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LOGs for ID: 22092917190249717

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22092917190249717.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22092917190249717.atom to be opened. Openam> File opened: 22092917190249717.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 76 First residue number = 1 Last residue number = 76 Number of atoms found = 1231 Mean number per residue = 16.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 30.265323 +/- 6.459673 From: 14.853000 To: 44.226000 = 28.306089 +/- 6.712460 From: 12.447000 To: 44.467000 = 15.763032 +/- 7.089031 From: 0.339000 To: 37.338000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 11.9594 % Filled. Pdbmat> 815750 non-zero elements. Pdbmat> 89831 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 145.95 +/- 50.76 Maximum number = 248 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.796620E+06 Pdbmat> Larger element = 864.348 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 76 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22092917190249717.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22092917190249717.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22092917190249717.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1231 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 76 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 56 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 76 Blocpdb> 22 atoms in block 6 Block first atom: 92 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 114 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 128 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 147 Blocpdb> 7 atoms in block 10 Block first atom: 161 Blocpdb> 22 atoms in block 11 Block first atom: 168 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 190 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 204 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 223 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 237 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 256 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 271 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 287 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 302 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 316 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 327 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 339 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 353 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 372 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 387 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 401 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 417 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 439 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 449 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 471 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 490 Blocpdb> 12 atoms in block 32 Block first atom: 507 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 519 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 541 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 556 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 563 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 582 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 596 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 610 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 622 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 639 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 656 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 680 Blocpdb> 19 atoms in block 44 Block first atom: 699 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 718 Blocpdb> 10 atoms in block 46 Block first atom: 738 Blocpdb> 7 atoms in block 47 Block first atom: 748 Blocpdb> 22 atoms in block 48 Block first atom: 755 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 777 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 794 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 813 Blocpdb> 12 atoms in block 52 Block first atom: 828 Blocpdb> 7 atoms in block 53 Block first atom: 840 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 847 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 871 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 885 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 904 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 915 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 927 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 948 Blocpdb> 19 atoms in block 61 Block first atom: 962 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 981 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 998 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 1020 Blocpdb> 11 atoms in block 65 Block first atom: 1035 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1046 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1060 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1079 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1096 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1115 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1131 Blocpdb> 24 atoms in block 72 Block first atom: 1150 Blocpdb> 19 atoms in block 73 Block first atom: 1174 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1193 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 1217 Blocpdb> 8 atoms in block 76 Block first atom: 1223 Blocpdb> 76 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 815826 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3693 Prepmat> Matrix trace = 1796620.0000 Prepmat> Last element read: 3693 3693 58.3440 Prepmat> 2927 lines saved. Prepmat> 1945 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1231 RTB> Total mass = 1231.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1231 RTB> Number of blocks = 76 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195097.5798 RTB> 34176 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 456 Diagstd> Nb of non-zero elements: 34176 Diagstd> Projected matrix trace = 195097.5798 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 456 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195097.5798 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.0277703 6.3960036 10.6634522 16.9900523 24.4132268 27.4373776 38.4067857 39.4750586 42.7106075 43.7714231 46.7405588 53.1573990 54.0328156 55.4176946 58.7780963 64.0473229 64.7294429 69.6413759 74.4911199 77.2297461 81.6942638 86.3848554 89.5930552 91.9124614 94.9396456 98.8377146 102.5110657 104.1532710 105.9173372 107.7932113 111.3948299 112.4342362 117.6565932 118.5177040 121.4659729 122.5419411 125.8484233 127.3437951 130.3515875 133.8166255 136.8750719 139.1344601 143.4069824 148.0108219 148.9473738 155.2142147 157.7073388 160.4851649 164.9088456 166.2523172 168.6409615 172.4510178 174.5248913 177.0565967 178.9908980 183.6321210 185.7293663 191.2839941 191.9506927 194.3170064 195.3861294 197.2904853 201.2447931 202.1544233 202.7420616 206.0478062 207.9974782 208.1456548 209.1109173 212.5992883 214.5324101 217.0657630 219.0865144 221.0694756 221.7637632 225.2466784 227.0095132 227.6324974 229.5614553 229.6728368 230.7324051 232.2678430 234.4984463 236.9561118 237.1967830 237.6519828 240.4642452 243.2342998 243.7810747 245.8975336 247.7281273 249.7845537 252.0142877 252.8085401 255.8648971 256.6108598 257.0388558 259.6633356 261.6038144 262.7184966 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034308 0.0034315 0.0034322 0.0034323 0.0034327 0.0034333 188.9542837 274.6310445 354.6044592 447.6026393 536.5471266 568.8091587 672.9755116 682.2706231 709.6809617 718.4401809 742.4072945 791.7300735 798.2227101 808.3873478 832.5360312 869.0520150 873.6675692 906.2102115 937.2329145 954.3058448 981.5017132 1009.2856199 1027.8564217 1041.0761047 1058.0814081 1079.5844676 1099.4630905 1108.2346818 1117.5804791 1127.4336309 1146.1139475 1151.4486294 1177.8864203 1182.1889484 1196.8028005 1202.0918644 1218.2016117 1225.4177721 1239.8051688 1256.1754952 1270.4496574 1280.8923556 1300.4103848 1321.1192338 1325.2923936 1352.8854504 1363.7075094 1375.6651224 1394.4959459 1400.1647307 1410.1873517 1426.0283554 1434.5773459 1444.9450659 1452.8164672 1471.5316435 1479.9108992 1501.8777936 1504.4928293 1513.7379041 1517.8964495 1525.2756982 1540.4854706 1543.9630566 1546.2054847 1558.7600901 1566.1174009 1566.6751500 1570.3036271 1583.3472913 1590.5295279 1599.8930243 1607.3227925 1614.5803804 1617.1137565 1629.7630903 1636.1281204 1638.3716026 1645.2987392 1645.6978342 1649.4895815 1654.9688494 1662.8966756 1671.5879729 1672.4366554 1674.0406567 1683.9164334 1693.5876920 1695.4901611 1702.8342102 1709.1608648 1716.2401972 1723.8832980 1726.5976706 1737.0032626 1739.5334976 1740.9835594 1749.8490906 1756.3752811 1760.1132220 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1231 Rtb_to_modes> Number of blocs = 76 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9814E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9857E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 191.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 194.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 195.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 197.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 201.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 202.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 202.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 206.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 209.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 212.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 214.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 1.00003 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 0.99996 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99994 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22092917190249717.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22092917190249717.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22092917190249717.atom Openam> file on opening on unit 11: 22092917190249717.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 76 First residue number = 1 Last residue number = 76 Number of atoms found = 1231 Mean number per residue = 16.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9814E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9857E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 191.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.1 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 229.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 229.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 232.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 234.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 240.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 243.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 243.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 245.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 247.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 249.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 255.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 256.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 257.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 259.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 261.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 262.7 Bfactors> 106 vectors, 3693 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.028000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.018 +/- 0.08 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.018 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22092917190249717.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22092917190249717.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1566. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1570. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1583. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1590. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1600. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1607. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1615. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1617. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1630. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1636. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1638. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1645. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1646. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1649. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1655. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1663. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1672. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1672. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1674. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1684. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1693. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1695. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1703. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1709. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1716. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1724. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1726. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1737. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1739. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1741. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1750. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1756. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1760. Chkmod> 106 vectors, 3693 coordinates in file. Chkmod> That is: 1231 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7679 0.0034 0.6800 0.0034 0.9864 0.0034 0.9068 0.0034 0.7782 0.0034 0.8012 188.9533 0.0103 274.6192 0.0064 354.5318 0.0682 447.5827 0.0623 536.4886 0.1127 568.8119 0.2366 672.9748 0.2370 682.2840 0.3542 709.6454 0.1547 718.3977 0.0552 742.3710 0.2767 791.7155 0.2980 798.1676 0.0379 808.3695 0.3091 832.5138 0.1448 869.0329 0.4198 873.6338 0.3712 906.1624 0.4188 937.1856 0.1580 954.2664 0.4757 981.4340 0.4830 1009.2139 0.2944 1027.7948 0.5089 1041.0175 0.2245 1058.0380 0.3019 1079.5506 0.2584 1099.3566 0.4032 1108.4357 0.5114 1117.4410 0.3169 1127.4207 0.3417 1146.0913 0.3197 1151.2239 0.2217 1178.0531 0.3025 1182.0499 0.4324 1196.9190 0.5659 1201.8345 0.3482 1217.9149 0.3111 1225.1544 0.3937 1239.9821 0.4674 1256.0435 0.5104 1270.5108 0.3696 1280.6787 0.2999 1300.3229 0.1727 1321.0142 0.2962 1325.0247 0.4581 1352.7654 0.4187 1363.6172 0.1533 1375.6696 0.3349 1394.3987 0.4227 1400.3054 0.3487 1409.9556 0.4401 1426.1696 0.3693 1434.4135 0.3446 1445.0601 0.4682 1452.7910 0.3032 1471.3398 0.4950 1479.7304 0.3536 1501.8762 0.4561 1504.6215 0.3980 1513.6067 0.4707 1517.8852 0.4795 1525.2470 0.2123 1540.2479 0.3576 1544.0708 0.4798 1545.9787 0.3878 1558.5123 0.2373 1566.0597 0.2839 1566.4361 0.3832 1570.1952 0.2155 1583.2820 0.4769 1590.3411 0.2353 1599.9505 0.3891 1607.3033 0.2576 1614.6225 0.1791 1617.1764 0.4918 1629.5243 0.2950 1636.0236 0.1829 1638.1843 0.4830 1645.3662 0.2451 1645.7245 0.2759 1649.3029 0.2854 1655.0124 0.3687 1662.8308 0.2591 1671.6710 0.2050 1672.3762 0.3092 1674.1379 0.1155 1683.9693 0.4649 1693.3956 0.3628 1695.4832 0.4629 1702.7697 0.4394 1708.9905 0.3931 1716.2196 0.4417 1723.7604 0.4131 1726.4944 0.3446 1737.0478 0.1820 1739.4220 0.1503 1740.7772 0.1715 1749.8975 0.3345 1756.2871 0.3463 1759.9757 0.3464 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22092917190249717 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom making animated gifs 11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22092917190249717 8 -100 100 20 on 0 normal mode 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calculating perturbed structure for DQ=100 22092917190249717.eigenfacs 22092917190249717.atom making animated gifs 11 models are in 22092917190249717.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22092917190249717.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22092917190249717.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated 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