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LOGs for ID: 22122120431932180

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22122120431932180.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22122120431932180.atom to be opened. Openam> File opened: 22122120431932180.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 638 First residue number = 7 Last residue number = 57 Number of atoms found = 10262 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.016056 +/- 14.506544 From: -47.151000 To: 34.402000 = 0.037277 +/- 11.077741 From: -26.033000 To: 27.950000 = -0.247474 +/- 23.587627 From: -48.670000 To: 54.381000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 10 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4424 % Filled. Pdbmat> 6835411 non-zero elements. Pdbmat> 752771 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 146.71 +/- 46.48 Maximum number = 240 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 1.505542E+07 Pdbmat> Larger element = 847.568 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 638 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22122120431932180.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22122120431932180.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22122120431932180.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10262 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 638 residues. Blocpdb> 77 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 54 atoms in block 2 Block first atom: 78 Blocpdb> 57 atoms in block 3 Block first atom: 132 Blocpdb> 62 atoms in block 4 Block first atom: 189 Blocpdb> 76 atoms in block 5 Block first atom: 251 Blocpdb> 71 atoms in block 6 Block first atom: 327 Blocpdb> 60 atoms in block 7 Block first atom: 398 Blocpdb> 52 atoms in block 8 Block first atom: 458 Blocpdb> 56 atoms in block 9 Block first atom: 510 Blocpdb> 71 atoms in block 10 Block first atom: 566 Blocpdb> 63 atoms in block 11 Block first atom: 637 Blocpdb> 60 atoms in block 12 Block first atom: 700 Blocpdb> 63 atoms in block 13 Block first atom: 760 Blocpdb> 74 atoms in block 14 Block first atom: 823 Blocpdb> 65 atoms in block 15 Block first atom: 897 Blocpdb> 82 atoms in block 16 Block first atom: 962 Blocpdb> 73 atoms in block 17 Block first atom: 1044 Blocpdb> 56 atoms in block 18 Block first atom: 1117 Blocpdb> 60 atoms in block 19 Block first atom: 1173 Blocpdb> 76 atoms in block 20 Block first atom: 1233 Blocpdb> 56 atoms in block 21 Block first atom: 1309 Blocpdb> 68 atoms in block 22 Block first atom: 1365 Blocpdb> 69 atoms in block 23 Block first atom: 1433 Blocpdb> 66 atoms in block 24 Block first atom: 1502 Blocpdb> 60 atoms in block 25 Block first atom: 1568 Blocpdb> 55 atoms in block 26 Block first atom: 1628 Blocpdb> 69 atoms in block 27 Block first atom: 1683 Blocpdb> 55 atoms in block 28 Block first atom: 1752 Blocpdb> 68 atoms in block 29 Block first atom: 1807 Blocpdb> 73 atoms in block 30 Block first atom: 1875 Blocpdb> 51 atoms in block 31 Block first atom: 1948 Blocpdb> 73 atoms in block 32 Block first atom: 1999 Blocpdb> 63 atoms in block 33 Block first atom: 2072 Blocpdb> 62 atoms in block 34 Block first atom: 2135 Blocpdb> 67 atoms in block 35 Block first atom: 2197 Blocpdb> 52 atoms in block 36 Block first atom: 2264 Blocpdb> 52 atoms in block 37 Block first atom: 2316 Blocpdb> 72 atoms in block 38 Block first atom: 2368 Blocpdb> 53 atoms in block 39 Block first atom: 2440 Blocpdb> 71 atoms in block 40 Block first atom: 2493 Blocpdb> 82 atoms in block 41 Block first atom: 2564 Blocpdb> 46 atoms in block 42 Block first atom: 2646 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 2692 Blocpdb> 59 atoms in block 44 Block first atom: 2761 Blocpdb> 58 atoms in block 45 Block first atom: 2820 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 2878 Blocpdb> 63 atoms in block 47 Block first atom: 2944 Blocpdb> 57 atoms in block 48 Block first atom: 3007 Blocpdb> 68 atoms in block 49 Block first atom: 3064 Blocpdb> 66 atoms in block 50 Block first atom: 3132 Blocpdb> 49 atoms in block 51 Block first atom: 3198 Blocpdb> 65 atoms in block 52 Block first atom: 3247 Blocpdb> 55 atoms in block 53 Block first atom: 3312 Blocpdb> 56 atoms in block 54 Block first atom: 3367 Blocpdb> 56 atoms in block 55 Block first atom: 3423 Blocpdb> 71 atoms in block 56 Block first atom: 3479 Blocpdb> 72 atoms in block 57 Block first atom: 3550 Blocpdb> 70 atoms in block 58 Block first atom: 3622 Blocpdb> 54 atoms in block 59 Block first atom: 3692 Blocpdb> 79 atoms in block 60 Block first atom: 3746 Blocpdb> 59 atoms in block 61 Block first atom: 3825 Blocpdb> 47 atoms in block 62 Block first atom: 3884 Blocpdb> 49 atoms in block 63 Block first atom: 3931 Blocpdb> 61 atoms in block 64 Block first atom: 3980 Blocpdb> 69 atoms in block 65 Block first atom: 4041 Blocpdb> 59 atoms in block 66 Block first atom: 4110 Blocpdb> 50 atoms in block 67 Block first atom: 4169 Blocpdb> 77 atoms in block 68 Block first atom: 4219 Blocpdb> 71 atoms in block 69 Block first atom: 4296 Blocpdb> 68 atoms in block 70 Block first atom: 4367 Blocpdb> 59 atoms in block 71 Block first atom: 4435 Blocpdb> 69 atoms in block 72 Block first atom: 4494 Blocpdb> 79 atoms in block 73 Block first atom: 4563 Blocpdb> 66 atoms in block 74 Block first atom: 4642 Blocpdb> 67 atoms in block 75 Block first atom: 4708 Blocpdb> 68 atoms in block 76 Block first atom: 4775 Blocpdb> 77 atoms in block 77 Block first atom: 4843 Blocpdb> 84 atoms in block 78 Block first atom: 4920 Blocpdb> 65 atoms in block 79 Block first atom: 5004 Blocpdb> 68 atoms in block 80 Block first atom: 5069 Blocpdb> 71 atoms in block 81 Block first atom: 5137 Blocpdb> 60 atoms in block 82 Block first atom: 5208 Blocpdb> 56 atoms in block 83 Block first atom: 5268 Blocpdb> 74 atoms in block 84 Block first atom: 5324 Blocpdb> 67 atoms in block 85 Block first atom: 5398 Blocpdb> 63 atoms in block 86 Block first atom: 5465 Blocpdb> 50 atoms in block 87 Block first atom: 5528 Blocpdb> 76 atoms in block 88 Block first atom: 5578 Blocpdb> 57 atoms in block 89 Block first atom: 5654 Blocpdb> 72 atoms in block 90 Block first atom: 5711 Blocpdb> 68 atoms in block 91 Block first atom: 5783 Blocpdb> 80 atoms in block 92 Block first atom: 5851 Blocpdb> 55 atoms in block 93 Block first atom: 5931 Blocpdb> 54 atoms in block 94 Block first atom: 5986 Blocpdb> 63 atoms in block 95 Block first atom: 6040 Blocpdb> 52 atoms in block 96 Block first atom: 6103 Blocpdb> 68 atoms in block 97 Block first atom: 6155 Blocpdb> 73 atoms in block 98 Block first atom: 6223 Blocpdb> 42 atoms in block 99 Block first atom: 6296 Blocpdb> 51 atoms in block 100 Block first atom: 6338 Blocpdb> 60 atoms in block 101 Block first atom: 6389 Blocpdb> 51 atoms in block 102 Block first atom: 6449 Blocpdb> 63 atoms in block 103 Block first atom: 6500 Blocpdb> 63 atoms in block 104 Block first atom: 6563 Blocpdb> 62 atoms in block 105 Block first atom: 6626 Blocpdb> 71 atoms in block 106 Block first atom: 6688 Blocpdb> 63 atoms in block 107 Block first atom: 6759 Blocpdb> 71 atoms in block 108 Block first atom: 6822 Blocpdb> 56 atoms in block 109 Block first atom: 6893 Blocpdb> 63 atoms in block 110 Block first atom: 6949 Blocpdb> 69 atoms in block 111 Block first atom: 7012 Blocpdb> 68 atoms in block 112 Block first atom: 7081 Blocpdb> 58 atoms in block 113 Block first atom: 7149 Blocpdb> 73 atoms in block 114 Block first atom: 7207 Blocpdb> 40 atoms in block 115 Block first atom: 7280 Blocpdb> 54 atoms in block 116 Block first atom: 7320 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 7374 Blocpdb> 64 atoms in block 118 Block first atom: 7434 Blocpdb> 64 atoms in block 119 Block first atom: 7498 Blocpdb> 68 atoms in block 120 Block first atom: 7562 Blocpdb> 62 atoms in block 121 Block first atom: 7630 Blocpdb> 63 atoms in block 122 Block first atom: 7692 Blocpdb> 55 atoms in block 123 Block first atom: 7755 Blocpdb> 60 atoms in block 124 Block first atom: 7810 Blocpdb> 79 atoms in block 125 Block first atom: 7870 Blocpdb> 60 atoms in block 126 Block first atom: 7949 Blocpdb> 62 atoms in block 127 Block first atom: 8009 Blocpdb> 53 atoms in block 128 Block first atom: 8071 Blocpdb> 78 atoms in block 129 Block first atom: 8124 Blocpdb> 56 atoms in block 130 Block first atom: 8202 Blocpdb> 62 atoms in block 131 Block first atom: 8258 Blocpdb> 55 atoms in block 132 Block first atom: 8320 Blocpdb> 67 atoms in block 133 Block first atom: 8375 Blocpdb> 65 atoms in block 134 Block first atom: 8442 Blocpdb> 70 atoms in block 135 Block first atom: 8507 Blocpdb> 52 atoms in block 136 Block first atom: 8577 Blocpdb> 58 atoms in block 137 Block first atom: 8629 Blocpdb> 60 atoms in block 138 Block first atom: 8687 Blocpdb> 56 atoms in block 139 Block first atom: 8747 Blocpdb> 65 atoms in block 140 Block first atom: 8803 Blocpdb> 49 atoms in block 141 Block first atom: 8868 Blocpdb> 61 atoms in block 142 Block first atom: 8917 Blocpdb> 68 atoms in block 143 Block first atom: 8978 Blocpdb> 70 atoms in block 144 Block first atom: 9046 Blocpdb> 58 atoms in block 145 Block first atom: 9116 Blocpdb> 74 atoms in block 146 Block first atom: 9174 Blocpdb> 56 atoms in block 147 Block first atom: 9248 Blocpdb> 64 atoms in block 148 Block first atom: 9304 Blocpdb> 59 atoms in block 149 Block first atom: 9368 Blocpdb> 64 atoms in block 150 Block first atom: 9427 Blocpdb> 51 atoms in block 151 Block first atom: 9491 Blocpdb> 54 atoms in block 152 Block first atom: 9542 Blocpdb> 74 atoms in block 153 Block first atom: 9596 Blocpdb> 76 atoms in block 154 Block first atom: 9670 Blocpdb> 71 atoms in block 155 Block first atom: 9746 Blocpdb> 63 atoms in block 156 Block first atom: 9817 Blocpdb> 69 atoms in block 157 Block first atom: 9880 Blocpdb> 121 atoms in block 158 Block first atom: 9949 Blocpdb> 30 atoms in block 159 Block first atom: 10070 Blocpdb> 129 atoms in block 160 Block first atom: 10100 Blocpdb> 34 atoms in block 161 Block first atom: 10228 Blocpdb> 161 blocks. Blocpdb> At most, 129 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6835572 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 30786 Prepmat> Matrix trace = 15055420.0000 Prepmat> Last element read: 30786 30786 44.3457 Prepmat> 13042 lines saved. Prepmat> 11413 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10262 RTB> Total mass = 10262.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10262 RTB> Number of blocks = 161 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 343947.5356 RTB> 56193 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 966 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56193 Diagstd> Projected matrix trace = 343947.5356 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 966 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 343947.5356 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2709500 1.7865949 2.4301968 3.2931771 3.6871053 4.3968403 4.7164520 5.3760356 6.2024511 7.3301367 8.2837387 8.5994802 8.8807499 11.1474852 11.5322290 12.6966402 13.3219028 14.2268809 14.3998250 15.5145198 16.8698000 17.8356398 18.1802921 18.8171908 19.3969664 21.0814167 21.3648417 22.9751574 24.3866396 25.6801635 26.5046561 26.8069091 27.7095374 28.3580536 29.1335001 29.9919790 30.3168616 31.7723666 32.9593862 33.7483289 34.9136814 35.4983885 36.6928669 37.8674111 38.4084496 39.0453356 39.5663004 40.5510333 40.9994295 41.1774317 42.0115114 42.5297962 43.9992152 45.7984080 47.8003160 48.4602204 49.5808626 50.2512678 51.3504344 52.2050757 52.5877019 54.8760757 55.9363859 56.1801365 57.1069436 58.0648267 59.2389036 59.8189936 60.1400363 60.5385968 61.7918780 62.9609689 63.1975901 63.8167934 63.8512048 64.7175519 65.8082547 67.0580405 68.1356654 68.3097719 69.2748679 70.3297304 71.0276434 71.1937856 73.2872400 73.5269191 74.5107682 74.7468923 75.4944029 75.9094269 77.4950265 78.3511756 78.8391078 79.6455793 81.3821615 82.4909137 83.1677309 83.7342462 83.9087534 85.0919191 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034291 0.0034297 0.0034308 0.0034318 0.0034329 0.0034347 122.4220116 145.1470882 169.2840354 197.0619716 208.5153579 227.7013611 235.8321380 251.7829683 270.4437524 294.0026988 312.5420635 318.4427604 323.6086347 362.5632088 368.7668800 386.9364895 396.3495868 409.5907390 412.0727422 427.7248171 446.0158037 458.6058882 463.0156905 471.0561456 478.2579384 498.5918517 501.9322717 520.5045477 536.2548836 550.2932329 559.0573576 562.2360016 571.6232938 578.2737652 586.1268441 594.6998677 597.9121806 612.0967347 623.4258957 630.8431865 641.6424711 646.9930261 657.7882372 668.2332592 672.9900895 678.5468840 683.0586606 691.5064622 695.3191446 696.8269007 703.8488952 708.1771848 720.3071822 734.8868416 750.7764896 755.9411250 764.6317363 769.7838436 778.1572015 784.6060364 787.4760904 804.4273048 812.1616564 813.9292861 820.6155434 827.4692187 835.7931092 839.8753426 842.1260914 844.9119559 853.6129154 861.6501770 863.2677946 867.4865889 867.7204415 873.5873175 880.9179646 889.2435211 896.3601303 897.5046306 903.8224687 910.6778145 915.1851890 916.2549278 929.6285723 931.1474635 937.3565116 938.8405748 943.5233612 946.1132762 955.9434367 961.2094654 964.1977878 969.1167905 979.6250693 986.2757099 990.3135164 993.6806612 994.7155675 1001.7040728 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10262 Rtb_to_modes> Number of blocs = 161 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9717E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9754E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9817E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.687 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.397 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.202 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.09 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 0.99995 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 184716 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 0.99995 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22122120431932180.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22122120431932180.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22122120431932180.atom Openam> file on opening on unit 11: 22122120431932180.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 638 First residue number = 7 Last residue number = 57 Number of atoms found = 10262 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9717E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9754E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9817E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.687 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.397 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.202 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.09 Bfactors> 106 vectors, 30786 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.271000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.008 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.008 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22122120431932180.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22122120431932180.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4290E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4296E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> 106 vectors, 30786 coordinates in file. Chkmod> That is: 10262 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22122120431932180.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22122120431932180.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22122120431932180 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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