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***  01-JUN-22  ***

LOGs for ID: 22120816585732199

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22120816585732199.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22120816585732199.atom to be opened. Openam> File opened: 22120816585732199.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 847 First residue number = 1 Last residue number = 847 Number of atoms found = 6849 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.336687 +/- 15.125759 From: -31.931000 To: 41.810000 = 1.006823 +/- 18.729468 From: -42.435000 To: 64.591000 = 0.516844 +/- 15.224816 From: -40.534000 To: 38.695000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2537 % Filled. Pdbmat> 2646648 non-zero elements. Pdbmat> 289556 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.55 +/- 23.22 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 5.791120E+06 Pdbmat> Larger element = 496.574 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 847 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22120816585732199.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22120816585732199.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22120816585732199.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6849 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 847 residues. Blocpdb> 37 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 42 atoms in block 2 Block first atom: 38 Blocpdb> 45 atoms in block 3 Block first atom: 80 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 125 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 163 Blocpdb> 40 atoms in block 6 Block first atom: 198 Blocpdb> 46 atoms in block 7 Block first atom: 238 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 284 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 328 Blocpdb> 37 atoms in block 10 Block first atom: 371 Blocpdb> 48 atoms in block 11 Block first atom: 408 Blocpdb> 37 atoms in block 12 Block first atom: 456 Blocpdb> 44 atoms in block 13 Block first atom: 493 Blocpdb> 48 atoms in block 14 Block first atom: 537 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 585 Blocpdb> 42 atoms in block 16 Block first atom: 632 Blocpdb> 51 atoms in block 17 Block first atom: 674 Blocpdb> 42 atoms in block 18 Block first atom: 725 Blocpdb> 42 atoms in block 19 Block first atom: 767 Blocpdb> 40 atoms in block 20 Block first atom: 809 Blocpdb> 36 atoms in block 21 Block first atom: 849 Blocpdb> 36 atoms in block 22 Block first atom: 885 Blocpdb> 43 atoms in block 23 Block first atom: 921 Blocpdb> 36 atoms in block 24 Block first atom: 964 Blocpdb> 44 atoms in block 25 Block first atom: 1000 Blocpdb> 39 atoms in block 26 Block first atom: 1044 Blocpdb> 28 atoms in block 27 Block first atom: 1083 Blocpdb> 35 atoms in block 28 Block first atom: 1111 Blocpdb> 35 atoms in block 29 Block first atom: 1146 Blocpdb> 34 atoms in block 30 Block first atom: 1181 Blocpdb> 30 atoms in block 31 Block first atom: 1215 Blocpdb> 40 atoms in block 32 Block first atom: 1245 Blocpdb> 48 atoms in block 33 Block first atom: 1285 Blocpdb> 45 atoms in block 34 Block first atom: 1333 Blocpdb> 45 atoms in block 35 Block first atom: 1378 Blocpdb> 39 atoms in block 36 Block first atom: 1423 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1462 Blocpdb> 45 atoms in block 38 Block first atom: 1511 Blocpdb> 42 atoms in block 39 Block first atom: 1556 Blocpdb> 43 atoms in block 40 Block first atom: 1598 Blocpdb> 44 atoms in block 41 Block first atom: 1641 Blocpdb> 42 atoms in block 42 Block first atom: 1685 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1727 Blocpdb> 46 atoms in block 44 Block first atom: 1762 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1808 Blocpdb> 41 atoms in block 46 Block first atom: 1843 Blocpdb> 38 atoms in block 47 Block first atom: 1884 Blocpdb> 38 atoms in block 48 Block first atom: 1922 Blocpdb> 48 atoms in block 49 Block first atom: 1960 Blocpdb> 34 atoms in block 50 Block first atom: 2008 Blocpdb> 43 atoms in block 51 Block first atom: 2042 Blocpdb> 45 atoms in block 52 Block first atom: 2085 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2130 Blocpdb> 39 atoms in block 54 Block first atom: 2171 Blocpdb> 38 atoms in block 55 Block first atom: 2210 Blocpdb> 40 atoms in block 56 Block first atom: 2248 Blocpdb> 43 atoms in block 57 Block first atom: 2288 Blocpdb> 44 atoms in block 58 Block first atom: 2331 Blocpdb> 45 atoms in block 59 Block first atom: 2375 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2420 Blocpdb> 32 atoms in block 61 Block first atom: 2468 Blocpdb> 44 atoms in block 62 Block first atom: 2500 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2544 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2586 Blocpdb> 31 atoms in block 65 Block first atom: 2623 Blocpdb> 42 atoms in block 66 Block first atom: 2654 Blocpdb> 36 atoms in block 67 Block first atom: 2696 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2732 Blocpdb> 37 atoms in block 69 Block first atom: 2773 Blocpdb> 37 atoms in block 70 Block first atom: 2810 Blocpdb> 45 atoms in block 71 Block first atom: 2847 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 2892 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 2934 Blocpdb> 47 atoms in block 74 Block first atom: 2975 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 3022 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 3066 Blocpdb> 37 atoms in block 77 Block first atom: 3105 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 3142 Blocpdb> 41 atoms in block 79 Block first atom: 3190 Blocpdb> 44 atoms in block 80 Block first atom: 3231 Blocpdb> 45 atoms in block 81 Block first atom: 3275 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3320 Blocpdb> 45 atoms in block 83 Block first atom: 3363 Blocpdb> 38 atoms in block 84 Block first atom: 3408 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 3446 Blocpdb> 44 atoms in block 86 Block first atom: 3489 Blocpdb> 43 atoms in block 87 Block first atom: 3533 Blocpdb> 38 atoms in block 88 Block first atom: 3576 Blocpdb> 39 atoms in block 89 Block first atom: 3614 Blocpdb> 31 atoms in block 90 Block first atom: 3653 Blocpdb> 34 atoms in block 91 Block first atom: 3684 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 3718 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 3757 Blocpdb> 43 atoms in block 94 Block first atom: 3795 Blocpdb> 42 atoms in block 95 Block first atom: 3838 Blocpdb> 44 atoms in block 96 Block first atom: 3880 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 3924 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3965 Blocpdb> 49 atoms in block 99 Block first atom: 4002 Blocpdb> 33 atoms in block 100 Block first atom: 4051 Blocpdb> 35 atoms in block 101 Block first atom: 4084 Blocpdb> 39 atoms in block 102 Block first atom: 4119 Blocpdb> 44 atoms in block 103 Block first atom: 4158 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 4202 Blocpdb> 44 atoms in block 105 Block first atom: 4240 Blocpdb> 35 atoms in block 106 Block first atom: 4284 Blocpdb> 47 atoms in block 107 Block first atom: 4319 Blocpdb> 39 atoms in block 108 Block first atom: 4366 Blocpdb> 43 atoms in block 109 Block first atom: 4405 Blocpdb> 45 atoms in block 110 Block first atom: 4448 Blocpdb> 46 atoms in block 111 Block first atom: 4493 Blocpdb> 39 atoms in block 112 Block first atom: 4539 Blocpdb> 39 atoms in block 113 Block first atom: 4578 Blocpdb> 43 atoms in block 114 Block first atom: 4617 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 4660 Blocpdb> 44 atoms in block 116 Block first atom: 4708 Blocpdb> 39 atoms in block 117 Block first atom: 4752 Blocpdb> 46 atoms in block 118 Block first atom: 4791 Blocpdb> 41 atoms in block 119 Block first atom: 4837 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 4878 Blocpdb> 40 atoms in block 121 Block first atom: 4922 Blocpdb> 30 atoms in block 122 Block first atom: 4962 Blocpdb> 38 atoms in block 123 Block first atom: 4992 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 5030 Blocpdb> 40 atoms in block 125 Block first atom: 5068 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 5108 Blocpdb> 38 atoms in block 127 Block first atom: 5141 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 5179 Blocpdb> 43 atoms in block 129 Block first atom: 5213 Blocpdb> 48 atoms in block 130 Block first atom: 5256 Blocpdb> 35 atoms in block 131 Block first atom: 5304 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 5339 Blocpdb> 38 atoms in block 133 Block first atom: 5375 Blocpdb> 35 atoms in block 134 Block first atom: 5413 Blocpdb> 31 atoms in block 135 Block first atom: 5448 Blocpdb> 31 atoms in block 136 Block first atom: 5479 Blocpdb> 44 atoms in block 137 Block first atom: 5510 Blocpdb> 32 atoms in block 138 Block first atom: 5554 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 5586 Blocpdb> 37 atoms in block 140 Block first atom: 5617 Blocpdb> 32 atoms in block 141 Block first atom: 5654 Blocpdb> 45 atoms in block 142 Block first atom: 5686 Blocpdb> 42 atoms in block 143 Block first atom: 5731 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 5773 Blocpdb> 39 atoms in block 145 Block first atom: 5809 Blocpdb> 39 atoms in block 146 Block first atom: 5848 Blocpdb> 47 atoms in block 147 Block first atom: 5887 Blocpdb> 41 atoms in block 148 Block first atom: 5934 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5975 Blocpdb> 39 atoms in block 150 Block first atom: 6015 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 6054 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 6096 Blocpdb> 40 atoms in block 153 Block first atom: 6139 Blocpdb> 49 atoms in block 154 Block first atom: 6179 Blocpdb> 49 atoms in block 155 Block first atom: 6228 Blocpdb> 39 atoms in block 156 Block first atom: 6277 Blocpdb> 43 atoms in block 157 Block first atom: 6316 Blocpdb> 39 atoms in block 158 Block first atom: 6359 Blocpdb> 43 atoms in block 159 Block first atom: 6398 Blocpdb> 43 atoms in block 160 Block first atom: 6441 Blocpdb> 40 atoms in block 161 Block first atom: 6484 Blocpdb> 28 atoms in block 162 Block first atom: 6524 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 6552 Blocpdb> 44 atoms in block 164 Block first atom: 6592 Blocpdb> 42 atoms in block 165 Block first atom: 6636 Blocpdb> 45 atoms in block 166 Block first atom: 6678 Blocpdb> 39 atoms in block 167 Block first atom: 6723 Blocpdb> 37 atoms in block 168 Block first atom: 6762 Blocpdb> 38 atoms in block 169 Block first atom: 6799 Blocpdb> 13 atoms in block 170 Block first atom: 6836 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2646818 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20547 Prepmat> Matrix trace = 5791120.0000 Prepmat> Last element read: 20547 20547 36.3513 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 12937 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6849 RTB> Total mass = 6849.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6849 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 200032.7907 RTB> 54978 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54978 Diagstd> Projected matrix trace = 200032.7907 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 200032.7907 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0708093 0.1592098 0.4818206 0.6388812 0.7150958 0.9433975 1.2828493 1.7222064 2.1741806 2.5127045 2.6089550 2.7790132 3.0973708 3.3754932 3.7190472 3.9740915 4.6640769 5.2679369 5.8459910 6.7629383 7.1330147 7.2065707 7.5269260 7.9324599 8.3721038 8.5275691 8.7424975 8.9643177 9.6820364 10.0301555 10.3817199 11.2662758 11.6836690 12.1423609 12.6256566 13.0816616 13.4787997 13.8591013 14.5669926 14.6969791 15.2759233 15.3892739 15.9030578 16.5239525 17.0416097 17.5154650 18.2125463 18.8855720 19.2952724 20.1192835 20.6631474 20.9015740 21.3044674 21.8264183 22.2943619 22.5178374 23.1029235 23.9998671 24.2045229 24.6387800 25.2527576 25.5433018 25.7678999 26.3020324 26.9369920 27.6632477 28.0535543 28.7044134 29.2486811 29.5037403 30.5579731 30.9545024 32.0120019 32.2519392 32.7339895 33.4415834 33.7653339 34.4585901 34.7771070 35.1773482 35.7129024 36.1437979 36.4727359 37.2737217 37.5235224 37.7927362 38.6927338 39.0838812 39.9298563 40.1849926 40.5252393 40.7109680 41.0481633 41.1555856 42.1409160 42.1864988 43.8963192 43.9436622 44.2611500 44.5196189 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034329 0.0034335 0.0034337 0.0034342 0.0034342 28.8961802 43.3291463 75.3768433 86.7971220 91.8284806 105.4733241 122.9937661 142.5075536 160.1190807 172.1337327 175.3995899 181.0258468 191.1137258 199.5096451 209.4166099 216.4782221 234.5190540 249.2387483 262.5574540 282.3988959 290.0225995 291.5141276 297.9230495 305.8434767 314.2046314 317.1085148 321.0798409 325.1276458 337.8925660 343.9134125 349.8887133 364.4898752 371.1802872 378.3962713 385.8533427 392.7595338 398.6767324 404.2619017 414.4577165 416.3027867 424.4231023 425.9948466 433.0475631 441.4202465 448.2812633 454.4709370 463.4262336 471.9112731 477.0025902 487.0813884 493.6208743 496.4605874 501.2225722 507.3252954 512.7348111 515.2981929 521.9498174 531.9853814 534.2487855 539.0200010 545.6946360 548.8248886 551.2324720 556.9163064 563.5985005 571.1456364 575.1607302 581.7945089 587.2843446 589.8394539 600.2850844 604.1672691 614.4006937 616.6989320 621.2905523 627.9697106 631.0021000 637.4469274 640.3862612 644.0607439 648.9449452 652.8481425 655.8121394 662.9742481 665.1920959 667.5740529 675.4761016 678.8817323 686.1896355 688.3783875 691.2864979 692.8687832 695.7322660 696.6420301 704.9320660 705.3132165 719.4644392 719.8523121 722.4480565 724.5544022 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6849 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0809E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1592 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4818 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.283 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.722 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.974 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.664 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.932 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00005 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 123282 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00005 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22120816585732199.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22120816585732199.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22120816585732199.atom Openam> file on opening on unit 11: 22120816585732199.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 847 First residue number = 1 Last residue number = 847 Number of atoms found = 6849 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0809E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1592 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4818 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7151 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.283 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.722 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.974 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.664 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.207 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.932 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52 Bfactors> 106 vectors, 20547 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.070809 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.377 for 847 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.074 +/- 0.45 Bfactors> = 92.650 +/- 10.00 Bfactors> Shiftng-fct= 92.575 Bfactors> Scaling-fct= 22.409 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22120816585732199.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22120816585732199.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 6849 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120816585732199.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120816585732199.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22120816585732199 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22120816585732199 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120816585732199.eigenfacs 22120816585732199.atom calculating perturbed 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