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LOGs for ID: 2211280533084420

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2211280533084420.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2211280533084420.atom to be opened. Openam> File opened: 2211280533084420.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.006036 +/- 16.774214 From: -32.831000 To: 34.268000 = 1.432164 +/- 11.766567 From: -23.727000 To: 26.432000 = 0.004206 +/- 16.687721 From: -35.332000 To: 36.316000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3127 % Filled. Pdbmat> 10482791 non-zero elements. Pdbmat> 1156119 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 173.58 +/- 44.80 Maximum number = 256 Minimum number = 24 Pdbmat> Matrix trace = 2.312238E+07 Pdbmat> Larger element = 897.149 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 908 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2211280533084420.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2211280533084420.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2211280533084420.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13321 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 908 residues. Blocpdb> 98 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 99 Blocpdb> 84 atoms in block 3 Block first atom: 170 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 254 Blocpdb> 63 atoms in block 5 Block first atom: 314 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 377 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 441 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 500 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 571 Blocpdb> 80 atoms in block 10 Block first atom: 646 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 726 Blocpdb> 65 atoms in block 12 Block first atom: 788 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 853 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 927 Blocpdb> 70 atoms in block 15 Block first atom: 996 Blocpdb> 83 atoms in block 16 Block first atom: 1066 Blocpdb> 83 atoms in block 17 Block first atom: 1149 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1232 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1310 Blocpdb> 79 atoms in block 20 Block first atom: 1369 Blocpdb> 63 atoms in block 21 Block first atom: 1448 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1511 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1589 Blocpdb> 63 atoms in block 24 Block first atom: 1655 Blocpdb> 64 atoms in block 25 Block first atom: 1718 Blocpdb> 65 atoms in block 26 Block first atom: 1782 Blocpdb> 63 atoms in block 27 Block first atom: 1847 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 1910 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 1988 Blocpdb> 83 atoms in block 30 Block first atom: 2065 Blocpdb> 74 atoms in block 31 Block first atom: 2148 Blocpdb> 72 atoms in block 32 Block first atom: 2222 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2294 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2366 Blocpdb> 93 atoms in block 35 Block first atom: 2435 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2528 Blocpdb> 69 atoms in block 37 Block first atom: 2602 Blocpdb> 73 atoms in block 38 Block first atom: 2671 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2744 Blocpdb> 64 atoms in block 40 Block first atom: 2813 Blocpdb> 96 atoms in block 41 Block first atom: 2877 Blocpdb> 90 atoms in block 42 Block first atom: 2973 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 3063 Blocpdb> 65 atoms in block 44 Block first atom: 3132 Blocpdb> 104 atoms in block 45 Block first atom: 3197 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 3301 Blocpdb> 98 atoms in block 47 Block first atom: 3331 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 3429 Blocpdb> 84 atoms in block 49 Block first atom: 3500 Blocpdb> 60 atoms in block 50 Block first atom: 3584 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3644 Blocpdb> 64 atoms in block 52 Block first atom: 3707 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 3771 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3830 Blocpdb> 75 atoms in block 55 Block first atom: 3901 Blocpdb> 80 atoms in block 56 Block first atom: 3976 Blocpdb> 62 atoms in block 57 Block first atom: 4056 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 4118 Blocpdb> 74 atoms in block 59 Block first atom: 4183 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 4257 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 4326 Blocpdb> 83 atoms in block 62 Block first atom: 4396 Blocpdb> 83 atoms in block 63 Block first atom: 4479 Blocpdb> 78 atoms in block 64 Block first atom: 4562 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4640 Blocpdb> 79 atoms in block 66 Block first atom: 4699 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4778 Blocpdb> 78 atoms in block 68 Block first atom: 4841 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4919 Blocpdb> 63 atoms in block 70 Block first atom: 4985 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 5048 Blocpdb> 65 atoms in block 72 Block first atom: 5112 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 5177 Blocpdb> 78 atoms in block 74 Block first atom: 5240 Blocpdb> 77 atoms in block 75 Block first atom: 5318 Blocpdb> 83 atoms in block 76 Block first atom: 5395 Blocpdb> 74 atoms in block 77 Block first atom: 5478 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5552 Blocpdb> 72 atoms in block 79 Block first atom: 5624 Blocpdb> 69 atoms in block 80 Block first atom: 5696 Blocpdb> 93 atoms in block 81 Block first atom: 5765 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 5858 Blocpdb> 69 atoms in block 83 Block first atom: 5932 Blocpdb> 73 atoms in block 84 Block first atom: 6001 Blocpdb> 69 atoms in block 85 Block first atom: 6074 Blocpdb> 64 atoms in block 86 Block first atom: 6143 Blocpdb> 96 atoms in block 87 Block first atom: 6207 Blocpdb> 90 atoms in block 88 Block first atom: 6303 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 6393 Blocpdb> 65 atoms in block 90 Block first atom: 6462 Blocpdb> 104 atoms in block 91 Block first atom: 6527 Blocpdb> 30 atoms in block 92 Block first atom: 6631 Blocpdb> 98 atoms in block 93 Block first atom: 6661 Blocpdb> 71 atoms in block 94 Block first atom: 6759 Blocpdb> 84 atoms in block 95 Block first atom: 6830 Blocpdb> 60 atoms in block 96 Block first atom: 6914 Blocpdb> 63 atoms in block 97 Block first atom: 6974 Blocpdb> 64 atoms in block 98 Block first atom: 7037 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 7101 Blocpdb> 71 atoms in block 100 Block first atom: 7160 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 7231 Blocpdb> 80 atoms in block 102 Block first atom: 7306 Blocpdb> 62 atoms in block 103 Block first atom: 7386 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 7448 Blocpdb> 74 atoms in block 105 Block first atom: 7513 Blocpdb> 69 atoms in block 106 Block first atom: 7587 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7656 Blocpdb> 83 atoms in block 108 Block first atom: 7726 Blocpdb> 83 atoms in block 109 Block first atom: 7809 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 7892 Blocpdb> 59 atoms in block 111 Block first atom: 7970 Blocpdb> 79 atoms in block 112 Block first atom: 8029 Blocpdb> 63 atoms in block 113 Block first atom: 8108 Blocpdb> 78 atoms in block 114 Block first atom: 8171 Blocpdb> 66 atoms in block 115 Block first atom: 8249 Blocpdb> 63 atoms in block 116 Block first atom: 8315 Blocpdb> 64 atoms in block 117 Block first atom: 8378 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 8442 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 8507 Blocpdb> 78 atoms in block 120 Block first atom: 8570 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 8648 Blocpdb> 83 atoms in block 122 Block first atom: 8725 Blocpdb> 74 atoms in block 123 Block first atom: 8808 Blocpdb> 72 atoms in block 124 Block first atom: 8882 Blocpdb> 72 atoms in block 125 Block first atom: 8954 Blocpdb> 69 atoms in block 126 Block first atom: 9026 Blocpdb> 93 atoms in block 127 Block first atom: 9095 Blocpdb> 74 atoms in block 128 Block first atom: 9188 Blocpdb> 69 atoms in block 129 Block first atom: 9262 Blocpdb> 73 atoms in block 130 Block first atom: 9331 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9404 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 9473 Blocpdb> 96 atoms in block 133 Block first atom: 9537 Blocpdb> 90 atoms in block 134 Block first atom: 9633 Blocpdb> 69 atoms in block 135 Block first atom: 9723 Blocpdb> 65 atoms in block 136 Block first atom: 9792 Blocpdb> 104 atoms in block 137 Block first atom: 9857 Blocpdb> 30 atoms in block 138 Block first atom: 9961 Blocpdb> 98 atoms in block 139 Block first atom: 9991 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 10089 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 10160 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 10244 Blocpdb> 63 atoms in block 143 Block first atom: 10304 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 10367 Blocpdb> 59 atoms in block 145 Block first atom: 10431 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 10490 Blocpdb> 75 atoms in block 147 Block first atom: 10561 Blocpdb> 80 atoms in block 148 Block first atom: 10636 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 10716 Blocpdb> 65 atoms in block 150 Block first atom: 10778 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 10843 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 10917 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 10986 Blocpdb> 83 atoms in block 154 Block first atom: 11056 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 11139 Blocpdb> 78 atoms in block 156 Block first atom: 11222 Blocpdb> 59 atoms in block 157 Block first atom: 11300 Blocpdb> 79 atoms in block 158 Block first atom: 11359 Blocpdb> 63 atoms in block 159 Block first atom: 11438 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 11501 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 11579 Blocpdb> 63 atoms in block 162 Block first atom: 11645 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 11708 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 11773 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 11838 Blocpdb> 78 atoms in block 166 Block first atom: 11901 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 11979 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 12056 Blocpdb> 74 atoms in block 169 Block first atom: 12139 Blocpdb> 72 atoms in block 170 Block first atom: 12213 Blocpdb> 72 atoms in block 171 Block first atom: 12285 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 12357 Blocpdb> 93 atoms in block 173 Block first atom: 12426 Blocpdb> 74 atoms in block 174 Block first atom: 12519 Blocpdb> 69 atoms in block 175 Block first atom: 12593 Blocpdb> 73 atoms in block 176 Block first atom: 12662 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 12735 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12804 Blocpdb> 96 atoms in block 179 Block first atom: 12868 Blocpdb> 90 atoms in block 180 Block first atom: 12964 Blocpdb> 69 atoms in block 181 Block first atom: 13054 Blocpdb> 65 atoms in block 182 Block first atom: 13123 Blocpdb> 104 atoms in block 183 Block first atom: 13188 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 13291 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10482975 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39963 Prepmat> Matrix trace = 23122380.0000 Prepmat> Last element read: 39963 39963 56.9356 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15067 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13321 RTB> Total mass = 13321.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13321 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 460873.5042 RTB> 67548 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67548 Diagstd> Projected matrix trace = 460873.5042 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 460873.5042 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.6489189 7.9806641 13.4123794 14.6179573 15.5340919 17.5744682 18.5368434 19.1884409 19.9219126 20.0784771 22.5639851 24.5510554 24.8096140 25.3042452 28.9170730 30.0122209 30.5890400 31.5234410 32.2982895 32.6999675 34.3040611 34.7759471 35.9016451 36.7749230 37.3226946 38.3556608 38.9370782 40.7945478 42.8088992 43.4600398 44.4456242 45.3208694 46.5725320 48.9181542 50.0021840 51.5442829 52.6532235 54.1845294 55.9984514 56.9581611 57.1043709 58.7482907 59.4572951 60.2900790 61.3918238 61.8034432 63.2286550 64.6779295 65.5685443 66.9114203 66.9867924 67.5454769 68.5045791 68.9278851 70.0010078 71.7337395 72.7212873 73.1590714 74.3113378 74.6908779 76.6413663 77.0102898 77.5185292 77.8003259 79.9594487 80.6508811 81.0988052 82.5067750 83.4594748 83.9962661 84.4187894 85.9885214 86.5098071 88.0476817 88.5679886 89.2009009 90.1488642 92.2921015 92.6041536 93.1189132 93.7783082 95.1881172 95.9236803 97.1399948 97.3780457 97.8994841 98.6987552 100.0146320 100.4101817 101.2641718 102.4537863 103.5237173 104.1141462 105.7580220 106.0198735 106.7427188 107.2677486 107.8988279 108.6537791 110.1560717 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034323 0.0034330 0.0034341 0.0034346 0.0034348 258.0940259 306.7713485 397.6932281 415.1821031 427.9945268 455.2357672 467.5339699 475.6802553 484.6863572 486.5871824 515.8259451 538.0595743 540.8854308 546.2506594 583.9456745 594.9005184 600.5901479 609.6942356 617.1419117 620.9676001 636.0160117 640.3755819 650.6575224 658.5233311 663.4096368 672.5274492 677.6055588 693.5796500 710.4971015 715.8801822 723.9520215 731.0454802 741.0716600 759.5044296 767.8736541 779.6245944 787.9665149 799.3425532 812.6121078 819.5458589 820.5970585 832.3249200 837.3323187 843.1759424 850.8451901 853.6927949 863.4799385 873.3198560 879.3121035 888.2708380 888.7709921 892.4695682 898.7834805 901.5561013 908.5470581 919.7229338 926.0321383 928.8153252 936.1012392 938.4887312 950.6636745 952.9490009 956.0883853 957.8246033 971.0244731 975.2138007 977.9181538 986.3705252 992.0489553 995.2341521 997.7341565 1006.9676553 1010.0152987 1018.9532126 1021.9594672 1025.6044593 1031.0397518 1043.2239475 1044.9860996 1047.8864621 1051.5900715 1059.4650841 1063.5506973 1070.2723808 1071.5829809 1074.4481980 1078.8252879 1085.9930626 1088.1384503 1092.7559701 1099.1558781 1104.8802472 1108.0265104 1116.7396604 1118.1213007 1121.9265110 1124.6823070 1127.9858293 1131.9251211 1139.7234928 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13321 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 239778 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2211280533084420.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2211280533084420.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2211280533084420.atom Openam> file on opening on unit 11: 2211280533084420.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2 Bfactors> 106 vectors, 39963 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.649000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.568 for 908 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.002 +/- 0.00 Bfactors> = 16.257 +/- 25.94 Bfactors> Shiftng-fct= 16.254 Bfactors> Scaling-fct= 13248.908 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2211280533084420.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2211280533084420.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.9 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140. Chkmod> 106 vectors, 39963 coordinates in file. Chkmod> That is: 13321 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8117 0.0034 0.8527 0.0034 0.9689 0.0034 0.8203 0.0034 0.7486 0.0034 0.7526 258.0848 0.6575 306.7646 0.6560 397.6409 0.6621 415.1933 0.7380 427.9198 0.8100 455.1584 0.4987 467.5537 0.4929 475.6792 0.5207 484.6423 0.5136 486.5847 0.4754 515.7583 0.0205 538.0249 0.5531 540.8664 0.5382 546.1814 0.5301 583.9502 0.5425 594.8530 0.4027 600.5738 0.4866 609.6348 0.2559 617.1318 0.3468 620.9413 0.2938 635.9511 0.1606 640.3854 0.3355 650.6147 0.4115 658.4510 0.3368 663.3572 0.4675 672.5366 0.1330 677.6019 0.4005 693.5112 0.3169 710.4757 0.2717 715.8491 0.3249 723.9566 0.6055 731.0071 0.2921 741.0197 0.4724 759.4862 0.4419 767.8239 0.4616 779.5587 0.5594 787.9086 0.4549 799.2748 0.2805 812.5885 0.3274 819.5239 0.3488 820.5304 0.4971 832.3013 0.3963 837.3154 0.3324 843.1392 0.3990 850.7960 0.3926 853.6324 0.2766 863.4521 0.3572 873.2963 0.3476 879.2841 0.4592 888.2233 0.5393 888.7541 0.4594 892.4611 0.3629 898.7149 0.3763 901.5312 0.3495 908.5015 0.2875 919.6595 0.3852 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structure for DQ=-80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom making animated gifs 11 models are in 2211280533084420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2211280533084420 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom making animated gifs 11 models are in 2211280533084420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2211280533084420 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom making animated gifs 11 models are in 2211280533084420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2211280533084420 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 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making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2211280533084420 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2211280533084420.eigenfacs 2211280533084420.atom making animated gifs 11 models are in 2211280533084420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2211280533084420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2211280533084420.10.pdb 2211280533084420.11.pdb 2211280533084420.7.pdb 2211280533084420.8.pdb 2211280533084420.9.pdb STDERR: real 1m3.482s user 1m3.040s sys 0m0.388s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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