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***  proz  ***

LOGs for ID: 22070401545669005

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22070401545669005.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22070401545669005.atom to be opened. Openam> File opened: 22070401545669005.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 53 First residue number = 1 Last residue number = 208 Number of atoms found = 792 Mean number per residue = 14.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 7.836232 +/- 4.997448 From: -6.241000 To: 20.509000 = 21.032747 +/- 6.411850 From: 5.191000 To: 33.704000 = 23.917260 +/- 7.389128 From: 8.513000 To: 41.168000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CGU ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 20 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 15.8810 % Filled. Pdbmat> 448459 non-zero elements. Pdbmat> 49308 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 124.52 +/- 42.53 Maximum number = 232 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 986160. Pdbmat> Larger element = 819.198 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 53 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22070401545669005.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22070401545669005.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22070401545669005.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 792 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 53 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 11 atoms in block 3 Block first atom: 20 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 31 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 52 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 71 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 90 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 107 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 124 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 143 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 163 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 180 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 187 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 201 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 220 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 237 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 259 Blocpdb> 10 atoms in block 18 Block first atom: 276 Blocpdb> 21 atoms in block 19 Block first atom: 286 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 307 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 324 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 341 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 360 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 370 Blocpdb> 21 atoms in block 25 Block first atom: 386 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 407 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 424 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 441 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 451 Blocpdb> 17 atoms in block 30 Block first atom: 475 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 492 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 508 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 528 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 545 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 559 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 576 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 592 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 608 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 622 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 634 Blocpdb> 20 atoms in block 41 Block first atom: 651 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 671 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 695 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 719 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 743 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 764 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 786th, in residue H 202 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 787th, in residue H 203 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 47 Block first atom: 786 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 789th, in residue H 205 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 790th, in residue H 206 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 48 Block first atom: 788 Blocpdb> 48 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 448507 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 2376 Prepmat> Matrix trace = 986160.0000 Prepmat> Last element read: 2376 2376 264.9947 Prepmat> 1177 lines saved. Prepmat> 637 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 792 RTB> Total mass = 792.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 792 RTB> Number of blocks = 48 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 109220.6640 RTB> 18684 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 288 Diagstd> Nb of non-zero elements: 18684 Diagstd> Projected matrix trace = 109220.6640 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 288 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 109220.6640 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 11.8382189 13.6735077 18.4025860 23.5094065 29.5765346 32.1986323 36.0730144 42.2808963 45.7716579 48.0039509 53.0462999 60.6412551 67.3504313 71.5038528 76.2607935 80.0681087 83.4451521 87.5011915 90.5080216 98.2752706 100.9399943 101.6250438 104.6537487 109.6335186 114.0021738 117.1451991 120.0643963 124.5786644 125.8931902 132.7707836 137.5929526 139.8565237 142.9136630 145.8084798 147.0335228 152.4394768 154.8324625 157.0878526 160.3786088 163.7972407 165.6369361 172.0577027 174.0392043 174.6227761 178.8880134 181.1562065 185.2387059 189.4075895 192.3989540 194.6337359 196.9268475 198.7141336 205.7888805 208.7127760 211.1343756 212.8774697 213.5657105 216.7339605 217.8338464 222.2820132 223.7299767 224.5047758 228.7602969 229.8531060 232.7810463 236.1723253 239.7927717 241.9004598 242.7176629 244.7097082 247.5975788 250.5027564 252.3683375 254.7791567 256.7577435 262.2467882 263.8707822 266.4510109 267.9812527 269.3978036 270.3570445 272.4836199 274.1938366 275.4448297 279.4566901 281.4557165 281.7476372 283.3144150 286.8482566 288.7232915 289.2435230 292.3836469 292.4882166 294.8530282 296.8719599 301.4365592 302.4344086 303.8372172 304.4488474 305.8438404 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034330 0.0034336 0.0034339 0.0034342 0.0034344 373.6271807 401.5459497 465.8377814 526.5215032 590.5666576 616.1890733 652.2085655 706.1018884 734.6721925 752.3739870 790.9022819 845.6280314 891.1800813 918.2480231 948.3004141 971.6840308 991.9638270 1015.7860952 1033.0915663 1076.5083539 1091.0054451 1094.7013487 1110.8941376 1137.0169963 1159.4495238 1175.3237920 1189.8779076 1212.0404542 1218.4182622 1251.2570558 1273.7769195 1284.2117668 1298.1717547 1311.2535327 1316.7504079 1340.7382667 1351.2207030 1361.0265017 1375.2083518 1389.7880432 1397.5709813 1424.4012308 1432.5798056 1434.9795911 1452.3988651 1461.5776360 1477.9547903 1494.4932878 1506.2485212 1514.9710704 1523.8693868 1530.7690014 1557.7803904 1568.8080079 1577.8828448 1584.3828399 1586.9419576 1598.6697739 1602.7211213 1619.0022080 1624.2668057 1627.0768736 1642.4252234 1646.3435581 1656.7961941 1668.8211035 1681.5637018 1688.9376891 1691.7881206 1698.7164010 1708.7104563 1718.7057690 1725.0937975 1733.3139336 1740.0312793 1758.5323792 1763.9689347 1772.5723332 1777.6550329 1782.3471893 1785.5175586 1792.5260690 1798.1425769 1802.2398680 1815.3172549 1821.7984035 1822.7429267 1827.8039697 1839.1679392 1845.1691731 1846.8307693 1856.8286123 1857.1606258 1864.6532242 1871.0262047 1885.3554562 1888.4734367 1892.8481074 1894.7523196 1899.0882620 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 792 Rtb_to_modes> Number of blocs = 48 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 181.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 194.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 196.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 205.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 211.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 212.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 213.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 216.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 217.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 222.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 223.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 224.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 228.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 229.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 232.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 236.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 239.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 241.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 242.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 244.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 247.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99996 0.99993 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00007 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99993 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99995 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00006 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99995 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00004 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99997 1.00002 0.99997 0.99998 1.00002 1.00000 1.00004 0.99997 1.00004 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22070401545669005.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22070401545669005.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22070401545669005.atom Openam> file on opening on unit 11: 22070401545669005.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 53 First residue number = 1 Last residue number = 208 Number of atoms found = 792 Mean number per residue = 14.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 196.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 213.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 222.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 228.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 229.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 232.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 236.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 239.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 241.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 244.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 247.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 254.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 256.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 262.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 263.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 266.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 268.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 269.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 272.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 274.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 275.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 279.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 281.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 283.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 286.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 289.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 292.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 294.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 296.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 302.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 303.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 304.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 305.8 Bfactors> 106 vectors, 2376 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 11.840000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.010 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.010 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22070401545669005.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22070401545669005.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1076. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1218. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1251. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1284. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1298. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1311. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1390. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1432. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1435. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1452. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1462. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1478. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1494. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1506. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1515. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1524. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1531. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1558. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1569. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1578. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1584. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1587. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1598. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1603. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1619. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1624. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1627. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1642. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1646. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1657. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1669. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1682. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1689. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1692. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1699. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1709. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1719. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1725. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1733. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1740. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1758. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1764. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1773. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1778. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1782. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1786. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1793. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1798. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1802. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1815. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1822. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1823. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1828. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1839. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1845. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1847. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1857. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1857. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1865. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1871. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1885. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1888. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1893. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1895. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1899. Chkmod> 106 vectors, 2376 coordinates in file. Chkmod> That is: 792 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 41 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 80 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7589 0.0034 0.7540 0.0034 0.9226 0.0034 0.6917 0.0034 0.9261 0.0034 0.7251 373.6392 0.5211 401.4772 0.3132 465.7851 0.3521 526.5055 0.2496 590.5759 0.3891 616.1757 0.2318 652.1533 0.2335 706.0641 0.2271 734.6273 0.2699 752.3107 0.4713 790.8959 0.4158 845.5830 0.5475 891.1390 0.5163 918.1839 0.4552 948.2548 0.3774 971.6538 0.2307 991.9501 0.2534 1015.7356 0.4019 1033.0585 0.2850 1076.4880 0.3340 1090.7425 0.5479 1094.5195 0.3121 1111.0919 0.2631 1136.7944 0.6261 1159.3887 0.3223 1175.0466 0.2588 1190.0032 0.2681 1212.0922 0.4591 1218.3989 0.3688 1251.3410 0.4849 1273.7549 0.5166 1284.3562 0.4221 1298.0540 0.3054 1311.1591 0.1488 1316.5438 0.3826 1340.5071 0.3152 1351.0210 0.3675 1361.0207 0.2692 1375.2410 0.5743 1389.7401 0.5232 1397.3552 0.3446 1424.5151 0.5862 1432.3570 0.3567 1434.8244 0.2540 1452.3852 0.4343 1461.6915 0.4320 1477.7369 0.5219 1494.3992 0.4385 1506.1880 0.5525 1514.7747 0.4054 1523.7001 0.4751 1530.6489 0.4623 1557.7556 0.1990 1568.6926 0.3739 1577.6867 0.1739 1584.3987 0.3119 1587.0012 0.1869 1598.4759 0.2684 1602.5278 0.1994 1618.9982 0.2630 1624.0883 0.3082 1626.9897 0.5019 1642.4972 0.3464 1646.4408 0.4360 1656.7925 0.4991 1668.8472 0.5037 1681.5169 0.4053 1688.8636 0.3922 1691.6539 0.4821 1698.6098 0.5184 1708.6455 0.2210 1718.6225 0.4252 1725.1280 0.4728 1733.3104 0.2765 1740.0998 0.4745 1758.3000 0.4354 1763.9909 0.4326 1772.6592 0.4602 1777.6409 0.5665 1782.2779 0.4383 1785.5827 0.5283 1792.5030 0.3414 1798.0856 0.3991 1802.0158 0.5342 1815.3800 0.4798 1821.8635 0.3452 1822.5106 0.4881 1827.6790 0.3363 1838.9343 0.5438 1845.0155 0.2844 1846.6125 0.4288 1856.8008 0.3013 1857.1183 0.3213 1864.7217 0.3512 1871.0342 0.3960 1885.1602 0.4649 1888.2849 0.4167 1892.6509 0.5692 1894.5190 0.4026 1898.8706 0.4832 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22070401545669005 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom making animated gifs 11 models are in 22070401545669005.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22070401545669005 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom making animated gifs 11 models are in 22070401545669005.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 22070401545669005 12 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom 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plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.14.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22070401545669005.14.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 22070401545669005 15 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 22070401545669005.eigenfacs 22070401545669005.atom calculating perturbed 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