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***  hdfhh  ***

LOGs for ID: 221017152136145846

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 221017152136145846.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 221017152136145846.atom to be opened. Openam> File opened: 221017152136145846.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2603 First residue number = 1 Last residue number = 2603 Number of atoms found = 19953 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.985227 +/- 48.776015 From: -94.966000 To: 105.207000 = -3.224334 +/- 22.910396 From: -62.117000 To: 50.491000 = -5.319321 +/- 37.265331 From: -83.164000 To: 80.860000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -2.0763 % Filled. Pdbmat> 7389692 non-zero elements. Pdbmat> 807891 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.98 +/- 23.66 Maximum number = 131 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.615782E+07 Pdbmat> Larger element = 498.076 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2603 non-zero elements, NRBL set to 14 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 221017152136145846.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 14 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 221017152136145846.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 221017152136145846.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 19953 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 14 residue(s) per block. Blocpdb> 2603 residues. Blocpdb> 103 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 109 atoms in block 2 Block first atom: 104 Blocpdb> 104 atoms in block 3 Block first atom: 213 Blocpdb> 105 atoms in block 4 Block first atom: 317 Blocpdb> 113 atoms in block 5 Block first atom: 422 Blocpdb> 115 atoms in block 6 Block first atom: 535 Blocpdb> 107 atoms in block 7 Block first atom: 650 Blocpdb> 107 atoms in block 8 Block first atom: 757 Blocpdb> 115 atoms in block 9 Block first atom: 864 Blocpdb> 107 atoms in block 10 Block first atom: 979 Blocpdb> 94 atoms in block 11 Block first atom: 1086 Blocpdb> 119 atoms in block 12 Block first atom: 1180 Blocpdb> 98 atoms in block 13 Block first atom: 1299 Blocpdb> 115 atoms in block 14 Block first atom: 1397 Blocpdb> 97 atoms in block 15 Block first atom: 1512 Blocpdb> 107 atoms in block 16 Block first atom: 1609 Blocpdb> 104 atoms in block 17 Block first atom: 1716 Blocpdb> 95 atoms in block 18 Block first atom: 1820 Blocpdb> 106 atoms in block 19 Block first atom: 1915 Blocpdb> 105 atoms in block 20 Block first atom: 2021 Blocpdb> 111 atoms in block 21 Block first atom: 2126 Blocpdb> 100 atoms in block 22 Block first atom: 2237 Blocpdb> 111 atoms in block 23 Block first atom: 2337 Blocpdb> 95 atoms in block 24 Block first atom: 2448 Blocpdb> 96 atoms in block 25 Block first atom: 2543 Blocpdb> 107 atoms in block 26 Block first atom: 2639 Blocpdb> 106 atoms in block 27 Block first atom: 2746 Blocpdb> 92 atoms in block 28 Block first atom: 2852 Blocpdb> 109 atoms in block 29 Block first atom: 2944 Blocpdb> 104 atoms in block 30 Block first atom: 3053 Blocpdb> 105 atoms in block 31 Block first atom: 3157 Blocpdb> 104 atoms in block 32 Block first atom: 3262 Blocpdb> 100 atoms in block 33 Block first atom: 3366 Blocpdb> 87 atoms in block 34 Block first atom: 3466 Blocpdb> 94 atoms in block 35 Block first atom: 3553 Blocpdb> 100 atoms in block 36 Block first atom: 3647 Blocpdb> 108 atoms in block 37 Block first atom: 3747 Blocpdb> 105 atoms in block 38 Block first atom: 3855 Blocpdb> 110 atoms in block 39 Block first atom: 3960 Blocpdb> 117 atoms in block 40 Block first atom: 4070 Blocpdb> 116 atoms in block 41 Block first atom: 4187 Blocpdb> 95 atoms in block 42 Block first atom: 4303 Blocpdb> 106 atoms in block 43 Block first atom: 4398 Blocpdb> 111 atoms in block 44 Block first atom: 4504 Blocpdb> 116 atoms in block 45 Block first atom: 4615 Blocpdb> 126 atoms in block 46 Block first atom: 4731 Blocpdb> 110 atoms in block 47 Block first atom: 4857 Blocpdb> 105 atoms in block 48 Block first atom: 4967 Blocpdb> 103 atoms in block 49 Block first atom: 5072 Blocpdb> 96 atoms in block 50 Block first atom: 5175 Blocpdb> 99 atoms in block 51 Block first atom: 5271 Blocpdb> 104 atoms in block 52 Block first atom: 5370 Blocpdb> 94 atoms in block 53 Block first atom: 5474 Blocpdb> 104 atoms in block 54 Block first atom: 5568 Blocpdb> 99 atoms in block 55 Block first atom: 5672 Blocpdb> 93 atoms in block 56 Block first atom: 5771 Blocpdb> 113 atoms in block 57 Block first atom: 5864 Blocpdb> 114 atoms in block 58 Block first atom: 5977 Blocpdb> 108 atoms in block 59 Block first atom: 6091 Blocpdb> 110 atoms in block 60 Block first atom: 6199 Blocpdb> 103 atoms in block 61 Block first atom: 6309 Blocpdb> 119 atoms in block 62 Block first atom: 6412 Blocpdb> 113 atoms in block 63 Block first atom: 6531 Blocpdb> 116 atoms in block 64 Block first atom: 6644 Blocpdb> 102 atoms in block 65 Block first atom: 6760 Blocpdb> 119 atoms in block 66 Block first atom: 6862 Blocpdb> 104 atoms in block 67 Block first atom: 6981 Blocpdb> 104 atoms in block 68 Block first atom: 7085 Blocpdb> 105 atoms in block 69 Block first atom: 7189 Blocpdb> 122 atoms in block 70 Block first atom: 7294 Blocpdb> 131 atoms in block 71 Block first atom: 7416 Blocpdb> 109 atoms in block 72 Block first atom: 7547 Blocpdb> 130 atoms in block 73 Block first atom: 7656 Blocpdb> 119 atoms in block 74 Block first atom: 7786 Blocpdb> 98 atoms in block 75 Block first atom: 7905 Blocpdb> 113 atoms in block 76 Block first atom: 8003 Blocpdb> 112 atoms in block 77 Block first atom: 8116 Blocpdb> 103 atoms in block 78 Block first atom: 8228 Blocpdb> 109 atoms in block 79 Block first atom: 8331 Blocpdb> 114 atoms in block 80 Block first atom: 8440 Blocpdb> 117 atoms in block 81 Block first atom: 8554 Blocpdb> 101 atoms in block 82 Block first atom: 8671 Blocpdb> 113 atoms in block 83 Block first atom: 8772 Blocpdb> 115 atoms in block 84 Block first atom: 8885 Blocpdb> 112 atoms in block 85 Block first atom: 9000 Blocpdb> 104 atoms in block 86 Block first atom: 9112 Blocpdb> 108 atoms in block 87 Block first atom: 9216 Blocpdb> 104 atoms in block 88 Block first atom: 9324 Blocpdb> 96 atoms in block 89 Block first atom: 9428 Blocpdb> 109 atoms in block 90 Block first atom: 9524 Blocpdb> 103 atoms in block 91 Block first atom: 9633 Blocpdb> 106 atoms in block 92 Block first atom: 9736 Blocpdb> 106 atoms in block 93 Block first atom: 9842 Blocpdb> 102 atoms in block 94 Block first atom: 9948 Blocpdb> 113 atoms in block 95 Block first atom: 10050 Blocpdb> 115 atoms in block 96 Block first atom: 10163 Blocpdb> 109 atoms in block 97 Block first atom: 10278 Blocpdb> 115 atoms in block 98 Block first atom: 10387 Blocpdb> 118 atoms in block 99 Block first atom: 10502 Blocpdb> 131 atoms in block 100 Block first atom: 10620 Blocpdb> 109 atoms in block 101 Block first atom: 10751 Blocpdb> 108 atoms in block 102 Block first atom: 10860 Blocpdb> 99 atoms in block 103 Block first atom: 10968 Blocpdb> 110 atoms in block 104 Block first atom: 11067 Blocpdb> 129 atoms in block 105 Block first atom: 11177 Blocpdb> 124 atoms in block 106 Block first atom: 11306 Blocpdb> 108 atoms in block 107 Block first atom: 11430 Blocpdb> 89 atoms in block 108 Block first atom: 11538 Blocpdb> 100 atoms in block 109 Block first atom: 11627 Blocpdb> 110 atoms in block 110 Block first atom: 11727 Blocpdb> 121 atoms in block 111 Block first atom: 11837 Blocpdb> 117 atoms in block 112 Block first atom: 11958 Blocpdb> 104 atoms in block 113 Block first atom: 12075 Blocpdb> 107 atoms in block 114 Block first atom: 12179 Blocpdb> 103 atoms in block 115 Block first atom: 12286 Blocpdb> 114 atoms in block 116 Block first atom: 12389 Blocpdb> 120 atoms in block 117 Block first atom: 12503 Blocpdb> 113 atoms in block 118 Block first atom: 12623 Blocpdb> 107 atoms in block 119 Block first atom: 12736 Blocpdb> 109 atoms in block 120 Block first atom: 12843 Blocpdb> 100 atoms in block 121 Block first atom: 12952 Blocpdb> 111 atoms in block 122 Block first atom: 13052 Blocpdb> 89 atoms in block 123 Block first atom: 13163 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13252 Blocpdb> 108 atoms in block 125 Block first atom: 13361 Blocpdb> 112 atoms in block 126 Block first atom: 13469 Blocpdb> 100 atoms in block 127 Block first atom: 13581 Blocpdb> 108 atoms in block 128 Block first atom: 13681 Blocpdb> 125 atoms in block 129 Block first atom: 13789 Blocpdb> 114 atoms in block 130 Block first atom: 13914 Blocpdb> 98 atoms in block 131 Block first atom: 14028 Blocpdb> 107 atoms in block 132 Block first atom: 14126 Blocpdb> 113 atoms in block 133 Block first atom: 14233 Blocpdb> 101 atoms in block 134 Block first atom: 14346 Blocpdb> 111 atoms in block 135 Block first atom: 14447 Blocpdb> 105 atoms in block 136 Block first atom: 14558 Blocpdb> 116 atoms in block 137 Block first atom: 14663 Blocpdb> 105 atoms in block 138 Block first atom: 14779 Blocpdb> 103 atoms in block 139 Block first atom: 14884 Blocpdb> 103 atoms in block 140 Block first atom: 14987 Blocpdb> 102 atoms in block 141 Block first atom: 15090 Blocpdb> 114 atoms in block 142 Block first atom: 15192 Blocpdb> 106 atoms in block 143 Block first atom: 15306 Blocpdb> 112 atoms in block 144 Block first atom: 15412 Blocpdb> 91 atoms in block 145 Block first atom: 15524 Blocpdb> 94 atoms in block 146 Block first atom: 15615 Blocpdb> 111 atoms in block 147 Block first atom: 15709 Blocpdb> 121 atoms in block 148 Block first atom: 15820 Blocpdb> 115 atoms in block 149 Block first atom: 15941 Blocpdb> 93 atoms in block 150 Block first atom: 16056 Blocpdb> 105 atoms in block 151 Block first atom: 16149 Blocpdb> 122 atoms in block 152 Block first atom: 16254 Blocpdb> 105 atoms in block 153 Block first atom: 16376 Blocpdb> 109 atoms in block 154 Block first atom: 16481 Blocpdb> 111 atoms in block 155 Block first atom: 16590 Blocpdb> 112 atoms in block 156 Block first atom: 16701 Blocpdb> 106 atoms in block 157 Block first atom: 16813 Blocpdb> 103 atoms in block 158 Block first atom: 16919 Blocpdb> 113 atoms in block 159 Block first atom: 17022 Blocpdb> 90 atoms in block 160 Block first atom: 17135 Blocpdb> 109 atoms in block 161 Block first atom: 17225 Blocpdb> 106 atoms in block 162 Block first atom: 17334 Blocpdb> 106 atoms in block 163 Block first atom: 17440 Blocpdb> 101 atoms in block 164 Block first atom: 17546 Blocpdb> 115 atoms in block 165 Block first atom: 17647 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 17762 Blocpdb> 116 atoms in block 167 Block first atom: 17864 Blocpdb> 107 atoms in block 168 Block first atom: 17980 Blocpdb> 105 atoms in block 169 Block first atom: 18087 Blocpdb> 88 atoms in block 170 Block first atom: 18192 Blocpdb> 113 atoms in block 171 Block first atom: 18280 Blocpdb> 97 atoms in block 172 Block first atom: 18393 Blocpdb> 104 atoms in block 173 Block first atom: 18490 Blocpdb> 112 atoms in block 174 Block first atom: 18594 Blocpdb> 103 atoms in block 175 Block first atom: 18706 Blocpdb> 99 atoms in block 176 Block first atom: 18809 Blocpdb> 123 atoms in block 177 Block first atom: 18908 Blocpdb> 117 atoms in block 178 Block first atom: 19031 Blocpdb> 94 atoms in block 179 Block first atom: 19148 Blocpdb> 101 atoms in block 180 Block first atom: 19242 Blocpdb> 103 atoms in block 181 Block first atom: 19343 Blocpdb> 98 atoms in block 182 Block first atom: 19446 Blocpdb> 114 atoms in block 183 Block first atom: 19544 Blocpdb> 101 atoms in block 184 Block first atom: 19658 Blocpdb> 96 atoms in block 185 Block first atom: 19759 Blocpdb> 99 atoms in block 186 Block first atom: 19854 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 131 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 87 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7389878 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 59859 Prepmat> Matrix trace = 16157820.0001 Prepmat> Last element read: 59859 59859 179.3229 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 15983 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 19953 RTB> Total mass = 19953.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 19953 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 165104.3793 RTB> 47898 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47898 Diagstd> Projected matrix trace = 165104.3793 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 165104.3793 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0091633 0.0140389 0.0155639 0.0186107 0.0281223 0.0472938 0.0820557 0.1263303 0.1456923 0.1708881 0.2069033 0.2343764 0.3009517 0.3670970 0.3896805 0.4214327 0.5054542 0.6538704 0.6826233 0.7223438 0.8479179 1.0126890 1.1224547 1.1827536 1.1932273 1.4103279 1.4530536 1.6206607 1.8046568 1.9239461 2.1586048 2.2720643 2.4490719 2.7043440 2.8636429 3.5492958 3.8364452 4.0674729 4.2164504 4.4596795 4.5901218 4.9179359 4.9606102 5.1791990 5.3810106 5.9146544 6.1597557 6.2425623 6.4043947 6.6916041 6.9718503 7.8153261 8.1919630 8.3224936 8.7965612 8.8197563 9.4273810 9.7285796 9.8716179 10.0743868 10.1924855 10.6609740 10.9466041 11.2747036 11.5167553 11.6208274 11.7848024 12.2079138 12.3450770 12.6935987 12.9514111 12.9901674 13.3451092 13.8855565 14.2586875 14.6674087 15.0622262 15.3004686 15.4998634 15.8821884 16.2485556 16.3095732 16.4979553 17.0299727 17.3762037 17.5147464 17.8142240 18.2889499 18.4505070 19.1225138 19.2588061 19.7274880 19.7956373 20.1288205 20.2939732 20.7894018 21.1430992 21.5858849 21.8301731 22.4349439 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034333 0.0034336 0.0034342 0.0034343 0.0034358 10.3949423 12.8665203 13.5473558 14.8141419 18.2104500 23.6155034 31.1063992 38.5966050 41.4489521 44.8901574 49.3945401 52.5717251 59.5722042 65.7939093 67.7874981 70.4951777 77.2033533 87.8094241 89.7192885 92.2926782 99.9935953 109.2781458 115.0481639 118.0979643 118.6197160 128.9600919 130.8989287 138.2424189 145.8789359 150.6231511 159.5445049 163.6837603 169.9401699 178.5772970 183.7615765 204.5815096 212.6962244 219.0068086 222.9814714 229.3227310 232.6523189 240.8167625 241.8593231 247.1306312 251.8994418 264.0948719 269.5113273 271.3168219 274.8111349 280.9056009 286.7274725 303.5769768 310.8059122 313.2723144 322.0710908 322.4954370 333.4193567 338.7037443 341.1846220 344.6708779 346.6852241 354.5632522 359.2816083 364.6261788 368.5193959 370.1807279 372.7832865 379.4163203 381.5418501 386.8901403 390.7993432 391.3836282 396.6946533 404.6475586 410.0483373 415.8837739 421.4439884 424.7639449 427.5227359 432.7633282 437.7263194 438.5474377 441.0728657 448.1281816 452.6606363 454.4616148 458.3304752 464.3972773 466.4439157 474.8623877 476.5516318 482.3154497 483.1478200 487.1968182 489.1914084 495.1266209 499.3207388 504.5221161 507.3689318 514.3488514 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 19953 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1633E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4039E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5564E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8611E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8122E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7294E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2056E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1709 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6826 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.013 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.453 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.621 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.864 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.961 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.179 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.381 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.322 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.729 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 1.00005 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00004 1.00008 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99995 0.99996 0.99997 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99995 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 359154 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 1.00005 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00004 1.00008 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99995 0.99996 0.99997 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99995 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221017152136145846.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221017152136145846.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 221017152136145846.atom Openam> file on opening on unit 11: 221017152136145846.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2603 First residue number = 1 Last residue number = 2603 Number of atoms found = 19953 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1633E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4039E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5564E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8611E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8122E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7294E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2056E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6826 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7223 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.013 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.621 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.864 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.961 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.179 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.729 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Bfactors> 106 vectors, 59859 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.009163 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.313 for 2603 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.333 +/- 2.31 Bfactors> = 82.941 +/- 14.98 Bfactors> Shiftng-fct= 82.608 Bfactors> Scaling-fct= 6.474 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 221017152136145846.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 221017152136145846.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3 Chkmod> 106 vectors, 59859 coordinates in file. Chkmod> That is: 19953 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 49 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 82 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7745 0.0034 0.7058 0.0034 0.8723 0.0034 0.8478 0.0034 0.9880 0.0034 0.9768 10.3945 0.0047 12.8660 0.0141 13.5468 0.5927 14.8136 0.0056 18.2096 0.6635 23.6145 0.6439 31.1051 0.0162 38.5903 0.3685 41.4483 0.0857 44.8898 0.2000 49.3920 0.5047 52.5721 0.3643 59.5744 0.0606 65.7914 0.3001 67.7863 0.0949 70.4894 0.4958 77.2035 0.4766 87.8076 0.1825 89.7139 0.3939 92.2859 0.1586 99.9882 0.1869 109.2902 0.5762 115.0199 0.4259 118.1052 0.1221 118.6033 0.3262 128.9396 0.4375 130.8909 0.0500 138.2510 0.5102 145.8865 0.4366 150.6188 0.2662 159.5523 0.3821 163.6744 0.5333 169.9304 0.6430 178.5583 0.4538 183.7651 0.6562 204.5642 0.5843 212.6748 0.0239 218.9847 0.3516 222.9600 0.3526 229.3211 0.5365 232.6392 0.3368 240.8080 0.3943 241.8584 0.0806 247.1153 0.2489 251.8884 0.4152 264.0912 0.4433 269.5051 0.4401 271.3147 0.3708 274.7909 0.3888 280.9019 0.5683 286.7182 0.3937 303.5576 0.1881 310.7933 0.4474 313.2496 0.4538 322.0653 0.1851 322.4860 0.0581 333.3983 0.0267 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 221017152136145846 8 -900 900 100 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-800 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 221017152136145846 9 -900 900 100 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-800 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thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 221017152136145846 11 -900 900 100 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-800 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-700 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-600 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=100 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=200 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=300 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=400 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=500 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=600 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=700 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=800 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom making animated gifs 19 models are in 221017152136145846.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19 models are in 221017152136145846.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 221017152136145846 12 -900 900 100 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom 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for DQ=200 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=300 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=400 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=500 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=600 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=700 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=800 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=900 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom making animated gifs 19 models are in 221017152136145846.12.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 19 will be plotted 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calculating perturbed structure for DQ=-800 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-700 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-600 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=0 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure for DQ=100 221017152136145846.eigenfacs 221017152136145846.atom calculating perturbed structure 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