***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22120310140814104.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22120310140814104.atom to be opened.
Openam> File opened: 22120310140814104.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 115
First residue number = 10
Last residue number = 124
Number of atoms found = 961
Mean number per residue = 8.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 21.363906 +/- 9.928335 From: 0.439000 To: 42.655000
= 29.655874 +/- 7.469262 From: 8.933000 To: 45.817000
= 37.921583 +/- 7.109216 From: 20.025000 To: 56.464000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.5258 % Filled.
Pdbmat> 354443 non-zero elements.
Pdbmat> 38748 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.64 +/- 22.22
Maximum number = 126
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 774960.
Pdbmat> Larger element = 480.662
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
115 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22120310140814104.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22120310140814104.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22120310140814104.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 961 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 115 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 16
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 24
Blocpdb> 7 atoms in block 5
Block first atom: 36
Blocpdb> 13 atoms in block 6
Block first atom: 43
Blocpdb> 7 atoms in block 7
Block first atom: 56
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 63
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 74
Blocpdb> 5 atoms in block 10
Block first atom: 82
Blocpdb> 7 atoms in block 11
Block first atom: 87
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 94
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 105
Blocpdb> 7 atoms in block 14
Block first atom: 109
Blocpdb> 7 atoms in block 15
Block first atom: 116
Blocpdb> 5 atoms in block 16
Block first atom: 123
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 128
Blocpdb> 8 atoms in block 18
Block first atom: 136
Blocpdb> 7 atoms in block 19
Block first atom: 144
Blocpdb> 5 atoms in block 20
Block first atom: 151
Blocpdb> 7 atoms in block 21
Block first atom: 156
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 163
Blocpdb> 7 atoms in block 23
Block first atom: 173
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 180
Blocpdb> 11 atoms in block 25
Block first atom: 191
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 202
Blocpdb> 5 atoms in block 27
Block first atom: 216
Blocpdb> 5 atoms in block 28
Block first atom: 221
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 226
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 234
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 242
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 249
Blocpdb> 9 atoms in block 33
Block first atom: 263
Blocpdb> 7 atoms in block 34
Block first atom: 272
Blocpdb> 11 atoms in block 35
Block first atom: 279
Blocpdb> 5 atoms in block 36
Block first atom: 290
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 295
Blocpdb> 4 atoms in block 38
Block first atom: 303
Blocpdb> 9 atoms in block 39
Block first atom: 307
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 316
Blocpdb> 6 atoms in block 41
Block first atom: 323
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 329
Blocpdb> 6 atoms in block 43
Block first atom: 338
Blocpdb> 4 atoms in block 44
Block first atom: 344
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 348
Blocpdb> 8 atoms in block 46
Block first atom: 357
Blocpdb> 10 atoms in block 47
Block first atom: 365
Blocpdb> 4 atoms in block 48
Block first atom: 375
Blocpdb> 8 atoms in block 49
Block first atom: 379
Blocpdb> 7 atoms in block 50
Block first atom: 387
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 394
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 401
Blocpdb> 9 atoms in block 53
Block first atom: 414
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 423
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 437
Blocpdb> 7 atoms in block 56
Block first atom: 448
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 455
Blocpdb> 4 atoms in block 58
Block first atom: 469
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 473
Blocpdb> 12 atoms in block 60
Block first atom: 481
Blocpdb> 9 atoms in block 61
Block first atom: 493
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 502
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 509
Blocpdb> 8 atoms in block 64
Block first atom: 523
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 531
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 543
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 550
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 561
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 569
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 581
Blocpdb> 9 atoms in block 71
Block first atom: 595
Blocpdb> 5 atoms in block 72
Block first atom: 604
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 609
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 621
Blocpdb> 7 atoms in block 76
Block first atom: 629
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 636
Blocpdb> 11 atoms in block 78
Block first atom: 643
Blocpdb> 10 atoms in block 79
Block first atom: 654
Blocpdb> 9 atoms in block 80
Block first atom: 664
Blocpdb> 10 atoms in block 81
Block first atom: 673
Blocpdb> 5 atoms in block 82
Block first atom: 683
Blocpdb> 9 atoms in block 83
Block first atom: 688
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 697
Blocpdb> 7 atoms in block 85
Block first atom: 704
Blocpdb> 11 atoms in block 86
Block first atom: 711
Blocpdb> 7 atoms in block 87
Block first atom: 722
Blocpdb> 5 atoms in block 88
Block first atom: 729
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 734
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 742
Blocpdb> 6 atoms in block 91
Block first atom: 754
Blocpdb> 4 atoms in block 92
Block first atom: 760
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 764
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 771
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 782
Blocpdb> 12 atoms in block 96
Block first atom: 793
Blocpdb> 7 atoms in block 97
Block first atom: 805
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 812
Blocpdb> 5 atoms in block 99
Block first atom: 820
Blocpdb> 5 atoms in block 100
Block first atom: 825
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 830
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 841
Blocpdb> 7 atoms in block 103
Block first atom: 849
Blocpdb> 7 atoms in block 104
Block first atom: 856
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 863
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 875
Blocpdb> 12 atoms in block 107
Block first atom: 883
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 895
Blocpdb> 10 atoms in block 109
Block first atom: 903
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 913
Blocpdb> 5 atoms in block 111
Block first atom: 925
Blocpdb> 7 atoms in block 112
Block first atom: 930
Blocpdb> 7 atoms in block 113
Block first atom: 937
Blocpdb> 10 atoms in block 114
Block first atom: 944
Blocpdb> 8 atoms in block 115
Block first atom: 953
Blocpdb> 115 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 354558 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2883
Prepmat> Matrix trace = 774960.0000
Prepmat> Last element read: 2883 2883 105.5444
Prepmat> 6671 lines saved.
Prepmat> 5338 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 961
RTB> Total mass = 961.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 961
RTB> Number of blocks = 115
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 170099.0536
RTB> 46227 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 690
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46227
Diagstd> Projected matrix trace = 170099.0536
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 690 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 170099.0536
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.9357430 6.2859585 6.4599461 11.1835442
12.4175617 17.2456469 17.4405667 19.1720930 20.1579806
21.4620755 22.7024378 24.5025311 25.4812336 27.4790027
30.1937400 32.2834353 34.5508133 35.5007320 36.9459565
37.6723284 38.3923042 40.3119666 40.6555254 43.5981645
45.2756663 46.7536378 48.5689362 49.3779529 50.1966121
51.8844034 52.9985496 54.5993241 55.8923890 56.6043536
57.9027597 58.0266509 59.8020335 61.8157361 63.3014322
63.7685542 64.4315559 65.9539204 66.7150359 68.0722108
68.8192809 70.7504664 73.2724568 73.9302875 76.1163018
77.6017611 78.6005195 79.3469337 81.0821214 82.0250681
83.2509174 84.1073397 84.7761706 85.8617235 86.2597079
86.6854019 88.2221681 89.5013020 90.6806241 91.5893153
92.3898373 93.2217006 94.0893879 95.5018234 97.0782176
97.9165700 98.6818741 99.0541819 101.1812341 101.8374868
102.2387252 103.3806248 104.0042232 105.1379596 106.1009069
107.3100727 108.1187041 108.9023357 110.5208896 110.9026874
111.3610086 112.6314994 113.1604945 114.4900593 114.8133153
115.8469900 116.3737790 117.7533575 118.7633785 119.4768094
120.2639174 121.0651905 121.5974059 121.9890712 122.8990286
124.0014556
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034327 0.0034337 0.0034340 0.0034350
0.0034354 241.2523473 272.2582410 276.0004107 363.1491316
382.6603321 450.9568883 453.4982091 475.4775795 487.5495856
503.0731510 517.4060798 537.5275832 548.1576825 569.2404640
596.6968375 616.9999820 638.2993730 647.0143818 660.0528905
666.5097580 672.8486250 689.4650772 692.3968271 717.0168852
730.6808162 742.5111576 756.7885908 763.0655043 769.3651028
782.1925838 790.5462312 802.3962925 811.8421895 816.9965034
826.3136212 827.1971566 839.7562722 853.7776917 863.9767353
867.1586598 871.6549279 881.8923760 886.9663468 895.9426439
900.8455665 913.3977426 929.5348073 933.6981057 947.4016135
956.6015251 962.7377214 967.2981439 977.8175591 983.4869014
990.8086611 995.8919650 999.8438463 1006.2249488 1008.5542684
1011.0398273 1019.9623565 1027.3299678 1034.0761709 1039.2443844
1043.7761796 1048.4646465 1053.3327851 1061.2094582 1069.9320012
1074.5419532 1078.7330249 1080.7660354 1092.3083822 1095.8449657
1098.0016510 1104.1163892 1107.4414324 1113.4611086 1118.5485220
1124.9041651 1129.1345494 1133.2190783 1141.6092162 1143.5793785
1145.9399448 1152.4582817 1155.1614800 1161.9278741 1163.5670358
1168.7931492 1171.4475514 1178.3706850 1183.4135895 1186.9627461
1190.8661569 1194.8267172 1197.4501296 1199.3770729 1203.8420396
1209.2293284
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 961
Rtb_to_modes> Number of blocs = 115
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.936
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.286
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 690 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99996 1.00001
1.00004 1.00000 1.00003 1.00004 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00004
1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 1.00003
1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999
1.00004 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 17298 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99996 1.00001
1.00004 1.00000 1.00003 1.00004 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00004
1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 1.00003
1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999
1.00004 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22120310140814104.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22120310140814104.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22120310140814104.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22120310140814104.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 115
First residue number = 10
Last residue number = 124
Number of atoms found = 961
Mean number per residue = 8.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.936
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.286
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0
Bfactors> 106 vectors, 2883 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.936000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.668 for 115 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.031 +/- 0.03
Bfactors> = 14.033 +/- 5.92
Bfactors> Shiftng-fct= 14.002
Bfactors> Scaling-fct= 183.703
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22120310140814104.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22120310140814104.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1129.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Chkmod> 106 vectors, 2883 coordinates in file.
Chkmod> That is: 961 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 64 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8287
0.0034 0.7338
0.0034 0.8926
0.0034 0.9325
0.0034 0.8533
0.0034 0.9122
241.2483 0.5436
272.2475 0.6621
275.9897 0.4344
363.0760 0.3733
382.6815 0.3080
450.9944 0.5539
453.4714 0.4700
475.4312 0.3007
487.5531 0.6364
503.0272 0.2957
517.3561 0.3111
537.4767 0.2133
548.1209 0.2324
569.2264 0.3802
596.6343 0.4099
616.9407 0.4378
638.2645 0.3531
646.9799 0.3131
660.0607 0.5572
666.4605 0.3889
672.7996 0.5212
689.4187 0.5261
692.4052 0.6312
717.0012 0.3349
730.6844 0.3615
742.4504 0.4700
756.7644 0.5117
763.0486 0.4902
769.3580 0.3923
782.1258 0.1533
790.5231 0.2488
802.3668 0.3563
811.7900 0.2730
816.9300 0.3806
826.2585 0.2757
827.1855 0.2902
839.7059 0.4266
853.7705 0.3255
863.9299 0.4338
867.1313 0.4675
871.6070 0.4626
881.8283 0.2031
886.9613 0.3732
895.8896 0.4143
900.8116 0.3353
913.3555 0.3977
929.4793 0.2548
933.6562 0.5171
947.3840 0.4418
956.5496 0.4506
962.6932 0.5052
967.2753 0.3091
977.7628 0.3155
983.4742 0.3826
990.7607 0.4529
995.8650 0.6064
999.8235 0.2383
1006.1717 0.3707
1008.5127 0.2098
1011.0232 0.3108
1019.9060 0.4797
1027.2784 0.4401
1034.0282 0.3835
1039.2037 0.4053
1043.7323 0.3103
1048.4101 0.3784
1053.2910 0.2172
1061.1538 0.4194
1069.8959 0.5174
1074.5146 0.4780
1078.6765 0.5485
1080.6968 0.3983
1092.3628 0.4427
1095.5962 0.3115
1097.7466 0.4234
1104.1724 0.5319
1107.3714 0.4176
1113.2123 0.4444
1118.4957 0.2744
1124.8031 0.3680
1128.9884 0.3995
1133.1583 0.2324
1141.4523 0.3826
1143.5164 0.3614
1146.0913 0.3377
1152.2477 0.4290
1155.3135 0.4696
1161.9284 0.4445
1163.4496 0.1602
1168.5059 0.3973
1171.5292 0.4101
1178.5534 0.4116
1183.5452 0.2583
1187.0270 0.3769
1190.9937 0.4129
1194.9472 0.3375
1197.4115 0.4502
1199.3793 0.4031
1203.7951 0.4997
1209.1703 0.2612
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22120310140814104 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
making animated gifs
11 models are in 22120310140814104.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22120310140814104 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
making animated gifs
11 models are in 22120310140814104.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22120310140814104 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
making animated gifs
11 models are in 22120310140814104.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22120310140814104 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
making animated gifs
11 models are in 22120310140814104.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22120310140814104 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22120310140814104.eigenfacs
22120310140814104.atom
making animated gifs
11 models are in 22120310140814104.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22120310140814104.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22120310140814104.10.pdb
22120310140814104.11.pdb
22120310140814104.7.pdb
22120310140814104.8.pdb
22120310140814104.9.pdb
STDERR:
real 0m4.076s
user 0m4.064s
sys 0m0.008s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|