdb> 29 atoms in block 115
Block first atom: 3493
Blocpdb> 35 atoms in block 116
Block first atom: 3522
Blocpdb> 30 atoms in block 117
Block first atom: 3557
Blocpdb> 30 atoms in block 118
Block first atom: 3587
Blocpdb> 28 atoms in block 119
Block first atom: 3617
Blocpdb> 29 atoms in block 120
Block first atom: 3645
Blocpdb> 30 atoms in block 121
Block first atom: 3674
Blocpdb> 37 atoms in block 122
Block first atom: 3704
Blocpdb> 21 atoms in block 123
Block first atom: 3741
Blocpdb> 29 atoms in block 124
Block first atom: 3762
Blocpdb> 31 atoms in block 125
Block first atom: 3791
Blocpdb> 31 atoms in block 126
Block first atom: 3822
Blocpdb> 27 atoms in block 127
Block first atom: 3853
Blocpdb> 31 atoms in block 128
Block first atom: 3880
Blocpdb> 25 atoms in block 129
Block first atom: 3911
Blocpdb> 31 atoms in block 130
Block first atom: 3936
Blocpdb> 26 atoms in block 131
Block first atom: 3967
Blocpdb> 31 atoms in block 132
Block first atom: 3993
Blocpdb> 32 atoms in block 133
Block first atom: 4024
Blocpdb> 38 atoms in block 134
Block first atom: 4056
Blocpdb> 29 atoms in block 135
Block first atom: 4094
Blocpdb> 29 atoms in block 136
Block first atom: 4123
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 4152
Blocpdb> 27 atoms in block 138
Block first atom: 4176
Blocpdb> 24 atoms in block 139
Block first atom: 4203
Blocpdb> 25 atoms in block 140
Block first atom: 4227
Blocpdb> 31 atoms in block 141
Block first atom: 4252
Blocpdb> 30 atoms in block 142
Block first atom: 4283
Blocpdb> 36 atoms in block 143
Block first atom: 4313
Blocpdb> 28 atoms in block 144
Block first atom: 4349
Blocpdb> 30 atoms in block 145
Block first atom: 4377
Blocpdb> 40 atoms in block 146
Block first atom: 4407
Blocpdb> 25 atoms in block 147
Block first atom: 4447
Blocpdb> 27 atoms in block 148
Block first atom: 4472
Blocpdb> 25 atoms in block 149
Block first atom: 4499
Blocpdb> 26 atoms in block 150
Block first atom: 4524
Blocpdb> 34 atoms in block 151
Block first atom: 4550
Blocpdb> 28 atoms in block 152
Block first atom: 4584
Blocpdb> 24 atoms in block 153
Block first atom: 4612
Blocpdb> 19 atoms in block 154
Block first atom: 4636
Blocpdb> 24 atoms in block 155
Block first atom: 4655
Blocpdb> 25 atoms in block 156
Block first atom: 4679
Blocpdb> 28 atoms in block 157
Block first atom: 4703
Blocpdb> 157 blocks.
Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1479808 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14193
Prepmat> Matrix trace = 3225600.0000
Prepmat> Last element read: 14193 14193 26.3601
Prepmat> 12404 lines saved.
Prepmat> 11340 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4731
RTB> Total mass = 4731.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4731
RTB> Number of blocks = 157
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 146609.1760
RTB> 35913 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 942
Diagstd> Nb of non-zero elements: 35913
Diagstd> Projected matrix trace = 146609.1760
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 942 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 146609.1760
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000152 0.0000370 0.0001275 0.0002338
0.0002993 0.0006086 0.0006351 0.0012542 0.0019316
0.0023459 0.0029635 0.0048114 0.0068164 0.0100209
0.0131009 0.0160548 0.0214220 0.0293420 0.0323379
0.0357139 0.0492117 0.0618591 0.0729180 0.0778945
0.0879315 0.1087502 0.1193221 0.1582787 0.1698096
0.1891719 0.2166710 0.2241090 0.2581827 0.2735919
0.2901536 0.3230386 0.3600488 0.3636059 0.4096189
0.4508135 0.4873643 0.5047043 0.5550038 0.6055151
0.7152314 0.7628603 0.7806733 0.8377790 0.9114326
1.0549817 1.0909495 1.1617053 1.1947693 1.2971261
1.3564669 1.4198725 1.5121169 1.5850187 1.7657312
1.8739636 1.9719892 2.1145292 2.1364691 2.2098101
2.2765096 2.2980781 2.5108365 2.6222245 2.8811008
2.9471565 3.1468022 3.1782741 3.2577473 3.5443850
3.6804019 3.9666445 4.0786542 4.1725404 4.4255650
4.5188094 4.6088294 4.7183472 5.2305938 5.4226326
5.4622233 5.8762867 6.1439782 6.3794199 6.4599006
6.6265022 6.7452960 6.9637408 6.9672235 7.0869140
7.2089763 7.3727412 7.6226406 7.7496763 8.0759135
8.1304722
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034340
0.0034340 0.4229646 0.6608630 1.2262321 1.6604034
1.8786191 2.6789527 2.7365293 3.8456956 4.7725827
5.2595572 5.9115460 7.5323530 8.9654644 10.8705010
12.4292566 13.7593378 15.8937170 18.6011527 19.5276944
20.5217160 24.0895880 27.0082984 29.3232925 30.3074032
32.2008639 35.8104877 37.5107509 43.2022658 44.7482834
47.2306192 50.5470364 51.4073180 55.1770934 56.7998100
58.4937177 61.7195095 65.1592299 65.4803128 69.5000766
72.9111126 75.8092419 77.1460637 80.8990213 84.5002064
91.8371882 94.8457299 95.9466780 99.3939628 103.6710671
111.5366863 113.4220799 117.0424120 118.6963322 123.6762694
126.4735981 129.3957316 133.5328008 136.7138377 144.2970928
148.6537443 152.4921701 157.9072695 158.7243626 161.4257299
163.8438058 164.6181329 172.0697372 175.8450781 184.3208665
186.4218783 192.6326962 193.5935815 195.9990535 204.4399311
208.3257261 216.2752978 219.3076206 221.8173710 228.4439396
230.8379954 233.1259384 235.8795172 248.3537807 252.8717833
253.7932142 263.2369007 269.1659465 274.2747801 275.9994388
279.5358106 282.0303114 286.5606660 286.6323152 289.0838715
291.5627782 294.8558686 299.8113034 302.2992444 308.5965805
309.6372245
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4731
Rtb_to_modes> Number of blocs = 157
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5171E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7037E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2751E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3380E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9929E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0861E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3505E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2542E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9316E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3459E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9635E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8114E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8164E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0021E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3101E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6055E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1422E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9342E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2338E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5714E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9212E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1859E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.2918E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7895E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7932E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1088
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1193
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1698
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1892
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2167
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2241
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2582
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2902
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3230
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3636
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4096
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4874
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5047
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7152
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7629
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7807
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8378
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.162
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.195
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.356
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.420
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.512
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.585
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.874
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.972
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.115
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.136
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.277
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.298
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.511
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.622
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.544
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.680
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.967
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.173
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.519
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.609
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.718
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.231
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.423
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.462
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.876
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.144
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.745
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.967
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.087
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.209
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.373
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.623
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.076
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.130
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 942 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997
1.00002 1.00004 1.00002 0.99998 0.99997
1.00000 0.99995 1.00004 1.00005 1.00000
0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00004 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001
0.99999 1.00002 1.00005 0.99996 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 1.00001 0.99999
1.00003 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001
0.99996 0.99999 0.99996 0.99998 1.00003
0.99998 1.00004 1.00003 0.99998 1.00004
0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000
1.00001 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000
1.00004 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999
0.99998 1.00005 0.99999 1.00001 1.00004
1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 85158 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997
1.00002 1.00004 1.00002 0.99998 0.99997
1.00000 0.99995 1.00004 1.00005 1.00000
0.99998 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00004 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001
0.99999 1.00002 1.00005 0.99996 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 1.00001 0.99999
1.00003 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001
0.99996 0.99999 0.99996 0.99998 1.00003
0.99998 1.00004 1.00003 0.99998 1.00004
0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000
1.00001 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000
1.00004 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999
0.99998 1.00005 0.99999 1.00001 1.00004
1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2212271600466321.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2212271600466321.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2212271600466321.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2212271600466321.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 628
First residue number = 1
Last residue number = 628
Number of atoms found = 4731
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5171E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7037E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2751E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3380E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9929E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0861E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3505E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2542E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3459E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9635E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8114E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8164E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0021E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3101E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6055E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1422E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9342E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2338E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5714E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9212E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1859E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.2918E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7895E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7932E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1193
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1583
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1698
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1892
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2241
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2582
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2902
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3230
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4096
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7152
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7629
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7807
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8378
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.162
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.195
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.420
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.512
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.585
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.115
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.136
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.210
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.277
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.298
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.511
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.178
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.680
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.173
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.519
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.718
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.462
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.876
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.144
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.745
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.209
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.373
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.623
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.076
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.130
Bfactors> 106 vectors, 14193 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000015
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.511 for 628 C-alpha atoms.
Bfactors> = 434.521 +/- ******
Bfactors> = 83.847 +/- 17.87
Bfactors> Shiftng-fct= -350.673
Bfactors> Scaling-fct= 0.010
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2212271600466321.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2212271600466321.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.4229
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6608
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.226
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.660
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.879
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.846
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.772
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.259
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.965
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6
Chkmod> 106 vectors, 14193 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4731 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 53 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 77 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.5899
0.0034 0.6818
0.0034 0.6319
0.0034 0.9675
0.0034 0.9303
0.0034 0.9806
0.4229 0.0588
0.6608 0.0707
1.2262 0.0849
1.6603 0.1059
1.8785 0.0410
2.6788 0.0926
2.7364 0.1033
3.8456 0.2027
4.7724 0.1528
5.2593 0.0726
5.9112 0.2011
7.5320 0.1018
8.9651 0.2353
10.8701 0.3735
12.4288 0.2028
13.7588 0.2272
15.8930 0.0910
18.6004 0.1623
19.5269 0.1416
20.5209 0.1265
24.0886 0.5673
27.0071 0.1266
29.3220 0.5698
30.3062 0.1271
32.1996 0.0526
35.8172 0.3498
37.5057 0.2038
43.2033 0.2697
44.7451 0.4307
47.2321 0.2926
50.5482 0.1577
51.4041 0.1114
55.1766 0.3685
56.7982 0.1815
58.4959 0.3930
61.7132 0.1857
65.1520 0.5018
65.4770 0.0560
69.4955 0.1068
72.9069 0.0908
75.8088 0.0329
77.1424 0.0823
80.8953 0.4811
84.4955 0.3739
91.8312 0.0106
94.8441 0.4473
95.9442 0.1204
99.3909 0.0366
103.6648 0.6060
111.5329 0.3021
113.4198 0.0645
117.0522 0.0957
118.7027 0.1334
123.6649 0.0961
126.4464 0.4324
129.3960 0.0570
133.5219 0.2640
136.7072 0.0568
144.3019 0.2768
148.6488 0.0434
152.4860 0.1040
157.9181 0.3641
158.7001 0.2390
161.4257 0.0348
163.8544 0.0476
164.6083 0.1534
172.0680 0.3013
175.8300 0.1799
184.3097 0.1148
186.4089 0.4229
192.6305 0.0262
193.5769 0.2126
195.9982 0.3915
204.4201 0.1676
208.3054 0.1849
216.2757 0.2858
219.3075 0.3263
221.8201 0.0495
228.4454 0.0444
230.8330 0.5786
233.1202 0.2253
235.8607 0.0672
248.3528 0.0402
252.8695 0.4571
253.7771 0.0387
263.2192 0.3209
269.1549 0.2193
274.2540 0.6176
275.9897 0.1996
279.5343 0.1793
282.0120 0.0571
286.5537 0.1635
286.6154 0.1825
289.0732 0.0445
291.5507 0.2594
294.8484 0.2957
299.8055 0.1007
302.2926 0.1749
308.5850 0.2427
309.6149 0.5137
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2212271600466321 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
making animated gifs
11 models are in 2212271600466321.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2212271600466321 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
making animated gifs
11 models are in 2212271600466321.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2212271600466321 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
making animated gifs
11 models are in 2212271600466321.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2212271600466321 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
making animated gifs
11 models are in 2212271600466321.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2212271600466321 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2212271600466321.eigenfacs
2212271600466321.atom
making animated gifs
11 models are in 2212271600466321.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2212271600466321.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2212271600466321.10.pdb
2212271600466321.11.pdb
2212271600466321.7.pdb
2212271600466321.8.pdb
2212271600466321.9.pdb
STDERR:
real 0m15.447s
user 0m15.356s
sys 0m0.064s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
