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LOGs for ID: 22112816154931486

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22112816154931486.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22112816154931486.atom to be opened. Openam> File opened: 22112816154931486.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 406 First residue number = 1 Last residue number = 678 Number of atoms found = 3660 Mean number per residue = 9.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.913675 +/- 11.377992 From: -44.432000 To: 10.372000 = -31.848363 +/- 12.321653 From: -63.229000 To: -2.023000 = 26.814827 +/- 14.727474 From: -5.717000 To: 63.368000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'C ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 57 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.3140 % Filled. Pdbmat> 1395003 non-zero elements. Pdbmat> 152582 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.38 +/- 23.01 Maximum number = 132 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 3.051640E+06 Pdbmat> Larger element = 493.159 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 406 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22112816154931486.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22112816154931486.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22112816154931486.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3660 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 406 residues. Blocpdb> 25 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 28 atoms in block 2 Block first atom: 26 Blocpdb> 23 atoms in block 3 Block first atom: 54 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 77 Blocpdb> 28 atoms in block 5 Block first atom: 101 Blocpdb> 27 atoms in block 6 Block first atom: 129 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 156 Blocpdb> 21 atoms in block 8 Block first atom: 179 Blocpdb> 29 atoms in block 9 Block first atom: 200 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 229 Blocpdb> 22 atoms in block 11 Block first atom: 254 Blocpdb> 23 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 299 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 327 Blocpdb> 28 atoms in block 15 Block first atom: 353 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 381 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 401 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 421 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 446 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 468 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 488 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 504 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 521 Blocpdb> 26 atoms in block 24 Block first atom: 543 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 569 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 588 Blocpdb> 26 atoms in block 27 Block first atom: 611 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 637 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 661 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 685 Blocpdb> 30 atoms in block 31 Block first atom: 711 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 741 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 765 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 793 Blocpdb> 28 atoms in block 35 Block first atom: 821 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 849 Blocpdb> 29 atoms in block 37 Block first atom: 869 Blocpdb> 29 atoms in block 38 Block first atom: 898 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 927 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 950 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 977 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 999 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 1030 Blocpdb> 19 atoms in block 44 Block first atom: 1056 Blocpdb> 26 atoms in block 45 Block first atom: 1075 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 1101 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1120 Blocpdb> 25 atoms in block 48 Block first atom: 1146 Blocpdb> 28 atoms in block 49 Block first atom: 1171 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1199 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 1221 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 1245 Blocpdb> 30 atoms in block 53 Block first atom: 1262 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1292 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 1315 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1339 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1363 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1391 Blocpdb> 24 atoms in block 59 Block first atom: 1416 Blocpdb> 21 atoms in block 60 Block first atom: 1440 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1461 Blocpdb> 26 atoms in block 62 Block first atom: 1483 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 64 Block first atom: 1533 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 1557 Blocpdb> 30 atoms in block 66 Block first atom: 1593 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1623 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1649 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1673 Blocpdb> 27 atoms in block 70 Block first atom: 1696 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1723 Blocpdb> 35 atoms in block 72 Block first atom: 1749 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1784 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1806 Blocpdb> 21 atoms in block 75 Block first atom: 1832 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1853 Blocpdb> 26 atoms in block 77 Block first atom: 1875 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1901 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1926 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 1948 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1979 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 2001 Blocpdb> 26 atoms in block 83 Block first atom: 2027 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 2053 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 2071 Blocpdb> 23 atoms in block 86 Block first atom: 2095 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 2118 Blocpdb> 24 atoms in block 88 Block first atom: 2143 Blocpdb> 28 atoms in block 89 Block first atom: 2167 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 2195 Blocpdb> 34 atoms in block 91 Block first atom: 2217 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2251 Blocpdb> 26 atoms in block 93 Block first atom: 2280 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2306 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 2328 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2350 Blocpdb> 26 atoms in block 97 Block first atom: 2372 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2398 Blocpdb> 25 atoms in block 99 Block first atom: 2423 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 2448 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 2472 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 2492 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 2510 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 2529 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2545 Blocpdb> 34 atoms in block 106 Block first atom: 2568 Blocpdb> 22 atoms in block 107 Block first atom: 2602 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2624 Blocpdb> 29 atoms in block 109 Block first atom: 2649 Blocpdb> 23 atoms in block 110 Block first atom: 2678 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 2701 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2722 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 2746 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 2764 Blocpdb> 29 atoms in block 115 Block first atom: 2780 Blocpdb> 26 atoms in block 116 Block first atom: 2809 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 2835 Blocpdb> 63 atoms in block 118 Block first atom: 2843 Blocpdb> 60 atoms in block 119 Block first atom: 2906 Blocpdb> 65 atoms in block 120 Block first atom: 2966 Blocpdb> 60 atoms in block 121 Block first atom: 3031 Blocpdb> 62 atoms in block 122 Block first atom: 3091 Blocpdb> 65 atoms in block 123 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 3218 Blocpdb> 57 atoms in block 125 Block first atom: 3240 Blocpdb> 64 atoms in block 126 Block first atom: 3297 Blocpdb> 67 atoms in block 127 Block first atom: 3361 Blocpdb> 63 atoms in block 128 Block first atom: 3428 Blocpdb> 66 atoms in block 129 Block first atom: 3491 Blocpdb> 65 atoms in block 130 Block first atom: 3557 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 3622 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 132 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3642th, in residue W 501 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 132 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3643th, in residue W 511 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 132 Block first atom: 3642 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 133 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3646th, in residue W 536 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 133 Block first atom: 3645 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 134 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3648th, in residue W 545 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 134 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3649th, in residue W 563 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 134 Block first atom: 3648 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 135 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3651th, in residue W 593 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 135 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3652th, in residue W 595 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 135 Block first atom: 3651 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 136 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3654th, in residue W 617 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 136 Block first atom: 3654 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 137 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3657th, in residue W 640 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 137 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 3658th, in residue W 658 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 137 Block first atom: 3656 Blocpdb> 137 blocks. Blocpdb> At most, 67 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1395140 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10980 Prepmat> Matrix trace = 3051640.0000 Prepmat> Last element read: 10980 10980 169.0118 Prepmat> 9454 lines saved. Prepmat> 8026 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3660 RTB> Total mass = 3660.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3660 RTB> Number of blocks = 137 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 175399.7602 RTB> 49317 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 822 Diagstd> Nb of non-zero elements: 49317 Diagstd> Projected matrix trace = 175399.7602 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 822 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 175399.7602 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0706861 2.3750489 3.7507163 3.9532359 4.4495793 4.7763047 5.9206799 6.5772779 7.1922973 7.8935343 8.1585723 9.0289547 9.1431547 9.9278615 11.0772110 11.3259232 12.2607439 12.6182184 13.5793486 14.2333883 14.8091235 14.9071517 15.9071246 16.1830751 16.9153381 17.8878896 18.1880015 18.5889743 19.7766153 21.1772830 21.6924735 22.5848021 22.8462997 24.2866233 24.5496911 25.3503576 25.7521374 26.5389970 26.9424374 27.8025023 28.7420867 29.2498949 29.7247470 29.9853195 30.7363243 31.5069543 31.8651178 32.9918554 33.3709929 33.7104360 34.2314442 34.5511990 35.2493281 36.1120054 36.9135826 37.4969138 37.7132257 38.5087750 39.0823890 39.5715858 40.5531449 41.2191277 41.6539098 41.6931415 43.0592024 43.3469326 43.7538582 44.7878025 45.4986737 45.7710773 46.5197426 47.2526166 48.8959073 49.5516568 49.9371550 50.3121149 50.7830754 51.0201327 51.5496402 52.2726315 52.5701391 52.9261048 53.9652154 54.1182219 55.5756982 55.6733668 56.3412851 57.0373279 57.7653861 57.9978649 58.9756960 59.1476194 59.8931433 60.6021459 61.1506063 62.3504054 62.8012269 63.5213565 63.9779463 64.2581268 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034322 0.0034332 0.0034335 0.0034340 0.0034345 156.2616531 167.3522513 210.3063515 215.9094483 229.0628995 237.3237991 264.2293598 278.4956234 291.2252968 305.0921484 310.1718381 326.2977028 328.3547592 342.1551927 361.4185959 365.4534669 380.2364015 385.7396657 400.1609897 409.6844022 417.8880559 419.2688674 433.1029295 436.8434260 446.6173821 459.2771438 463.1138512 468.1909276 482.9156308 499.7242221 505.7662183 516.0638344 519.0428524 535.1540892 538.0446241 546.7481541 551.0638488 559.4194131 563.6554643 572.5813826 582.1761747 587.2965303 592.0445170 594.6338400 602.0343136 609.5347808 612.9895123 623.7328969 627.3065826 630.4889292 635.3424761 638.3029352 644.7193450 652.5609531 659.7636417 664.9562038 666.8714428 673.8684633 678.8687720 683.1042822 691.5244656 697.1796123 700.8469158 701.1768839 712.5712085 714.9480164 718.2960160 726.7334623 732.4781075 734.6675326 740.6515426 746.4628719 759.3317072 764.4064979 767.3741733 770.2497520 773.8464230 775.6504918 779.6651091 785.1135305 787.3445820 790.0057394 797.7232279 798.8533118 809.5389400 810.2499690 815.0957989 820.1152088 825.3328294 826.9919519 833.9342635 835.1489034 840.3957230 845.3553035 849.1719964 857.4620760 860.5564110 865.4762648 868.5812053 870.4810294 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3660 Rtb_to_modes> Number of blocs = 137 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.26 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 822 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 0.99998 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 65880 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 0.99998 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22112816154931486.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22112816154931486.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22112816154931486.atom Openam> file on opening on unit 11: 22112816154931486.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 406 First residue number = 1 Last residue number = 678 Number of atoms found = 3660 Mean number per residue = 9.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.776 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.26 Bfactors> 106 vectors, 10980 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.071000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.740 for 369 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.03 Bfactors> = 35.368 +/- 14.65 Bfactors> Shiftng-fct= 35.349 Bfactors> Scaling-fct= 557.647 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22112816154931486.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22112816154931486.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 3660 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112816154931486.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112816154931486.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22112816154931486 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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