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LOGs for ID: 22070501501467326

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22070501501467326.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22070501501467326.atom to be opened. Openam> File opened: 22070501501467326.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 51 First residue number = 1 Last residue number = 606 Number of atoms found = 404 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.438943 +/- 5.884957 From: -11.891000 To: 13.552000 = -12.143980 +/- 6.169218 From: -25.701000 To: 1.660000 = 43.755396 +/- 6.870237 From: 28.392000 To: 59.846000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 15 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 16.5815 % Filled. Pdbmat> 121887 non-zero elements. Pdbmat> 13277 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 65.73 +/- 22.56 Maximum number = 125 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 265540. Pdbmat> Larger element = 509.448 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 51 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22070501501467326.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22070501501467326.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22070501501467326.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 404 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 51 residues. Blocpdb> 5 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 6 Blocpdb> 7 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 21 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 32 Blocpdb> 12 atoms in block 6 Block first atom: 40 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 52 Blocpdb> 7 atoms in block 8 Block first atom: 64 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 71 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 82 Blocpdb> 4 atoms in block 11 Block first atom: 91 Blocpdb> 8 atoms in block 12 Block first atom: 95 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 103 Blocpdb> 12 atoms in block 14 Block first atom: 111 Blocpdb> 11 atoms in block 15 Block first atom: 123 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 134 Blocpdb> 6 atoms in block 17 Block first atom: 146 Blocpdb> 7 atoms in block 18 Block first atom: 152 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 159 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 171 Blocpdb> 7 atoms in block 21 Block first atom: 183 Blocpdb> 6 atoms in block 22 Block first atom: 190 Blocpdb> 6 atoms in block 23 Block first atom: 196 Blocpdb> 12 atoms in block 24 Block first atom: 202 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 214 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 226 Blocpdb> 5 atoms in block 27 Block first atom: 238 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 243 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 254 Blocpdb> 5 atoms in block 30 Block first atom: 266 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 271 Blocpdb> 12 atoms in block 32 Block first atom: 279 Blocpdb> 6 atoms in block 33 Block first atom: 291 Blocpdb> 6 atoms in block 34 Block first atom: 297 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 303 Blocpdb> 5 atoms in block 36 Block first atom: 310 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 315 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 322 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 330 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 337 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 348 Blocpdb> 5 atoms in block 42 Block first atom: 362 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 367 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 376 Blocpdb> 7 atoms in block 45 Block first atom: 388 Blocpdb> 5 atoms in block 46 Block first atom: 395 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 400th, in residue A 602 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 401th, in residue A 603 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 47 Block first atom: 400 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 404th, in residue A 606 %Blocpdb-Wn> It is merged with last block. Blocpdb> 47 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 121934 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 1212 Prepmat> Matrix trace = 265540.0000 Prepmat> Last element read: 1212 1212 218.9729 Prepmat> 1129 lines saved. Prepmat> 714 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 404 RTB> Total mass = 404.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 404 RTB> Number of blocks = 47 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 54196.5300 RTB> 14199 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 282 Diagstd> Nb of non-zero elements: 14199 Diagstd> Projected matrix trace = 54196.5300 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 282 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 54196.5300 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.0615767 5.2410172 8.4642427 8.9377768 11.8382143 13.1717628 15.6889441 17.4669775 19.9800781 22.2353200 22.6303619 24.4100226 26.4232543 28.1473625 29.5186329 31.2184277 32.5482362 33.6163673 38.1532285 39.2141784 41.5628401 42.7141110 43.7813782 45.6612874 48.5639196 50.2117475 52.4543245 52.7467531 55.1834730 57.6068419 58.7928780 59.9074144 61.9025440 63.7772166 65.8564697 67.3627495 68.3956945 69.0723151 70.8327660 71.0281035 73.5445890 74.5664927 76.0815272 78.9987776 79.5429858 81.1254866 82.4253896 84.6264298 84.9101563 86.2813933 87.1290636 89.7761896 91.2357940 92.6781608 93.7066043 95.1015882 96.1305407 97.7402660 98.5875600 100.7800971 101.1749214 102.4373999 104.7826378 106.4674118 107.2531353 108.6802356 110.0276909 110.6678811 111.2071305 113.3929643 113.9460782 114.4595672 116.5739071 118.2636723 119.8431251 122.3662920 123.8899778 125.5309306 126.0967941 127.1855356 127.9352838 128.8102855 129.1499145 131.6374732 132.0091031 133.5996988 134.9174352 136.1886230 137.4624681 137.8785212 138.4684226 140.9043855 142.1043232 143.6025972 143.9580993 145.1068628 145.2500073 146.4662768 147.3556165 150.9332619 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034332 0.0034333 0.0034337 0.0034340 0.0034345 218.8480135 248.6011164 315.9288853 324.6459828 373.6271083 394.1097974 430.1224776 453.8414522 485.3934046 512.0554252 516.5840936 536.5119142 558.1982011 576.1215674 589.9883010 606.7374378 619.5252476 629.6086270 670.7503797 680.0124132 700.0803511 709.7100682 718.5218752 733.7858901 756.7495058 769.4810844 786.4768242 788.6660500 806.6772242 824.1994374 832.6407086 840.4958398 854.3769614 867.2175556 881.2406119 891.2615745 898.0689105 902.5001577 913.9288375 915.1881530 931.2593432 937.7069575 947.1851729 965.1736700 968.4924174 978.0790073 985.8839230 998.9604400 1000.6336430 1008.6810340 1013.6238099 1028.9063901 1037.2367801 1045.4035813 1051.1879660 1058.9834313 1064.6968587 1073.5741322 1078.2174081 1090.1409821 1092.2743069 1099.0679753 1111.5780030 1120.4787604 1124.6056955 1132.0629207 1139.0591570 1142.3681274 1145.1479440 1156.3474172 1159.1642311 1161.7731360 1172.4543885 1180.9213123 1188.7809665 1201.2300286 1208.6856550 1216.6639904 1219.4031227 1224.6560767 1228.2603959 1232.4535263 1234.0772372 1245.9053450 1247.6627827 1255.1569053 1261.3317228 1267.2599060 1273.1727917 1275.0980707 1277.8228583 1289.0137068 1294.4906728 1301.2969972 1302.9067446 1308.0949127 1308.7399559 1314.2079837 1318.1918652 1334.0980802 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 404 Rtb_to_modes> Number of blocs = 47 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.241 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00004 1.00000 1.00004 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00005 0.99997 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00005 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00002 1.00005 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99996 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99995 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22070501501467326.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22070501501467326.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22070501501467326.atom Openam> file on opening on unit 11: 22070501501467326.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 51 First residue number = 1 Last residue number = 606 Number of atoms found = 404 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.241 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.9 Bfactors> 106 vectors, 1212 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.062000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.381 for 51 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.056 +/- 0.05 Bfactors> = 108.349 +/- 11.61 Bfactors> Shiftng-fct= 108.293 Bfactors> Scaling-fct= 246.925 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22070501501467326.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22070501501467326.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1246. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1255. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1278. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1289. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1301. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1308. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1314. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334. Chkmod> 106 vectors, 1212 coordinates in file. Chkmod> That is: 404 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 48 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 74 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 84 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 85 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7134 0.0034 0.8458 0.0034 0.7407 0.0034 0.8923 0.0034 0.7580 0.0034 0.8049 218.8500 0.5792 248.5900 0.4948 315.9108 0.4787 324.6361 0.2444 373.6392 0.1511 394.0665 0.5823 430.1185 0.4882 453.8612 0.4590 485.3716 0.3135 512.0873 0.2886 516.5578 0.3065 536.4886 0.2666 558.1399 0.2407 576.1238 0.2799 589.9766 0.2882 606.7267 0.3301 619.5154 0.2447 629.6156 0.4495 670.6932 0.3024 679.9470 0.3896 700.0264 0.5107 709.6454 0.2297 718.4797 0.3315 733.7440 0.2173 756.6865 0.3406 769.4347 0.1838 786.4106 0.3117 788.6565 0.3920 806.6172 0.3912 824.1866 0.2672 832.5846 0.3506 840.4779 0.3544 854.3227 0.4220 867.1993 0.3771 881.2264 0.4366 891.2051 0.2190 898.0586 0.0903 902.4463 0.2489 913.8718 0.3600 915.1611 0.5299 931.1903 0.5232 937.6888 0.3657 947.1350 0.5125 965.1397 0.5270 968.4327 0.4956 978.0642 0.3275 985.8692 0.0445 998.9386 0.3479 1000.5898 0.4413 1008.6296 0.2334 1013.5857 0.4242 1028.8841 0.3676 1037.2162 0.2908 1045.3691 0.2353 1051.1619 0.2516 1058.9291 0.4141 1064.6482 0.2327 1073.5266 0.2134 1078.1845 0.3295 1090.2018 0.4216 1092.3628 0.3296 1098.8202 0.3686 1111.6224 0.4607 1120.6021 0.2775 1124.8031 0.3199 1132.1173 0.3908 1138.8669 0.3106 1142.4848 0.3912 1145.0621 0.3795 1156.3336 0.3775 1158.8801 0.3135 1161.9284 0.2190 1172.5353 0.2893 1181.0520 0.3089 1188.5160 0.4474 1201.3439 0.4099 1208.6827 0.3935 1216.4619 0.3202 1219.3663 0.1788 1224.6731 0.4584 1228.0383 0.3022 1232.3514 0.2785 1233.7858 0.1312 1245.6745 0.3863 1247.5662 0.5011 1255.1044 0.4271 1261.1961 0.3834 1267.2584 0.4104 1273.2919 0.3944 1275.1426 0.4384 1277.9137 0.4548 1288.9383 0.4492 1294.4154 0.5012 1301.2294 0.4191 1303.0404 0.5406 1308.0078 0.4113 1308.9090 0.4952 1314.3028 0.4216 1318.3338 0.4063 1333.8938 0.4220 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22070501501467326 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom making animated gifs 11 models are in 22070501501467326.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070501501467326.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070501501467326.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22070501501467326 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22070501501467326.eigenfacs 22070501501467326.atom making animated gifs 11 models are in 22070501501467326.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070501501467326.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070501501467326.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting 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