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LOGs for ID: 22071122400425431

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22071122400425431.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22071122400425431.atom to be opened. Openam> File opened: 22071122400425431.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2046 First residue number = 146 Last residue number = 3153 Number of atoms found = 15999 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.596953 +/- 39.837124 From: -81.941000 To: 88.778000 = 8.802378 +/- 20.821440 From: -46.860000 To: 63.347000 = 7.460344 +/- 19.026244 From: -31.397000 To: 63.039000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.5594 % Filled. Pdbmat> 5569244 non-zero elements. Pdbmat> 608252 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.04 +/- 18.63 Maximum number = 122 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.216504E+07 Pdbmat> Larger element = 474.489 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2046 non-zero elements, NRBL set to 11 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22071122400425431.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 11 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22071122400425431.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22071122400425431.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 15999 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 11 residue(s) per block. Blocpdb> 2046 residues. Blocpdb> 90 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 84 atoms in block 2 Block first atom: 91 Blocpdb> 87 atoms in block 3 Block first atom: 175 Blocpdb> 85 atoms in block 4 Block first atom: 262 Blocpdb> 83 atoms in block 5 Block first atom: 347 Blocpdb> 84 atoms in block 6 Block first atom: 430 Blocpdb> 94 atoms in block 7 Block first atom: 514 Blocpdb> 85 atoms in block 8 Block first atom: 608 Blocpdb> 95 atoms in block 9 Block first atom: 693 Blocpdb> 90 atoms in block 10 Block first atom: 788 Blocpdb> 90 atoms in block 11 Block first atom: 878 Blocpdb> 89 atoms in block 12 Block first atom: 968 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 1057 Blocpdb> 86 atoms in block 14 Block first atom: 1131 Blocpdb> 86 atoms in block 15 Block first atom: 1217 Blocpdb> 83 atoms in block 16 Block first atom: 1303 Blocpdb> 72 atoms in block 17 Block first atom: 1386 Blocpdb> 109 atoms in block 18 Block first atom: 1458 Blocpdb> 81 atoms in block 19 Block first atom: 1567 Blocpdb> 83 atoms in block 20 Block first atom: 1648 Blocpdb> 92 atoms in block 21 Block first atom: 1731 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 1823 Blocpdb> 80 atoms in block 23 Block first atom: 1832 Blocpdb> 99 atoms in block 24 Block first atom: 1912 Blocpdb> 81 atoms in block 25 Block first atom: 2011 Blocpdb> 93 atoms in block 26 Block first atom: 2092 Blocpdb> 75 atoms in block 27 Block first atom: 2185 Blocpdb> 33 atoms in block 28 Block first atom: 2260 Blocpdb> 82 atoms in block 29 Block first atom: 2293 Blocpdb> 83 atoms in block 30 Block first atom: 2375 Blocpdb> 75 atoms in block 31 Block first atom: 2458 Blocpdb> 91 atoms in block 32 Block first atom: 2533 Blocpdb> 74 atoms in block 33 Block first atom: 2624 Blocpdb> 77 atoms in block 34 Block first atom: 2698 Blocpdb> 92 atoms in block 35 Block first atom: 2775 Blocpdb> 95 atoms in block 36 Block first atom: 2867 Blocpdb> 90 atoms in block 37 Block first atom: 2962 Blocpdb> 72 atoms in block 38 Block first atom: 3052 Blocpdb> 89 atoms in block 39 Block first atom: 3124 Blocpdb> 88 atoms in block 40 Block first atom: 3213 Blocpdb> 78 atoms in block 41 Block first atom: 3301 Blocpdb> 92 atoms in block 42 Block first atom: 3379 Blocpdb> 72 atoms in block 43 Block first atom: 3471 Blocpdb> 79 atoms in block 44 Block first atom: 3543 Blocpdb> 86 atoms in block 45 Block first atom: 3622 Blocpdb> 95 atoms in block 46 Block first atom: 3708 Blocpdb> 87 atoms in block 47 Block first atom: 3803 Blocpdb> 96 atoms in block 48 Block first atom: 3890 Blocpdb> 84 atoms in block 49 Block first atom: 3986 Blocpdb> 95 atoms in block 50 Block first atom: 4070 Blocpdb> 83 atoms in block 51 Block first atom: 4165 Blocpdb> 88 atoms in block 52 Block first atom: 4248 Blocpdb> 88 atoms in block 53 Block first atom: 4336 Blocpdb> 84 atoms in block 54 Block first atom: 4424 Blocpdb> 83 atoms in block 55 Block first atom: 4508 Blocpdb> 17 atoms in block 56 Block first atom: 4591 Blocpdb> 95 atoms in block 57 Block first atom: 4608 Blocpdb> 84 atoms in block 58 Block first atom: 4703 Blocpdb> 84 atoms in block 59 Block first atom: 4787 Blocpdb> 79 atoms in block 60 Block first atom: 4871 Blocpdb> 79 atoms in block 61 Block first atom: 4950 Blocpdb> 90 atoms in block 62 Block first atom: 5029 Blocpdb> 33 atoms in block 63 Block first atom: 5119 Blocpdb> 75 atoms in block 64 Block first atom: 5152 Blocpdb> 89 atoms in block 65 Block first atom: 5227 Blocpdb> 76 atoms in block 66 Block first atom: 5316 Blocpdb> 75 atoms in block 67 Block first atom: 5392 Blocpdb> 11 atoms in block 68 Block first atom: 5467 Blocpdb> 84 atoms in block 69 Block first atom: 5478 Blocpdb> 91 atoms in block 70 Block first atom: 5562 Blocpdb> 84 atoms in block 71 Block first atom: 5653 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 5737 Blocpdb> 92 atoms in block 73 Block first atom: 5764 Blocpdb> 88 atoms in block 74 Block first atom: 5856 Blocpdb> 90 atoms in block 75 Block first atom: 5944 Blocpdb> 85 atoms in block 76 Block first atom: 6034 Blocpdb> 84 atoms in block 77 Block first atom: 6119 Blocpdb> 84 atoms in block 78 Block first atom: 6203 Blocpdb> 89 atoms in block 79 Block first atom: 6287 Blocpdb> 82 atoms in block 80 Block first atom: 6376 Blocpdb> 62 atoms in block 81 Block first atom: 6458 Blocpdb> 90 atoms in block 82 Block first atom: 6520 Blocpdb> 87 atoms in block 83 Block first atom: 6610 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 6697 Blocpdb> 91 atoms in block 85 Block first atom: 6711 Blocpdb> 88 atoms in block 86 Block first atom: 6802 Blocpdb> 88 atoms in block 87 Block first atom: 6890 Blocpdb> 92 atoms in block 88 Block first atom: 6978 Blocpdb> 88 atoms in block 89 Block first atom: 7070 Blocpdb> 100 atoms in block 90 Block first atom: 7158 Blocpdb> 90 atoms in block 91 Block first atom: 7258 Blocpdb> 69 atoms in block 92 Block first atom: 7348 Blocpdb> 83 atoms in block 93 Block first atom: 7417 Blocpdb> 74 atoms in block 94 Block first atom: 7500 Blocpdb> 84 atoms in block 95 Block first atom: 7574 Blocpdb> 42 atoms in block 96 Block first atom: 7658 Blocpdb> 87 atoms in block 97 Block first atom: 7700 Blocpdb> 95 atoms in block 98 Block first atom: 7787 Blocpdb> 92 atoms in block 99 Block first atom: 7882 Blocpdb> 100 atoms in block 100 Block first atom: 7974 Blocpdb> 90 atoms in block 101 Block first atom: 8074 Blocpdb> 89 atoms in block 102 Block first atom: 8164 Blocpdb> 80 atoms in block 103 Block first atom: 8253 Blocpdb> 86 atoms in block 104 Block first atom: 8333 Blocpdb> 89 atoms in block 105 Block first atom: 8419 Blocpdb> 77 atoms in block 106 Block first atom: 8508 Blocpdb> 88 atoms in block 107 Block first atom: 8585 Blocpdb> 83 atoms in block 108 Block first atom: 8673 Blocpdb> 89 atoms in block 109 Block first atom: 8756 Blocpdb> 89 atoms in block 110 Block first atom: 8845 Blocpdb> 23 atoms in block 111 Block first atom: 8934 Blocpdb> 98 atoms in block 112 Block first atom: 8957 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 9055 Blocpdb> 81 atoms in block 114 Block first atom: 9143 Blocpdb> 88 atoms in block 115 Block first atom: 9224 Blocpdb> 81 atoms in block 116 Block first atom: 9312 Blocpdb> 75 atoms in block 117 Block first atom: 9393 Blocpdb> 83 atoms in block 118 Block first atom: 9468 Blocpdb> 81 atoms in block 119 Block first atom: 9551 Blocpdb> 90 atoms in block 120 Block first atom: 9632 Blocpdb> 87 atoms in block 121 Block first atom: 9722 Blocpdb> 86 atoms in block 122 Block first atom: 9809 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 9895 Blocpdb> 87 atoms in block 124 Block first atom: 9974 Blocpdb> 92 atoms in block 125 Block first atom: 10061 Blocpdb> 83 atoms in block 126 Block first atom: 10153 Blocpdb> 97 atoms in block 127 Block first atom: 10236 Blocpdb> 76 atoms in block 128 Block first atom: 10333 Blocpdb> 83 atoms in block 129 Block first atom: 10409 Blocpdb> 82 atoms in block 130 Block first atom: 10492 Blocpdb> 88 atoms in block 131 Block first atom: 10574 Blocpdb> 79 atoms in block 132 Block first atom: 10662 Blocpdb> 14 atoms in block 133 Block first atom: 10741 Blocpdb> 84 atoms in block 134 Block first atom: 10755 Blocpdb> 81 atoms in block 135 Block first atom: 10839 Blocpdb> 80 atoms in block 136 Block first atom: 10920 Blocpdb> 88 atoms in block 137 Block first atom: 11000 Blocpdb> 84 atoms in block 138 Block first atom: 11088 Blocpdb> 95 atoms in block 139 Block first atom: 11172 Blocpdb> 82 atoms in block 140 Block first atom: 11267 Blocpdb> 85 atoms in block 141 Block first atom: 11349 Blocpdb> 99 atoms in block 142 Block first atom: 11434 Blocpdb> 96 atoms in block 143 Block first atom: 11533 Blocpdb> 94 atoms in block 144 Block first atom: 11629 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 11723 Blocpdb> 84 atoms in block 146 Block first atom: 11742 Blocpdb> 77 atoms in block 147 Block first atom: 11826 Blocpdb> 70 atoms in block 148 Block first atom: 11903 Blocpdb> 91 atoms in block 149 Block first atom: 11973 Blocpdb> 91 atoms in block 150 Block first atom: 12064 Blocpdb> 87 atoms in block 151 Block first atom: 12155 Blocpdb> 88 atoms in block 152 Block first atom: 12242 Blocpdb> 93 atoms in block 153 Block first atom: 12330 Blocpdb> 8 atoms in block 154 Block first atom: 12423 Blocpdb> 81 atoms in block 155 Block first atom: 12431 Blocpdb> 89 atoms in block 156 Block first atom: 12512 Blocpdb> 83 atoms in block 157 Block first atom: 12601 Blocpdb> 85 atoms in block 158 Block first atom: 12684 Blocpdb> 83 atoms in block 159 Block first atom: 12769 Blocpdb> 84 atoms in block 160 Block first atom: 12852 Blocpdb> 83 atoms in block 161 Block first atom: 12936 Blocpdb> 85 atoms in block 162 Block first atom: 13019 Blocpdb> 98 atoms in block 163 Block first atom: 13104 Blocpdb> 93 atoms in block 164 Block first atom: 13202 Blocpdb> 85 atoms in block 165 Block first atom: 13295 Blocpdb> 74 atoms in block 166 Block first atom: 13380 Blocpdb> 82 atoms in block 167 Block first atom: 13454 Blocpdb> 86 atoms in block 168 Block first atom: 13536 Blocpdb> 80 atoms in block 169 Block first atom: 13622 Blocpdb> 85 atoms in block 170 Block first atom: 13702 Blocpdb> 86 atoms in block 171 Block first atom: 13787 Blocpdb> 81 atoms in block 172 Block first atom: 13873 Blocpdb> 85 atoms in block 173 Block first atom: 13954 Blocpdb> 95 atoms in block 174 Block first atom: 14039 Blocpdb> 79 atoms in block 175 Block first atom: 14134 Blocpdb> 75 atoms in block 176 Block first atom: 14213 Blocpdb> 84 atoms in block 177 Block first atom: 14288 Blocpdb> 90 atoms in block 178 Block first atom: 14372 Blocpdb> 85 atoms in block 179 Block first atom: 14462 Blocpdb> 87 atoms in block 180 Block first atom: 14547 Blocpdb> 79 atoms in block 181 Block first atom: 14634 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 14713 Blocpdb> 83 atoms in block 183 Block first atom: 14765 Blocpdb> 95 atoms in block 184 Block first atom: 14848 Blocpdb> 84 atoms in block 185 Block first atom: 14943 Blocpdb> 97 atoms in block 186 Block first atom: 15027 Blocpdb> 86 atoms in block 187 Block first atom: 15124 Blocpdb> 92 atoms in block 188 Block first atom: 15210 Blocpdb> 93 atoms in block 189 Block first atom: 15302 Blocpdb> 87 atoms in block 190 Block first atom: 15395 Blocpdb> 87 atoms in block 191 Block first atom: 15482 Blocpdb> 79 atoms in block 192 Block first atom: 15569 Blocpdb> 87 atoms in block 193 Block first atom: 15648 Blocpdb> 83 atoms in block 194 Block first atom: 15735 Blocpdb> 88 atoms in block 195 Block first atom: 15818 Blocpdb> 94 atoms in block 196 Block first atom: 15905 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 109 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5569440 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 47997 Prepmat> Matrix trace = 12165040.0000 Prepmat> Last element read: 47997 47997 239.9081 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 18046 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15999 RTB> Total mass = 15999.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 15999 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 151154.1849 RTB> 42420 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 42420 Diagstd> Projected matrix trace = 151154.1849 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 151154.1849 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0605082 0.0984258 0.1796209 0.4058897 0.4873372 0.6578283 0.7816036 0.8478983 1.0587727 1.0985457 1.3586639 1.4215943 1.7614410 1.7900870 1.8905686 2.0769106 2.5063902 2.8473400 2.9110694 3.0257715 3.2976866 3.6113358 3.6515585 3.8088309 3.8678861 4.2646250 4.4931765 4.5402307 5.0651580 5.3001448 5.4187137 5.5976026 5.7443189 6.2677165 6.4682575 6.6580431 6.7621255 6.9726107 7.3255232 7.4946987 7.6771445 8.0757352 8.3009139 8.5639191 8.6954298 8.8337641 9.1727462 9.3576682 9.7184907 9.8551044 9.9704837 10.0758985 10.5405674 10.8314088 11.0026915 11.3388798 11.9730759 12.2298580 12.4058517 12.5841221 12.8168482 13.0799160 13.1887103 13.3444475 13.6652883 13.7580350 14.2317861 14.3003655 14.5234726 14.6640041 14.8833707 15.1090317 15.5005291 15.6631722 15.8674920 16.5804733 17.1223195 17.3433531 17.4269180 17.6006789 17.7296060 18.1037519 18.4747286 18.5323088 18.9726649 19.0313102 19.1880685 19.6935687 20.2166065 20.2613757 20.3772273 20.4381713 20.7944871 21.0971618 21.4759493 21.6448971 21.7034207 21.9637070 22.6177569 22.6489226 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034333 0.0034334 0.0034336 0.0034339 0.0034347 26.7117487 34.0682467 46.0228764 69.1829817 75.8071310 88.0747752 96.0038271 99.9924399 111.7369078 113.8162711 126.5759792 129.4741635 144.1216850 145.2888726 149.3108954 156.4963392 171.9173166 183.2377472 185.2770222 188.8919031 197.1968478 206.3617581 207.5077942 211.9293596 213.5660031 224.2516790 230.1823489 231.3844890 244.3946973 249.9995036 252.7803922 256.9190513 260.2642705 271.8629053 276.1779039 280.2002897 282.3819248 286.7431077 293.9101635 297.2845714 300.8812587 308.5931747 312.8659034 317.7836571 320.2143617 322.7514336 328.8856832 332.1842994 338.5280757 340.8991321 342.8888741 344.6967373 352.5553215 357.3861789 360.2008631 365.6624425 375.7492717 379.7571750 382.4798607 385.2181507 388.7638729 392.7333282 394.3632574 396.6848179 401.4252434 402.7851819 409.6613425 410.6471837 413.8381413 415.8355049 418.9343106 422.0982943 427.5319167 429.7690548 432.5630549 442.1745494 449.3415497 452.2325453 453.3207242 455.5751118 457.2406380 462.0399998 466.7499858 467.4767801 472.9981566 473.7286214 475.6756390 481.9006271 488.2580460 488.7983659 490.1938124 490.9262983 495.1871730 498.7780082 503.2357262 505.2112857 505.8938208 508.9183389 516.4402066 516.7958932 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15999 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0508E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8426E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7816 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.790 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.847 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.809 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.868 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.300 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.744 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.495 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.076 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.301 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.695 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.855 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 287982 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22071122400425431.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22071122400425431.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22071122400425431.atom Openam> file on opening on unit 11: 22071122400425431.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2046 First residue number = 146 Last residue number = 3153 Number of atoms found = 15999 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0508E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8426E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7816 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.891 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.847 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.809 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.868 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.300 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.495 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.076 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.301 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.695 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65 Bfactors> 106 vectors, 47997 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.060508 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.053 +/- 0.04 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.053 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22071122400425431.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22071122400425431.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 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vecteur en lecture: 422.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.8 Chkmod> 106 vectors, 47997 coordinates in file. Chkmod> That is: 15999 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9679 0.0034 0.7079 0.0034 0.7705 0.0034 0.9452 0.0034 0.7234 0.0034 0.8070 26.7106 0.6812 34.0668 0.6723 46.0182 0.6675 69.1809 0.2844 75.8010 0.3676 88.0691 0.6199 95.9995 0.6313 99.9882 0.5927 111.7441 0.7094 113.8349 0.5599 126.5862 0.6259 129.4871 0.6365 144.0975 0.4850 145.2791 0.4620 149.3215 0.5708 156.4930 0.5272 171.8966 0.5102 183.2189 0.6076 185.2669 0.6114 188.8909 0.2729 197.1978 0.3683 206.3433 0.5669 207.5114 0.5752 211.9250 0.3473 213.5600 0.5621 224.2519 0.6196 230.1679 0.5283 231.3687 0.5678 244.3804 0.5621 249.9854 0.4684 252.7762 0.4516 256.9171 0.4203 260.2459 0.5042 271.8574 0.3811 276.1606 0.5278 280.1874 0.4491 282.3672 0.5982 286.7388 0.2548 293.9071 0.2236 297.2778 0.3926 300.8655 0.6118 308.5850 0.2476 312.8541 0.4956 317.7715 0.5797 320.1927 0.4917 322.7419 0.3903 328.8761 0.4111 332.1759 0.4205 338.5050 0.4007 340.8827 0.2134 342.8658 0.4694 344.7521 0.3437 352.5307 0.3498 357.3476 0.3745 360.1413 0.4364 365.6648 0.4170 375.6849 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22071122400425431.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22071122400425431.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22071122400425431 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom making animated gifs 11 models are in 22071122400425431.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22071122400425431.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22071122400425431.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22071122400425431 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22071122400425431.eigenfacs 22071122400425431.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22071122400425431.eigenfacs 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