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***  TRANSFERASE 15-FEB-17 XXXX  ***

LOGs for ID: 22112810450575144

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22112810450575144.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22112810450575144.atom to be opened. Openam> File opened: 22112810450575144.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 859 First residue number = 149 Last residue number = 38 Number of atoms found = 8875 Mean number per residue = 10.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 16.712406 +/- 32.944314 From: -46.153000 To: 89.935000 = 62.116953 +/- 15.569180 From: 10.471000 To: 101.539000 = 64.245385 +/- 20.685276 From: 10.205000 To: 115.542000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 145 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9006 % Filled. Pdbmat> 3192332 non-zero elements. Pdbmat> 348838 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.61 +/- 22.35 Maximum number = 127 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 6.976760E+06 Pdbmat> Larger element = 498.859 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 859 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22112810450575144.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22112810450575144.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22112810450575144.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8875 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 859 residues. Blocpdb> 42 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 44 atoms in block 2 Block first atom: 43 Blocpdb> 45 atoms in block 3 Block first atom: 87 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 132 Blocpdb> 40 atoms in block 5 Block first atom: 165 Blocpdb> 42 atoms in block 6 Block first atom: 205 Blocpdb> 47 atoms in block 7 Block first atom: 247 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 294 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 338 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 378 Blocpdb> 49 atoms in block 11 Block first atom: 414 Blocpdb> 35 atoms in block 12 Block first atom: 463 Blocpdb> 43 atoms in block 13 Block first atom: 498 Blocpdb> 43 atoms in block 14 Block first atom: 541 Blocpdb> 42 atoms in block 15 Block first atom: 584 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 626 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 673 Blocpdb> 47 atoms in block 18 Block first atom: 710 Blocpdb> 46 atoms in block 19 Block first atom: 757 Blocpdb> 38 atoms in block 20 Block first atom: 803 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 841 Blocpdb> 34 atoms in block 22 Block first atom: 885 Blocpdb> 37 atoms in block 23 Block first atom: 919 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 956 Blocpdb> 43 atoms in block 25 Block first atom: 1002 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1045 Blocpdb> 37 atoms in block 27 Block first atom: 1087 Blocpdb> 43 atoms in block 28 Block first atom: 1124 Blocpdb> 29 atoms in block 29 Block first atom: 1167 Blocpdb> 38 atoms in block 30 Block first atom: 1196 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1234 Blocpdb> 37 atoms in block 32 Block first atom: 1278 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1315 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1353 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1392 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1429 Blocpdb> 39 atoms in block 37 Block first atom: 1465 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1504 Blocpdb> 47 atoms in block 39 Block first atom: 1545 Blocpdb> 45 atoms in block 40 Block first atom: 1592 Blocpdb> 38 atoms in block 41 Block first atom: 1637 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1675 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1712 Blocpdb> 42 atoms in block 44 Block first atom: 1755 Blocpdb> 47 atoms in block 45 Block first atom: 1797 Blocpdb> 42 atoms in block 46 Block first atom: 1844 Blocpdb> 37 atoms in block 47 Block first atom: 1886 Blocpdb> 33 atoms in block 48 Block first atom: 1923 Blocpdb> 30 atoms in block 49 Block first atom: 1956 Blocpdb> 43 atoms in block 50 Block first atom: 1986 Blocpdb> 46 atoms in block 51 Block first atom: 2029 Blocpdb> 42 atoms in block 52 Block first atom: 2075 Blocpdb> 47 atoms in block 53 Block first atom: 2117 Blocpdb> 41 atoms in block 54 Block first atom: 2164 Blocpdb> 41 atoms in block 55 Block first atom: 2205 Blocpdb> 40 atoms in block 56 Block first atom: 2246 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 2286 Blocpdb> 38 atoms in block 58 Block first atom: 2334 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2372 Blocpdb> 34 atoms in block 60 Block first atom: 2421 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2455 Blocpdb> 44 atoms in block 62 Block first atom: 2499 Blocpdb> 41 atoms in block 63 Block first atom: 2543 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 2584 Blocpdb> 46 atoms in block 65 Block first atom: 2631 Blocpdb> 42 atoms in block 66 Block first atom: 2677 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 2719 Blocpdb> 44 atoms in block 68 Block first atom: 2763 Blocpdb> 40 atoms in block 69 Block first atom: 2807 Blocpdb> 49 atoms in block 70 Block first atom: 2847 Blocpdb> 38 atoms in block 71 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 72 Block first atom: 2934 Blocpdb> 42 atoms in block 73 Block first atom: 2953 Blocpdb> 44 atoms in block 74 Block first atom: 2995 Blocpdb> 45 atoms in block 75 Block first atom: 3039 Blocpdb> 33 atoms in block 76 Block first atom: 3084 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3117 Blocpdb> 42 atoms in block 78 Block first atom: 3157 Blocpdb> 47 atoms in block 79 Block first atom: 3199 Blocpdb> 44 atoms in block 80 Block first atom: 3246 Blocpdb> 40 atoms in block 81 Block first atom: 3290 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 3330 Blocpdb> 49 atoms in block 83 Block first atom: 3366 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 3415 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 3450 Blocpdb> 43 atoms in block 86 Block first atom: 3493 Blocpdb> 42 atoms in block 87 Block first atom: 3536 Blocpdb> 47 atoms in block 88 Block first atom: 3578 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 3625 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 3662 Blocpdb> 46 atoms in block 91 Block first atom: 3709 Blocpdb> 38 atoms in block 92 Block first atom: 3755 Blocpdb> 44 atoms in block 93 Block first atom: 3793 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 3837 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 3871 Blocpdb> 46 atoms in block 96 Block first atom: 3908 Blocpdb> 43 atoms in block 97 Block first atom: 3954 Blocpdb> 42 atoms in block 98 Block first atom: 3997 Blocpdb> 37 atoms in block 99 Block first atom: 4039 Blocpdb> 43 atoms in block 100 Block first atom: 4076 Blocpdb> 29 atoms in block 101 Block first atom: 4119 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 4148 Blocpdb> 44 atoms in block 103 Block first atom: 4186 Blocpdb> 37 atoms in block 104 Block first atom: 4230 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 4267 Blocpdb> 39 atoms in block 106 Block first atom: 4305 Blocpdb> 37 atoms in block 107 Block first atom: 4344 Blocpdb> 36 atoms in block 108 Block first atom: 4381 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 4417 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 4456 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 4497 Blocpdb> 45 atoms in block 112 Block first atom: 4544 Blocpdb> 38 atoms in block 113 Block first atom: 4589 Blocpdb> 37 atoms in block 114 Block first atom: 4627 Blocpdb> 43 atoms in block 115 Block first atom: 4664 Blocpdb> 42 atoms in block 116 Block first atom: 4707 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 4749 Blocpdb> 42 atoms in block 118 Block first atom: 4796 Blocpdb> 37 atoms in block 119 Block first atom: 4838 Blocpdb> 33 atoms in block 120 Block first atom: 4875 Blocpdb> 30 atoms in block 121 Block first atom: 4908 Blocpdb> 43 atoms in block 122 Block first atom: 4938 Blocpdb> 46 atoms in block 123 Block first atom: 4981 Blocpdb> 42 atoms in block 124 Block first atom: 5027 Blocpdb> 47 atoms in block 125 Block first atom: 5069 Blocpdb> 41 atoms in block 126 Block first atom: 5116 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 5157 Blocpdb> 40 atoms in block 128 Block first atom: 5198 Blocpdb> 48 atoms in block 129 Block first atom: 5238 Blocpdb> 38 atoms in block 130 Block first atom: 5286 Blocpdb> 49 atoms in block 131 Block first atom: 5324 Blocpdb> 34 atoms in block 132 Block first atom: 5373 Blocpdb> 44 atoms in block 133 Block first atom: 5407 Blocpdb> 44 atoms in block 134 Block first atom: 5451 Blocpdb> 41 atoms in block 135 Block first atom: 5495 Blocpdb> 47 atoms in block 136 Block first atom: 5536 Blocpdb> 46 atoms in block 137 Block first atom: 5583 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 5629 Blocpdb> 44 atoms in block 139 Block first atom: 5671 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 5715 Blocpdb> 40 atoms in block 141 Block first atom: 5759 Blocpdb> 49 atoms in block 142 Block first atom: 5799 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 5848 Blocpdb> 19 atoms in block 144 Block first atom: 5886 Blocpdb> 102 atoms in block 145 Block first atom: 5905 Blocpdb> 103 atoms in block 146 Block first atom: 6007 Blocpdb> 102 atoms in block 147 Block first atom: 6110 Blocpdb> 104 atoms in block 148 Block first atom: 6212 Blocpdb> 102 atoms in block 149 Block first atom: 6316 Blocpdb> 102 atoms in block 150 Block first atom: 6418 Blocpdb> 103 atoms in block 151 Block first atom: 6520 Blocpdb> 39 atoms in block 152 Block first atom: 6623 Blocpdb> 101 atoms in block 153 Block first atom: 6662 Blocpdb> 103 atoms in block 154 Block first atom: 6763 Blocpdb> 103 atoms in block 155 Block first atom: 6866 Blocpdb> 102 atoms in block 156 Block first atom: 6969 Blocpdb> 103 atoms in block 157 Block first atom: 7071 Blocpdb> 103 atoms in block 158 Block first atom: 7174 Blocpdb> 104 atoms in block 159 Block first atom: 7277 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 7381 Blocpdb> 102 atoms in block 161 Block first atom: 7400 Blocpdb> 103 atoms in block 162 Block first atom: 7502 Blocpdb> 102 atoms in block 163 Block first atom: 7605 Blocpdb> 104 atoms in block 164 Block first atom: 7707 Blocpdb> 102 atoms in block 165 Block first atom: 7811 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 7913 Blocpdb> 103 atoms in block 167 Block first atom: 8015 Blocpdb> 20 atoms in block 168 Block first atom: 8118 Blocpdb> 101 atoms in block 169 Block first atom: 8138 Blocpdb> 103 atoms in block 170 Block first atom: 8239 Blocpdb> 103 atoms in block 171 Block first atom: 8342 Blocpdb> 102 atoms in block 172 Block first atom: 8445 Blocpdb> 103 atoms in block 173 Block first atom: 8547 Blocpdb> 103 atoms in block 174 Block first atom: 8650 Blocpdb> 104 atoms in block 175 Block first atom: 8753 Blocpdb> 19 atoms in block 176 Block first atom: 8856 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3192508 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26625 Prepmat> Matrix trace = 6976760.0000 Prepmat> Last element read: 26625 26625 170.1644 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 14199 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8875 RTB> Total mass = 8875.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8875 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 179066.0172 RTB> 46932 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46932 Diagstd> Projected matrix trace = 179066.0172 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 179066.0172 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0416195 0.1062672 0.2197508 0.2495509 0.2929739 0.3240758 0.4007423 0.4984879 0.6982199 0.7975021 1.0477893 1.2215245 1.6140685 1.8269111 1.9127566 2.0935253 2.1515569 2.2224275 2.6981578 2.8166005 2.9528354 3.0350823 3.1578365 3.3276732 3.5697686 3.9454116 4.3251500 4.5280152 5.3600473 5.5419403 5.7234703 6.0741724 6.4455594 6.6858198 6.8324847 6.9924465 7.4064748 7.7062785 7.8578320 8.0439242 8.2271487 8.6409895 8.9753385 9.2452350 9.5069984 9.8491947 10.2336883 10.8849315 11.3480240 11.4615233 11.8100362 12.1512156 12.7027819 13.0585168 13.3230946 13.9385720 14.3147037 14.4335522 14.5986078 14.9500717 15.2358948 15.4472759 15.8805967 15.9697741 16.5510889 16.6004832 16.9475667 17.4201598 17.7480552 17.9114951 18.1992714 18.7887266 19.2242499 19.3126547 19.5957291 20.0749429 20.3339813 20.7446885 21.2330851 21.5102836 21.5584395 22.4639585 23.2527992 23.3365186 23.9313761 24.0743845 24.5037930 25.0805701 25.5551609 26.0419813 26.2561017 27.1180174 27.6826752 27.9989910 28.7263550 28.8505016 29.1799057 29.3188614 29.7740952 30.0699752 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034318 0.0034324 0.0034341 0.0034343 0.0034345 0.0034350 22.1535749 35.3993119 50.9050124 54.2468888 58.7773200 61.8185205 68.7429053 76.6694894 90.7384567 96.9753178 111.1558354 120.0179949 137.9609790 146.7756430 150.1845062 157.1210567 159.2838334 161.8859225 178.3729329 182.2459585 186.6014022 189.1823060 192.9701361 198.0913978 205.1706864 215.6956755 225.8374017 231.0730078 251.4082876 255.6384650 259.7915358 267.6324915 275.6929038 280.7841655 283.8472003 287.1506843 295.5296460 301.4516254 304.4014027 307.9847864 311.4726763 319.2103907 325.3274417 330.1826576 334.8243170 340.7969053 347.3852487 358.2680917 365.8098570 367.6346622 373.1821771 378.5342170 387.0300627 392.4119344 396.3673158 405.4193020 410.8529998 412.5550364 414.9072277 419.8720039 423.8666649 426.7968757 432.7416418 433.9549706 441.7825582 442.4412849 447.0426472 453.2328165 457.4784759 459.5800837 463.2573105 470.6997349 476.1238993 477.2173980 480.7020719 486.5443563 489.6733739 494.5938808 500.3821745 503.6378346 504.2012768 514.6813413 523.6401049 524.5819147 531.2257479 532.8106244 537.5414246 543.8310283 548.9522760 554.1563208 556.4298290 565.4891122 571.3461552 574.6011231 582.0168282 583.2731229 586.5934680 587.9884982 592.5357614 595.4726447 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8875 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9875E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1620E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2496 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3241 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.614 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.827 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.035 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.832 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99996 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00005 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 159750 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99996 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00005 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22112810450575144.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22112810450575144.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22112810450575144.atom Openam> file on opening on unit 11: 22112810450575144.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 859 First residue number = 149 Last residue number = 38 Number of atoms found = 8875 Mean number per residue = 10.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9875E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1620E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2496 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3241 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.614 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.827 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.832 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Bfactors> 106 vectors, 26625 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.041620 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.438 for 714 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.085 +/- 0.05 Bfactors> = 189.088 +/- 44.77 Bfactors> Shiftng-fct= 189.003 Bfactors> Scaling-fct= 981.377 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22112810450575144.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22112810450575144.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8 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Chkmod> That is: 8875 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112810450575144.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112810450575144.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22112810450575144 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom 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0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22112810450575144.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22112810450575144 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22112810450575144 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22112810450575144.eigenfacs 22112810450575144.atom making animated gifs 11 models are in 22112810450575144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112810450575144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22112810450575144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22112810450575144.10.pdb 22112810450575144.11.pdb 22112810450575144.7.pdb 22112810450575144.8.pdb 22112810450575144.9.pdb STDERR: real 0m34.796s user 0m34.656s sys 0m0.104s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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