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LOGs for ID: 221128050107109410

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221128050107109410.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221128050107109410.atom to be opened. Openam> File opened: 221128050107109410.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13324 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.004071 +/- 16.691657 From: -35.035000 To: 34.643000 = 1.432456 +/- 11.711005 From: -24.051000 To: 26.298000 = -0.001443 +/- 16.709367 From: -33.937000 To: 33.936000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3196 % Filled. Pdbmat> 10541988 non-zero elements. Pdbmat> 1162683 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 174.52 +/- 44.90 Maximum number = 257 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 2.325366E+07 Pdbmat> Larger element = 902.404 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 908 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221128050107109410.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221128050107109410.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221128050107109410.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13324 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 908 residues. Blocpdb> 98 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 99 Blocpdb> 84 atoms in block 3 Block first atom: 170 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 254 Blocpdb> 63 atoms in block 5 Block first atom: 314 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 377 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 441 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 500 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 571 Blocpdb> 80 atoms in block 10 Block first atom: 646 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 726 Blocpdb> 66 atoms in block 12 Block first atom: 788 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 854 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 928 Blocpdb> 70 atoms in block 15 Block first atom: 997 Blocpdb> 83 atoms in block 16 Block first atom: 1067 Blocpdb> 83 atoms in block 17 Block first atom: 1150 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1233 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1311 Blocpdb> 79 atoms in block 20 Block first atom: 1370 Blocpdb> 63 atoms in block 21 Block first atom: 1449 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1512 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 1590 Blocpdb> 63 atoms in block 24 Block first atom: 1656 Blocpdb> 64 atoms in block 25 Block first atom: 1719 Blocpdb> 65 atoms in block 26 Block first atom: 1783 Blocpdb> 63 atoms in block 27 Block first atom: 1848 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 1911 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 1989 Blocpdb> 83 atoms in block 30 Block first atom: 2066 Blocpdb> 74 atoms in block 31 Block first atom: 2149 Blocpdb> 72 atoms in block 32 Block first atom: 2223 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2295 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2367 Blocpdb> 93 atoms in block 35 Block first atom: 2436 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2529 Blocpdb> 69 atoms in block 37 Block first atom: 2603 Blocpdb> 73 atoms in block 38 Block first atom: 2672 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2745 Blocpdb> 64 atoms in block 40 Block first atom: 2814 Blocpdb> 96 atoms in block 41 Block first atom: 2878 Blocpdb> 90 atoms in block 42 Block first atom: 2974 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 3064 Blocpdb> 65 atoms in block 44 Block first atom: 3133 Blocpdb> 104 atoms in block 45 Block first atom: 3198 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 3302 Blocpdb> 98 atoms in block 47 Block first atom: 3332 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 3430 Blocpdb> 84 atoms in block 49 Block first atom: 3501 Blocpdb> 60 atoms in block 50 Block first atom: 3585 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3645 Blocpdb> 64 atoms in block 52 Block first atom: 3708 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 3772 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3831 Blocpdb> 75 atoms in block 55 Block first atom: 3902 Blocpdb> 80 atoms in block 56 Block first atom: 3977 Blocpdb> 62 atoms in block 57 Block first atom: 4057 Blocpdb> 66 atoms in block 58 Block first atom: 4119 Blocpdb> 74 atoms in block 59 Block first atom: 4185 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 4259 Blocpdb> 70 atoms in block 61 Block first atom: 4328 Blocpdb> 83 atoms in block 62 Block first atom: 4398 Blocpdb> 83 atoms in block 63 Block first atom: 4481 Blocpdb> 78 atoms in block 64 Block first atom: 4564 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4642 Blocpdb> 79 atoms in block 66 Block first atom: 4701 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4780 Blocpdb> 78 atoms in block 68 Block first atom: 4843 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4921 Blocpdb> 63 atoms in block 70 Block first atom: 4987 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 5050 Blocpdb> 65 atoms in block 72 Block first atom: 5114 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 5179 Blocpdb> 78 atoms in block 74 Block first atom: 5242 Blocpdb> 77 atoms in block 75 Block first atom: 5320 Blocpdb> 83 atoms in block 76 Block first atom: 5397 Blocpdb> 74 atoms in block 77 Block first atom: 5480 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5554 Blocpdb> 72 atoms in block 79 Block first atom: 5626 Blocpdb> 69 atoms in block 80 Block first atom: 5698 Blocpdb> 93 atoms in block 81 Block first atom: 5767 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 5860 Blocpdb> 69 atoms in block 83 Block first atom: 5934 Blocpdb> 73 atoms in block 84 Block first atom: 6003 Blocpdb> 69 atoms in block 85 Block first atom: 6076 Blocpdb> 64 atoms in block 86 Block first atom: 6145 Blocpdb> 96 atoms in block 87 Block first atom: 6209 Blocpdb> 90 atoms in block 88 Block first atom: 6305 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 6395 Blocpdb> 65 atoms in block 90 Block first atom: 6464 Blocpdb> 104 atoms in block 91 Block first atom: 6529 Blocpdb> 30 atoms in block 92 Block first atom: 6633 Blocpdb> 98 atoms in block 93 Block first atom: 6663 Blocpdb> 71 atoms in block 94 Block first atom: 6761 Blocpdb> 84 atoms in block 95 Block first atom: 6832 Blocpdb> 60 atoms in block 96 Block first atom: 6916 Blocpdb> 63 atoms in block 97 Block first atom: 6976 Blocpdb> 64 atoms in block 98 Block first atom: 7039 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 7103 Blocpdb> 71 atoms in block 100 Block first atom: 7162 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 7233 Blocpdb> 80 atoms in block 102 Block first atom: 7308 Blocpdb> 62 atoms in block 103 Block first atom: 7388 Blocpdb> 66 atoms in block 104 Block first atom: 7450 Blocpdb> 74 atoms in block 105 Block first atom: 7516 Blocpdb> 69 atoms in block 106 Block first atom: 7590 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7659 Blocpdb> 83 atoms in block 108 Block first atom: 7729 Blocpdb> 83 atoms in block 109 Block first atom: 7812 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 7895 Blocpdb> 59 atoms in block 111 Block first atom: 7973 Blocpdb> 79 atoms in block 112 Block first atom: 8032 Blocpdb> 63 atoms in block 113 Block first atom: 8111 Blocpdb> 78 atoms in block 114 Block first atom: 8174 Blocpdb> 66 atoms in block 115 Block first atom: 8252 Blocpdb> 63 atoms in block 116 Block first atom: 8318 Blocpdb> 64 atoms in block 117 Block first atom: 8381 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 8445 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 8510 Blocpdb> 78 atoms in block 120 Block first atom: 8573 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 8651 Blocpdb> 83 atoms in block 122 Block first atom: 8728 Blocpdb> 74 atoms in block 123 Block first atom: 8811 Blocpdb> 72 atoms in block 124 Block first atom: 8885 Blocpdb> 72 atoms in block 125 Block first atom: 8957 Blocpdb> 69 atoms in block 126 Block first atom: 9029 Blocpdb> 93 atoms in block 127 Block first atom: 9098 Blocpdb> 74 atoms in block 128 Block first atom: 9191 Blocpdb> 69 atoms in block 129 Block first atom: 9265 Blocpdb> 73 atoms in block 130 Block first atom: 9334 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9407 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 9476 Blocpdb> 96 atoms in block 133 Block first atom: 9540 Blocpdb> 90 atoms in block 134 Block first atom: 9636 Blocpdb> 69 atoms in block 135 Block first atom: 9726 Blocpdb> 65 atoms in block 136 Block first atom: 9795 Blocpdb> 104 atoms in block 137 Block first atom: 9860 Blocpdb> 30 atoms in block 138 Block first atom: 9964 Blocpdb> 98 atoms in block 139 Block first atom: 9994 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 10092 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 10163 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 10247 Blocpdb> 63 atoms in block 143 Block first atom: 10307 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 10370 Blocpdb> 59 atoms in block 145 Block first atom: 10434 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 10493 Blocpdb> 75 atoms in block 147 Block first atom: 10564 Blocpdb> 80 atoms in block 148 Block first atom: 10639 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 10719 Blocpdb> 66 atoms in block 150 Block first atom: 10781 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 10847 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 10921 Blocpdb> 70 atoms in block 153 Block first atom: 10990 Blocpdb> 83 atoms in block 154 Block first atom: 11060 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 11143 Blocpdb> 78 atoms in block 156 Block first atom: 11226 Blocpdb> 59 atoms in block 157 Block first atom: 11304 Blocpdb> 79 atoms in block 158 Block first atom: 11363 Blocpdb> 63 atoms in block 159 Block first atom: 11442 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 11505 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 11583 Blocpdb> 63 atoms in block 162 Block first atom: 11649 Blocpdb> 64 atoms in block 163 Block first atom: 11712 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 11776 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 11841 Blocpdb> 78 atoms in block 166 Block first atom: 11904 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 11982 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 12059 Blocpdb> 74 atoms in block 169 Block first atom: 12142 Blocpdb> 72 atoms in block 170 Block first atom: 12216 Blocpdb> 72 atoms in block 171 Block first atom: 12288 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 12360 Blocpdb> 93 atoms in block 173 Block first atom: 12429 Blocpdb> 74 atoms in block 174 Block first atom: 12522 Blocpdb> 69 atoms in block 175 Block first atom: 12596 Blocpdb> 73 atoms in block 176 Block first atom: 12665 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 12738 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12807 Blocpdb> 96 atoms in block 179 Block first atom: 12871 Blocpdb> 90 atoms in block 180 Block first atom: 12967 Blocpdb> 69 atoms in block 181 Block first atom: 13057 Blocpdb> 65 atoms in block 182 Block first atom: 13126 Blocpdb> 104 atoms in block 183 Block first atom: 13191 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 13294 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10542172 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39972 Prepmat> Matrix trace = 23253660.0000 Prepmat> Last element read: 39972 39972 268.0187 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15061 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13324 RTB> Total mass = 13324.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13324 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 466860.8333 RTB> 67764 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67764 Diagstd> Projected matrix trace = 466860.8333 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 466860.8333 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.8380563 8.2268183 14.0938975 14.9081354 15.9127527 18.5254367 19.0567255 19.4903910 20.5465928 20.8159590 24.5558830 25.4523643 26.3545914 28.8880246 30.2767396 30.7914244 32.3241437 33.3663208 33.8956884 34.5708843 34.7780496 36.3693611 37.1927589 37.5234699 39.0921172 40.3538594 41.7298108 44.4630804 45.7358714 46.2469090 46.5698008 48.0148426 49.0857744 52.3405533 53.1293439 54.5358451 55.6987847 57.2838427 58.7928709 59.7271975 60.6490763 62.2136739 62.7448784 63.0057063 64.5732071 65.6502149 66.3275677 67.4278256 67.6957337 68.4489271 68.9245253 70.6383520 71.1529627 71.6329182 72.2598845 74.0752559 74.6403607 76.0830784 77.4128312 79.2371154 80.0070454 80.1966202 82.4615900 82.9494117 84.3286406 85.2241504 86.4634148 86.8363436 87.7033743 88.1411617 90.4443112 91.3891022 92.3103035 93.0381603 94.0725894 95.7312061 96.5194810 97.5185276 97.9059806 98.8196587 99.5542040 100.7996684 101.8321783 102.6094105 103.5472256 104.7991054 105.4919128 106.9824957 107.7432540 108.1137474 108.4045727 111.1866833 111.4138110 112.8081213 113.3466320 114.0210189 115.0651554 116.4561572 118.3643317 119.0763827 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034315 0.0034318 0.0034327 0.0034333 0.0034339 0.0034340 262.3792102 311.4664218 407.6719530 419.2827012 433.1795406 467.3900984 474.0448358 479.4083079 492.2267218 495.4427669 538.1124726 547.8470731 557.4724687 583.6523020 597.5164049 602.5736965 617.3888680 627.2626676 632.2189504 638.4847435 640.3949398 654.8820948 662.2538287 665.1916309 678.9532571 689.8232355 701.4851603 724.0941749 734.3849351 738.4764255 741.0499295 752.4593363 760.8045547 785.6234441 791.5211187 801.9297107 810.4349092 821.8855634 832.6406589 839.2306736 845.6825623 856.5213730 860.1702566 861.9562491 872.6125578 879.8595583 884.3869308 891.6919742 893.4616786 898.4183274 901.5341285 912.6737494 915.9921977 919.0763744 923.0897145 934.6130922 938.1713043 947.1948291 955.4363406 966.6285289 971.3134364 972.4635075 986.1003942 989.0128526 997.2012859 1002.4820854 1009.7444440 1011.9196853 1016.9589710 1019.4939792 1032.7278957 1038.1078754 1043.3268152 1047.4319989 1053.2387514 1062.4831358 1066.8485450 1072.3556588 1074.4838471 1079.4858528 1083.4904364 1090.2468284 1095.8164033 1099.9903533 1105.0056884 1111.6653471 1115.3338006 1123.1858996 1127.1723431 1129.1086661 1130.6262941 1145.0426619 1146.2115890 1153.3615352 1156.1111516 1159.5453510 1164.8424643 1171.8620980 1181.4237726 1184.9720233 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13324 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9873E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.1 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 239832 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128050107109410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128050107109410.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221128050107109410.atom Openam> file on opening on unit 11: 221128050107109410.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 908 First residue number = 3 Last residue number = 229 Number of atoms found = 13324 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9873E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.1 Bfactors> 106 vectors, 39972 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.838000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.671 for 908 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.002 +/- 0.00 Bfactors> = 12.231 +/- 14.65 Bfactors> Shiftng-fct= 12.228 Bfactors> Scaling-fct= 8066.217 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221128050107109410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221128050107109410.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8799 0.0034 0.8019 0.0034 0.9587 0.0034 0.8862 0.0034 0.7646 0.0034 0.7742 262.3667 0.6564 311.4565 0.6599 407.5981 0.6562 419.2909 0.7721 433.1235 0.7956 467.4276 0.5461 474.0652 0.5673 479.3829 0.5468 492.2464 0.5404 495.4696 0.5457 538.1345 0.4684 547.7981 0.6437 557.4000 0.5641 583.6472 0.1040 597.5229 0.5631 602.5339 0.3358 617.3228 0.3830 627.2703 0.2001 632.2320 0.4396 638.4492 0.2838 640.3854 0.3104 654.8597 0.3131 662.2008 0.3869 665.1323 0.4433 678.9057 0.4550 689.7606 0.3946 701.4566 0.5360 724.0380 0.5907 734.3866 0.4066 738.4694 0.3628 741.0197 0.3399 752.3891 0.3963 760.8046 0.4344 785.5856 0.4904 791.4920 0.4108 801.9258 0.5643 810.4090 0.2596 821.8227 0.4083 832.5846 0.2609 839.2143 0.2635 845.6527 0.4719 856.4593 0.5191 860.0999 0.3994 861.9486 0.3624 872.5534 0.3790 879.8203 0.4187 884.3652 0.5601 891.6681 0.4791 893.4515 0.3333 898.3868 0.4210 901.4658 0.3529 912.6452 0.3605 915.9338 0.4058 919.0182 0.4442 923.0508 0.3307 934.6029 0.4286 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calculating perturbed structure for DQ=100 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom making animated gifs 11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 221128050107109410.eigenfacs 221128050107109410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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