CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 22120511533433498

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22120511533433498.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22120511533433498.atom to be opened. Openam> File opened: 22120511533433498.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 398 First residue number = 19 Last residue number = 121 Number of atoms found = 3020 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -6.089973 +/- 8.232193 From: -24.561000 To: 21.803000 = -10.439188 +/- 9.928375 From: -43.818000 To: 12.294000 = 15.030406 +/- 21.836155 From: -25.698000 To: 62.358000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.7064 % Filled. Pdbmat> 1110873 non-zero elements. Pdbmat> 121437 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.42 +/- 21.97 Maximum number = 130 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 2.428740E+06 Pdbmat> Larger element = 525.348 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 398 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22120511533433498.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22120511533433498.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22120511533433498.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3020 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 398 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 33 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 12 atoms in block 6 Block first atom: 81 Blocpdb> 10 atoms in block 7 Block first atom: 93 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 103 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 117 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 132 Blocpdb> 12 atoms in block 11 Block first atom: 147 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 159 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 175 Blocpdb> 15 atoms in block 14 Block first atom: 190 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 205 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 219 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 235 Blocpdb> 13 atoms in block 18 Block first atom: 248 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 261 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 277 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 292 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 312 Blocpdb> 17 atoms in block 23 Block first atom: 331 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 348 Blocpdb> 11 atoms in block 25 Block first atom: 361 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 372 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 388 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 404 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 415 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 432 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 448 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 468 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 483 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 502 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 517 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 533 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 554 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 566 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 580 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 593 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 609 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 631 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 644 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 664 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 678 Blocpdb> 11 atoms in block 46 Block first atom: 692 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 703 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 718 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 734 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 750 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 764 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 783 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 806 Blocpdb> 14 atoms in block 54 Block first atom: 823 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 837 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 849 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 864 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 883 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 895 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 913 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 925 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 938 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 950 Blocpdb> 10 atoms in block 64 Block first atom: 966 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 976 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 995 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1010 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1027 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1043 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1062 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1074 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 1090 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1115 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 1135 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 1147 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1158 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1176 Blocpdb> 9 atoms in block 78 Block first atom: 1192 Blocpdb> 11 atoms in block 79 Block first atom: 1201 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1212 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1232 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1252 Blocpdb> 13 atoms in block 83 Block first atom: 1269 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 1282 Blocpdb> 18 atoms in block 85 Block first atom: 1294 Blocpdb> 11 atoms in block 86 Block first atom: 1312 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1323 Blocpdb> 10 atoms in block 88 Block first atom: 1336 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 1346 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1369 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1384 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 1399 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1415 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1429 Blocpdb> 24 atoms in block 95 Block first atom: 1449 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1473 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1487 Blocpdb> 11 atoms in block 98 Block first atom: 1503 Blocpdb> 5 atoms in block 99 Block first atom: 1514 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1519 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1533 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1546 Blocpdb> 10 atoms in block 103 Block first atom: 1560 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1570 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 1584 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1602 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1618 Blocpdb> 16 atoms in block 108 Block first atom: 1631 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1647 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1663 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 1679 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1700 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 1712 Blocpdb> 15 atoms in block 114 Block first atom: 1732 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1747 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1762 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1778 Blocpdb> 11 atoms in block 118 Block first atom: 1796 Blocpdb> 13 atoms in block 119 Block first atom: 1807 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1820 Blocpdb> 15 atoms in block 121 Block first atom: 1835 Blocpdb> 21 atoms in block 122 Block first atom: 1850 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1871 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1886 Blocpdb> 22 atoms in block 125 Block first atom: 1902 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 1924 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1942 Blocpdb> 13 atoms in block 128 Block first atom: 1958 Blocpdb> 16 atoms in block 129 Block first atom: 1971 Blocpdb> 12 atoms in block 130 Block first atom: 1987 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 1999 Blocpdb> 13 atoms in block 132 Block first atom: 2017 Blocpdb> 11 atoms in block 133 Block first atom: 2030 Blocpdb> 12 atoms in block 134 Block first atom: 2041 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 2053 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2069 Blocpdb> 20 atoms in block 137 Block first atom: 2081 Blocpdb> 18 atoms in block 138 Block first atom: 2101 Blocpdb> 10 atoms in block 139 Block first atom: 2119 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 2129 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2141 Blocpdb> 14 atoms in block 142 Block first atom: 2158 Blocpdb> 10 atoms in block 143 Block first atom: 2172 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 2182 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2190 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2205 Blocpdb> 12 atoms in block 147 Block first atom: 2219 Blocpdb> 14 atoms in block 148 Block first atom: 2231 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2245 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 2264 Blocpdb> 10 atoms in block 151 Block first atom: 2276 Blocpdb> 10 atoms in block 152 Block first atom: 2286 Blocpdb> 19 atoms in block 153 Block first atom: 2296 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2315 Blocpdb> 19 atoms in block 155 Block first atom: 2328 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 2347 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2363 Blocpdb> 12 atoms in block 158 Block first atom: 2380 Blocpdb> 25 atoms in block 159 Block first atom: 2392 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 2417 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2437 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2449 Blocpdb> 20 atoms in block 163 Block first atom: 2462 Blocpdb> 13 atoms in block 164 Block first atom: 2482 Blocpdb> 13 atoms in block 165 Block first atom: 2495 Blocpdb> 14 atoms in block 166 Block first atom: 2508 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2522 Blocpdb> 11 atoms in block 168 Block first atom: 2537 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2548 Blocpdb> 12 atoms in block 170 Block first atom: 2558 Blocpdb> 17 atoms in block 171 Block first atom: 2570 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2587 Blocpdb> 10 atoms in block 173 Block first atom: 2601 Blocpdb> 15 atoms in block 174 Block first atom: 2611 Blocpdb> 18 atoms in block 175 Block first atom: 2626 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2644 Blocpdb> 11 atoms in block 177 Block first atom: 2658 Blocpdb> 13 atoms in block 178 Block first atom: 2669 Blocpdb> 17 atoms in block 179 Block first atom: 2682 Blocpdb> 14 atoms in block 180 Block first atom: 2699 Blocpdb> 20 atoms in block 181 Block first atom: 2713 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2733 Blocpdb> 14 atoms in block 183 Block first atom: 2750 Blocpdb> 13 atoms in block 184 Block first atom: 2764 Blocpdb> 16 atoms in block 185 Block first atom: 2777 Blocpdb> 15 atoms in block 186 Block first atom: 2793 Blocpdb> 12 atoms in block 187 Block first atom: 2808 Blocpdb> 19 atoms in block 188 Block first atom: 2820 Blocpdb> 12 atoms in block 189 Block first atom: 2839 Blocpdb> 19 atoms in block 190 Block first atom: 2851 Blocpdb> 15 atoms in block 191 Block first atom: 2870 Blocpdb> 21 atoms in block 192 Block first atom: 2885 Blocpdb> 14 atoms in block 193 Block first atom: 2906 Blocpdb> 21 atoms in block 194 Block first atom: 2920 Blocpdb> 18 atoms in block 195 Block first atom: 2941 Blocpdb> 13 atoms in block 196 Block first atom: 2959 Blocpdb> 16 atoms in block 197 Block first atom: 2972 Blocpdb> 14 atoms in block 198 Block first atom: 2988 Blocpdb> 13 atoms in block 199 Block first atom: 3002 Blocpdb> 6 atoms in block 200 Block first atom: 3014 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1111073 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9060 Prepmat> Matrix trace = 2428740.0000 Prepmat> Last element read: 9060 9060 79.2586 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18027 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3020 RTB> Total mass = 3020.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3020 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 268787.7694 RTB> 71628 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71628 Diagstd> Projected matrix trace = 268787.7694 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 268787.7694 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6681773 0.8015960 1.0812469 1.4694034 2.5907741 3.5900090 3.8418079 3.9671634 4.4055632 5.0623730 5.6285841 6.1965063 7.1314386 7.6622552 8.2798195 8.7997168 9.6841181 10.2614866 11.0203020 11.7086883 12.6827460 13.1186528 14.1099055 14.7703907 15.2230109 15.7264383 15.9666164 16.8558721 17.1399772 17.7336094 18.5451315 19.4612694 19.7843109 20.2343451 20.7269029 21.3524322 21.7698354 22.6852109 23.1080023 23.7622407 24.9487421 25.2972791 25.4552915 26.0587883 26.8621511 27.1033137 27.6033409 28.1212510 28.6110119 29.1845598 29.2198531 30.1648194 30.6706830 31.5425528 31.9027876 32.5790576 32.7811895 33.4198749 33.7541993 34.5026903 34.7517554 35.1664612 35.6975980 36.2580912 37.6782126 38.2639266 38.7070724 39.3570780 39.7066603 41.0199648 41.5129829 42.2370965 42.5776488 43.1795723 43.6598154 44.3617816 44.6901818 45.4305012 45.6792685 46.3650506 47.7362735 48.2826263 48.3503452 49.1763419 49.3483661 49.6833534 50.1898380 50.8853290 51.6316030 51.8919482 52.5615008 53.4640581 53.7843505 54.5900061 55.4635365 55.6518789 56.2361809 56.6315032 57.6539194 57.9669655 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034328 0.0034332 0.0034337 0.0034341 0.0034361 88.7648750 97.2239003 112.9165788 131.6333091 174.7873709 205.7515194 212.8448284 216.2894453 227.9271162 244.3275003 257.6290675 270.3141183 289.9905560 300.5893489 312.4681212 322.1288552 337.9288884 347.8567390 360.4890093 371.5774950 386.7247150 393.3144478 407.9034075 417.3412113 423.6874104 430.6361341 433.9120656 445.8316476 449.5731850 457.2922591 467.6384784 479.0500205 483.0095792 488.4722045 494.3818145 501.7864808 506.6672730 517.2097356 522.0071851 529.3451952 542.3999081 546.1754641 547.8785750 554.3351134 562.8150138 565.3357846 570.5268724 575.8542794 580.8471854 586.6402454 586.9948551 596.4110000 601.3911105 609.8790278 613.3517324 619.8185065 621.7383189 627.7658552 630.8980508 637.8547006 640.1528067 643.9610712 648.8058808 653.8795401 666.5618086 671.7227347 675.6012472 681.2502960 684.2691501 695.4932540 699.6603303 705.7360591 708.5754769 713.5664925 717.5236625 723.2688649 725.9410262 731.9291511 733.9303552 739.4190740 750.2733786 754.5546903 755.0836555 761.5061062 762.8368590 765.4216304 769.3131878 774.6251154 780.2846878 782.2494533 787.2798912 794.0104903 796.3853173 802.3278209 808.7216308 810.0935906 814.3351663 817.1924116 824.5361450 826.7716258 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3020 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.967 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.197 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54360 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22120511533433498.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22120511533433498.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22120511533433498.atom Openam> file on opening on unit 11: 22120511533433498.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 398 First residue number = 19 Last residue number = 121 Number of atoms found = 3020 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.967 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.197 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97 Bfactors> 106 vectors, 9060 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.668200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.295 for 398 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.048 +/- 0.08 Bfactors> = 116.487 +/- 27.38 Bfactors> Shiftng-fct= 116.438 Bfactors> Scaling-fct= 361.013 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22120511533433498.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22120511533433498.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8 Chkmod> 106 vectors, 9060 coordinates in file. Chkmod> That is: 3020 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9695 0.0034 0.8345 0.0034 0.6979 0.0034 0.8637 0.0034 0.7449 0.0034 0.8709 88.7626 0.2260 97.2200 0.6684 112.8988 0.3384 131.6096 0.5639 174.7875 0.2550 205.7424 0.1672 212.8410 0.6388 216.2757 0.6116 227.9286 0.2631 244.3080 0.1760 257.6275 0.0404 270.3133 0.1428 289.9692 0.1974 300.5714 0.1086 312.4581 0.1631 322.1202 0.4047 337.9123 0.3363 347.8166 0.5135 360.4686 0.4490 371.5824 0.2935 386.6662 0.4502 393.3178 0.3514 407.8873 0.4998 417.3178 0.1948 423.6273 0.5027 430.6664 0.3063 433.9394 0.3560 445.8671 0.3032 449.5542 0.4468 457.2261 0.4957 467.6798 0.4156 479.0138 0.2728 482.9362 0.3824 488.3988 0.3843 494.3975 0.3374 501.7364 0.3435 506.6474 0.3444 517.2421 0.1692 522.0073 0.3059 529.2975 0.3622 542.3903 0.5090 546.1814 0.1850 547.9057 0.2240 554.3242 0.4161 562.7683 0.3707 565.2770 0.3863 570.4679 0.2099 575.8168 0.2976 580.8120 0.3165 586.5692 0.2733 586.9711 0.2929 596.3378 0.4111 601.3586 0.3175 609.8282 0.2947 613.2986 0.3462 619.8009 0.3167 621.7003 0.4825 627.7401 0.4644 630.8317 0.4078 637.8025 0.4855 640.1092 0.3648 643.9658 0.4403 648.7999 0.5397 653.8687 0.4841 666.5490 0.4643 671.6594 0.4332 675.5978 0.5303 681.2463 0.3094 684.2686 0.4190 695.4637 0.3829 699.6052 0.4770 705.7300 0.4178 708.5646 0.5005 713.5394 0.4459 717.4944 0.4133 723.2233 0.2586 725.9084 0.4891 731.8937 0.4813 733.9047 0.4141 739.4268 0.4713 750.2705 0.3805 754.5018 0.4362 755.0485 0.3574 761.5017 0.4075 762.8167 0.4442 765.3629 0.3333 769.2814 0.4652 774.6274 0.4238 780.2391 0.3934 782.2012 0.2929 787.2349 0.4073 793.9463 0.4557 796.3189 0.4711 802.2933 0.4149 808.6611 0.4217 810.0451 0.4651 814.3279 0.4578 817.1465 0.4534 824.4727 0.4914 826.7578 0.3111 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22120511533433498 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom making animated gifs 11 models are in 22120511533433498.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22120511533433498 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom making animated gifs 11 models are in 22120511533433498.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22120511533433498 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom making animated gifs 11 models are in 22120511533433498.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22120511533433498 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom making animated gifs 11 models are in 22120511533433498.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22120511533433498 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22120511533433498.eigenfacs 22120511533433498.atom making animated gifs 11 models are in 22120511533433498.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22120511533433498.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22120511533433498.10.pdb 22120511533433498.11.pdb 22120511533433498.7.pdb 22120511533433498.8.pdb 22120511533433498.9.pdb STDERR: real 0m20.282s user 0m20.224s sys 0m0.048s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.