*** HYDROLASE 06-MAY-21 7OG5 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22121317415457420.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22121317415457420.atom to be opened.
Openam> File opened: 22121317415457420.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1892
First residue number = 1
Last residue number = 189
Number of atoms found = 15444
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 110.616955 +/- 20.756687 From: 62.739000 To: 157.449000
= 103.657088 +/- 20.271896 From: 52.155000 To: 159.294000
= 104.564007 +/- 24.987815 From: 48.581000 To: 163.406000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5587 % Filled.
Pdbmat> 5996417 non-zero elements.
Pdbmat> 656077 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.96 +/- 20.45
Maximum number = 128
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.312154E+07
Pdbmat> Larger element = 519.393
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1892 non-zero elements, NRBL set to 10
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22121317415457420.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 10
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22121317415457420.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22121317415457420.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 15444 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 10 residue(s) per block.
Blocpdb> 1892 residues.
Blocpdb> 82 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 90 atoms in block 2
Block first atom: 83
Blocpdb> 76 atoms in block 3
Block first atom: 173
Blocpdb> 76 atoms in block 4
Block first atom: 249
Blocpdb> 86 atoms in block 5
Block first atom: 325
Blocpdb> 80 atoms in block 6
Block first atom: 411
Blocpdb> 81 atoms in block 7
Block first atom: 491
Blocpdb> 86 atoms in block 8
Block first atom: 572
Blocpdb> 85 atoms in block 9
Block first atom: 658
Blocpdb> 71 atoms in block 10
Block first atom: 743
Blocpdb> 78 atoms in block 11
Block first atom: 814
Blocpdb> 79 atoms in block 12
Block first atom: 892
Blocpdb> 75 atoms in block 13
Block first atom: 971
Blocpdb> 85 atoms in block 14
Block first atom: 1046
Blocpdb> 82 atoms in block 15
Block first atom: 1131
Blocpdb> 68 atoms in block 16
Block first atom: 1213
Blocpdb> 82 atoms in block 17
Block first atom: 1281
Blocpdb> 90 atoms in block 18
Block first atom: 1363
Blocpdb> 76 atoms in block 19
Block first atom: 1453
Blocpdb> 76 atoms in block 20
Block first atom: 1529
Blocpdb> 86 atoms in block 21
Block first atom: 1605
Blocpdb> 80 atoms in block 22
Block first atom: 1691
Blocpdb> 81 atoms in block 23
Block first atom: 1771
Blocpdb> 86 atoms in block 24
Block first atom: 1852
Blocpdb> 85 atoms in block 25
Block first atom: 1938
Blocpdb> 86 atoms in block 26
Block first atom: 2023
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 2109
Blocpdb> 95 atoms in block 28
Block first atom: 2128
Blocpdb> 81 atoms in block 29
Block first atom: 2223
Blocpdb> 80 atoms in block 30
Block first atom: 2304
Blocpdb> 67 atoms in block 31
Block first atom: 2384
Blocpdb> 85 atoms in block 32
Block first atom: 2451
Blocpdb> 83 atoms in block 33
Block first atom: 2536
Blocpdb> 38 atoms in block 34
Block first atom: 2619
Blocpdb> 82 atoms in block 35
Block first atom: 2657
Blocpdb> 90 atoms in block 36
Block first atom: 2739
Blocpdb> 76 atoms in block 37
Block first atom: 2829
Blocpdb> 76 atoms in block 38
Block first atom: 2905
Blocpdb> 86 atoms in block 39
Block first atom: 2981
Blocpdb> 80 atoms in block 40
Block first atom: 3067
Blocpdb> 81 atoms in block 41
Block first atom: 3147
Blocpdb> 86 atoms in block 42
Block first atom: 3228
Blocpdb> 85 atoms in block 43
Block first atom: 3314
Blocpdb> 71 atoms in block 44
Block first atom: 3399
Blocpdb> 78 atoms in block 45
Block first atom: 3470
Blocpdb> 79 atoms in block 46
Block first atom: 3548
Blocpdb> 75 atoms in block 47
Block first atom: 3627
Blocpdb> 85 atoms in block 48
Block first atom: 3702
Blocpdb> 82 atoms in block 49
Block first atom: 3787
Blocpdb> 68 atoms in block 50
Block first atom: 3869
Blocpdb> 82 atoms in block 51
Block first atom: 3937
Blocpdb> 90 atoms in block 52
Block first atom: 4019
Blocpdb> 76 atoms in block 53
Block first atom: 4109
Blocpdb> 76 atoms in block 54
Block first atom: 4185
Blocpdb> 86 atoms in block 55
Block first atom: 4261
Blocpdb> 80 atoms in block 56
Block first atom: 4347
Blocpdb> 81 atoms in block 57
Block first atom: 4427
Blocpdb> 86 atoms in block 58
Block first atom: 4508
Blocpdb> 85 atoms in block 59
Block first atom: 4594
Blocpdb> 71 atoms in block 60
Block first atom: 4679
Blocpdb> 78 atoms in block 61
Block first atom: 4750
Blocpdb> 79 atoms in block 62
Block first atom: 4828
Blocpdb> 75 atoms in block 63
Block first atom: 4907
Blocpdb> 85 atoms in block 64
Block first atom: 4982
Blocpdb> 82 atoms in block 65
Block first atom: 5067
Blocpdb> 68 atoms in block 66
Block first atom: 5149
Blocpdb> 82 atoms in block 67
Block first atom: 5217
Blocpdb> 90 atoms in block 68
Block first atom: 5299
Blocpdb> 76 atoms in block 69
Block first atom: 5389
Blocpdb> 76 atoms in block 70
Block first atom: 5465
Blocpdb> 86 atoms in block 71
Block first atom: 5541
Blocpdb> 80 atoms in block 72
Block first atom: 5627
Blocpdb> 81 atoms in block 73
Block first atom: 5707
Blocpdb> 86 atoms in block 74
Block first atom: 5788
Blocpdb> 85 atoms in block 75
Block first atom: 5874
Blocpdb> 71 atoms in block 76
Block first atom: 5959
Blocpdb> 78 atoms in block 77
Block first atom: 6030
Blocpdb> 79 atoms in block 78
Block first atom: 6108
Blocpdb> 75 atoms in block 79
Block first atom: 6187
Blocpdb> 85 atoms in block 80
Block first atom: 6262
Blocpdb> 82 atoms in block 81
Block first atom: 6347
Blocpdb> 68 atoms in block 82
Block first atom: 6429
Blocpdb> 87 atoms in block 83
Block first atom: 6497
Blocpdb> 87 atoms in block 84
Block first atom: 6584
Blocpdb> 79 atoms in block 85
Block first atom: 6671
Blocpdb> 74 atoms in block 86
Block first atom: 6750
Blocpdb> 86 atoms in block 87
Block first atom: 6824
Blocpdb> 79 atoms in block 88
Block first atom: 6910
Blocpdb> 81 atoms in block 89
Block first atom: 6989
Blocpdb> 86 atoms in block 90
Block first atom: 7070
Blocpdb> 86 atoms in block 91
Block first atom: 7156
Blocpdb> 62 atoms in block 92
Block first atom: 7242
Blocpdb> 78 atoms in block 93
Block first atom: 7304
Blocpdb> 79 atoms in block 94
Block first atom: 7382
Blocpdb> 75 atoms in block 95
Block first atom: 7461
Blocpdb> 85 atoms in block 96
Block first atom: 7536
Blocpdb> 82 atoms in block 97
Block first atom: 7621
Blocpdb> 68 atoms in block 98
Block first atom: 7703
Blocpdb> 82 atoms in block 99
Block first atom: 7771
Blocpdb> 90 atoms in block 100
Block first atom: 7853
Blocpdb> 76 atoms in block 101
Block first atom: 7943
Blocpdb> 76 atoms in block 102
Block first atom: 8019
Blocpdb> 86 atoms in block 103
Block first atom: 8095
Blocpdb> 80 atoms in block 104
Block first atom: 8181
Blocpdb> 81 atoms in block 105
Block first atom: 8261
Blocpdb> 86 atoms in block 106
Block first atom: 8342
Blocpdb> 85 atoms in block 107
Block first atom: 8428
Blocpdb> 71 atoms in block 108
Block first atom: 8513
Blocpdb> 78 atoms in block 109
Block first atom: 8584
Blocpdb> 79 atoms in block 110
Block first atom: 8662
Blocpdb> 75 atoms in block 111
Block first atom: 8741
Blocpdb> 85 atoms in block 112
Block first atom: 8816
Blocpdb> 82 atoms in block 113
Block first atom: 8901
Blocpdb> 68 atoms in block 114
Block first atom: 8983
Blocpdb> 82 atoms in block 115
Block first atom: 9051
Blocpdb> 90 atoms in block 116
Block first atom: 9133
Blocpdb> 76 atoms in block 117
Block first atom: 9223
Blocpdb> 76 atoms in block 118
Block first atom: 9299
Blocpdb> 86 atoms in block 119
Block first atom: 9375
Blocpdb> 80 atoms in block 120
Block first atom: 9461
Blocpdb> 81 atoms in block 121
Block first atom: 9541
Blocpdb> 86 atoms in block 122
Block first atom: 9622
Blocpdb> 85 atoms in block 123
Block first atom: 9708
Blocpdb> 71 atoms in block 124
Block first atom: 9793
Blocpdb> 78 atoms in block 125
Block first atom: 9864
Blocpdb> 79 atoms in block 126
Block first atom: 9942
Blocpdb> 75 atoms in block 127
Block first atom: 10021
Blocpdb> 85 atoms in block 128
Block first atom: 10096
Blocpdb> 82 atoms in block 129
Block first atom: 10181
Blocpdb> 68 atoms in block 130
Block first atom: 10263
Blocpdb> 82 atoms in block 131
Block first atom: 10331
Blocpdb> 90 atoms in block 132
Block first atom: 10413
Blocpdb> 76 atoms in block 133
Block first atom: 10503
Blocpdb> 76 atoms in block 134
Block first atom: 10579
Blocpdb> 86 atoms in block 135
Block first atom: 10655
Blocpdb> 80 atoms in block 136
Block first atom: 10741
Blocpdb> 81 atoms in block 137
Block first atom: 10821
Blocpdb> 86 atoms in block 138
Block first atom: 10902
Blocpdb> 85 atoms in block 139
Block first atom: 10988
Blocpdb> 71 atoms in block 140
Block first atom: 11073
Blocpdb> 78 atoms in block 141
Block first atom: 11144
Blocpdb> 79 atoms in block 142
Block first atom: 11222
Blocpdb> 75 atoms in block 143
Block first atom: 11301
Blocpdb> 85 atoms in block 144
Block first atom: 11376
Blocpdb> 82 atoms in block 145
Block first atom: 11461
Blocpdb> 68 atoms in block 146
Block first atom: 11543
Blocpdb> 82 atoms in block 147
Block first atom: 11611
Blocpdb> 90 atoms in block 148
Block first atom: 11693
Blocpdb> 76 atoms in block 149
Block first atom: 11783
Blocpdb> 76 atoms in block 150
Block first atom: 11859
Blocpdb> 86 atoms in block 151
Block first atom: 11935
Blocpdb> 80 atoms in block 152
Block first atom: 12021
Blocpdb> 81 atoms in block 153
Block first atom: 12101
Blocpdb> 86 atoms in block 154
Block first atom: 12182
Blocpdb> 85 atoms in block 155
Block first atom: 12268
Blocpdb> 71 atoms in block 156
Block first atom: 12353
Blocpdb> 78 atoms in block 157
Block first atom: 12424
Blocpdb> 79 atoms in block 158
Block first atom: 12502
Blocpdb> 75 atoms in block 159
Block first atom: 12581
Blocpdb> 85 atoms in block 160
Block first atom: 12656
Blocpdb> 82 atoms in block 161
Block first atom: 12741
Blocpdb> 68 atoms in block 162
Block first atom: 12823
Blocpdb> 82 atoms in block 163
Block first atom: 12891
Blocpdb> 90 atoms in block 164
Block first atom: 12973
Blocpdb> 76 atoms in block 165
Block first atom: 13063
Blocpdb> 76 atoms in block 166
Block first atom: 13139
Blocpdb> 86 atoms in block 167
Block first atom: 13215
Blocpdb> 80 atoms in block 168
Block first atom: 13301
Blocpdb> 81 atoms in block 169
Block first atom: 13381
Blocpdb> 86 atoms in block 170
Block first atom: 13462
Blocpdb> 85 atoms in block 171
Block first atom: 13548
Blocpdb> 71 atoms in block 172
Block first atom: 13633
Blocpdb> 78 atoms in block 173
Block first atom: 13704
Blocpdb> 79 atoms in block 174
Block first atom: 13782
Blocpdb> 75 atoms in block 175
Block first atom: 13861
Blocpdb> 85 atoms in block 176
Block first atom: 13936
Blocpdb> 82 atoms in block 177
Block first atom: 14021
Blocpdb> 68 atoms in block 178
Block first atom: 14103
Blocpdb> 87 atoms in block 179
Block first atom: 14171
Blocpdb> 87 atoms in block 180
Block first atom: 14258
Blocpdb> 79 atoms in block 181
Block first atom: 14345
Blocpdb> 74 atoms in block 182
Block first atom: 14424
Blocpdb> 86 atoms in block 183
Block first atom: 14498
Blocpdb> 79 atoms in block 184
Block first atom: 14584
Blocpdb> 81 atoms in block 185
Block first atom: 14663
Blocpdb> 86 atoms in block 186
Block first atom: 14744
Blocpdb> 86 atoms in block 187
Block first atom: 14830
Blocpdb> 62 atoms in block 188
Block first atom: 14916
Blocpdb> 78 atoms in block 189
Block first atom: 14978
Blocpdb> 79 atoms in block 190
Block first atom: 15056
Blocpdb> 75 atoms in block 191
Block first atom: 15135
Blocpdb> 85 atoms in block 192
Block first atom: 15210
Blocpdb> 82 atoms in block 193
Block first atom: 15295
Blocpdb> 68 atoms in block 194
Block first atom: 15376
Blocpdb> 194 blocks.
Blocpdb> At most, 95 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5996611 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 46332
Prepmat> Matrix trace = 13121540.0000
Prepmat> Last element read: 46332 46332 192.3791
Prepmat> 18916 lines saved.
Prepmat> 17444 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15444
RTB> Total mass = 15444.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 15444
RTB> Number of blocks = 194
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 184195.3573
RTB> 50046 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1164
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50046
Diagstd> Projected matrix trace = 184195.3573
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1164 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 184195.3573
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.8226254 1.0047130 1.2654643 1.4880066
1.5438249 2.0157501 2.6841471 2.7718375 3.2587340
3.4097982 3.5728214 3.7374600 3.8683058 4.0402387
4.1439859 4.5844479 4.7454762 4.9242680 5.0997699
5.3065350 5.7227103 5.8411296 5.9871752 6.1858081
6.2688285 7.5826176 7.7572721 8.1819228 8.2761599
8.6678555 8.7182764 8.9906064 9.2111143 9.5827630
9.7585410 9.9537442 10.0729473 10.2711350 10.5566310
10.7593302 10.8829446 11.1606432 11.5416450 11.9184592
12.0442237 12.5643346 13.1336563 13.3678001 13.5618967
13.7827523 14.1240417 14.3221726 14.6125386 14.8831741
15.1115404 15.4739596 15.6225321 15.9195158 16.5068555
16.6446496 16.9167366 17.3671311 17.6164507 17.9442718
18.4369443 18.6833636 18.9821776 19.2009359 19.5259490
19.9376474 20.7301526 21.1788111 21.5429735 22.2737781
22.7519703 22.8961122 23.0699602 23.5969006 23.7843407
24.2673917 24.6474871 25.4670788 25.5348621 25.7936186
26.6329059 26.7851709 27.4486649 27.9205827 28.3472569
28.5580806 28.7416930 29.6043017 29.6733167 30.2065983
30.5334889 31.1367981 31.6182457 31.9410290 32.4130515
33.0896392
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034331 0.0034334 0.0034337 0.0034342
0.0034349 98.4909514 108.8469569 122.1575254 132.4639515
134.9255803 154.1748823 177.9092138 180.7919793 196.0287353
200.5208887 205.2583971 209.9343750 213.5775904 218.2723856
221.0570719 232.5084811 236.5566594 240.9717446 245.2282908
250.1501661 259.7742865 262.4482625 265.7090002 270.0806691
271.8870204 299.0231816 302.4473573 310.6153899 312.3990584
319.7062389 320.6347559 325.6040309 329.5728034 336.1558351
339.2249029 342.6009152 344.6462531 348.0202372 352.8238630
356.1950649 358.2353917 362.7771234 368.9173974 374.8912781
376.8640292 384.9151701 393.5392947 397.0317617 399.9037687
403.1468362 408.1076878 410.9601699 415.1051453 418.9315427
422.1333340 427.1653426 429.2111472 433.2715847 441.1918230
443.0294623 446.6358439 452.5424473 455.7791841 460.0003902
466.2724468 469.3780895 473.1167206 475.8351045 479.8454219
484.8777282 494.4205685 499.7422510 504.0203874 512.4980585
517.9702136 519.6083870 521.5773256 527.5003612 529.5912958
534.9421639 539.1152346 548.0054106 548.7342129 551.5074927
560.4082981 562.0079914 568.9261459 573.7960035 578.1636722
580.3096438 582.1721870 590.8438111 591.5321126 596.8238785
600.0445509 605.9436733 610.6103550 613.7192304 618.2373513
624.6565472
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15444
Rtb_to_modes> Number of blocs = 194
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.09
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000
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1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
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1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
0.99997
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 277992 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
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1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
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1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
0.99997
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22121317415457420.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317415457420.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22121317415457420.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22121317415457420.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1892
First residue number = 1
Last residue number = 189
Number of atoms found = 15444
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.005
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.016
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.09
Bfactors> 106 vectors, 46332 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.822600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.519 for 1892 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.014 +/- 0.01
Bfactors> = 106.639 +/- 36.36
Bfactors> Shiftng-fct= 106.626
Bfactors> Scaling-fct= 3386.453
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22121317415457420.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317415457420.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.6
Chkmod> 106 vectors, 46332 coordinates in file.
Chkmod> That is: 15444 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9744
0.0034 0.9226
0.0034 0.7600
0.0034 0.8656
0.0034 0.8062
0.0034 0.8086
98.4852 0.4936
108.8578 0.5749
122.1299 0.7169
132.4580 0.6774
134.9274 0.7970
154.1778 0.5161
177.8967 0.1731
180.7895 0.7523
196.0283 0.5987
200.5182 0.6238
205.2547 0.6780
209.9124 0.5719
213.5600 0.6676
218.2566 0.5877
221.0480 0.4412
232.4871 0.2276
236.5346 0.2508
240.9548 0.3538
245.2233 0.4247
250.1504 0.2180
259.7697 0.5786
262.4341 0.6141
265.6937 0.6503
270.0733 0.4757
271.8791 0.5813
299.0179 0.7178
302.4291 0.6794
310.6035 0.6052
312.3826 0.5332
319.6952 0.5107
320.6159 0.5122
325.5972 0.4130
329.5566 0.5870
336.1456 0.4496
339.2183 0.5598
342.5906 0.6599
344.5810 0.5184
347.9861 0.4026
352.8650 0.3884
356.1909 0.3351
358.1715 0.6450
362.7511 0.6748
368.8753 0.4103
374.8994 0.3323
376.7818 0.4620
384.8322 0.5424
393.4676 0.5505
397.0474 0.4911
399.8586 0.2188
403.0893 0.3656
408.0318 0.4563
410.9114 0.2920
415.0513 0.4631
418.8689 0.5277
422.0937 0.2589
427.0924 0.5267
429.1579 0.4127
433.2596 0.4219
441.2149 0.5301
442.9486 0.4705
446.6597 0.5336
452.5604 0.5047
455.8055 0.4370
459.9259 0.2835
466.2911 0.3116
469.3157 0.4657
473.0693 0.4933
475.8031 0.4216
479.8746 0.2707
484.8855 0.4006
494.3975 0.5168
499.7348 0.5254
503.9640 0.4202
512.4326 0.4227
517.9256 0.5227
519.6302 0.6027
521.5554 0.4697
527.5124 0.2939
529.5202 0.3643
534.9479 0.4129
539.1196 0.4781
548.0133 0.5169
548.6584 0.2992
551.4451 0.2726
560.3537 0.3651
562.0345 0.5580
568.9156 0.4442
573.7654 0.5490
578.1668 0.3601
580.3042 0.5264
582.1301 0.3861
590.7755 0.2906
591.4737 0.4762
596.8319 0.4514
599.9845 0.3668
605.9488 0.2500
610.6011 0.4943
613.6830 0.4256
618.1817 0.5177
624.6331 0.3602
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 22121317415457420.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22121317415457420.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 22121317415457420.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22121317415457420.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 22121317415457420.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
22121317415457420.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.6
Projmod> 106 vectors, 46332 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1892
First residue number = 1
Last residue number = 189
Number of atoms found = 15444
Mean number per residue = 8.2
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2256
First residue number = 1
Last residue number = 190
Number of atoms found = 18564
Mean number per residue = 8.2
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 1 of first conformer: SER 1 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317415457420 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317415457420.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 165 14.313
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 165 14.328
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 165 14.342
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 165 14.357
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 165 14.373
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 165 14.388
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 165 14.403
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 165 14.419
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 165 14.435
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 165 14.451
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 165 14.467
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317415457420 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317415457420.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 165 14.305
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 165 14.321
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 165 14.337
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 165 14.353
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 165 14.370
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 165 14.388
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 165 14.406
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 165 14.424
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 165 14.443
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 165 14.462
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 165 14.481
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317415457420 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
22121317415457420.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 165 14.487
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 165 14.465
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 165 14.444
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 165 14.424
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 165 14.406
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 165 14.388
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 165 14.371
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 165 14.355
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 165 14.341
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 165 14.327
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 165 14.314
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317415457420 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
22121317415457420.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 165 14.458
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 165 14.443
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 165 14.429
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 165 14.415
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 165 14.401
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 165 14.388
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 165 14.374
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 165 14.361
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 165 14.348
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 165 14.336
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 165 14.323
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22121317415457420 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22121317415457420.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
22121317415457420.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
22121317415457420.eigenfacs
22121317415457420.atom
making animated gifs
11 models are in 22121317415457420.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22121317415457420.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 165 14.458
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 165 14.443
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 165 14.428
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 165 14.414
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 165 14.400
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 165 14.388
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 165 14.376
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 165 14.365
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 165 14.354
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 165 14.344
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 165 14.335
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real 1m26.596s
user 1m26.240s
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elNémo
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