***  10  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 221128050107109410.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 221128050107109410.atom to be opened.
Openam> File opened: 221128050107109410.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 908
First residue number = 3
Last residue number = 229
Number of atoms found = 13324
Mean number per residue = 14.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.004071 +/- 16.691657 From: -35.035000 To: 34.643000
= 1.432456 +/- 11.711005 From: -24.051000 To: 26.298000
= -0.001443 +/- 16.709367 From: -33.937000 To: 33.936000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3196 % Filled.
Pdbmat> 10541988 non-zero elements.
Pdbmat> 1162683 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 174.52 +/- 44.90
Maximum number = 257
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 2.325366E+07
Pdbmat> Larger element = 902.404
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
908 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 221128050107109410.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 221128050107109410.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
221128050107109410.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 13324 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 908 residues.
Blocpdb> 98 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 71 atoms in block 2
Block first atom: 99
Blocpdb> 84 atoms in block 3
Block first atom: 170
Blocpdb> 60 atoms in block 4
Block first atom: 254
Blocpdb> 63 atoms in block 5
Block first atom: 314
Blocpdb> 64 atoms in block 6
Block first atom: 377
Blocpdb> 59 atoms in block 7
Block first atom: 441
Blocpdb> 71 atoms in block 8
Block first atom: 500
Blocpdb> 75 atoms in block 9
Block first atom: 571
Blocpdb> 80 atoms in block 10
Block first atom: 646
Blocpdb> 62 atoms in block 11
Block first atom: 726
Blocpdb> 66 atoms in block 12
Block first atom: 788
Blocpdb> 74 atoms in block 13
Block first atom: 854
Blocpdb> 69 atoms in block 14
Block first atom: 928
Blocpdb> 70 atoms in block 15
Block first atom: 997
Blocpdb> 83 atoms in block 16
Block first atom: 1067
Blocpdb> 83 atoms in block 17
Block first atom: 1150
Blocpdb> 78 atoms in block 18
Block first atom: 1233
Blocpdb> 59 atoms in block 19
Block first atom: 1311
Blocpdb> 79 atoms in block 20
Block first atom: 1370
Blocpdb> 63 atoms in block 21
Block first atom: 1449
Blocpdb> 78 atoms in block 22
Block first atom: 1512
Blocpdb> 66 atoms in block 23
Block first atom: 1590
Blocpdb> 63 atoms in block 24
Block first atom: 1656
Blocpdb> 64 atoms in block 25
Block first atom: 1719
Blocpdb> 65 atoms in block 26
Block first atom: 1783
Blocpdb> 63 atoms in block 27
Block first atom: 1848
Blocpdb> 78 atoms in block 28
Block first atom: 1911
Blocpdb> 77 atoms in block 29
Block first atom: 1989
Blocpdb> 83 atoms in block 30
Block first atom: 2066
Blocpdb> 74 atoms in block 31
Block first atom: 2149
Blocpdb> 72 atoms in block 32
Block first atom: 2223
Blocpdb> 72 atoms in block 33
Block first atom: 2295
Blocpdb> 69 atoms in block 34
Block first atom: 2367
Blocpdb> 93 atoms in block 35
Block first atom: 2436
Blocpdb> 74 atoms in block 36
Block first atom: 2529
Blocpdb> 69 atoms in block 37
Block first atom: 2603
Blocpdb> 73 atoms in block 38
Block first atom: 2672
Blocpdb> 69 atoms in block 39
Block first atom: 2745
Blocpdb> 64 atoms in block 40
Block first atom: 2814
Blocpdb> 96 atoms in block 41
Block first atom: 2878
Blocpdb> 90 atoms in block 42
Block first atom: 2974
Blocpdb> 69 atoms in block 43
Block first atom: 3064
Blocpdb> 65 atoms in block 44
Block first atom: 3133
Blocpdb> 104 atoms in block 45
Block first atom: 3198
Blocpdb> 30 atoms in block 46
Block first atom: 3302
Blocpdb> 98 atoms in block 47
Block first atom: 3332
Blocpdb> 71 atoms in block 48
Block first atom: 3430
Blocpdb> 84 atoms in block 49
Block first atom: 3501
Blocpdb> 60 atoms in block 50
Block first atom: 3585
Blocpdb> 63 atoms in block 51
Block first atom: 3645
Blocpdb> 64 atoms in block 52
Block first atom: 3708
Blocpdb> 59 atoms in block 53
Block first atom: 3772
Blocpdb> 71 atoms in block 54
Block first atom: 3831
Blocpdb> 75 atoms in block 55
Block first atom: 3902
Blocpdb> 80 atoms in block 56
Block first atom: 3977
Blocpdb> 62 atoms in block 57
Block first atom: 4057
Blocpdb> 66 atoms in block 58
Block first atom: 4119
Blocpdb> 74 atoms in block 59
Block first atom: 4185
Blocpdb> 69 atoms in block 60
Block first atom: 4259
Blocpdb> 70 atoms in block 61
Block first atom: 4328
Blocpdb> 83 atoms in block 62
Block first atom: 4398
Blocpdb> 83 atoms in block 63
Block first atom: 4481
Blocpdb> 78 atoms in block 64
Block first atom: 4564
Blocpdb> 59 atoms in block 65
Block first atom: 4642
Blocpdb> 79 atoms in block 66
Block first atom: 4701
Blocpdb> 63 atoms in block 67
Block first atom: 4780
Blocpdb> 78 atoms in block 68
Block first atom: 4843
Blocpdb> 66 atoms in block 69
Block first atom: 4921
Blocpdb> 63 atoms in block 70
Block first atom: 4987
Blocpdb> 64 atoms in block 71
Block first atom: 5050
Blocpdb> 65 atoms in block 72
Block first atom: 5114
Blocpdb> 63 atoms in block 73
Block first atom: 5179
Blocpdb> 78 atoms in block 74
Block first atom: 5242
Blocpdb> 77 atoms in block 75
Block first atom: 5320
Blocpdb> 83 atoms in block 76
Block first atom: 5397
Blocpdb> 74 atoms in block 77
Block first atom: 5480
Blocpdb> 72 atoms in block 78
Block first atom: 5554
Blocpdb> 72 atoms in block 79
Block first atom: 5626
Blocpdb> 69 atoms in block 80
Block first atom: 5698
Blocpdb> 93 atoms in block 81
Block first atom: 5767
Blocpdb> 74 atoms in block 82
Block first atom: 5860
Blocpdb> 69 atoms in block 83
Block first atom: 5934
Blocpdb> 73 atoms in block 84
Block first atom: 6003
Blocpdb> 69 atoms in block 85
Block first atom: 6076
Blocpdb> 64 atoms in block 86
Block first atom: 6145
Blocpdb> 96 atoms in block 87
Block first atom: 6209
Blocpdb> 90 atoms in block 88
Block first atom: 6305
Blocpdb> 69 atoms in block 89
Block first atom: 6395
Blocpdb> 65 atoms in block 90
Block first atom: 6464
Blocpdb> 104 atoms in block 91
Block first atom: 6529
Blocpdb> 30 atoms in block 92
Block first atom: 6633
Blocpdb> 98 atoms in block 93
Block first atom: 6663
Blocpdb> 71 atoms in block 94
Block first atom: 6761
Blocpdb> 84 atoms in block 95
Block first atom: 6832
Blocpdb> 60 atoms in block 96
Block first atom: 6916
Blocpdb> 63 atoms in block 97
Block first atom: 6976
Blocpdb> 64 atoms in block 98
Block first atom: 7039
Blocpdb> 59 atoms in block 99
Block first atom: 7103
Blocpdb> 71 atoms in block 100
Block first atom: 7162
Blocpdb> 75 atoms in block 101
Block first atom: 7233
Blocpdb> 80 atoms in block 102
Block first atom: 7308
Blocpdb> 62 atoms in block 103
Block first atom: 7388
Blocpdb> 66 atoms in block 104
Block first atom: 7450
Blocpdb> 74 atoms in block 105
Block first atom: 7516
Blocpdb> 69 atoms in block 106
Block first atom: 7590
Blocpdb> 70 atoms in block 107
Block first atom: 7659
Blocpdb> 83 atoms in block 108
Block first atom: 7729
Blocpdb> 83 atoms in block 109
Block first atom: 7812
Blocpdb> 78 atoms in block 110
Block first atom: 7895
Blocpdb> 59 atoms in block 111
Block first atom: 7973
Blocpdb> 79 atoms in block 112
Block first atom: 8032
Blocpdb> 63 atoms in block 113
Block first atom: 8111
Blocpdb> 78 atoms in block 114
Block first atom: 8174
Blocpdb> 66 atoms in block 115
Block first atom: 8252
Blocpdb> 63 atoms in block 116
Block first atom: 8318
Blocpdb> 64 atoms in block 117
Block first atom: 8381
Blocpdb> 65 atoms in block 118
Block first atom: 8445
Blocpdb> 63 atoms in block 119
Block first atom: 8510
Blocpdb> 78 atoms in block 120
Block first atom: 8573
Blocpdb> 77 atoms in block 121
Block first atom: 8651
Blocpdb> 83 atoms in block 122
Block first atom: 8728
Blocpdb> 74 atoms in block 123
Block first atom: 8811
Blocpdb> 72 atoms in block 124
Block first atom: 8885
Blocpdb> 72 atoms in block 125
Block first atom: 8957
Blocpdb> 69 atoms in block 126
Block first atom: 9029
Blocpdb> 93 atoms in block 127
Block first atom: 9098
Blocpdb> 74 atoms in block 128
Block first atom: 9191
Blocpdb> 69 atoms in block 129
Block first atom: 9265
Blocpdb> 73 atoms in block 130
Block first atom: 9334
Blocpdb> 69 atoms in block 131
Block first atom: 9407
Blocpdb> 64 atoms in block 132
Block first atom: 9476
Blocpdb> 96 atoms in block 133
Block first atom: 9540
Blocpdb> 90 atoms in block 134
Block first atom: 9636
Blocpdb> 69 atoms in block 135
Block first atom: 9726
Blocpdb> 65 atoms in block 136
Block first atom: 9795
Blocpdb> 104 atoms in block 137
Block first atom: 9860
Blocpdb> 30 atoms in block 138
Block first atom: 9964
Blocpdb> 98 atoms in block 139
Block first atom: 9994
Blocpdb> 71 atoms in block 140
Block first atom: 10092
Blocpdb> 84 atoms in block 141
Block first atom: 10163
Blocpdb> 60 atoms in block 142
Block first atom: 10247
Blocpdb> 63 atoms in block 143
Block first atom: 10307
Blocpdb> 64 atoms in block 144
Block first atom: 10370
Blocpdb> 59 atoms in block 145
Block first atom: 10434
Blocpdb> 71 atoms in block 146
Block first atom: 10493
Blocpdb> 75 atoms in block 147
Block first atom: 10564
Blocpdb> 80 atoms in block 148
Block first atom: 10639
Blocpdb> 62 atoms in block 149
Block first atom: 10719
Blocpdb> 66 atoms in block 150
Block first atom: 10781
Blocpdb> 74 atoms in block 151
Block first atom: 10847
Blocpdb> 69 atoms in block 152
Block first atom: 10921
Blocpdb> 70 atoms in block 153
Block first atom: 10990
Blocpdb> 83 atoms in block 154
Block first atom: 11060
Blocpdb> 83 atoms in block 155
Block first atom: 11143
Blocpdb> 78 atoms in block 156
Block first atom: 11226
Blocpdb> 59 atoms in block 157
Block first atom: 11304
Blocpdb> 79 atoms in block 158
Block first atom: 11363
Blocpdb> 63 atoms in block 159
Block first atom: 11442
Blocpdb> 78 atoms in block 160
Block first atom: 11505
Blocpdb> 66 atoms in block 161
Block first atom: 11583
Blocpdb> 63 atoms in block 162
Block first atom: 11649
Blocpdb> 64 atoms in block 163
Block first atom: 11712
Blocpdb> 65 atoms in block 164
Block first atom: 11776
Blocpdb> 63 atoms in block 165
Block first atom: 11841
Blocpdb> 78 atoms in block 166
Block first atom: 11904
Blocpdb> 77 atoms in block 167
Block first atom: 11982
Blocpdb> 83 atoms in block 168
Block first atom: 12059
Blocpdb> 74 atoms in block 169
Block first atom: 12142
Blocpdb> 72 atoms in block 170
Block first atom: 12216
Blocpdb> 72 atoms in block 171
Block first atom: 12288
Blocpdb> 69 atoms in block 172
Block first atom: 12360
Blocpdb> 93 atoms in block 173
Block first atom: 12429
Blocpdb> 74 atoms in block 174
Block first atom: 12522
Blocpdb> 69 atoms in block 175
Block first atom: 12596
Blocpdb> 73 atoms in block 176
Block first atom: 12665
Blocpdb> 69 atoms in block 177
Block first atom: 12738
Blocpdb> 64 atoms in block 178
Block first atom: 12807
Blocpdb> 96 atoms in block 179
Block first atom: 12871
Blocpdb> 90 atoms in block 180
Block first atom: 12967
Blocpdb> 69 atoms in block 181
Block first atom: 13057
Blocpdb> 65 atoms in block 182
Block first atom: 13126
Blocpdb> 104 atoms in block 183
Block first atom: 13191
Blocpdb> 30 atoms in block 184
Block first atom: 13294
Blocpdb> 184 blocks.
Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 10542172 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 39972
Prepmat> Matrix trace = 23253660.0000
Prepmat> Last element read: 39972 39972 268.0187
Prepmat> 17021 lines saved.
Prepmat> 15061 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13324
RTB> Total mass = 13324.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 13324
RTB> Number of blocks = 184
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 466860.8333
RTB> 67764 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1104
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67764
Diagstd> Projected matrix trace = 466860.8333
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1104 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 466860.8333
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 5.8380563 8.2268183 14.0938975 14.9081354
15.9127527 18.5254367 19.0567255 19.4903910 20.5465928
20.8159590 24.5558830 25.4523643 26.3545914 28.8880246
30.2767396 30.7914244 32.3241437 33.3663208 33.8956884
34.5708843 34.7780496 36.3693611 37.1927589 37.5234699
39.0921172 40.3538594 41.7298108 44.4630804 45.7358714
46.2469090 46.5698008 48.0148426 49.0857744 52.3405533
53.1293439 54.5358451 55.6987847 57.2838427 58.7928709
59.7271975 60.6490763 62.2136739 62.7448784 63.0057063
64.5732071 65.6502149 66.3275677 67.4278256 67.6957337
68.4489271 68.9245253 70.6383520 71.1529627 71.6329182
72.2598845 74.0752559 74.6403607 76.0830784 77.4128312
79.2371154 80.0070454 80.1966202 82.4615900 82.9494117
84.3286406 85.2241504 86.4634148 86.8363436 87.7033743
88.1411617 90.4443112 91.3891022 92.3103035 93.0381603
94.0725894 95.7312061 96.5194810 97.5185276 97.9059806
98.8196587 99.5542040 100.7996684 101.8321783 102.6094105
103.5472256 104.7991054 105.4919128 106.9824957 107.7432540
108.1137474 108.4045727 111.1866833 111.4138110 112.8081213
113.3466320 114.0210189 115.0651554 116.4561572 118.3643317
119.0763827
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034315 0.0034318 0.0034327 0.0034333 0.0034339
0.0034340 262.3792102 311.4664218 407.6719530 419.2827012
433.1795406 467.3900984 474.0448358 479.4083079 492.2267218
495.4427669 538.1124726 547.8470731 557.4724687 583.6523020
597.5164049 602.5736965 617.3888680 627.2626676 632.2189504
638.4847435 640.3949398 654.8820948 662.2538287 665.1916309
678.9532571 689.8232355 701.4851603 724.0941749 734.3849351
738.4764255 741.0499295 752.4593363 760.8045547 785.6234441
791.5211187 801.9297107 810.4349092 821.8855634 832.6406589
839.2306736 845.6825623 856.5213730 860.1702566 861.9562491
872.6125578 879.8595583 884.3869308 891.6919742 893.4616786
898.4183274 901.5341285 912.6737494 915.9921977 919.0763744
923.0897145 934.6130922 938.1713043 947.1948291 955.4363406
966.6285289 971.3134364 972.4635075 986.1003942 989.0128526
997.2012859 1002.4820854 1009.7444440 1011.9196853 1016.9589710
1019.4939792 1032.7278957 1038.1078754 1043.3268152 1047.4319989
1053.2387514 1062.4831358 1066.8485450 1072.3556588 1074.4838471
1079.4858528 1083.4904364 1090.2468284 1095.8164033 1099.9903533
1105.0056884 1111.6653471 1115.3338006 1123.1858996 1127.1723431
1129.1086661 1130.6262941 1145.0426619 1146.2115890 1153.3615352
1156.1111516 1159.5453510 1164.8424643 1171.8620980 1181.4237726
1184.9720233
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13324
Rtb_to_modes> Number of blocs = 184
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9873E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.227
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000
0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 239832 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000
0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221128050107109410.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221128050107109410.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 221128050107109410.atom
Openam> file on opening on unit 11:
221128050107109410.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 908
First residue number = 3
Last residue number = 229
Number of atoms found = 13324
Mean number per residue = 14.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9873E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.838
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.1
Bfactors> 106 vectors, 39972 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.838000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.671 for 908 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.002 +/- 0.00
Bfactors> = 12.231 +/- 14.65
Bfactors> Shiftng-fct= 12.228
Bfactors> Scaling-fct= 8066.217
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221128050107109410.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221128050107109410.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1129.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Chkmod> 106 vectors, 39972 coordinates in file.
Chkmod> That is: 13324 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8799
0.0034 0.8019
0.0034 0.9587
0.0034 0.8862
0.0034 0.7646
0.0034 0.7742
262.3667 0.6564
311.4565 0.6599
407.5981 0.6562
419.2909 0.7721
433.1235 0.7956
467.4276 0.5461
474.0652 0.5673
479.3829 0.5468
492.2464 0.5404
495.4696 0.5457
538.1345 0.4684
547.7981 0.6437
557.4000 0.5641
583.6472 0.1040
597.5229 0.5631
602.5339 0.3358
617.3228 0.3830
627.2703 0.2001
632.2320 0.4396
638.4492 0.2838
640.3854 0.3104
654.8597 0.3131
662.2008 0.3869
665.1323 0.4433
678.9057 0.4550
689.7606 0.3946
701.4566 0.5360
724.0380 0.5907
734.3866 0.4066
738.4694 0.3628
741.0197 0.3399
752.3891 0.3963
760.8046 0.4344
785.5856 0.4904
791.4920 0.4108
801.9258 0.5643
810.4090 0.2596
821.8227 0.4083
832.5846 0.2609
839.2143 0.2635
845.6527 0.4719
856.4593 0.5191
860.0999 0.3994
861.9486 0.3624
872.5534 0.3790
879.8203 0.4187
884.3652 0.5601
891.6681 0.4791
893.4515 0.3333
898.3868 0.4210
901.4658 0.3529
912.6452 0.3605
915.9338 0.4058
919.0182 0.4442
923.0508 0.3307
934.6029 0.4286
938.1288 0.4291
947.1350 0.4375
955.3779 0.4116
966.6046 0.4065
971.2897 0.4916
972.4423 0.3564
986.0486 0.4068
988.9739 0.3930
997.1665 0.4442
1002.4146 0.3263
1009.6812 0.3936
1011.8975 0.4566
1016.8958 0.4698
1019.4435 0.4749
1032.6590 0.5213
1038.0684 0.4846
1043.2803 0.4459
1047.3974 0.4728
1053.1790 0.5215
1062.4308 0.3829
1066.8056 0.4126
1072.3177 0.4670
1074.4598 0.5039
1079.4414 0.5045
1083.4210 0.4704
1090.2018 0.5380
1095.5962 0.4243
1099.8927 0.4265
1104.7063 0.4263
1111.6224 0.5068
1115.3287 0.3797
1123.2296 0.3034
1126.8977 0.4015
1128.9884 0.3366
1130.5539 0.4013
1145.0621 0.4460
1146.0913 0.4046
1153.2705 0.4328
1155.8237 0.4219
1159.3887 0.4844
1164.9688 0.4606
1172.0324 0.4113
1181.5510 0.4527
1185.0387 0.4669
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
making animated gifs
11 models are in 221128050107109410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
making animated gifs
11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
making animated gifs
11 models are in 221128050107109410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
making animated gifs
11 models are in 221128050107109410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 221128050107109410 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221128050107109410.eigenfacs
221128050107109410.atom
making animated gifs
11 models are in 221128050107109410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221128050107109410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
221128050107109410.10.pdb
221128050107109410.11.pdb
221128050107109410.7.pdb
221128050107109410.8.pdb
221128050107109410.9.pdb
STDERR:
real 1m4.566s
user 1m4.204s
sys 0m0.336s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|