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please let us know.


***  7cyc_nma  ***

LOGs for ID: 22120805114639768

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 22120805114639768.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 22120805114639768.atom to be opened.

 Openam> File opened: 22120805114639768.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =   2877
            First residue number     =     48
            Last  residue number     =   1033
            Number of atoms found    =  21282
            Mean number per residue  =      7.4

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   140.029186 +/-    22.128218 From:    77.590000 To:   195.291000
 =   140.001890 +/-    22.144781 From:    75.782000 To:   190.293000
 =   139.956003 +/-    35.876846 From:    51.508000 To:   203.305000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is  -6.4789 % Filled.
 Pdbmat>      7081202  non-zero elements.
 Pdbmat>       772740 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     72.62 +/-     17.09
         Maximum number =    122
         Minimum number =      8

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.545480E+07
 Pdbmat> Larger element =  472.671    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2877 non-zero elements, NRBL set to 15
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 22120805114639768.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =         15
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 22120805114639768.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 22120805114639768.atom                                                                                                          

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb> 21282 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>    15 residue(s) per block.
 Blocpdb>  2877 residues.
 Blocpdb>   125 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>   105 atoms in block      2
 Block first atom:    126
 Blocpdb>   114 atoms in block      3
 Block first atom:    231
 Blocpdb>   107 atoms in block      4
 Block first atom:    345
 Blocpdb>   119 atoms in block      5
 Block first atom:    452
 Blocpdb>   122 atoms in block      6
 Block first atom:    571
 Blocpdb>   109 atoms in block      7
 Block first atom:    693
 Blocpdb>    17 atoms in block      8
 Block first atom:    802
 Blocpdb>   110 atoms in block      9
 Block first atom:    819
 Blocpdb>   109 atoms in block     10
 Block first atom:    929
 Blocpdb>   131 atoms in block     11
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    99 atoms in block     12
 Block first atom:   1169
 Blocpdb>   104 atoms in block     13
 Block first atom:   1268
 Blocpdb>   106 atoms in block     14
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>   119 atoms in block     15
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>   108 atoms in block     16
 Block first atom:   1597
 Blocpdb>   117 atoms in block     17
 Block first atom:   1705
 Blocpdb>   115 atoms in block     18
 Block first atom:   1822
 Blocpdb>   106 atoms in block     19
 Block first atom:   1937
 Blocpdb>   105 atoms in block     20
 Block first atom:   2043
 Blocpdb>   115 atoms in block     21
 Block first atom:   2148
 Blocpdb>   108 atoms in block     22
 Block first atom:   2263
 Blocpdb>   115 atoms in block     23
 Block first atom:   2371
 Blocpdb>   105 atoms in block     24
 Block first atom:   2486
 Blocpdb>   124 atoms in block     25
 Block first atom:   2591
 Blocpdb>    94 atoms in block     26
 Block first atom:   2715
 Blocpdb>   113 atoms in block     27
 Block first atom:   2809
 Blocpdb>   105 atoms in block     28
 Block first atom:   2922
 Blocpdb>   102 atoms in block     29
 Block first atom:   3027
 Blocpdb>   109 atoms in block     30
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>   112 atoms in block     31
 Block first atom:   3238
 Blocpdb>   109 atoms in block     32
 Block first atom:   3350
 Blocpdb>   116 atoms in block     33
 Block first atom:   3459
 Blocpdb>   107 atoms in block     34
 Block first atom:   3575
 Blocpdb>   101 atoms in block     35
 Block first atom:   3682
 Blocpdb>   101 atoms in block     36
 Block first atom:   3783
 Blocpdb>   119 atoms in block     37
 Block first atom:   3884
 Blocpdb>    99 atoms in block     38
 Block first atom:   4003
 Blocpdb>   112 atoms in block     39
 Block first atom:   4102
 Blocpdb>   112 atoms in block     40
 Block first atom:   4214
 Blocpdb>   114 atoms in block     41
 Block first atom:   4326
 Blocpdb>   107 atoms in block     42
 Block first atom:   4440
 Blocpdb>   105 atoms in block     43
 Block first atom:   4547
 Blocpdb>    84 atoms in block     44
 Block first atom:   4652
 Blocpdb>   109 atoms in block     45
 Block first atom:   4736
 Blocpdb>   107 atoms in block     46
 Block first atom:   4845
 Blocpdb>   105 atoms in block     47
 Block first atom:   4952
 Blocpdb>    92 atoms in block     48
 Block first atom:   5057
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 Block first atom:   5149
 Blocpdb>   116 atoms in block     50
 Block first atom:   5262
 Blocpdb>    77 atoms in block     51
 Block first atom:   5378
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 Block first atom:   5455
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 Block first atom:   5559
 Blocpdb>   116 atoms in block     54
 Block first atom:   5668
 Blocpdb>   124 atoms in block     55
 Block first atom:   5784
 Blocpdb>   109 atoms in block     56
 Block first atom:   5908
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 Block first atom:   6017
 Blocpdb>   117 atoms in block     58
 Block first atom:   6136
 Blocpdb>   110 atoms in block     59
 Block first atom:   6253
 Blocpdb>   107 atoms in block     60
 Block first atom:   6363
 Blocpdb>   115 atoms in block     61
 Block first atom:   6470
 Blocpdb>   121 atoms in block     62
 Block first atom:   6585
 Blocpdb>   129 atoms in block     63
 Block first atom:   6706
 Blocpdb>   114 atoms in block     64
 Block first atom:   6835
 Blocpdb>   112 atoms in block     65
 Block first atom:   6949
 Blocpdb>    34 atoms in block     66
 Block first atom:   7061
 Blocpdb>   125 atoms in block     67
 Block first atom:   7095
 Blocpdb>   105 atoms in block     68
 Block first atom:   7220
 Blocpdb>   114 atoms in block     69
 Block first atom:   7325
 Blocpdb>   107 atoms in block     70
 Block first atom:   7439
 Blocpdb>   119 atoms in block     71
 Block first atom:   7546
 Blocpdb>   122 atoms in block     72
 Block first atom:   7665
 Blocpdb>   109 atoms in block     73
 Block first atom:   7787
 Blocpdb>    17 atoms in block     74
 Block first atom:   7896
 Blocpdb>   110 atoms in block     75
 Block first atom:   7913
 Blocpdb>   109 atoms in block     76
 Block first atom:   8023
 Blocpdb>   131 atoms in block     77
 Block first atom:   8132
 Blocpdb>    99 atoms in block     78
 Block first atom:   8263
 Blocpdb>   104 atoms in block     79
 Block first atom:   8362
 Blocpdb>   106 atoms in block     80
 Block first atom:   8466
 Blocpdb>   119 atoms in block     81
 Block first atom:   8572
 Blocpdb>   108 atoms in block     82
 Block first atom:   8691
 Blocpdb>   117 atoms in block     83
 Block first atom:   8799
 Blocpdb>   115 atoms in block     84
 Block first atom:   8916
 Blocpdb>   106 atoms in block     85
 Block first atom:   9031
 Blocpdb>   105 atoms in block     86
 Block first atom:   9137
 Blocpdb>   115 atoms in block     87
 Block first atom:   9242
 Blocpdb>   108 atoms in block     88
 Block first atom:   9357
 Blocpdb>   115 atoms in block     89
 Block first atom:   9465
 Blocpdb>   105 atoms in block     90
 Block first atom:   9580
 Blocpdb>   124 atoms in block     91
 Block first atom:   9685
 Blocpdb>    94 atoms in block     92
 Block first atom:   9809
 Blocpdb>   113 atoms in block     93
 Block first atom:   9903
 Blocpdb>   105 atoms in block     94
 Block first atom:  10016
 Blocpdb>   102 atoms in block     95
 Block first atom:  10121
 Blocpdb>   109 atoms in block     96
 Block first atom:  10223
 Blocpdb>   112 atoms in block     97
 Block first atom:  10332
 Blocpdb>   109 atoms in block     98
 Block first atom:  10444
 Blocpdb>   116 atoms in block     99
 Block first atom:  10553
 Blocpdb>   107 atoms in block    100
 Block first atom:  10669
 Blocpdb>   101 atoms in block    101
 Block first atom:  10776
 Blocpdb>   101 atoms in block    102
 Block first atom:  10877
 Blocpdb>   119 atoms in block    103
 Block first atom:  10978
 Blocpdb>    99 atoms in block    104
 Block first atom:  11097
 Blocpdb>   112 atoms in block    105
 Block first atom:  11196
 Blocpdb>   112 atoms in block    106
 Block first atom:  11308
 Blocpdb>   114 atoms in block    107
 Block first atom:  11420
 Blocpdb>   107 atoms in block    108
 Block first atom:  11534
 Blocpdb>   105 atoms in block    109
 Block first atom:  11641
 Blocpdb>    84 atoms in block    110
 Block first atom:  11746
 Blocpdb>   109 atoms in block    111
 Block first atom:  11830
 Blocpdb>   107 atoms in block    112
 Block first atom:  11939
 Blocpdb>   105 atoms in block    113
 Block first atom:  12046
 Blocpdb>    92 atoms in block    114
 Block first atom:  12151
 Blocpdb>   113 atoms in block    115
 Block first atom:  12243
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 Block first atom:  12356
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 Block first atom:  12472
 Blocpdb>   104 atoms in block    118
 Block first atom:  12549
 Blocpdb>   109 atoms in block    119
 Block first atom:  12653
 Blocpdb>   116 atoms in block    120
 Block first atom:  12762
 Blocpdb>   124 atoms in block    121
 Block first atom:  12878
 Blocpdb>   109 atoms in block    122
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 Block first atom:  13111
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 Block first atom:  13347
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 Block first atom:  13457
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 Block first atom:  13564
 Blocpdb>   121 atoms in block    128
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 Block first atom:  14155
 Blocpdb>   125 atoms in block    133
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 Block first atom:  15357
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 Block first atom:  15560
 Blocpdb>   119 atoms in block    147
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 Blocpdb>   105 atoms in block    156
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 Blocpdb>   124 atoms in block    157
 Block first atom:  16779
 Blocpdb>    94 atoms in block    158
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 Block first atom:  17647
 Blocpdb>   107 atoms in block    166
 Block first atom:  17763
 Blocpdb>   101 atoms in block    167
 Block first atom:  17870
 Blocpdb>   101 atoms in block    168
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 Blocpdb>   119 atoms in block    169
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 Blocpdb>    99 atoms in block    170
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 Block first atom:  18290
 Blocpdb>   112 atoms in block    172
 Block first atom:  18402
 Blocpdb>   114 atoms in block    173
 Block first atom:  18514
 Blocpdb>   107 atoms in block    174
 Block first atom:  18628
 Blocpdb>   105 atoms in block    175
 Block first atom:  18735
 Blocpdb>    84 atoms in block    176
 Block first atom:  18840
 Blocpdb>   109 atoms in block    177
 Block first atom:  18924
 Blocpdb>   107 atoms in block    178
 Block first atom:  19033
 Blocpdb>   105 atoms in block    179
 Block first atom:  19140
 Blocpdb>    92 atoms in block    180
 Block first atom:  19245
 Blocpdb>   113 atoms in block    181
 Block first atom:  19337
 Blocpdb>   116 atoms in block    182
 Block first atom:  19450
 Blocpdb>    77 atoms in block    183
 Block first atom:  19566
 Blocpdb>   104 atoms in block    184
 Block first atom:  19643
 Blocpdb>   109 atoms in block    185
 Block first atom:  19747
 Blocpdb>   116 atoms in block    186
 Block first atom:  19856
 Blocpdb>   124 atoms in block    187
 Block first atom:  19972
 Blocpdb>   109 atoms in block    188
 Block first atom:  20096
 Blocpdb>   119 atoms in block    189
 Block first atom:  20205
 Blocpdb>   117 atoms in block    190
 Block first atom:  20324
 Blocpdb>   110 atoms in block    191
 Block first atom:  20441
 Blocpdb>   107 atoms in block    192
 Block first atom:  20551
 Blocpdb>   115 atoms in block    193
 Block first atom:  20658
 Blocpdb>   121 atoms in block    194
 Block first atom:  20773
 Blocpdb>   129 atoms in block    195
 Block first atom:  20894
 Blocpdb>   114 atoms in block    196
 Block first atom:  21023
 Blocpdb>   112 atoms in block    197
 Block first atom:  21137
 Blocpdb>    34 atoms in block    198
 Block first atom:  21248

 Blocpdb>   198 blocks.

 Blocpdb> At most,    131 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    17 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      7081400 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      63846

 Prepmat> Matrix trace    =   15454800.0001
 Prepmat> Last element read:   63846  63846        97.2036
 Prepmat>        19702 lines saved.
 Prepmat>        18238 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 21282
 RTB> Total mass =       21282.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix: 21282
 RTB> Number of blocks =   198
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  148116.5065
 RTB>     49698 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =     1188
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49698
 Diagstd> Projected matrix trace =  148116.5065

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>   1188 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 148116.5065
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.5145832      0.5180128      0.6192032      1.2862801
      1.2927365      1.6451322      1.8426855      1.8576978      1.8897223
      1.9099321      2.3521834      2.3632711      2.3699206      2.5911466
      3.4206436      3.4365719      3.5055333      3.6849914      3.9787351
      4.0018151      4.5661556      4.6967933      4.7258281      5.1925823
      5.2166191      5.3551421      5.4273518      5.5524345      5.5854275
      5.9904930      6.1395819      6.2339530      6.2647347      6.9473414
      6.9690068      6.9905314      7.1592704      7.1797239      7.2458641
      7.4377084      7.4616237      7.8034007      7.8607697      8.4055342
      8.4552733      8.5107064      8.7234604      8.8923741      9.0952762
      9.3428113      9.3721960      9.6142734      9.7364858      9.8600280
     10.1199214     10.2114133     10.3447876     11.0032099     11.0660346
     11.2719522     11.5067351     11.5744093     12.3375360     12.3483082
     12.4444658     12.7803031     12.9671550     13.0300987     13.3409273
     13.7495766     13.8238831     14.4229986     14.5332094     14.5825771
     14.7985161     15.2935070     15.3667426     15.3745858     15.7358499
     15.9043065     16.2071696     16.6009727     16.6302816     16.7610888
     16.9674245     17.0698870     17.8078273     17.9149759     17.9379904
     19.2903860     19.3520426     19.4038905     19.7934901     19.8597336
     19.9385571     20.0539496     20.2699183     20.3280569     20.7620368
     20.8537890

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034319      0.0034330      0.0034336      0.0034337      0.0034339
      0.0034342     77.8974212     78.1565738     85.4499592    123.1581221
    123.4668276    139.2822191    147.4079453    148.0071890    149.2774711
    150.0735808    166.5447191    166.9367883    167.1714779    174.7999387
    200.8395299    201.3065915    203.3163621    208.4555776    216.6046575
    217.2319949    232.0441549    235.3401372    236.0664338    247.4497240
    248.0217926    251.2932248    252.9817942    255.8803899    256.6394930
    265.7826106    269.0696280    271.1296677    271.7982296    286.2230472
    286.6689958    287.1113606    290.5558772    290.9706274    292.3077776
    296.1521255    296.6278697    303.3452752    304.4582986    314.8313276
    315.7614486    316.7948287    320.7300694    323.8203540    327.4939088
    331.9204939    332.4420582    336.7080605    338.8413460    340.9842780
    345.4489291    347.0069771    349.2658059    360.2093480    361.2362222
    364.5816871    368.3590438    369.4406666    381.4253006    381.5917803
    383.0746466    388.2092306    391.0368014    391.9847147    396.6324929
    402.6613470    403.7479282    412.4041823    413.9768409    414.6793611
    417.7383668    424.6673023    425.6828840    425.7915050    430.7649736
    433.0645644    437.1685077    442.4478080    442.8382047    444.5763882
    447.3044746    448.6530287    458.2481794    459.6247375    459.9198708
    476.9421873    477.7037887    478.3432914    483.1216158    483.9293804
    484.8887896    486.2898886    488.9013981    489.6020343    494.8006467
    495.8927605

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =  21282
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    198

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9882E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5146    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5180    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6192    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.286    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.293    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.645    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.843    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.858    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.890    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.910    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.352    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.363    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.370    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.591    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.421    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.437    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.506    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.685    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.979    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.002    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.566    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.697    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.726    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.193    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.217    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.355    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.427    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.552    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.585    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.990    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.140    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.234    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.265    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.947    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.969    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.991    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.159    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.180    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.246    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.438    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.462    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.803    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.861    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.406    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.455    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.511    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.723    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.892    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.095    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.343    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.372    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.614    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.736    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.860    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.85    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with   1188 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00005 1.00003 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>   383076 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00005 1.00003 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22120805114639768.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22120805114639768.eigenfacs                                     
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 22120805114639768.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 22120805114639768.atom                                          
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =   2877
            First residue number     =     48
            Last  residue number     =   1033
            Number of atoms found    =  21282
            Mean number per residue  =      7.4

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9882E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9996E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5146    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5180    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6192    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.286    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.293    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.645    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.843    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.858    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.890    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.910    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.352    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.363    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.370    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.591    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.421    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.437    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.506    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.685    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.979    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.002    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.566    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.697    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.726    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.193    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.217    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.355    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.427    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.552    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.585    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.990    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.140    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.234    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.265    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.947    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.969    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.991    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.159    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.180    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.246    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.438    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.462    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.803    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.861    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.406    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.455    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.511    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.723    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.892    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.095    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.343    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.372    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.614    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.736    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.860    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.85    

 Bfactors>  106 vectors,  63846 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.514600
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.697 for   2877 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.015 +/-   0.01
 Bfactors> =    177.500 +/-  49.45
 Bfactors> Shiftng-fct=    177.485
 Bfactors> Scaling-fct=   5266.131

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 22120805114639768.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 22120805114639768.eigenfacs                                     

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4318E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   77.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   78.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   85.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   123.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   123.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   139.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   147.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   148.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   149.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   150.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   166.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   166.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   167.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   174.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   200.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   201.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   203.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   208.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   216.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   217.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   232.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   235.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   236.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   247.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   248.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   251.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   253.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   255.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   256.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   265.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   269.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   271.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   271.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   286.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   286.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   287.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   290.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   291.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   292.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   296.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   296.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   303.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   304.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   314.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   315.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   316.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   320.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   323.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   327.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   331.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   332.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   336.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   338.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   341.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   345.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   347.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   349.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   360.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   361.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   364.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   368.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   369.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   381.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   381.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   383.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   388.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   391.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   392.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   396.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   402.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   403.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   412.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   413.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   414.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   417.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   424.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   425.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   425.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   430.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   433.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   437.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   442.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   442.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   444.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   447.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   448.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   458.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   459.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   459.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   476.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   477.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   478.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   483.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   483.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   484.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   486.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   488.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   489.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   494.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   495.8    

 Chkmod>  106 vectors,  63846 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:  21282 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    92 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7236
      0.0034      0.7607
      0.0034      0.6676
      0.0034      0.9754
      0.0034      0.9576
      0.0034      0.7180
     77.8953      0.6605
     78.1523      0.6573
     85.4461      0.5127
    123.1394      0.4680
    123.4741      0.4537
    139.2706      0.5893
    147.4142      0.6920
    148.0129      0.6483
    149.2820      0.5326
    150.0698      0.4445
    166.5311      0.6203
    166.9200      0.6492
    167.1671      0.6114
    174.7875      0.4927
    200.8414      0.6736
    201.3105      0.6897
    203.3212      0.7282
    208.4469      0.4229
    216.6026      0.5300
    217.2277      0.5323
    232.0302      0.6956
    235.3352      0.4661
    236.0606      0.4686
    247.4491      0.3744
    248.0202      0.3618
    251.2791      0.5385
    252.9627      0.3693
    255.8594      0.4414
    256.6187      0.4294
    265.7603      0.6744
    269.0672      0.5479
    271.1191      0.6069
    271.7923      0.5782
    286.2037      0.3310
    286.6565      0.3432
    287.1087      0.1369
    290.5379      0.4505
    290.9637      0.5134
    292.2980      0.4227
    296.1452      0.5032
    296.6226      0.5626
    303.3245      0.6271
    304.4497      0.6700
    314.8265      0.4908
    315.7428      0.5088
    316.7867      0.4997
    320.7078      0.2576
    323.7996      0.4731
    327.4749      0.6242
    331.9096      0.6711
    332.4243      0.6598
    336.6888      0.4023
    338.8183      0.5464
    340.9692      0.5131
    345.4354      0.6138
    346.9681      0.5623
    349.1700      0.5378
    360.1413      0.6661
    361.2854      0.6328
    364.5345      0.5590
    368.3955      0.5805
    369.3544      0.5850
    381.4470      0.4310
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getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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getting mode 10
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 22120805114639768 12 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 22120805114639768 13 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=20
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22120805114639768.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
22120805114639768.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 22120805114639768.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 22120805114639768 14 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 22120805114639768 15 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 22120805114639768 16 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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22120805114639768.eigenfacs
22120805114639768.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120805114639768.eigenfacs
22120805114639768.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120805114639768.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
22120805114639768.eigenfacs
22120805114639768.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120805114639768.eigenfacs
22120805114639768.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120805114639768.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 22120805114639768.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120805114639768.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22120805114639768.10.pdb
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