Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* PLANT PROTEIN 30-APR-81 1CRN *

LOGs for ID: 221109122551125182

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 221109122551125182.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 221109122551125182.atom to be opened.

 Openam> File opened: 221109122551125182.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     46
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     46
            Number of atoms found    =    327
            Mean number per residue  =      7.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     9.268829 +/-     5.802600 From:    -3.097000 To:    24.284000
 =     9.787284 +/-     4.741781 From:    -0.516000 To:    20.937000
 =     6.967089 +/-     6.105933 From:    -7.422000 To:    19.580000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is  21.2780 % Filled.
 Pdbmat>       102490  non-zero elements.
 Pdbmat>        11172 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     68.33 +/-     21.38
         Maximum number =    134
         Minimum number =     26

 Pdbmat> Matrix trace   =  223440.    
 Pdbmat> Larger element =  500.215    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
46 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 221109122551125182.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 221109122551125182.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 221109122551125182.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   327 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    46 residues.
 Blocpdb>     7 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     7 atoms in block      2
 Block first atom:      8
 Blocpdb>     6 atoms in block      3
 Block first atom:     15
 Blocpdb>     6 atoms in block      4
 Block first atom:     21
 Blocpdb>     7 atoms in block      5
 Block first atom:     27
 Blocpdb>     6 atoms in block      6
 Block first atom:     34
 Blocpdb>     8 atoms in block      7
 Block first atom:     40
 Blocpdb>     7 atoms in block      8
 Block first atom:     48
 Blocpdb>     5 atoms in block      9
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    11 atoms in block     10
 Block first atom:     60
 Blocpdb>     6 atoms in block     11
 Block first atom:     71
 Blocpdb>     8 atoms in block     12
 Block first atom:     77
 Blocpdb>    11 atoms in block     13
 Block first atom:     85
 Blocpdb>     8 atoms in block     14
 Block first atom:     96
 Blocpdb>     7 atoms in block     15
 Block first atom:    104
 Blocpdb>     6 atoms in block     16
 Block first atom:    111
 Blocpdb>    11 atoms in block     17
 Block first atom:    117
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    128
 Blocpdb>     7 atoms in block     19
 Block first atom:    136
 Blocpdb>     4 atoms in block     20
 Block first atom:    143
 Blocpdb>     7 atoms in block     21
 Block first atom:    147
 Blocpdb>     7 atoms in block     22
 Block first atom:    154
 Blocpdb>     9 atoms in block     23
 Block first atom:    161
 Blocpdb>     5 atoms in block     24
 Block first atom:    170
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    175
 Blocpdb>     6 atoms in block     26
 Block first atom:    183
 Blocpdb>     5 atoms in block     27
 Block first atom:    189
 Blocpdb>     7 atoms in block     28
 Block first atom:    194
 Blocpdb>    12 atoms in block     29
 Block first atom:    201
 Blocpdb>     7 atoms in block     30
 Block first atom:    213
 Blocpdb>     4 atoms in block     31
 Block first atom:    220
 Blocpdb>     6 atoms in block     32
 Block first atom:    224
 Blocpdb>     8 atoms in block     33
 Block first atom:    230
 Blocpdb>     8 atoms in block     34
 Block first atom:    238
 Blocpdb>     8 atoms in block     35
 Block first atom:    246
 Blocpdb>     7 atoms in block     36
 Block first atom:    254
 Blocpdb>     4 atoms in block     37
 Block first atom:    261
 Blocpdb>     5 atoms in block     38
 Block first atom:    265
 Blocpdb>     7 atoms in block     39
 Block first atom:    270
 Blocpdb>     6 atoms in block     40
 Block first atom:    277
 Blocpdb>     7 atoms in block     41
 Block first atom:    283
 Blocpdb>     4 atoms in block     42
 Block first atom:    290
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    294
 Blocpdb>    12 atoms in block     44
 Block first atom:    302
 Blocpdb>     5 atoms in block     45
 Block first atom:    314
 Blocpdb>     9 atoms in block     46
 Block first atom:    318

 Blocpdb>    46 blocks.

 Blocpdb> At most,     12 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       102536 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =        981

 Prepmat> Matrix trace    =     223440.0000
 Prepmat> Last element read:     981    981       277.7341
 Prepmat>         1082 lines saved.
 Prepmat>          628 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   327
 RTB> Total mass =         327.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   327
 RTB> Number of blocks =    46
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =   56509.2148
 RTB>     15618 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      276
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    15618
 Diagstd> Projected matrix trace =   56509.2148

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    276 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues =  56509.2148
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      7.6723425      8.8110154     11.5436938     18.0119262
     20.5318293     21.1459402     24.4711226     29.2015222     33.6706224
     35.3229756     39.4524390     41.3751943     43.5565799     46.3632790
     48.1955778     50.0119395     52.3947721     56.5038548     57.0643868
     58.4766175     59.7817515     60.6156329     64.9036547     66.2198914
     67.6445412     70.1434583     73.0601420     75.0631632     76.9559786
     77.9654549     79.1620963     81.2374236     83.1974260     86.0989245
     88.6795927     91.1475939     92.3760760     93.2694903     94.2337298
     95.6740764     96.2153607     98.0906274     99.1425855    100.7820922
    102.2971856    105.3610293    107.9108151    108.8669423    112.2742027
    113.7614951    114.8065713    115.4468370    116.1998220    117.3424637
    119.4121572    120.7251675    121.1258308    121.5348370    122.8579621
    124.7005949    125.4315008    126.7680399    127.7843191    128.7911610
    130.1991621    131.6523846    132.9741196    133.2401822    135.0471218
    135.8469025    137.5703444    139.1954567    141.1347653    142.2640845
    143.1516635    143.9302120    145.5375877    147.2715641    147.8201625
    148.6906000    150.8170073    151.7342731    152.3803264    153.8600063
    154.4657367    157.8109301    158.5005957    159.0584020    159.8217795
    160.4220171    162.1440908    163.0243654    163.9600641    164.7283020
    165.2627989    166.5845449    167.2464730    168.4893020    169.0068085
    170.6121262

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034329      0.0034331      0.0034336      0.0034337      0.0034342
      0.0034351    300.7871446    322.3355912    368.9501404    460.8667319
    492.0498491    499.3542839    537.1829589    586.8107015    630.1165011
    645.3925103    682.0751214    698.4982191    716.6748525    739.4049471
    753.8741917    767.9485573    786.0302464    816.2709086    820.3097198
    830.3982056    839.6138571    845.4493651    874.8424671    883.6687816
    893.1237908    909.4710252    928.1871169    940.8247011    952.6129099
    958.8405421    966.1708344    978.7535519    990.4902967   1007.6138854
   1022.6031475   1036.7352961   1043.6984421   1048.7333573   1054.1404311
   1062.1660588   1065.1664687   1075.4965867   1081.2482073   1090.1517722
   1098.3155261   1114.6416899   1128.0484852   1133.0349145   1150.6288794
   1158.2249762   1163.5328622   1166.7728089   1170.5716769   1176.3129588
   1186.6415535   1193.1476453   1195.1259179   1197.1420113   1203.6408923
   1212.6334473   1216.1820511   1222.6444135   1227.5355035   1232.3620313
   1239.0800794   1245.9759088   1252.2148277   1253.4669550   1261.9377920
   1265.6690216   1273.6722667   1281.1730970   1290.0670501   1295.2181361
   1299.2522566   1302.7805402   1310.0349021   1317.8158595   1320.2680630
   1324.1495498   1333.5841944   1337.6334622   1340.4781214   1346.9707136
   1349.6195490   1364.1553170   1367.1328843   1369.5364256   1372.8189367
   1375.3944472   1382.7569282   1386.5053172   1390.4786340   1393.7323839
   1395.9916869   1401.5630309   1404.3448442   1409.5531155   1411.7161419
   1418.4049161

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    327
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     46

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9941E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9952E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.672    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.811    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   112.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   113.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   115.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   116.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   119.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   120.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   122.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   125.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   127.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   130.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   133.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   133.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   139.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   142.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   145.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   147.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   147.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   148.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   150.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   151.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   152.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   153.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   154.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   157.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   158.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   159.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   159.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   160.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   162.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   163.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   164.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   164.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   165.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   166.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   167.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   168.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   169.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   170.6    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    276 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00003 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00004 1.00005 1.00003 1.00004
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996
 0.99996 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001 1.00003
 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
 0.99999 1.00006 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00005 1.00003 1.00001 0.99999
 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 1.00003
 0.99994 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003
 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004
 1.00003 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>     5886 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00003 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00004 1.00005 1.00003 1.00004
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996
 0.99996 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001 1.00003
 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
 0.99999 1.00006 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00005 1.00003 1.00001 0.99999
 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 1.00003
 0.99994 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003
 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004
 1.00003 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 221109122551125182.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 221109122551125182.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 221109122551125182.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 221109122551125182.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     46
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =     46
            Number of atoms found    =    327
            Mean number per residue  =      7.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9941E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9952E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.672    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.811    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   112.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   113.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   115.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   116.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   119.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   120.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   125.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   127.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   130.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   133.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   133.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   139.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   142.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   145.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   147.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   147.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   148.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   150.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   151.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   152.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   153.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   154.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   157.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   158.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   159.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   159.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   160.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   162.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   163.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   165.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   166.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   167.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   168.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   169.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   170.6    

 Bfactors>  106 vectors,    981 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     7.672000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.585 for     46 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.058 +/-   0.06
 Bfactors> =      5.812 +/-   1.85
 Bfactors> Shiftng-fct=      5.754
 Bfactors> Scaling-fct=     29.716

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 221109122551125182.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 221109122551125182.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   300.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   322.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   368.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   460.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   492.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   499.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   537.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   586.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   630.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   645.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   682.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   698.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   739.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   767.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   786.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   816.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   820.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   830.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   874.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   909.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   928.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   940.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   952.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   958.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   966.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   978.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   990.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1008.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1023.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1037.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1044.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1049.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1054.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1062.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1065.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1075.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1081.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1090.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1098.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1115.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1128.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1133.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1151.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1158.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1163.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1166.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1171.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1176.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1187.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1193.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1195.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1197.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1204.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1213.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1216.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1223.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1228.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1232.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1239.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1246.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1252.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1253.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1262.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1265.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1274.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1281.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1290.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1295.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1299.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1303.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1310.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1318.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1320.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1324.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1333.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1337.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1341.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1347.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1350.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1364.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1367.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1370.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1373.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1375.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1383.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1386.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1391.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1394.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1396.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1402.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1404.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1410.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1412.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1418.    

 Chkmod>  106 vectors,    981 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    327 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     7 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector     8 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    15 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    16 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    23 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    25 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    42 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    47 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    52 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    55 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    61 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    69 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    87 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   105 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7478
      0.0034      0.7677
      0.0034      0.7519
      0.0034      0.6888
      0.0034      0.8100
      0.0034      0.9298
    300.7675      0.4647
    322.3215      0.4396
    368.8753      0.2041
    460.8223      0.4171
    492.0068      0.3407
    499.3808      0.2906
    537.1476      0.3928
    586.7702      0.2867
    630.0836      0.3077
    645.3376      0.4718
    682.0248      0.1362
    698.5088      0.6102
    716.6722      0.3013
    739.3471      0.3588
    753.8764      0.7026
    767.9007      0.4039
    785.9607      0.3628
    816.2080      0.2335
    820.2430      0.2570
    830.3866      0.2639
    839.5655      0.2954
    845.4435      0.4129
    874.7803      0.3004
    883.6316      0.1908
    893.0555      0.1792
    909.4096      0.4193
    928.1464      0.2799
    940.7645      0.3191
    952.5969      0.4113
    958.8273      0.1970
    966.1166      0.3687
    978.7271      0.2355
    990.4631      0.4928
   1007.5769      0.3515
   1022.5616      0.4626
   1036.7045      0.2907
   1043.6758      0.1928
   1048.6912      0.4143
   1054.0743      0.5295
   1062.0978      0.3199
   1065.1464      0.1833
   1075.4470      0.4658
   1081.1877      0.4819
   1090.2018      0.4811
   1098.2835      0.5246
   1114.8000      0.3689
   1127.9435      0.3191
   1133.1583      0.4279
   1150.7117      0.1527
   1158.3712      0.3776
   1163.4496      0.4128
   1166.4860      0.3947
   1170.5223      0.3533
   1176.0496      0.2500
   1186.5302      0.3109
   1192.9721      0.3521
   1194.9472      0.4660
   1196.9190      0.3927
   1203.7951      0.3363
   1212.5785      0.3009
   1215.9771      0.3396
   1222.7460      0.3406
   1227.5581      0.1196
   1232.3514      0.2877
   1239.0309      0.2977
   1246.1477      0.4916
   1252.2829      0.1719
   1253.2241      0.2765
   1261.6634      0.3888
   1265.3962      0.5188
   1273.7549      0.3710
   1281.1390      0.2563
   1289.8528      0.3542
   1295.3260      0.1899
   1299.4158      0.5012
   1302.5879      0.4382
   1309.8095      0.3495
   1317.8865      0.4328
   1320.1213      0.4143
   1324.1346      0.3591
   1333.4518      0.4863
   1337.4250      0.4848
   1340.5071      0.2592
   1347.0879      0.4279
   1349.7113      0.4876
   1364.0495      0.3916
   1367.0716      0.4905
   1369.6567      0.4544
   1372.6665      0.4633
   1375.2410      0.3355
   1382.5096      0.4299
   1386.3422      0.4903
   1390.5883      0.4334
   1393.5528      0.3359
   1396.0889      0.3412
   1401.5679      0.3322
   1404.0894      0.3468
   1409.5374      0.2683
   1411.6271      0.2147
   1418.2936      0.4577
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 221109122551125182 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
making animated gifs
11 models are in 221109122551125182.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 221109122551125182 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
making animated gifs
11 models are in 221109122551125182.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 221109122551125182 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
making animated gifs
11 models are in 221109122551125182.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 221109122551125182 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
making animated gifs
11 models are in 221109122551125182.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 221109122551125182 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
221109122551125182.eigenfacs
221109122551125182.atom
making animated gifs
11 models are in 221109122551125182.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 221109122551125182.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
221109122551125182.10.pdb
221109122551125182.11.pdb
221109122551125182.7.pdb
221109122551125182.8.pdb
221109122551125182.9.pdb



STDERR:

real	0m0.492s
user	0m0.488s
sys	0m0.000s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know.

*** PLANT PROTEIN 30-APR-81 1CRN ***

LOGs for ID: 221109122551125182

output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* PLANT PROTEIN 30-APR-81 1CRN *
