*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22092917190249717.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22092917190249717.atom to be opened.
Openam> File opened: 22092917190249717.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 76
First residue number = 1
Last residue number = 76
Number of atoms found = 1231
Mean number per residue = 16.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 30.265323 +/- 6.459673 From: 14.853000 To: 44.226000
= 28.306089 +/- 6.712460 From: 12.447000 To: 44.467000
= 15.763032 +/- 7.089031 From: 0.339000 To: 37.338000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 11.9594 % Filled.
Pdbmat> 815750 non-zero elements.
Pdbmat> 89831 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 145.95 +/- 50.76
Maximum number = 248
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.796620E+06
Pdbmat> Larger element = 864.348
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
76 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22092917190249717.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22092917190249717.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22092917190249717.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1231 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 76 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 56
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 76
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 92
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 114
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 128
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 147
Blocpdb> 7 atoms in block 10
Block first atom: 161
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 168
Blocpdb> 14 atoms in block 12
Block first atom: 190
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 204
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 223
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 237
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 256
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 271
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 287
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 302
Blocpdb> 11 atoms in block 20
Block first atom: 316
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 327
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 339
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 353
Blocpdb> 15 atoms in block 24
Block first atom: 372
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 387
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 401
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 417
Blocpdb> 10 atoms in block 28
Block first atom: 439
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 449
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 471
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 490
Blocpdb> 12 atoms in block 32
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 519
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 541
Blocpdb> 7 atoms in block 35
Block first atom: 556
Blocpdb> 19 atoms in block 36
Block first atom: 563
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 582
Blocpdb> 14 atoms in block 38
Block first atom: 596
Blocpdb> 12 atoms in block 39
Block first atom: 610
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 622
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 639
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 656
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 680
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 699
Blocpdb> 20 atoms in block 45
Block first atom: 718
Blocpdb> 10 atoms in block 46
Block first atom: 738
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 748
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 755
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 777
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 794
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 813
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 828
Blocpdb> 7 atoms in block 53
Block first atom: 840
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 847
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 871
Blocpdb> 19 atoms in block 56
Block first atom: 885
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 904
Blocpdb> 12 atoms in block 58
Block first atom: 915
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 927
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 948
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 962
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 981
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 998
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1020
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 1035
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1046
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1060
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1079
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1096
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1115
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1131
Blocpdb> 24 atoms in block 72
Block first atom: 1150
Blocpdb> 19 atoms in block 73
Block first atom: 1174
Blocpdb> 24 atoms in block 74
Block first atom: 1193
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 1217
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 1223
Blocpdb> 76 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 815826 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3693
Prepmat> Matrix trace = 1796620.0000
Prepmat> Last element read: 3693 3693 58.3440
Prepmat> 2927 lines saved.
Prepmat> 1945 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1231
RTB> Total mass = 1231.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1231
RTB> Number of blocks = 76
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 195097.5798
RTB> 34176 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 456
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34176
Diagstd> Projected matrix trace = 195097.5798
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 456 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 195097.5798
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.0277703 6.3960036 10.6634522 16.9900523
24.4132268 27.4373776 38.4067857 39.4750586 42.7106075
43.7714231 46.7405588 53.1573990 54.0328156 55.4176946
58.7780963 64.0473229 64.7294429 69.6413759 74.4911199
77.2297461 81.6942638 86.3848554 89.5930552 91.9124614
94.9396456 98.8377146 102.5110657 104.1532710 105.9173372
107.7932113 111.3948299 112.4342362 117.6565932 118.5177040
121.4659729 122.5419411 125.8484233 127.3437951 130.3515875
133.8166255 136.8750719 139.1344601 143.4069824 148.0108219
148.9473738 155.2142147 157.7073388 160.4851649 164.9088456
166.2523172 168.6409615 172.4510178 174.5248913 177.0565967
178.9908980 183.6321210 185.7293663 191.2839941 191.9506927
194.3170064 195.3861294 197.2904853 201.2447931 202.1544233
202.7420616 206.0478062 207.9974782 208.1456548 209.1109173
212.5992883 214.5324101 217.0657630 219.0865144 221.0694756
221.7637632 225.2466784 227.0095132 227.6324974 229.5614553
229.6728368 230.7324051 232.2678430 234.4984463 236.9561118
237.1967830 237.6519828 240.4642452 243.2342998 243.7810747
245.8975336 247.7281273 249.7845537 252.0142877 252.8085401
255.8648971 256.6108598 257.0388558 259.6633356 261.6038144
262.7184966
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034308 0.0034315 0.0034322 0.0034323 0.0034327
0.0034333 188.9542837 274.6310445 354.6044592 447.6026393
536.5471266 568.8091587 672.9755116 682.2706231 709.6809617
718.4401809 742.4072945 791.7300735 798.2227101 808.3873478
832.5360312 869.0520150 873.6675692 906.2102115 937.2329145
954.3058448 981.5017132 1009.2856199 1027.8564217 1041.0761047
1058.0814081 1079.5844676 1099.4630905 1108.2346818 1117.5804791
1127.4336309 1146.1139475 1151.4486294 1177.8864203 1182.1889484
1196.8028005 1202.0918644 1218.2016117 1225.4177721 1239.8051688
1256.1754952 1270.4496574 1280.8923556 1300.4103848 1321.1192338
1325.2923936 1352.8854504 1363.7075094 1375.6651224 1394.4959459
1400.1647307 1410.1873517 1426.0283554 1434.5773459 1444.9450659
1452.8164672 1471.5316435 1479.9108992 1501.8777936 1504.4928293
1513.7379041 1517.8964495 1525.2756982 1540.4854706 1543.9630566
1546.2054847 1558.7600901 1566.1174009 1566.6751500 1570.3036271
1583.3472913 1590.5295279 1599.8930243 1607.3227925 1614.5803804
1617.1137565 1629.7630903 1636.1281204 1638.3716026 1645.2987392
1645.6978342 1649.4895815 1654.9688494 1662.8966756 1671.5879729
1672.4366554 1674.0406567 1683.9164334 1693.5876920 1695.4901611
1702.8342102 1709.1608648 1716.2401972 1723.8832980 1726.5976706
1737.0032626 1739.5334976 1740.9835594 1749.8490906 1756.3752811
1760.1132220
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1231
Rtb_to_modes> Number of blocs = 76
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9814E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9857E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.028
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.396
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 256.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 261.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 262.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 456 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000
0.99997 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
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1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 0.99996
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0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001
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0.99996 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000
0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 22158 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000
0.99997 1.00004 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
0.99998 1.00003 1.00000 1.00004 0.99999
1.00000 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 0.99996
0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001
0.99994 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000
0.99996 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001
0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000
0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22092917190249717.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22092917190249717.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22092917190249717.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22092917190249717.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 76
First residue number = 1
Last residue number = 76
Number of atoms found = 1231
Mean number per residue = 16.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9814E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9857E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.396
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 191.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 219.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 225.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 229.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 229.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 232.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 234.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 240.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 243.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 243.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 245.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 247.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 249.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 255.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 256.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 259.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 261.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 262.7
Bfactors> 106 vectors, 3693 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.028000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.018 +/- 0.08
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.018
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22092917190249717.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22092917190249717.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1218.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1300.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1353.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1376.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1400.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1410.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1426.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1445.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1453.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1480.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1502.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1514.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1518.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1525.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1540.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1544.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1546.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1559.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1566.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1566.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1570.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1583.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1590.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1600.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1607.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1615.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1617.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1630.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1636.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1638.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1645.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1646.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1649.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1655.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1663.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1672.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1672.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1674.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1684.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1693.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1695.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1703.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1709.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1716.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1724.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1726.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1737.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1739.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1741.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1750.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1756.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1760.
Chkmod> 106 vectors, 3693 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1231 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7679
0.0034 0.6800
0.0034 0.9864
0.0034 0.9068
0.0034 0.7782
0.0034 0.8012
188.9533 0.0103
274.6192 0.0064
354.5318 0.0682
447.5827 0.0623
536.4886 0.1127
568.8119 0.2366
672.9748 0.2370
682.2840 0.3542
709.6454 0.1547
718.3977 0.0552
742.3710 0.2767
791.7155 0.2980
798.1676 0.0379
808.3695 0.3091
832.5138 0.1448
869.0329 0.4198
873.6338 0.3712
906.1624 0.4188
937.1856 0.1580
954.2664 0.4757
981.4340 0.4830
1009.2139 0.2944
1027.7948 0.5089
1041.0175 0.2245
1058.0380 0.3019
1079.5506 0.2584
1099.3566 0.4032
1108.4357 0.5114
1117.4410 0.3169
1127.4207 0.3417
1146.0913 0.3197
1151.2239 0.2217
1178.0531 0.3025
1182.0499 0.4324
1196.9190 0.5659
1201.8345 0.3482
1217.9149 0.3111
1225.1544 0.3937
1239.9821 0.4674
1256.0435 0.5104
1270.5108 0.3696
1280.6787 0.2999
1300.3229 0.1727
1321.0142 0.2962
1325.0247 0.4581
1352.7654 0.4187
1363.6172 0.1533
1375.6696 0.3349
1394.3987 0.4227
1400.3054 0.3487
1409.9556 0.4401
1426.1696 0.3693
1434.4135 0.3446
1445.0601 0.4682
1452.7910 0.3032
1471.3398 0.4950
1479.7304 0.3536
1501.8762 0.4561
1504.6215 0.3980
1513.6067 0.4707
1517.8852 0.4795
1525.2470 0.2123
1540.2479 0.3576
1544.0708 0.4798
1545.9787 0.3878
1558.5123 0.2373
1566.0597 0.2839
1566.4361 0.3832
1570.1952 0.2155
1583.2820 0.4769
1590.3411 0.2353
1599.9505 0.3891
1607.3033 0.2576
1614.6225 0.1791
1617.1764 0.4918
1629.5243 0.2950
1636.0236 0.1829
1638.1843 0.4830
1645.3662 0.2451
1645.7245 0.2759
1649.3029 0.2854
1655.0124 0.3687
1662.8308 0.2591
1671.6710 0.2050
1672.3762 0.3092
1674.1379 0.1155
1683.9693 0.4649
1693.3956 0.3628
1695.4832 0.4629
1702.7697 0.4394
1708.9905 0.3931
1716.2196 0.4417
1723.7604 0.4131
1726.4944 0.3446
1737.0478 0.1820
1739.4220 0.1503
1740.7772 0.1715
1749.8975 0.3345
1756.2871 0.3463
1759.9757 0.3464
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22092917190249717 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
making animated gifs
11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22092917190249717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22092917190249717 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22092917190249717.eigenfacs
22092917190249717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22092917190249717.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22092917190249717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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