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LOGs for ID: 221128051413118155

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221128051413118155.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221128051413118155.atom to be opened. Openam> File opened: 221128051413118155.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.005276 +/- 16.789293 From: -34.786000 To: 34.557000 = 1.437513 +/- 11.706269 From: -24.659000 To: 26.400000 = 0.003732 +/- 16.649400 From: -35.404000 To: 35.914000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3201 % Filled. Pdbmat> 10541707 non-zero elements. Pdbmat> 1162677 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 174.56 +/- 44.97 Maximum number = 258 Minimum number = 23 Pdbmat> Matrix trace = 2.325354E+07 Pdbmat> Larger element = 899.727 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 908 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221128051413118155.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221128051413118155.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221128051413118155.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13321 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 908 residues. Blocpdb> 98 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 99 Blocpdb> 84 atoms in block 3 Block first atom: 170 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 254 Blocpdb> 63 atoms in block 5 Block first atom: 314 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 377 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 441 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 500 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 571 Blocpdb> 80 atoms in block 10 Block first atom: 646 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 726 Blocpdb> 65 atoms in block 12 Block first atom: 788 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 853 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 927 Blocpdb> 70 atoms in block 15 Block first atom: 996 Blocpdb> 83 atoms in block 16 Block first atom: 1066 Blocpdb> 83 atoms in block 17 Block first atom: 1149 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1232 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1310 Blocpdb> 79 atoms in block 20 Block first atom: 1369 Blocpdb> 63 atoms in block 21 Block first atom: 1448 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1511 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1589 Blocpdb> 63 atoms in block 24 Block first atom: 1655 Blocpdb> 64 atoms in block 25 Block first atom: 1718 Blocpdb> 65 atoms in block 26 Block first atom: 1782 Blocpdb> 63 atoms in block 27 Block first atom: 1847 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 1910 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 1988 Blocpdb> 83 atoms in block 30 Block first atom: 2065 Blocpdb> 74 atoms in block 31 Block first atom: 2148 Blocpdb> 72 atoms in block 32 Block first atom: 2222 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2294 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2366 Blocpdb> 93 atoms in block 35 Block first atom: 2435 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2528 Blocpdb> 69 atoms in block 37 Block first atom: 2602 Blocpdb> 73 atoms in block 38 Block first atom: 2671 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2744 Blocpdb> 64 atoms in block 40 Block first atom: 2813 Blocpdb> 96 atoms in block 41 Block first atom: 2877 Blocpdb> 90 atoms in block 42 Block first atom: 2973 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 3063 Blocpdb> 65 atoms in block 44 Block first atom: 3132 Blocpdb> 104 atoms in block 45 Block first atom: 3197 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 3301 Blocpdb> 98 atoms in block 47 Block first atom: 3331 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 3429 Blocpdb> 84 atoms in block 49 Block first atom: 3500 Blocpdb> 60 atoms in block 50 Block first atom: 3584 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3644 Blocpdb> 64 atoms in block 52 Block first atom: 3707 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 3771 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3830 Blocpdb> 75 atoms in block 55 Block first atom: 3901 Blocpdb> 80 atoms in block 56 Block first atom: 3976 Blocpdb> 62 atoms in block 57 Block first atom: 4056 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 4118 Blocpdb> 74 atoms in block 59 Block first atom: 4183 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 4257 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 4326 Blocpdb> 83 atoms in block 62 Block first atom: 4396 Blocpdb> 83 atoms in block 63 Block first atom: 4479 Blocpdb> 78 atoms in block 64 Block first atom: 4562 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4640 Blocpdb> 79 atoms in block 66 Block first atom: 4699 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4778 Blocpdb> 78 atoms in block 68 Block first atom: 4841 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4919 Blocpdb> 63 atoms in block 70 Block first atom: 4985 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 5048 Blocpdb> 65 atoms in block 72 Block first atom: 5112 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 5177 Blocpdb> 78 atoms in block 74 Block first atom: 5240 Blocpdb> 77 atoms in block 75 Block first atom: 5318 Blocpdb> 83 atoms in block 76 Block first atom: 5395 Blocpdb> 74 atoms in block 77 Block first atom: 5478 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5552 Blocpdb> 72 atoms in block 79 Block first atom: 5624 Blocpdb> 69 atoms in block 80 Block first atom: 5696 Blocpdb> 93 atoms in block 81 Block first atom: 5765 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 5858 Blocpdb> 69 atoms in block 83 Block first atom: 5932 Blocpdb> 73 atoms in block 84 Block first atom: 6001 Blocpdb> 69 atoms in block 85 Block first atom: 6074 Blocpdb> 64 atoms in block 86 Block first atom: 6143 Blocpdb> 96 atoms in block 87 Block first atom: 6207 Blocpdb> 90 atoms in block 88 Block first atom: 6303 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 6393 Blocpdb> 65 atoms in block 90 Block first atom: 6462 Blocpdb> 104 atoms in block 91 Block first atom: 6527 Blocpdb> 30 atoms in block 92 Block first atom: 6631 Blocpdb> 98 atoms in block 93 Block first atom: 6661 Blocpdb> 71 atoms in block 94 Block first atom: 6759 Blocpdb> 84 atoms in block 95 Block first atom: 6830 Blocpdb> 60 atoms in block 96 Block first atom: 6914 Blocpdb> 63 atoms in block 97 Block first atom: 6974 Blocpdb> 64 atoms in block 98 Block first atom: 7037 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 7101 Blocpdb> 71 atoms in block 100 Block first atom: 7160 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 7231 Blocpdb> 80 atoms in block 102 Block first atom: 7306 Blocpdb> 62 atoms in block 103 Block first atom: 7386 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 7448 Blocpdb> 74 atoms in block 105 Block first atom: 7513 Blocpdb> 69 atoms in block 106 Block first atom: 7587 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7656 Blocpdb> 83 atoms in block 108 Block first atom: 7726 Blocpdb> 83 atoms in block 109 Block first atom: 7809 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 7892 Blocpdb> 59 atoms in block 111 Block first atom: 7970 Blocpdb> 79 atoms in block 112 Block first atom: 8029 Blocpdb> 63 atoms in block 113 Block first atom: 8108 Blocpdb> 78 atoms in block 114 Block first atom: 8171 Blocpdb> 66 atoms in block 115 Block first atom: 8249 Blocpdb> 63 atoms in block 116 Block first atom: 8315 Blocpdb> 64 atoms in block 117 Block first atom: 8378 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 8442 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 8507 Blocpdb> 78 atoms in block 120 Block first atom: 8570 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 8648 Blocpdb> 83 atoms in block 122 Block first atom: 8725 Blocpdb> 74 atoms in block 123 Block first atom: 8808 Blocpdb> 72 atoms in block 124 Block first atom: 8882 Blocpdb> 72 atoms in block 125 Block first atom: 8954 Blocpdb> 69 atoms in block 126 Block first atom: 9026 Blocpdb> 93 atoms in block 127 Block first atom: 9095 Blocpdb> 74 atoms in block 128 Block first atom: 9188 Blocpdb> 69 atoms in block 129 Block first atom: 9262 Blocpdb> 73 atoms in block 130 Block first atom: 9331 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9404 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 9473 Blocpdb> 96 atoms in block 133 Block first atom: 9537 Blocpdb> 90 atoms in block 134 Block first atom: 9633 Blocpdb> 69 atoms in block 135 Block first atom: 9723 Blocpdb> 65 atoms in block 136 Block first atom: 9792 Blocpdb> 104 atoms in block 137 Block first atom: 9857 Blocpdb> 30 atoms in block 138 Block first atom: 9961 Blocpdb> 98 atoms in block 139 Block first atom: 9991 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 10089 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 10160 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 10244 Blocpdb> 63 atoms in block 143 Block first atom: 10304 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 10367 Blocpdb> 59 atoms in block 145 Block first atom: 10431 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 10490 Blocpdb> 75 atoms in block 147 Block first atom: 10561 Blocpdb> 80 atoms in block 148 Block first atom: 10636 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 10716 Blocpdb> 65 atoms in block 150 Block first atom: 10778 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 10843 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 10917 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 10986 Blocpdb> 83 atoms in block 154 Block first atom: 11056 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 11139 Blocpdb> 78 atoms in block 156 Block first atom: 11222 Blocpdb> 59 atoms in block 157 Block first atom: 11300 Blocpdb> 79 atoms in block 158 Block first atom: 11359 Blocpdb> 63 atoms in block 159 Block first atom: 11438 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 11501 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 11579 Blocpdb> 63 atoms in block 162 Block first atom: 11645 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 11708 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 11773 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 11838 Blocpdb> 78 atoms in block 166 Block first atom: 11901 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 11979 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 12056 Blocpdb> 74 atoms in block 169 Block first atom: 12139 Blocpdb> 72 atoms in block 170 Block first atom: 12213 Blocpdb> 72 atoms in block 171 Block first atom: 12285 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 12357 Blocpdb> 93 atoms in block 173 Block first atom: 12426 Blocpdb> 74 atoms in block 174 Block first atom: 12519 Blocpdb> 69 atoms in block 175 Block first atom: 12593 Blocpdb> 73 atoms in block 176 Block first atom: 12662 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 12735 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12804 Blocpdb> 96 atoms in block 179 Block first atom: 12868 Blocpdb> 90 atoms in block 180 Block first atom: 12964 Blocpdb> 69 atoms in block 181 Block first atom: 13054 Blocpdb> 65 atoms in block 182 Block first atom: 13123 Blocpdb> 104 atoms in block 183 Block first atom: 13188 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 13291 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10541891 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39963 Prepmat> Matrix trace = 23253540.0000 Prepmat> Last element read: 39963 39963 124.0686 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15054 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13321 RTB> Total mass = 13321.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13321 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 465978.6284 RTB> 68016 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68016 Diagstd> Projected matrix trace = 465978.6284 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 465978.6284 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.7301690 8.1697890 13.6996526 14.9818619 15.9517849 18.2477461 18.5403151 19.4742354 20.2395680 20.7523135 24.8991964 25.5043058 25.9535190 28.4574852 29.7296290 29.9031967 31.5067087 32.1265072 32.6332046 33.5962634 34.3628397 35.7044534 36.0051015 36.5968856 37.7417935 39.1049311 41.6877908 42.3468620 44.8545180 45.5921474 45.9606107 47.3558798 51.5672010 52.3525573 53.1712028 54.0939752 56.7086129 56.9460953 57.6948873 59.5167862 60.9536040 61.6848464 62.6912895 63.6911203 65.1274387 65.8375370 67.2922712 67.8554730 68.1141463 69.0377107 69.6101394 69.9860491 70.4654680 71.9167352 73.2732123 73.5090837 74.7343264 76.0900118 76.8337848 78.3843116 79.8927027 80.6525726 81.5690534 81.8850777 83.0654677 83.4898996 85.4645806 87.1840222 87.8323465 89.0171908 89.7212665 90.4043394 90.6177986 91.8763425 92.1369981 93.1667644 95.9440938 96.4886097 97.2278367 97.7326111 99.0518864 99.4593332 99.9920742 100.6412309 101.2705571 101.8087530 103.1520115 104.0808739 104.6202863 105.5486282 106.9645491 108.3987318 108.6243247 109.0882172 110.0820680 110.8387493 111.4583449 113.5810403 114.8807764 115.7566613 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034298 0.0034314 0.0034321 0.0034323 0.0034325 0.0034351 259.9435193 310.3849831 401.9296620 420.3181796 433.7104858 463.8738550 467.5777489 479.2095758 488.5352431 494.6847698 541.8610644 548.4057932 553.2143103 579.2866764 592.0931346 593.8189998 609.5324047 615.4985527 620.3333669 629.4203339 636.5606717 648.8681760 651.5943356 656.9273517 667.1239730 679.0645242 701.1318901 706.6524954 727.2745284 733.2301329 736.1870531 747.2780662 779.7978974 785.7135284 791.8328639 798.6743351 817.7485688 819.4590490 824.8290440 837.7511187 847.8030504 852.8733104 859.8028529 866.6320066 876.3493715 881.1139315 890.7952109 894.5151933 896.2185714 902.2740584 906.0069557 908.4499784 911.5562026 920.8953121 929.5395997 931.0345224 938.7616565 947.2379863 951.8563112 961.4126993 970.6191084 975.2240271 980.7492650 982.6472953 989.7044835 992.2297623 1003.8951661 1013.9434425 1017.7064403 1024.5477942 1028.5916109 1032.4996635 1033.7178936 1040.8715289 1042.3469726 1048.1556671 1063.6638584 1066.6779181 1070.7561849 1073.5320908 1080.7535127 1082.9740539 1085.8705857 1089.3896635 1092.7904218 1095.6903566 1102.8949063 1107.8494471 1110.7165227 1115.6335774 1123.0916869 1130.5958342 1131.7716867 1134.1857917 1139.3405909 1143.2496801 1146.4406461 1157.3059908 1163.9088256 1168.3373922 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13321 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9760E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9849E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9892E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.730 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 239778 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128051413118155.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128051413118155.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221128051413118155.atom Openam> file on opening on unit 11: 221128051413118155.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13321 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9760E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9849E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9892E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.730 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8 Bfactors> 106 vectors, 39963 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.730000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.558 for 908 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.002 +/- 0.00 Bfactors> = 12.867 +/- 18.29 Bfactors> Shiftng-fct= 12.864 Bfactors> Scaling-fct= 9760.021 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128051413118155.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128051413118155.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4297E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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calculating perturbed structure for DQ=100 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom making animated gifs 11 models are in 221128051413118155.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128051413118155.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128051413118155.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 221128051413118155 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221128051413118155.eigenfacs 221128051413118155.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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