*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22102716150789813.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22102716150789813.atom to be opened.
Openam> File opened: 22102716150789813.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 140
First residue number = 1
Last residue number = 140
Number of atoms found = 2016
Mean number per residue = 14.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -9.515080 +/- 27.599959 From: -50.605000 To: 52.946000
= -0.209465 +/- 13.371776 From: -16.856000 To: 36.607000
= 13.759519 +/- 34.790581 From: -48.918000 To: 76.857000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.4520 % Filled.
Pdbmat> 814368 non-zero elements.
Pdbmat> 89153 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 88.45 +/- 30.70
Maximum number = 158
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 1.783060E+06
Pdbmat> Larger element = 680.133
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
140 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22102716150789813.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22102716150789813.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22102716150789813.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2016 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 140 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 12 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 68
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 85
Blocpdb> 7 atoms in block 7
Block first atom: 107
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 133
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 144
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 166
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 176
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 198
Blocpdb> 7 atoms in block 14
Block first atom: 213
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 220
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 236
Blocpdb> 10 atoms in block 17
Block first atom: 252
Blocpdb> 10 atoms in block 18
Block first atom: 262
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 272
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 282
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 297
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 319
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 333
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 355
Blocpdb> 7 atoms in block 25
Block first atom: 372
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 379
Blocpdb> 10 atoms in block 27
Block first atom: 395
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 405
Blocpdb> 10 atoms in block 29
Block first atom: 420
Blocpdb> 10 atoms in block 30
Block first atom: 430
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 440
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 447
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 469
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 483
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 505
Blocpdb> 7 atoms in block 36
Block first atom: 520
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 527
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 543
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 562
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 583
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 599
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 606
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 617
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 639
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 653
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 675
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 690
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 697
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 713
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 729
Blocpdb> 7 atoms in block 51
Block first atom: 746
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 753
Blocpdb> 10 atoms in block 53
Block first atom: 769
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 779
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 793
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 809
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 819
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 834
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 856
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 870
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 892
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 907
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 924
Blocpdb> 14 atoms in block 64
Block first atom: 940
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 954
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 968
Blocpdb> 7 atoms in block 67
Block first atom: 984
Blocpdb> 7 atoms in block 68
Block first atom: 991
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 998
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1008
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1024
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1040
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 1054
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1061
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1077
Blocpdb> 10 atoms in block 76
Block first atom: 1091
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1101
Blocpdb> 10 atoms in block 78
Block first atom: 1117
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1127
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1144
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1166
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1180
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1196
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 1211
Blocpdb> 10 atoms in block 85
Block first atom: 1218
Blocpdb> 7 atoms in block 86
Block first atom: 1228
Blocpdb> 11 atoms in block 87
Block first atom: 1235
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1246
Blocpdb> 10 atoms in block 89
Block first atom: 1265
Blocpdb> 10 atoms in block 90
Block first atom: 1275
Blocpdb> 10 atoms in block 91
Block first atom: 1285
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1295
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 1309
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 1316
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1336
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 1352
Blocpdb> 22 atoms in block 97
Block first atom: 1374
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1396
Blocpdb> 17 atoms in block 99
Block first atom: 1408
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1425
Blocpdb> 7 atoms in block 101
Block first atom: 1444
Blocpdb> 22 atoms in block 102
Block first atom: 1451
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1473
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1487
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1502
Blocpdb> 7 atoms in block 106
Block first atom: 1517
Blocpdb> 10 atoms in block 107
Block first atom: 1524
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1534
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1548
Blocpdb> 15 atoms in block 110
Block first atom: 1565
Blocpdb> 7 atoms in block 111
Block first atom: 1580
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1587
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 1606
Blocpdb> 15 atoms in block 114
Block first atom: 1625
Blocpdb> 12 atoms in block 115
Block first atom: 1640
Blocpdb> 17 atoms in block 116
Block first atom: 1652
Blocpdb> 14 atoms in block 117
Block first atom: 1669
Blocpdb> 16 atoms in block 118
Block first atom: 1683
Blocpdb> 12 atoms in block 119
Block first atom: 1699
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1711
Blocpdb> 12 atoms in block 121
Block first atom: 1725
Blocpdb> 14 atoms in block 122
Block first atom: 1737
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1751
Blocpdb> 10 atoms in block 124
Block first atom: 1766
Blocpdb> 21 atoms in block 125
Block first atom: 1776
Blocpdb> 15 atoms in block 126
Block first atom: 1797
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 1812
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1829
Blocpdb> 11 atoms in block 129
Block first atom: 1843
Blocpdb> 15 atoms in block 130
Block first atom: 1854
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 1869
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 1884
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 1891
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 1912
Blocpdb> 12 atoms in block 135
Block first atom: 1929
Blocpdb> 21 atoms in block 136
Block first atom: 1941
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 1962
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 1977
Blocpdb> 15 atoms in block 139
Block first atom: 1991
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 2005
Blocpdb> 140 blocks.
Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 814508 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6048
Prepmat> Matrix trace = 1783060.0000
Prepmat> Last element read: 6048 6048 179.3951
Prepmat> 9871 lines saved.
Prepmat> 8861 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2016
RTB> Total mass = 2016.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2016
RTB> Number of blocks = 140
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 213661.8294
RTB> 34224 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 840
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34224
Diagstd> Projected matrix trace = 213661.8294
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 840 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 213661.8294
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000939 0.0002113 0.0018543 0.0031688
0.0095444 0.0151625 0.0223529 0.0477499 0.0560288
0.0658041 0.0782312 0.1136120 0.1530910 0.1796335
0.2231051 0.2694889 0.2960431 0.4044744 0.4215109
0.5640427 0.6347150 0.6591172 0.8526728 0.9824625
1.1186733 1.2804906 1.4988480 1.7160613 1.8504065
2.1382578 2.3167294 2.4581761 2.5044612 2.6255220
2.9884238 3.1503496 3.4437927 3.6917493 4.1916711
4.2364851 4.8209681 5.0237792 5.3687941 5.4900455
6.0572637 6.2521558 6.4678408 6.4850368 6.9037617
7.0632363 7.7880661 8.7375765 8.7912173 8.8514592
9.3369527 10.5746868 10.9869338 11.6054019 12.9575893
13.4181676 13.7846727 14.0794069 14.4456601 14.7564520
15.3719550 15.8004246 16.3482046 16.8734832 17.5986379
17.9288799 18.1623757 18.7367707 19.6915235 20.1628622
21.0530137 21.3313530 22.9170147 23.9006138 24.4152770
24.7533564 25.3595955 26.8403464 27.9398466 29.4749749
30.2804822 31.2638733 31.7244255 32.0079896 33.4146139
33.6157412 34.2766970 34.3534206 35.3821104 36.0863802
36.5341999 38.1568897 38.8542465 38.8913749 39.5241698
40.8135387
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034324 0.0034329 0.0034330 0.0034334
0.0034363 1.0521738 1.5786143 4.6760757 6.1128772
10.6089022 13.3715076 16.2353572 23.7291192 25.7040141
27.8561856 30.3728285 36.6022171 42.4883807 46.0244865
51.2920456 56.3722991 59.0843918 69.0622602 70.5017183
81.5551267 86.5136535 88.1610198 100.2735736 107.6349385
114.8542072 122.8806452 132.9456344 142.2530783 147.7164481
158.7907911 165.2848059 170.2557444 171.8511469 175.9556088
187.7225178 192.7412420 201.5179715 208.6466333 222.3252965
223.5105986 238.4308283 243.3943841 251.6133342 254.4387498
267.2597281 271.5252222 276.1690078 276.5358885 285.3239161
288.6005453 303.0470744 320.9894630 321.9732472 323.0745265
331.8164103 353.1254643 359.9428359 369.9349580 390.8925431
397.7790318 403.1749204 407.4623262 412.7280408 417.1442439
425.7550743 431.6479273 439.0665106 446.0644901 455.5486959
459.8030621 462.7874865 470.0484785 481.8756032 487.6086166
498.2558622 501.5387366 519.8455152 530.8842086 536.5696553
540.2718353 546.8477644 562.5865418 573.9939162 589.5518443
597.5533341 607.1789007 611.6347664 614.3621888 627.7164414
629.6027637 635.7622879 636.4734232 645.9325151 652.3293826
656.3644952 670.7825614 676.8844325 677.2077639 682.6949000
693.7410704
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2016
Rtb_to_modes> Number of blocs = 140
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3882E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1133E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8543E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 840 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 36288 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00003
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1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99996
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22102716150789813.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22102716150789813.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22102716150789813.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22102716150789813.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 140
First residue number = 1
Last residue number = 140
Number of atoms found = 2016
Mean number per residue = 14.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3882E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1133E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8543E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1688E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5444E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5162E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2353E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7750E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6029E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5804E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8231E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1136
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1531
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1796
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4045
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6347
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.716
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.317
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.458
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.626
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.150
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.024
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.252
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.063
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.791
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.337
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81
Bfactors> 106 vectors, 6048 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000094
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.131 for 140 C-alpha atoms.
Bfactors> = 121.905 +/- 225.62
Bfactors> = 55.533 +/- 8.31
Bfactors> Shiftng-fct= -66.372
Bfactors> Scaling-fct= 0.037
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22102716150789813.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22102716150789813.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.052
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.579
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.676
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.113
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7
Chkmod> 106 vectors, 6048 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2016 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 87 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8902
0.0034 0.9061
0.0034 0.8788
0.0034 0.4059
0.0034 0.6570
0.0034 0.8543
1.0521 0.3263
1.5785 0.5084
4.6759 0.5929
6.1126 0.4625
10.6084 0.7414
13.3707 0.4236
16.2347 0.4641
23.7281 0.2487
25.7030 0.5518
27.8550 0.5767
30.3715 0.5947
36.5987 0.5651
42.4878 0.5214
46.0182 0.4802
51.2893 0.2671
56.3710 0.5425
59.0776 0.5279
69.0615 0.4395
70.4978 0.4964
81.5485 0.4626
86.5089 0.3252
88.1561 0.6755
100.2709 0.6529
107.6324 0.5582
114.8660 0.3410
122.8518 0.0843
132.9467 0.5924
142.2444 0.5419
147.6939 0.2898
158.7744 0.2756
165.2874 0.2677
170.2423 0.6865
171.8279 0.2053
175.9641 0.3698
187.7011 0.5616
192.7223 0.3417
201.5154 0.5525
208.6448 0.4451
222.3245 0.1453
223.4882 0.5321
238.4214 0.3729
243.3893 0.1248
251.6074 0.5278
254.4268 0.2291
267.2424 0.2133
271.5102 0.1498
276.1606 0.5717
276.5232 0.0852
285.3166 0.5964
288.5833 0.4536
303.0328 0.1615
320.9835 0.1338
321.9554 0.2778
323.0523 0.5756
331.8030 0.4672
353.0320 0.1461
359.9776 0.5192
369.9924 0.2182
390.9121 0.4486
397.7891 0.0989
403.0893 0.1384
407.4534 0.0631
412.7723 0.0506
417.1765 0.5350
425.7097 0.4471
431.6236 0.1536
439.0718 0.4686
445.9993 0.0795
455.5468 0.2404
459.7977 0.2089
462.7374 0.1149
470.0688 0.4029
481.8363 0.1965
487.5531 0.1064
498.1988 0.4993
501.5013 0.1107
519.8571 0.3789
530.8546 0.2652
536.5985 0.0805
540.2120 0.6310
546.8287 0.2212
562.5588 0.3928
573.9709 0.4405
589.4768 0.5624
597.5229 0.4294
607.1152 0.2180
611.5658 0.4998
614.3551 0.3998
627.6462 0.3862
629.6156 0.1334
635.7656 0.2165
636.4144 0.3191
645.8855 0.0342
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getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22102716150789813 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22102716150789813.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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