***  hdfhh  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 221017152136145846.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 221017152136145846.atom to be opened.
Openam> File opened: 221017152136145846.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2603
First residue number = 1
Last residue number = 2603
Number of atoms found = 19953
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.985227 +/- 48.776015 From: -94.966000 To: 105.207000
= -3.224334 +/- 22.910396 From: -62.117000 To: 50.491000
= -5.319321 +/- 37.265331 From: -83.164000 To: 80.860000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -2.0763 % Filled.
Pdbmat> 7389692 non-zero elements.
Pdbmat> 807891 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.98 +/- 23.66
Maximum number = 131
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.615782E+07
Pdbmat> Larger element = 498.076
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2603 non-zero elements, NRBL set to 14
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 221017152136145846.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 14
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 221017152136145846.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
221017152136145846.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 19953 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 14 residue(s) per block.
Blocpdb> 2603 residues.
Blocpdb> 103 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 109 atoms in block 2
Block first atom: 104
Blocpdb> 104 atoms in block 3
Block first atom: 213
Blocpdb> 105 atoms in block 4
Block first atom: 317
Blocpdb> 113 atoms in block 5
Block first atom: 422
Blocpdb> 115 atoms in block 6
Block first atom: 535
Blocpdb> 107 atoms in block 7
Block first atom: 650
Blocpdb> 107 atoms in block 8
Block first atom: 757
Blocpdb> 115 atoms in block 9
Block first atom: 864
Blocpdb> 107 atoms in block 10
Block first atom: 979
Blocpdb> 94 atoms in block 11
Block first atom: 1086
Blocpdb> 119 atoms in block 12
Block first atom: 1180
Blocpdb> 98 atoms in block 13
Block first atom: 1299
Blocpdb> 115 atoms in block 14
Block first atom: 1397
Blocpdb> 97 atoms in block 15
Block first atom: 1512
Blocpdb> 107 atoms in block 16
Block first atom: 1609
Blocpdb> 104 atoms in block 17
Block first atom: 1716
Blocpdb> 95 atoms in block 18
Block first atom: 1820
Blocpdb> 106 atoms in block 19
Block first atom: 1915
Blocpdb> 105 atoms in block 20
Block first atom: 2021
Blocpdb> 111 atoms in block 21
Block first atom: 2126
Blocpdb> 100 atoms in block 22
Block first atom: 2237
Blocpdb> 111 atoms in block 23
Block first atom: 2337
Blocpdb> 95 atoms in block 24
Block first atom: 2448
Blocpdb> 96 atoms in block 25
Block first atom: 2543
Blocpdb> 107 atoms in block 26
Block first atom: 2639
Blocpdb> 106 atoms in block 27
Block first atom: 2746
Blocpdb> 92 atoms in block 28
Block first atom: 2852
Blocpdb> 109 atoms in block 29
Block first atom: 2944
Blocpdb> 104 atoms in block 30
Block first atom: 3053
Blocpdb> 105 atoms in block 31
Block first atom: 3157
Blocpdb> 104 atoms in block 32
Block first atom: 3262
Blocpdb> 100 atoms in block 33
Block first atom: 3366
Blocpdb> 87 atoms in block 34
Block first atom: 3466
Blocpdb> 94 atoms in block 35
Block first atom: 3553
Blocpdb> 100 atoms in block 36
Block first atom: 3647
Blocpdb> 108 atoms in block 37
Block first atom: 3747
Blocpdb> 105 atoms in block 38
Block first atom: 3855
Blocpdb> 110 atoms in block 39
Block first atom: 3960
Blocpdb> 117 atoms in block 40
Block first atom: 4070
Blocpdb> 116 atoms in block 41
Block first atom: 4187
Blocpdb> 95 atoms in block 42
Block first atom: 4303
Blocpdb> 106 atoms in block 43
Block first atom: 4398
Blocpdb> 111 atoms in block 44
Block first atom: 4504
Blocpdb> 116 atoms in block 45
Block first atom: 4615
Blocpdb> 126 atoms in block 46
Block first atom: 4731
Blocpdb> 110 atoms in block 47
Block first atom: 4857
Blocpdb> 105 atoms in block 48
Block first atom: 4967
Blocpdb> 103 atoms in block 49
Block first atom: 5072
Blocpdb> 96 atoms in block 50
Block first atom: 5175
Blocpdb> 99 atoms in block 51
Block first atom: 5271
Blocpdb> 104 atoms in block 52
Block first atom: 5370
Blocpdb> 94 atoms in block 53
Block first atom: 5474
Blocpdb> 104 atoms in block 54
Block first atom: 5568
Blocpdb> 99 atoms in block 55
Block first atom: 5672
Blocpdb> 93 atoms in block 56
Block first atom: 5771
Blocpdb> 113 atoms in block 57
Block first atom: 5864
Blocpdb> 114 atoms in block 58
Block first atom: 5977
Blocpdb> 108 atoms in block 59
Block first atom: 6091
Blocpdb> 110 atoms in block 60
Block first atom: 6199
Blocpdb> 103 atoms in block 61
Block first atom: 6309
Blocpdb> 119 atoms in block 62
Block first atom: 6412
Blocpdb> 113 atoms in block 63
Block first atom: 6531
Blocpdb> 116 atoms in block 64
Block first atom: 6644
Blocpdb> 102 atoms in block 65
Block first atom: 6760
Blocpdb> 119 atoms in block 66
Block first atom: 6862
Blocpdb> 104 atoms in block 67
Block first atom: 6981
Blocpdb> 104 atoms in block 68
Block first atom: 7085
Blocpdb> 105 atoms in block 69
Block first atom: 7189
Blocpdb> 122 atoms in block 70
Block first atom: 7294
Blocpdb> 131 atoms in block 71
Block first atom: 7416
Blocpdb> 109 atoms in block 72
Block first atom: 7547
Blocpdb> 130 atoms in block 73
Block first atom: 7656
Blocpdb> 119 atoms in block 74
Block first atom: 7786
Blocpdb> 98 atoms in block 75
Block first atom: 7905
Blocpdb> 113 atoms in block 76
Block first atom: 8003
Blocpdb> 112 atoms in block 77
Block first atom: 8116
Blocpdb> 103 atoms in block 78
Block first atom: 8228
Blocpdb> 109 atoms in block 79
Block first atom: 8331
Blocpdb> 114 atoms in block 80
Block first atom: 8440
Blocpdb> 117 atoms in block 81
Block first atom: 8554
Blocpdb> 101 atoms in block 82
Block first atom: 8671
Blocpdb> 113 atoms in block 83
Block first atom: 8772
Blocpdb> 115 atoms in block 84
Block first atom: 8885
Blocpdb> 112 atoms in block 85
Block first atom: 9000
Blocpdb> 104 atoms in block 86
Block first atom: 9112
Blocpdb> 108 atoms in block 87
Block first atom: 9216
Blocpdb> 104 atoms in block 88
Block first atom: 9324
Blocpdb> 96 atoms in block 89
Block first atom: 9428
Blocpdb> 109 atoms in block 90
Block first atom: 9524
Blocpdb> 103 atoms in block 91
Block first atom: 9633
Blocpdb> 106 atoms in block 92
Block first atom: 9736
Blocpdb> 106 atoms in block 93
Block first atom: 9842
Blocpdb> 102 atoms in block 94
Block first atom: 9948
Blocpdb> 113 atoms in block 95
Block first atom: 10050
Blocpdb> 115 atoms in block 96
Block first atom: 10163
Blocpdb> 109 atoms in block 97
Block first atom: 10278
Blocpdb> 115 atoms in block 98
Block first atom: 10387
Blocpdb> 118 atoms in block 99
Block first atom: 10502
Blocpdb> 131 atoms in block 100
Block first atom: 10620
Blocpdb> 109 atoms in block 101
Block first atom: 10751
Blocpdb> 108 atoms in block 102
Block first atom: 10860
Blocpdb> 99 atoms in block 103
Block first atom: 10968
Blocpdb> 110 atoms in block 104
Block first atom: 11067
Blocpdb> 129 atoms in block 105
Block first atom: 11177
Blocpdb> 124 atoms in block 106
Block first atom: 11306
Blocpdb> 108 atoms in block 107
Block first atom: 11430
Blocpdb> 89 atoms in block 108
Block first atom: 11538
Blocpdb> 100 atoms in block 109
Block first atom: 11627
Blocpdb> 110 atoms in block 110
Block first atom: 11727
Blocpdb> 121 atoms in block 111
Block first atom: 11837
Blocpdb> 117 atoms in block 112
Block first atom: 11958
Blocpdb> 104 atoms in block 113
Block first atom: 12075
Blocpdb> 107 atoms in block 114
Block first atom: 12179
Blocpdb> 103 atoms in block 115
Block first atom: 12286
Blocpdb> 114 atoms in block 116
Block first atom: 12389
Blocpdb> 120 atoms in block 117
Block first atom: 12503
Blocpdb> 113 atoms in block 118
Block first atom: 12623
Blocpdb> 107 atoms in block 119
Block first atom: 12736
Blocpdb> 109 atoms in block 120
Block first atom: 12843
Blocpdb> 100 atoms in block 121
Block first atom: 12952
Blocpdb> 111 atoms in block 122
Block first atom: 13052
Blocpdb> 89 atoms in block 123
Block first atom: 13163
Blocpdb> 109 atoms in block 124
Block first atom: 13252
Blocpdb> 108 atoms in block 125
Block first atom: 13361
Blocpdb> 112 atoms in block 126
Block first atom: 13469
Blocpdb> 100 atoms in block 127
Block first atom: 13581
Blocpdb> 108 atoms in block 128
Block first atom: 13681
Blocpdb> 125 atoms in block 129
Block first atom: 13789
Blocpdb> 114 atoms in block 130
Block first atom: 13914
Blocpdb> 98 atoms in block 131
Block first atom: 14028
Blocpdb> 107 atoms in block 132
Block first atom: 14126
Blocpdb> 113 atoms in block 133
Block first atom: 14233
Blocpdb> 101 atoms in block 134
Block first atom: 14346
Blocpdb> 111 atoms in block 135
Block first atom: 14447
Blocpdb> 105 atoms in block 136
Block first atom: 14558
Blocpdb> 116 atoms in block 137
Block first atom: 14663
Blocpdb> 105 atoms in block 138
Block first atom: 14779
Blocpdb> 103 atoms in block 139
Block first atom: 14884
Blocpdb> 103 atoms in block 140
Block first atom: 14987
Blocpdb> 102 atoms in block 141
Block first atom: 15090
Blocpdb> 114 atoms in block 142
Block first atom: 15192
Blocpdb> 106 atoms in block 143
Block first atom: 15306
Blocpdb> 112 atoms in block 144
Block first atom: 15412
Blocpdb> 91 atoms in block 145
Block first atom: 15524
Blocpdb> 94 atoms in block 146
Block first atom: 15615
Blocpdb> 111 atoms in block 147
Block first atom: 15709
Blocpdb> 121 atoms in block 148
Block first atom: 15820
Blocpdb> 115 atoms in block 149
Block first atom: 15941
Blocpdb> 93 atoms in block 150
Block first atom: 16056
Blocpdb> 105 atoms in block 151
Block first atom: 16149
Blocpdb> 122 atoms in block 152
Block first atom: 16254
Blocpdb> 105 atoms in block 153
Block first atom: 16376
Blocpdb> 109 atoms in block 154
Block first atom: 16481
Blocpdb> 111 atoms in block 155
Block first atom: 16590
Blocpdb> 112 atoms in block 156
Block first atom: 16701
Blocpdb> 106 atoms in block 157
Block first atom: 16813
Blocpdb> 103 atoms in block 158
Block first atom: 16919
Blocpdb> 113 atoms in block 159
Block first atom: 17022
Blocpdb> 90 atoms in block 160
Block first atom: 17135
Blocpdb> 109 atoms in block 161
Block first atom: 17225
Blocpdb> 106 atoms in block 162
Block first atom: 17334
Blocpdb> 106 atoms in block 163
Block first atom: 17440
Blocpdb> 101 atoms in block 164
Block first atom: 17546
Blocpdb> 115 atoms in block 165
Block first atom: 17647
Blocpdb> 102 atoms in block 166
Block first atom: 17762
Blocpdb> 116 atoms in block 167
Block first atom: 17864
Blocpdb> 107 atoms in block 168
Block first atom: 17980
Blocpdb> 105 atoms in block 169
Block first atom: 18087
Blocpdb> 88 atoms in block 170
Block first atom: 18192
Blocpdb> 113 atoms in block 171
Block first atom: 18280
Blocpdb> 97 atoms in block 172
Block first atom: 18393
Blocpdb> 104 atoms in block 173
Block first atom: 18490
Blocpdb> 112 atoms in block 174
Block first atom: 18594
Blocpdb> 103 atoms in block 175
Block first atom: 18706
Blocpdb> 99 atoms in block 176
Block first atom: 18809
Blocpdb> 123 atoms in block 177
Block first atom: 18908
Blocpdb> 117 atoms in block 178
Block first atom: 19031
Blocpdb> 94 atoms in block 179
Block first atom: 19148
Blocpdb> 101 atoms in block 180
Block first atom: 19242
Blocpdb> 103 atoms in block 181
Block first atom: 19343
Blocpdb> 98 atoms in block 182
Block first atom: 19446
Blocpdb> 114 atoms in block 183
Block first atom: 19544
Blocpdb> 101 atoms in block 184
Block first atom: 19658
Blocpdb> 96 atoms in block 185
Block first atom: 19759
Blocpdb> 99 atoms in block 186
Block first atom: 19854
Blocpdb> 186 blocks.
Blocpdb> At most, 131 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 87 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7389878 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 59859
Prepmat> Matrix trace = 16157820.0001
Prepmat> Last element read: 59859 59859 179.3229
Prepmat> 17392 lines saved.
Prepmat> 15983 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 19953
RTB> Total mass = 19953.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 19953
RTB> Number of blocks = 186
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 165104.3793
RTB> 47898 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1116
Diagstd> Nb of non-zero elements: 47898
Diagstd> Projected matrix trace = 165104.3793
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1116 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 165104.3793
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0091633 0.0140389 0.0155639 0.0186107
0.0281223 0.0472938 0.0820557 0.1263303 0.1456923
0.1708881 0.2069033 0.2343764 0.3009517 0.3670970
0.3896805 0.4214327 0.5054542 0.6538704 0.6826233
0.7223438 0.8479179 1.0126890 1.1224547 1.1827536
1.1932273 1.4103279 1.4530536 1.6206607 1.8046568
1.9239461 2.1586048 2.2720643 2.4490719 2.7043440
2.8636429 3.5492958 3.8364452 4.0674729 4.2164504
4.4596795 4.5901218 4.9179359 4.9606102 5.1791990
5.3810106 5.9146544 6.1597557 6.2425623 6.4043947
6.6916041 6.9718503 7.8153261 8.1919630 8.3224936
8.7965612 8.8197563 9.4273810 9.7285796 9.8716179
10.0743868 10.1924855 10.6609740 10.9466041 11.2747036
11.5167553 11.6208274 11.7848024 12.2079138 12.3450770
12.6935987 12.9514111 12.9901674 13.3451092 13.8855565
14.2586875 14.6674087 15.0622262 15.3004686 15.4998634
15.8821884 16.2485556 16.3095732 16.4979553 17.0299727
17.3762037 17.5147464 17.8142240 18.2889499 18.4505070
19.1225138 19.2588061 19.7274880 19.7956373 20.1288205
20.2939732 20.7894018 21.1430992 21.5858849 21.8301731
22.4349439
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034333 0.0034336 0.0034342 0.0034343
0.0034358 10.3949423 12.8665203 13.5473558 14.8141419
18.2104500 23.6155034 31.1063992 38.5966050 41.4489521
44.8901574 49.3945401 52.5717251 59.5722042 65.7939093
67.7874981 70.4951777 77.2033533 87.8094241 89.7192885
92.2926782 99.9935953 109.2781458 115.0481639 118.0979643
118.6197160 128.9600919 130.8989287 138.2424189 145.8789359
150.6231511 159.5445049 163.6837603 169.9401699 178.5772970
183.7615765 204.5815096 212.6962244 219.0068086 222.9814714
229.3227310 232.6523189 240.8167625 241.8593231 247.1306312
251.8994418 264.0948719 269.5113273 271.3168219 274.8111349
280.9056009 286.7274725 303.5769768 310.8059122 313.2723144
322.0710908 322.4954370 333.4193567 338.7037443 341.1846220
344.6708779 346.6852241 354.5632522 359.2816083 364.6261788
368.5193959 370.1807279 372.7832865 379.4163203 381.5418501
386.8901403 390.7993432 391.3836282 396.6946533 404.6475586
410.0483373 415.8837739 421.4439884 424.7639449 427.5227359
432.7633282 437.7263194 438.5474377 441.0728657 448.1281816
452.6606363 454.4616148 458.3304752 464.3972773 466.4439157
474.8623877 476.5516318 482.3154497 483.1478200 487.1968182
489.1914084 495.1266209 499.3207388 504.5221161 507.3689318
514.3488514
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 19953
Rtb_to_modes> Number of blocs = 186
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.322
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.03
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 359154 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221017152136145846.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221017152136145846.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 221017152136145846.atom
Openam> file on opening on unit 11:
221017152136145846.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2603
First residue number = 1
Last residue number = 2603
Number of atoms found = 19953
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1709
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.815
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.797
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43
Bfactors> 106 vectors, 59859 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.009163
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.313 for 2603 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.333 +/- 2.31
Bfactors> = 82.941 +/- 14.98
Bfactors> Shiftng-fct= 82.608
Bfactors> Scaling-fct= 6.474
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 221017152136145846.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
221017152136145846.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3
Chkmod> 106 vectors, 59859 coordinates in file.
Chkmod> That is: 19953 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 49 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 82 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7745
0.0034 0.7058
0.0034 0.8723
0.0034 0.8478
0.0034 0.9880
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
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MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
MODEL 19 will be plotted
making thumbnail 100x100
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19 models are in 221017152136145846.10.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
MODEL 19 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 4 will be plotted
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getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 221017152136145846 16 -900 900 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-900
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221017152136145846.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
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user 2m6.456s
sys 0m0.256s
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elNémo
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It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
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