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***  8d9p  ***

LOGs for ID: 22100401063033404

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22100401063033404.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22100401063033404.atom to be opened. Openam> File opened: 22100401063033404.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 195 First residue number = 2 Last residue number = 196 Number of atoms found = 1581 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 20.269884 +/- 6.844141 From: 3.965000 To: 38.623000 = 8.080095 +/- 8.629741 From: -13.342000 To: 28.840000 = -11.596158 +/- 19.003425 From: -48.957000 To: 24.238000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.8676 % Filled. Pdbmat> 547620 non-zero elements. Pdbmat> 59806 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 75.66 +/- 20.40 Maximum number = 117 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 1.196120E+06 Pdbmat> Larger element = 493.157 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 195 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22100401063033404.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22100401063033404.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22100401063033404.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1581 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 195 residues. Blocpdb> 6 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 7 Blocpdb> 9 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 8 atoms in block 4 Block first atom: 23 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 31 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 42 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 51 Blocpdb> 10 atoms in block 8 Block first atom: 60 Blocpdb> 9 atoms in block 9 Block first atom: 70 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 79 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 88 Blocpdb> 5 atoms in block 12 Block first atom: 96 Blocpdb> 9 atoms in block 13 Block first atom: 101 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 110 Blocpdb> 11 atoms in block 15 Block first atom: 119 Blocpdb> 9 atoms in block 16 Block first atom: 130 Blocpdb> 9 atoms in block 17 Block first atom: 139 Blocpdb> 8 atoms in block 18 Block first atom: 148 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 156 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 164 Blocpdb> 9 atoms in block 21 Block first atom: 173 Blocpdb> 8 atoms in block 22 Block first atom: 182 Blocpdb> 9 atoms in block 23 Block first atom: 190 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 199 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 208 Blocpdb> 4 atoms in block 26 Block first atom: 216 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 220 Blocpdb> 9 atoms in block 28 Block first atom: 231 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 240 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 248 Blocpdb> 9 atoms in block 31 Block first atom: 256 Blocpdb> 4 atoms in block 32 Block first atom: 265 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 269 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 278 Blocpdb> 9 atoms in block 35 Block first atom: 286 Blocpdb> 4 atoms in block 36 Block first atom: 295 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 299 Blocpdb> 9 atoms in block 38 Block first atom: 307 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 316 Blocpdb> 8 atoms in block 40 Block first atom: 325 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 333 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 344 Blocpdb> 5 atoms in block 43 Block first atom: 353 Blocpdb> 6 atoms in block 44 Block first atom: 358 Blocpdb> 9 atoms in block 45 Block first atom: 364 Blocpdb> 9 atoms in block 46 Block first atom: 373 Blocpdb> 5 atoms in block 47 Block first atom: 382 Blocpdb> 11 atoms in block 48 Block first atom: 387 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 398 Blocpdb> 7 atoms in block 50 Block first atom: 406 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 413 Blocpdb> 9 atoms in block 52 Block first atom: 422 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 431 Blocpdb> 6 atoms in block 54 Block first atom: 440 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 446 Blocpdb> 8 atoms in block 56 Block first atom: 453 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 461 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 470 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 479 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 487 Blocpdb> 9 atoms in block 61 Block first atom: 495 Blocpdb> 8 atoms in block 62 Block first atom: 504 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 512 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 521 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 530 Blocpdb> 10 atoms in block 66 Block first atom: 539 Blocpdb> 8 atoms in block 67 Block first atom: 549 Blocpdb> 9 atoms in block 68 Block first atom: 557 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 566 Blocpdb> 8 atoms in block 70 Block first atom: 574 Blocpdb> 9 atoms in block 71 Block first atom: 582 Blocpdb> 7 atoms in block 72 Block first atom: 591 Blocpdb> 8 atoms in block 73 Block first atom: 598 Blocpdb> 9 atoms in block 74 Block first atom: 606 Blocpdb> 9 atoms in block 75 Block first atom: 615 Blocpdb> 7 atoms in block 76 Block first atom: 624 Blocpdb> 4 atoms in block 77 Block first atom: 631 Blocpdb> 9 atoms in block 78 Block first atom: 635 Blocpdb> 9 atoms in block 79 Block first atom: 644 Blocpdb> 5 atoms in block 80 Block first atom: 653 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 658 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 667 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 676 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 684 Blocpdb> 9 atoms in block 85 Block first atom: 692 Blocpdb> 9 atoms in block 86 Block first atom: 701 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 710 Blocpdb> 9 atoms in block 88 Block first atom: 718 Blocpdb> 9 atoms in block 89 Block first atom: 727 Blocpdb> 7 atoms in block 90 Block first atom: 736 Blocpdb> 4 atoms in block 91 Block first atom: 743 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 747 Blocpdb> 9 atoms in block 93 Block first atom: 756 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 765 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 773 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 787 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 796 Blocpdb> 4 atoms in block 98 Block first atom: 804 Blocpdb> 4 atoms in block 99 Block first atom: 808 Blocpdb> 6 atoms in block 100 Block first atom: 812 Blocpdb> 4 atoms in block 101 Block first atom: 818 Blocpdb> 4 atoms in block 102 Block first atom: 822 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 826 Blocpdb> 9 atoms in block 104 Block first atom: 833 Blocpdb> 8 atoms in block 105 Block first atom: 842 Blocpdb> 11 atoms in block 106 Block first atom: 850 Blocpdb> 9 atoms in block 107 Block first atom: 861 Blocpdb> 9 atoms in block 108 Block first atom: 870 Blocpdb> 10 atoms in block 109 Block first atom: 879 Blocpdb> 9 atoms in block 110 Block first atom: 889 Blocpdb> 9 atoms in block 111 Block first atom: 898 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 907 Blocpdb> 5 atoms in block 113 Block first atom: 915 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 920 Blocpdb> 9 atoms in block 115 Block first atom: 929 Blocpdb> 8 atoms in block 116 Block first atom: 938 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 946 Blocpdb> 9 atoms in block 118 Block first atom: 955 Blocpdb> 8 atoms in block 119 Block first atom: 964 Blocpdb> 8 atoms in block 120 Block first atom: 972 Blocpdb> 9 atoms in block 121 Block first atom: 980 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 989 Blocpdb> 10 atoms in block 123 Block first atom: 998 Blocpdb> 9 atoms in block 124 Block first atom: 1008 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 1017 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 1026 Blocpdb> 4 atoms in block 127 Block first atom: 1034 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 1038 Blocpdb> 9 atoms in block 129 Block first atom: 1043 Blocpdb> 8 atoms in block 130 Block first atom: 1052 Blocpdb> 8 atoms in block 131 Block first atom: 1060 Blocpdb> 9 atoms in block 132 Block first atom: 1068 Blocpdb> 8 atoms in block 133 Block first atom: 1077 Blocpdb> 9 atoms in block 134 Block first atom: 1085 Blocpdb> 9 atoms in block 135 Block first atom: 1094 Blocpdb> 9 atoms in block 136 Block first atom: 1103 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 1112 Blocpdb> 8 atoms in block 138 Block first atom: 1122 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1130 Blocpdb> 8 atoms in block 140 Block first atom: 1139 Blocpdb> 8 atoms in block 141 Block first atom: 1147 Blocpdb> 9 atoms in block 142 Block first atom: 1155 Blocpdb> 7 atoms in block 143 Block first atom: 1164 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1171 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1179 Blocpdb> 4 atoms in block 146 Block first atom: 1187 Blocpdb> 4 atoms in block 147 Block first atom: 1191 Blocpdb> 6 atoms in block 148 Block first atom: 1195 Blocpdb> 4 atoms in block 149 Block first atom: 1201 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1205 Blocpdb> 8 atoms in block 151 Block first atom: 1209 Blocpdb> 9 atoms in block 152 Block first atom: 1217 Blocpdb> 8 atoms in block 153 Block first atom: 1226 Blocpdb> 11 atoms in block 154 Block first atom: 1234 Blocpdb> 9 atoms in block 155 Block first atom: 1245 Blocpdb> 8 atoms in block 156 Block first atom: 1254 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1262 Blocpdb> 9 atoms in block 158 Block first atom: 1270 Blocpdb> 4 atoms in block 159 Block first atom: 1279 Blocpdb> 9 atoms in block 160 Block first atom: 1283 Blocpdb> 8 atoms in block 161 Block first atom: 1292 Blocpdb> 9 atoms in block 162 Block first atom: 1300 Blocpdb> 4 atoms in block 163 Block first atom: 1309 Blocpdb> 8 atoms in block 164 Block first atom: 1313 Blocpdb> 9 atoms in block 165 Block first atom: 1321 Blocpdb> 9 atoms in block 166 Block first atom: 1330 Blocpdb> 12 atoms in block 167 Block first atom: 1339 Blocpdb> 11 atoms in block 168 Block first atom: 1351 Blocpdb> 9 atoms in block 169 Block first atom: 1362 Blocpdb> 8 atoms in block 170 Block first atom: 1371 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 1379 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1388 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 1397 Blocpdb> 4 atoms in block 174 Block first atom: 1405 Blocpdb> 9 atoms in block 175 Block first atom: 1409 Blocpdb> 9 atoms in block 176 Block first atom: 1418 Blocpdb> 5 atoms in block 177 Block first atom: 1427 Blocpdb> 9 atoms in block 178 Block first atom: 1432 Blocpdb> 9 atoms in block 179 Block first atom: 1441 Blocpdb> 8 atoms in block 180 Block first atom: 1450 Blocpdb> 7 atoms in block 181 Block first atom: 1458 Blocpdb> 9 atoms in block 182 Block first atom: 1465 Blocpdb> 9 atoms in block 183 Block first atom: 1474 Blocpdb> 8 atoms in block 184 Block first atom: 1483 Blocpdb> 9 atoms in block 185 Block first atom: 1491 Blocpdb> 9 atoms in block 186 Block first atom: 1500 Blocpdb> 7 atoms in block 187 Block first atom: 1509 Blocpdb> 4 atoms in block 188 Block first atom: 1516 Blocpdb> 9 atoms in block 189 Block first atom: 1520 Blocpdb> 9 atoms in block 190 Block first atom: 1529 Blocpdb> 8 atoms in block 191 Block first atom: 1538 Blocpdb> 14 atoms in block 192 Block first atom: 1546 Blocpdb> 9 atoms in block 193 Block first atom: 1560 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 1569 Blocpdb> 5 atoms in block 195 Block first atom: 1576 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 547815 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4743 Prepmat> Matrix trace = 1196120.0000 Prepmat> Last element read: 4743 4743 194.2250 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 16762 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1581 RTB> Total mass = 1581.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1581 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 263805.5334 RTB> 81603 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 81603 Diagstd> Projected matrix trace = 263805.5334 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 263805.5334 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1012440 1.1380453 1.5237157 4.7484825 5.2077956 5.5807729 6.2490280 9.0585566 9.6370781 10.1879595 10.8576031 11.4627008 12.5193281 13.2252594 14.6340023 15.4432359 16.3972208 17.1878770 17.9207623 19.5097572 20.0589516 21.2660393 21.9682399 22.1628459 23.0746705 24.1364079 25.2331312 25.6150226 26.5319490 27.2867978 29.1847148 29.7046455 30.2630715 31.2294382 32.4142924 32.5879436 32.9606289 33.7872749 34.8904706 35.3461510 35.7060880 35.8288351 36.6790411 37.3649209 37.4724601 38.2331457 38.8788526 39.9680944 40.4712495 41.2198178 41.6502050 42.6442013 42.9014038 43.4556762 43.9573180 44.4494475 45.1486710 45.4193989 46.0205210 46.1745591 47.1608478 47.8182368 48.1542904 48.6388347 49.3445214 49.7756726 50.2139331 50.7750299 51.3728160 52.1836553 52.8699550 53.2543301 53.9337077 54.3572789 54.6749470 55.7883695 56.4514470 57.6542551 58.1150179 58.3777457 59.2210828 59.7510452 60.2851959 60.5864142 61.4817848 62.4228104 63.3686394 64.3048309 64.7307943 65.4678959 66.4028819 66.5239145 67.2035037 67.4650514 67.9954614 69.0276285 69.9712372 70.6230734 70.7142943 71.1361763 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034329 0.0034330 0.0034333 0.0034340 0.0034371 113.9559616 115.8444018 134.0439612 236.6315781 247.8119513 256.5325354 271.4572929 326.8321576 337.1071550 346.6082424 357.8180633 367.6535456 384.2251522 394.9093165 415.4098980 426.7410608 439.7242359 450.2009413 459.6989588 479.6464260 486.3505325 500.7703259 508.9708520 511.2202441 521.6305685 533.4965297 545.4825384 549.5948466 559.3451249 567.2461626 586.6418034 591.8442975 597.3815180 606.8444243 618.2491857 619.9030291 623.4376484 631.2070818 641.4291516 645.6041962 648.8830290 649.9974076 657.6642993 663.7848159 664.7393426 671.4525019 677.0987312 686.5181148 690.8258603 697.1854488 700.8157473 709.1290431 711.2643346 715.8442423 719.9641534 723.9831589 729.6553407 731.8397107 736.6667122 737.8985536 745.7376708 750.9172127 753.5512146 757.3329645 762.8071427 766.1324348 769.4978309 773.7851202 778.3267674 784.4450535 789.5865663 792.4515939 797.4903173 800.6157589 802.9517808 811.0863910 815.8922717 824.5385460 827.8267733 829.6958934 835.6673846 839.3982001 843.1417958 845.2455734 851.4683578 857.9597997 864.4352565 870.7973132 873.6766896 878.6369675 884.8888942 885.6949710 890.2074778 891.9380842 895.4374267 902.2081725 908.3538403 912.5750419 913.1642194 915.8841409 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1581 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0018E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.14 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99994 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 0.99996 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 28458 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99994 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 0.99996 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100401063033404.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100401063033404.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22100401063033404.atom Openam> file on opening on unit 11: 22100401063033404.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 195 First residue number = 2 Last residue number = 196 Number of atoms found = 1581 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0018E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.14 Bfactors> 106 vectors, 4743 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.101000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.639 for 195 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.052 +/- 0.05 Bfactors> = 31.319 +/- 15.55 Bfactors> Shiftng-fct= 31.267 Bfactors> Scaling-fct= 311.383 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22100401063033404.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22100401063033404.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4369E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9 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vecteur en lecture: 792.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 1581 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 98 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9669 0.0034 0.6542 0.0034 0.8768 0.0034 0.7182 0.0034 0.8098 0.0034 0.9961 113.9384 0.7105 115.8371 0.7245 134.0507 0.6071 236.6094 0.7003 247.8062 0.6929 256.5267 0.6578 271.4450 0.7201 326.8261 0.1572 337.0913 0.2477 346.6281 0.4537 357.8422 0.5306 367.5944 0.4602 384.2190 0.3253 394.9631 0.3406 415.3353 0.5419 426.6780 0.3080 439.7426 0.4075 450.2094 0.2825 459.6694 0.3588 479.6288 0.3695 486.3424 0.3049 500.7955 0.1601 508.9694 0.4586 511.1655 0.4447 521.5554 0.4970 533.5133 0.6465 545.4253 0.4823 549.6246 0.3963 559.3006 0.1525 567.2551 0.3853 586.5692 0.3634 591.7726 0.4114 597.3256 0.2654 606.8238 0.5030 618.1817 0.4224 619.8960 0.1189 623.4049 0.1469 631.2054 0.4658 641.3973 0.3685 645.6116 0.4609 648.8907 0.3689 649.9801 0.6054 657.6447 0.3263 663.7126 0.3654 664.6890 0.3717 671.3961 0.4954 677.0797 0.4344 686.5050 0.4068 690.7855 0.4060 697.1571 0.3712 700.7839 0.3914 709.0637 0.3573 711.2222 0.4460 715.8491 0.4311 719.9552 0.2879 723.9566 0.3880 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22100401063033404 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom making animated gifs 11 models are in 22100401063033404.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22100401063033404 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100401063033404.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22100401063033404 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22100401063033404 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22100401063033404.eigenfacs 22100401063033404.atom making animated gifs 11 models are in 22100401063033404.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22100401063033404.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22100401063033404.10.pdb 22100401063033404.11.pdb 22100401063033404.7.pdb 22100401063033404.8.pdb 22100401063033404.9.pdb STDERR: real 0m23.715s user 0m23.680s sys 0m0.024s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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